# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -H -O./tmp/sh05582.fasta.huge -Q ../query/FLJ00306.ptfa ./tmplib.10216 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 FLJ00306, 278 aa vs ./tmplib.10216 library 2210716 residues in 2457 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2941+/-0.00445; mu= 8.7784+/- 0.298 mean_var=142.9430+/-35.228, 0's: 0 Z-trim: 79 B-trim: 16 in 1/39 Lambda= 0.107274 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 36, opt: 24, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2457) KIAA1969 ( 595 res) fk06944 ( 595) 608 105.7 6.3e-24 KIAA1710 ( 515 res) fj18457 ( 515) 600 104.3 1.4e-23 KIAA0065 ( 848 res) ha00946 ( 848) 599 104.5 2e-23 KIAA1956 ( 680 res) fk08713 ( 680) 596 103.9 2.5e-23 KIAA2007 ( 580 res) fj01689 ( 580) 594 103.5 2.8e-23 KIAA1473 ( 574 res) fj03262 ( 574) 593 103.3 3.1e-23 KIAA0326 ( 927 res) hg00579 ( 927) 594 103.8 3.6e-23 KIAA2033 ( 766 res) ej00602s1 ( 766) 592 103.4 4e-23 KIAA1827 ( 469 res) fk01409 ( 469) 589 102.6 4.2e-23 FLJ00032 ( 705 res) as00032 ( 705) 588 102.7 5.9e-23 KIAA1611 ( 813 res) fj12627 ( 813) 588 102.8 6.4e-23 KIAA0972 ( 702 res) hj06859 ( 702) 582 101.8 1.1e-22 KIAA0412 ( 720 res) hg03242 ( 720) 581 101.6 1.3e-22 KIAA0628 ( 540 res) hh01433 ( 540) 577 100.8 1.7e-22 KIAA1508 ( 573 res) hk06576 ( 573) 577 100.9 1.7e-22 KIAA1615 ( 484 res) fj13419 ( 484) 575 100.4 1.9e-22 KIAA1559 ( 544 res) fh19195 ( 544) 575 100.5 2.1e-22 KIAA1874 ( 579 res) hk07257s1 ( 579) 572 100.1 2.9e-22 KIAA1806 ( 481 res) fk00438 ( 481) 571 99.8 3e-22 FLJ00309 ( 564 res) sh05969 ( 564) 571 99.9 3.2e-22 KIAA2003 ( 460 res) ah02593 ( 460) 566 99.0 4.9e-22 KIAA1141 ( 914 res) hk01833 ( 914) 567 99.6 6.5e-22 KIAA1948 ( 487 res) fh24556 ( 487) 563 98.6 7e-22 KIAA1962 ( 746 res) hm00158 ( 746) 565 99.2 7.2e-22 KIAA0441 ( 702 res) hh00601s1 ( 702) 562 98.7 9.6e-22 KIAA1852 ( 948 res) fj01514 ( 948) 563 99.0 1e-21 KIAA1947 ( 608 res) fh23660 ( 608) 553 97.2 2.3e-21 KIAA1349 ( 752 res) fj00940 ( 752) 553 97.3 2.6e-21 KIAA1829 ( 557 res) hj00069 ( 557) 550 96.7 3.1e-21 KIAA1431 ( 891 res) fj00022 ( 891) 550 96.9 4e-21 KIAA0961 ( 530 res) hj05830 ( 530) 540 95.1 8.7e-21 KIAA1198 ( 553 res) fg01911 ( 553) 532 93.9 2.1e-20 KIAA1588 ( 613 res) fj08823 ( 613) 532 93.9 2.2e-20 KIAA1339 ( 409 res) fj00071 ( 409) 520 91.8 6.4e-20 KIAA0426 ( 613 res) hh01274 ( 613) 520 92.1 8.1e-20 KIAA0798 ( 682 res) hk06584 ( 682) 520 92.1 8.6e-20 KIAA1982 ( 599 res) fk06527(revised) ( 599) 515 91.3 1.4e-19 KIAA0924 ( 617 res) hh02883 ( 617) 513 91.0 1.7e-19 KIAA1954 ( 468 res) fk02322 ( 468) 508 90.0 2.5e-19 KIAA1396 ( 551 res) hj08221 ( 551) 503 89.4 4.7e-19 KIAA1871 ( 821 res) hj05256s1 ( 821) 493 88.1 1.7e-18 KIAA1388 ( 599 res) fj06552 ( 599) 473 84.8 1.2e-17 FLJ00187 ( 563 res) sj02149 ( 563) 464 83.4 3.1e-17 KIAA1979 ( 309 res) fj09511 ( 309) 457 81.9 4.7e-17 KIAA1015 ( 841 res) hk03609(revised) ( 841) 431 78.5 1.3e-15 KIAA0557 ( 493 res) hh01334 ( 493) 428 77.7 1.4e-15 KIAA1020 ( 638 res) fg00473s1 ( 638) 399 73.4 3.6e-14 FLJ00284 ( 366 res) sh02281 ( 366) 387 71.2 9.4e-14 KIAA1703 ( 1165 res) fj16891 (1165) 390 72.4 1.3e-13 KIAA1572 ( 492 res) fh23424 ( 492) 346 65.0 9.1e-12 >>KIAA1969 ( 595 res) fk06944 (595 aa) initn: 1596 init1: 579 opt: 608 Z-score: 522.9 bits: 105.7 E(): 6.3e-24 Smith-Waterman score: 608; 36.321% identity (66.038% similar) in 212 aa overlap (2-213:288-499) 10 20 30 FLJ003 GFAYPSELKAHEVKHESGRCHVCVECGLDFS : : : .:.. : . . . : ::: :. KIAA19 KAFKWFSTLTRHKRIHTGEKPFKCEECGKAFKQSSTLTTHKIIHTGEKPYRCEECGKAFN 260 270 280 290 300 310 40 50 60 70 80 90 FLJ003 TLTQLKRHLASHQGPTLYQCLECDKSFHYRSQLQNHMLKHQNVRPFVCTECGMEFSQIHH ..: : : : :.: :: :.:. : :..: . : . .:. : :: :... . KIAA19 RSSHLTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTLSTHKFIHAGEKPYKCEECDKAFNRFSY 320 330 340 350 360 370 100 110 120 130 140 150 FLJ003 LKQHSLTHKGVKEFKCEVCGREFTLQANMKRHMLIHTSVRPYQCHICFKTFVQKQTLKTH : .:.. : : : .::: ::. :. .... .: :::. .::.:..: :.: ....: :: KIAA19 LTKHKIIHTGEKSYKCEECGKGFNWSSTLTKHKRIHTGEKPYKCEVCGKAFNESSNLTTH 380 390 400 410 420 430 160 170 180 190 200 210 FLJ003 MIVHSPVKPFKCKVCGKSFNRMYNLLGHMHLHAGSKPFKCPYCSSKFNLKGNLSRHMKVK ..:. ::.::. :::.::: .: .: .:.: ::.:: :.. :. .. :. : ... KIAA19 KMIHTGEKPYKCEECGKAFNRSPQLTAHKIIHTGEKPYKCEECGKAFSQSSILTTHKRIH 440 450 460 470 480 490 220 230 240 250 260 270 FLJ003 HGVMDIGLDSQDPMMELTGTDPSELDGQQEMEDFEENAYSYASVDSSAEASVLTEQAMKE : KIAA19 TGEKPYKCEECGKAFNRSSNLTKHKIIHTGEKSYKCEECGKAFNQSSTLTKHRKIHTRQK 500 510 520 530 540 550 >>KIAA1710 ( 515 res) fj18457 (515 aa) initn: 600 init1: 600 opt: 600 Z-score: 516.9 bits: 104.3 E(): 1.4e-23 Smith-Waterman score: 600; 37.559% identity (67.606% similar) in 213 aa overlap (1-213:219-431) 10 20 30 FLJ003 GFAYPSELKAHEVKHESGRCHVCVECGLDF ::. :.: :. : . : . : ::: .: KIAA17 GKAFSQISDLNRHQKTHTGDRPYKCYECGKGFSRSSHLIQHQRTHTGERPYDCNECGKSF 190 200 210 220 230 240 40 50 60 70 80 90 FLJ003 STLTQLKRHLASHQGPTLYQCLECDKSFHYRSQLQNHMLKHQNVRPFVCTECGMEFSQIH . ..: .: . : : ..: :: ::: :.: .:. :.. .:. : ::: ::. KIAA17 GRSSHLIQHQTIHTGEKPHKCNECGKSFCRLSHLIQHQRTHSGEKPYECEECGKSFSRSS 250 260 270 280 290 300 100 110 120 130 140 150 FLJ003 HLKQHSLTHKGVKEFKCEVCGREFTLQANMKRHMLIHTSVRPYQCHICFKTFVQKQTLKT :: ::. :: : : ..:. ::: :. .... .:. .::. :::.: : :.: :.. : KIAA17 HLAQHQRTHTGEKPYECNECGRGFSERSDLIKHYRVHTGERPYKCDECGKNFSQNSDLVR 310 320 330 340 350 360 160 170 180 190 200 210 FLJ003 HMIVHSPVKPFKCKVCGKSFNRMYNLLGHMHLHAGSKPFKCPYCSSKFNLKGNLSRHMKV : .:. ::..:. ::..:.:. .:. :.. :.: ::..: :...:. ...: :.:. KIAA17 HRRAHTGEKPYHCNECGENFSRISHLVQHQRTHTGEKPYECNACGKSFSRSSHLITHQKI 370 380 390 400 410 420 220 230 240 250 260 270 FLJ003 KHGVMDIGLDSQDPMMELTGTDPSELDGQQEMEDFEENAYSYASVDSSAEASVLTEQAMK . : KIAA17 HTGEKPYECNECWRSFGERSDLIKHQRTHTGEKPYECVQCGKGFTQSSNLITHQRVHTGE 430 440 450 460 470 480 >>KIAA0065 ( 848 res) ha00946 (848 aa) initn: 2579 init1: 570 opt: 599 Z-score: 513.8 bits: 104.5 E(): 2e-23 Smith-Waterman score: 599; 38.679% identity (63.208% similar) in 212 aa overlap (2-213:403-614) 10 20 30 FLJ003 GFAYPSELKAHEVKHESGRCHVCVECGLDFS : :.: :. .: . . : ::: :: KIAA00 KAFWEKSHLTRHQRVHTGQKPFQCNECEKAFWDKSNLTKHQRSHTGEKPFECNECGKAFS 380 390 400 410 420 430 40 50 60 70 80 90 FLJ003 TLTQLKRHLASHQGPTLYQCLECDKSFHYRSQLQNHMLKHQNVRPFVCTECGMEFSQIHH . : : .: : ::: : :.: .:.: .:. : ...:. : ::: : : KIAA00 HKSALTLHQRTHTGEKPYQCNACGKTFCQKSDLTKHQRTHTGLKPYECYECGKSFRVTSH 440 450 460 470 480 490 100 110 120 130 140 150 FLJ003 LKQHSLTHKGVKEFKCEVCGREFTLQANMKRHMLIHTSVRPYQCHICFKTFVQKQTLKTH :: :. :: : : :.: ::. :. ..:. .:. :: . . :.:. : ::: .:. : : KIAA00 LKVHQRTHTGEKPFECLECGKSFSEKSNLTQHQRIHIGDKSYECNACGKTFYHKSLLTRH 500 510 520 530 540 550 160 170 180 190 200 210 FLJ003 MIVHSPVKPFKCKVCGKSFNRMYNLLGHMHLHAGSKPFKCPYCSSKFNLKGNLSRHMKVK .:.:. ::..: :::.: .: :.. :.:.::: :: :.. :. :..::.:.... KIAA00 QIIHTGWKPYECYECGKTFCLKSDLTVHQRTHTGQKPFACPECGKFFSHKSTLSQHYRTH 560 570 580 590 600 610 220 230 240 250 260 270 FLJ003 HGVMDIGLDSQDPMMELTGTDPSELDGQQEMEDFEENAYSYASVDSSAEASVLTEQAMKE : KIAA00 TGEKPYECHECGKIFYNKSYLTKHNRTHTGEKPYECNECGKAFYQKSQLTQHQRIHIGEK 620 630 640 650 660 670 >>KIAA1956 ( 680 res) fk08713 (680 aa) initn: 578 init1: 578 opt: 596 Z-score: 512.3 bits: 103.9 E(): 2.5e-23 Smith-Waterman score: 596; 39.623% identity (65.094% similar) in 212 aa overlap (2-213:243-454) 10 20 30 FLJ003 GFAYPSELKAHEVKHESGRCHVCVECGLDFS :. . .. :. : . : . : ::: .:: KIAA19 MKHSSTKHVFVQQQRLPSREECYCWECGKSFSKYDSVSNHQRVHTGKRPYECGECGKSFS 220 230 240 250 260 270 40 50 60 70 80 90 FLJ003 TLTQLKRHLASHQGPTLYQCLECDKSFHYRSQLQNHMLKHQNVRPFVCTECGMEFSQIHH .: .: : : :.: :: ::: ....: .:. : . ::. : ::: ::: KIAA19 HKGSLVQHQRVHTGKRPYECGECGKSFSHKGSLVQHQRVHTGERPYECGECGKSFSQNGT 280 290 300 310 320 330 100 110 120 130 140 150 FLJ003 LKQHSLTHKGVKEFKCEVCGREFTLQANMKRHMLIHTSVRPYQCHICFKTFVQKQTLKTH : .:. .: : . ..:: ::. :: ..:. .:. ::: :::.:. : : : :: :: : KIAA19 LIKHQRVHTGERPYECEECGKCFTQKGNLIQHQRGHTSERPYECEECGKCFSQKGTLTEH 340 350 360 370 380 390 160 170 180 190 200 210 FLJ003 MIVHSPVKPFKCKVCGKSFNRMYNLLGHMHLHAGSKPFKCPYCSSKFNLKGNLSRHMKVK ::. .:..: :::::.: .: .:.. :.: .:..: :...:. :::: .:.. . KIAA19 HRVHTRERPYECGECGKSFSRKGHLRNHQRGHTGERPYECGECGKSFSRKGNLIQHQRSH 400 410 420 430 440 450 220 230 240 250 260 270 FLJ003 HGVMDIGLDSQDPMMELTGTDPSELDGQQEMEDFEENAYSYASVDSSAEASVLTEQAMKE : KIAA19 TGERPYECRECRKLFRGKSHLIEHQRVHTGERPYECNECGKSFQDSSGFRVHQRVHTGEK 460 470 480 490 500 510 >>KIAA2007 ( 580 res) fj01689 (580 aa) initn: 1993 init1: 594 opt: 594 Z-score: 511.3 bits: 103.5 E(): 2.8e-23 Smith-Waterman score: 594; 36.620% identity (63.380% similar) in 213 aa overlap (1-213:251-463) 10 20 30 FLJ003 GFAYPSELKAHEVKHESGRCHVCVECGLDF :: : . :. : : . . : ::: : KIAA20 GRGFIHSTDLAVRIQTHRSEKPYKCKECGKGFRYSAYLNIHMGTHTGDNPYECKECGKAF 230 240 250 260 270 280 40 50 60 70 80 90 FLJ003 STLTQLKRHLASHQGPTLYQCLECDKSFHYRSQLQNHMLKHQNVRPFVCTECGMEFSQIH . :: .: .: : :.: .: ..: : :..:: : . .:. : :::. :.. KIAA20 TRSCQLTQHRKTHTGEKPYKCKDCGRAFTVSSCLSQHMKIHVGEKPYECKECGIAFTRSS 290 300 310 320 330 340 100 110 120 130 140 150 FLJ003 HLKQHSLTHKGVKEFKCEVCGREFTLQANMKRHMLIHTSVRPYQCHICFKTFVQKQTLKT .: .: :: . :.:..::. : .. .. :. :::...::.:. : :.:.:.. : KIAA20 QLTEHLKTHTAKDPFECKICGKSFRNSSCLSDHFRIHTGIKPYKCKDCGKAFTQNSDLTK 350 360 370 380 390 400 160 170 180 190 200 210 FLJ003 HMIVHSPVKPFKCKVCGKSFNRMYNLLGHMHLHAGSKPFKCPYCSSKFNLKGNLSRHMKV : .:: .:..:: :::.: : : : . :.: :::.: :.. : ...::: :... KIAA20 HARTHSGERPYECKECGKAFARSSRLSEHTRTHTGEKPFECVKCGKAFAISSNLSGHLRI 410 420 430 440 450 460 220 230 240 250 260 270 FLJ003 KHGVMDIGLDSQDPMMELTGTDPSELDGQQEMEDFEENAYSYASVDSSAEASVLTEQAMK . : KIAA20 HTGEKPFECLECGKAFTHSSSLNNHMRTHSAKKPFTCMECGKAFKFPTCVNLHMRIHTGE 470 480 490 500 510 520 >>KIAA1473 ( 574 res) fj03262 (574 aa) initn: 1622 init1: 573 opt: 593 Z-score: 510.5 bits: 103.3 E(): 3.1e-23 Smith-Waterman score: 596; 38.208% identity (64.151% similar) in 212 aa overlap (2-213:333-544) 10 20 30 FLJ003 GFAYPSELKAHEVKHESGRCHVCVECGLDFS :. : : .:.. : . . . : ::: :: KIAA14 RAFSQSSTLTAHKIIHAGEKPYKCEECGKAFSQSSTLTTHKIIHTGEKFYKCEECGKAFS 310 320 330 340 350 360 40 50 60 70 80 90 FLJ003 TLTQLKRHLASHQGPTLYQCLECDKSFHYRSQLQNHMLKHQNVRPFVCTECGMEFSQIHH :..: : :.: :.: :: :.:. : : .: : . . . : :. ::.. : KIAA14 QLSHLTTHKRIHSGEKPYKCEECGKAFKQSSTLTTHKRIHAGEKFYKCEVCSKAFSRFSH 370 380 390 400 410 420 100 110 120 130 140 150 FLJ003 LKQHSLTHKGVKEFKCEVCGREFTLQANMKRHMLIHTSVRPYQCHICFKTFVQKQTLKTH : :. : : : .::: ::. :.:.... : .:::. .::.:. : :.: :..::. : KIAA14 LTTHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNLSSQLTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTLSKH 430 440 450 460 470 480 160 170 180 190 200 210 FLJ003 MIVHSPVKPFKCKVCGKSFNRMYNLLGHMHLHAGSKPFKCPYCSSKFNLKGNLSRHMKVK ..:. ::.: . :::.::. .: : .:.: ::.:: :.. :: .. :.:: .. 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