# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -H -O./tmp/sj02030.fasta.huge -Q ../query/FLJ00266.ptfa ./tmplib.10216 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 FLJ00266, 1544 aa vs ./tmplib.10216 library 2209450 residues in 2457 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.3038+/-0.00589; mu= 3.5142+/- 0.394 mean_var=241.3322+/-55.891, 0's: 0 Z-trim: 9 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.082559 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 41, opt: 29, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2457) KIAA1564 ( 2432 res) fh20840s1 (2432) 10476 1262.3 0 KIAA1335 ( 2041 res) bf00973 (2041) 4244 520.0 2.3e-147 KIAA1416 ( 1966 res) hh02957s1 (1966) 4017 492.9 3.1e-139 KIAA0308 ( 2759 res) ee00163 (2759) 3636 447.7 1.8e-125 KIAA0444 ( 978 res) hg00035 ( 978) 718 99.6 3.7e-21 KIAA0309 ( 3053 res) hg00096s1 (3053) 527 77.4 5.7e-14 KIAA1259 ( 1561 res) hh15706 (1561) 508 74.8 1.7e-13 KIAA1122 ( 1048 res) hj01698 (1048) 439 66.5 3.9e-11 KIAA0809 ( 1385 res) hk10195 (1385) 302 50.3 3.9e-06 KIAA1994 ( 1117 res) bh00052 (1117) 153 32.4 0.74 KIAA0828 ( 619 res) hh04230 ( 619) 141 30.7 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KIAA13 RAECFRVEKNLLIFGWGRWKDILTHGRFKWHLNEKDMEMICRALLVYCVKHYKGDEKIKS 420 430 440 450 460 470 470 480 490 500 510 520 FLJ002 FIWDLISPAENGKTKELQNHSGLSIPVPRGRKGKKVKSQSTF-DIHKADWIRKYNPDTLF :::.::.:...:... :::::::: ::::::::::.:.: . ... :::. ::.... KIAA13 FIWELITPTKDGQAQTLQNHSGLSAPVPRGRKGKKTKNQLLIPELKDADWLATCNPEVVL 480 490 500 510 520 530 530 540 550 560 570 580 FLJ002 QDESYKKHLKHQCNKVLLRVRMLYYLRQEVIGDQAEKVLGGAIASEIDIWFPVVDQLEVP .:..::::::..::::::::::::::. :..:. :::.. :. : :.:. .: .: .:.: KIAA13 HDDGYKKHLKQHCNKVLLRVRMLYYLKAEILGEAAEKAFEGSPARELDVPLPDIDYMEIP 540 550 560 570 580 590 590 600 610 620 630 640 FLJ002 TTWWDSEADKSLLIGVFKHGYEKYNTMRADPALCFLEKAGRPDDKAIAAEHRVLDNFSDI . :::.::::::::::::::::.::.::::::::::::.: ::.:...::. : :. ::: KIAA13 VDWWDAEADKSLLIGVFKHGYERYNAMRADPALCFLEKVGMPDEKSLSAEQGVTDGTSDI 600 610 620 630 640 650 650 660 670 680 690 700 FLJ002 VEGVDFDK-DCEDPEYKPLQGPPKDQDDEGDPLMMMDEEISVIDGDEAQVTQQPGHLFWP : . :: : . . :: ....: :: .. .. :. :: ..: . :: KIAA13 PERGNTDKEDNAEDKVDGLQKQTESSSDGGDGVFSEKKD----DSRAAQDGSDPDKSPWP 660 670 680 690 700 710 710 720 730 740 750 760 FLJ002 PGSALTARLRRLVTAYQRSYKREQMKIEAAERGDRRRRRCEAAFKLK---EIARREKQQR .::::::::::::.::: ..: . : :.. : :. .. .: :.: KIAA13 VSSALTARLRRLVTVYQRCNRKELCRPEILGPGNQGYWVQEEMFRRTSEMDLINKEAQKR 720 730 740 750 760 770 770 780 790 800 810 820 FLJ002 WTRREQTDFYRVVSTFGVEYDPDTMQFHWDRFRTFARLDKKTDESLTKYFHGFVAMCRQV ::::::.::::.::.::: :: . : : .:: ..:::::.:::: .::..::::::.: KIAA13 WTRREQADFYRTVSSFGVVYDQEKKTFDWTQFRIISRLDKKSDESLEQYFYSFVAMCRNV 780 790 800 810 820 830 830 840 850 860 870 880 FLJ002 CRLPPAAGDEPPDPNLFIEPITEERASRTLYRIELLRRLREQVLCHPLLEDRLALCQPPG :::: ::: ....::::::::.::::::::::..::::: : :..:: ::.: . KIAA13 CRLPTWKDGGPPDTTIYVEPITEERAARTLYRIELLRKVREQVLKCPQLHERLQLCRP-S 840 850 860 870 880 890 890 900 910 920 930 940 FLJ002 PELPKWWEPVRHDGELLRGAARHGVSQTDCNIMQDPDFSFLAARMNYMQNHQAGAPAPSL :: ::: .:: .:: :.:.::...::: ::.::..::: : :: :....:. ::. KIAA13 LYLPVWWECGKHDRDLLIGTAKHGLNRTDCYIMNDPQLSFLDAYRNYAQHKRSGTQAPGN 900 910 920 930 940 950 950 960 970 980 990 1000 FLJ002 SRCSTPLLHQQYTSRTASPLPLRPDAPVEKSPEETATQVPSLESLTLKLEHEVVARSRPT : . : : : : . : . .:. :: KIAA13 LCCLYQTNSKLYESLTYSQMS-RTSESLENEPENLVRVESRDDHLSLPDVTCENFISKVQ 960 970 980 990 1000 1010 1010 1020 1030 1040 1050 1060 FLJ002 PQDYEMRVSPSDTTPLVSRSVPPVKLEDEDDSDSELDLSKLSPSSSSSSSSSSSSSSTDE KIAA13 DVISINHDESLLPESLESMMYGKKVLSQEPSSFQESPSTNTESRKDVITISISKDGNCQS 1020 1030 1040 1050 1060 1070 >>KIAA1416 ( 1966 res) hh02957s1 (1966 aa) initn: 4866 init1: 2276 opt: 4017 Z-score: 2593.0 bits: 492.9 E(): 3.1e-139 Smith-Waterman score: 5023; 56.545% identity (74.022% similar) in 1482 aa overlap (1-1357:433-1895) 10 20 30 FLJ002 EKNLAPKQETIIEVELTNIQKKYYRAILEK :::::::.:::::::::::::::::::::: KIAA14 EFGDLKTEEQVQKLQAILKPMMLRRLKEDVEKNLAPKEETIIEVELTNIQKKYYRAILEK 410 420 430 440 450 460 40 50 60 70 80 90 FLJ002 NFSFLSKGAGHTNMPNLLNTMMELRKCCNHPYLINGAEEKILTEFREACHIIPHDFHLQA ::.:::::.:..:.:::::::::::::::::::::::::::: ::.:. . ::.::: KIAA14 NFTFLSKGGGQANVPNLLNTMMELRKCCNHPYLINGAEEKILEEFKETHNAESPDFQLQA 470 480 490 500 510 520 100 110 120 130 140 150 FLJ002 MVRSAGKLVLIDKLLPKLKAGGHKVLIFSQMVRCLDILEDYLIQRRYLYERIDGRVRGNL :...:::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::: :::::::::::: KIAA14 MIQAAGKLVLIDKLLPKLKAGGHRVLIFSQMVRCLDILEDYLIQRRYPYERIDGRVRGNL 530 540 550 560 570 580 160 170 180 190 200 210 FLJ002 RQAAIDRFSKPDSDRFVFLLCTRAGGLGINLTAADTCIIFDSDWNPQNDLQAQARCHRIG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: KIAA14 RQAAIDRFSKPDSDRFVFLLCTRAGGLGINLTAADTCIIFDSDWNPQNDLQAQARCHRIG 590 600 610 620 630 640 220 230 240 250 260 270 FLJ002 QSKAVKVYRLITRNSYEREMFDKASLKLGLDKAVLQSMSGRDGNITGIQQFSKKEIEDLL :::.::.::::::::::::::::::::::::::::::::::.. .:.::.::::::::: KIAA14 QSKSVKIYRLITRNSYEREMFDKASLKLGLDKAVLQSMSGRENATNGVQQLSKKEIEDLL 650 660 670 680 690 700 280 290 300 310 320 330 FLJ002 RKGAYAAIMEEDDEGSKFCEEDIDQILLRRTTTITIESEGKGSTFAKASFVASENRTDIS :::::.:.:.:.::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::: :::::: KIAA14 RKGAYGALMDEEDEGSKFCEEDIDQILLRRTHTITIESEGKGSTFAKASFVASGNRTDIS 710 720 730 740 750 760 340 350 360 370 380 390 FLJ002 LDDPNFWQKWAKKADLDMDLLNSKNNLVIDTPRVRKQTRHFSTLKDDDLVEFSDLESEDD ::::::::::::::.::.: ::..::::::::::::::: .:..:.:.:.:::::::... KIAA14 LDDPNFWQKWAKKAELDIDALNGRNNLVIDTPRVRKQTRLYSAVKEDELMEFSDLESDSE 770 780 790 800 810 820 400 410 420 430 440 FLJ002 ERP--RSRR-HDRHHAYGRTDCFRVEKHLLVYGWGRWRDILSHGRFKRRMTERDVETICR :.: . :: .:. ..:.:..::::::.::::::::: :::::::.::..::.::::::: KIAA14 EKPCAKPRRPQDKSQGYARSECFRVEKNLLVYGWGRWTDILSHGRYKRQLTEQDVETICR 830 840 850 860 870 880 450 460 470 480 490 500 FLJ002 AILVYCLLHYRGDENIKGFIWDLISPAENGKTKELQNHSGLSIPVPRGRKGKKVKSQSTF .:::::: ::.::::::.::::::.:. .:.:. : :::::: ::::::::::::.::: KIAA14 TILVYCLNHYKGDENIKSFIWDLITPTADGQTRALVNHSGLSAPVPRGRKGKKVKAQSTQ 890 900 910 920 930 940 510 520 530 540 550 560 FLJ002 DI-HKADWIRKYNPDTLFQDESYKKHLKHQCNKVLLRVRMLYYLRQEVIGDQAEKVLGGA . . :::. . :::.:::..::::::::.:::::::::::::::::::::::.:.: :: KIAA14 PVVQDADWLASCNPDALFQEDSYKKHLKHHCNKVLLRVRMLYYLRQEVIGDQADKILEGA 950 960 970 980 990 1000 570 580 590 600 610 620 FLJ002 IASEIDIWFPVVDQLEVPTTWWDSEADKSLLIGVFKHGYEKYNTMRADPALCFLEKAGRP .:: :.:.: . :::. :::.:::::::::::::::::::.:::::::::::..: : KIAA14 DSSEADVWIPEPFHAEVPADWWDKEADKSLLIGVFKHGYEKYNSMRADPALCFLERVGMP 1010 1020 1030 1040 1050 1060 630 640 650 660 670 680 FLJ002 DDKAIAAEHRVLDNFSDIVEGVDFDKDCEDPEYKPLQGPPKDQDDE--GDPLMMMDEEIS : ::::::.: : ..: .: .::.. ::::::: . : ::. :: ..: .: . KIAA14 DAKAIAAEQRGTDMLADGGDGGEFDREDEDPEYKPTRTPFKDEIDEFANSPSEDKEESME 1070 1080 1090 1100 1110 1120 690 700 710 720 730 740 FLJ002 V-IDGDEAQVTQQPGHLFWPPGSALTARLRRLVTAYQRSYKREQMKIEAAERGDRRRRRC . : ... . . :.:.:: :.::.:::::.:::::::::.::. :: . :::::: KIAA14 IHATGKHSESNAELGQLYWPNTSTLTTRLRRLITAYQRSYKRQQMRQEALMKTDRRRRRP 1130 1140 1150 1160 1170 1180 750 760 770 780 790 FLJ002 EAAFKLKEIARR----EKQQRWTRREQTDFYRVVSTFGVEYDPDTMQFHWDRFRTFARLD . . : :. ::.:.:::::..::::::::::: .:: .:: :..::.::::: KIAA14 REEVRALEAEREAIISEKRQKWTRREEADFYRVVSTFGVIFDPVKQQFDWNQFRAFARLD 1190 1200 1210 1220 1230 1240 800 810 820 830 840 850 FLJ002 KKTDESLTKYFHGFVAMCRQVCRLPPAAGDEPPDPNLFIEPITEERASRTLYRIELLRRL ::.:::: ::: ::::::.:::.: ::::: . .::::::::::::::::::::.. KIAA14 KKSDESLEKYFSCFVAMCRRVCRMPVKPDDEPPDLSSIIEPITEERASRTLYRIELLRKI 1250 1260 1270 1280 1290 1300 860 870 880 890 900 910 FLJ002 REQVLCHPLLEDRLALCQPPGPELPKWWEPVRHDGELLRGAARHGVSQTDCNIMQDPDFS ::::: :: : .:: :::: . .::.::: ::: .:: :::.::::.:: .:..::..: KIAA14 REQVLHHPQLGERLKLCQP-SLDLPEWWECGRHDRDLLVGAAKHGVSRTDYHILNDPELS 1310 1320 1330 1340 1350 1360 920 930 940 950 960 970 FLJ002 FLAARMNYMQNHQAGAPAPSLSRCSTPLLHQQYTSRTASPLPLRPDAPVEKSPEETATQV :: :. :. ::. :: . ::. .. ... . .: : .: . :: . . KIAA14 FLDAHKNFAQNRGAGNTS-SLNPLAVGFVQTPPVISSAHIQDERVLEQAEGKVEEPENPA 1370 1380 1390 1400 1410 1420 980 990 1000 1010 1020 1030 FLJ002 PSLESLTLKLEHEVVARSRPTPQDYEMRVSPSDTTPLVSRSVPPVKLEDEDDSDSELDLS . . . :.:. . .. . :. : ..: :. . :.. . : : .: KIAA14 AKEKCEGKEEEEETDGSGKESKQECEAEASS------VKNELKGVEVGADTGSKS---IS 1430 1440 1450 1460 1470 1040 1050 1060 1070 1080 1090 FLJ002 KLSPSSSSSSSSSSSSSSTDESEDEKEEKLTDQSRSKLYDEESLLSLTM----SQDGFPN . ..: . . . :.::. .. . ::.: .:::: :.. ..::: KIAA14 E----KGSEEDEEEKLEDDDKSEESSQPEAGAVSRGKNFDEESNASMSTARDETRDGFYM 1480 1490 1500 1510 1520 1100 1110 1120 1130 1140 1150 FLJ002 EDGEQMTPELLLLQERQRA-SEWPKDRVLINRIDLVCQAVLSGKWPSSRRSQEMVTGGIL :::. . .: :.:: : : ::::::.:::.: .:.:::.:::: .::.. : : KIAA14 EDGDPSVAQL--LHERTFAFSFWPKDRVMINRLDNICEAVLKGKWPVNRRQMFDFQGLIP 1530 1540 1550 1560 1570 1580 1160 1170 1180 FLJ002 GPGNHLLDSP---------------SLTPGE-YGDSP-----------VPTPR------- : .::: :.. .: :: :: : KIAA14 GYTPTTVDSPLQKRSFAELSMVGQASISGSEDITTSPQLSKEDALNLSVPRQRRRRRRKI 1590 1600 1610 1620 1630 1640 1190 1200 1210 FLJ002 ---SSSAA---SMAE-----EEASAVS------------------TAAAQFTKLRRGMDE . :: .. : .:...:: .....:..: . KIAA14 EIEAERAAKRRNLMEMVAQLRESQVVSENGQEKVVDLSKASREATSSTSNFSSLSSKFIL 1650 1660 1670 1680 1690 1700 1220 1230 1240 1250 1260 FLJ002 KEFTVQIKD---------EEGLKLTFQKHKLMANGVMGDGHPLFHKKKGNRKKLVELEVE . .. ..: . ::. : .: : :: . ::.: .....: ::.. :.. KIAA14 PNVSTPVSDAFKTQMELLQAGLSRTPTRHLL--NGSLVDGEPPMKRRRGRRKNVEGLDLL 1710 1720 1730 1740 1750 1760 1270 1280 1290 FLJ002 CM------------------EE----------PNHLDVDLETRIPVINKVDGTLLVGEDA : :: :. ..: .::::::: ::: :::::: KIAA14 FMSHKRTSLSAEDAEVTKAFEEDIETPPTRNIPSPGQLDPDTRIPVINLEDGTRLVGEDA 1770 1780 1790 1800 1810 1820 1300 1310 1320 1330 1340 FLJ002 PRRAELEMWLQGHPEFAVD-PRFLAYMED-------RRKQKWQRCKKNNKAELNCL-GME :. .: ::. :: ..:: : .. : . ::: .::.. :: ..: : : : KIAA14 PKNKDLVEWLKLHPTYTVDMPSYVPKNADVLFSSFQKPKQKRHRCRNPNKLDINTLTGEE 1830 1840 1850 1860 1870 1880 1350 1360 1370 1380 1390 1400 FLJ002 PVQTANSRNGKKGHHTETVFNRVLPGPIAPESSKKRARRMRPDLSKMMALMQGGSTGSLS : ..:.::::: KIAA14 RVPVVNKRNGKKMGGAMAPPMKDLPRWLEENPEFAVAPDWTDIVKQSGFVPESMFDRLLT 1890 1900 1910 1920 1930 1940 >>KIAA0308 ( 2759 res) ee00163 (2759 aa) initn: 3859 init1: 2803 opt: 3636 Z-score: 2345.9 bits: 447.7 E(): 1.8e-125 Smith-Waterman score: 5081; 53.248% identity (72.181% similar) in 1632 aa overlap (1-1445:964-2562) 10 20 30 FLJ002 EKNLAPKQETIIEVELTNIQKKYYRAILEK ::.::::.:::::::::::::::::::::: KIAA03 EFGDLKTEEQVQKLQAILKPMMLRRLKEDVEKKLAPKEETIIEVELTNIQKKYYRAILEK 940 950 960 970 980 990 40 50 60 70 80 90 FLJ002 NFSFLSKGAGHTNMPNLLNTMMELRKCCNHPYLINGAEEKILTEFREACHIIPHDFHLQA ::::::::::.::.:::.::::::::::::::::.::::::: :::.. . :::::: KIAA03 NFSFLSKGAGQTNVPNLVNTMMELRKCCNHPYLIKGAEEKILGEFRDTYNPAASDFHLQA 1000 1010 1020 1030 1040 1050 100 110 120 130 140 150 FLJ002 MVRSAGKLVLIDKLLPKLKAGGHKVLIFSQMVRCLDILEDYLIQRRYLYERIDGRVRGNL :..::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::..::::::::::::::: KIAA03 MIQSAGKLVLIDKLLPKMKAGGHKVLIFSQMVRCLDILEDYLIHKRYLYERIDGRVRGNL 1060 1070 1080 1090 1100 1110 160 170 180 190 200 210 FLJ002 RQAAIDRFSKPDSDRFVFLLCTRAGGLGINLTAADTCIIFDSDWNPQNDLQAQARCHRIG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: KIAA03 RQAAIDRFSKPDSDRFVFLLCTRAGGLGINLTAADTCIIFDSDWNPQNDLQAQARCHRIG 1120 1130 1140 1150 1160 1170 220 230 240 250 260 270 FLJ002 QSKAVKVYRLITRNSYEREMFDKASLKLGLDKAVLQSMSGRDGNITGIQQFSKKEIEDLL :.::::::::.:::::::::::.::::::::::::::::::..:. ::::.::::::::: KIAA03 QNKAVKVYRLVTRNSYEREMFDRASLKLGLDKAVLQSMSGRESNVGGIQQLSKKEIEDLL 1180 1190 1200 1210 1220 1230 280 290 300 310 320 330 FLJ002 RKGAYAAIMEEDDEGSKFCEEDIDQILLRRTTTITIESEGKGSTFAKASFVASENRTDIS :.:::.:::::.::::::::::::::::::: ::::::::.:::::::::::: :::::: KIAA03 RRGAYGAIMEEEDEGSKFCEEDIDQILLRRTKTITIESEGRGSTFAKASFVASGNRTDIS 1240 1250 1260 1270 1280 1290 340 350 360 370 380 390 FLJ002 LDDPNFWQKWAKKADLDMDLLNSKNNLVIDTPRVRKQTRHFSTLKDDDLVEFSDLESEDD ::::::::::::::..:.. ....:.:::::::.::::: ::. ::. :.:.:. ::: : KIAA03 LDDPNFWQKWAKKAEIDIEAISGRNSLVIDTPRIRKQTRPFSATKDE-LAELSEAESEGD 1300 1310 1320 1330 1340 1350 400 410 420 430 440 FLJ002 ERPRSRRH-DRHHAYGRTDCFRVEKHLLVYGWGRWRDILSHGRFKRRMTERDVETICRAI :.:. :: :: ..::::.::::::.::::::::::.:::::::::...:.::: ::::. KIAA03 EKPKLRRPCDRSNGYGRTECFRVEKNLLVYGWGRWREILSHGRFKRQLNEHDVEIICRAL 1360 1370 1380 1390 1400 1410 450 460 470 480 490 500 FLJ002 LVYCLLHYRGDENIKGFIWDLISPAENGKTKELQNHSGLSIPVPRGRKGKKVKSQ-STFD :.:::.::::::.:::::::::.:.:.:.:.::::: ::: ::::::::::::.: :.:: KIAA03 LAYCLVHYRGDEKIKGFIWDLITPTEDGQTRELQNHLGLSAPVPRGRKGKKVKTQTSSFD 1420 1430 1440 1450 1460 1470 510 520 530 540 550 560 FLJ002 IHKADWIRKYNPDTLFQDESYKKHLKHQCNKVLLRVRMLYYLRQEVIGDQAEKVLGGAIA :.::.:.:::::. :.:::.::::.::.::::::::::::::.:::::.. .::. :. : KIAA03 IQKAEWLRKYNPEQLLQDEGYKKHIKHHCNKVLLRVRMLYYLKQEVIGNECQKVFDGVDA 1480 1490 1500 1510 1520 1530 570 580 590 600 610 620 FLJ002 SEIDIWFPVVDQLEVPTTWWDSEADKSLLIGVFKHGYEKYNTMRADPALCFLEKAGRPDD :.::.: : :. :::. ::: .:::::::::::::::::::.::::::::::..:.::. KIAA03 SDIDVWVPEPDHSEVPAEWWDFDADKSLLIGVFKHGYEKYNTIRADPALCFLERVGKPDE 1540 1550 1560 1570 1580 1590 630 640 650 660 670 680 FLJ002 KAIAAEHRVLDNFSDIVEGVDFDKDCEDPEYKPLQGPPKD--QDDEGDP--LMMMDEEIS ::.:::.:. .: ..: : ::::::: . :: .:: ..: :.. : . . KIAA03 KAVAAEQRA----NDYMDG-----DVEDPEYKPAPAIFKDDIEDDVSSPGDLVIADGDGQ 1600 1610 1620 1630 1640 690 700 710 720 730 740 FLJ002 VIDGDEAQVTQQPGHLFWPPGSALTARLRRLVTAYQRSYKREQMK-IE---AAERGDRRR ...::. ..:: ::::.:::::.:::::. : .:.. :. .. . . KIAA03 LMEGDK---------VYWPTQSALTTRLRRLITAYQRTNKNRQIQQIQPTFSVPTSVMQP 1650 1660 1670 1680 1690 750 760 770 780 790 800 FLJ002 RRCEAAFKLKEIARREKQQRWTRREQTDFYRVVSTFGVEYDPDTMQFHWDRFRTFARLDK ::... : :. :.::::::::..::::::::::: .::: :: : .::..::: : KIAA03 IYEEATLNPKMAAKIERQQRWTRREEADFYRVVSTFGVVFDPDRGQFDWTKFRAMARLHK 1700 1710 1720 1730 1740 1750 810 820 830 840 850 860 FLJ002 KTDESLTKYFHGFVAMCRQVCRLPPAAGDEPPDPNLFIEPITEERASRTLYRIELLRRLR :::.:: ::...:..:::.::::: . .: :::.::.::::::::::::::::::..: KIAA03 KTDDSLEKYLYAFMSMCRRVCRLP--SKEELVDPNIFIQPITEERASRTLYRIELLRKVR 1760 1770 1780 1790 1800 1810 870 880 890 900 910 920 FLJ002 EQVLCHPLLEDRLALCQPPGPELPKWWEPVRHDGELLRGAARHGVSQTDCNIMQDPDFSF ::.: :: : .:: ::.: .:.:: ::: :: .:: :::.::::.:: .:..::..:: KIAA03 EQALRHPQLFERLKLCHP-NPDLPVWWECGPHDRDLLIGAAKHGVSRTDYHILRDPELSF 1820 1830 1840 1850 1860 1870 930 940 950 960 FLJ002 LAARMNYMQNHQAGAPAPSLSRCSTPLLHQQYTSRTASPLPLRP---DAP---------- .::. :: :...: :: :::::.: .. .:::: : :: KIAA03 MAAQRNYSQSKMAH------SRTSTPLLQQYQVALSASPLTSLPRLLDAKGIILEEMKVK 1880 1890 1900 1910 1920 970 980 990 1000 1010 FLJ002 ---VEKSPEETATQ-VPSLESLTLKLEHEVVARSRPTPQ-----------DYEMRVSPSD ... :. . . . :.:. :: . : .. :: . . :. . KIAA03 SENLKEEPQSSEEESMSSVETRTLIKSEPVSPKNGVLPQATGDQKSGGKCETDRRMVAAR 1930 1940 1950 1960 1970 1980 1020 1030 1040 FLJ002 TTPLVSRSV---PPVKL---EDEDDSDSELDLSKLSP----------------------- : ::. . : :. :. .::::. . :. : KIAA03 TEPLTPNPASKKPRVHKRGSESSSDSDSDSERSSCSSRSSSSSSSSSCSHSRSGSSSSSS 1990 2000 2010 2020 2030 2040 1050 1060 1070 1080 1090 FLJ002 ----------SSSSSSSSSSSSSSTDESE-DEKEEKLTDQSRS--KLYDEESLLSLTMSQ :::.::::::::::..::. ::.: . .: . : :::::. ::. .: KIAA03 SSCSSASSSSSSSTSSSSSSSSSSSEESDSDEEEAQKRAESTTHMKAYDEESVASLSTTQ 2050 2060 2070 2080 2090 2100 1100 1110 1120 1130 1140 FLJ002 DGFPNEDGEQM---TPE-LLLLQ--ERQRASEWPKDRVLINRIDLVCQAVLSGKWPSSRR : ..:. :: ::: .:: :: ::::::.:::.: .::.::.:::::.:: KIAA03 D--ETQDSFQMNNGTPESAYILQGGYMLAASYWPKDRVMINRLDSICQTVLKGKWPSARR 2110 2120 2130 2140 2150 2160 1150 1160 1170 1180 1190 1200 FLJ002 SQEMVTGGILGPGNHLLDSPSLTPGEYGDSPVPTPRSSSAASMAEEEASAVSTAAAQFTK : . : . . ..:::::. . ::.. :::: .... .. .. . .. ..: KIAA03 SYDANTVASFYT-TKLLDSPG-AATEYSEPSVPTPPGAGVKEEHDQSTQMSKEGGLKLTF 2170 2180 2190 2200 2210 2220 1210 1220 1230 FLJ002 LRRGMDEK-------------EFTVQIKDEEGLKLT----FQKH----------KLMANG ..:. .: .. ..... .. . : : : : ::: KIAA03 QKQGLAQKRPFDGEDGALGQQQYLTRLRELQSASETSLVNFPKSIPVSGTSIQPTLGANG 2230 2240 2250 2260 2270 2280 1240 1250 1260 1270 FLJ002 VMGDGHPLFHKKKGNRKKLVELEVECMEE---PNHLDV---------------------- :. :..:. .:..: ::.. ... ... :::... KIAA03 VILDNQPIVKKRRGRRKNVEGVDIFFFNRNKPPNHVSLGLTSSQISTGINPALSYTQPQG 2290 2300 2310 2320 2330 2340 1280 1290 1300 1310 1320 FLJ002 --DLETRIPVINKVDGTLLVGEDAPRRAELEMWLQGHPEFAVD-----PRFLAYMEDRRK : :. .:::: ::: :.:.:::.: .:: ::. :: .. : :: . : : : KIAA03 IPDTESPVPVINLKDGTRLAGDDAPKRKDLEKWLKEHPGYVEDLGAFIPR-MQLHEGRPK 2350 2360 2370 2380 2390 2400 1330 1340 1350 FLJ002 QKWQRCKKNNKAELNCL-GMEPVQTANSRNGKK--------------------------- :: .::.. :: ..: : : : :: : ::..: KIAA03 QKRHRCRNPNKLDVNSLTGEERVQLINRRNARKVGGAFAPPLKDLCRFLKENSEYGVAPE 2410 2420 2430 2440 2450 2460 1360 1370 1380 1390 1400 FLJ002 --------GHHTETVFNRVLPGPIAPESSKKRARRMRPDLSKMMALMQGGSTGSLSLHNT : :....:.: ::.. : ..:.:: . ..: : ..:. :.: . KIAA03 WGDVVKQSGFLPESMYERILTGPVVREEVSRRGRRPKSGIAKATAAAAAASATSVSGNPL 2470 2480 2490 2500 2510 2520 1410 1420 1430 1440 1450 1460 FLJ002 FQHS---SSGLQSVSSLGHSSATSASLPFMPFVMG---GAPSSPHVDSSTMLHHHHHHPH . .. . : ....: .. . :: .:: : :: KIAA03 LANGLLPGVDLTTLQALQQNLQNLQSLQVTAGLMGMPTGLPSGGEAKNMAAMFPMLLSGM 2530 2540 2550 2560 2570 2580 1470 1480 1490 1500 1510 1520 FLJ002 PHHHHHHHPGLRAPGYPSSPVTTASGTTLRLPPLQPEEDDDEDEEDDDDLSQGYDSSERD KIAA03 AGLPNLLGMGGLLTKPTESGTEDKKGSDSKESEGKTERTESQSSENGGENSVSSSPSASS 2590 2600 2610 2620 2630 2640 >>KIAA0444 ( 978 res) hg00035 (978 aa) initn: 784 init1: 593 opt: 718 Z-score: 473.1 bits: 99.6 E(): 3.7e-21 Smith-Waterman score: 718; 48.163% identity (76.327% similar) in 245 aa overlap (43-285:2-231) 20 30 40 50 60 70 FLJ002 EVELTNIQKKYYRAILEKNFSFLSKGAGHTNMPNLLNTMMELRKCCNHPYLINGAEEKIL :. .::: ::.:.::::::::. : KIAA04 GNQVSLLNIMMDLKKCCNHPYLFPVAAV--- 10 20 80 90 100 110 120 130 FLJ002 TEFREACHIIPH-DFHLQAMVRSAGKLVLIDKLLPKLKAGGHKVLIFSQMVRCLDILEDY :: ..:. .. ...:.:.:::.:..:.: ::. ::.:::::::.. ::.:::. KIAA04 ----EA-PVLPNGSYDGSSLVKSSGKLMLLQKMLKKLRDEGHRVLIFSQMTKMLDLLEDF 30 40 50 60 70 80 140 150 160 170 180 190 FLJ002 LIQRRYLYERIDGRVRGNLRQAAIDRFSKPDSDRFVFLLCTRAGGLGINLTAADTCIIFD : . : :::::: . :.::: :::::. : ...: ::: ::::::::::..::: ::.: KIAA04 LEYEGYKYERIDGGITGGLRQEAIDRFNAPGAQQFCFLLSTRAGGLGINLATADTVIIYD 90 100 110 120 130 140 200 210 220 230 240 250 FLJ002 SDWNPQNDLQAQARCHRIGQSKAVKVYRLITRNSYEREMFDKASLKLGLDKAVLQ-SMSG :::::.::.:: .: :::::.: : .::..:: : :... . :. :. : . :.. .... KIAA04 SDWNPHNDIQAFSRAHRIGQNKKVMIYRFVTRASVEERITQVAKRKMMLTHLVVRPGLGS 150 160 170 180 190 200 260 270 280 290 300 310 FLJ002 RDGNITGIQQFSKKEIEDLLRKGAYAAIMEEDDEGSKFCEEDIDQILLRRTTTITIESEG ..:..: :.:..:.:. :. ....: :: KIAA04 KSGSMT------KQELDDILKFGT-EELFKDDVEGMMSQGQRPVTPIPDVQSSKGGNLAA 210 220 230 240 250 320 330 340 350 360 370 FLJ002 KGSTFAKASFVASENRTDISLDDPNFWQKWAKKADLDMDLLNSKNNLVIDTPRVRKQTRH KIAA04 SAKKKHGSTPPGDNKDVEDSSVIHYDDAAISKLLDRNQDATDDTELQNMNEYLSSFKVAQ 260 270 280 290 300 310 >>KIAA0309 ( 3053 res) hg00096s1 (3053 aa) initn: 550 init1: 277 opt: 527 Z-score: 344.1 bits: 77.4 E(): 5.7e-14 Smith-Waterman score: 530; 30.233% identity (59.948% similar) in 387 aa overlap (44-414:1803-2181) 20 30 40 50 60 70 FLJ002 VELTNIQKKYYRAILEKNFSFLSKGAGHTNMPNLLNTMMELRKCCNHPYLI---NGAEEK :: . :. : :.: . .:. KIAA03 TYTEAAHRAVLFPQQRLDQLSEIIERFIFVMPPVEAPPPSLHACHPPPWLAPRQAAFQEQ 1780 1790 1800 1810 1820 1830 80 90 100 110 120 FLJ002 ILTEF--------REACHIIPHDFHLQAMVRSAGKLVLIDKLLPKLKAGGHKVLIFSQMV . .:. : .:.. . :. . . ::: . :: .::: ::.::::.::. KIAA03 LASELWPRARPLHRIVCNMRTQFPDLRLIQYDCGKLQTLAVLLRQLKAEGHRVLIFTQMT 1840 1850 1860 1870 1880 1890 130 140 150 160 170 180 FLJ002 RCLDILEDYLIQRRYLYERIDGRVRGNLRQAAIDRFSKPDSDRFVFLLCTRAGGLGINLT : ::.::..: . .:: :.:: .: . ::: ..::. :. : :.: ::.::.:.::: KIAA03 RMLDVLEQFLTYHGHLYLRLDGSTRVEQRQALMERFNA-DKRIFCFILSTRSGGVGVNLT 1900 1910 1920 1930 1940 1950 190 200 210 220 230 240 FLJ002 AADTCIIFDSDWNPQNDLQAQARCHRIGQSKAVKVYRLITRNSYEREMFDKASLKLGLDK .::: ...:::::: : ::: :::::::.. :..::::.. . :.... ::. .: KIAA03 GADTVVFYDSDWNPTMDAQAQDRCHRIGQTRDVHIYRLISERTVEENILKKAN-----QK 1960 1970 1980 1990 2000 250 260 270 280 290 FLJ002 AVLQSMSGRDGNITG--IQQFSKKEIEDL-LRKGAYAAIMEEDDEGSKFCEEDIDQILLR .: .:. . ::.: ..: . .:. :. :.. . ... .: . .:: . KIAA03 RMLGDMAIEGGNFTTAYFKQQTIRELFDMPLEEPSSSSVPSAPEEEEETVASKQTHILEQ 2010 2020 2030 2040 2050 2060 300 310 320 330 340 350 FLJ002 RTTTITIESEGKGSTFAKASFVASENRTDISLDDP-NFWQKWAKKADLDMDLLNSKNNLV : . ...: ::: :: . . . : . .. .. . : .. ...... KIAA03 ALCRAEDEEDIRAATQAKAEQVAELAEFNENDGFPAGEGEEAGRPGAEDEEMSRAEQEIA 2070 2080 2090 2100 2110 2120 360 370 380 390 400 410 FLJ002 IDTPRVRKQTRHFSTLKDDDLVEFSDLE-SEDDERPRSRRHDRHHAYGRTDCFRVEKHLL . .. :. . . .: : : : .. .:. .. :.: .: . . ::. . KIAA03 ALVEQLTPIERYAMKFLEASLEEVSREELKQAEEQVEAARKDLDQA--KEEVFRLPQEEE 2130 2140 2150 2160 2170 2180 420 430 440 450 460 470 FLJ002 VYGWGRWRDILSHGRFKRRMTERDVETICRAILVYCLLHYRGDENIKGFIWDLISPAENG KIAA03 EGPGAGDESSCGTGGGTHRRSKKAKAPERPGTRVSERLRGARAETQGANHTPVISAHQTR 2190 2200 2210 2220 2230 2240 >>KIAA1259 ( 1561 res) hh15706 (1561 aa) initn: 534 init1: 298 opt: 508 Z-score: 335.4 bits: 74.8 E(): 1.7e-13 Smith-Waterman score: 508; 45.055% identity (72.527% similar) in 182 aa overlap (89-270:1099-1273) 60 70 80 90 100 110 FLJ002 NHPYLINGAEEKILTEFREACHIIPHDFHLQAMVRSAGKLVLIDKLLPKLKAGGHKVLIF .... ..::: .: :: .::. ::.:::. KIAA12 RRSQFFPEPAGGLWSIRPQNGWSFIRIPGKESLITDSGKLYALDVLLTRLKSQGHRVLIY 1070 1080 1090 1100 1110 1120 120 130 140 150 160 170 FLJ002 SQMVRCLDILEDYLIQRRYLYERIDGRVRGNLRQAAIDRFSKPDSDRFVFLLCTRAGGLG :::.: .:.::.:.. :.. : :.:: . . :. . : . .: ::::: ::::::: KIAA12 SQMTRMIDLLEEYMVYRKHTYMRLDGSSKISERRDMVADF-QNRNDIFVFLLSTRAGGLG 1130 1140 1150 1160 1170 1180 180 190 200 210 220 230 FLJ002 INLTAADTCIIFDSDWNPQNDLQAQARCHRIGQSKAVKVYRLITRNSYEREMFDKASLKL :::::::: :..:::::: : ::. : ::.::.: : ::::: ... :......:. KIAA12 INLTAADTVIFYDSDWNPTVDQQAMDRAHRLGQTKQVTVYRLICKGTIEERILQRAK--- 1190 1200 1210 1220 1230 1240 240 250 260 270 280 290 FLJ002 GLDKAVLQSMSGRDGNITGIQQFSKKEIEDLLRKGAYAAIMEEDDEGSKFCEEDIDQILL .:. .: : ::. . .. ::. .:: KIAA12 --EKSEIQRMVISGGNFKP-DTLKPKEVVSLLLDDEELEKKLRLRQEEKRQQEETNRVKE 1250 1260 1270 1280 1290 1300 300 310 320 330 340 350 FLJ002 RRTTTITIESEGKGSTFAKASFVASENRTDISLDDPNFWQKWAKKADLDMDLLNSKNNLV KIAA12 RKRKREKYAEKKKKEDELDGKRRKEGVNLVIPFVPSADNSNLSADGDDSFISVDSAMPSP 1310 1320 1330 1340 1350 1360 >>KIAA1122 ( 1048 res) hj01698 (1048 aa) initn: 436 init1: 265 opt: 439 Z-score: 293.2 bits: 66.5 E(): 3.9e-11 Smith-Waterman score: 447; 33.333% identity (61.111% similar) in 288 aa overlap (2-255:749-1034) 10 20 30 FLJ002 EKNLAPKQETIIEVELTNIQKKYYRAILEKN :.: ::.. : ... :.. : ..... KIAA11 EQSIYEKERIAHAKQIIKPFILRRVKEEVLKQLPPKKDRIELCAMSEKQEQLYLGLFNRL 720 730 740 750 760 770 40 50 60 70 80 FLJ002 FSFLSKGAGHTNMPNLLNTMMELRKCCNHPYL---INGAEE-KILTEF--REA--CHIIP . ... . . : .. :.::.::: ::: : ::. : .... .: :. : KIAA11 KKSINNLVTEKNT-EMCNVMMQLRKMANHPLLHRQYYTAEKLKEMSQLMLKEPTHCEANP 780 790 800 810 820 830 90 100 110 FLJ002 H----------DFHLQAMVRS----------------AGKLVLIDKLLPKLKAGGHKVLI ::.:... .. .::. .. .: .:: : .:.. KIAA11 DLIFEDMEVMTDFELHVLCKQYRHINNFQLDMDLILDSGKFRVLGCILSELKQKGDRVVL 840 850 860 870 880 890 120 130 140 150 160 170 FLJ002 FSQMVRCLDILEDYLIQRRYLYERIDGRVRGNLRQAAIDRFSKPDSDRFVFLLCTRAGGL :::.. ::::: : .... : :.::... . : ::.:. : : ::::: :.:::: KIAA11 FSQFTMMLDILEVLLKHHQHRYLRLDGKTQISERIHLIDEFNT-DMDIFVFLLSTKAGGL 900 910 920 930 940 950 180 190 200 210 220 230 FLJ002 GINLTAADTCIIFDSDWNPQNDLQAQARCHRIGQSKAVKVYRLITRNSYEREMFDKASLK :::::.:.. :. : : :: :: ::. ::::.::.: : : .::.... :. :. . : KIAA11 GINLTSANVVILHDIDCNPYNDKQAEDRCHRVGQTKEVLVIKLISQGTIEESMLKINQQK 960 970 980 990 1000 1010 240 250 260 270 280 290 FLJ002 LGLDKAVLQSMSGRDGNITGIQQFSKKEIEDLLRKGAYAAIMEEDDEGSKFCEEDIDQIL : :.. . : .:.. KIAA11 LKLEQDMTTVDEGDEGSMPADIATLLKTSMGL 1020 1030 1040 >>KIAA0809 ( 1385 res) hk10195 (1385 aa) initn: 341 init1: 241 opt: 302 Z-score: 203.5 bits: 50.3 E(): 3.9e-06 Smith-Waterman score: 336; 31.156% identity (62.312% similar) in 199 aa overlap (91-270:634-825) 70 80 90 100 110 120 FLJ002 PYLINGAEEKILTEFREACHIIPHDFHLQAMVRSAGKLVLIDKLLPKLKAGGHKVLIFSQ ..... :.::. .:. . : :.:.::: KIAA08 GVGFNPFQERGNNIVTYEWAKDLLTNYQTGVLENSPKMVLLFHLIEESVKLGDKILVFSQ 610 620 630 640 650 660 130 140 150 160 FLJ002 MVRCLDILEDYLIQR-----------------RYL-YERIDGRVRGNLRQAAIDRFSKPD . : ..:..: .: : . : :.:: . . :. :..:. :. KIAA08 SLSTLALIEEFLGKREVPCPPGTEGQGAQKWVRNISYFRLDGSTPAFERERLINQFNDPS 670 680 690 700 710 720 170 180 190 200 210 220 FLJ002 S-DRFVFLLCTRAGGLGINLTAADTCIIFDSDWNPQNDLQAQARCHRIGQSKAVKVYRLI . ..::: :::: ::.:: .:. ..::..::: .: :: : .: ::.: .:::. KIAA08 NLTTWLFLLSTRAGCLGVNLIGANRVVVFDASWNPCHDAQAVCRVYRYGQKKPCYIYRLV 730 740 750 760 770 780 230 240 250 260 270 280 FLJ002 TRNSYEREMFDKASLKLGLDKAVLQSMSGRDGNITGIQQFSKKEIEDLLRKGAYAAIMEE . . :....:. : :.. :..... . .:..::.:.:: KIAA08 ADYTLEKKIYDRQISKQGMSDRVVDDLNP-------MLNFTRKEVENLLHFVEKEPAPQV 790 800 810 820 830 290 300 310 320 330 340 FLJ002 DDEGSKFCEEDIDQILLRRTTTITIESEGKGSTFAKASFVASENRTDISLDDPNFWQKWA KIAA08 SLNVKGIKESVLQLACLKYPHLITKEPFEHESLLLNRKDHKLTKAEKKAAKKSYEEDKRT 840 850 860 870 880 890 >>KIAA1994 ( 1117 res) bh00052 (1117 aa) initn: 382 init1: 104 opt: 153 Z-score: 108.7 bits: 32.4 E(): 0.74 Smith-Waterman score: 153; 30.159% identity (51.587% similar) in 126 aa overlap (1389-1499:203-320) 1360 1370 1380 1390 1400 1410 FLJ002 HHTETVFNRVLPGPIAPESSKKRARRMRPDLSKMMALMQGGSTGSLSLHNTFQHSSSGLQ ::. : . ..: :.::.. . KIAA19 NSIAEDTESYDDLDESHTEDLSSSEILDVSLSRATDLGEPERSSSEETLNNFQEAET--P 180 190 200 210 220 230 1420 1430 1440 1450 1460 1470 FLJ002 SVSSLGHSSATSASLPFMP---FVMGGAPSSPHVDSSTMLHHHH--HHPHPHHHHHHHPG .. : .. . :: .: :..: . :: ::::: :: : .: ::::. KIAA19 GAVSPNQPHLPQPHLPHLPQQNVVINGN-AHPH-----HLHHHHQIHHGHHLQHGHHHPS 240 250 260 270 280 1480 1490 1500 1510 1520 FLJ002 LRA-------PGYPSSPVT---TASGTTLRLPPLQPEEDDDEDEEDDDDLSQGYDSSERD : : :::::. ...:.. . :. : KIAA19 HVAVASASITGGPPSSPVSRKLSTTGSSDSITPVAPTSAVSSSGSPASVMTNMRAPSTTG 290 300 310 320 330 340 1530 1540 FLJ002 FSLIDDPMMPANSDSSEDADD KIAA19 GIGINSVTGTSTVNNVNITAVGSFNPNVTSSILGNVNISTSNIPSAAGVSVGPGVTSGVN 350 360 370 380 390 400 1544 residues in 1 query sequences 2209450 residues in 2457 library sequences Tcomplib [34.26] (2 proc) start: Fri Feb 27 10:48:25 2009 done: Fri Feb 27 10:48:27 2009 Total Scan time: 1.020 Total Display time: 0.850 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]