# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -H -O./tmp/sh05462.fasta.huge -Q ../query/FLJ00149.ptfa ./tmplib.10216 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 FLJ00149, 792 aa vs ./tmplib.10216 library 2210202 residues in 2457 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5226+/-0.00494; mu= 14.4862+/- 0.333 mean_var=150.7898+/-33.284, 0's: 0 Z-trim: 4 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.104445 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2457) KIAA0435 ( 787 res) hh02241 ( 787) 4851 743.3 2.7e-215 KIAA0805 ( 1327 res) hk02940s1 (1327) 2163 338.6 3.1e-93 KIAA2022 ( 1520 res) ff04229 (1520) 136 33.2 0.29 FLJ00034 ( 1343 res) as00034 (1343) 132 32.6 0.41 KIAA1202 ( 1502 res) fg03353 (1502) 126 31.7 0.82 KIAA1491 ( 757 res) fj08187 ( 757) 122 30.7 0.84 KIAA1357 ( 836 res) fj01906 ( 836) 113 29.4 2.3 KIAA1742 ( 1301 res) pj01304s1 (1301) 111 29.4 3.6 FLJ00204 ( 573 res) sj04432 ( 573) 105 28.0 4.2 KIAA1203 ( 727 res) fg03361 ( 727) 105 28.1 4.8 KIAA0144 ( 983 res) ha03843 ( 983) 106 28.5 5.2 KIAA1787 ( 1564 res) fh19054 (1564) 108 29.0 5.5 FLJ00031 ( 188 res) as00031 ( 188) 92 25.3 8.6 KIAA0190 ( 813 res) ha03225 ( 813) 98 27.1 11 KIAA1912 ( 589 res) fj18220 ( 589) 96 26.6 11 KIAA1494 ( 638 res) fj08673 ( 638) 96 26.7 11 KIAA0860 ( 551 res) hk06518 ( 551) 95 26.4 12 FLJ00005 ( 111 res) as00005 ( 111) 86 24.1 12 KIAA1860 ( 689 res) fh18358 ( 689) 96 26.7 12 KIAA1201 ( 761 res) fg03153 ( 761) 96 26.8 13 KIAA0324 ( 2800 res) ee08846s1 (2800) 103 28.6 13 FLJ00103 ( 678 res) as00103 ( 678) 95 26.6 13 KIAA1053 ( 508 res) hh05049 ( 508) 93 26.1 14 FLJ00155 ( 612 res) sh06465 ( 612) 94 26.4 14 FLJ00056 ( 1310 res) as00056 (1310) 98 27.4 14 KIAA1457 ( 1359 res) fh16161s1 (1359) 98 27.5 14 KIAA0497 ( 239 res) hg00150 ( 239) 88 24.9 15 KIAA1134 ( 611 res) hj00883 ( 611) 93 26.2 15 FLJ00420 ( 613 res) sj09535 ( 613) 93 26.2 15 FLJ00128 ( 1546 res) sh01521 (1546) 98 27.5 16 KIAA0638 ( 1384 res) hj03347s1 (1384) 97 27.3 16 KIAA0669 ( 825 res) hk02346 ( 825) 94 26.5 16 KIAA0691 ( 762 res) hk03735 ( 762) 93 26.3 17 KIAA1398 ( 1586 res) ha02572 (1586) 97 27.4 17 KIAA0827 ( 1608 res) hh03726 (1608) 97 27.4 18 KIAA1453 ( 1123 res) fh14729 (1123) 95 26.9 18 FLJ00261 ( 1651 res) sh06537 (1651) 97 27.4 18 KIAA0821 ( 1566 res) hh02631 (1566) 96 27.2 19 FLJ00181 ( 368 res) sj01527 ( 368) 88 25.1 19 KIAA1820 ( 1644 res) hh01321 (1644) 96 27.3 20 KIAA0149 ( 830 res) ha01221 ( 830) 92 26.2 20 KIAA0938 ( 1257 res) hh04777s1 (1257) 94 26.8 21 KIAA0160 ( 803 res) ha03912s1 ( 803) 91 26.1 22 KIAA1081 ( 1003 res) bg00262 (1003) 92 26.4 23 KIAA0243 ( 699 res) ha04782 ( 699) 90 25.8 23 KIAA1853 ( 708 res) hj04155 ( 708) 90 25.8 23 KIAA0079 ( 1102 res) ha03543 (1102) 92 26.4 24 KIAA1271 ( 542 res) hk06527 ( 542) 88 25.4 24 KIAA0164 ( 929 res) ha02373 ( 929) 90 26.0 27 KIAA1441 ( 1258 res) hg02860b (1258) 91 26.3 28 >>KIAA0435 ( 787 res) hh02241 (787 aa) initn: 4845 init1: 4845 opt: 4851 Z-score: 3958.7 bits: 743.3 E(): 2.7e-215 Smith-Waterman score: 4851; 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KIAA08 TTANNPHSNVTQGSIGNPGQGSGTGLHPPVTSYPPTLGTSHSSHSVQSGLVRQSPARASV 1050 1060 1070 1080 1090 1100 610 620 630 640 650 660 FLJ001 LSSSGPILESRQTFLQTSTSVHELAQRLSGSRLSLHASATSLHSQPPPVTTTGHLSVR-E :.:. ::.. :. ::. .: : :..::. .:..:. .. .... . KIAA08 ASQSSYCYSSRHSSLRMSTTGFVPCRRSSTSQISLRNLPSSIQSR---LSMVNQMEPSGQ 1110 1120 1130 1140 1150 1160 670 680 690 700 710 720 FLJ001 RAEALIRSSLGSSTSSTLSFLFGKRSFSSALVISGLSAAEGGNTS--DTQSSSSVNIVMG . : .. .: ::.::. :. :. .. :. :.:::..: :.: ..... . . KIAA08 SGLACVQHGLPSSSSSSQSIPACKHH-----TLVGFLATEGGQSSATDAQPGNTLSPANN 1170 1180 1190 1200 1210 1220 730 740 750 760 770 780 FLJ001 PSARAASQATR-HLSEPCEPPDATEQGQLHDRCLAEAVADTLGVVCRRASQEDMGLDDTA .. : : .. .: . KIAA08 SHSKKAEVIYRVQIVDPSQILEGINLSKRKELQWPDEGIRLKAGRNSWKDWSPQEGMEGH 1230 1240 1250 1260 1270 1280 >>KIAA2022 ( 1520 res) ff04229 (1520 aa) initn: 75 init1: 51 opt: 136 Z-score: 116.0 bits: 33.2 E(): 0.29 Smith-Waterman score: 136; 21.127% identity (55.282% similar) in 284 aa overlap (456-726:587-862) 430 440 450 460 470 480 FLJ001 SFKVIKVNKECVRGLWAGQQQELIFLRNRNPERGSIQNNKQVLRNLINSSCDQPLGYPMY : .: :..:. :: ..: :.. . KIAA20 NMLVKLGKVDASETTVNLSENQLNKYAKLAPLKGFWQKKKK-QRNTNTDSIKTPFSQKQS 560 570 580 590 600 610 490 500 510 520 530 540 FLJ001 VSP--LTTSYLGTHRQLKNIWGGPITLDRIRTWFWTKWVRMRKDCNARQHSGGNIEDVDG : . .:.: :. :. :. ..:: . . .. . :: ..:.... :: KIAA20 FEPGSFEVSFLPPARKRKSKLGNRHRIQRIPSIEISASSKQISLCNDQRHASNHKEDGGL 620 630 640 650 660 670 550 560 570 580 590 FLJ001 GGAPTTGGNNAPS--GGSQESSAEQPRKGGAQHGVSSCEGTQRTG------RRKGRSQSV :. .. .::: .::. .. : . .. . .: .: . ..: .: KIAA20 KGTLKSAPLGAPSCANGSHLNDITGPDSVKVKAQDTEFKGPERKVLNKIKFKSEARLKSK 680 690 700 710 720 730 600 610 620 630 640 650 FLJ001 QAHSALSQRPPMLSSSGPILESRQTFLQTSTSVHELAQRLSGSRLS-LHASATSLHSQPP ....: .. :... : :.::.... . .. : . ..:::: .: . .. : KIAA20 KVKAAGQESKPIVQMS-PLLENQSSKANLKNEV--IPGTSNSSRLSEFHEAKAAKSSTFL 740 750 760 770 780 790 660 670 680 690 700 710 FLJ001 PVTTTGHLSVRERAEALIRSSLGSSTSSTLSFLFGKRSFSSALVISGLS--AAEGGNTSD :.: .... . . : . ... .. :. :. ..:. :: .: . : .. : KIAA20 PTTCSSEMPL---SSANVTTNIPVIPGGYLQTLLDASDLSNNTSISYFSHHSPEQNEGSL 800 810 820 830 840 720 730 740 750 760 770 FLJ001 TQSSSSVNIVMGPSARAASQATRHLSEPCEPPDATEQGQLHDRCLAEAVADTLGVVCRRA ::. .: . . :. 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KIAA12 NPLNEASAELAKASFGRPPHLIGPTGHRHSAPEQLLASHLQHVHLDTRGSKGMELPPVQD 390 400 410 420 430 440 >>KIAA1491 ( 757 res) fj08187 (757 aa) initn: 74 init1: 47 opt: 122 Z-score: 107.7 bits: 30.7 E(): 0.84 Smith-Waterman score: 125; 28.351% identity (53.608% similar) in 194 aa overlap (548-729:239-431) 520 530 540 550 560 570 FLJ001 WTKWVRMRKDCNARQHSGGNIEDVDGGGAPTTGGNNAPSGGSQESSAEQPR---KGGAQH :... :. : .. :: .: . : KIAA14 LSEPLNTSLSMTSAVQNSTYTTSVITSCSLTSSSLNSASPVAMSSSYDQSSVHNRIPYQS 210 220 230 240 250 260 580 590 600 610 620 FLJ001 GVSSCE---GTQRTGRRKGRSQSVQAHSALSQRPPMLSSSGPILESRQ-TFLQTSTSVH- ::: : :: .:. ::::.. . : : : . . . . : : ::: : KIAA14 PVSSSESAPGTIMNGHGGGRSQQTLDTPKTTGPPSALPSVSSLPSTTSCTALLPSTSQHT 270 280 290 300 310 320 630 640 650 660 670 680 FLJ001 -ELAQR-LS--GSRLSLHASATSLHSQPPPVTTTGHLSVRERAEALIRSSLGSSTSSTLS .:.. :: .: :: : :. : :. :. : ::. . ........:. : KIAA14 GDLTSSPLSQLSSSLSSHQSSLSAHAALSSSTSHTHASVESASSHQSSATFSTAATSVSS 330 340 350 360 370 380 690 700 710 720 730 740 FLJ001 FLFGKRSFSSALVISGLSAAEGGNTSDTQSSSSVNIVMGPSARAASQATRHLSEPCEPPD . :.::.. .. : ::. ....:::: . :..: KIAA14 SASSGVSLSSSMNTAN-SLCLGGTPASASSSSSRAAPLVTSGKAPPNLPQGVPPLLHNQY 390 400 410 420 430 440 750 760 770 780 790 FLJ001 ATEQGQLHDRCLAEAVADTLGVVCRRASQEDMGLDDTASQQSVSDEQ KIAA14 LVGPGGLLPAYPIYGYDELQMLQSRLPVDYYGIPFAAPTALASRDGSLANNPYPGDVTKF 450 460 470 480 490 500 >>KIAA1357 ( 836 res) fj01906 (836 aa) initn: 55 init1: 55 opt: 113 Z-score: 100.0 bits: 29.4 E(): 2.3 Smith-Waterman score: 116; 28.017% identity (52.155% similar) in 232 aa overlap (533-739:487-708) 510 520 530 540 550 FLJ001 IWGGPITLDRIRTWFWTKWVRMRKDCNARQHSGGNIEDVDGGGA----PTTGGNNAPSGG : : .. ..::.: :. :.: KIAA13 VPSPTTGEEGSVHSREAKESSAAQAGSHATHPGTSV--LEGGAAGSMSPSRVEANVPMVQ 460 470 480 490 500 510 560 570 580 590 600 610 FLJ001 SQESSA---EQPRKGGAQHGVS--SCEGTQRTGRRKGRSQSVQAHSALSQRPPMLSSSGP . : : :.: ...:. : . :: .:. : : .. : :. :. .:. .: KIAA13 PDVSPAPKQEEPAENSADTGGDGESCL-SQQDGA-AGVPETNAAGSS-SEACDFLKEDGN 520 530 540 550 560 570 620 630 640 650 660 FLJ001 ---ILESR-QTFLQTSTSVHELAQRLSGSRLSLHASATSLHSQPPPVTTTG---HLSVRE . :: .: . ...:. ... : : : . . :: :::: :: :. . 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KIAA17 VLERGQLNGKRDTLWLALRETVYDPSLPASHHSSLSWKGRGGPGDGSPVVLPNSQPDLPD 1230 1240 1250 1260 1270 1280 >>FLJ00204 ( 573 res) sj04432 (573 aa) initn: 60 init1: 60 opt: 105 Z-score: 95.1 bits: 28.0 E(): 4.2 Smith-Waterman score: 108; 21.631% identity (48.582% similar) in 282 aa overlap (544-789:231-503) 520 530 540 550 560 FLJ001 RTWFWTKWVRMRKDCNARQHSGGNIEDVDGGGAPTTGGNNA---PSGGSQESSAEQPR-- ::.: . : .. :..:: : : : FLJ002 GVSGVFPGNYVTPVSRVPAGGAGPPRNNVVGGSPLAKGITTTMHPGSGSLSSLATATRPA 210 220 230 240 250 260 570 580 590 600 610 620 FLJ001 ------KGGAQHGVSSCEGTQRTGRRKGRSQSVQAHSALSQRPPMLSSSGPILESRQTFL .. ::: ..: : :.... . ::.:..: . :. ..: : FLJ002 LPITTPQAHAQHPTAS-PPTGSCLRHSAQPTASQARSTISTA----AHSAAQAQDRPTAT 270 280 290 300 310 630 640 650 660 670 680 FLJ001 QTSTSVHELAQRLSGSRLSLHASATSLHSQPPPVTTTGHLSVRERAEALIRSSLGSSTSS . ... .:: .. : :. .. ::. ::: .. : .: . . 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