# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -H -O./tmp/as00051.fasta.huge -Q ../query/FLJ00051.ptfa ./tmplib.10216 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 FLJ00051, 462 aa vs ./tmplib.10216 library 2210532 residues in 2457 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 3.6631+/-0.00417; mu= 23.4416+/- 0.282 mean_var=110.8582+/-25.269, 0's: 0 Z-trim: 13 B-trim: 7 in 1/39 Lambda= 0.121812 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2457) FLJ00073 ( 462 res) as00073 ( 462) 3065 549.1 2.6e-157 FLJ00055 ( 977 res) as00055 ( 977) 2937 527.2 2.2e-150 FLJ00411 ( 437 res) sf00010 ( 437) 243 53.1 5e-08 KIAA0230 ( 1496 res) ha02538 (1496) 209 48.1 5.5e-06 KIAA1867 ( 779 res) fj18636 ( 779) 179 42.3 0.00016 KIAA1132 ( 2092 res) hh01132s1 (2092) 176 42.6 0.00036 KIAA0657 ( 1237 res) hk01859s1 (1237) 167 40.6 0.00084 KIAA1355 ( 1189 res) fj01564 (1189) 164 40.0 0.0012 KIAA1568 ( 1380 res) fh22308 (1380) 163 40.0 0.0014 FLJ00333 ( 437 res) sj04245 ( 437) 142 35.4 0.011 KIAA1496 ( 920 res) fj09513 ( 920) 135 34.7 0.036 KIAA1465 ( 785 res) fh13187 ( 785) 124 32.7 0.13 KIAA1297 ( 2242 res) fg03883 (2242) 127 34.0 0.14 KIAA0343 ( 1187 res) hg01457 (1187) 119 32.1 0.29 KIAA1233 ( 1023 res) fh08611 (1023) 109 30.3 0.9 KIAA0806 ( 1073 res) hk04165(revised) (1073) 108 30.1 1 KIAA1773 ( 3434 res) hj00752s2 (3434) 109 31.2 1.6 KIAA1484 ( 700 res) fj06928 ( 700) 102 28.7 1.8 KIAA1628 ( 980 res) fh14247(revised) ( 980) 103 29.2 1.8 KIAA1580 ( 640 res) fj04979 ( 640) 97 27.8 3.2 KIAA0992 ( 772 res) hk07554 ( 772) 97 27.9 3.4 KIAA0974 ( 565 res) hj06874 ( 565) 90 26.4 7 KIAA0466 ( 1214 res) pg00625 (1214) 92 27.4 7.7 KIAA0518 ( 650 res) hg01059 ( 650) 88 26.2 9.5 KIAA0656 ( 912 res) hk01789 ( 912) 89 26.7 9.8 KIAA1436 ( 924 res) hh15451 ( 924) 89 26.7 9.9 KIAA0514 ( 483 res) hf00310 ( 483) 86 25.6 11 KIAA0407 ( 2143 res) hg01339 (2143) 90 27.5 13 KIAA0309 ( 3053 res) hg00096s1 (3053) 91 28.0 13 KIAA0512 ( 710 res) hf00239 ( 710) 85 25.7 14 KIAA0473 ( 937 res) hh00220 ( 937) 86 26.1 14 FLJ00161 ( 596 res) sh06688 ( 596) 84 25.4 15 KIAA0865 ( 1900 res) hk06640y1 (1900) 88 27.1 15 KIAA0807 ( 1329 res) hk04449(revised) (1329) 86 26.4 17 KIAA1539 ( 543 res) fg02356 ( 543) 82 25.0 18 KIAA1497 ( 730 res) hg01608 ( 730) 83 25.4 18 FLJ00041 ( 330 res) as00041 ( 330) 80 24.3 19 KIAA1481 ( 1380 res) fj05724 (1380) 85 26.3 19 KIAA1883 ( 1480 res) fh02249 (1480) 85 26.3 20 KIAA1477 ( 870 res) fj04927 ( 870) 83 25.6 20 KIAA0758 ( 1370 res) hh15259 (1370) 84 26.1 22 KIAA0525 ( 951 res) hg02148s1 ( 951) 82 25.5 23 KIAA1795 ( 572 res) fj17734 ( 572) 80 24.7 24 FLJ00231 ( 354 res) sj06637 ( 354) 78 24.0 24 KIAA1526 ( 963 res) fj04743(revised) ( 963) 81 25.3 27 KIAA0432 ( 827 res) hh01859s1 ( 827) 80 25.0 28 KIAA0680 ( 635 res) hk02746 ( 635) 79 24.6 28 KIAA1744 ( 855 res) pj01516 ( 855) 80 25.0 28 FLJ00198 ( 677 res) sj03504 ( 677) 79 24.7 29 KIAA1644 ( 132 res) fg07060 ( 132) 73 22.3 29 >>FLJ00073 ( 462 res) as00073 (462 aa) initn: 3065 init1: 3065 opt: 3065 Z-score: 2917.4 bits: 549.1 E(): 2.6e-157 Smith-Waterman score: 3065; 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KIAA02 TPVFASIPSDTTVEVGANVQLPCSSQGEPEPAITWNKDGVQVTESGKFHISPEGFLTIND 550 560 570 580 590 600 320 330 340 350 360 370 FLJ000 VARAQAGMYHCLAELPTGVAASAPVMLRVLYPPKTPTMMVFVEPEGGLRGILDCRVDSEP :. :.:: :.:.:. : .::. ..: : : KIAA02 VGPADAGRYECVARNTIG-SASVSMVLSVNVPDVSRNGDPFVATSIVEAIATVDRAINST 610 620 630 640 650 380 390 400 410 420 430 FLJ000 LASLTLHLGSRLVASSQPQGAPAEPHIHVLASPNALRVDIEALRPSDQGEYICSASNVLG KIAA02 RTHLFDSRPRSPNDLLALFRYPRDPYTVEQARAGEIFERTLQLIQEHVQHGLMVDLNGTS 660 670 680 690 700 710 >>KIAA1867 ( 779 res) fj18636 (779 aa) initn: 122 init1: 75 opt: 179 Z-score: 174.6 bits: 42.3 E(): 0.00016 Smith-Waterman score: 199; 25.527% identity (46.370% similar) in 427 aa overlap (37-434:116-508) 10 20 30 40 50 60 FLJ000 TVDSRPPAQLALSHAGRLLASSTAASVPNTLRLELRGPQPRDEGFYSCSARSPLGQANTS :: ::. :.. : :.: . : : KIAA18 LALGVGRDLSSYPQYLVVGNHLSGEHHLKILRAELQ-----DDAVYECQA---IQAAIRS 90 100 110 120 130 70 80 90 100 110 120 FLJ000 LELRLEGVRVILAPEAAVPEGAP-ITVTCADPAAHAPTLYTWYHNGRWLQEGPAASLSFL :: :.. :. : :.: :.. .:: .: :.. ::::. .: KIAA18 RPARLT---VLVPPDDPVILGGPVISLRAGDPL----NLTCHADNAK-----PAASIIWL 140 150 160 170 180 130 140 150 160 170 180 FLJ000 VATRAHAGAYSCQAQDAQGTRSSRPAALQVLYAPQDAVLSSFRDSRARSMAV-----IQC .. :: .. .: : : ..: . .: :. .. :: . :. . KIAA18 RKGEVINGATYSKTLLRDGKRESIVSTL--FISPGDVENGQSIVCRATNKAIPGGKETSV 190 200 210 220 230 240 190 200 210 220 230 FLJ000 TVDSEPPAELALSHDGKVLATSSGV--HSLASGTGHVQVARNALRLQVQDVPAG------ :.: . : . :: . . . .. : : :... : : : : :. .: KIAA18 TIDIQHPPLVNLSVEPQPVLEDNVVTFHCSAKANPAVTQYRWAKRGQIIKEASGEVYRTT 250 260 270 280 290 300 240 250 260 270 280 FLJ000 -DDTYV-----CTAQNLLGSISTIGRLQVE-GARVVAEP-GLDVPEGAALNLSCRLLGGP : :: : . : ::: . ..: : :...:: .: : :. .:: :.: KIAA18 VDYTYFSEPVSCEVTNALGSTNLSRTVDVYFGPRMTTEPQSLLVDLGSDAIFSCAWTGNP 310 320 330 340 350 360 290 300 310 320 330 340 FLJ000 GPVGNSTFAWFWNDRRLHAEPVPTLAFTHVARAQAGMYHCLAELPTGVAASAPVMLRVLY . :..:. . ::.. : . .:: : : : .: :. : : : KIAA18 ----SLTIVWMKRGSGVVLSNEKTLTLKSVRQEDAGKYVCRAVVPRVGAGEREVTLTVNG 370 380 390 400 410 350 360 370 380 390 FLJ000 PPKTPTMMVFVEPEGGLRGILDCRVDSEPLASLTLHLGSRLVASSQPQG-------APAE :: . .. . : .: . : . : : . .. : : .: . : KIAA18 PPIISSTQT-QHALHGEKGQIKCFIRSTPPPDRIAWSWKENVLESGTSGRYTVETISTEE 420 430 440 450 460 470 400 410 420 430 440 450 FLJ000 PHIHVLASPNALRVDIEALRPSDQGEYICSASNVLGSASTSTYFGVRGEGRGLHLPGHSA : .:. : .:.:.... : :.: : .:: KIAA18 GVISTLTISNIVRADFQTI-------YNCTAWNSFGSDTEIIRLKEQGSEMKSGAGLEAE 480 490 500 510 520 530 460 FLJ000 QKPSS KIAA18 SVPMAVIIGVAVGAGVAFLVLMATIVAFCCARSQRNLKGVVSAKNDIRVEIVHKEPASGR 540 550 560 570 580 590 >>KIAA1132 ( 2092 res) hh01132s1 (2092 aa) initn: 136 init1: 95 opt: 176 Z-score: 168.3 bits: 42.6 E(): 0.00036 Smith-Waterman score: 274; 23.173% identity (52.610% similar) in 479 aa overlap (6-455:286-737) 10 20 30 FLJ000 LALVLCTVDSRPPAQLALSHAGRLLASSTAASVPN ::... : . . :: : ... . KIAA11 SVTDPAESIPTILDGFHSQEVWAGHTVELPCTASGYPIPAIRWLKDGRPLPADSRWT-KR 260 270 280 290 300 310 40 50 60 70 80 90 FLJ000 TLRLELRGPQPRDEGFYSCSARSPLGQAN-TSLELRLEGVRVILAPEA-AVPEGAPITVT : . . .: : : : . . .:.:. :.. . .. ..: :.:. . :. . .. KIAA11 ITGLTISDLRTEDSGTYICEVTNTFGSAEATGILMVIDPLHVTLTPKKLKTGIGSTVILS 320 330 340 350 360 370 100 110 120 130 140 FLJ000 CADPAAHAPTLYTWYHNGRWLQEGPAASL------SFLV--ATRAHAGAYSCQAQDAQGT :: .. :. ::.: . . : :. ..:. : ..:.:::.: : : KIAA11 CALTGSPEFTIR-WYRNTELVLPDEAISIRGLSNETLLITSAQKSHSGAYQCFA-----T 380 390 400 410 420 150 160 170 180 190 200 FLJ000 RSSRPAALQVLYAPQDA---VLSSFRDSRARS--MAVIQCTVDSEPPAELALSHDGKVLA :... : .. : .:. ..::: .. . . ..:.. . :: .. . : . .. KIAA11 RKAQTAQDFAIIALEDGTPRIVSSFSEKVVNPGEQFSLMCAAKGAPPPTVTWALDDEPIV 430 440 450 460 470 480 210 220 230 240 250 FLJ000 TSSGVHSLASGT---GHVQVARNALRLQVQDVPAGDDTYVCTAQNLLGSISTIGRLQVEG . : : . : : . :. :..: .: .: :::.::.:: .:..:.: KIAA11 RD-GSHRTNQYTMSDGTTISHMNVTGPQIRD--GG--VYRCTARNLVGSAEYQARINVRG 490 500 510 520 530 540 260 270 280 290 300 310 FLJ000 A-RVVAEPGLDVPEGAALNLSCRLLGGPGPVGNSTFAWFWNDRRL---HAEPV---PTLA . : .. . : ..::..: : .. :. . : : . : :: KIAA11 PPSIRAMRNITAVAGRDTLINCRVIGYP----YYSIKWYKDALLLPDNHRQVVFENGTLK 550 560 570 580 590 320 330 340 350 360 FLJ000 FTHVARAQ-AGMYHCLAELPTGVAASAPVMLRVLYPPKTPTMMVFVEPEGGLRGIL--DC .: : ... : : : . . .. : : . : :: .. : : ... .: : KIAA11 LTDVQKGMDEGEYLCSVLIQPQLSISQSVHVAVKVPP---LIQPFEFPPASIGQLLYIPC 600 610 620 630 640 650 370 380 390 400 410 420 FLJ000 RVDSEPLA-SLTLHLGSRLVASSQPQGAPAEPHIHVLASPNALRVDIEALRPSDQGEYIC :.: . .: . .... :. .:. : . . ..: :... .:. . :.: : KIAA11 VVSSGDMPIRITWRKDGQVIISG--SGVTIESK-EFMSS---LQISSVSLKHN--GNYTC 660 670 680 690 700 430 440 450 460 FLJ000 SASNVLGSASTSTYFGVRGEGRGLHLPGHSAQKPSS :::. ...: . :: : . :.. KIAA11 IASNAAATVSRERQLIVRVPPRFVVQPNNQDGIYGKAGVLNCSVDGYPPPKVMWKHAKGS 710 720 730 740 750 760 >>KIAA0657 ( 1237 res) hk01859s1 (1237 aa) initn: 103 init1: 87 opt: 167 Z-score: 161.6 bits: 40.6 E(): 0.00084 Smith-Waterman score: 220; 29.680% identity (55.251% similar) in 219 aa overlap (38-240:881-1087) 10 20 30 40 50 60 FLJ000 VDSRPPAQLALSHAGRLLASSTAASVPNTLRLELRGPQPRDEGFYSCSARSPLGQANTSL :: : . ::.: : . :.: . . .... KIAA06 REDAPVRWYKDGLEVEESEALVLERDGPRCRLVLPAAQPEDGGEFVCDAGDDSAFFTVTV 860 870 880 890 900 910 70 80 90 100 110 FLJ000 E---LRLEGVRVILAPEAAVPEGAPITVTCADPAAHAPTLYTWYHNGRWLQEG------- ... .... .: ..: : :....: : ::.. : :::: .::: KIAA06 TEPPVQFLALETTPSPLCVAP-GEPVVLSCELSRAGAPVV--WSHNGRPVQEGEGLELHA 920 930 940 950 960 120 130 140 150 160 170 FLJ000 --PAASLSFLVATRAHAGAYSCQAQDAQGTRSSRPAALQVLYAPQDAVLSSFRDSRARSM : : . .: :::: :.::. : :. : ..:: : .: ..:.:: KIAA06 EGPRRVLCIQAAGPAHAGLYTCQSGAAPGA-PSLSFTVQVAEPPVRVVAPEAAQTRVRST 970 980 990 1000 1010 1020 180 190 200 210 220 230 FLJ000 --AVIQCTVD-SEPPAELALSHDGKVLATSSGVHSLASGTGHVQVARNALRLQVQDVPAG . .. .: : : . . .::. ::... :. .: ::..:: :: . .: KIAA06 PGGDLELVVHLSGPGGPVRWYKDGERLASQGRVQLEQAG------ARQVLR--VQGARSG 1030 1040 1050 1060 1070 240 250 260 270 280 290 FLJ000 D-DTYVCTAQNLLGSISTIGRLQVEGARVVAEPGLDVPEGAALNLSCRLLGGPGPVGNST : :.: : KIAA06 DAGEYLCDAPQDSRIFLVSVEEPLLVKLVSDLTPLTVHEGDDATFRCEVSPPDADVTWLR 1080 1090 1100 1110 1120 1130 >>KIAA1355 ( 1189 res) fj01564 (1189 aa) initn: 146 init1: 85 opt: 164 Z-score: 158.9 bits: 40.0 E(): 0.0012 Smith-Waterman score: 245; 23.480% identity (47.799% similar) in 477 aa overlap (6-447:168-615) 10 20 30 FLJ000 LALVLCTVDSRPPAQLALSHAGRLLASSTAASVPN :.. . : ... . :. :... . . KIAA13 VHLTVNSPPQFQETPPAVLEVQELEPVTLRCVARGSPLPHVTWKLRGKDLGQGQGQVQVQ 140 150 160 170 180 190 40 50 60 70 80 90 FLJ000 TLRLELRGPQPRDEGFYSCSARSPLGQANTSLELRLEGVRVILAP--EAAVPEGAPITVT . :..: . . : :.:.: : :.:. . .: . : ::..: ...: . .... KIAA13 NGTLRIRRVERGSSGVYTCQASSTEGSATHATQLLVLGPPVIVVPPKNSTVNASQDVSLA 200 210 220 230 240 250 100 110 120 130 140 FLJ000 CADPAAHAPTLYTWYHNG-------------RWLQEGPAASLSFLVATRAHAGAYSCQAQ : : : :.:.... : : .: :: .:.. :: :.: . KIAA13 CHAEAYPANLTYSWFQDNINVFHISRLQPRVRILVDG---SLRLLATQPDDAGCYTCVPS 260 270 280 290 300 310 150 160 170 180 190 FLJ000 DAQGTRSSRPAALQVLYAPQDAVLSSFRDSRARSMAVIQCTVDSEPPAEL-ALSHDGKVL .. : : : ::: : ... .::.: : ..:: . . ..:::.: KIAA13 NGLLHPPSASAYLTVLYPAQVTAMPPETPLPIGMPGVIRCPVRANPPLLFVSWTKDGKAL 320 330 340 350 360 370 200 210 220 230 240 250 FLJ000 ATSSGVHSLASGTGHVQVARNALRLQVQDVPAGDDTYVCTAQNLLGSI--STIGRLQVEG .: . : : ....: . . . : . : :: : ::. : . :. ... KIAA13 -------QLDKFPGWSQGTEGSLIIALGNEDALGE-YSCTPYNSLGTAGPSPVTRVLLKA 380 390 400 410 420 260 270 280 290 300 310 FLJ000 ARVVAE-PGLDVPE--GAALNLSCRLLGGPGPVGNSTFAWFWNDRRLHAEPV----PTLA . : : . . : : . : : : :: .: : :... .: KIAA13 PPAFIERPKEEYFQEVGRELLIPCSAQGDPPPV----VSWTKVGRGLQGQAQVDSNSSLI 430 440 450 460 470 480 320 330 340 350 360 FLJ000 FTHVARAQAGMYHCLAELPTG-VAASAPVMLRVLYPPKTPTMMVFVEPEG-------GLR . ... : ..: : .. ::.:. :.. : . .. : . :.: :. KIAA13 LRPLTKEAHGHWECSASNAVARVATSTNVYVLGTSPHVVTNVSVVALPKGANVSWEPGFD 490 500 510 520 530 540 370 380 390 400 410 420 FLJ000 GILDCR--VDSEPLASLTLHLGSRLVASSQPQGAPAEPHIHVLASPNALRVDIEALRPSD : : : :::. .. :. . : :: :.: . .:.: KIAA13 GGYLQRFSVWYTPLAKRPDRMHHDWVSLAVPVGAA-----HLL---------VPGLQPHT 550 560 570 580 430 440 450 460 FLJ000 QGEYICSASNVLGSASTSTYFGVRGEGRGLHLPGHSAQKPSS : .. :.: :::. : :: KIAA13 QYQFSVLAQNKLGSGPFSEIVLSAPEGLPTTPAAPGLPPTEIPPPLSPPRGLVAVRTPRG 590 600 610 620 630 640 >>KIAA1568 ( 1380 res) fh22308 (1380 aa) initn: 117 init1: 66 opt: 163 Z-score: 157.4 bits: 40.0 E(): 0.0014 Smith-Waterman score: 308; 24.027% identity (51.259% similar) in 437 aa overlap (42-447:101-511) 20 30 40 50 60 FLJ000 PPAQLALSHAGRLLASSTAASVPNTLRLELRGPQPRDEGFYSCSARSPLGQA---NTSLE : .: ::: : : ::. ::.: :.::: KIAA15 ERVETDKDDPRSHRMLLPSGSLFFLRIVHGRRSKP-DEGSYVCVARNYLGEAVSRNASLE 80 90 100 110 120 70 80 90 100 110 120 FLJ000 LRLEGVRVILAP-EAAVPEGAPITVTCADPAAHA-PTLYTWYHNGRWLQEGP------AA . : : ...: : : . : : .: ::.: : .. ... .. KIAA15 VALLRDDFRQNPTDVVVAAGEPAILECQPPRGHPEPTIY-WKKDKVRIDDKEERISIRGG 130 140 150 160 170 180 130 140 150 160 170 FLJ000 SLSFLVATRAHAGAYSCQAQDAQGTRSSRPAALQVLYAPQDAVLSSFRDSRARSMAV-IQ .: . . .. :: :.: . . : :.: :: : :. : . . . . :: .. KIAA15 KLMISNTRKSDAGMYTCVGTNMVGERDSDPAELTVFERPT-FLRRPINQVVLEEEAVEFR 190 200 210 220 230 240 180 190 200 210 220 230 FLJ000 CTVDSEPPAELALSHDGKVLATSSGVHSLASGTGHVQVARNALRLQVQDVPAGDD-TYVC : :...: . ..: : :. .. .. :... . . :. ::.: KIAA15 CQVQGDPQPTVRWKKDDADLPR-----------GRYDI-KDDYTLRIKKTMSTDEGTYMC 250 260 270 280 290 240 250 260 270 280 290 FLJ000 TAQNLLGSISTIGRLQVEGA-RVVAEPGLD-VPEGAALNLSCRLLGGPGPV------GNS :.: .:.. . . : :.. . :..: . : .: .... :. :.: :. :.. KIAA15 IAENRVGKMEASATLTVRAPPQFVVRPRDQIVAQGRTVTFPCETKGNPQPAVFWQKEGSQ 300 310 320 330 340 350 300 310 320 330 340 FLJ000 TFAWFWN-----DRRLHAEPVPTLAFTHVARAQAGMYHCLAELPTG-VAASAPVMLRVLY .. : : . : . :. :..:.. :..::.: : : .: . :.: . . . KIAA15 NLL-FPNQPQQPNSRCSVSPTGDLTITNIQRSDAGYYICQALTVAGSILAKAQLEVTDVL 360 370 380 390 400 410 350 360 370 380 390 400 FLJ000 PPKTPTMMVFVEPEGGL----RGILDCRVDSEPLASLTLHLGSRLVASSQPQGAPAEPHI . : ... . : ..: :.. ..:: .. . . .:... : KIAA15 TDRPPPIILQGPANQTLAVDGTALLKCKATGDPLPVISWLKEGFTFPGRDPRATIQEQGT 420 430 440 450 460 470 410 420 430 440 450 460 FLJ000 HVLASPNALRVDIEALRPSDQGEYICSASNVLGSASTSTYFGVRGEGRGLHLPGHSAQKP ..:. :: :: : : : :.. : .: :. . : : KIAA15 ----------LQIKNLRISDTGTYTCVATSSSGETSWSAVLDVTESGATISKNYDLSDLP 480 490 500 510 520 FLJ000 SS KIAA15 GPPSKPQVTDVTKNSVTLSWQPGTPGTLPASAYIIEAFSQSVSNSWQTVANHVKTTLYTV 530 540 550 560 570 580 >>FLJ00333 ( 437 res) sj04245 (437 aa) initn: 80 init1: 57 opt: 142 Z-score: 141.4 bits: 35.4 E(): 0.011 Smith-Waterman score: 174; 25.887% identity (49.291% similar) in 282 aa overlap (80-342:33-297) 50 60 70 80 90 100 FLJ000 GFYSCSARSPLGQANTSLELRLEGVRVILAPEAAVPEGAPITVTCADPAAHAPTLYTWYH : : . : . . : : . : :: .:: FLJ003 ELFLILKIHVSLTHFLSQFQCLAPSSPSGFPGAQAVVGDLLELHCEAPRGSPPILYWFYH 10 20 30 40 50 60 110 120 130 140 150 160 FLJ000 NGRWLQEGPAAS---LSF-LVATRAHAGAYSCQAQDAQGTRSSRPAALQVLYAPQDAVLS . : . : : :: : : :.: :::.:... .. : .:.:. .: . . 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