# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -H -O./tmp/as00105.fasta.huge -Q ../query/FLJ00105.ptfa ./tmplib.10216 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 FLJ00105, 721 aa vs ./tmplib.10216 library 2210273 residues in 2457 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.1438+/-0.00371; mu= 19.2642+/- 0.251 mean_var=87.7189+/-18.916, 0's: 0 Z-trim: 8 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.136939 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2457) FLJ00098 ( 780 res) as00098 ( 780) 4789 956.8 0 KIAA1176 ( 1101 res) hg02851a (1101) 3214 645.9 7.4e-186 FLJ00100 ( 672 res) as00100 ( 672) 650 139.0 1.7e-33 FLJ00010 ( 772 res) as00010 ( 772) 650 139.1 1.9e-33 FLJ00379 ( 487 res) sj00523 ( 487) 415 92.4 1.3e-19 FLJ00009 ( 540 res) as00009 ( 540) 415 92.4 1.4e-19 FLJ00059 ( 477 res) as00059 ( 477) 328 75.2 2e-14 KIAA1613 ( 686 res) fj12845 ( 686) 123 34.9 0.038 KIAA1565 ( 1313 res) bf00184 (1313) 101 31.0 1.1 KIAA1164 ( 390 res) hk00541 ( 390) 89 27.8 2.9 FLJ00016 ( 349 res) as00016 ( 349) 88 27.6 3.1 KIAA1847 ( 564 res) bm00425 ( 564) 89 28.1 3.6 KIAA1994 ( 1117 res) bh00052 (1117) 88 28.3 6 KIAA1166 ( 165 res) hk01743 ( 165) 80 25.5 6.1 KIAA0707 ( 630 res) hh00286(revised) ( 630) 85 27.3 6.6 KIAA0803 ( 1708 res) hj03049(revised) (1708) 89 28.7 6.7 KIAA0287 ( 1523 res) fg06332 (1523) 87 28.3 8.3 KIAA1467 ( 432 res) fj01477 ( 432) 81 26.3 9.2 KIAA1664 ( 920 res) fj04751s1 ( 920) 84 27.4 9.4 KIAA0881 ( 1064 res) hk07534 (1064) 84 27.5 10 KIAA1604 ( 937 res) fj10713 ( 937) 83 27.2 11 KIAA1671 ( 364 res) hh02164 ( 364) 78 25.6 13 FLJ00279 ( 563 res) sh01691 ( 563) 79 26.1 14 KIAA1105 ( 730 res) hh02687(revised) ( 730) 80 26.4 14 KIAA0890 ( 1210 res) hk08057 (1210) 81 27.0 17 KIAA0578 ( 1542 res) bf00990 (1542) 82 27.3 17 KIAA0632 ( 727 res) hh01900 ( 727) 78 26.0 19 KIAA0413 ( 1237 res) hh00077s1 (1237) 80 26.8 19 FLJ00153 ( 497 res) sh06127 ( 497) 76 25.4 20 KIAA1028 ( 501 res) fh00176s1 ( 501) 76 25.4 20 KIAA0153 ( 638 res) ha00521 ( 638) 77 25.8 20 KIAA1907 ( 1737 res) ah00504 (1737) 81 27.2 20 KIAA0085 ( 269 res) ha01520 ( 269) 73 24.4 21 KIAA1799 ( 610 res) fj20761 ( 610) 76 25.5 22 KIAA0655 ( 1083 res) hk01768 (1083) 78 26.3 23 FLJ00231 ( 354 res) sj06637 ( 354) 73 24.6 25 KIAA0113 ( 636 res) ha01652s1 ( 636) 75 25.4 26 KIAA0605 ( 1031 res) hg03238a (1031) 77 26.1 26 KIAA1783 ( 1560 res) fg01285 (1560) 78 26.5 29 KIAA0359 ( 760 res) hh00048 ( 760) 75 25.5 29 KIAA1843 ( 1778 res) bf02364 (1778) 78 26.6 31 FLJ00255 ( 733 res) sj09579 ( 733) 74 25.3 32 KIAA0266 ( 766 res) ha02755 ( 766) 74 25.3 33 KIAA1589 ( 816 res) fj08951 ( 816) 74 25.3 34 KIAA0184 ( 863 res) ha02918 ( 863) 74 25.4 35 KIAA0033 ( 335 res) ha02009 ( 335) 70 24.0 36 KIAA0958 ( 428 res) hj05707 ( 428) 71 24.3 36 KIAA1816 ( 1162 res) fh16716 (1162) 75 25.7 36 KIAA0204 ( 1164 res) ha02801 (1164) 75 25.7 36 KIAA0751 ( 1200 res) hk04424 (1200) 75 25.8 37 >>FLJ00098 ( 780 res) as00098 (780 aa) initn: 4789 init1: 4789 opt: 4789 Z-score: 5113.2 bits: 956.8 E(): 0 Smith-Waterman score: 4789; 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FLJ001 LGVASCLLMMFLISPGAAGGSLLLMGLLAALLTARGGPSSWGYVSQALLFHQVRKYLLRL 220 230 240 250 260 270 320 330 340 350 360 370 FLJ001 EHGPPHTKNWRPQVLVMLNLDAEQAVKHPRLLSFTSQLKAGKGLTIVGSVLEGTYLDK-- . :.: ::::.:.... . . :. : :: ...::: : :: ..: : : ::. FLJ001 DVRKDHVKFWRPQLLLLVG-NPRGAL--P-LLRLANQLKKG-GLYVLGHVTLGD-LDSLP 280 290 300 310 320 330 380 390 400 410 420 430 FLJ001 HMEAQRAEENIRSLMSTEKTKGFCQLVVSSSLRDGMSHLIQSAGLGGLKHNTVLMAW--- .: ::.. ..:.: .:..: :.:.: .::.. .::::.: ::..... FLJ001 SDPVQPQYGAWLSLVDRAQVKAFVDLTLSPSVRQGAQHLLRISGLGGMKPNTLVLGFYDD 340 350 360 370 380 390 440 450 460 FLJ001 ----------PA------SWKQEDNP-----------------FSWKNFVDTVRDTTAAH :: : .. ..: .. ...: :: :. . FLJ001 APPQDHFLTDPAFSEPADSTREGSSPALSTLFPPPRAPGSPRALNPQDYVATVADALKMN 400 410 420 430 440 450 470 480 490 500 FLJ001 QALLVAKNVDSFPQNQERFGGG------HIDVW---WIVHDGG---------MLMLLPFL . ...:. ..: .. :.: :.::: . :: .:. . . 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FLJ000 LGVASCLLMMFLISPGAAGGSLLLMGLLAALLTARGGPSSWGYVSQALLFHQVRKYLLRL 320 330 340 350 360 370 320 330 340 350 360 370 FLJ001 EHGPPHTKNWRPQVLVMLNLDAEQAVKHPRLLSFTSQLKAGKGLTIVGSVLEGTYLDK-- . :.: ::::.:.... . . :. : :: ...::: : :: ..: : : ::. FLJ000 DVRKDHVKFWRPQLLLLVG-NPRGAL--P-LLRLANQLKKG-GLYVLGHVTLGD-LDSLP 380 390 400 410 420 430 380 390 400 410 420 430 FLJ001 HMEAQRAEENIRSLMSTEKTKGFCQLVVSSSLRDGMSHLIQSAGLGGLKHNTVLMAW--- .: ::.. ..:.: .:..: :.:.: .::.. .::::.: ::..... FLJ000 SDPVQPQYGAWLSLVDRAQVKAFVDLTLSPSVRQGAQHLLRISGLGGMKPNTLVLGFYDD 440 450 460 470 480 490 440 450 460 FLJ001 ----------PA------SWKQEDNP-----------------FSWKNFVDTVRDTTAAH :: : .. ..: .. ...: :: :. . FLJ000 APPQDHFLTDPAFSEPADSTREGSSPALSTLFPPPRAPGSPRALNPQDYVATVADALKMN 500 510 520 530 540 550 470 480 490 500 FLJ001 QALLVAKNVDSFPQNQERFGGG------HIDVW---WIVHDGG---------MLMLLPFL . ...:. ..: .. :.: :.::: . :: .:. . . FLJ000 KNVVLARASGALPPERLSRGSGGTSQLHHVDVWPLNLLRPRGGPGYVDVCGLFLLQMATI 560 570 580 590 600 610 510 520 530 540 550 560 FLJ001 LRQHKVWRKCRMRIFTVAQVDDNSIQMKKDLQMFLYHLRISAEVEVVEMVENDISAFTYE : . .:.. :.::: . . :. .: .::: :::. : FLJ000 LGMVPAWHSARLRIFLCLGPREAPGAAEGRLRALLSQLRIRAEVQEVVWGEGAGAGEPEA 620 630 640 650 660 670 570 580 590 600 610 620 FLJ001 RTLMMEQRSQMLKQMQLSKNEQEREAQLIHDRNTASHTAAAARTQAPPTPDKVQMTWTRE FLJ000 EEEGDFVNSGRGDAEAEALARSANALVRAQQGRGTGGGPGGPEGGDAEGPITALTFLYLP 680 690 700 710 720 730 >>FLJ00379 ( 487 res) sj00523 (487 aa) initn: 358 init1: 220 opt: 415 Z-score: 445.2 bits: 92.4 E(): 1.3e-19 Smith-Waterman score: 446; 27.068% identity (55.890% similar) in 399 aa overlap (207-549:35-427) 180 190 200 210 220 230 FLJ001 VPFLQVFGHGKANGEPTWALLLTVLICETGILIASLDSVAPILSMFFLMCYLFVNLACAV .: ..:...: ....:.:. : :.:.: FLJ003 HWHSLVFTGILGVHWHFGTTARLLALAQLVLLAGKLNTLAAVVTVFYLVAYAAVDLSCLS 10 20 30 40 50 60 240 250 260 270 280 290 FLJ001 QTLLRTPNWRPRFKFYHWTLSFLGMSLCLALMFICSWYYALSAMLIAGCIYKYIEYRGAE .::.:: :... : .::.. :: .::. : : ...:. : . . ::. 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FLJ000 LEWASAPNFRPTFSLFSWHTCLLGVASCLLMMFLISPGAAGGSLLLMGLLAALLTARGGP 70 80 90 100 110 120 300 310 320 330 340 350 FLJ001 KEWGDGIRGLSLNAARYALLRVEHGPPHTKNWRPQVLVMLNLDAEQAVKHPRLLSFTSQL . :: ..: .. .: :::.. :.: ::::.:.... . . :. : :: ...:: FLJ000 SSWGYVSQALLFHQVRKYLLRLDVRKDHVKFWRPQLLLLVG-NPRGAL--P-LLRLANQL 130 140 150 160 170 180 360 370 380 390 400 410 FLJ001 KAGKGLTIVGSVLEGTYLDK--HMEAQRAEENIRSLMSTEKTKGFCQLVVSSSLRDGMSH : : :: ..: : : ::. .: ::.. ..:.: .:..: :.:.: .: FLJ000 KKG-GLYVLGHVTLGD-LDSLPSDPVQPQYGAWLSLVDRAQVKAFVDLTLSPSVRQGAQH 190 200 210 220 230 420 430 440 FLJ001 LIQSAGLGGLKHNTVLMAW-------------PA------SWKQEDNP------------ :.. .::::.: ::..... :: : .. ..: FLJ000 LLRISGLGGMKPNTLVLGFYDDAPPQDHFLTDPAFSEPADSTREGSSPALSTLFPPPRAP 240 250 260 270 280 290 450 460 470 480 FLJ001 -----FSWKNFVDTVRDTTAAHQALLVAKNVDSFPQNQERFGGG------HIDVWWI--- .. ...: :: :. .. ...:. ..: .. :.: :.::: . 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KIAA15 WQEEGIENSQEI-LKALD--FSLDGNINLTELTLALENELLVTKN----SIHQAALASFK 360 370 380 390 400 490 500 510 520 530 540 FLJ001 IDVWWIVHDGGMLMLLPFLLRQHKVWRKCRMRIFTVAQVDDNSIQMKKDLQMFLYHLRIS .. ... ... ::. . . ... . ...:::. ... . :.:: KIAA15 AEIRHLLERVDQVVREKEKLRSD-LDKAEKLKSLMASEVDDHHAAIERRNE---YNLRKL 410 420 430 440 450 460 550 560 570 580 590 600 FLJ001 AEVEVVEMVENDISAFTYERTLMMEQRSQMLKQMQLSKNEQEREAQLIHDRNTASHTAAA : : : . . . :: ...: ... ... .. . : . :.:: KIAA15 DE-EYKERIAALKNELRKEREQILQQAGKQRLELEQEIEKAKTEENYIRDRLALSLKENS 470 480 490 500 510 610 620 630 640 650 660 FLJ001 ARTQAPPTPDKVQMTWTREKLIAEKYRSRDTSLSGFKDLFSMKPDQSNVRRMHTAVKLNG KIAA15 RLENELLENAEKLAEYENLTNKLQRNLENVLAEKFGDLDPSSAEFFLQEERLTQMRNEYE 520 530 540 550 560 570 >>KIAA1164 ( 390 res) hk00541 (390 aa) initn: 80 init1: 52 opt: 89 Z-score: 98.1 bits: 27.8 E(): 2.9 Smith-Waterman score: 100; 26.852% identity (60.185% similar) in 108 aa overlap (538-630:263-370) 510 520 530 540 550 560 FLJ001 VWRKCRMRIFTVAQVDDNSIQMKKDLQMFLYHLRISAEVEVVEMVENDI--SAFTYERTL .::: .. :.: ..: . . . .: KIAA11 VTDQGFLTEEKVVWESLHNVDGDGNFCDSEFHLRPPSDPETVYKGQQDQIDQDYLMALSL 240 250 260 270 280 290 570 580 590 600 610 FLJ001 MMEQRSQMLK---------QMQLSKNEQERE----AQLIHDRNTASHTAAAARTQAPPTP ..::.:: .. ...:.:. ::.: .: .... :. .:::: ::: : KIAA11 QQEQQSQEINWEQIPEGISDLELAKKLQEEEDRRASQYYQEQEQAAAAAAAASTQAQGQP 300 310 320 330 340 350 620 630 640 650 660 670 FLJ001 DKVQMTWTREKLIAEKYRSRDTSLSGFKDLFSMKPDQSNVRRMHTAVKLNGVVLNKSQDA ... . :.. .:. : KIAA11 AQASPSSGRQSGNSERKRKEPREKDKEKEKEKNSCVIL 360 370 380 390 721 residues in 1 query sequences 2210273 residues in 2457 library sequences Tcomplib [34.26] (2 proc) start: Fri Feb 27 10:34:35 2009 done: Fri Feb 27 10:34:36 2009 Total Scan time: 0.680 Total Display time: 0.190 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]