# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -H -O./tmp/sf00010.fasta.huge -Q ../query/FLJ00411.ptfa ./tmplib.10216 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 FLJ00411, 437 aa vs ./tmplib.10216 library 2210557 residues in 2457 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.0521+/-0.00423; mu= 20.5839+/- 0.286 mean_var=107.2258+/-23.190, 0's: 0 Z-trim: 12 B-trim: 22 in 2/38 Lambda= 0.123858 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2457) FLJ00055 ( 977 res) as00055 ( 977) 2501 457.8 1.6e-129 FLJ00051 ( 462 res) as00051 ( 462) 243 53.8 3.3e-08 FLJ00073 ( 462 res) as00073 ( 462) 243 53.8 3.3e-08 KIAA0756 ( 1222 res) ff01911 (1222) 200 46.8 1.1e-05 KIAA1496 ( 920 res) fj09513 ( 920) 169 41.0 0.00044 KIAA0230 ( 1496 res) ha02538 (1496) 170 41.6 0.0005 KIAA1867 ( 779 res) fj18636 ( 779) 158 38.9 0.0016 KIAA1355 ( 1189 res) fj01564 (1189) 156 38.9 0.0025 KIAA0343 ( 1187 res) hg01457 (1187) 139 35.9 0.021 KIAA0657 ( 1237 res) hk01859s1 (1237) 124 33.2 0.13 KIAA0806 ( 1073 res) hk04165(revised) (1073) 121 32.6 0.18 KIAA1568 ( 1380 res) fh22308 (1380) 121 32.7 0.21 KIAA1564 ( 2432 res) fh20840s1 (2432) 115 32.1 0.58 KIAA1639 ( 2584 res) af14886 (2584) 115 32.1 0.59 KIAA1556 ( 1595 res) fh18619 (1595) 112 31.2 0.68 KIAA1132 ( 2092 res) hh01132s1 (2092) 113 31.6 0.68 FLJ00259 ( 659 res) sh04102 ( 659) 107 29.7 0.81 KIAA1773 ( 3434 res) hj00752s2 (3434) 111 31.6 1.1 KIAA0627 ( 1324 res) hh01026s2 (1324) 105 29.9 1.5 KIAA1632 ( 1457 res) fh19068(revised) (1457) 105 29.9 1.5 KIAA1926 ( 412 res) hh10052 ( 412) 98 27.8 1.9 KIAA1777 ( 954 res) fh19201x1 ( 954) 97 28.2 3.3 KIAA1263 ( 850 res) hj00608 ( 850) 95 27.7 4 KIAA1522 ( 1044 res) fh14706(revised) (1044) 95 27.9 4.5 FLJ00376 ( 931 res) sh07947 ( 931) 94 27.6 4.8 FLJ00041 ( 330 res) as00041 ( 330) 89 26.0 5.3 KIAA1908 ( 445 res) ah02604 ( 445) 89 26.2 6.1 KIAA1977 ( 606 res) fh18284(revised) ( 606) 90 26.6 6.3 FLJ00121 ( 448 res) sh00381 ( 448) 88 26.0 7 FLJ00382 ( 482 res) sj02645 ( 482) 88 26.1 7.2 KIAA0023 ( 2111 res) ha00512 (2111) 93 28.0 8.2 KIAA1150 ( 499 res) hg02066 ( 499) 87 25.9 8.3 KIAA1957 ( 481 res) fk12643 ( 481) 86 25.7 9.3 KIAA1580 ( 640 res) fj04979 ( 640) 87 26.1 9.5 FLJ00385 ( 509 res) sj03289 ( 509) 85 25.6 11 KIAA1152 ( 354 res) hh00415 ( 354) 83 25.0 12 KIAA0467 ( 2687 res) ff08895 (2687) 90 27.7 13 KIAA1497 ( 730 res) hg01608 ( 730) 84 25.7 15 KIAA1233 ( 1023 res) fh08611 (1023) 85 26.1 15 KIAA0820 ( 892 res) bg00036 ( 892) 84 25.8 16 KIAA1739 ( 963 res) pj00464 ( 963) 84 25.9 17 KIAA0582 ( 760 res) fh15957 ( 760) 83 25.5 17 FLJ00133 ( 1282 res) sh02303 (1282) 85 26.3 17 FLJ00269 ( 1383 res) sj06049 (1383) 85 26.3 18 KIAA0200 ( 1042 res) ha02508 (1042) 83 25.8 20 FLJ00184 ( 580 res) sj01836 ( 580) 80 24.8 21 KIAA0344 ( 2066 res) hg01568 (2066) 84 26.4 25 FLJ00204 ( 573 res) sj04432 ( 573) 78 24.4 27 KIAA0909 ( 1234 res) hk10471 (1234) 81 25.5 27 KIAA1656 ( 136 res) fg00806 ( 136) 72 22.3 28 >>FLJ00055 ( 977 res) as00055 (977 aa) initn: 2501 init1: 2501 opt: 2501 Z-score: 2418.4 bits: 457.8 E(): 1.6e-129 Smith-Waterman score: 2501; 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KIAA07 YFCLASNKMGSIRHTISVRVKAAPYWLDEPKNLILAPGEDGRLVCRA-NGNPKPT-VQWM 380 390 400 410 420 430 160 170 180 190 200 FLJ004 RDGQPLQ--------ESTSATLRFAAITLTQAGAYHCQAQAPGSATTSLAVPISLHVS-- .:.::: : .. :. : ... ..:.:... . . : : : KIAA07 VNGEPLQSAPPNPNREVAGDTIIFRDTQISSRAVYQCNTSNEHGYLLANAFVSVLDVPPR 440 450 460 470 480 490 210 220 230 240 250 260 FLJ004 -YAPRHVTLTTLMDTGPGRLGLLLCRVDSDPPAQLRLLHGDRLVASTLQGVGGPEGSSPR .::. . ... . :: : ..: :: ... . .:.:.: :. 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KIAA14 LGNPIPQINWRRSDGLPFSSKIKLRKFSGVLEIPNFQQEDAGSYECIAENSRGKNVARGR 150 160 170 180 190 200 120 130 140 150 160 FLJ004 LFFQVRGAWVQVSPSPELQEGQAVVLSCQVPTGVPEGTSYRWYRDGQPL--QEST---SA : . .. :::. . :. ... :.. .: :. :::: ..: : .: : .. KIAA14 LTYYAKPHWVQLIKDVEIAVEDSLYWECRA-SGKPK-PSYRWLKNGAALVLEERTQIENG 210 220 230 240 250 260 170 180 190 200 210 220 FLJ004 TLRFAAITLTQAGAYHCQAQAP-GSATTSLAVPISLHVSYAP--RHVTLTTLMDTGPGRL .: .. ...:..: ..: :. : . .: . . :. :: . . :... : : KIAA14 ALTISNLSVTDSGMFQCIAENKHGLVYSSAELKV---VASAPDFSKNPMKKLVQVQVGSL 270 280 290 300 310 230 240 250 260 270 280 FLJ004 GLLLCRVDSDPPAQLRLLHGDRLVASTLQGVGGPEGSSPRLHVAVAPNTLRLEIHGAMLE : :. ..: : .:: : :. . : :.: .. KIAA14 VSLDCKPRASPRALSSWKKGDVSVQE-----------HERISLL---NDGGLKIANVTKA 320 330 340 350 360 290 300 310 320 330 340 FLJ004 DEGVYICEASNTLGQASASADFDA-QAVNVQVWPGAT-VREGQLVNLTCLVWTTHPAQLT : :.: : : : .:.:.... . . . . . . :. : :. : : : : .. 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