# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -H -O./tmp/sh02980.fasta.huge -Q ../query/FLJ00357.ptfa ./tmplib.10216 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 FLJ00357, 628 aa vs ./tmplib.10216 library 2210366 residues in 2457 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2345+/-0.00446; mu= 15.9814+/- 0.301 mean_var=123.9620+/-27.629, 0's: 0 Z-trim: 15 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.115194 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2457) KIAA0782 ( 1281 res) hk05405s1 (1281) 3913 661.9 1.1e-190 KIAA0580 ( 1631 res) hj00601s1 (1631) 1520 264.3 6.8e-71 KIAA0167 ( 844 res) ha01026 ( 844) 328 65.8 2e-11 KIAA1716 ( 804 res) hj06603 ( 804) 306 62.2 2.4e-10 FLJ00312 ( 663 res) sh06481 ( 663) 287 58.9 1.9e-09 KIAA0041 ( 781 res) ha00469s1 ( 781) 277 57.3 6.7e-09 KIAA0400 ( 1022 res) hg01091 (1022) 276 57.3 8.8e-09 KIAA0050 ( 796 res) ha01557 ( 796) 267 55.7 2.1e-08 KIAA1249 ( 949 res) hh04184 ( 949) 266 55.6 2.7e-08 KIAA1099 ( 864 res) hk07834 ( 864) 264 55.2 3.2e-08 KIAA1975 ( 597 res) aj01061 ( 597) 256 53.7 6.4e-08 KIAA0148 ( 704 res) fh23975 ( 704) 218 47.5 5.6e-06 KIAA0969 ( 1091 res) hj06525 (1091) 145 35.6 0.033 KIAA0799 ( 2111 res) fg01615y1 (2111) 133 34.0 0.2 KIAA1686 ( 1175 res) fh25862s1 (1175) 128 32.8 0.24 KIAA0403 ( 416 res) hg01159 ( 416) 107 28.7 1.5 FLJ00276 ( 426 res) sh00612 ( 426) 99 27.4 3.7 KIAA1664 ( 920 res) fj04751s1 ( 920) 100 28.0 5.3 KIAA1620 ( 1398 res) hj04150 (1398) 102 28.6 5.4 KIAA1118 ( 1165 res) hk07196(revised) (1165) 101 28.3 5.4 KIAA1555 ( 2414 res) fh17482s2 (2414) 104 29.2 6 KIAA0395 ( 1003 res) fg04028s1 (1003) 98 27.7 7 KIAA1251 ( 1483 res) hh07943 (1483) 100 28.3 7.1 KIAA0379 ( 1059 res) hh00505s1 (1059) 97 27.6 8.1 KIAA1524 ( 884 res) fj00637(revised) ( 884) 96 27.3 8.2 KIAA1756 ( 1001 res) fh13904(revised) (1001) 96 27.4 8.8 KIAA0640 ( 603 res) hj03440 ( 603) 93 26.6 9.2 KIAA0793 ( 1055 res) hk05692 (1055) 95 27.2 10 KIAA0053 ( 666 res) ha01417 ( 666) 92 26.5 11 KIAA0129 ( 442 res) ha00496 ( 442) 89 25.8 12 KIAA0236 ( 1696 res) ha04654 (1696) 96 27.7 12 KIAA1626 ( 1284 res) fg01925(revised) (1284) 94 27.2 13 KIAA0465 ( 4433 res) hg01123s2 (4433) 100 28.9 14 KIAA1831 ( 663 res) hk00543 ( 663) 90 26.1 14 KIAA1362 ( 699 res) fj02381 ( 699) 90 26.2 14 KIAA1743 ( 1036 res) pj01380s1 (1036) 92 26.7 14 KIAA1935 ( 441 res) fk03135(revised) ( 441) 87 25.4 15 KIAA0306 ( 1451 res) hg00063 (1451) 92 26.9 18 FLJ00356 ( 851 res) sh02495 ( 851) 88 26.0 20 KIAA1968 ( 860 res) fk04713 ( 860) 88 26.0 20 KIAA1317 ( 435 res) fh13117 ( 435) 84 24.9 21 KIAA1532 ( 601 res) fg04455(revised) ( 601) 85 25.3 23 KIAA0902 ( 910 res) hk09777 ( 910) 87 25.8 23 KIAA0842 ( 1020 res) hk05077 (1020) 87 25.9 25 KIAA1269 ( 531 res) hk04070 ( 531) 83 24.9 27 KIAA0761 ( 551 res) hk04655s1 ( 551) 83 24.9 27 KIAA1589 ( 816 res) fj08951 ( 816) 85 25.4 28 FLJ00281 ( 1495 res) sh01915 (1495) 88 26.3 28 KIAA1418 ( 889 res) hj05336(revised) ( 889) 85 25.5 29 KIAA1072 ( 759 res) hj06360 ( 759) 84 25.2 30 >>KIAA0782 ( 1281 res) hk05405s1 (1281 aa) initn: 3939 init1: 3911 opt: 3913 Z-score: 3516.5 bits: 661.9 E(): 1.1e-190 Smith-Waterman score: 3913; 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KIAA05 KSQSLTSQ-SQAVVT-------PEKCGYLELRGYKAKIFTVLSGNSVWLCKNEQDFKSGL 510 520 530 540 550 270 280 290 300 310 320 FLJ003 GITFIDMSVGNVKEVDR---RSFDLTTPYRIFSFSADSELEKEQWLEAMEGAIAEALSTS :::.: :.:.:::.::: .::.. :::: :::.:..: ::..:.::.. .:::.:: KIAA05 GITIIPMNVANVKQVDRTVKQSFEIITPYRSFSFTAETEKEKQDWIEAVQQSIAETLSDY 560 570 580 590 600 610 330 340 350 360 370 380 FLJ003 EVAERIWAPAPNRFCADCGAPQPDWASINLCVVICKRCAGEHRGLGAGVSKVRSLKMDRK ::::.:: :: :::: ::.::::::::::::::.:::.::.:: ::::::::: . KIAA05 EVAEKIWFNESNRSCADCKAPDPDWASINLCVVICKKCAGQHRSLGPKDSKVRSLKMDAS 620 630 640 650 660 670 390 400 410 420 430 440 FLJ003 VWTETLIELFLQLGNGAGNRFWAANVPPSEALQPSSSPSTRRCHLEAKYREGKYRRYHPL .:.. :::::. .:: .: :::.:. .: :. .: :. . ::.:::.:. KIAA05 IWSNELIELFIVIGNKRANDFWAGNLQKDEELHMDSPVEKRKNFITQKYKEGKFRKTLLA 680 690 700 710 720 730 450 460 470 480 490 500 FLJ003 FGNQEELDKALCAAVTTTDLAETQALLGCGAGINCFSGDPEAPTPLALAEQAGQTLQMEF ..:::.:::::::. :. ::.::: :: . : .::: :: ::..:::.::::: KIAA05 SLTKEELNKALCAAVVKPDVLETMALLFSGADVMCATGDPVHSTPYLLAKKAGQSLQMEF 740 750 760 770 780 790 510 520 530 540 550 560 FLJ003 LRNNRTTEVPRLD--SMKPLEKHYSVVLPTVSHSGFLYKTASAG-KLLQDRRAREEFSRR : .:. .. :. : : : .. : .. :::.. ::. :: .... :: ... KIAA05 LYHNKFSDFPQHDIHSEGVLSQESS---QSTFLCDFLYQAPSAASKLSSEKKLLEETNKK 800 810 820 830 840 570 580 590 600 610 FLJ003 WCVLGDGVLSYFENERAVTPNGEIRASEIVCLAVPPPDTH---GFEHTFEVYTEGERLYL :::: : :::.::....:::: : .:..:::. : . : ::.: .::..: KIAA05 WCVLEGGFLSYYENDKSTTPNGTININEVICLAIHKEDFYLNTGPIFIFEIYLPSERVFL 850 860 870 880 890 900 620 FLJ003 LWAGECGAGS . : KIAA05 FGAETSQAQRKWTEAIAKHFVPLFAENLTEADYDLIGQLFYKDCHALDQWRKGWFAMDKS 910 920 930 940 950 960 >>KIAA0167 ( 844 res) ha01026 (844 aa) initn: 342 init1: 211 opt: 328 Z-score: 298.6 bits: 65.8 E(): 2e-11 Smith-Waterman score: 359; 30.242% identity (59.274% similar) in 248 aa overlap (275-505:519-762) 250 260 270 280 290 300 FLJ003 LYVAVVGDKVQLYKNLEEYHLGIGITFIDMSVGNVKEVDRRSFDLTTPYRIFSFSADSEL :.:...: . . . ... . . : : : KIAA01 LSPLSREPPPSPMVKKQRRKKLTTPSKTEGSAGQAEEENFEFLIVSSTGQTWHFEAASFE 490 500 510 520 530 540 310 320 330 340 FLJ003 EKEQWLEAMEGAIAEALS---TSEVAER------------IWAPAPNRFCADCGAPQPDW :.. :..:.:. : .:. .:.: : : : .:.:::::.: : KIAA01 ERDAWVQAIESQILASLQCCESSKVKLRTDSQSEAVAIQAIRNAKGNSICVDCGAPNPTW 550 560 570 580 590 600 350 360 370 380 390 400 FLJ003 ASINLCVVICKRCAGEHRGLGAGVSKVRSLKMDRKVWTETLIELFLQLGNGAGNRFWAAN ::.:: ..:: .:.: ::.::. .:.:::: .: : . : .. .:: ..:: : .. 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