# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -H -O./tmp/sh05404.fasta.huge -Q ../query/FLJ00148.ptfa ./tmplib.10216 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. 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KIAA15 VTVDVKGNSPLWLKVKDLAEGVTYRFRIRAKTFTYGPEIEANVTTGPGEGAPGPPGVPII 1460 1470 1480 1490 1500 1510 280 290 300 310 320 330 FLJ001 TKSASELTLQWTEGHSGDTPTTGYVIEARPSDEGLWDMFVKDIPRSATSYTLSLDKLRQG .. .: ....:. : : : : :::::::: KIAA15 VRYSSAIAIHWSSGDPGKGPITRYVIEARPSGAPRPAGLRPHSSLSPFFLGPSTWGTCLC 1520 1530 1540 1550 1560 1570 340 350 360 370 380 390 FLJ001 VTYEFRVVAVNEAGYGEPSNPSTAVSAQVEAPFYEEWWFLLVMALSSLIVILLVVFALVL KIAA15 PPPEKALVLLQVKSPGPVEEWETGLGGS 1580 1590 >>KIAA0343 ( 1187 res) hg01457 (1187 aa) initn: 351 init1: 185 opt: 376 Z-score: 365.3 bits: 78.5 E(): 3.8e-15 Smith-Waterman score: 376; 30.698% identity (60.930% similar) in 215 aa overlap (32-239:805-1019) 10 20 30 40 50 60 FLJ001 ELTAQSSFKTVNSSSTSTMCELTHLKKYRRYEVIMTAYNIIGESPASAPVEVFVGEAAPA : . . : : .: .: : : :: : KIAA03 RQKDGDDEWTSVVVANVSKYIVSGTPTFVPYLIKVQALNDMGFAPEPAVVMGHSGEDLPM 780 790 800 810 820 830 70 80 90 100 110 FLJ001 MAPQNVQVTPLTASQLEVTWDPPPPESQNGNIQGYKIYYWEADSQNETEKM----KVLFL .:: ::.:. .... :: ::: : .: :..:::.::::...:... .. :.: . KIAA03 VAPGNVRVNVVNSTLAEVHWDPVPLKSIRGHLQGYRIYYWKTQSSSKRNRRHIEKKILTF 840 850 860 870 880 890 120 130 140 150 160 170 FLJ001 PEPVVR--LKNLTSHTKYLVSISAFNAAGDGPKSDPQQGRTHQAAPGAPSFLAFSEITST .. : .: ..: ... . :. :.:: : . : ...:.::: : . . : KIAA03 QGSKTHGMLPGLEPFSHYTLNVRVVNGKGEGPASPDRVFNTPEGVPSAPSSLKIVNPTLD 900 910 920 930 940 950 180 190 200 210 220 230 FLJ001 TLNVSWGEPAAANGILQGYRVVYEPLAPVQGVSKVVTVEVRGNWQRW-LKVRDLTKGVTY .:.. : :. :::: : . :.:. .. .. .: ... .: :: :: ... . KIAA03 SLTLEWDPPSHPNGILTEYTLKYQPINSTHELGPLVDLKIPANKTRWTLKNLNFSTRYKF 960 970 980 990 1000 1010 240 250 260 270 280 290 FLJ001 FFRVQARTITYGPELQANITAGPAEGSPGSPRDVLVTKSASELTLQWTEGHSGDTPTTGY .: .: KIAA03 YFYAQTSAGSGSQITEEAVTTVDEAMASRQVDIATQGWFIGLMCAVALLILILLIVCFIR 1020 1030 1040 1050 1060 1070 >>KIAA1132 ( 2092 res) hh01132s1 (2092 aa) initn: 331 init1: 271 opt: 376 Z-score: 362.2 bits: 78.8 E(): 5.6e-15 Smith-Waterman score: 418; 30.328% identity (56.284% similar) in 366 aa overlap (11-362:976-1328) 10 20 30 40 FLJ001 AELTAQSSFKTVNSSSTSTMCELTHLKKYRRYEVIMTAYN : : : : .. ... :. : . : ..: KIAA11 WTQRFDGNSIITGFDIEYKNKSDSWDFKQSTRNISPTINQANIVDLHPASVYSIRMYSFN 950 960 970 980 990 1000 50 60 70 80 90 100 FLJ001 IIGESPASAPVEVFVGEAAPAMAPQNVQVTPLTASQLEVTWDPPPPESQNGNIQGYKIYY ::.: : . . . :::: :..: . :.:.....::: : : ::: :.::.: : KIAA11 KIGRSEPSKELTISTEEAAPDGPPMDVTLQPVTSQSIQVTWKAPKKELQNGVIRGYQIGY 1010 1020 1030 1040 1050 1060 110 120 130 140 150 FLJ001 WE----ADSQNETEKMKVLFLPEPVVRLKNLTSHTKYLVSISAFNAAGDGPKSDPQQGRT : ...: .::. : : : :: . ..: : ..::: :: ::.:. .. : KIAA11 RENSPGSNGQYSIVEMKATGDSE-VYTLDNLKKFAQYGVVVQAFNRAGTGPSSSEINATT 1070 1080 1090 1100 1110 1120 160 170 180 190 200 FLJ001 HQAAPGAP--SFLAFSEITSTTLNVSWGEP--AAANGILQGYRVVYEPLAPVQG----VS . .:. : . :.: ::: . .::.:: .. ::.:.::::.. : :.: .. KIAA11 LEDVPSQPPENVRALS-ITSDVAVISWSEPPRSTLNGVLKGYRVIFWSLY-VDGEWGEMQ 1130 1140 1150 1160 1170 1180 210 220 230 240 250 260 FLJ001 KVVTVEVRGNWQRWLKVRDLTKGVTYFFRVQARTITYGPELQANIT-AGPAEGSPGSPRD ...:.. : ...: . : ..: .: : : : ..... : :: : KIAA11 NITTTRER------VELRGMEKFTNYSVQVLAYT-QAGDGVRSSVLYIQTKEDVPGPPAG 1190 1200 1210 1220 1230 270 280 290 300 310 320 FLJ001 V-LVTKSASELTLQWTEGHSGDTPTTGYVIEARPSDEGLWDMFVKDIPRSATSYTLSLDK . : .::: ....: . . :.: :. : . .. : . . . KIAA11 IKAVPSSASSVVVSWLPPTKPNGVIRKYTIFC--SSPGSGQPAPSEYETSPEQLFYRIAH 1240 1250 1260 1270 1280 1290 330 340 350 360 370 380 FLJ001 LRQGVTYEFRVVAVNEAGYGEPSNPSTAVSAQVEAPFYEEWWFLLVMALSSLIVILLVVF : .: : . :.::. :: :. :. : : .:: KIAA11 LNRGQQYLLWVAAVTSAGRGNSSEKVTIEPAG-KAPAKIISFGGTVTTPWMKDVRLPCNS 1300 1310 1320 1330 1340 1350 390 400 410 420 430 440 FLJ001 ALVLHGQNKKYKNCSTGKGISTMEESVTLDNGGFAALELSSRHLNVKSTFSKKNGTRSPP KIAA11 VGDPAPAVKWTKDSEDSAIPVSMDGHRLIHTNGTLLLRAVKAEDSGYYTCTATNTGGFDT 1360 1370 1380 1390 1400 1410 >>KIAA1496 ( 920 res) fj09513 (920 aa) initn: 401 init1: 273 opt: 318 Z-score: 310.3 bits: 68.0 E(): 4.4e-12 Smith-Waterman score: 318; 33.526% identity (65.318% similar) in 173 aa overlap (29-198:663-834) 10 20 30 40 50 FLJ001 AELTAQSSFKTVNSSSTSTMCELTHLKKYRRYEVIMTAYNIIGESPASAPVEVFVGEA : ::: . .:: ::.: : . :: .: KIAA14 RPLGVTTWIQTVVTSPDTPRYVFRNESIVPYSPYEVKVGVYNNKGEGPFSPVTTVFSAEE 640 650 660 670 680 690 60 70 80 90 100 110 FLJ001 APAMAPQNVQVTPLTASQLEVTWDPPPPESQNGNIQGYKIYYWEADSQNETE-KMKVLFL :..::..:... :..:..::.:. : . .::.. ::.. ::.. ...:. :::: KIAA14 EPTVAPSQVSANSLSSSEIEVSWNTIPWKLSNGHLLGYEVRYWNGGGKEESSSKMKVAG- 700 710 720 730 740 750 120 130 140 150 160 170 FLJ001 PEPVVRLKNLTSHTKYLVSISAFNAAGDGPKSDPQQGRTHQAAPGAPSFLAFSEITSTTL : .::..: :. : ... :.:.:: :: : . :... :. : . . :.: . KIAA14 NETSARLRGLKSNLAYYTAVRAYNSAGAGPFSATVNVTTKKTPPSQPPGNVVWNATDTKV 760 770 780 790 800 810 180 190 200 210 220 230 FLJ001 NVSWGEPAAANGI--LQGYRVVYEPLAPVQGVSKVVTVEVRGNWQRWLKVRDLTKGVTYF ..: . : .. . ::.: : KIAA14 LLNWEQVKAMENESEVTGYKVFYRTSSQNNVQVLNTNKTSAELVLPIKEDYIIEVKATTD 820 830 840 850 860 870 >>KIAA0756 ( 1222 res) ff01911 (1222 aa) initn: 326 init1: 140 opt: 301 Z-score: 292.2 bits: 65.1 E(): 4.4e-11 Smith-Waterman score: 301; 25.954% identity (55.344% similar) in 262 aa overlap (29-284:843-1095) 10 20 30 40 50 FLJ001 AELTAQSSFKTVNSSSTSTMCELTHLKKYRRYEVIMTAYNIIGESPASAPVEVFVGEA : ::. . : : .:..: : . :: KIAA07 IVKWRRRETREAWNNVTVWGSRYVVGQTPVYVPYEIRVQAENDFGKGPEPESVIGYSGED 820 830 840 850 860 870 60 70 80 90 100 110 FLJ001 APAMAPQNVQVTPLTASQLEVTWDPPPPESQNGNIQGYKIYYWEADS--QNETEKMKVLF : :: .:.: .... . . :. .. .:... :. :::. .: .: ..: KIAA07 YPRAAPTEVKVRVMNSTAISLQWNRVYSDTVQGQLREYRAYYWRESSLLKNLWVSQKRQQ 880 890 900 910 920 930 120 130 140 150 160 170 FLJ001 LPEPVVRLKNLTS----HTKYLVSISAFNAAGDGPKSDPQQGRTHQAAPGAPSFLAFSEI : ::....: ...: . . . :. ::::.:. .. : ...:.:: . . KIAA07 ASFPGDRLRGVVSRLFPYSNYKLEMVVVNGRGDGPRSETKEFTTPEGVPSAPRRFRVRQP 940 950 960 970 980 990 180 190 200 210 220 230 FLJ001 TSTTLNVSWGEPAAANGILQGYRVVYEPLAPVQGVSKVVTVEVRGNWQRWLKVRDLTKGV . :.:. : .: :::. :: . : . .. :.: .. . : : . :. 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KIAA09 ISDDEIENPHYSPSTCLAISWEKPCDHGSEILAYSIDF-------GDKQSLTV---GKVT 820 830 840 850 860 230 240 250 260 270 FLJ001 RWLKVRDLTKGVTYFFRVQA-RTITYGPELQANITAGPAEGSPGSPRDVLVTKSASELTL .. . .: .:: .:.:: .. :: .. : : :: :. : ..: : KIAA09 SYI-INNLQPDTTYRIRIQALNSLGAGP-FSHMIKLKTKPLPPDPPRLECVAFSHQNLKL 870 880 890 900 910 920 280 290 300 310 320 330 FLJ001 QWTEGHSGDTPTTGYVIEARPSDEGLWDMFVKDIPRSATSYTLSLDKLRQGVTYEFRVVA .: :: : . . . :.. ::. . :. .: ....: ....:.: . : KIAA09 KWGEGTPKTLSTDSIQYHLQMEDKN--GRFVS-LYRGPC-HTYKVQRLNESTSYKFCIQA 930 940 950 960 970 340 350 360 370 380 FLJ001 VNEAGYGEPSN------PSTAVSAQVEAPFYEE---------WWFLLVMALSSLIVILLV :::: : :. :.. : : ..:: :. : : : . .: : : KIAA09 CNEAGEGPLSQEYIFTTPKS-VPAALKAPKIEKVNDHICEITWECLQPMKGDPVIYSLQV 980 990 1000 1010 1020 1030 390 400 410 420 430 440 FLJ001 VFALVLHGQNKKYKNCSTGKGISTMEESVTLDNGGFAALELSSRHLNVKSTFSKKNGTRS .. :.....:. : : :. :. 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