# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -H -O./tmp/sh05120.fasta.huge -Q ../query/FLJ00305.ptfa ./tmplib.10216 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 FLJ00305, 789 aa vs ./tmplib.10216 library 2210205 residues in 2457 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.1510+/-0.00688; mu= 4.2592+/- 0.461 mean_var=308.0837+/-70.382, 0's: 0 Z-trim: 4 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.073070 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2457) KIAA1928 ( 757 res) fg05950(revised) ( 757) 4833 523.4 4.2e-149 KIAA0310 ( 2388 res) ee03470 (2388) 1327 154.4 1.5e-37 KIAA1139 ( 1124 res) hk00330 (1124) 165 31.5 0.72 FLJ00420 ( 613 res) sj09535 ( 613) 158 30.4 0.83 KIAA0434 ( 1571 res) hh02165 (1571) 164 31.6 0.94 KIAA0691 ( 762 res) hk03735 ( 762) 158 30.5 0.95 KIAA0669 ( 825 res) hk02346 ( 825) 157 30.5 1.1 KIAA0235 ( 1064 res) ha04677s1 (1064) 150 29.9 2.1 KIAA1030 ( 763 res) fh00432 ( 763) 139 28.5 3.8 KIAA2036 ( 1322 res) pf06513 (1322) 143 29.3 3.9 KIAA0458 ( 1552 res) ef01252 (1552) 144 29.5 4 KIAA0910 ( 1315 res) hg02207s1 (1315) 142 29.2 4.2 KIAA0985 ( 697 res) hj08038 ( 697) 133 27.8 5.6 KIAA1236 ( 1840 res) pg00641 (1840) 137 28.8 7.4 FLJ00086 ( 399 res) as00086 ( 399) 124 26.6 7.7 FLJ00259 ( 659 res) sh04102 ( 659) 128 27.3 7.8 KIAA0250 ( 1122 res) ha02790 (1122) 130 27.8 9.2 KIAA0324 ( 2800 res) ee08846s1 (2800) 136 29.0 10 KIAA1811 ( 715 res) ha06731 ( 715) 123 26.8 12 KIAA0672 ( 824 res) hk02382 ( 824) 124 27.0 12 KIAA0515 ( 670 res) hg00183 ( 670) 122 26.7 12 FLJ00139 ( 585 res) sh03241 ( 585) 120 26.4 13 KIAA1824 ( 958 res) fh17057 ( 958) 124 27.1 13 KIAA1357 ( 836 res) fj01906 ( 836) 122 26.8 14 KIAA1085 ( 584 res) hj07690 ( 584) 119 26.3 14 KIAA1587 ( 991 res) fj08327 ( 991) 123 27.0 14 KIAA1442 ( 627 res) hh10127b ( 627) 119 26.3 15 KIAA1506 ( 3309 res) ff04330 (3309) 132 28.7 15 KIAA1224 ( 997 res) fh02652 ( 997) 119 26.6 19 KIAA1306 ( 1154 res) fh05845 (1154) 120 26.8 20 FLJ00008 ( 217 res) as00008 ( 217) 106 24.3 20 FLJ00358 ( 217 res) sh03894 ( 217) 106 24.3 20 FLJ00099 ( 217 res) as00099 ( 217) 106 24.3 20 KIAA1002 ( 962 res) hk09859 ( 962) 118 26.5 20 FLJ00093 ( 977 res) as00093 ( 977) 118 26.5 20 FLJ00356 ( 851 res) sh02495 ( 851) 116 26.2 22 KIAA0582 ( 760 res) fh15957 ( 760) 115 26.0 22 KIAA1968 ( 860 res) fk04713 ( 860) 116 26.2 22 FLJ00020 ( 1142 res) as00020 (1142) 118 26.6 22 FLJ00201 ( 705 res) sj04110 ( 705) 114 25.9 23 FLJ00315 ( 925 res) sh06842 ( 925) 116 26.2 23 KIAA1779 ( 1233 res) hg04229 (1233) 118 26.6 24 KIAA1202 ( 1502 res) fg03353 (1502) 118 26.7 26 KIAA1332 ( 651 res) fh15405 ( 651) 111 25.5 27 KIAA1862 ( 1070 res) aj00563 (1070) 115 26.2 27 KIAA0641 ( 1326 res) hj03494s1 (1326) 116 26.4 28 KIAA0687 ( 1175 res) hk02992 (1175) 115 26.3 28 FLJ00281 ( 1495 res) sh01915 (1495) 116 26.5 30 KIAA1986 ( 334 res) pg00636 ( 334) 103 24.3 32 KIAA0820 ( 892 res) bg00036 ( 892) 111 25.7 32 >>KIAA1928 ( 757 res) fg05950(revised) (757 aa) initn: 4234 init1: 4109 opt: 4833 Z-score: 2770.3 bits: 523.4 E(): 4.2e-149 Smith-Waterman score: 4833; 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KIAA11 QGSPSSPAPGPPPGAPWAFSYLAGPPATP-PDPPRP-KRRSHSLSRPGPTEGDAEGEAEG 690 700 710 720 730 610 620 630 640 650 660 FLJ003 PRNTAQRGKLGDGKEHTKSSGFGWFSWFRSKPTKNASPAGDEDSSDSPDSEQETPRASSP : ... ::. :. : . . :..:. . .:: :.: . . : KIAA11 PVGST----LGSYATLTRRPGRS--ALVRTSPSVTPTPARGTPRSQSFALRARRKGPPPP 740 750 760 770 780 790 670 680 690 700 710 720 FLJ003 HQAGLGLSLTPSPESPPLPDVSAFSRGRGGGEGRGSASSGGAAAGAGVGGLSGPESVSFE :. :::: ::: . ..: : . : . .: . : . .:: : . : KIAA11 PPKRLSSVSGPSPEPPPLDGSPGPKEGATGPRRRTLSEPAGPSEPPGPPAPAGPASDTEE 800 810 820 830 840 850 730 740 750 760 770 780 FLJ003 LCSNPGVLLPPPALKGAVPLYNPSQVPQLPTATSLNRPNRLGSASLSHPAMLRINTRPRL .:: ::. 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