# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -H -O./tmp/sh03877.fasta.huge -Q ../query/FLJ00295.ptfa ./tmplib.10216 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 FLJ00295, 770 aa vs ./tmplib.10216 library 2210224 residues in 2457 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.3149+/-0.0072; mu= 3.4642+/- 0.483 mean_var=342.2083+/-77.618, 0's: 0 Z-trim: 7 B-trim: 27 in 1/39 Lambda= 0.069331 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2457) KIAA1523 ( 687 res) fh16681(revised) ( 687) 3167 330.8 3.3e-91 KIAA0309 ( 3053 res) hg00096s1 (3053) 214 36.4 0.064 KIAA1471 ( 1421 res) fj02383s1 (1421) 190 33.5 0.22 FLJ00141 ( 1326 res) sh04092 (1326) 187 33.2 0.26 KIAA0638 ( 1384 res) hj03347s1 (1384) 187 33.2 0.27 KIAA1696 ( 635 res) fj12768 ( 635) 173 31.3 0.45 KIAA1542 ( 1654 res) hh03408 (1654) 176 32.2 0.63 KIAA1930 ( 664 res) fj11193 ( 664) 161 30.1 1.1 KIAA0383 ( 1781 res) hh00708s1 (1781) 168 31.5 1.1 KIAA1802 ( 821 res) fj21631 ( 821) 160 30.2 1.3 FLJ00072 ( 204 res) as00072 ( 204) 144 27.7 1.7 FLJ00160 ( 1696 res) sh06621 (1696) 161 30.7 1.8 KIAA1085 ( 584 res) hj07690 ( 584) 148 28.8 2.4 KIAA0234 ( 1512 res) ha02764 (1512) 153 29.9 3 KIAA1690 ( 482 res) fh27434 ( 482) 142 28.1 3.3 KIAA2026 ( 858 res) fk11517 ( 858) 146 28.8 3.5 KIAA0783 ( 899 res) hk05408 ( 899) 145 28.7 3.8 KIAA1902 ( 1112 res) hj04383 (1112) 146 29.0 4 KIAA1539 ( 543 res) fg02356 ( 543) 137 27.6 5 KIAA1506 ( 3309 res) ff04330 (3309) 152 30.2 5 FLJ00406 ( 261 res) sj08464 ( 261) 130 26.5 5.3 KIAA0847 ( 645 res) hk05395 ( 645) 135 27.5 6.3 KIAA0613 ( 734 res) hg01088b ( 734) 135 27.6 6.8 KIAA1744 ( 855 res) pj01516 ( 855) 136 27.8 6.9 KIAA0400 ( 1022 res) hg01091 (1022) 137 28.0 7.1 KIAA0458 ( 1552 res) ef01252 (1552) 140 28.6 7.4 KIAA1986 ( 334 res) pg00636 ( 334) 127 26.3 7.5 KIAA0473 ( 937 res) hh00220 ( 937) 135 27.8 7.8 KIAA1086 ( 902 res) hj08218 ( 902) 134 27.6 8.2 KIAA1831 ( 663 res) hk00543 ( 663) 131 27.1 8.4 KIAA0346 ( 1682 res) hg01508s1 (1682) 138 28.4 8.9 KIAA1125 ( 1205 res) hk07594 (1205) 135 27.9 9 KIAA1090 ( 715 res) hk03921a ( 715) 130 27.1 9.4 KIAA1306 ( 1154 res) fh05845 (1154) 132 27.6 11 KIAA0023 ( 2111 res) ha00512 (2111) 136 28.4 12 KIAA0697 ( 2486 res) hk04486s1 (2486) 137 28.6 12 KIAA1620 ( 1398 res) hj04150 (1398) 129 27.4 15 KIAA1234 ( 727 res) fh08618 ( 727) 123 26.4 15 KIAA1636 ( 1864 res) ff02660 (1864) 130 27.7 16 KIAA0595 ( 1666 res) hj02929s1 (1666) 128 27.4 18 KIAA1760 ( 2219 res) af00030 (2219) 130 27.8 18 FLJ00092 ( 369 res) as00092 ( 369) 115 25.2 18 KIAA0672 ( 824 res) hk02382 ( 824) 121 26.3 19 KIAA0019 ( 838 res) ha00537 ( 838) 121 26.3 19 FLJ00221 ( 298 res) sj06160 ( 298) 112 24.8 20 KIAA0067 ( 1300 res) ha01038 (1300) 124 26.9 20 KIAA2027 ( 802 res) hg02843(revised) ( 802) 119 26.1 22 KIAA0561 ( 1308 res) hh01676 (1308) 123 26.8 22 KIAA0910 ( 1315 res) hg02207s1 (1315) 123 26.8 22 KIAA1887 ( 967 res) fk02232 ( 967) 120 26.3 22 >>KIAA1523 ( 687 res) fh16681(revised) (687 aa) initn: 3167 init1: 3167 opt: 3167 Z-score: 1730.8 bits: 330.8 E(): 3.3e-91 Smith-Waterman score: 3169; 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KIAA18 LNKETDPVKSPPLPEHQKIPCNSAEPKSIPALSMETQKLGSVLSPESPKPTPLTPLEPQK 110 120 130 140 150 160 350 360 370 380 390 FLJ002 LATQAEQQEWLCSVVALQCSILKHLSAKQMPSHWDSEQTEK-ADI------KPVIVTDSS .. . . : . . . : .:. . :. ...: : . ::. :. : KIAA18 PGSVV-SPELQTPLPSPEPSKPASVSSPEPPKSVPVCESQKLAPVPSPEPQKPAPVSPES 170 180 190 200 210 220 400 410 420 430 440 450 FLJ002 VTTSLQTADKTPTPSHYP--LSCPSGISTQNS-LSCSPPHQSPALEDIGCSSCAEKSKKT : ..: . : ::.: :. ::. : .. :. :: .:. . : ..:: .: KIAA18 VKATL-SNPKPQKQSHFPETLGPPSASSPESPVLAASPEPWGPS---PAASPESRKSART 230 240 250 260 270 280 460 470 480 490 500 510 FLJ002 PCGTANGPVNTEVKANGPHLYSS-PTDSTDPRRLPGANTPLPGLSHRQGWPRPL--TPPA : .: .:. .. :. : .::: : .: : ::: .: : KIAA18 TSPEPRKPSPSE----SPEPWKPFPAVSPEPRRPAPAVSPGSWKPGPPGSPRPWKSNPSA 290 300 310 320 330 520 530 540 550 560 FLJ002 AGGLQNHTVGIIVKTENATGPSS-CPQRSLVPVPSLP-PSIPSSCASIENTSTLQRKTVQ ..: . . : ...:. : :. : : : ::. :. . ..: . :. 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KIAA18 SGSPDLWK-LS-PDQRKTSPASLDFPESQKS--SRGGSPDL----WKSSFFIEPQK--PV 460 470 480 490 500 690 700 710 720 730 740 FLJ002 FPSRVQPSPGSVGTHQLASGGHHIEGAHVHTCHHIIRSPLYVCEWSPCLHGESELPVSQT :: .:.: KIAA18 FPETRKPGPSGPSESPKAASDIWKPVLSIDTEPRKPALFPEPAKTAPPASPEARKRALFP 510 520 530 540 550 560 770 residues in 1 query sequences 2210224 residues in 2457 library sequences Tcomplib [34.26] (2 proc) start: Fri Feb 27 10:51:13 2009 done: Fri Feb 27 10:51:14 2009 Total Scan time: 0.720 Total Display time: 0.250 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]