# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -H -O./tmp/sh00566.fasta.huge -Q ../query/FLJ00275.ptfa ./tmplib.10216 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 FLJ00275, 382 aa vs ./tmplib.10216 library 2210612 residues in 2457 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9990+/-0.00466; mu= 15.2264+/- 0.314 mean_var=124.5279+/-26.853, 0's: 0 Z-trim: 4 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.114932 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2457) FLJ00060 ( 227 res) as00060 ( 227) 366 70.9 9.7e-14 KIAA0364 ( 1437 res) hh00116 (1437) 295 60.3 9.8e-10 KIAA0230 ( 1496 res) ha02538 (1496) 144 35.2 0.034 KIAA0657 ( 1237 res) hk01859s1 (1237) 124 31.8 0.31 KIAA1132 ( 2092 res) hh01132s1 (2092) 119 31.3 0.74 KIAA0423 ( 1723 res) hh01239s1 (1723) 109 29.5 2.1 KIAA1555 ( 2414 res) fh17482s2 (2414) 110 29.9 2.3 KIAA0806 ( 1073 res) hk04165(revised) (1073) 105 28.6 2.5 KIAA0756 ( 1222 res) ff01911 (1222) 103 28.3 3.4 KIAA1030 ( 763 res) fh00432 ( 763) 95 26.7 6.5 KIAA1306 ( 1154 res) fh05845 (1154) 96 27.1 7.4 KIAA0091 ( 1058 res) ha01032 (1058) 95 26.9 7.9 KIAA0309 ( 3053 res) hg00096s1 (3053) 100 28.4 8.1 KIAA1359 ( 517 res) fj02042 ( 517) 91 25.8 8.3 FLJ00154 ( 1471 res) sh06142 (1471) 96 27.3 8.5 KIAA0079 ( 1102 res) ha03543 (1102) 94 26.8 9 KIAA1680 ( 902 res) fh23414 ( 902) 92 26.3 10 KIAA1849 ( 1114 res) fg05386(revised) (1114) 93 26.6 10 FLJ00066 ( 162 res) as00066 ( 162) 83 23.8 11 KIAA1662 ( 1653 res) fj03879s1 (1653) 94 27.0 11 KIAA2038 ( 917 res) pj01991 ( 917) 91 26.2 11 KIAA0414 ( 492 res) hh00161 ( 492) 87 25.1 13 KIAA1983 ( 418 res) fk09737(revised) ( 418) 86 24.8 13 FLJ00227 ( 196 res) sj06355 ( 196) 82 23.7 13 KIAA1549 ( 1865 res) fh16155s1 (1865) 92 26.8 15 FLJ00254 ( 225 res) sj09520 ( 225) 81 23.6 16 FLJ00375 ( 708 res) sh07824 ( 708) 86 25.2 18 KIAA1984 ( 339 res) hk01547 ( 339) 82 24.1 18 FLJ00315 ( 925 res) sh06842 ( 925) 87 25.5 18 KIAA0468 ( 410 res) hg01596 ( 410) 82 24.2 20 FLJ00201 ( 705 res) sj04110 ( 705) 84 24.8 22 KIAA1534 ( 865 res) fh03661(revised) ( 865) 85 25.1 22 KIAA1002 ( 962 res) hk09859 ( 962) 85 25.2 23 KIAA0755 ( 1093 res) hk04532 (1093) 84 25.1 28 FLJ00043 ( 1415 res) as00043 (1415) 85 25.4 29 KIAA1976 ( 351 res) fg02988 ( 351) 78 23.4 29 KIAA1704 ( 351 res) fj16938 ( 351) 78 23.4 29 FLJ00084 ( 641 res) as00084 ( 641) 81 24.3 29 KIAA0293 ( 1505 res) hg03205 (1505) 85 25.5 30 KIAA0995 ( 1014 res) hk07740 (1014) 83 24.9 30 KIAA0802 ( 1578 res) hh07536 (1578) 85 25.5 31 KIAA1472 ( 601 res) fj03211 ( 601) 80 24.1 32 KIAA0557 ( 493 res) hh01334 ( 493) 79 23.8 32 FLJ00220 ( 503 res) sj05828 ( 503) 79 23.8 32 KIAA1844 ( 367 res) fj12009 ( 367) 77 23.3 34 KIAA1305 ( 1819 res) fh04045s1 (1819) 85 25.6 34 FLJ00317 ( 111 res) sh07047 ( 111) 71 21.5 34 KIAA0860 ( 551 res) hk06518 ( 551) 79 23.9 34 FLJ00189 ( 491 res) sj02334 ( 491) 78 23.6 35 KIAA0999 ( 1371 res) fj10213 (1371) 83 25.1 36 >>FLJ00060 ( 227 res) as00060 (227 aa) initn: 352 init1: 252 opt: 366 Z-score: 340.0 bits: 70.9 E(): 9.7e-14 Smith-Waterman score: 459; 39.796% identity (67.857% similar) in 196 aa overlap (103-295:2-195) 80 90 100 110 120 130 FLJ002 KFHIPSTVYDSAGRYRCYYETPAGWSEPSDPLELVATGVSRKPSLLIPQGSVVARGGSLT :: :. .:. :::. .:.: :. .. 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FLJ000 SHSRYEWSAPSDPLDIVITGKYKK-PSLSTQVDPMMRLGEKLTLFCSSEISFDQYHLFRH 100 110 120 130 140 250 260 270 280 290 300 FLJ002 GAAHPPLCLKSKYQSYRHQAEFSMSPVTSAQGGTYRCYSAIRSYPYLLSSPSYPQELVVS :.:: .. . ::.::.. .: . :::::::... . :: FLJ000 GVAHGQWLSGGQRHREAFQANFSVGRATPVPGGTYRCYGSFNDSPYKPPVTRCNFTPQET 150 160 170 180 190 200 310 320 330 340 350 360 FLJ002 GEGPDPVLSKLKGSAQALPPGELWAGMESRCGGEGLRGAQPEGDSPLRGEEDNGGSPGMP FLJ000 LRVLLCHSQNPPLNLVSK 210 220 >>KIAA0364 ( 1437 res) hh00116 (1437 aa) initn: 585 init1: 175 opt: 295 Z-score: 268.1 bits: 60.3 E(): 9.8e-10 Smith-Waterman score: 519; 35.294% identity (55.728% similar) in 323 aa overlap (7-318:963-1267) 10 20 30 FLJ002 GMGMSWDPASDSILGTLPKPTLWAEPASVIARGKPV ::. . ::::: :.:. :. :: : KIAA03 AHFLIISVGIGDGGNYSCRYYDFSIWSEPSDPVELVVTEFYPKPTLLAQPGPVVFPGKSV 940 950 960 970 980 990 40 50 60 70 80 90 FLJ002 TLWCQGPLETEEYRLDKEG--LPWARKRQNPLEPGAKAKFHIPSTVYDSAGRYRC-YYET : ::: .. .. : .:: .: . . : .: : . .. ...: : : :::: KIAA03 ILRCQGTFQGMRFALLQEGAHVPLQFRSVS----GNSADFLLHTVGAEDSGNYSCIYYET 1000 1010 1020 1030 1040 100 110 120 130 140 150 FLJ002 PAG--WSEPSDPLELVATGVSRKPSLLIPQGSVVARGGSLTLQCRSDVGYDIFVLYKEGE . : : :: . .: . :: :. .::: : ..:: ::. : ..:.:::: KIAA03 TMSNRGSYLSMPLMIWVTDTFPKPWLFAEPSSVVPMGQNVTLWCRGPVHGVGYILHKEGE 1050 1060 1070 1080 1090 1100 160 170 180 190 200 FLJ002 HDLVQGSGQQPQAGLSQANFTLGPVSRSHGGQYRCYGAHNLSPRWSA-----PSDPLDIL .: :. . : : . .: . :.: : : :.. ::. :..: KIAA03 ATSMQLWGSTSNDG----AFPITNISGTSMGRYSC----CYHPDWTSSIKIQPSNTLELL 1110 1120 1130 1140 1150 1160 210 220 230 240 250 260 FLJ002 IAGLIPDIPALSVQPGPKVASGENVTLLCQSWHQIDTFFLTKEGAAHPPLCLKSKYQS-Y ..::.: :.: .:::: :: :::.:: ::. .:: : :::: .: :... : : KIAA03 VTGLLPK-PSLLAQPGPMVAPGENMTLQCQGELPDSTFVLLKEGAQEP---LEQQRPSGY 1170 1180 1190 1200 1210 270 280 290 300 310 320 FLJ002 RHQAEFSMSPVTSAQGGTYRCYSAIRSYPYLLSSPSYPQELVVSGEGPDPVLSKLKGSAQ : :.: : : . ..: : : . : :. :. : :. :. . : : :: KIAA03 R--ADFWMPAVRGEDSGIYSCVYYLDSTPFAASNHSDSLEIWVTDKPPKPSLSAWPSTMF 1220 1230 1240 1250 1260 1270 330 340 350 360 370 380 FLJ002 ALPPGELWAGMESRCGGEGLRGAQPEGDSPLRGEEDNGGSPGMPTLGPISWDANGER KIAA03 KLGKDITLQCRGPLPGVEFVLEHDGEEAPQQFSEDGDFVINNVEGKGIGNYSCSYRLQAY 1280 1290 1300 1310 1320 1330 >>KIAA0230 ( 1496 res) ha02538 (1496 aa) initn: 54 init1: 54 opt: 144 Z-score: 132.6 bits: 35.2 E(): 0.034 Smith-Waterman score: 156; 20.996% identity (54.448% similar) in 281 aa overlap (14-286:353-611) 10 20 30 40 FLJ002 GMGMSWDPASDSILGTLPKPTLWAEPASV-IARGKPVTLWCQG .:. .::. .: .. . :. ::: :.. KIAA02 NTQETDQGIYQCMAKNVAGEVKTQEVTLRYFGSPARPTFVIQPQNTEVLVGESVTLECSA 330 340 350 360 370 380 50 60 70 80 90 FLJ002 ----PLETEEYRLDKEGLPWARKRQNPLEPGAKAKFHIPSTVYDSAGRYRCYYETPAGWS : . : :. :: . : : :. ..: ..: ..:.: : . . KIAA02 TGHPPPRISWTRGDRTPLP-VDPRVNITPSGG---LYIQNVVQGDSGEYAC------SAT 390 400 410 420 430 100 110 120 130 140 150 FLJ002 EPSDPLELVATGVSRK-PSLLI-PQGSVVARGGSLTLQCRSDVGYDIFVLYKEGEHDLVQ . : .. .: . . :.. . :: :: .: .. .::.. . . . .: .: KIAA02 NNIDSVHATAFIIVQALPQFTVTPQDRVVIEGQTVDFQCEAKGNPPPVIAWTKGGSQL-- 440 450 460 470 480 490 160 170 180 190 200 210 FLJ002 GSGQQPQAGLSQANFTLGPVSRSHGGQYRCYGAHNLSPRWSAPSDPLDILIAGLIPDIPA : .. . ::.... .. :. :::.: ... .. . . .. .. .. .::. KIAA02 -SVDRRHLVLSSGTLRISGVALHDQGQYECQAVNIIGSQKVVAHLTVQPRVTPVFASIPS 500 510 520 530 540 220 230 240 250 260 270 FLJ002 LSVQPGPKVASGENVTLLCQSWHQID-TFFLTKEGAAHPPLCLKSKYQSYRHQAEFSMSP .. : : :: : :.: . . .. .:.:. . ..:.. .. .... KIAA02 DTT-----VEVGANVQLPCSSQGEPEPAITWNKDGVQ---VTESGKFH-ISPEGFLTIND 550 560 570 580 590 600 280 290 300 310 320 330 FLJ002 VTSAQGGTYRCYSAIRSYPYLLSSPSYPQELVVSGEGPDPVLSKLKGSAQALPPGELWAG : :..: :.: KIAA02 VGPADAGRYECVARNTIGSASVSMVLSVNVPDVSRNGDPFVATSIVEAIATVDRAINSTR 610 620 630 640 650 660 >>KIAA0657 ( 1237 res) hk01859s1 (1237 aa) initn: 113 init1: 60 opt: 124 Z-score: 115.6 bits: 31.8 E(): 0.31 Smith-Waterman score: 142; 24.904% identity (49.425% similar) in 261 aa overlap (8-255:914-1145) 10 20 30 FLJ002 GMGMSWDPASDSILGTLPKPTLWAEPASVIARGKPVT :.. : : :.: .: :.::. KIAA06 LPAAQPEDGGEFVCDAGDDSAFFTVTVTEPPVQFLALETTPSPL-------CVAPGEPVV 890 900 910 920 930 40 50 60 70 80 90 FLJ002 LWCQGPLETEEYRLDKEGLP--WARKRQNPLEPGAKAKFHI--PSTVY--DSAGRYRCYY : :. :.. : : :... . :.. : ..: : : ..:: . KIAA06 LSCE---------LSRAGAPVVWSHNGR-PVQEGEGLELHAEGPRRVLCIQAAGPAHAGL 940 950 960 970 980 100 110 120 130 140 FLJ002 ETPAGWSEPSDPLELVATGVSRKPSLLIPQGSVVAR-----GGSLTLQCR-SDVGYDIFV : . . :. : .. :.. : .. .. .: ::.: : . : : . KIAA06 YTCQSGAAPGAPSLSFTVQVAEPPVRVVAPEAAQTRVRSTPGGDLELVVHLSGPGGPVR- 990 1000 1010 1020 1030 1040 150 160 170 180 190 200 FLJ002 LYKEGEHDLVQGSGQQPQAGLSQANFTLGPVSRSHGGQYRCYGAHNLSPRWSAPSDPLDI ::.::. :: : ::: :. . : : . .:.: : . .. . .:: KIAA06 WYKDGERLASQGRVQLEQAGARQVLRVQGARS-GDAGEYLCDAPQDSRIFLVSVEEPL-- 1050 1060 1070 1080 1090 1100 210 220 230 240 250 260 FLJ002 LIAGLIPDIPALSVQPGPKVASGENVTLLCQ-SWHQIDTFFLTKEGAAHPPLCLKSKYQS .. :. :. :.:. : ...:. :. : . :. .: ..::. : KIAA06 -LVKLVSDLTPLTVHEG------DDATFRCEVSPPDADVTWL-RNGAVVTPGPQRQSCCS 1110 1120 1130 1140 1150 270 280 290 300 310 320 FLJ002 YRHQAEFSMSPVTSAQGGTYRCYSAIRSYPYLLSSPSYPQELVVSGEGPDPVLSKLKGSA KIAA06 YGGCRMCGQRKARTCVSKWRQAEWVQRGPCAGCEVGSPCPTTLACPWPRMGTSTASSSMV 1160 1170 1180 1190 1200 1210 >>KIAA1132 ( 2092 res) hh01132s1 (2092 aa) initn: 44 init1: 44 opt: 119 Z-score: 108.7 bits: 31.3 E(): 0.74 Smith-Waterman score: 133; 22.050% identity (48.758% similar) in 322 aa overlap (7-310:259-543) 10 20 30 FLJ002 GMGMSWDPASD--SILGTLPKPTLWAEPASVIARGK ::: . .:: . . .:: :. 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KIAA11 DGTPRIVSSFSEKVVNPGEQFSLMCAAKGAPPPTVTW-ALDDEPIVRDGS-H-----RTN 450 460 470 480 490 270 280 290 300 310 FLJ002 YQSYRHQAEFSMSPVTSAQ---GGTYRCYSAIRSYPYLLSSPSYPQELVVSGEGPDPVLS .. . .: ::. : ::.::: . :. :..: : .. : : KIAA11 QYTMSDGTTISHMNVTGPQIRDGGVYRCTA--RN---LVGSAEYQARINVRGPPSIRAMR 500 510 520 530 540 550 320 330 340 350 360 370 FLJ002 KLKGSAQALPPGELWAGMESRCGGEGLRGAQPEGDSPLRGEEDNGGSPGMPTLGPISWDA KIAA11 NITAVAGRDTLINCRVIGYPYYSIKWYKDALLLPDNHRQVVFENGTLKLTDVQKGMDEGE 560 570 580 590 600 610 >>KIAA0423 ( 1723 res) hh01239s1 (1723 aa) initn: 58 init1: 58 opt: 109 Z-score: 100.7 bits: 29.5 E(): 2.1 Smith-Waterman score: 109; 28.972% identity (57.009% similar) in 107 aa overlap (254-358:819-922) 230 240 250 260 270 280 FLJ002 KVASGENVTLLCQSWHQIDTFFLTKEGAAHPPLCLKSKYQSYRHQAEFSMSPVTSAQGGT : ..: : .: . . .:: : .... 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