# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -H -O./tmp/sh06716.fasta.huge -Q ../query/FLJ00371.ptfa ./tmplib.10216 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 FLJ00371, 625 aa vs ./tmplib.10216 library 2210369 residues in 2457 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.8256+/-0.00803; mu= -9.7222+/- 0.535 mean_var=524.9803+/-119.825, 0's: 0 Z-trim: 8 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.055976 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2457) FLJ00185 ( 824 res) sj01856 ( 824) 4066 343.1 6.7e-95 KIAA1308 ( 745 res) fh08652 ( 745) 3421 290.9 3e-79 KIAA0959 ( 820 res) hj05718 ( 820) 1436 130.7 5.8e-31 FLJ00153 ( 497 res) sh06127 ( 497) 974 93.1 7.2e-20 KIAA0351 ( 590 res) hg01609 ( 590) 299 38.7 0.0021 KIAA0313 ( 1508 res) hg00186 (1508) 236 34.1 0.12 FLJ00160 ( 1696 res) sh06621 (1696) 235 34.1 0.14 KIAA0269 ( 567 res) ha06751 ( 567) 193 30.1 0.76 KIAA1681 ( 1236 res) fh23697 (1236) 198 30.9 0.92 KIAA0309 ( 3053 res) hg00096s1 (3053) 206 32.1 1 KIAA0846 ( 691 res) hk05386 ( 691) 188 29.8 1.1 KIAA1802 ( 821 res) fj21631 ( 821) 183 29.5 1.7 KIAA1760 ( 2219 res) af00030 (2219) 193 30.9 1.7 KIAA1139 ( 1124 res) hk00330 (1124) 183 29.7 2 KIAA1343 ( 520 res) fj00420 ( 520) 173 28.4 2.2 KIAA1071 ( 675 res) hj05664s2 ( 675) 174 28.7 2.4 FLJ00084 ( 641 res) as00084 ( 641) 172 28.5 2.6 KIAA0458 ( 1552 res) ef01252 (1552) 180 29.6 2.9 KIAA0339 ( 1709 res) hg01304(revised) (1709) 181 29.8 2.9 KIAA0754 ( 1174 res) hh06485 (1174) 176 29.1 3.1 KIAA1471 ( 1421 res) fj02383s1 (1421) 178 29.4 3.1 KIAA1072 ( 759 res) hj06360 ( 759) 171 28.5 3.1 KIAA1375 ( 546 res) fj04426 ( 546) 166 27.9 3.4 KIAA0886 ( 1233 res) hk07722 (1233) 174 29.0 3.5 FLJ00353 ( 1766 res) sh01144 (1766) 176 29.4 3.9 KIAA1902 ( 1112 res) hj04383 (1112) 170 28.6 4.1 KIAA0613 ( 734 res) hg01088b ( 734) 165 28.0 4.3 KIAA1297 ( 2242 res) fg03883 (2242) 177 29.6 4.3 KIAA1096 ( 1919 res) pf00402 (1919) 175 29.3 4.4 KIAA0845 ( 1034 res) hk05234s1 (1034) 168 28.4 4.4 KIAA1076 ( 804 res) hj06779 ( 804) 164 28.0 4.8 KIAA1522 ( 1044 res) fh14706(revised) (1044) 166 28.3 5 KIAA1623 ( 1236 res) fj04650 (1236) 167 28.4 5.2 KIAA1205 ( 1217 res) fg03511a (1217) 163 28.1 6.5 KIAA0277 ( 583 res) ha06833 ( 583) 155 27.0 6.5 KIAA0927 ( 1001 res) hg03734 (1001) 158 27.6 7.6 KIAA0304 ( 2415 res) af07172 (2415) 166 28.7 8.3 KIAA0867 ( 568 res) hk06783 ( 568) 150 26.6 8.4 KIAA1779 ( 1233 res) hg04229 (1233) 158 27.7 8.6 KIAA1306 ( 1154 res) fh05845 (1154) 157 27.6 8.8 KIAA0910 ( 1315 res) hg02207s1 (1315) 158 27.7 9 KIAA0991 ( 630 res) hk06065 ( 630) 149 26.6 9.5 KIAA0612 ( 1810 res) hg00654s1 (1810) 159 28.0 10 KIAA0495 ( 209 res) hg00106 ( 209) 133 24.7 12 KIAA0442 ( 1266 res) hh03913 (1266) 152 27.2 12 FLJ00034 ( 1343 res) as00034 (1343) 150 27.1 14 KIAA0940 ( 699 res) hh04894 ( 699) 141 26.0 16 KIAA0775 ( 639 res) hk05255 ( 639) 140 25.9 16 KIAA0992 ( 772 res) hk07554 ( 772) 142 26.2 16 KIAA0306 ( 1451 res) hg00063 (1451) 148 27.0 17 >>FLJ00185 ( 824 res) sj01856 (824 aa) initn: 4066 init1: 4066 opt: 4066 Z-score: 1797.1 bits: 343.1 E(): 6.7e-95 Smith-Waterman score: 4066; 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KIAA09 MYKSIMLTSQDKTPAVIQRAMLKHNLDSDPAEEYELVQVISEDKELVIPDSANVFYAMNS 720 730 740 750 760 770 >>FLJ00153 ( 497 res) sh06127 (497 aa) initn: 1079 init1: 617 opt: 974 Z-score: 450.0 bits: 93.1 E(): 7.2e-20 Smith-Waterman score: 1049; 42.373% identity (63.559% similar) in 472 aa overlap (143-609:8-432) 120 130 140 150 160 FLJ003 GLESAPAPALELEPAPEQDPAPSQTLELEPAPAPVPSLQPSWPSPVVA----ENGLSEEK : .: : : :. : :.:: . FLJ001 ARAGRGAASGPPRVAQTSDPDSSEACAEEEEGLMPQG 10 20 30 170 180 190 200 210 220 FLJ003 PHLLVFPPDLVAEQFTLMDAELFKKVVPYHCLGSIWSQRDKKGKEHLAPTIRATVTQFNS :.:: : : ::::.::.: :::.:: :.::::.:::::. : .::.::::.:::. FLJ001 PQLLDFSVDEVAEQLTLIDLELFSKVRLYECLGSVWSQRDRPGAAGASPTVRATVAQFNT 40 50 60 70 80 90 230 240 250 260 270 280 FLJ003 VANCVITTCLGNRSTKAPDRARVVEHWIEVARECRILKNFSSLYAILSALQSNSIHRLKK :..::. . :: . ::.::. .:.::..:..:: :.::::: ::::::::: :.:::. 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FLJ001 SPSGS------------P----GDPSSPTSSVSPGSP------------PSSPRSR---- 340 350 360 530 540 550 560 570 580 FLJ003 WESASQSSPETSGISSASSNTSSSSASTTPVAATRTHKRSVSGLCNSSSALPLYNQQVGD .. . : : . : .. :.. : .: : . : .: .:: :: .. FLJ001 -DAPAGSPPASPGPQGPSTKLPLSLDLPSP--------RPFA-LPLGSPRIPLPAQQSSE 370 380 390 400 410 590 600 610 620 FLJ003 CCIIRVSLDVDNGNMYKSILVSRRGWPGCLPPLAANAP :.::::.: :.::.:.:::.. FLJ001 ACVIRVSIDNDHGNLYRSILLTSQDKAPSVVRRALQKHNVPQPWACDYQLFQVLPGDRGW 420 430 440 450 460 470 >>KIAA0351 ( 590 res) hg01609 (590 aa) initn: 372 init1: 188 opt: 299 Z-score: 154.6 bits: 38.7 E(): 0.0021 Smith-Waterman score: 408; 27.119% identity (55.448% similar) in 413 aa overlap (171-571:79-447) 150 160 170 180 190 200 FLJ003 EPAPAPVPSLQPSWPSPVVAENGLSEEKPHLLVFPPDLVAEQFTLMDAELFKKVVPYHCL .: :. : :.:::: .:: . : . KIAA03 ATPQGSSSSDSLEGQSCDYASKSYDAVVFDVLKVTPEEFASQITLMDIPVFKAIQPEELA 50 60 70 80 90 100 210 220 230 240 250 260 FLJ003 GSIWSQRDKKGKEHLAPTIRATVTQFNSVANCVITTCLGNRSTKAPDRARVVEHWIEVAR . :: :: :. :::.. : . .::.:. :. : .. : ::... :....:. KIAA03 SCGWS---KKEKHSLAPNVVAFTRRFNQVSFWVVREILTAQTLKI--RAEILSHFVKIAK 110 120 130 140 150 160 270 280 290 300 310 320 FLJ003 ECRILKNFSSLYAILSALQSNSIHRLKKTWEDVSRDSFRIFQKLSEIFSDENNYSLSREL . :.:. ::....::::: : :: ::: ..: . :.::. ..: :.::. .:: KIAA03 KLLELNNLHSLMSVVSALQSAPIFRLTKTWALLNRKDKTTFEKLDYLMSKEDNYKRTREY 170 180 190 200 210 220 330 340 350 360 370 380 FLJ003 LIKEGTSKFATLEMNPKRAQKRPKETGIIQGTVPYLGTFLTDLVMLDTAMKDYLYGRLIN . .:.: : ..:::: .: ::...:.:. : ... KIAA03 I--------RSLKMVP---------------SIPYLGIYLLDLIYIDSAYPAS--GSIME 230 240 250 390 400 410 420 430 FLJ003 FEKRRKEFEVIAQIKL-LQSAC--NNYSIAPDEQ-FGAWFRAVERLS---ETESYNLSCE :.: .... : .: :: .: .. . : : . : .:.:. : ..:.:: . KIAA03 NEQRSNQMNNILRIIADLQVSCSYDHLTTLPHVQKYLKSVRYIEELQKFVEDDNYKLSLR 260 270 280 290 300 310 440 450 460 470 480 490 FLJ003 LEPPSESASNTLRTKKNTAIVKRWSDRQAPSTELSTSGSSHSKSCDQLRCGPYLSSGDIA .:: : :. . .:.. : .::. ... :. .: . . : . . KIAA03 IEPGS-SSPRLVSSKEDLA---------GPSAGSGSARFSRRPTCPDTSVAGSLPTPPVP 320 330 340 350 360 500 510 520 530 540 FLJ003 DALSVHSAGSSS----SDVEEINISFVPESPDGQEKKFWE-SASQSSPETSGISSASSNT . :: :.. : :: . .: :. . ... . :. .: :.. .::.. KIAA03 RHRKSHSLGNNMMCQLSVVESKSATF----PSEKARHLLDDSVLESRSPRRGLALTSSSA 370 380 390 400 410 420 550 560 570 580 590 600 FLJ003 SSSSASTTPVAATRTHKRSVSGLCNSSSALPLYNQQVGDCCIIRVSLDVDNGNMYKSILV ... : ... .. ::: KIAA03 VTNGLSLGSSESSEFSEEMSSGLESPTGPCICSLGNSAAVPTMEGPLRRKTLLKEGRKPA 430 440 450 460 470 480 >>KIAA0313 ( 1508 res) hg00186 (1508 aa) initn: 179 init1: 140 opt: 236 Z-score: 122.7 bits: 34.1 E(): 0.12 Smith-Waterman score: 239; 24.436% identity (56.015% similar) in 266 aa overlap (160-424:711-945) 130 140 150 160 170 180 FLJ003 QDPAPSQTLELEPAPAPVPSLQPSWPSPVVAENGLSEEKPHLLVFPPDLVAEQFTLMDAE :.. : : . :: . :: :... . : KIAA03 LSKLADRIQLSGRYYLKNNMETETLCSDEDAQELLRESQISLLQLSTVEVATQLSMRNFE 690 700 710 720 730 740 190 200 210 220 230 240 FLJ003 LFKKVVPYHCLGSIWSQRDKKGKEHLAPTIRATVTQFNS-VANCVITTCLGNRSTKAPDR ::... : . . .... :.: . .: .. ...: . ::. .. : :. : KIAA03 LFRNIEPTEYIDDLFKLRSKTSCANLK-RFEEVINQETFWVASEIL------RETNQLKR 750 760 770 780 790 250 260 270 280 290 300 FLJ003 ARVVEHWIEVARECRILKNFSSLYAILSALQSNSIHRLKKTWEDVSRDSFRIFQKLSEIF ....:.:..: .:: :::.:..::.:.:. . ::. ::: . ..:: :...: KIAA03 MKIIKHFIKIALHCRECKNFNSMFAIISGLNLAPVARLRTTWEKLPNKYEKLFQDLQDLF 800 810 820 830 840 850 310 320 330 340 350 360 FLJ003 SDENNYSLSRELLIKEGTSKFATLEMNPKRAQKRPKETGIIQGTVPYLGTFLTDLVMLDT . :.. :..: ... ..: : .: . .. ::..: KIAA03 DPSRNMAKYRNVLNSQN--------LQP------P--------IIPLFPVIKKDLTFLHE 860 870 880 890 370 380 390 400 410 420 FLJ003 AMKDYLYGRLINFEKRRKEFEVIAQIKLLQSACNNYSIAPDEQFGAWFRAVERLSETESY . . . : :.:::: : . : .. . :. . .. . : :.. ::. KIAA03 GNDSKVDG-LVNFEKLRMIAKEIRHVGRMASVNMDPALMFRTRKKKW-RSLGSLSQGSTN 900 910 920 930 940 430 440 450 460 470 480 FLJ003 NLSCELEPPSESASNTLRTKKNTAIVKRWSDRQAPSTELSTSGSSHSKSCDQLRCGPYLS KIAA03 ATVLDVAQTGGHKKRVRRSSFLNAKKLYEDAQMARKVKQYLSNLELEMDEESLQTLSLQC 950 960 970 980 990 1000 >>FLJ00160 ( 1696 res) sh06621 (1696 aa) initn: 205 init1: 205 opt: 235 Z-score: 121.7 bits: 34.1 E(): 0.14 Smith-Waterman score: 235; 39.344% identity (56.557% similar) in 122 aa overlap (40-158:257-374) 10 20 30 40 50 60 FLJ003 LKQLVAYVQLNMPGSDLERRAHLLLAQLEHSEPIEAEPEALSPVPALKPTPELELALT-P :.:. . .: :::: : : . :. : FLJ001 ATSVPAPSPPLAPVPALAPAPPSVPTLISDSNPLSVSASVLVPVPASAP-PSGPVPLSAP 230 240 250 260 270 280 70 80 90 100 110 120 FLJ003 ARAPSPVPAPAPEPE--PAPTPAPGSELEVAPAPAPELQQAPEPAVGLESAPAPALELEP : :: ::. :: ::.: . : .::.:.: : :: :: .:::: : FLJ001 APAPLSVPVSAPPLALIQAPVPPSAPTLVLAPVPTPVL--APMPASTPPAAPAPPSVPMP 290 300 310 320 330 340 130 140 150 160 170 180 FLJ003 APEQDPAPSQTLELEPAPAPVPSLQPSWPSPVVAENGLSEEKPHLLVFPPDLVAEQFTLM .: . .: .: : :: ::.: :. :.:. 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KIAA03 TLSLGTGNPQGPFPTQTLSLTPASSLVPTPAQTLSLAPGPPLGPTQTLSLAPAPPLAPAS 1530 1540 1550 1560 1570 1580 170 180 190 200 210 220 FLJ003 GLSEEKPHLLVFPPDLVAEQFTLMDAELFKKVVPYHCLGSIWSQRDKKGKEHLAPTIRAT .. : :.. : KIAA03 PVGPAPAHTLTLAPASSSASLLAPASVQTLTLSPAPVPTLGPAAAQTLALAPASTQSPAS 1590 1600 1610 1620 1630 1640 625 residues in 1 query sequences 2210369 residues in 2457 library sequences Tcomplib [34.26] (2 proc) start: Fri Feb 27 11:02:05 2009 done: Fri Feb 27 11:02:06 2009 Total Scan time: 0.640 Total Display time: 0.190 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]