# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -H -O./tmp/sh02437.fasta.huge -Q ../query/FLJ00134.ptfa ./tmplib.10216 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 FLJ00134, 341 aa vs ./tmplib.10216 library 2210653 residues in 2457 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.3477+/-0.00728; mu= 7.4634+/- 0.488 mean_var=363.8959+/-84.829, 0's: 0 Z-trim: 54 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.067233 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2457) KIAA1954 ( 468 res) fk02322 ( 468) 296 41.7 0.00011 KIAA0412 ( 720 res) hg03242 ( 720) 275 40.0 0.00055 KIAA1339 ( 409 res) fj00071 ( 409) 254 37.5 0.0017 KIAA0557 ( 493 res) hh01334 ( 493) 255 37.8 0.0017 KIAA1710 ( 515 res) fj18457 ( 515) 251 37.4 0.0023 KIAA1962 ( 746 res) hm00158 ( 746) 250 37.6 0.003 KIAA1015 ( 841 res) hk03609(revised) ( 841) 250 37.7 0.0032 KIAA1396 ( 551 res) hj08221 ( 551) 242 36.6 0.0044 KIAA1871 ( 821 res) hj05256s1 ( 821) 244 37.1 0.0047 KIAA0972 ( 702 res) hj06859 ( 702) 242 36.8 0.005 KIAA1947 ( 608 res) fh23660 ( 608) 239 36.4 0.0057 KIAA1874 ( 579 res) hk07257s1 ( 579) 238 36.3 0.0059 KIAA0961 ( 530 res) hj05830 ( 530) 236 36.0 0.0065 KIAA1508 ( 573 res) hk06576 ( 573) 234 35.9 0.0077 KIAA1559 ( 544 res) fh19195 ( 544) 232 35.6 0.0086 KIAA1829 ( 557 res) hj00069 ( 557) 231 35.5 0.0093 KIAA0798 ( 682 res) hk06584 ( 682) 232 35.8 0.0096 KIAA0198 ( 562 res) ha02521 ( 562) 230 35.5 0.01 KIAA1956 ( 680 res) fk08713 ( 680) 231 35.7 0.01 KIAA0326 ( 927 res) hg00579 ( 927) 233 36.1 0.01 KIAA0065 ( 848 res) ha00946 ( 848) 232 35.9 0.011 KIAA1141 ( 914 res) hk01833 ( 914) 230 35.8 0.013 KIAA0628 ( 540 res) hh01433 ( 540) 226 35.0 0.013 KIAA1431 ( 891 res) fj00022 ( 891) 229 35.7 0.013 KIAA1388 ( 599 res) fj06552 ( 599) 226 35.1 0.014 KIAA2003 ( 460 res) ah02593 ( 460) 223 34.6 0.015 FLJ00187 ( 563 res) sj02149 ( 563) 224 34.9 0.015 KIAA1982 ( 599 res) fk06527(revised) ( 599) 224 34.9 0.015 FLJ00284 ( 366 res) sh02281 ( 366) 219 34.1 0.017 FLJ00309 ( 564 res) sh05969 ( 564) 222 34.7 0.017 KIAA1806 ( 481 res) fk00438 ( 481) 219 34.3 0.019 FLJ00032 ( 705 res) as00032 ( 705) 221 34.7 0.02 KIAA1827 ( 469 res) fk01409 ( 469) 218 34.2 0.021 KIAA1611 ( 813 res) fj12627 ( 813) 221 34.9 0.022 KIAA1349 ( 752 res) fj00940 ( 752) 217 34.4 0.028 KIAA1615 ( 484 res) fj13419 ( 484) 213 33.7 0.029 KIAA1852 ( 948 res) fj01514 ( 948) 216 34.5 0.033 KIAA1948 ( 487 res) fh24556 ( 487) 211 33.5 0.033 KIAA2033 ( 766 res) ej00602s1 ( 766) 214 34.1 0.034 KIAA1951 ( 679 res) fj05532 ( 679) 212 33.8 0.037 KIAA1809 ( 800 res) fk01629 ( 800) 210 33.8 0.046 KIAA1969 ( 595 res) fk06944 ( 595) 205 33.1 0.055 KIAA1979 ( 309 res) fj09511 ( 309) 200 32.1 0.056 FLJ00416 ( 221 res) sj04686 ( 221) 197 31.6 0.058 KIAA2007 ( 580 res) fj01689 ( 580) 203 32.9 0.062 KIAA1473 ( 574 res) fj03262 ( 574) 202 32.8 0.066 KIAA1198 ( 553 res) fg01911 ( 553) 201 32.6 0.07 KIAA1190 ( 174 res) hg03443a ( 174) 192 30.9 0.072 KIAA0426 ( 613 res) hh01274 ( 613) 200 32.6 0.078 KIAA1588 ( 613 res) fj08823 ( 613) 200 32.6 0.078 >>KIAA1954 ( 468 res) fk02322 (468 aa) initn: 834 init1: 271 opt: 296 Z-score: 177.6 bits: 41.7 E(): 0.00011 Smith-Waterman score: 357; 39.344% identity (63.934% similar) in 122 aa overlap (195-316:359-465) 170 180 190 200 210 220 FLJ001 QAVRPYKQEPSSPPLAPGLPAFLAAPGTTSCPECGKTSLKPAHLLRHRQSHSGEKPHACP : :::.. . . : .:...:.::::. : KIAA19 YQCNVCGKAFKRSTSFIEHHRIHTGEKPYECNECGEAFSRRSSLTQHERTHTGEKPYECI 330 340 350 360 370 380 230 240 250 260 270 280 FLJ001 ECGKAFRRKEHLRRHRDTHPGSPGSPGPALRPLPAREKPHACCECGKTFYWREHLVRHRK .::::: .. : .:. :: : :::. : :::..: . .: :.. 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KIAA19 MCNECGKAFSDSSSLTPHHRTHSG---------------EKPFKCDDCGKGFTLSAHLIK 470 480 490 500 510 290 300 310 320 330 340 FLJ001 HRKTHSGARPFACWECGKGFGRREHVLRHQRIHGRAAASAQGAVAPGPDGGGPFPPWPLG :.. :.: .:. : .::. :. ...::::: KIAA19 HQRIHTGEKPYKCKDCGRPFSDSSSLIQHQRIHTGEKPYTCSNCGKSFSHSSSLSKHQRI 520 530 540 550 560 570 KIAA19 HTGEKPYKCGECGKAFRQNSCLTRHQRIHTGEKPYLCNDCGMTFSHFTSVIYHQRLHSGE 580 590 600 610 620 630 >>KIAA1015 ( 841 res) hk03609(revised) (841 aa) initn: 637 init1: 241 opt: 250 Z-score: 151.2 bits: 37.7 E(): 0.0032 Smith-Waterman score: 442; 30.970% identity (55.970% similar) in 268 aa overlap (64-316:408-659) 40 50 60 70 80 FLJ001 WPGCHLKVGGFKMAPWQGVGRRPWFLTWGPLCGAA-SVSPSM----TVASSQQGWDCTAG .:: : :: . .: :... . :. KIAA10 CGECGKSYNQRVHLTQHQRVHTGEKPYKCQVCGKAFRVSSHLVQHHSVHSGERPYGCNEC 380 390 400 410 420 430 90 100 110 120 130 140 FLJ001 RRWLGEGE--IEALAQVSEFKTVLSFQGPAASPDGSSATRVPQDVTQGPGATGGKEDSGM . .:. :: : . . :. . . . : .. .. ... .:: . .. 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