# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -H -O./tmp/as00029.fasta.huge -Q ../query/FLJ00029.ptfa ./tmplib.10216 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 FLJ00029, 240 aa vs ./tmplib.10216 library 2210754 residues in 2457 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 3.6810+/-0.00357; mu= 16.5883+/- 0.242 mean_var=68.2929+/-15.006, 0's: 0 Z-trim: 20 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.155198 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 36, opt: 24, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2457) KIAA1921 ( 545 res) fg00938 ( 545) 391 96.5 2.9e-21 KIAA1687 ( 728 res) fh26020 ( 728) 350 87.5 2e-18 KIAA1490 ( 749 res) fj08103 ( 749) 350 87.5 2e-18 KIAA0795 ( 465 res) hk06104 ( 465) 325 81.6 7.5e-17 KIAA1129 ( 625 res) hg04330 ( 625) 304 77.1 2.3e-15 KIAA1340 ( 441 res) fj00164 ( 441) 284 72.4 4.2e-14 FLJ00393 ( 547 res) sj05490 ( 547) 269 69.2 4.9e-13 KIAA1354 ( 632 res) fj01502 ( 632) 260 67.2 2.2e-12 KIAA1309 ( 639 res) fh10381 ( 639) 250 65.0 1e-11 KIAA0132 ( 637 res) ha01449s1 ( 637) 242 63.2 3.5e-11 KIAA1900 ( 582 res) fk07650 ( 582) 237 62.0 7.3e-11 KIAA1384 ( 652 res) fj06146 ( 652) 229 60.3 2.7e-10 KIAA1378 ( 628 res) fj04831s1 ( 628) 221 58.5 9.1e-10 KIAA0850 ( 644 res) hk05995 ( 644) 218 57.8 1.5e-09 KIAA1842 ( 526 res) fj22905s1 ( 526) 204 54.6 1.2e-08 KIAA0469 ( 559 res) hg01666 ( 559) 171 47.2 2e-06 KIAA0711 ( 661 res) hg00358 ( 661) 170 47.1 2.6e-06 KIAA1489 ( 511 res) fj07905 ( 511) 165 45.8 4.8e-06 FLJ00127 ( 296 res) sh01274 ( 296) 135 38.8 0.00037 KIAA0534 ( 1028 res) hg03820s1 (1028) 111 34.2 0.031 KIAA1677 ( 521 res) fh18965 ( 521) 100 31.3 0.12 FLJ00112 ( 1192 res) as00112 (1192) 88 29.1 1.2 KIAA1774 ( 1041 res) hk10268 (1041) 87 28.8 1.3 KIAA1974 ( 362 res) ah03502 ( 362) 83 27.3 1.3 FLJ00122 ( 1736 res) sh00417 (1736) 88 29.3 1.5 KIAA1337 ( 1438 res) fh16696 (1438) 83 28.1 2.9 FLJ00182 ( 938 res) sj01566 ( 938) 79 26.9 4.3 FLJ00070 ( 1382 res) as00070 (1382) 80 27.4 4.6 KIAA0366 ( 1201 res) hh00124 (1201) 79 27.1 4.9 KIAA1455 ( 2450 res) ef02451 (2450) 79 27.5 7.4 KIAA0466 ( 1214 res) pg00625 (1214) 74 26.0 11 KIAA0742 ( 1338 res) hk04073s1 (1338) 74 26.0 11 KIAA0492 ( 167 res) hh01162 ( 167) 66 23.0 12 KIAA0313 ( 1508 res) hg00186 (1508) 74 26.1 12 KIAA0817 ( 2785 res) hg01392s2 (2785) 76 26.9 13 FLJ00322 ( 659 res) sh08187 ( 659) 70 24.7 14 KIAA0533 ( 1645 res) hg03784 (1645) 73 26.0 15 KIAA0199 ( 1283 res) ha03150s1 (1283) 72 25.6 15 KIAA1881 ( 1348 res) ah02284 (1348) 72 25.6 16 FLJ00284 ( 366 res) sh02281 ( 366) 67 23.7 16 KIAA2036 ( 1322 res) pf06513 (1322) 71 25.4 18 FLJ00264 ( 644 res) sj01648 ( 644) 68 24.3 19 KIAA1715 ( 429 res) hh02382 ( 429) 66 23.6 21 KIAA1988 ( 636 res) fk07519s1 ( 636) 67 24.0 22 KIAA0547 ( 696 res) hh00544 ( 696) 67 24.1 23 KIAA1331 ( 589 res) fh15253s1 ( 589) 66 23.7 25 KIAA0870 ( 1019 res) hk06970(revised) (1019) 68 24.5 25 KIAA0523 ( 468 res) hg01394 ( 468) 65 23.4 25 KIAA0749 ( 678 res) hk04328 ( 678) 66 23.8 27 KIAA0417 ( 710 res) hh00790 ( 710) 66 23.9 27 >>KIAA1921 ( 545 res) fg00938 (545 aa) initn: 296 init1: 296 opt: 391 Z-score: 475.0 bits: 96.5 E(): 2.9e-21 Smith-Waterman score: 391; 31.739% identity (59.130% similar) in 230 aa overlap (1-225:311-540) 10 20 FLJ000 SGGKE---TQHDVWKYNSSINKWIQIEYLN ::: : : ::: : : ...: . .. 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KIAA19 TTIYDPEKGNIKAGPNMNHSRQFCSAVVLDGKIYATGGIVSSEGPALGNMEAYEPTTNTW 470 480 490 500 510 520 210 220 230 240 FLJ000 TEECVLPRGVSHHGSVTIRKSYTHIRRIVPGAVSV : .: : .:: :.:.: KIAA19 TLLPHMPCPVFRHGCVVIKKYIQSG 530 540 >>KIAA1687 ( 728 res) fh26020 (728 aa) initn: 319 init1: 156 opt: 350 Z-score: 424.1 bits: 87.5 E(): 2e-18 Smith-Waterman score: 350; 26.923% identity (65.934% similar) in 182 aa overlap (10-186:456-636) 10 20 30 FLJ000 SGGKETQHDVWKYNSSINKWIQIEYLNIGRWRHKMVVLG . ::. :.:..: .: : . ..:. 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KIAA07 KRSAMGTVVLDGQIYVCGGYDGNSSLSSVETYSPETDKWTVVTSMSSNRSAAGVTVFEGR 270 280 290 300 310 320 90 100 110 120 130 140 FLJ000 LYVIGGGPNGKLATDKTQCYDPSTNKWSLKAAMPVEAKCIN-AVSFPDRIYVVGGA---- .:: .:: .: .... :. : : :.: .. .: . :.:. ....: :: KIAA07 IYV-SGGHDGLQIFSSVEHYNHHTATWHPAAGM-LNKRCRHGAASLGSKMFVCGGYDGSG 330 340 350 360 370 380 150 160 170 180 190 200 FLJ000 -MRALYAYSPLEDSWCLVTQLSHERASCGIAPCNNRLYITGGRDEKNEVIATVLCWDPEA . :: . :.:::.. . .:. ... .::: .:: : ... ...: .:::. KIAA07 FLSIAEMYSSVADQWCLIVPMHTRRSRVSLVASCGRLYAVGGYDGQSN-LSSVEMYDPET 390 400 410 420 430 210 220 230 240 FLJ000 QKLTEECVLPRGVSHHGSVTIRKSYTHIRRIVPGAVSV . : . . :.:.: . KIAA07 DCWT---FMAPMACHEGGVGVGCIPLLTI 440 450 460 >>KIAA1129 ( 625 res) hg04330 (625 aa) initn: 169 init1: 169 opt: 304 Z-score: 369.1 bits: 77.1 E(): 2.3e-15 Smith-Waterman score: 304; 27.885% identity (60.577% similar) in 208 aa overlap (2-200:345-550) 10 20 FLJ000 SGGKETQ--HDVWKYNSSINKWIQIEYLNIG ::. . ..: :. ..: :: : KIAA11 LLPLDQRLLIKNPRTKPRTPVSLPKVMIVVGGQAPKAIRSVECYDFEEDRWDQIAELPSR 320 330 340 350 360 370 30 40 50 60 70 80 FLJ000 RWRHKMVVLGGKVYVIGGFDGLQRINNVETYDPFHNCWSEAAPLLVHVSSFAATSHKKKL : : .: ..:.::..:::.: :. .:..:: .. :. : . . :...:. . : KIAA11 RCRAGVVFMAGHVYAVGGFNGSLRVRTVDVYDGVKDQWTSIASMQERRSTLGAAVLNDLL 380 390 400 410 420 430 90 100 110 120 130 140 FLJ000 YVIGGGPNGKLATDKTQCYDPSTNKWSLKAAMPVEAKCINAVSFPDRIYVVGG------- :..:: .:. . ... :. .::.: . : : .. . ... ..:.::: KIAA11 YAVGGF-DGSTGLASVEAYSYKTNEWFFVAPMNTRRSSVGVGVVEGKLYAVGGYDGASRQ 440 450 460 470 480 490 150 160 170 180 190 200 FLJ000 AMRALYAYSPLEDSWCLVTQLSHERASCGIAPCNNRLYITGGRDEKNEVIATVLCWDPEA . .. :.: . : :...: .:.. :.. ...:: :::.: : .: .:: KIAA11 CLSTVEQYNPATNEWIYVADMSTRRSGAGVGVLSGQLYATGGHD-GPLVRKSVEVYDPGT 500 510 520 530 540 550 210 220 230 240 FLJ000 QKLTEECVLPRGVSHHGSVTIRKSYTHIRRIVPGAVSV KIAA11 NTWKQVADMNMCRRNAGVCAVNGLLYVVGGDDGSCNLASVEYYNPVTDKWTLLPTNMSTG 560 570 580 590 600 610 >>KIAA1340 ( 441 res) fj00164 (441 aa) initn: 230 init1: 130 opt: 284 Z-score: 346.5 bits: 72.4 E(): 4.2e-14 Smith-Waterman score: 284; 36.296% identity (62.222% similar) in 135 aa overlap (13-147:210-339) 10 20 30 40 FLJ000 SGGKETQHDVWKYNSSINKWIQIEYLNIGRWRHKMVVLGGKV :: : :.:.:. .: : :.:....:. KIAA13 RGYGSAILDNYLFIVGGYRITSQEISAAHSYNPSTNEWLQVASMNQKRSNFKLVAVNSKL 180 190 200 210 220 230 50 60 70 80 90 100 FLJ000 YVIGGFDGLQRINNVETYDPFHNCWSEAAPLLVHVSSFAATSHKKKLYVIGGGPNGKLAT :.::: : ..::: :.: .. :. .::: .. :.: : :.::::: . KIAA13 YAIGG----QAVSNVECYNPEQDAWNFVAPLPNPLAEFSACECKGKIYVIGGYTTRDRNM 240 250 260 270 280 290 110 120 130 140 150 160 FLJ000 DKTQCYDPSTNKWSLKAAMPVEAKCINAVSFPDRIYVVGGAMRALYAYSPLEDSWCLVTQ . : : ::.. :.: . :. . . :: . ::.::: .. : KIAA13 NILQ-YCPSSDMWTLFETCDVHIRKQQMVSVEETIYIVGGCLHELGPNRRSSQSEDMLTV 300 310 320 330 340 350 170 180 190 200 210 220 FLJ000 LSHERASCGIAPCNNRLYITGGRDEKNEVIATVLCWDPEAQKLTEECVLPRGVSHHGSVT KIAA13 QSYNTVTRQWLYLKENTSKSGLNLTCALHNDGIYIMSRDVTLSTSLEHRVFLKYNIFSDS 360 370 380 390 400 410 >>FLJ00393 ( 547 res) sj05490 (547 aa) initn: 325 init1: 113 opt: 269 Z-score: 327.4 bits: 69.2 E(): 4.9e-13 Smith-Waterman score: 336; 27.511% identity (59.389% similar) in 229 aa overlap (1-227:293-512) 10 20 30 FLJ000 SGGKETQHDVWKYNSSINKWIQIEYLNIGR : :.. ::.::::.:.: .. . .: FLJ003 QWRYLAEFPDHLGGGYSIVALGNDIYVTGGSDGSRLYDCVWRYNSSVNEWAEVAPMLKAR 270 280 290 300 310 320 40 50 60 70 80 90 FLJ000 WRHKMVVLGGKVYVIGGFDGLQRINNVETYDPFHNCWSEAAPLLVHVSSFAATSHKKKLY :. :: : .::... ...: :: . : :. ... ..:. . .:: FLJ003 EYHSSSVLDGLLYVVAA-------DSTERYDHTTDSWEALQPMTYPMDNCSTTACRGRLY 330 340 350 360 370 100 110 120 130 140 FLJ000 VIGGGPNGKLATDKTQCYDPSTNKWSLK--AAMPVEAKCINAVSFPDRIYVVGGAMRALY .::. :: : :::::.:. ::: . .: . ..... .: : . 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KIAA13 FHLSALKGHLYAVGGRSAAGELATVECYNPRMNEWSYVAKMSEPHYGHAGTVYGGLMYIS 410 420 430 440 450 460 100 110 120 130 140 FLJ000 GGGPNGKLATDKTQCYDPSTNKWSLKAAMPVEA--KCINAVSFPDRIYVVGGA------- :: . . .. .:.::.:.:: :: : . .:. .:. :..::.:: KIAA13 GGITHDTFQ-NELMCFDPDTDKWMQKAPMTTVRGLHCMCTVG--DKLYVIGGNHFRGTSD 470 480 490 500 510 520 150 160 170 180 190 FLJ000 ---MRALYAYSPLEDSWCLVTQLSHERASCGIAPCNNRLYITGGRDEKNE-VIATVLCWD . . ::: :.: .. . . ... :.: .:..:..:: . .:. .. : .: KIAA13 YDDVLSCEYYSPTLDQWTPIAAMLRGQSDVGVAVFENKIYVVGGYSWNNRCMVEIVQKYD 530 540 550 560 570 580 200 210 220 230 240 FLJ000 PEAQKLTEECVLPRGVSHHGSVTIRKSYTHIRRIVPGAVSV :: .. . ::... 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