# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -H -O./tmp/sj01172.fasta.huge -Q ../query/FLJ00262.ptfa ./tmplib.10216 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 FLJ00262, 1112 aa vs ./tmplib.10216 library 2209882 residues in 2457 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3568+/-0.00498; mu= 10.0420+/- 0.334 mean_var=151.2245+/-33.877, 0's: 0 Z-trim: 34 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.104295 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2457) KIAA1790 ( 1369 res) fh24104 (1369) 7514 1143.6 0 KIAA1995 ( 1011 res) bh00088 (1011) 256 51.3 9.8e-07 KIAA1760 ( 2219 res) af00030 (2219) 260 52.3 1.1e-06 KIAA1860 ( 689 res) fh18358 ( 689) 244 49.3 2.7e-06 KIAA0344 ( 2066 res) hg01568 (2066) 245 50.0 5e-06 KIAA0787 ( 557 res) hk05521s1 ( 557) 236 48.0 5.3e-06 KIAA0204 ( 1164 res) ha02801 (1164) 238 48.7 7e-06 KIAA1459 ( 853 res) fh16961 ( 853) 234 47.9 8.7e-06 KIAA0537 ( 698 res) hg03925 ( 698) 232 47.5 9.4e-06 KIAA0369 ( 794 res) hh00177 ( 794) 230 47.3 1.3e-05 KIAA0623 ( 1100 res) hg04615 (1100) 228 47.2 1.9e-05 KIAA1264 ( 753 res) hj01058 ( 753) 219 45.6 3.8e-05 KIAA1278 ( 1311 res) hg03689(revised) (1311) 222 46.3 4e-05 KIAA0472 ( 365 res) hh00171 ( 365) 211 44.1 5.4e-05 KIAA0881 ( 1064 res) hk07534 (1064) 215 45.2 7.3e-05 KIAA1079 ( 1476 res) hj06972 (1476) 215 45.3 9.1e-05 KIAA0999 ( 1371 res) fj10213 (1371) 213 45.0 0.00011 KIAA0722 ( 1066 res) hk02030s1 (1066) 211 44.6 0.00011 KIAA1361 ( 1005 res) fj02367 (1005) 210 44.4 0.00012 KIAA0968 ( 527 res) hj06483 ( 527) 204 43.2 0.00014 KIAA1142 ( 467 res) hh05864 ( 467) 199 42.4 0.00022 KIAA1765 ( 608 res) fj12188(revised) ( 608) 200 42.7 0.00024 KIAA0096 ( 766 res) ha01240s1 ( 766) 194 41.9 0.00052 KIAA1901 ( 1265 res) hh03635 (1265) 194 42.1 0.00073 KIAA0536 ( 1028 res) hg03863 (1028) 188 41.1 0.0012 KIAA1883 ( 1480 res) fh02249 (1480) 189 41.4 0.0014 KIAA0175 ( 656 res) ha02337 ( 656) 174 38.8 0.0038 KIAA1297 ( 2242 res) fg03883 (2242) 179 40.1 0.0051 KIAA1101 ( 467 res) hk08029 ( 467) 163 37.0 0.0096 KIAA0936 ( 640 res) hh04647 ( 640) 164 37.3 0.011 FLJ00113 ( 419 res) as00113 ( 419) 156 35.8 0.018 KIAA1028 ( 501 res) fh00176s1 ( 501) 155 35.8 0.023 KIAA1639 ( 2584 res) af14886 (2584) 162 37.6 0.033 KIAA0619 ( 1428 res) hg04117 (1428) 149 35.4 0.087 KIAA1124 ( 1760 res) fg05708 (1760) 148 35.3 0.11 KIAA0904 ( 1535 res) ha00554 (1535) 136 33.5 0.35 KIAA0807 ( 1329 res) hk04449(revised) (1329) 135 33.3 0.36 KIAA0965 ( 489 res) hj06174s1 ( 489) 126 31.4 0.47 KIAA1338 ( 1495 res) fh16948 (1495) 125 31.8 1.1 FLJ00141 ( 1326 res) sh04092 (1326) 123 31.4 1.2 KIAA0638 ( 1384 res) hj03347s1 (1384) 123 31.5 1.3 FLJ00265 ( 155 res) sj01842 ( 155) 108 28.1 1.4 KIAA0561 ( 1308 res) hh01676 (1308) 120 31.0 1.7 KIAA0303 ( 2137 res) hg00009 (2137) 122 31.5 1.9 KIAA0973 ( 1583 res) hj06871 (1583) 120 31.1 1.9 KIAA1053 ( 508 res) hh05049 ( 508) 104 28.1 4.8 KIAA0414 ( 492 res) hh00161 ( 492) 101 27.7 6.4 KIAA1543 ( 917 res) hh05613a ( 917) 101 28.0 9.6 KIAA0127 ( 315 res) ha03921 ( 315) 91 25.9 13 KIAA1369 ( 653 res) fj03222 ( 653) 95 26.9 14 >>KIAA1790 ( 1369 res) fh24104 (1369 aa) initn: 7514 init1: 7514 opt: 7514 Z-score: 6114.8 bits: 1143.6 E(): 0 Smith-Waterman score: 7514; 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KIAA19 EYCNGGN-LYDKILRQKDKLFEEEMVVWYL-FQIVSAVSCIHKAGILHRDIKTLNIFLTK 170 180 190 200 210 500 510 520 530 540 550 FLJ002 LDVKEHINIKLSDYGISRQ--SFHEGALGVEGTPGYQAPEIRPRIVYDEKVDMFSYGMVL .. :::.:::.... : . : . ::: :..::. . :. : :... : :. KIAA19 ANL-----IKLGDYGLAKKLNSEYSMAETLVGTPYYMSPELCQGVKYNFKSDIWAVGCVI 220 230 240 250 260 270 560 570 580 590 600 610 FLJ002 YELLSGQRPALGHHQLQIAKKLSKGIRPVLGQPEEVQFRRLQALMMECWDTKPEKRPLAL .:::. .: . . :.. :. .::: . . . ... .: .. : : ::.:: : KIAA19 FELLTLKRTFDATNPLNLCVKIVQGIRAMEVDSSQYSLELIQ-MVHSCLDQDPEQRPTAD 280 290 300 310 320 330 620 630 640 650 660 670 FLJ002 SVVSQMKDPTFATFMYELCCGKQTAFFSSQGQEYTVVFWDGKEESRNYTVVNTEKGLMEV KIAA19 ELLDRPLLRKRRREMEEKVTLLNAPTKRPRSSTVTEAPIAVVTSRTSEVYVWGGGKSTPQ 340 350 360 370 380 390 >>KIAA1760 ( 2219 res) af00030 (2219 aa) initn: 271 init1: 81 opt: 260 Z-score: 213.4 bits: 52.3 E(): 1.1e-06 Smith-Waterman score: 267; 30.093% identity (60.185% similar) in 216 aa overlap (401-607:234-436) 380 390 400 410 420 FLJ002 IKKFKNFANVPADTMLRHLRATDAMKNFSEFRQEASMLHALQHPCIVALIGI----SIHP :..:: ::..:::: :: . . . 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KIAA03 --PEVKEIIEGCIRQNKDERYS--IKDLL---NHAFF----QEETGVRVELAEED----- 390 400 410 420 670 680 690 700 710 720 FLJ002 VNTEKGLMEVQRMCCPGMKVSCQLQVQRSLWTATEDQKIYIYTLKGMCPLNTPQQ-ALDT : :.. .: : :: : ::: : . ..: KIAA03 ---------------DGEKIAIKL------WLRIED----IKKLKGKYKDNEAIEFSFDL 430 440 450 460 730 740 750 760 770 780 FLJ002 PAVVTCFLAVPVIKKNSYLVLAGLADGLVAVFPVVRGTPKDSCSYLCSHTANRSKFSIAD : .: ... : : : .. .. :: : . . .:. . KIAA03 ERDVPEDVAQEMVE--SGYVCEGDHKTMAKAI-------KDRVSLIKRKREQRQLVREEQ 470 480 490 500 510 790 800 810 820 FLJ002 EDARQNPYPVKAMEVVNSGSEVWYSNGP----GLLVIDCASLEICRRLEP---------- : .:. .: . .:.:.. .. : :. . . .: . ..:: KIAA03 EKKKQEESSLKQQVEQSSASQTGIKQLPSASTGIPTASTTSASVSTQVEPEEPEADQHQQ 520 530 540 550 560 570 830 840 850 860 870 880 FLJ002 --YMAPSM-VTSVVCSSEGRGEEVVWCLDDKANSLVMYHSTTYQLCARYFCGVPS--PLR :. ::. : : . :.: : .... : : : : :. ::. : KIAA03 LQYQQPSISVLSDGTVDSGQGSSVFTESRVSSQQTVSYGSQHEQ--AHSTGTVPGHIPST 580 590 600 610 620 890 900 910 920 930 FLJ002 DMFPVRPLDTEPPAA-SHTANPKVPEGDSIADVS----IMYSEELGTQILIHQESLTDYC . .: . ::.. .. . : ..:.. :: :.. .. : : .. ..: KIAA03 VQAQSQPHGVYPPSSVAQGQSQGQPSSSSLTGVSSSQPIQHPQQQGIQQTAPPQQTVQY- 630 640 650 660 670 680 940 950 960 970 980 990 FLJ002 SMSSYSSSPPRQAARSPSSLPSSPASSSSVPFSTDCEDSDMLHTPGAASDRSEHDLTPMD :.:. :.: .:. : : :..: KIAA03 SLSQTSTSSEATTAQ-PVSQPQAPQVLPQVSAGKQSTQGVSQVAPAEPVAVAQPQATQPT 690 700 710 720 730 740 >>KIAA0787 ( 557 res) hk05521s1 (557 aa) initn: 104 init1: 104 opt: 236 Z-score: 201.1 bits: 48.0 E(): 5.3e-06 Smith-Waterman score: 236; 24.927% identity (54.545% similar) in 341 aa overlap (285-607:116-435) 260 270 280 290 300 310 FLJ002 LMEQYVPCPVCETAWAQHTDPSEKSEDVQYFDMED-CVLTAIERDFISCPRH-PDLPV-P .::. :. .. . .: :. : :: : KIAA07 SSGSQARPHLSGRKLSLQERSQGGLAAGGSLDMNGRCICPSLPYSPVSSPQSSPRLPRRP 90 100 110 120 130 140 320 330 340 350 360 370 FLJ002 LQELVPELFMTDFPARLFLENSKLEHSEDEGSVLGQGGSGTV-IYRARYQGQPVAVKRFH : .. .: . . :.. :. :: .:.:. :.: . . .. :.: . 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KIAA07 FSGKALDVWAMGVTLYCFVFGQCPFMDERIMCLHSKIKSQALEFPDQPDIAE--DLKDLI 370 380 390 400 410 420 600 610 620 630 640 650 FLJ002 MECWDTKPEKRPLALSVVSQMKDPTFATFMYELCCGKQTAFFSSQGQEYTVVFWDGKEES . : .::.: KIAA07 TRMLDKNPESRIVVPEIKLHPWVTRHGAEPLPSEDENCTLVEVTEEEVENSVKHIPSLAT 430 440 450 460 470 480 >>KIAA0204 ( 1164 res) ha02801 (1164 aa) initn: 143 init1: 84 opt: 238 Z-score: 198.9 bits: 48.7 E(): 7e-06 Smith-Waterman score: 238; 26.990% identity (56.055% similar) in 289 aa overlap (392-664:79-342) 370 380 390 400 410 420 FLJ002 QPVAVKRFHIKKFKNFANVPADTMLRHLRATDAMKNFSEFRQEASMLHALQHPCIVALIG : . ... .. : ..: . .:: :: :. KIAA02 IGELGDGAFGKVYKAQNKETSVLAAAKVIDTKSEEELEDYMVEIDILASCDHPNIVKLLD 50 60 70 80 90 100 430 440 450 460 470 FLJ002 ISIHP--LCFALELAPLSSLNTVLSENARDSSFIPLGHMLTQKIAYQIASGLAYLHKKNI . : . .:. .....:. : : :: . : . : ..: ::: ..: KIAA02 AFYYENNLWILIEFCAGGAVDAVMLELER-----PLTESQIQVVCKQTLDALNYLHDNKI 110 120 130 140 150 160 480 490 500 510 520 530 FLJ002 IFCDLKSDNILVWSLDVKEHINIKLSDYGISRQSFH--EGALGVEGTPGYQAPEI----- : :::. ::: ..:: .:::.:.:.: .. . . . ::: ..:::. KIAA02 IHRDLKAGNIL-FTLDG----DIKLADFGVSAKNTRTIQRRDSFIGTPYWMAPEVVMCET 170 180 190 200 210 540 550 560 570 580 FLJ002 ---RPRIVYDEKVDMFSYGMVLYELLSGQRPALGHHQL---QIAKKLSKGIRPVLGQPEE :: :: :.:..: :..: :. . : ::.: .. :..:. :.:.:: . 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KIAA02 TEEVEDGKEEDEEEETENSLPIPASKRASSDLSIASSEEDKLSQNACILESVSEKTERSN 330 340 350 360 370 380 >>KIAA1459 ( 853 res) fh16961 (853 aa) initn: 132 init1: 67 opt: 234 Z-score: 197.2 bits: 47.9 E(): 8.7e-06 Smith-Waterman score: 257; 25.610% identity (51.220% similar) in 328 aa overlap (305-615:447-738) 280 290 300 310 320 FLJ002 PSEKSEDVQYFDMEDCVLTAIERDFISCPRHPDLPVPLQELVPELFMTDFPARL---F-- :: .: .. . . :.: : KIAA14 GYSKAFQDSDEEKMHYQNGQAPPPVFLPLHHPPGKLPEPQFYAQPHTYEEPGRAGRSFTR 420 430 440 450 460 470 330 340 350 360 370 380 FLJ002 -LENSKLEHSEDEGSVLGQGGSGTVIY-RARYQGQPVAVKRFHIKKFKNFANVPADTMLR .: :.. : : ...:.: :: : : : : :: .:: . .. KIAA14 EIEASRI-HIE---KIIGSGDSGEVCYGRLRVPGQ---------------RDVP--VAIK 480 490 500 510 390 400 410 420 430 440 FLJ002 HLRATDAMKNFSEFRQEASMLHALQHPCIVALIGISIHP--LCFALELAPLSSLNTVLSE :.: . .. .: .:::.. ..:: :. : :. . .. : .::.: : KIAA14 ALKAGYTERQRRDFLSEASIMGQFDHPNIIRLEGVVTRGRLAMIVTEYMENGSLDTFLRT 520 530 540 550 560 570 450 460 470 480 490 500 FLJ002 NARDSSFIPLGHMLTQKIAYQIASGLAYLHKKNIIFCDLKSDNILVWSLDVKEHINIKLS . . ... : :: ...:. :: . . :: . :.:: : .. :.: KIAA14 HDGQFTIMQLVGMLRG-----VGAGMRYLSDLGYVHRDLAARNVLVDS-----NLVCKVS 580 590 600 610 620 510 520 530 540 550 FLJ002 DYGISRQSFHEGALGVEGTPG-----YQAPEIRPRIVYDEKVDMFSYGMVLYELLS-GQR :.:.:: . . : : . ::: ... :..:.:.:..:.:. :.: KIAA14 DFGLSRVLEDDPDAAYTTTGGKIPIRWTAPEAIAFRTFSSASDVWSFGVVMWEVLAYGER 630 640 650 660 670 680 560 570 580 590 600 610 FLJ002 PALGHHQLQIAKKLSKGIR-PV-LGQPEEVQFRRLQALMMECWDTKPEKRPLALSVVSQM : . . .. ... .: : :. .: :. :. ::..:: .:: ..:: KIAA14 PYWNMTNRDVISSVEEGYRLPAPMGCPHA-----LHQLMLDCWHKDRAQRPRFSQIVSVL 690 700 710 720 730 740 620 630 640 650 660 670 FLJ002 KDPTFATFMYELCCGKQTAFFSSQGQEYTVVFWDGKEESRNYTVVNTEKGLMEVQRMCCP KIAA14 DALIRSPESLRATATVSRCPPPAFVRSCFDLRGGSGGGGGLTVGDWLDSIRMGRYRDHFA 750 760 770 780 790 800 >>KIAA0537 ( 698 res) hg03925 (698 aa) initn: 79 init1: 79 opt: 232 Z-score: 196.6 bits: 47.5 E(): 9.4e-06 Smith-Waterman score: 252; 27.599% identity (54.122% similar) in 279 aa overlap (335-607:88-331) 310 320 330 340 350 360 FLJ002 HPDLPVPLQELVPELFMTDFPARLFLENSKLEHSEDEGSVLGQGGSGTVIYRA--RYQGQ :.: . .::.: : : :: :..:. 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