# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -H -O./tmp/sj01277.fasta.huge -Q ../query/FLJ00179.ptfa ./tmplib.10216 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 FLJ00179, 194 aa vs ./tmplib.10216 library 2210800 residues in 2457 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.3933+/-0.00573; mu= -3.9033+/- 0.385 mean_var=222.2201+/-50.744, 0's: 0 Z-trim: 2 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.086036 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 36, opt: 24, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2457) KIAA0324 ( 2800 res) ee08846s1 (2800) 163 32.3 0.25 KIAA1844 ( 367 res) fj12009 ( 367) 141 28.8 0.38 KIAA0599 ( 697 res) hj03137 ( 697) 114 25.7 6.1 KIAA1138 ( 1239 res) hj05928 (1239) 118 26.4 6.6 FLJ00242 ( 804 res) sj07550 ( 804) 114 25.7 6.8 FLJ00252 ( 819 res) sj09394 ( 819) 114 25.8 6.9 FLJ00378 ( 855 res) sj00210 ( 855) 114 25.8 7.1 KIAA0763 ( 843 res) hk04726 ( 843) 113 25.6 7.7 KIAA1041 ( 642 res) fh02801 ( 642) 110 25.2 8.1 KIAA1768 ( 1207 res) ph00672(revised) (1207) 114 25.9 9.1 KIAA0755 ( 1093 res) hk04532 (1093) 113 25.7 9.2 KIAA1668 ( 791 res) fh11717 ( 791) 110 25.2 9.5 KIAA0662 ( 1114 res) hk01953s1 (1114) 112 25.6 10 KIAA0490 ( 135 res) hh00727 ( 135) 94 22.6 10 KIAA0029 ( 974 res) ha00566 ( 974) 108 25.1 13 KIAA2035 ( 1135 res) ff09201 (1135) 109 25.3 13 FLJ00260 ( 922 res) sh05833 ( 922) 107 24.9 14 KIAA0257 ( 1805 res) ha07065 (1805) 112 25.8 14 KIAA0720 ( 1091 res) hk01741s1 (1091) 107 25.0 15 KIAA0418 ( 989 res) hh00988 ( 989) 106 24.8 16 KIAA0553 ( 1450 res) pf08859 (1450) 109 25.4 16 KIAA0339 ( 1709 res) hg01304(revised) (1709) 110 25.6 17 KIAA1788 ( 413 res) fh22801 ( 413) 98 23.5 17 KIAA1743 ( 1036 res) pj01380s1 (1036) 105 24.7 18 KIAA0595 ( 1666 res) hj02929s1 (1666) 108 25.3 19 KIAA1663 ( 347 res) hk01115 ( 347) 94 22.9 21 FLJ00094 ( 376 res) as00094 ( 376) 94 23.0 22 KIAA1535 ( 711 res) fk12792 ( 711) 99 23.8 23 FLJ00084 ( 641 res) as00084 ( 641) 98 23.7 23 KIAA1359 ( 517 res) fj02042 ( 517) 96 23.3 23 KIAA0551 ( 1385 res) hh00867s1 (1385) 104 24.7 24 KIAA2016 ( 1715 res) pf04366 (1715) 105 24.9 25 FLJ00018 ( 1430 res) as00018 (1430) 103 24.6 26 KIAA1029 ( 1015 res) fh00363 (1015) 100 24.1 27 KIAA1909 ( 1287 res) ff10210 (1287) 101 24.3 29 KIAA1545 ( 968 res) fj14026s1 ( 968) 98 23.8 31 KIAA1212 ( 802 res) fh00638s1 ( 802) 96 23.5 32 KIAA1172 ( 929 res) hj03919(revised) ( 929) 97 23.7 32 KIAA0546 ( 1919 res) ef04555 (1919) 103 24.7 33 KIAA0045 ( 2005 res) ha00941 (2005) 103 24.8 34 KIAA0630 ( 490 res) hh01735 ( 490) 91 22.7 34 KIAA0660 ( 490 res) hk01902 ( 490) 91 22.7 34 KIAA1689 ( 2627 res) bg00184s4 (2627) 105 25.1 34 KIAA1816 ( 1162 res) fh16716 (1162) 98 23.9 35 KIAA0256 ( 1065 res) eg00512 (1065) 97 23.8 36 KIAA1957 ( 481 res) fk12643 ( 481) 90 22.6 37 FLJ00169 ( 432 res) sh07709 ( 432) 89 22.4 37 KIAA1202 ( 1502 res) fg03353 (1502) 99 24.1 38 KIAA0603 ( 1348 res) hg01488b (1348) 98 24.0 39 KIAA1858 ( 2469 res) ae00147 (2469) 103 24.8 39 >>KIAA0324 ( 2800 res) ee08846s1 (2800 aa) initn: 187 init1: 125 opt: 163 Z-score: 117.3 bits: 32.3 E(): 0.25 Smith-Waterman score: 163; 32.117% identity (61.314% similar) in 137 aa overlap (4-136:2602-2733) 10 20 FLJ001 GGGTSSGGSSTNSLTGSRP--PK-ARPTILS-S .:::.::..: .: : :. : . : . 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FLJ003 QPALAQEESEERGGQREGEGEEKLSLEAHAGSPSLKTPDGPVPGPGPQGAAPEPLGASVQ 360 370 380 390 400 410 40 50 60 70 80 90 FLJ001 EEPDQNLSSPEEVFHSGHSRNSSYASQQSKISGYSTEHSRSSSLSDLTHRRNTSTSSSAS .. :. : ... ...: :. : . . : ..:.: . . :: FLJ003 RDSAQGRPCPPPQAPANQPEGASSAAPGSPVPAPPT---KASALPVEQGPAEPIPPGVAS 420 430 440 450 460 100 110 120 130 140 150 FLJ001 GGLGMTVEGPEGSEREHRPPEKPPRPPRPLHLSDRSFRRKKDSVESHPTWVDDTRIDADA ::: . :: . :. :..::.::: FLJ003 GGLRPDALGPTTA---HHGPRHPPKPPRSKATERPGQEPEGPGATPAGERDDQSPDSVPE 470 480 490 500 510 520 >>KIAA0763 ( 843 res) hk04726 (843 aa) initn: 69 init1: 69 opt: 113 Z-score: 90.5 bits: 25.6 E(): 7.7 Smith-Waterman score: 113; 27.523% identity (56.881% similar) in 109 aa overlap (73-172:269-374) 50 60 70 80 90 FLJ001 EEVFHSGHSRNSSYASQQSKISGYSTEHSRSSSLSDLTHR----RNTSTSSSASGGLGMT : .::: ..: :... : .: : KIAA07 CRSTPSLERQEQRLRVEHLPLLTIEPPSDSSVDLSDRSERGSLKRQSAYERSLGGQQGSP 240 250 260 270 280 290 100 110 120 130 140 150 FLJ001 VEGPEGSEREHRPPEKP---PRPPRPL--HLSDRSFRRKKDSVESHPTWVDDTRIDADAI .::... . : :.: ::::::: ::. . .... :: . :. :.. . 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KIAA17 QPALAQEESEERGGQREGEGEEKLSLEAHAGSPSLKTPDGPVPGPGPQGAAPEPLGASVQ 700 710 720 730 740 750 40 50 60 70 80 90 FLJ001 EEPDQNLSSPEEVFHSGHSRNSSYASQQSKISGYSTEHSRSSSLSDLTHRRNTSTSSSAS .. :. : ... ...: :. : . . : ..:.: . . :: KIAA17 RDSAQGRPCPPPQAPANQPEGASSAAPGSPVPAPPT---KASALPVEQGPAEPIPPGVAS 760 770 780 790 800 100 110 120 130 140 150 FLJ001 GGLGMTVEGPEGSEREHRPPEKPPRPPRPLHLSDRSFRRKKDSVESHPTWVDDTRIDADA ::: . :: . :. :..::.::: KIAA17 GGLRPDALGPTTA---HHGPRHPPKPPRSKATERPGQEPEGPGATPAGERDDQSPDSVPE 810 820 830 840 850 860 194 residues in 1 query sequences 2210800 residues in 2457 library sequences Tcomplib [34.26] (2 proc) start: Fri Feb 27 10:44:02 2009 done: Fri Feb 27 10:44:02 2009 Total Scan time: 0.370 Total Display time: 0.040 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]