# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -H -O./tmp/sh01728.fasta.huge -Q ../query/FLJ00280.ptfa ./tmplib.10216 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 FLJ00280, 440 aa vs ./tmplib.10216 library 2210554 residues in 2457 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.3354+/-0.0102; mu= -11.0230+/- 0.686 mean_var=720.3802+/-161.125, 0's: 0 Z-trim: 6 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.047785 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2457) FLJ00160 ( 1696 res) sh06621 (1696) 310 36.7 0.017 KIAA1681 ( 1236 res) fh23697 (1236) 278 34.2 0.066 KIAA1471 ( 1421 res) fj02383s1 (1421) 265 33.4 0.13 KIAA1887 ( 967 res) fk02232 ( 967) 258 32.7 0.15 KIAA1522 ( 1044 res) fh14706(revised) (1044) 234 31.1 0.49 KIAA1760 ( 2219 res) af00030 (2219) 236 31.7 0.67 KIAA0522 ( 1555 res) hg01393 (1555) 220 30.4 1.2 KIAA1856 ( 1134 res) fh03203 (1134) 216 29.9 1.2 KIAA1205 ( 1217 res) fg03511a (1217) 215 29.9 1.3 FLJ00201 ( 705 res) sj04110 ( 705) 206 28.9 1.5 KIAA1587 ( 991 res) fj08327 ( 991) 205 29.1 1.9 KIAA1802 ( 821 res) fj21631 ( 821) 202 28.7 2 KIAA0269 ( 567 res) ha06751 ( 567) 196 28.1 2.2 KIAA0616 ( 634 res) hg03623 ( 634) 195 28.1 2.4 KIAA1029 ( 1015 res) fh00363 (1015) 197 28.5 2.8 KIAA1458 ( 612 res) fh16694 ( 612) 190 27.7 3 KIAA1139 ( 1124 res) hk00330 (1124) 196 28.5 3.1 KIAA0905 ( 1229 res) hk10341 (1229) 196 28.6 3.3 FLJ00086 ( 399 res) as00086 ( 399) 182 26.9 3.5 KIAA0915 ( 846 res) hk06275s1 ( 846) 189 27.9 3.8 KIAA0512 ( 710 res) hf00239 ( 710) 187 27.6 3.8 KIAA1076 ( 804 res) hj06779 ( 804) 188 27.8 3.8 KIAA0618 ( 1052 res) hg03971 (1052) 190 28.1 4 KIAA0595 ( 1666 res) hj02929s1 (1666) 193 28.6 4.5 KIAA1306 ( 1154 res) fh05845 (1154) 187 27.9 4.9 KIAA0613 ( 734 res) hg01088b ( 734) 180 27.1 5.3 KIAA0863 ( 1181 res) hk06535 (1181) 183 27.7 6 KIAA0790 ( 1319 res) hk05609 (1319) 184 27.8 6.1 KIAA1172 ( 929 res) hj03919(revised) ( 929) 179 27.2 6.4 KIAA1025 ( 1917 res) fg00971s1 (1917) 187 28.3 6.4 KIAA1311 ( 889 res) fh11512 ( 889) 176 27.0 7.2 KIAA2011 ( 1091 res) pj02017 (1091) 177 27.2 7.6 KIAA1375 ( 546 res) fj04426 ( 546) 168 26.1 8.1 KIAA1811 ( 715 res) ha06731 ( 715) 170 26.4 8.5 KIAA1931 ( 514 res) fj14393 ( 514) 165 25.9 9 KIAA1662 ( 1653 res) fj03879s1 (1653) 177 27.5 9.6 KIAA0913 ( 1881 res) fh07519s2 (1881) 178 27.6 9.8 KIAA0309 ( 3053 res) hg00096s1 (3053) 183 28.3 10 KIAA0771 ( 948 res) hk05113 ( 948) 168 26.5 11 KIAA0079 ( 1102 res) ha03543 (1102) 169 26.7 11 KIAA1261 ( 787 res) hh15855b ( 787) 165 26.2 11 KIAA0023 ( 2111 res) ha00512 (2111) 176 27.6 11 KIAA0904 ( 1535 res) ha00554 (1535) 172 27.1 12 KIAA0755 ( 1093 res) hk04532 (1093) 168 26.6 12 KIAA1685 ( 1505 res) pf04287 (1505) 171 27.0 12 KIAA0495 ( 209 res) hg00106 ( 209) 148 24.1 12 KIAA0181 ( 2079 res) ha02522s1 (2079) 174 27.4 13 KIAA1623 ( 1236 res) fj04650 (1236) 168 26.7 13 KIAA1481 ( 1380 res) fj05724 (1380) 169 26.8 13 KIAA0697 ( 2486 res) hk04486s1 (2486) 173 27.5 14 >>FLJ00160 ( 1696 res) sh06621 (1696 aa) initn: 293 init1: 125 opt: 310 Z-score: 138.2 bits: 36.7 E(): 0.017 Smith-Waterman score: 310; 31.513% identity (52.101% similar) in 238 aa overlap (70-293:168-391) 40 50 60 70 80 90 FLJ002 PPRTHSYLPGHSPLLGHTPTSRDTPPSRNTLPPPWMLPSPRTLPSPRTLPSPRTLPTPGT .: :: : :: ::.: :.::. 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KIAA18 GAPTVEGP--GAPPFLASSLLSAAAKAQHPPLPPPSTLQGRRPRAQAPSASHSSSLRPSQ 270 280 290 300 310 320 200 210 220 230 240 FLJ002 DIPLSLDAPLSL------DTPY-SRDTLPATGTLPPPRTLPSPGT--LPPSGTL---PPP : . . : .:: :: :: .: : .:: :. :: .: : : KIAA18 RRPRRPPTVFRLLEGRGPQTPRRSRPRAPAP--VPQPFSLPEPSQPILPSVLSLLGLPTP 330 340 350 360 370 380 250 260 270 280 290 300 FLJ002 GTVPTPGT---LPSPGTLPAPRTLPTPGTLPSPRTLPTPRTLP--TPGTLPR-PGTSYVL : . :. : : . :: : :: . :. :.:: : .:: : :.: ::. KIAA18 GPSHSDGSFNLLGSDAHLPPPPTL-SSGSPPQPRH-PIQPSLPGTTSGSLSSVPGAP--- 390 400 410 420 430 440 310 320 330 340 350 FLJ002 YGTVGGRAWGLSFPPSLIRRCTMRGLSVAFREVM-------GCRWRFGGSGEGGWLCSRG ....: :: . . .::... . : . : . .: : . : KIAA18 APPAASKA---PVVPSPVLQSPSEGLGMGAGPACPLPPLAGGEAFPFPSPEQGLALSGAG 450 460 470 480 490 360 370 380 390 400 FLJ002 CPGEPRALCPSP-----PTPRPQLSFHAVMVVHRATAQ---KCLLHAHHTPRDAMRRPGR :: :: : : : : : :. :. . .: . :: : . ::. KIAA18 FPGMLGAL-PLPLSLGQPPPSPLLNHSLFGVLTGGGGQPPPEPLLPPPGGPGPPLA-PGE 500 510 520 530 540 550 410 420 430 440 FLJ002 WLGAQLWGFGVRLAVEAWMGQAPRKAGPPPGKGV : .: : . . : ::: KIAA18 PEGPSLL-------VASLLPPPPSDLLPPPSAPPSNLLASFLPLLALGPTAGDGEGSAEG 560 570 580 590 600 >>KIAA1522 ( 1044 res) fh14706(revised) (1044 aa) initn: 165 init1: 135 opt: 234 Z-score: 111.9 bits: 31.1 E(): 0.49 Smith-Waterman score: 283; 27.234% identity (44.894% similar) in 470 aa overlap (17-436:540-974) 10 20 30 40 FLJ002 VARPRWGWGCHADGTRTRTLPPPGILRTPGTLPCPGTLPPPR---- : :::: :. :.. :: ::. KIAA15 PGLSPGGSRRPPRSPERTLSPSSGYSSQSGTPTLPPKGLAGPPAS---PGKAQPPKPERV 510 520 530 540 550 560 50 60 70 80 FLJ002 THSYLPG---HSPLLGHTPTSRDTPPS-------------RNTLPPPWMLPSPRTLP--S : :: : : . .: : :: : ..:: .:.: . : . KIAA15 TSLRSPGASVSSSLTSLCSSSSDPAPSDRSGPQILTPLGDRFVIPPHPKVPAPFSPPPSK 570 580 590 600 610 620 90 100 110 120 130 140 FLJ002 PRTLPSPRTLPTPGTHFYLPGHSPLLGHTSPSWDTLPPPGTHF-PLQGHTSPSWDILPTP ::. :.: . :. .. .:: :. . :. : .. : : : . ::: : : : : KIAA15 PRS-PNP-AAPALAAPAVVPG--PV-STTDASPQSPPTPQTTLTPLQESPVISKDQSPPP 630 640 650 660 670 680 150 160 170 180 190 FLJ002 GMLPSPRTLPAPRTHSYFLGRSPFPGHS---PLLGHY--PLPGHTPRYRDTPPSRDTPPS . :: . : : . . ..: ... :: : : .:. .: . : :: KIAA15 SPPPSYHPPPPPTKKPEVVVEAPSASETAEEPLQDPNWPPPPPPAPEEQDLSMA-DFPPP 690 700 710 720 730 740 200 210 220 230 240 FLJ002 RDIPLSLDAPLS---------LDTPY-SRDTLPATGTLPPPRTLPSPGTLPPSGTLPPPG .. .:. .: ...: : .. : :: : :. :. . :: KIAA15 EEAFFSVASPEPAGPSGSPELVSSPAASSSSATALQIQPPGSPDPPPAPPAPAPASSAPG 750 760 770 780 790 800 250 260 270 280 290 300 FLJ002 TVPT-PGTLP---SPGTLPAPRTLPTPGTLPSPRTLPTPRTLPTPGTLPRP--GTSYV-- : : : : : : . . .: . :: . :.. .:: : : : : KIAA15 HVAKLPQKEPVGCSKGGGPPREDVGAPLVTPSLLQMVRLRSVGAPGGAPTPALGPSAPQK 810 820 830 840 850 860 310 320 330 340 350 FLJ002 -LYGTVGGRAWGLSFPPSLIRRCTMRGLSVAFREVMGCRWRFGGSGEGGWLCSRGCPGEP : ...::: . : : :: .: : . .: ...:: : : : : KIAA15 PLRRALSGRASPVPAPSS--------GLHAAVR-LKACSL---AASEG--LSSAQPNGPP 870 880 890 900 360 370 380 390 400 410 FLJ002 RALCPSPP-TPRPQLSFHAVMVVHRATAQKCLLHAHHTPRDAMRRPGRWLGAQLWGFGVR .: : :: .: :: . ..: :. .: ... : : :.: : KIAA15 EAE-PRPPQSPASTASF-----IFSKGSRKLQLERPVSP-ETQADLQRNLVAEL-----R 910 920 930 940 950 420 430 440 FLJ002 LAVEAWMGQAPRKA--GPPPGKGV : :::.:. .::: KIAA15 SISEQRPPQAPKKSPKAPPPVARKPSVGVPPPASPSYPRAEPLTAPPTNGLPHTQDRTKR 960 970 980 990 1000 1010 >>KIAA1760 ( 2219 res) af00030 (2219 aa) initn: 153 init1: 153 opt: 236 Z-score: 109.5 bits: 31.7 E(): 0.67 Smith-Waterman score: 286; 30.421% identity (48.220% similar) in 309 aa overlap (21-303:734-1021) 10 20 30 40 FLJ002 VARPRWGWGCHADGTRTRTLPPPGILRTPGTLP---CPGTLPP---PRTH : : .: ..: : ::: : .. KIAA17 VLPPPSTPMPTGPGQPAPPGQQPPPLAQPTPLPQVLAPQPVVPLQPVPPHLPPYLAPASQ 710 720 730 740 750 760 50 60 70 80 90 FLJ002 SYLPGH-SPL-LGHTPTS--RDTPPSRNTLP--PPWMLPS------PRTLPSPRTLPSPR :.. .:: . ..: . ..::. .: :: . : : .::. ::. KIAA17 VGAPAQLKPLQMPQAPLQPLAQVPPQMPPIPVVPP-ITPLAGIDGLPPALPD---LPTAT 770 780 790 800 810 100 110 120 130 140 150 FLJ002 TLPTPGTHFYLPGHSPLLGHTSPSWDTLPPPGTHFPLQGHTSPSWDILPTPGMLPSPRTL . :.: ... :. : . ..: ::: . .:::. : .: .: . KIAA17 VPPVPPPQYFSPA-VILPSLAAP----LPPASPALPLQAVKLPHPP--GAPLAMPCRTIV 820 830 840 850 860 870 160 170 180 190 200 FLJ002 P-APRTHSYFLGRSPFPGHSPLLGHYP---LPGHTPRYRDTPPS---RDTPPSRDIPLSL : :: : .:. .: :: . : : :::. : : . :. :.::: : KIAA17 PNAPATIP-LLAVAP-PGVAALSIHSAVAQLPGQ-PVYPAAFPQMAPTDVPPS---PHHT 880 890 900 910 920 210 220 230 240 250 260 FLJ002 DAPLSLDTPYSRDTLPATGTLPPPRTLPSPGTLPPSGTLPPPGTVPTPGTLPSPGTLPAP . : . .:: :::: .:: ::::. .::: : : .:: :: KIAA17 VQNMRATPP--QPALPPQPTLPPQPVLPPQPTLPPQPVLPPQPTRPPQPVLPPQPMLPPQ 930 940 950 960 970 980 270 280 290 300 310 320 FLJ002 RTLPTPGTLPSPRTLPTPRTLPTPGT-LPRPGTSYVLYGTVGGRAWGLSFPPSLIRRCTM .:: .:: : : :: .. :: : .: : KIAA17 PVLPPQPALPV-RPEPLQPHLPEQAAPAATPG-SQILLGHPAPYAVDVAAQVPTVPVPPA 990 1000 1010 1020 1030 1040 330 340 350 360 370 380 FLJ002 RGLSVAFREVMGCRWRFGGSGEGGWLCSRGCPGEPRALCPSPPTPRPQLSFHAVMVVHRA KIAA17 AVLSPPLPEVLLPAAPELLPQFPSSLATVSASVQSVPTQTATLLPPANPPLPGGPGIASP 1050 1060 1070 1080 1090 1100 >>KIAA0522 ( 1555 res) hg01393 (1555 aa) initn: 138 init1: 98 opt: 220 Z-score: 105.0 bits: 30.4 E(): 1.2 Smith-Waterman score: 249; 29.060% identity (44.444% similar) in 234 aa overlap (35-266:1342-1547) 10 20 30 40 50 60 FLJ002 RWGWGCHADGTRTRTLPPPGILRTPGTLPCPGTLPPPRTHSYLPGHSPLLGHTPTSRDTP :: ::: ::: ..: : : . 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KIAA05 PHGPLHASGPPGTANPPSANPKAKPSRISTVV 1530 1540 1550 >>KIAA1856 ( 1134 res) fh03203 (1134 aa) initn: 181 init1: 129 opt: 216 Z-score: 104.9 bits: 29.9 E(): 1.2 Smith-Waterman score: 258; 31.408% identity (41.877% similar) in 277 aa overlap (13-281:915-1129) 10 20 30 40 FLJ002 VARPRWGWGCHADGTRTRTLPPPGILRTPGTLPCPGT-LPPP :. :.. : . : ::. :::: KIAA18 ASAAAPAPVSTAPATKTSRCAKGGPLSPRKDAGRAKDRKDPRK-KKKGKEAGPGAGLPPP 890 900 910 920 930 940 50 60 70 80 90 100 FLJ002 RTHSYLPGHSPLLGHTPTSRDTPPSRNTLPPPWMLPSPRTLPSPRTLPSPRTLPTPGTHF : .: : :. .:: ::: : : : : :: : :: : . 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KIAA12 PPLVAPTPSS-PPPPPLPPP---PPPA-MPSPPPPPPPAAAPLAAP-PEEPAAPSPEDPE 670 680 690 700 710 720 290 300 310 320 330 340 FLJ002 TPGTLPRPGTSYVLYGTVGGRAWGLSFPPSLIRRCTMRGLSVAFREVMGCRWRFGGSGEG : : : KIAA12 LPDTRPLHLAKKQETAAVCGETDEEAGESGGEGIFRERDEFVIRAEDIPSLKLALQTGRE 730 740 750 760 770 780 >>FLJ00201 ( 705 res) sj04110 (705 aa) initn: 206 init1: 86 opt: 206 Z-score: 103.2 bits: 28.9 E(): 1.5 Smith-Waterman score: 272; 29.600% identity (45.067% similar) in 375 aa overlap (22-369:159-507) 10 20 30 40 FLJ002 VARPRWGWGCHADGTRTRTLPPPGILRTPGTLPCPG--TLPPPRTHSYLPG ::: :: :: :. :.: . .:: FLJ002 PPGLPGKVGPPGQPGLRGEPGIRGDQGLRGPPG---PPG-LPGPSGITIPGKPGAQGVPG 130 140 150 160 170 180 50 60 70 80 90 100 FLJ002 HSPLLGHT-PTSRDTPPSR------NTLPPPWM--LPSPRTLPSPRTLPSPRTLPTPGTH . :. : .. ::. : . : . :. :.: ::.: : :: FLJ002 PPGFQGEPGPQGEPGPPGDRGLKGDNGVGQPGLPGAPGQGGAPGPPGLPGPAGLGKPGLD 190 200 210 220 230 240 110 120 130 140 150 FLJ002 FYLPGHSPLLGHTSPSWDTLP--PPGTHFPLQGHTSPSWDILPTPGMLPSPRTLPAPRTH ::: :...: : ::. : .: :. : . .:: ::.:. 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