# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -H -O./tmp/as00010.fasta.huge -Q ../query/FLJ00010.ptfa ./tmplib.10216 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 FLJ00010, 772 aa vs ./tmplib.10216 library 2210222 residues in 2457 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9719+/-0.00486; mu= 18.5802+/- 0.326 mean_var=137.0715+/-30.824, 0's: 0 Z-trim: 7 B-trim: 159 in 1/39 Lambda= 0.109547 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2457) FLJ00100 ( 672 res) as00100 ( 672) 4413 709.2 4.1e-205 FLJ00009 ( 540 res) as00009 ( 540) 3422 552.4 5.1e-158 FLJ00059 ( 477 res) as00059 ( 477) 3151 509.5 3.7e-145 FLJ00379 ( 487 res) sj00523 ( 487) 2952 478.1 1.1e-135 KIAA1176 ( 1101 res) hg02851a (1101) 664 117.0 1.2e-26 FLJ00105 ( 721 res) as00105 ( 721) 650 114.5 4.5e-26 FLJ00098 ( 780 res) as00098 ( 780) 650 114.6 4.7e-26 KIAA1330 ( 945 res) fh15188 ( 945) 118 30.6 1.1 KIAA1284 ( 953 res) hh09454s1 ( 953) 109 29.2 2.9 FLJ00135 ( 597 res) sh02493 ( 597) 104 28.1 3.9 FLJ00350 ( 601 res) sg00019 ( 601) 104 28.1 3.9 KIAA1494 ( 638 res) fj08673 ( 638) 104 28.2 4 KIAA1059 ( 1297 res) hh12158 (1297) 105 28.8 5.3 FLJ00330 ( 246 res) sj03258 ( 246) 92 25.6 8.9 FLJ00043 ( 1415 res) as00043 (1415) 99 27.9 11 KIAA1887 ( 967 res) fk02232 ( 967) 97 27.3 11 KIAA1481 ( 1380 res) fj05724 (1380) 97 27.6 13 KIAA1384 ( 652 res) fj06146 ( 652) 93 26.4 14 KIAA0154 ( 692 res) ha03131 ( 692) 93 26.5 14 KIAA1981 ( 862 res) fk03148(revised) ( 862) 94 26.8 14 KIAA0346 ( 1682 res) hg01508s1 (1682) 97 27.7 15 KIAA1951 ( 679 res) fj05532 ( 679) 92 26.3 15 KIAA1814 ( 1285 res) ph00952 (1285) 95 27.2 16 KIAA1086 ( 902 res) hj08218 ( 902) 93 26.7 16 KIAA0164 ( 929 res) ha02373 ( 929) 93 26.7 16 KIAA1743 ( 1036 res) pj01380s1 (1036) 93 26.7 17 FLJ00007 ( 701 res) as00007 ( 701) 91 26.2 18 KIAA1139 ( 1124 res) hk00330 (1124) 93 26.8 18 FLJ00207 ( 288 res) sj04935 ( 288) 86 24.8 19 KIAA1809 ( 800 res) fk01629 ( 800) 91 26.3 19 KIAA1292 ( 595 res) hk05468(revised) ( 595) 89 25.8 20 KIAA0702 ( 988 res) hg01814(revised) ( 988) 91 26.4 21 FLJ00386 ( 811 res) sj04204 ( 811) 90 26.1 21 KIAA0909 ( 1234 res) hk10471 (1234) 92 26.7 21 KIAA1043 ( 2126 res) af02720 (2126) 94 27.4 23 KIAA1475 ( 986 res) fj03454 ( 986) 90 26.2 24 KIAA0853 ( 967 res) hk06136 ( 967) 89 26.1 26 KIAA0542 ( 1212 res) hg04325s1 (1212) 90 26.4 26 KIAA1868 ( 463 res) fj22550 ( 463) 85 25.0 27 KIAA0593 ( 2005 res) hj02824s1 (2005) 92 27.0 28 KIAA0225 ( 2013 res) ha02515 (2013) 92 27.0 28 KIAA1120 ( 1024 res) hg02941 (1024) 88 25.9 30 FLJ00363 ( 151 res) sh04774 ( 151) 78 23.1 31 KIAA0375 ( 1540 res) hh00360s1 (1540) 89 26.4 33 FLJ00268 ( 695 res) sj05723 ( 695) 85 25.2 33 KIAA0600 ( 1080 res) fh08981 (1080) 87 25.8 34 KIAA0176 ( 265 res) ha03941 ( 265) 80 23.8 34 KIAA1543 ( 917 res) hh05613a ( 917) 86 25.6 35 KIAA1181 ( 336 res) hf00712a ( 336) 81 24.1 35 KIAA1539 ( 543 res) fg02356 ( 543) 83 24.7 36 >>FLJ00100 ( 672 res) as00100 (672 aa) initn: 4413 init1: 4413 opt: 4413 Z-score: 3775.8 bits: 709.2 E(): 4.1e-205 Smith-Waterman score: 4413; 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KIAA11 LLVGIYFPSVTGIMAGSNRSGDLRDAQKSIPTGTILAIATTSAVYISSVVLFGACIEGVV 400 410 420 430 440 450 190 200 210 220 230 FLJ000 LQEDYGFFRAISL------WP-P-LVLIGIYATALSASMSSLIGASRILHALARDDL--F :.. .: .: :: : ...:: . .. .:...:: :: :.:.:..:: . : KIAA11 LRDKFGEAVNGNLVVGTLAWPSPWVIVIGSFFSTCGAGLQSLTGAPRLLQAISRDGIVPF 460 470 480 490 500 510 240 250 260 270 280 290 FLJ000 GVILAPAKVVSRGGNPWAAVLYSWGLVQLVLLAGKLNTLAAVVTVFYLVAYAAVDLSCLS ... .:. .:.: :.: . . .. .: ..:. .: ....:.:. : :.:.: KIAA11 LQVFGHGKA---NGEPTWALLLTACICEIGILIASLDEVAPILSMFFLMCYMFVNLACAV 520 530 540 550 560 570 300 310 320 330 340 350 FLJ000 LEWASAPNFRPTFSLFSWHTCLLGVASCLLMMFLISPGAAGGSLLLMGLLAALLTARGGP .::.:: : . : .::.. :: .::. : : ..:. ::. . ::. KIAA11 QTLLRTPNWRPRFRYYHWTLSFLGMSLCLALMFICSWYYALVAMLIAGLIYKYIEYRGAE 580 590 600 610 620 630 360 370 380 390 400 410 FLJ000 SSWGYVSQALLFHQVRKYLLRLDVRKDHVKFWRPQLLLLV---GNPRGALP-LLRLANQL . :: ..: . .: ::::. :.: ::::::.:: . . : :: :..:: KIAA11 KEWGDGIRGLSLSAARYALLRLEEGPPHTKNWRPQLLVLVRVDQDQNVVHPQLLSLTSQL 640 650 660 670 680 690 420 430 440 450 460 FLJ000 KKG-GLYVLGHVTLGDLDSLPSDPVQPQYG--AWLSLVDRAQVKAFVDLTLSPSVRQGAQ : : :: ..: : : . : . : : : . . :.. .::.: ....: ..:.:.. KIAA11 KAGKGLTIVGSVLEGTF--LENHP-QAQRAEESIRRLMEAEKVKGFCQVVISSNLRDGVS 700 710 720 730 740 470 480 490 500 510 520 FLJ000 HLLRISGLGGMKPNTLVLGFYDDAPPQDHFLTDPAFSEPADSTREGSSPALSTLFPPPRA ::.. .::::.. ::...:. . .. : : : .:: .. : KIAA11 HLIQSGGLGGLQHNTVLVGWPRNWRQKEDHQTWRNFIE---LVRETTAGHL--------- 750 760 770 780 790 530 540 550 560 570 580 FLJ000 PGSPRALNPQDYVATVADALKMNKNVVLARASGALPPERLSRGSGGTSQLHHVDVWPLNL :: ..::: . .. :::.:.:: .::: KIAA11 ------------------ALLVTKNVSMFPGN----PERFSEGS--------IDVW---W 800 810 820 590 600 610 620 630 640 FLJ000 LRPRGGPGYVDVCGLFLLQMATILGMVPAWHSARLRIFLCLGPREAPGAAEGRLRALLSQ . :: .:. . .: .:.. ..::: . . : ..: . KIAA11 IVHDGG---------MLMLLPFLLRHHKVWRKCKMRIFTVAQMDDNSIQMKKDLTTFLYH 830 840 850 860 870 650 660 670 680 690 700 FLJ000 LRIRAEVQEVVWGEGAGAGEPEAEEEGDFVNSGRGDAEAEALARSANALVRAQQGRGTGG ::: :::. : KIAA11 LRITAEVEVVEMHESDISAYTYEKTLVMEQRSQILKQMHLTKNEREREIQSITDESRGSI 880 890 900 910 920 930 >>FLJ00105 ( 721 res) as00105 (721 aa) initn: 660 init1: 220 opt: 650 Z-score: 561.4 bits: 114.5 E(): 4.5e-26 Smith-Waterman score: 685; 28.366% identity (58.169% similar) in 557 aa overlap (119-659:52-549) 90 100 110 120 130 140 FLJ000 SLPPRFGHFTGFNSSTLKDNLGAGYAEDYTTGAVMNFASVFAVLFNGCTGIMAGANMSGE : . .:. . .. : . ::::::.: ::. FLJ001 AHAGAFVEKKGVPSVPVAEESRASALPYVLTDIAASFTLLVGIYFPSVTGIMAGSNRSGD 30 40 50 60 70 80 150 160 170 180 190 200 FLJ000 LKDPSRAIPLGTIVAVAYTFFVYVLLFFLSSFTCDRTLLQEDYG------FFRAISLWP- ::: ...:: :::.:.. : :.:. . : . . ..:.. .: . .. :: FLJ001 LKDAQKSIPTGTILAIVTTSFIYLSCIVLFGACIEGVVLRDKFGEALQGNLVIGMLAWPS 90 100 110 120 130 140 210 220 230 240 250 FLJ000 P-LVLIGIYATALSASMSSLIGASRILHALARDDL--FGVILAPAKVVSRGGNPWAAVLY : ...:: . .. .:...:: :: :.:.:.::: . : ... .:. .:.: :.: FLJ001 PWVIVIGSFFSTCGAGLQSLTGAPRLLQAIARDGIVPFLQVFGHGKA---NGEPTWALLL 150 160 170 180 190 260 270 280 290 300 310 FLJ000 SWGLVQLVLLAGKLNTLAAVVTVFYLVAYAAVDLSCLSLEWASAPNFRPTFSLFSWHTCL . . . .: ..:...: ....:.:. : :.:.: .::.:: :... : . FLJ001 TVLICETGILIASLDSVAPILSMFFLMCYLFVNLACAVQTLLRTPNWRPRFKFYHWTLSF 200 210 220 230 240 250 320 330 340 350 360 370 FLJ000 LGVASCLLMMFLISPGAAGGSLLLMGLLAALLTARGGPSSWGYVSQALLFHQVRKYLLRL ::.. :: .::. : : ...:. : . . ::. . :: ..: .. .: :::. FLJ001 LGMSLCLALMFICSWYYALSAMLIAGCIYKYIEYRGAEKEWGDGIRGLSLNAARYALLRV 260 270 280 290 300 310 380 390 400 410 420 430 FLJ000 DVRKDHVKFWRPQLLLLVG-NPRGAL--P-LLRLANQLKKG-GLYVLGHVTLGD-LDSLP . :.: ::::.:.... . . :. : :: ...::: : :: ..: : : ::. FLJ001 EHGPPHTKNWRPQVLVMLNLDAEQAVKHPRLLSFTSQLKAGKGLTIVGSVLEGTYLDK-- 320 330 340 350 360 370 440 450 460 470 480 490 FLJ000 SDPVQPQYGAWLSLVDRAQVKAFVDLTLSPSVRQGAQHLLRISGLGGMKPNTLVLGFYDD .: ::.. ..:.: .:..: :.:.: .::.. .::::.: ::..... FLJ001 HMEAQRAEENIRSLMSTEKTKGFCQLVVSSSLRDGMSHLIQSAGLGGLKHNTVLMAW--- 380 390 400 410 420 430 500 510 520 530 540 550 FLJ000 APPQDHFLTDPAFSEPADSTREGSSPALSTLFPPPRAPGSPRALNPQDYVATVADALKMN :: : .. ..: .. ...: :: :. . FLJ001 ----------PA------SWKQEDNP-----------------FSWKNFVDTVRDTTAAH 440 450 460 560 570 580 590 600 610 FLJ000 KNVVLARASGALPPERLSRGSGGTSQLHHVDVWPLNLLRPRGGPGYVDVCGLFLLQMATI . ...:. ..: .. :.: :.::: . :: .:. . . FLJ001 QALLVAKNVDSFPQNQERFGGG------HIDVW---WIVHDGG---------MLMLLPFL 470 480 490 500 620 630 640 650 660 670 FLJ000 LGMVPAWHSARLRIFLCLGPREAPGAAEGRLRALLSQLRIRAEVQEVVWGEGAGAGEPEA : . .:.. :.::: . . :. .: .::: :::. : FLJ001 LRQHKVWRKCRMRIFTVAQVDDNSIQMKKDLQMFLYHLRISAEVEVVEMVENDISAFTYE 510 520 530 540 550 560 680 690 700 710 720 730 FLJ000 EEEGDFVNSGRGDAEAEALARSANALVRAQQGRGTGGGPGGPEGGDAEGPITALTFLYLP FLJ001 RTLMMEQRSQMLKQMQLSKNEQEREAQLIHDRNTASHTAAAARTQAPPTPDKVQMTWTRE 570 580 590 600 610 620 >>FLJ00098 ( 780 res) as00098 (780 aa) initn: 689 init1: 220 opt: 650 Z-score: 561.0 bits: 114.6 E(): 4.7e-26 Smith-Waterman score: 685; 28.366% identity (58.169% similar) in 557 aa overlap (119-659:111-608) 90 100 110 120 130 140 FLJ000 SLPPRFGHFTGFNSSTLKDNLGAGYAEDYTTGAVMNFASVFAVLFNGCTGIMAGANMSGE : . .:. . .. : . ::::::.: ::. FLJ000 AHAGAFVEKKGVPSVPVAEESRASALPYVLTDIAASFTLLVGIYFPSVTGIMAGSNRSGD 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 FLJ000 LKDPSRAIPLGTIVAVAYTFFVYVLLFFLSSFTCDRTLLQEDYG------FFRAISLWP- ::: ...:: :::.:.. : :.:. . : . . ..:.. .: . .. :: FLJ000 LKDAQKSIPTGTILAIVTTSFIYLSCIVLFGACIEGVVLRDKFGEALQGNLVIGMLAWPS 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 FLJ000 P-LVLIGIYATALSASMSSLIGASRILHALARDDL--FGVILAPAKVVSRGGNPWAAVLY : ...:: . .. .:...:: :: :.:.:.::: . : ... .:. .:.: :.: FLJ000 PWVIVIGSFFSTCGAGLQSLTGAPRLLQAIARDGIVPFLQVFGHGKA---NGEPTWALLL 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 FLJ000 SWGLVQLVLLAGKLNTLAAVVTVFYLVAYAAVDLSCLSLEWASAPNFRPTFSLFSWHTCL . . . .: ..:...: ....:.:. : :.:.: .::.:: :... : . FLJ000 TVLICETGILIASLDSVAPILSMFFLMCYLFVNLACAVQTLLRTPNWRPRFKFYHWTLSF 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 FLJ000 LGVASCLLMMFLISPGAAGGSLLLMGLLAALLTARGGPSSWGYVSQALLFHQVRKYLLRL ::.. :: .::. : : ...:. : . . ::. . :: ..: .. .: :::. FLJ000 LGMSLCLALMFICSWYYALSAMLIAGCIYKYIEYRGAEKEWGDGIRGLSLNAARYALLRV 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 FLJ000 DVRKDHVKFWRPQLLLLVG-NPRGAL--P-LLRLANQLKKG-GLYVLGHVTLGD-LDSLP . :.: ::::.:.... . . :. : :: ...::: : :: ..: : : ::. FLJ000 EHGPPHTKNWRPQVLVMLNLDAEQAVKHPRLLSFTSQLKAGKGLTIVGSVLEGTYLDK-- 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 FLJ000 SDPVQPQYGAWLSLVDRAQVKAFVDLTLSPSVRQGAQHLLRISGLGGMKPNTLVLGFYDD .: ::.. ..:.: .:..: :.:.: .::.. .::::.: ::..... FLJ000 HMEAQRAEENIRSLMSTEKTKGFCQLVVSSSLRDGMSHLIQSAGLGGLKHNTVLMAW--- 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 FLJ000 APPQDHFLTDPAFSEPADSTREGSSPALSTLFPPPRAPGSPRALNPQDYVATVADALKMN :: : .. ..: .. ...: :: :. . FLJ000 ----------PA------SWKQEDNP-----------------FSWKNFVDTVRDTTAAH 500 510 560 570 580 590 600 610 FLJ000 KNVVLARASGALPPERLSRGSGGTSQLHHVDVWPLNLLRPRGGPGYVDVCGLFLLQMATI . ...:. ..: .. :.: :.::: . :: .:. . . 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KIAA13 ---CTSRRLTGLLDR-EVQAGRQALAAARGSWGPGPSSLTVPAIVVDEEDPGLASEGASE 280 290 300 310 320 330 690 700 710 720 730 740 FLJ000 AEAEALARSANALVRAQQGRGTGG-GPGGPEGGDAEGPITALTFLYLPRPPADPARYPRY .:.:. .. . : .:.. .: : .: ... ..:: .: . . . :.. ..: KIAA13 GEGEVSLEGPGLLGASQESSMAGRLGEAGGQAAPGQGP-SAES---IAQEPSQEEKFPGE 340 350 360 370 380 750 760 770 FLJ000 LALLETLTRDLGPTLLVHGVTPVTCTDL KIAA13 ALTGLPAATPEELALGARRKRFLPKVRAAGDGEATTPEERESPTVSPRGPRKSLVPGSPG 390 400 410 420 430 440 >>KIAA1284 ( 953 res) hh09454s1 (953 aa) initn: 98 init1: 59 opt: 109 Z-score: 98.1 bits: 29.2 E(): 2.9 Smith-Waterman score: 109; 30.328% identity (59.016% similar) in 122 aa overlap (370-487:372-491) 340 350 360 370 380 390 FLJ000 LLLMGLLAALLTARGGPSSWGYVSQALLFHQVRKYLLRLDVRKDHVKFWRPQ-LLLLVGN :: . : :. .. :: .:. . :::.: KIAA12 YPMSEASQKLKSVRGIFLTLCDMLENVTGTQVTSSSLLLNGKQIHVAYWKESDKLLLIGL 350 360 370 380 390 400 400 410 420 430 440 450 FLJ000 PRGALPLLRLANQLKKGGLYVLGHVTLGDLDSLPSDPVQ-PQYGAWLSLV-DRAQVKAFV : .:: :: :.... . .: . :.::: . . :. ...: .:: : . KIAA12 PAEEVPLPRLRNMIENV-IQTL-KFMYGSLDSAFCQIENVPRLDHFFNLFFQRALQPAKL 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 FLJ000 DLTLSPSVRQ-GAQHLLRISGLGGMKPNTLVLGFYDDAPPQDHFLTDPAFSEPADSTREG . :::..: :. . ...: :.. :: : KIAA12 HSSASPSAQQYDASSAVLLDNLPGVRWLTLPLEIKMELDMALSDLEAADFAELSEDYYDM 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 FLJ000 SSPALSTLFPPPRAPGSPRALNPQDYVATVADALKMNKNVVLARASGALPPERLSRGSGG KIAA12 RRLYTILGSSLFYKGYLICSHLPKDDLIDIAVYCRHYCLLPLAAKQRIGQLIIWREVFPQ 520 530 540 550 560 570 >>FLJ00135 ( 597 res) sh02493 (597 aa) initn: 140 init1: 66 opt: 104 Z-score: 95.8 bits: 28.1 E(): 3.9 Smith-Waterman score: 104; 31.373% identity (51.961% similar) in 102 aa overlap (216-312:79-175) 190 200 210 220 230 240 FLJ000 LLQEDYGFFRAISLWPPLVLIGIYATALSASMSSLIGASRILHALARDDLFGVILAPAKV :. . :.. .: : . : .:: . 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