# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -H -O./tmp/sh05777.fasta.huge -Q ../query/FLJ00307.ptfa ./tmplib.10216 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 FLJ00307, 452 aa vs ./tmplib.10216 library 2210542 residues in 2457 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3575+/-0.00475; mu= 15.2317+/- 0.320 mean_var=140.1083+/-31.580, 0's: 0 Z-trim: 9 B-trim: 158 in 1/39 Lambda= 0.108353 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2457) KIAA1597 ( 913 res) fj09819 ( 913) 451 81.9 2.3e-16 KIAA1228 ( 843 res) fh05620s1 ( 843) 245 49.6 1.1e-06 KIAA0340 ( 1053 res) hg01396 (1053) 217 45.4 2.5e-05 KIAA0559 ( 1212 res) hh01510 (1212) 188 41.0 0.00063 KIAA0747 ( 1072 res) hk04143 (1072) 180 39.6 0.0014 KIAA0237 ( 315 res) ha06286 ( 315) 168 37.0 0.0025 KIAA0985 ( 697 res) hj08038 ( 697) 171 38.0 0.0029 KIAA0751 ( 1200 res) hk04424 (1200) 166 37.5 0.0068 KIAA0439 ( 995 res) hj00462 ( 995) 135 32.6 0.18 KIAA0080 ( 486 res) hh13320 ( 486) 120 29.8 0.59 KIAA1375 ( 546 res) fj04426 ( 546) 109 28.1 2.1 KIAA1427 ( 439 res) fh02770 ( 439) 105 27.4 2.8 KIAA0093 ( 927 res) ha00935 ( 927) 104 27.7 4.8 KIAA1342 ( 426 res) fj00418 ( 426) 99 26.4 5.3 KIAA0820 ( 892 res) bg00036 ( 892) 99 26.9 8.1 KIAA0903 ( 962 res) hk09970 ( 962) 99 26.9 8.5 KIAA0295 ( 981 res) hf00226 ( 981) 99 26.9 8.6 KIAA1508 ( 573 res) hk06576 ( 573) 96 26.1 8.7 FLJ00345 ( 339 res) sf00014 ( 339) 93 25.3 8.9 KIAA0753 ( 979 res) hk04444 ( 979) 98 26.8 9.6 KIAA0915 ( 846 res) hk06275s1 ( 846) 97 26.5 9.8 FLJ00386 ( 811 res) sj04204 ( 811) 96 26.3 11 KIAA0269 ( 567 res) ha06751 ( 567) 94 25.8 11 FLJ00066 ( 162 res) as00066 ( 162) 87 24.0 11 KIAA0396 ( 627 res) hg00180s1 ( 627) 92 25.6 14 KIAA1306 ( 1154 res) fh05845 (1154) 95 26.4 15 KIAA0029 ( 974 res) ha00566 ( 974) 94 26.1 15 KIAA0442 ( 1266 res) hh03913 (1266) 95 26.4 15 FLJ00217 ( 547 res) sj05423 ( 547) 90 25.2 16 KIAA0304 ( 2415 res) af07172 (2415) 96 27.0 20 KIAA1212 ( 802 res) fh00638s1 ( 802) 90 25.4 20 KIAA1574 ( 670 res) fh24775 ( 670) 89 25.1 20 KIAA0056 ( 1507 res) ha01062 (1507) 93 26.2 21 FLJ00420 ( 613 res) sj09535 ( 613) 88 24.9 22 KIAA0381 ( 1114 res) ah04695 (1114) 91 25.7 22 KIAA1332 ( 651 res) fh15405 ( 651) 88 24.9 22 KIAA1893 ( 800 res) fk04261 ( 800) 89 25.2 23 KIAA1076 ( 804 res) hj06779 ( 804) 89 25.2 23 KIAA0226 ( 973 res) fg02838 ( 973) 90 25.5 23 KIAA1362 ( 699 res) fj02381 ( 699) 88 25.0 23 FLJ00253 ( 349 res) sj09455 ( 349) 84 23.9 24 KIAA0691 ( 762 res) hk03735 ( 762) 88 25.0 24 KIAA0346 ( 1682 res) hg01508s1 (1682) 92 26.1 25 KIAA1096 ( 1919 res) pf00402 (1919) 92 26.2 27 KIAA1404 ( 1925 res) eg01672 (1925) 92 26.2 27 KIAA1022 ( 1131 res) fg00613 (1131) 89 25.4 27 KIAA0221 ( 1151 res) ha02799 (1151) 89 25.5 28 KIAA1205 ( 1217 res) fg03511a (1217) 89 25.5 29 KIAA1383 ( 907 res) fj06145 ( 907) 87 25.0 30 KIAA0495 ( 209 res) hg00106 ( 209) 79 22.9 30 >>KIAA1597 ( 913 res) fj09819 (913 aa) initn: 507 init1: 425 opt: 451 Z-score: 387.3 bits: 81.9 E(): 2.3e-16 Smith-Waterman score: 477; 34.701% identity (61.940% similar) in 268 aa overlap (191-451:545-796) 170 180 190 200 210 FLJ003 KLSKISVVPPTPPPVSESQCSRSPGRKVSAPDILKPLNQED-PKCST------NPILKQQ :: ::...: :. :: ::. . . 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KIAA12 KTHVSKKTLNPVFDQSFDFSVSLPEVQRRTLDVAVKNSGGFLSKDKGLLGKVLVALASEE 770 780 790 800 810 820 370 380 390 400 410 420 FLJ003 FEDSTTQSFRWHPLRAKAEKYEDSVPQSNGELTVRAKLVLPSRPRKLQEAQEGTDQPSLH . . :: :. : KIAA12 LAKGWTQ---WYDLTEDGTRPQAMT 830 840 >>KIAA0340 ( 1053 res) hg01396 (1053 aa) initn: 179 init1: 102 opt: 217 Z-score: 189.0 bits: 45.4 E(): 2.5e-05 Smith-Waterman score: 219; 25.424% identity (53.898% similar) in 295 aa overlap (145-420:636-920) 120 130 140 150 160 170 FLJ003 WKCTVCFEDRNVKIKTGEWFYEERAKKFPTGGKHETVG--GQLLQSYQKLSKISVVPP-- ::: .: : .. . .: : .:: KIAA03 EGDRLIGRVILNKRTTMPKDSGALLGLKVVGGKMTDLGRLGAFITKVKKGSLADVVGHLR 610 620 630 640 650 660 180 190 200 210 220 FLJ003 TPPPVSESQCSRSPGRKVSAPDILKPL--NQEDPKCS---TNPILKQQNLP-SSPAPSTI . : : . . :: .. .. . . .. .:. . :: .: :: : KIAA03 AGDEVLEWNGKPLPG--ATNEEVYNIILESKSEPQVEIIVSRPIGDIPRIPESSHPPLES 670 680 690 700 710 720 230 240 250 260 270 FLJ003 FSGGFRHGSL----ISIDSTCTEMGNFDNAN--VTGEIEFAIHYCFKTHSLEICIKACKN :..:. .. ::. : : : . .: . :.. . : :.: . . . 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KIAA03 LEITVWDQPRVQEEESEFLGEILIELETALLDDEP----HWYKLQTHDESSLP-LPQPSP 850 860 870 880 890 400 410 420 430 440 450 FLJ003 ELTVRAKLVLPSRPRKLQEAQEGTDQPSLHGQLCLVVLGAKNLPVRPDGTLNSFVKG . : .. : .:::..:. .: KIAA03 FMP-RRHIHGESSSKKLQRSQRISDSDISDYEVDDGIGVVPPVGYRSSARESKSTTLTVP 900 910 920 930 940 950 >>KIAA0559 ( 1212 res) hh01510 (1212 aa) initn: 249 init1: 103 opt: 188 Z-score: 163.8 bits: 41.0 E(): 0.00063 Smith-Waterman score: 246; 27.119% identity (58.051% similar) in 236 aa overlap (173-394:894-1117) 150 160 170 180 190 FLJ003 PTGGKHETVGGQLLQSYQKLSKISVVPPTPPPVSESQCSRSPGRKVS---APDILKPLNQ : :. .: . . .::: .: .:. . . KIAA05 RLDLNMLSDSENSQHLELHEPPKAVDKAKSPGVDPKQLA-AELQKVSLQQSPLVLSSVVE 870 880 890 900 910 920 200 210 220 230 240 250 FLJ003 EDPKCSTNPILK-QQNLPSSPAPSTIFSGGFRHGSLISIDSTCTEMGNFDNANVTGEIEF . . ..: ....:: :.. . .::: :.: . . .::::.. KIAA05 KGSHVHSGPTSAGSSSVPSPGQPGSPSVSKKKHGSSKPTDGT-----KVVSHPITGEIQL 930 940 950 960 970 260 270 280 290 300 FLJ003 AIHYCFKTHSLEICIKACKNLAYGEEKKKKCNPYVKTYLLPDR---------SSQGKRKT :.: .: : : .::. .... .:.::.:::: : :.. ::.: KIAA05 QINY--DLGNLIIHILQARNLV-PRDNNGYSDPFVKVYLLPGRGQVMVVQNASAEYKRRT 980 990 1000 1010 1020 1030 310 320 330 340 350 360 FLJ003 GVQRNTVDPTFQETLKYQ-VAPAQLVTRQLQVSVWHLGTLARRVFLGEVIIPLATWDFED .....: ...:. :. .. :: . :.:.:: .. :::::.: :.. . : KIAA05 KHVQKSLNPEWNQTVIYKSISMEQLKKKTLEVTVWDYDRFSSNDFLGEVLIDLSSTSHLD 1040 1050 1060 1070 1080 1090 370 380 390 400 410 420 FLJ003 STTQSFRWHPLRAKAEKYEDSVPQSNGELTVRAKLVLPSRPRKLQEAQEGTDQPSLHGQL .: ::.::. ..:. . . .:. KIAA05 NTP---RWYPLKEQTESIDHGKSHSSQSSQQSPKPSVIKSRSHGIFPDPSKDMQVPTIEK 1100 1110 1120 1130 1140 1150 >>KIAA0747 ( 1072 res) hk04143 (1072 aa) initn: 125 init1: 125 opt: 180 Z-score: 157.6 bits: 39.6 E(): 0.0014 Smith-Waterman score: 180; 24.590% identity (59.016% similar) in 183 aa overlap (205-385:898-1069) 180 190 200 210 220 230 FLJ003 VSESQCSRSPGRKVSAPDILKPLNQEDPKCSTNPILKQQNLPSSPAPSTIFSGGFRHGSL :.. . .. .: ..: : :. . : KIAA07 GQGQVLLRAQLGILVSQHSGVEAHSHSYSHSSSSLSEEPELSGGP-PHITSSAPELRQRL 870 880 890 900 910 920 240 250 260 270 280 290 FLJ003 ISIDSTCTEMGNFDNANVTGEIEFAIHYCFKTHSLEICIKACKNLAYGEEKKKKCNPYVK .:: :. :...... : . ..: ...:..: .. . .:::. 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KIAA02 GDYGRMDHKCFMGMAQIMLDELDLSAAVTGWYKLFPTSSVADSTLGSLTRRLSQSSLESA 250 260 270 280 290 300 410 420 430 440 450 FLJ003 LVLPSRPRKLQEAQEGTDQPSLHGQLCLVVLGAKNLPVRPDGTLNSFVKG KIAA02 TSPSCS 310 >>KIAA0985 ( 697 res) hj08038 (697 aa) initn: 256 init1: 150 opt: 171 Z-score: 152.0 bits: 38.0 E(): 0.0029 Smith-Waterman score: 201; 24.309% identity (51.381% similar) in 181 aa overlap (77-255:101-262) 50 60 70 80 90 100 FLJ003 SEGCRKLKTHLQHLRWKGAKNTDWEHKEKCCARCQQVLGFLLHRGAVCRGCSHRVCAQCR : : . ::.: .::. :.. ::..: KIAA09 MEEMEQERIGRLVDRLENMRKNVAGDGVNRCILCGEQLGMLGSACVVCEDCKKNVCTKCG 80 90 100 110 120 130 110 120 130 140 150 160 FLJ003 VFL--RGTHAWKCTVCFEDRNVKIKTGEWFYEERAKKFPTGGKHETVGGQLLQSYQKLSK : : .: : .:.:.:.: ..: ::. : :: :.: . . ..: KIAA09 VETNNRLHSVWLCKICIEQREVWKRSGAWFF----KGFPK---------QVLPQPMPIKK 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 FLJ003 ISVVPPTPPPVSESQCSRSPGRKVSAPDILKPLNQEDPKCSTNPILKQQNLPSSPAPSTI . :. :.. : . : . . :: ... : .:.: :.: KIAA09 TKPQQPVSEPAAPEQPAPEPKHPARAPARGDSEDRRGPGQKTGPD------PASAPGRGN 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 FLJ003 FSGGFRHGSLISIDSTCTEMGNFDNANVTGEIEFAIHYCFKTHSLEICIKACKNLAYGEE .. :..: ..:. . ..:... .:. 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