# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -H -O./tmp/sj01081.fasta.huge -Q ../query/FLJ00177.ptfa ./tmplib.10216 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 FLJ00177, 526 aa vs ./tmplib.10216 library 2210468 residues in 2457 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.3729+/-0.00364; mu= 17.0768+/- 0.246 mean_var=81.9099+/-18.488, 0's: 0 Z-trim: 0 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.141712 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2457) KIAA1163 ( 437 res) hj05329 ( 437) 92 28.5 1.5 KIAA0215 ( 857 res) ha02776 ( 857) 94 29.3 1.7 FLJ00259 ( 659 res) sh04102 ( 659) 91 28.5 2.2 KIAA1574 ( 670 res) fh24775 ( 670) 91 28.6 2.2 KIAA0768 ( 872 res) hk05006 ( 872) 90 28.5 3 KIAA0092 ( 475 res) ha01343 ( 475) 87 27.5 3.1 KIAA1735 ( 493 res) ph00512 ( 493) 85 27.2 4.2 KIAA0421 ( 1988 res) hh01158s1 (1988) 91 29.2 4.3 KIAA1290 ( 1011 res) hj00086s2 (1011) 87 28.0 5 KIAA1687 ( 728 res) fh26020 ( 728) 85 27.4 5.4 KIAA0491 ( 391 res) ha02617 ( 391) 82 26.4 5.6 KIAA0130 ( 1006 res) ha01208 (1006) 85 27.6 6.6 KIAA1372 ( 773 res) fj03335 ( 773) 83 27.0 7.5 FLJ00401 ( 504 res) sj07492 ( 504) 81 26.4 7.6 KIAA1626 ( 1284 res) fg01925(revised) (1284) 85 27.7 7.7 KIAA0663 ( 816 res) hk02006 ( 816) 83 27.0 7.7 KIAA1346 ( 999 res) fj00671 ( 999) 82 26.9 10 FLJ00208 ( 333 res) sj04945 ( 333) 76 25.1 12 KIAA1524 ( 884 res) fj00637(revised) ( 884) 80 26.5 12 KIAA1568 ( 1380 res) fh22308 (1380) 81 26.9 14 KIAA1150 ( 499 res) hg02066 ( 499) 76 25.3 15 KIAA0511 ( 933 res) he00818 ( 933) 78 26.1 17 KIAA0533 ( 1645 res) hg03784 (1645) 80 26.8 18 KIAA1483 ( 428 res) fj06303 ( 428) 74 24.8 18 KIAA1401 ( 853 res) hk09639 ( 853) 77 25.8 19 KIAA1245 ( 892 res) hg04073 ( 892) 77 25.9 19 FLJ00293 ( 812 res) sh03709 ( 812) 76 25.6 21 KIAA0292 ( 1716 res) ha06353 (1716) 79 26.6 22 KIAA1848 ( 445 res) bm03548 ( 445) 73 24.7 22 FLJ00080 ( 716 res) as00080 ( 716) 75 25.3 22 FLJ00418 ( 200 res) sj09371 ( 200) 69 23.4 23 KIAA0827 ( 1608 res) hh03726 (1608) 78 26.4 24 KIAA1440 ( 1377 res) hg02441b (1377) 77 26.1 25 FLJ00121 ( 448 res) sh00381 ( 448) 72 24.5 25 KIAA1113 ( 1131 res) hj06379(revised) (1131) 76 25.8 25 KIAA0403 ( 416 res) hg01159 ( 416) 71 24.2 28 KIAA1278 ( 1311 res) hg03689(revised) (1311) 75 25.7 32 KIAA1539 ( 543 res) fg02356 ( 543) 70 24.1 37 KIAA1262 ( 1362 res) hh15990 (1362) 74 25.5 38 KIAA1676 ( 735 res) fh07095 ( 735) 71 24.5 39 KIAA0875 ( 621 res) hk07350 ( 621) 70 24.2 41 KIAA1731 ( 2056 res) bf02656 (2056) 75 25.9 42 KIAA1229 ( 696 res) fh05775 ( 696) 70 24.3 44 KIAA0159 ( 1406 res) ha03574 (1406) 73 25.3 44 FLJ00074 ( 191 res) as00074 ( 191) 64 22.3 46 KIAA1385 ( 768 res) fj06168 ( 768) 70 24.3 46 KIAA0719 ( 624 res) hk01141 ( 624) 69 24.0 47 FLJ00126 ( 878 res) sh01242 ( 878) 70 24.4 50 KIAA1579 ( 704 res) fj04678 ( 704) 69 24.1 51 KIAA0974 ( 565 res) hj06874 ( 565) 68 23.8 51 >>KIAA1163 ( 437 res) hj05329 (437 aa) initn: 58 init1: 58 opt: 92 Z-score: 103.4 bits: 28.5 E(): 1.5 Smith-Waterman score: 92; 27.928% identity (53.153% similar) in 111 aa overlap (407-512:140-244) 380 390 400 410 420 430 FLJ001 HEIMYKLEVLYVLCVLLMGRQRNQVHRMIAEFKLIPGLNNLFDKLIWRKHSASALVLHGH ..: .: : .: : : ..: ::.. 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KIAA15 LSFNSSSSSEANFKLEPNSPMHGGTLLEDVVGGRQTTPESDF--NLQALRSRYEALKKSL 510 520 530 540 550 240 250 260 270 280 290 FLJ001 FCRILAVTISEMDTGNDDKHTLLAKNAQQKKSLSLGPSAAEINQAALLSIPGFVERLCKL KIAA15 SKKREESYLSNSQTPERHKPELSPTPQNVQTDDTLNFLDTCDLHTEHIKPSLRTSIGERK 560 570 580 590 600 610 >>KIAA0768 ( 872 res) hk05006 (872 aa) initn: 104 init1: 73 opt: 90 Z-score: 97.9 bits: 28.5 E(): 3 Smith-Waterman score: 90; 35.185% identity (57.407% similar) in 54 aa overlap (324-371:702-755) 300 310 320 330 340 FLJ001 RLCKLATRKVSESTGTASFLQELEEWYTWLDNALVLDALMRVANEESE-----HNQASI- :.:.::: .::: :.... 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