# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -H -O./tmp/sh07709.fasta.huge -Q ../query/FLJ00169.ptfa ./tmplib.10216 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 FLJ00169, 432 aa vs ./tmplib.10216 library 2210562 residues in 2457 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.9693+/-0.00842; mu= -11.0577+/- 0.561 mean_var=437.8983+/-100.313, 0's: 0 Z-trim: 2 B-trim: 159 in 1/39 Lambda= 0.061290 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2457) KIAA0595 ( 1666 res) hj02929s1 (1666) 200 31.8 0.49 KIAA0324 ( 2800 res) ee08846s1 (2800) 198 31.8 0.78 KIAA1187 ( 813 res) fk03027 ( 813) 180 29.6 1 KIAA1853 ( 708 res) hj04155 ( 708) 175 29.1 1.3 KIAA0045 ( 2005 res) ha00941 (2005) 181 30.2 1.8 KIAA0164 ( 929 res) ha02373 ( 929) 171 28.9 1.9 KIAA1020 ( 638 res) fg00473s1 ( 638) 161 27.9 2.8 KIAA2009 ( 501 res) fj05611 ( 501) 154 27.1 3.6 KIAA0434 ( 1571 res) hh02165 (1571) 164 28.5 4.3 FLJ00034 ( 1343 res) as00034 (1343) 162 28.3 4.3 KIAA1980 ( 660 res) fj10323s1 ( 660) 153 27.2 4.7 KIAA1727 ( 1130 res) pg00153 (1130) 158 27.9 4.9 KIAA0308 ( 2759 res) ee00163 (2759) 167 29.1 5.2 KIAA1172 ( 929 res) hj03919(revised) ( 929) 153 27.3 5.9 KIAA0653 ( 558 res) hk01718 ( 558) 143 26.2 7.7 KIAA0332 ( 1028 res) hg00939 (1028) 149 27.0 8 FLJ00248 ( 501 res) sj08681 ( 501) 140 25.9 8.6 KIAA0418 ( 989 res) hh00988 ( 989) 147 26.8 8.8 KIAA1538 ( 1029 res) fg06773 (1029) 147 26.8 9.1 KIAA0741 ( 1222 res) hk04024 (1222) 148 27.0 9.6 KIAA1029 ( 1015 res) fh00363 (1015) 143 26.5 11 KIAA1522 ( 1044 res) fh14706(revised) (1044) 143 26.5 12 KIAA0575 ( 952 res) hj00216 ( 952) 140 26.2 13 KIAA1768 ( 1207 res) ph00672(revised) (1207) 142 26.5 14 KIAA1464 ( 621 res) fh18679 ( 621) 134 25.5 14 KIAA0035 ( 707 res) ha01976 ( 707) 134 25.5 16 KIAA1604 ( 937 res) fj10713 ( 937) 137 25.9 16 KIAA0819 ( 989 res) hh01037 ( 989) 137 25.9 16 KIAA2011 ( 1091 res) pj02017 (1091) 137 26.0 17 KIAA1820 ( 1644 res) hh01321 (1644) 141 26.5 18 KIAA0577 ( 1043 res) hj00291 (1043) 135 25.8 19 KIAA0226 ( 973 res) fg02838 ( 973) 133 25.6 21 KIAA0551 ( 1385 res) hh00867s1 (1385) 136 26.0 22 KIAA0985 ( 697 res) hj08038 ( 697) 128 25.0 22 KIAA0585 ( 416 res) hj00998 ( 416) 122 24.2 23 KIAA0801 ( 1058 res) hg03949(revised) (1058) 132 25.5 23 KIAA1423 ( 616 res) fh08369(revised) ( 616) 126 24.7 23 KIAA1870 ( 832 res) hh05136b ( 832) 129 25.2 24 KIAA0731 ( 1096 res) hk03714 (1096) 132 25.5 24 KIAA0257 ( 1805 res) ha07065 (1805) 137 26.2 24 KIAA0904 ( 1535 res) ha00554 (1535) 134 25.9 26 KIAA2031 ( 515 res) ef03841 ( 515) 122 24.3 26 KIAA0680 ( 635 res) hk02746 ( 635) 124 24.6 27 KIAA0401 ( 344 res) hg01095 ( 344) 117 23.7 27 KIAA1866 ( 1783 res) pf09734 (1783) 135 26.0 27 KIAA0339 ( 1709 res) hg01304(revised) (1709) 134 25.9 28 FLJ00193 ( 491 res) sj02629 ( 491) 120 24.1 29 FLJ00198 ( 677 res) sj03504 ( 677) 123 24.5 30 KIAA0303 ( 2137 res) hg00009 (2137) 135 26.1 31 KIAA0670 ( 1286 res) hk02359s1 (1286) 129 25.4 32 >>KIAA0595 ( 1666 res) hj02929s1 (1666 aa) initn: 1018 init1: 147 opt: 200 Z-score: 112.0 bits: 31.8 E(): 0.49 Smith-Waterman score: 226; 26.667% identity (48.986% similar) in 345 aa overlap (23-337:1225-1554) 10 20 30 40 50 FLJ001 ESAGKRPRRHSRRTAASSQGFGAGCAGVGPPGTGRALNRHRCGDWSRRRKPG :. ::. ::.: . . : : KIAA05 PADSLAVGNSGGVDIPQEKRPLDRLQAPELANVAGLTPPATPPHQLWKPLAAVSLLAKAK 1200 1210 1220 1230 1240 1250 60 70 80 90 100 110 FLJ001 SPALGVGEGRSFSRDGDGYWASPGPGPARATLGAR-P-RPALGASAQARLLRRQPAAPWL :: . :: . .: . :. .: :.. : : .:.. . .: KIAA05 SPKSTAQEG---TLKPEGVTEAKHPAAVRLQEGVHGPSRVHVGSGDHDYCVR-------- 1260 1270 1280 1290 1300 120 130 140 150 160 FLJ001 TSAPASARGVAAGPGDGGRKRERRRAGKTPR-----GTARPPHPKVARPARPLGRRVRTT . .: . . . : :.: .:. : . : : :: : .: .:: .:. . 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