# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -H -O./tmp/sj01856.fasta.huge -Q ../query/FLJ00185.ptfa ./tmplib.10216 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 FLJ00185, 824 aa vs ./tmplib.10216 library 2210170 residues in 2457 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.3560+/-0.00788; mu= 0.6114+/- 0.526 mean_var=517.8803+/-119.068, 0's: 0 Z-trim: 9 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.056359 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2457) FLJ00371 ( 625 res) sh06716 ( 625) 4066 345.5 1.3e-95 KIAA1308 ( 745 res) fh08652 ( 745) 3555 304.0 4.5e-83 KIAA0959 ( 820 res) hj05718 ( 820) 1432 131.5 4.4e-31 FLJ00153 ( 497 res) sh06127 ( 497) 974 93.9 5.5e-20 KIAA0351 ( 590 res) hg01609 ( 590) 299 39.1 0.002 KIAA0313 ( 1508 res) hg00186 (1508) 236 34.6 0.11 FLJ00160 ( 1696 res) sh06621 (1696) 235 34.6 0.13 KIAA1681 ( 1236 res) fh23697 (1236) 202 31.7 0.69 KIAA0269 ( 567 res) ha06751 ( 567) 193 30.5 0.76 KIAA0309 ( 3053 res) hg00096s1 (3053) 206 32.7 0.89 KIAA0846 ( 691 res) hk05386 ( 691) 188 30.2 1.1 KIAA1760 ( 2219 res) af00030 (2219) 198 31.8 1.2 KIAA1802 ( 821 res) fj21631 ( 821) 183 29.9 1.6 KIAA1139 ( 1124 res) hk00330 (1124) 184 30.2 1.8 KIAA1343 ( 520 res) fj00420 ( 520) 173 28.8 2.3 KIAA1071 ( 675 res) hj05664s2 ( 675) 174 29.1 2.4 FLJ00084 ( 641 res) as00084 ( 641) 172 28.9 2.7 KIAA0339 ( 1709 res) hg01304(revised) (1709) 181 30.3 2.7 KIAA0458 ( 1552 res) ef01252 (1552) 180 30.1 2.7 KIAA1471 ( 1421 res) fj02383s1 (1421) 178 29.9 2.9 KIAA0754 ( 1174 res) hh06485 (1174) 176 29.6 2.9 KIAA1072 ( 759 res) hj06360 ( 759) 171 28.9 3.1 KIAA0886 ( 1233 res) hk07722 (1233) 174 29.5 3.4 FLJ00353 ( 1766 res) sh01144 (1766) 176 29.9 3.6 KIAA1297 ( 2242 res) fg03883 (2242) 177 30.1 3.9 KIAA1902 ( 1112 res) hj04383 (1112) 170 29.1 4 KIAA1096 ( 1919 res) pf00402 (1919) 175 29.9 4 KIAA0613 ( 734 res) hg01088b ( 734) 165 28.4 4.2 KIAA0845 ( 1034 res) hk05234s1 (1034) 168 28.9 4.3 KIAA1375 ( 546 res) fj04426 ( 546) 162 27.9 4.3 KIAA1076 ( 804 res) hj06779 ( 804) 164 28.4 4.7 KIAA1522 ( 1044 res) fh14706(revised) (1044) 166 28.7 4.8 KIAA1623 ( 1236 res) fj04650 (1236) 167 28.9 5 KIAA1205 ( 1217 res) fg03511a (1217) 163 28.6 6.2 KIAA0277 ( 583 res) ha06833 ( 583) 155 27.4 6.6 KIAA0927 ( 1001 res) hg03734 (1001) 158 28.0 7.4 KIAA0304 ( 2415 res) af07172 (2415) 166 29.3 7.5 KIAA1779 ( 1233 res) hg04229 (1233) 158 28.2 8.3 KIAA1306 ( 1154 res) fh05845 (1154) 157 28.0 8.4 KIAA0910 ( 1315 res) hg02207s1 (1315) 158 28.2 8.6 KIAA0867 ( 568 res) hk06783 ( 568) 150 27.0 8.6 KIAA0612 ( 1810 res) hg00654s1 (1810) 159 28.5 9.6 KIAA0991 ( 630 res) hk06065 ( 630) 149 27.0 9.6 KIAA0442 ( 1266 res) hh03913 (1266) 152 27.7 12 KIAA0495 ( 209 res) hg00106 ( 209) 133 24.9 13 FLJ00034 ( 1343 res) as00034 (1343) 150 27.6 14 KIAA2038 ( 917 res) pj01991 ( 917) 145 26.9 15 KIAA0306 ( 1451 res) hg00063 (1451) 148 27.5 16 KIAA0992 ( 772 res) hk07554 ( 772) 142 26.5 16 KIAA0940 ( 699 res) hh04894 ( 699) 141 26.4 16 >>FLJ00371 ( 625 res) sh06716 (625 aa) initn: 4066 init1: 4066 opt: 4066 Z-score: 1810.0 bits: 345.5 E(): 1.3e-95 Smith-Waterman score: 4066; 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KIAA09 REPPHFPCLQKLLDYLTRMMPGSDPERRAQNLLEQFQKQE-VETDN-------------- 220 230 240 250 270 280 290 300 310 320 FLJ001 LELALTPARAPSPVPAPAPEPEPAPTPAPGSELEVAPAPAPELQQAPEPAVGLESAPAPA :: .. . . KIAA09 ---------------------------------------------------GLPNTISFS 260 330 340 350 360 370 380 FLJ001 LELEPAPEQDPAPSQTLELEPAPAPVPSLQPSWPSPVVAENGLSEEKPHLLVFPPDLVAE :: : ::: .: : : . : ::::: KIAA09 LEEEE------------ELE--------------------GGESAE---FTCFSEDLVAE 270 280 290 390 400 410 420 430 440 FLJ001 QFTLMDAELFKKVVPYHCLGSIWSQRDKKGKEHLAPTIRATVTQFNSVANCVITTCLGNR :.: :::.:::::::.:::: :::.:::: ..:::::::::..:::....::..: ::.. KIAA09 QLTYMDAQLFKKVVPHHCLGCIWSRRDKKENKHLAPTIRATISQFNTLTKCVVSTILGGK 300 310 320 330 340 350 450 460 470 480 490 500 FLJ001 STKAPDRARVVEHWIEVARECRILKNFSSLYAILSALQSNSIHRLKKTWEDVSRDSFRIF :. .::...:.::..:.:::.::::::: ::.::::::::.:::::: : :: . .: KIAA09 ELKTQQRAKIIEKWINIAHECRLLKNFSSLRAIVSALQSNSIYRLKKTWAAVPRDRMLMF 360 370 380 390 400 410 510 520 530 540 550 FLJ001 QKLSEIFSDENNYSLSRELLIKEGTSKFATLEM----NPKRAQKR---PKETGIIQGTVP ..::.::::.::. :::::.::::::::.:. : ::.:.: :. :..::::: KIAA09 EELSDIFSDHNNHLTSRELLMKEGTSKFANLDSSVKENQKRTQRRLQLQKDMGVMQGTVP 420 430 440 450 460 470 560 570 580 590 600 610 FLJ001 YLGTFLTDLVMLDTAMKDYLYGRLINFEKRRKEFEVIAQIKLLQSACNNYSIAPDEQFGA :::::::::.:::::..::. : ::::::::.::::::::::::::::.: ..::..: KIAA09 YLGTFLTDLTMLDTALQDYIEGGLINFEKRRREFEVIAQIKLLQSACNSYCMTPDQKFIQ 480 490 500 510 520 530 620 630 640 650 660 670 FLJ001 WFRAVERLSETESYNLSCELEPPSESASNTLRTKKNTAIVKRWSDRQAPSTELSTSGSSH ::. . :.: ::: ::::.: ....... . .:. .::: : : .. : KIAA09 WFQRQQLLTEEESYALSCEIEAAADASTTSPKPRKS--MVKRLSLLFLGSDMIT----SP 540 550 560 570 580 680 690 700 710 720 730 FLJ001 SKSCDQLRCGPYLSSGDIADALSVHSAGSSSSDVEEINISFVPESPDGQEKKFWESASQS . . .: . :::. :..:: : :. :..:: .:. . ..:: .::. ::.:. 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FLJ001 ---GPVPYLGTFLTDLVMLDTALPDMLEGDLINFEKRRKEWEILARIQQLQRRCQSYTLS 220 230 240 250 260 270 610 620 630 640 650 660 FLJ001 PDEQFGAWFRAVERLSETESYNLSCELEPPSESASNTLRTKKNTAIVKRWSDRQAPSTEL : . : ..: ..:.: .:: :: .:::. : .. : .. ...:: : . : FLJ001 PHPPILAALHAQNQLTEEQSYRLSRVIEPPAASCPSSPRIRRRISLTKRLSAKLAREKSS 280 290 300 310 320 330 670 680 690 700 710 720 FLJ001 STSGSSHSKSCDQLRCGPYLSSGDIADALSVHSAGSSSSDVEEINISFVPESPDGQEKKF : ::: : :: .. : : :: : :: .. FLJ001 SPSGS------------P----GDPSSPTSSVSPGSP------------PSSPRSR---- 340 350 360 730 740 750 760 770 780 FLJ001 WESASQSSPETSGISSASSSTSSSSASTTPVAATRTHKRSVSGLCNSSSALPLYNQQVGD .. . : : . : .. :.. : .: : . : .: .:: :: .. FLJ001 -DAPAGSPPASPGPQGPSTKLPLSLDLPSP--------RPFA-LPLGSPRIPLPAQQSSE 370 380 390 400 410 790 800 810 820 FLJ001 CCIIRVSLDVDNGNMYKSILVSRRGWPGCLPPLAANAP :.::::.: :.::.:.:::.. FLJ001 ACVIRVSIDNDHGNLYRSILLTSQDKAPSVVRRALQKHNVPQPWACDYQLFQVLPGDRGW 420 430 440 450 460 470 >>KIAA0351 ( 590 res) hg01609 (590 aa) initn: 372 init1: 188 opt: 299 Z-score: 154.9 bits: 39.1 E(): 0.002 Smith-Waterman score: 412; 27.361% identity (55.448% similar) in 413 aa overlap (370-770:79-447) 340 350 360 370 380 390 FLJ001 EPAPAPVPSLQPSWPSPVVAENGLSEEKPHLLVFPPDLVAEQFTLMDAELFKKVVPYHCL .: :. : :.:::: .:: . : . KIAA03 ATPQGSSSSDSLEGQSCDYASKSYDAVVFDVLKVTPEEFASQITLMDIPVFKAIQPEELA 50 60 70 80 90 100 400 410 420 430 440 450 FLJ001 GSIWSQRDKKGKEHLAPTIRATVTQFNSVANCVITTCLGNRSTKAPDRARVVEHWIEVAR . :: :: :. :::.. : . .::.:. :. : .. : ::... :....:. 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KIAA03 RHRKSHSLGNNMMCQLSVVESKSATF----PSEKARHLLDDSVLESRSPRRGLALTSSSA 370 380 390 400 410 420 750 760 770 780 790 800 FLJ001 SSSSASTTPVAATRTHKRSVSGLCNSSSALPLYNQQVGDCCIIRVSLDVDNGNMYKSILV ... : ... .. ::: KIAA03 VTNGLSLGSSESSEFSEEMSSGLESPTGPCICSLGNSAAVPTMEGPLRRKTLLKEGRKPA 430 440 450 460 470 480 >>KIAA0313 ( 1508 res) hg00186 (1508 aa) initn: 248 init1: 140 opt: 236 Z-score: 123.3 bits: 34.6 E(): 0.11 Smith-Waterman score: 239; 24.436% identity (56.015% similar) in 266 aa overlap (359-623:711-945) 330 340 350 360 370 380 FLJ001 QDPAPSQTLELEPAPAPVPSLQPSWPSPVVAENGLSEEKPHLLVFPPDLVAEQFTLMDAE :.. : : . :: . :: :... . : KIAA03 LSKLADRIQLSGRYYLKNNMETETLCSDEDAQELLRESQISLLQLSTVEVATQLSMRNFE 690 700 710 720 730 740 390 400 410 420 430 440 FLJ001 LFKKVVPYHCLGSIWSQRDKKGKEHLAPTIRATVTQFNS-VANCVITTCLGNRSTKAPDR ::... : . . .... :.: . .: .. ...: . ::. .. : :. : KIAA03 LFRNIEPTEYIDDLFKLRSKTSCANLK-RFEEVINQETFWVASEIL------RETNQLKR 750 760 770 780 790 450 460 470 480 490 500 FLJ001 ARVVEHWIEVARECRILKNFSSLYAILSALQSNSIHRLKKTWEDVSRDSFRIFQKLSEIF ....:.:..: .:: :::.:..::.:.:. . ::. ::: . ..:: :...: KIAA03 MKIIKHFIKIALHCRECKNFNSMFAIISGLNLAPVARLRTTWEKLPNKYEKLFQDLQDLF 800 810 820 830 840 850 510 520 530 540 550 560 FLJ001 SDENNYSLSRELLIKEGTSKFATLEMNPKRAQKRPKETGIIQGTVPYLGTFLTDLVMLDT . :.. :..: ... ..: : .: . .. ::..: KIAA03 DPSRNMAKYRNVLNSQN--------LQP------P--------IIPLFPVIKKDLTFLHE 860 870 880 890 570 580 590 600 610 620 FLJ001 AMKDYLYGRLINFEKRRKEFEVIAQIKLLQSACNNYSIAPDEQFGAWFRAVERLSETESY . . . : :.:::: : . : .. . :. . .. . : :.. ::. 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KIAA03 TLSLGTGNPQGPFPTQTLSLTPASSLVPTPAQTLSLAPGPPLGPTQTLSLAPAPPLAPAS 1530 1540 1550 1560 1570 1580 370 380 390 400 410 420 FLJ001 GLSEEKPHLLVFPPDLVAEQFTLMDAELFKKVVPYHCLGSIWSQRDKKGKEHLAPTIRAT .. : :.. : KIAA03 PVGPAPAHTLTLAPASSSASLLAPASVQTLTLSPAPVPTLGPAAAQTLALAPASTQSPAS 1590 1600 1610 1620 1630 1640 824 residues in 1 query sequences 2210170 residues in 2457 library sequences Tcomplib [34.26] (2 proc) start: Fri Feb 27 10:44:07 2009 done: Fri Feb 27 10:44:08 2009 Total Scan time: 0.750 Total Display time: 0.250 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]