# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -H -O./tmp/sh06481.fasta.huge -Q ../query/FLJ00312.ptfa ./tmplib.10216 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 FLJ00312, 663 aa vs ./tmplib.10216 library 2210331 residues in 2457 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2582+/-0.00458; mu= 9.5371+/- 0.308 mean_var=126.8108+/-28.609, 0's: 0 Z-trim: 13 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.113893 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2457) KIAA1975 ( 597 res) aj01061 ( 597) 1425 245.4 1.3e-65 KIAA1099 ( 864 res) hk07834 ( 864) 1089 190.4 6.9e-49 KIAA0167 ( 844 res) ha01026 ( 844) 682 123.5 9.2e-29 KIAA1716 ( 804 res) hj06603 ( 804) 430 82.1 2.6e-16 KIAA0050 ( 796 res) ha01557 ( 796) 409 78.6 2.8e-15 KIAA0041 ( 781 res) ha00469s1 ( 781) 393 76.0 1.7e-14 KIAA0580 ( 1631 res) hj00601s1 (1631) 363 71.3 8.8e-13 KIAA1249 ( 949 res) hh04184 ( 949) 342 67.7 6.6e-12 KIAA0782 ( 1281 res) hk05405s1 (1281) 294 59.9 1.9e-09 FLJ00357 ( 628 res) sh02980 ( 628) 287 58.5 2.6e-09 KIAA0400 ( 1022 res) hg01091 (1022) 286 58.5 4.1e-09 KIAA0148 ( 704 res) fh23975 ( 704) 280 57.4 6.2e-09 KIAA2028 ( 1449 res) hg04183 (1449) 133 33.5 0.19 KIAA1200 ( 1403 res) fg02656 (1403) 117 30.9 1.2 KIAA1205 ( 1217 res) fg03511a (1217) 113 30.1 1.7 FLJ00253 ( 349 res) sj09455 ( 349) 104 28.2 1.9 KIAA1138 ( 1239 res) hj05928 (1239) 109 29.5 2.7 KIAA1718 ( 377 res) pf00323 ( 377) 101 27.7 2.8 KIAA1494 ( 638 res) fj08673 ( 638) 102 28.1 3.7 KIAA1041 ( 642 res) fh02801 ( 642) 99 27.6 5.2 KIAA1798 ( 781 res) fj20547 ( 781) 99 27.7 6 KIAA2021 ( 648 res) ah05004 ( 648) 96 27.1 7.4 KIAA0808 ( 530 res) hk04477s1 ( 530) 92 26.4 10 KIAA0991 ( 630 res) hk06065 ( 630) 92 26.4 11 KIAA1738 ( 1127 res) pj00192s1 (1127) 94 27.0 14 KIAA0442 ( 1266 res) hh03913 (1266) 94 27.0 15 KIAA1357 ( 836 res) fj01906 ( 836) 91 26.4 16 KIAA1066 ( 1346 res) ah03682 (1346) 93 26.9 17 KIAA1598 ( 446 res) fj09914 ( 446) 85 25.1 20 KIAA0559 ( 1212 res) hh01510 (1212) 91 26.5 20 KIAA1779 ( 1233 res) hg04229 (1233) 91 26.5 21 KIAA0862 ( 584 res) hk06532 ( 584) 86 25.4 21 FLJ00034 ( 1343 res) as00034 (1343) 91 26.6 22 KIAA1097 ( 980 res) hk07058 ( 980) 89 26.1 22 KIAA1522 ( 1044 res) fh14706(revised) (1044) 89 26.1 23 KIAA1951 ( 679 res) fj05532 ( 679) 86 25.5 24 KIAA0305 ( 1547 res) hg00042 (1547) 90 26.5 27 KIAA0035 ( 707 res) ha01976 ( 707) 85 25.3 27 KIAA1403 ( 1337 res) fg02666s1 (1337) 88 26.1 30 KIAA0113 ( 636 res) ha01652s1 ( 636) 83 25.0 32 KIAA1608 ( 872 res) fj20142 ( 872) 84 25.2 35 FLJ00224 ( 896 res) sj06244 ( 896) 84 25.3 36 KIAA0909 ( 1234 res) hk10471 (1234) 86 25.7 36 KIAA1213 ( 484 res) fh01142 ( 484) 80 24.3 37 KIAA1419 ( 2464 res) ff01653 (2464) 90 26.7 37 KIAA0383 ( 1781 res) hh00708s1 (1781) 87 26.0 42 KIAA0599 ( 697 res) hj03137 ( 697) 81 24.7 42 KIAA0492 ( 167 res) hh01162 ( 167) 72 22.6 43 KIAA0207 ( 605 res) ha02795 ( 605) 80 24.4 43 KIAA1924 ( 613 res) hh01339 ( 613) 80 24.4 43 >>KIAA1975 ( 597 res) aj01061 (597 aa) initn: 2588 init1: 1405 opt: 1425 Z-score: 1271.4 bits: 245.4 E(): 1.3e-65 Smith-Waterman score: 2892; 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KIAA10 EIDLLRTTVKVPGKRPPRATSACAPISSPKTNGLSKDMSSLHISPNSDTGLGDSVCSSPS 460 470 480 490 500 510 410 420 430 440 FLJ003 ISSTTSPKLNPPPSPHANKKKHLKKKSTNNF------------------MIVSATGQTWH :::::::::.::::::::.::: .::::.:: .::: :::::: KIAA10 ISSTTSPKLDPPPSPHANRKKHRRKKSTSNFKADGLSGTAEEQEENFEFIIVSLTGQTWH 520 530 540 550 560 570 450 460 470 480 FLJ003 FEATTYEERDAWVQAIQSQ--------------------SEAMALQSIQNMRGNAHCVDC ::::::::::::::::.:: :::::::::.:::::.::::: KIAA10 FEATTYEERDAWVQAIESQILASLQSCESSKNKSRLTSQSEAMALQSIRNMRGNSHCVDC 580 590 600 610 620 630 490 500 510 520 530 540 FLJ003 ETQNPKWASLNLGVLMCIECSGIHRSFGTRLSRVRSLELDDWPVELRKVMSSIGNELANS :::::.:::::::.:::::::::::..::.:::::::.:::::.:: ::::::::::::: KIAA10 ETQNPNWASLNLGALMCIECSGIHRNLGTHLSRVRSLDLDDWPIELIKVMSSIGNELANS 640 650 660 670 680 690 550 560 570 580 590 600 FLJ003 IWEGSSQGQTKPSIKSTREEKEWWIRSKYEEKLFLAPLPCTELSLGQQLLRATTDEDLQT .:: ::::.::::. ::::::: :::.:::.::::::::::::::::.:::::.::::.: KIAA10 VWEESSQGRTKPSVDSTREEKERWIRAKYEQKLFLAPLPCTELSLGQHLLRATADEDLRT 700 710 720 730 740 750 610 620 630 640 650 660 FLJ003 AILLLAHGSREEVNETCGEGDGCTALHLACRKGNVVLEQLLTGWTSWPEMPTGTQR ::::::::::.::::::::::: :::::::::::::: ::: : KIAA10 AILLLAHGSRDEVNETCGEGDGRTALHLACRKGNVVLAQLLI-WYGVDVTARDAHGNTAL 760 770 780 790 800 810 KIAA10 AYARQASSQECIDVLLQYGCPDERFVLMATPNLSRRNNNRNNSSGRVPTII 820 830 840 850 860 >>KIAA0167 ( 844 res) ha01026 (844 aa) initn: 931 init1: 680 opt: 682 Z-score: 609.7 bits: 123.5 E(): 9.2e-29 Smith-Waterman score: 1221; 41.993% identity (65.480% similar) in 562 aa overlap (167-651:217-764) 140 150 160 170 180 190 FLJ003 IFQRNSQTDVVEIRRSNCTNHVSTERFSQQYSSCSTIFLDDSTAIQHYLTMTIISVTLEI : .:.: :. . ..:. . :::. KIAA01 TQDRISASSPRVVGDARARALCADMKRCSYYETCATYGLNVDRVFQEVAQKV---VTLRK 190 200 210 220 230 240 200 210 220 230 240 250 FLJ003 PHHITQRDADRSLSIPDEQLHSFAVSTVHIMKKRNGGGSLNNYSSSIPPTPSTSQEDPQF ... : .:: :. :: :.:: . . ..:: ..::::.: .:...... . KIAA01 QQQLLA--ACKSL--PSSPSHS-AAST-PVAGQASNGGHTSDYSSSLPSSPNVGHRELRA 250 260 270 280 290 260 270 280 290 300 310 FLJ003 SVPPTANTPTP--VCKRSMRWSNLFTSEKGSDPDKERKAPENHADTIGSGRAIPIKQGML . .:. :: . . . : ..::....:: :.:... .....: ::::::::::..: KIAA01 EAAAVAGLSTPGSLHRAAKRRTSLFANRRGS--DSEKRSLDSRGETTGSGRAIPIKQSFL 300 310 320 330 340 350 320 330 340 350 360 370 FLJ003 LKRSGKWL-KTWKKKYVTLCSNGVLTYYSSLGDYMKNIHKKEIDLRTSTIKVPGKWPSLA :::::. : : :::::::: ::: : :. :..::... : ::.:: .:.::::: : : KIAA01 LKRSGNSLNKEWKKKYVTLSSNGFLLYHPSINDYIHSTHGKEMDLLRTTVKVPGKRPPRA 360 370 380 390 400 410 380 390 400 410 420 FLJ003 TSACAPISSSKSNGLSKDMDT-GLGDSI-CFSPGISSTTSPK-LNPPP---SPHANK--- :: .: :.. ::: :::.: .:... .: : . ::. :.::: : : : KIAA01 ISAFGP--SASINGLVKDMSTVQMGEGLEATTPMPSPSPSPSSLQPPPDQTSKHLLKPDR 420 430 440 450 460 470 430 FLJ003 -----------------------------KKHLKKKSTN----------------NFMIV ::. .:: :. .:.:: KIAA01 NLARALSTDCTPSGDLSPLSREPPPSPMVKKQRRKKLTTPSKTEGSAGQAEEENFEFLIV 480 490 500 510 520 530 440 450 460 470 FLJ003 SATGQTWHFEATTYEERDAWVQAIQSQ--------------------SEAMALQSIQNMR :.:::::::::...::::::::::.:: :::.:.:.:.: . KIAA01 SSTGQTWHFEAASFEERDAWVQAIESQILASLQCCESSKVKLRTDSQSEAVAIQAIRNAK 540 550 560 570 580 590 480 490 500 510 520 530 FLJ003 GNAHCVDCETQNPKWASLNLGVLMCIECSGIHRSFGTRLSRVRSLELDDWPVELRKVMSS ::. :::: . :: :::::::.:.:::::::::..::.:::::::.::::: :: :... KIAA01 GNSICVDCGAPNPTWASLNLGALICIECSGIHRNLGTHLSRVRSLDLDDWPRELTLVLTA 600 610 620 630 640 650 540 550 560 570 580 590 FLJ003 IGNELANSIWEGSSQGQTKPSIKSTREEKEWWIRSKYEEKLFLAPLPCTELSLGQQLLRA :::. :: .::....:..::: :.:::.: :::.:::. :::::: .: ::.:: : KIAA01 IGNDTANRVWESDTRGRAKPSRDSSREERESWIRAKYEQLLFLAPLSTSEEPLGRQLWAA 660 670 680 690 700 710 600 610 620 630 640 650 FLJ003 TTDEDLQTAILLLAHGSREEVNETCGEGDGCTALHLACRKGNVVLEQLLTGWTSWPEMPT . .:. :..:::::. . .. . . . . :::: . ..::. ::: : KIAA01 VQAQDVATVLLLLAHARHGPLDTSVEDPQLRSPLHLAAELAHVVITQLLL-WYGADVAAR 720 730 740 750 760 770 660 FLJ003 GTQR KIAA01 DAQGRTALFYARQAGSQLCADILLQHGCPGEGGSAATTPSAATTPSITATPSPRRRSSAA 780 790 800 810 820 830 >>KIAA1716 ( 804 res) hj06603 (804 aa) initn: 546 init1: 339 opt: 430 Z-score: 386.2 bits: 82.1 E(): 2.6e-16 Smith-Waterman score: 479; 34.722% identity (64.236% similar) in 288 aa overlap (309-589:273-531) 280 290 300 310 320 330 FLJ003 FTSEKGSDPDKERKAPENHADTIGSGRAIPIKQGMLLKRSGKWLKTWKKKYVTLCSNGVL . .:.:.::... .:::.... .. .:. : KIAA17 HAAIQQRTLLQDFSYDESKVEFDVDAPSGVVMEGYLFKRASNAFKTWNRRWFSI-QNSQL 250 260 270 280 290 300 340 350 360 370 380 390 FLJ003 TYYSSLGDYMKNIHKKEIDLRTSTIKVPGKWPSLATSACAPI-SSSKSNGLSKDMDTGLG .: ..: : . . ::: ..: : . .. : . : .:: :. : . : KIAA17 VYQKKLKDALTVVVD---DLRLCSVK-PCE--DIERRFCFEVLSPTKSCMLQADSEK-LR 310 320 330 340 350 400 410 420 430 440 450 FLJ003 DSICFSPGI-SSTTSPKLNPPPSPHANKKKHLKKKSTNNFMIVSATGQTWHFEATTYEER .. . .. .: .: . : : .... . . ::.. : ::: KIAA17 QA--WVQAVQASIASAYRESPDSCYSERLDRTASPSTSS--IDSAT-------------- 360 370 380 390 460 470 480 490 500 510 FLJ003 DAWVQAIQSQSEAMALQSIQNMRGNAHCVDCETQNPKWASLNLGVLMCIECSGIHRSFGT :. ......: .:: .:.. ::..: :: .:.:::.:::::.::::::::::.:. KIAA17 DTRERGVKGES---VLQRVQSVAGNSQCGDCGQPDPRWASINLGVLLCIECSGIHRSLGV 400 410 420 430 440 450 520 530 540 550 560 570 FLJ003 RLSRVRSLELDDWPVELRKVMSSIGNELANSIWEGSSQG--QTKPSIKSTREEKEWWIRS . :.:::: ::.: :: :.: .:: .:.:.:.. .: . ::. .:.:..:: ::.. KIAA17 HCSKVRSLTLDSWEPELLKLMCELGNSAVNQIYEAQCEGAGSRKPTASSSRQDKEAWIKD 460 470 480 490 500 510 580 590 600 610 620 630 FLJ003 KYEEKLFL--APL-PCTELSLGQQLLRATTDEDLQTAILLLAHGSREEVNETCGEGDGCT :: :: :: ::. : : KIAA17 KYVEKKFLRKAPMAPALEAPRRWRVQKCLRPHSSPRAPTARRKVRLEPVLPCVAALSSVG 520 530 540 550 560 570 >>KIAA0050 ( 796 res) ha01557 (796 aa) initn: 499 init1: 318 opt: 409 Z-score: 367.6 bits: 78.6 E(): 2.8e-15 Smith-Waterman score: 464; 34.276% identity (60.424% similar) in 283 aa overlap (309-586:323-580) 280 290 300 310 320 330 FLJ003 FTSEKGSDPDKERKAPENHADTIGSGRAIPIKQGMLLKRSGKWLKTWKKKYVTLCSNGVL . .: :.::... .:::.... :. :: : KIAA00 DMEQRHVLLKQKELGGEEPEPSLREGPGGLVMEGHLFKRASNAFKTWSRRWFTIQSNQ-L 300 310 320 330 340 350 340 350 360 370 380 390 FLJ003 TYYSSLGDYMKNIHKKEIDLRTSTIKVPGKWPSLATSACAPI-SSSKSNGLSKDMDT--G .: .. : . . ::: :.:. :. : . :.::: :. : . KIAA00 VYQKKYKDPVTVVVD---DLRLCTVKLC---PDSERRFCFEVVSTSKSCLLQADSERLLQ 360 370 380 390 400 400 410 420 430 440 450 FLJ003 LGDSICFSPGISSTTSPKLNPPPSPHANKKKHLKKKSTNNFMIVSATGQTWHFEATTYEE : : : :. .. .:. : .. . :: :. . ... :.. : KIAA00 LWVSAVQSSIASAFSQARLDDSPRGPGQGSGHLAIGSAAT---LGSGGMARGREP----- 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 FLJ003 RDAWVQAIQSQSEAMALQSIQNMRGNAHCVDCETQNPKWASLNLGVLMCIECSGIHRSFG . : . .: .:.. :::.: ::. :.:::.:::: .::.:::::::.: KIAA00 --GGVGHVVAQ--------VQSVDGNAQCCDCREPAPEWASINLGVTLCIQCSGIHRSLG 460 470 480 490 500 520 530 540 550 560 570 FLJ003 TRLSRVRSLELDDWPVELRKVMSSIGNELANSIWEGSSQGQT--KPSIKSTREEKEWWIR ...:.:::: ::.: :: :.: .:: . :.:.:. .... ::. . .:.::: ::. KIAA00 VHFSKVRSLTLDSWEPELVKLMCELGNVIINQIYEARVEAMAVKKPGPSCSRQEKEAWIH 510 520 530 540 550 560 580 590 600 610 620 630 FLJ003 SKYEEKLFLAPLPCTELSLGQQLLRATTDEDLQTAILLLAHGSREEVNETCGEGDGCTAL .:: :: ::. :: KIAA00 AKYVEKKFLTKLPEIRGRRGGRGRPRGQPPVPPKPSIRPRPGSLRSKPEPPSEDLGSLHP 570 580 590 600 610 620 >>KIAA0041 ( 781 res) ha00469s1 (781 aa) initn: 466 init1: 336 opt: 393 Z-score: 353.5 bits: 76.0 E(): 1.7e-14 Smith-Waterman score: 424; 31.408% identity (61.733% similar) in 277 aa overlap (309-582:271-516) 280 290 300 310 320 330 FLJ003 FTSEKGSDPDKERKAPENHADTIGSGRAIPIKQGMLLKRSGKWLKTWKKKYVTLCSNGVL . .:.:.::... .:::.... .. .:. : KIAA00 MEQKHSTIQQKDFSSDDSKLEYNVDAANGIVMEGYLFKRASNAFKTWNRRWFSI-QNNQL 250 260 270 280 290 340 350 360 370 380 390 FLJ003 TYYSSLGDYMKNIHKKEIDLRTSTIKVPGKWPSLATSACAPI-SSSKSNGLSKDMDTGLG .: ... : . . ::: :.: . .. : . : .:: :. : . 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KIAA00 YVERKFVDKYSISLSPPEQQKKFVSKSSEEKRLSISKFGPGDQVRASAQSSVRSNDSGIQ 510 520 530 540 550 560 >>KIAA0580 ( 1631 res) hj00601s1 (1631 aa) initn: 269 init1: 194 opt: 363 Z-score: 322.8 bits: 71.3 E(): 8.8e-13 Smith-Waterman score: 363; 32.068% identity (60.759% similar) in 237 aa overlap (426-648:565-793) 400 410 420 430 440 450 FLJ003 LGDSICFSPGISSTTSPKLNPPPSPHANKKKHLKKKSTNNFMIVSATGQTWHFEATTYEE :.. . ..: :.. ... : : : .: KIAA05 SGNSVWLCKNEQDFKSGLGITIIPMNVANVKQVDRTVKQSFEIITPY-RSFSFTAETEKE 540 550 560 570 580 590 460 470 480 490 500 FLJ003 RDAWVQAIQSQSEAMAL------QSIQNMRGNAHCVDCETQNPKWASLNLGVLMCIECSG .. :..:.: :: : .: ..: ..: :.::.. .: :::.:: :..: .:.: KIAA05 KQDWIEAVQ-QSIAETLSDYEVAEKIWFNESNRSCADCKAPDPDWASINLCVVICKKCAG 600 610 620 630 640 650 510 520 530 540 550 560 FLJ003 IHRSFGTRLSRVRSLELDD--WPVELRKVMSSIGNELANSIWEGSSQGQTKPSIKSTREE :::.: . :.::::..: : :: ... :::. ::..: :. : . . . : :. KIAA05 QHRSLGPKDSKVRSLKMDASIWSNELIELFIVIGNKRANDFWAGNLQKDEELHMDSPVEK 660 670 680 690 700 710 570 580 590 600 610 620 FLJ003 KEWWIRSKYEE----KLFLAPLPCTELSLGQQLLRATTDEDLQTAILLLAHGSREEVNET .. .: .::.: : .:: : :. :.. : :.. :. .. :: :. . KIAA05 RKNFITQKYKEGKFRKTLLASL--TKEELNKALCAAVVKPDVLETMALLFSGA----DVM 720 730 740 750 760 630 640 650 660 FLJ003 CGEGDGC--TALHLACRKGNVVLEQLLTGWTSWPEMPTGTQR :. :: : :: . :. . ..: KIAA05 CATGDPVHSTPYLLAKKAGQSLQMEFLYHNKFSDFPQHDIHSEGVLSQESSQSTFLCDFL 770 780 790 800 810 820 >>KIAA1249 ( 949 res) hh04184 (949 aa) initn: 280 init1: 241 opt: 342 Z-score: 307.1 bits: 67.7 E(): 6.6e-12 Smith-Waterman score: 343; 31.984% identity (58.300% similar) in 247 aa overlap (420-641:197-433) 390 400 410 420 430 440 FLJ003 KDMDTGLGDSICFSPGISSTTSPKLNPPPSPHANKKKHLKKKSTNNFMIVSATGQTWHFE :.:. :: .: ..: . .:.::. 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FLJ003 PNRFCADCGAPQPDWASINLCVVICKRCAGEHRGLGAGVSKVRSLKMDRKVWTETLIELF 340 350 360 370 380 390 540 550 560 570 580 590 FLJ003 SSIGNELANSIWEGS---SQGQTKPSIKSTREEKEWWIRSKYEEKLF--LAPLPCTELSL ..:: .: .: .. :.. : :::. . ...::.: . :: .. : FLJ003 LQLGNGAGNRFWAANVPPSEALQPSSSPSTRRCH---LEAKYREGKYRRYHPLFGNQEEL 400 410 420 430 440 450 600 610 620 630 640 650 FLJ003 GQQLLRATTDEDLQTAILLLAHGSREEVNETCGEGDGCTALHLACRKGNVVLEQLLTGWT . : :.: :: . ::. :. .: :. .. : : :: . :... ..: FLJ003 DKALCAAVTTTDLAETQALLGCGAG--INCFSGDPEAPTPLALAEQAGQTLQMEFLRNNR 460 470 480 490 500 660 FLJ003 SWPEMPTGTQR FLJ003 TTEVPRLDSMKPLEKHYSVVLPTVSHSGFLYKTASAGKLLQDRRAREEFSRRWCVLGDGV 510 520 530 540 550 560 663 residues in 1 query sequences 2210331 residues in 2457 library sequences Tcomplib [34.26] (2 proc) start: Fri Feb 27 10:51:29 2009 done: Fri Feb 27 10:51:29 2009 Total Scan time: 0.660 Total Display time: 0.190 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]