# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -H -O./tmp/sj02957.fasta.huge -Q ../query/FLJ00195.ptfa ./tmplib.10216 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 FLJ00195, 639 aa vs ./tmplib.10216 library 2210355 residues in 2457 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9808+/-0.00567; mu= 15.5061+/- 0.382 mean_var=183.3787+/-40.304, 0's: 0 Z-trim: 9 B-trim: 154 in 1/39 Lambda= 0.094711 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2457) KIAA0239 ( 849 res) ha06313 ( 849) 3517 492.8 5.9e-140 KIAA0215 ( 857 res) ha02776 ( 857) 1794 257.4 4.4e-69 KIAA1807 ( 702 res) fk00712 ( 702) 1365 198.6 1.8e-51 KIAA1286 ( 1214 res) hh11961(revised) (1214) 629 98.4 4.5e-21 KIAA0876 ( 1119 res) hh03683 (1119) 403 67.5 8.5e-12 KIAA0780 ( 1100 res) hk05362 (1100) 374 63.5 1.3e-10 KIAA0677 ( 1073 res) hk02635 (1073) 372 63.2 1.6e-10 KIAA0783 ( 899 res) hk05408 ( 899) 366 62.3 2.5e-10 KIAA0304 ( 2415 res) af07172 (2415) 197 39.8 0.0039 KIAA0582 ( 760 res) fh15957 ( 760) 130 29.9 1.2 KIAA1542 ( 1654 res) hh03408 (1654) 132 30.7 1.5 KIAA0292 ( 1716 res) ha06353 (1716) 132 30.7 1.5 KIAA0913 ( 1881 res) fh07519s2 (1881) 130 30.5 1.9 KIAA1932 ( 795 res) fj14525 ( 795) 121 28.7 2.8 KIAA1187 ( 813 res) fk03027 ( 813) 112 27.5 6.6 KIAA0757 ( 534 res) hk04606 ( 534) 109 26.9 6.9 KIAA1086 ( 902 res) hj08218 ( 902) 110 27.3 8.5 KIAA1808 ( 539 res) fk00917 ( 539) 106 26.5 9.2 KIAA1668 ( 791 res) fh11717 ( 791) 108 27.0 9.5 KIAA1555 ( 2414 res) fh17482s2 (2414) 114 28.5 10 KIAA0990 ( 883 res) hk05454 ( 883) 107 26.9 11 FLJ00072 ( 204 res) as00072 ( 204) 98 24.8 11 KIAA1236 ( 1840 res) pg00641 (1840) 111 27.9 12 FLJ00011 ( 394 res) as00011 ( 394) 101 25.6 12 KIAA0969 ( 1091 res) hj06525 (1091) 106 26.9 14 KIAA1831 ( 663 res) hk00543 ( 663) 103 26.2 14 KIAA1639 ( 2584 res) af14886 (2584) 111 28.1 14 KIAA1113 ( 1131 res) hj06379(revised) (1131) 106 26.9 14 KIAA0701 ( 1354 res) hg01611s1 (1354) 107 27.2 14 KIAA2010 ( 920 res) fj14762 ( 920) 104 26.5 15 KIAA0427 ( 601 res) hh01382 ( 601) 101 25.8 16 KIAA1858 ( 2469 res) ae00147 (2469) 109 27.8 16 KIAA1139 ( 1124 res) hk00330 (1124) 104 26.6 17 KIAA1832 ( 694 res) fg02852(revised) ( 694) 101 25.9 17 KIAA1535 ( 711 res) fk12792 ( 711) 100 25.8 19 KIAA0593 ( 2005 res) hj02824s1 (2005) 105 27.1 21 KIAA1681 ( 1236 res) fh23697 (1236) 102 26.4 22 KIAA0268 ( 1193 res) ha07061 (1193) 101 26.3 23 KIAA1893 ( 800 res) fk04261 ( 800) 98 25.6 24 FLJ00386 ( 811 res) sj04204 ( 811) 98 25.6 25 KIAA0681 ( 538 res) hk02748 ( 538) 95 24.9 26 KIAA1310 ( 794 res) fh10589 ( 794) 97 25.5 27 KIAA1526 ( 963 res) fj04743(revised) ( 963) 98 25.7 27 FLJ00052 ( 368 res) as00052 ( 368) 92 24.3 28 KIAA1538 ( 1029 res) fg06773 (1029) 98 25.8 28 KIAA0527 ( 768 res) hg02246 ( 768) 96 25.3 29 FLJ00034 ( 1343 res) as00034 (1343) 99 26.1 30 FLJ00123 ( 255 res) sh00869 ( 255) 89 23.7 30 KIAA1354 ( 632 res) fj01502 ( 632) 94 24.9 31 KIAA1002 ( 962 res) hk09859 ( 962) 96 25.4 33 >>KIAA0239 ( 849 res) ha06313 (849 aa) initn: 3514 init1: 3514 opt: 3517 Z-score: 2605.9 bits: 492.8 E(): 5.9e-140 Smith-Waterman score: 3517; 90.625% identity (93.229% similar) in 576 aa overlap (25-594:4-576) 10 20 30 40 50 FLJ001 RHRLRSCGPTVPGGGRGAWDAAGPAASLAATPDGCA-PPALPRRPQELPASGASFPR--R : ::. .:. :: :: :.: . . . 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KIAA02 RVRNLCYMISRREKLKLSHNKIQEQIFGLQVQLLNQEIDAGLPLTNALENSLFYPPPRIT 520 530 540 550 560 570 620 630 FLJ001 GSKGSTEKKEKVKAGPDSVLGQLGE KIAA02 LKLKMPKSTPEDHRNSSTETDQQPHSPDSSSSVHSIRNMQVPQESLEMRTKSYPRYPLES 580 590 600 610 620 630 >>KIAA1807 ( 702 res) fk00712 (702 aa) initn: 1921 init1: 1365 opt: 1365 Z-score: 1017.6 bits: 198.6 E(): 1.8e-51 Smith-Waterman score: 1934; 69.849% identity (84.673% similar) in 398 aa overlap (214-591:1-397) 190 200 210 220 230 240 FLJ001 PPLEGPPAQASPSSTMLGEGSQPDWPGGSRYDLDEIDAYWLELINSELKEMERPELDELT :::...:: :::: : :.::: ::::: : KIAA18 YDLNDMDAAWLELTNEEFKEMGMPELDEYT 10 20 30 250 260 270 280 290 300 FLJ001 LERVLEELETLCHQNMARAIETQEGLGIEYDEDVVCDVCRSPEGEDGNEMVFCDKCNVCV .::::::.: :..:: .::::.::::::::::::::::.::.::::::::::::::.:: KIAA18 MERVLEEFEQRCYDNMNHAIETEEGLGIEYDEDVVCDVCQSPDGEDGNEMVFCDKCNICV 40 50 60 70 80 90 310 320 330 340 350 360 FLJ001 HQACYGILKVPTGSWLCRTCALGVQPKCLLCPKRGGALKPTRSGTKWVHVSCALWIPEVS ::::::::::: :::::::::::::::::::::.:::.:::::::::::::::::::::: KIAA18 HQACYGILKVPEGSWLCRTCALGVQPKCLLCPKKGGAMKPTRSGTKWVHVSCALWIPEVS 100 110 120 130 140 150 370 380 390 400 410 420 FLJ001 IGCPEKMEPITKISHIPASRWALSCSLCKECTGTCIQCSMPSCVTAFHVTCAFDHGLEMR :: :::::::::.::::.::::: ::::.: :. ::::. .: ::::::::::.::::. 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KIAA18 YTKLLEQERVSGVPSSCSSSSLENMLLFNSPSVGPDAPKIEDLKWHSAFFRKQMGTSLVH 390 400 410 420 430 440 >>KIAA1286 ( 1214 res) hh11961(revised) (1214 aa) initn: 647 init1: 223 opt: 629 Z-score: 471.7 bits: 98.4 E(): 4.5e-21 Smith-Waterman score: 709; 31.263% identity (55.280% similar) in 483 aa overlap (175-585:123-600) 150 160 170 180 190 200 FLJ001 QLSPDDYYILADPWRQEWEKGVQVPAGAEAIPEPVVRILPPLEGPPAQASPSSTMLGEGS .:.: :.. : : :.. . . KIAA12 PQFPGKSKKPSSKGKKKESCSKHASGTSFHLPQPSFRMVDSGIQPEAPPLPAAYYRYIEK 100 110 120 130 140 150 210 220 230 240 250 260 FLJ001 QP-DWPGGSRYDLDEIDAYWLELINSELKEMERPELDELTLERVLEELETLCHQNMARAI : : . .::.:: : ::...: . . . .. :.: ....:: . . .:. KIAA12 PPEDLDAEVEYDMDEEDLAWLDMVNEKRRVDGHSLVSADTFELLVDRLEKESYLE-SRSS 160 170 180 190 200 210 270 280 290 300 310 320 FLJ001 ETQEGLGIEYDEDVVCDVCRSPEGEDGNEMVFCDKCNVCVHQACYGILKVPTGSWLCRTC .:..: :::. : :: . : ...: ..::: ::. ::: :::. .: :.:::: : KIAA12 GAQQSL---IDEDAFCCVCLDDECHNSNVILFCDICNLAVHQECYGVPYIPEGQWLCRCC 220 230 240 250 260 330 340 350 360 370 380 FLJ001 ALG-VQP-KCLLCPKRGGALKPTRSGTKWVHVSCALWIPEVSIGCPEKMEPITKISHIPA . .: :.:::..:::.: : .: .:.:: ::.::::: .. .::: :..:: KIAA12 LQSPSRPVDCILCPNKGGAFKQTSDG-HWAHVVCAIWIPEVCFANTVFLEPIEGIDNIPP 270 280 290 300 310 320 390 400 410 420 430 FLJ001 SRWALSCSLCKEC-TGTCIQCSMPSCVTAFHVTCAFDHGLEMR------TILADND-EVK .:: :.: .::. :. ::: .: :::::::: :: :. : : . :. KIAA12 ARWKLTCYICKQKGLGAAIQCHKVNCYTAFHVTCAQRAGLFMKIEPMRETSLNGTIFTVR 330 340 350 360 370 380 440 450 460 FLJ001 FKSFCQEHSDGG----------PRN--------------------EPTSEPTEPSQAGED ..:. :: : ::. : . : . .:.: . KIAA12 KTAYCEAHSPPGAATARRKGDSPRSISETGDEEGLKEGDGEEEEEEEVEEEEQEAQGGVS 390 400 410 420 430 440 470 480 490 500 FLJ001 --LEKVTLR-----KQRLQQLEEDFYE--------LVEPAEVAERLDLAEALVDF----- :. : . ::.... :. . :. : . ::. . ..: KIAA12 GSLKGVPKKSKMSLKQKIKKEPEEAGQDTPSTLPMLAVPQIPSYRLNKICSGLSFQRKNQ 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 FLJ001 ----IYQYWKLKRKANANQPL---LTPKTDEVDNLAQQEQD----VLYRRLKLFTHLRQD ...:: :::.: . :: : . . : :.::: .. ..:: . .::.: KIAA12 FMQRLHNYWLLKRQARNGVPLIRRLHSHLQSQRNAEQREQDEKTSAVKEELKYWQKLRHD 510 520 530 540 550 560 560 570 580 590 600 610 FLJ001 LERVRNLCYMVTRRERTKHAICKLQEQIFHLQMKLIEQDLCRERSGRRAKGKKSDSKRKG :::.: : .. .::. :. :.:. ..:.. KIAA12 LERARLLIELIRKREKLKREQVKVQQAAMELELMPFNVLLRTTLDLLQEKDPAHIFAEPV 570 580 590 600 610 620 620 630 FLJ001 CEGSKGSTEKKEKVKAGPDSVLGQLGE KIAA12 NLSEVPDYLEFISKPMDFSTMRRKLESHLYRTLEEFEEDFNLIVTNCMKYNAKDTIFHRA 630 640 650 660 670 680 >>KIAA0876 ( 1119 res) hh03683 (1119 aa) initn: 279 init1: 120 opt: 403 Z-score: 305.1 bits: 67.5 E(): 8.5e-12 Smith-Waterman score: 403; 38.554% identity (60.843% similar) in 166 aa overlap (287-445:773-933) 260 270 280 290 300 310 FLJ001 QNMARAIETQEGLGIEYDEDVVCDVCRSPEGEDG-NEMVFCDKCNVCVHQACYGIL-KVP :.:: . .. : :: . :: .:::: .. KIAA08 SRQKTRPLIPEMCFTSGGENTEPLPANSYIGDDGTSPLIACGKCCLQVHASCYGIRPELV 750 760 770 780 790 800 320 330 340 350 360 370 FLJ001 TGSWLCRTCALGVQP-KCLLCPKRGGALKPTRSGTKWVHVSCALWIPEVSIGCPEKMEPI . .: : :: . .: :: :::::. : . .:.:: ::. .::. . . .:. 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KIAA08 D-ISAIPEQRWKLKCVYCRKRMKKVSGACIQCSYEHCSTSFHVTCAHAAGVLMEP---DD 870 880 890 900 910 430 440 450 460 470 480 FLJ001 DEVKFKSFCQEHSDGGPRNEPTSEPTEPSQAGEDLEKVTLRKQRLQQLEEDFYELVEPAE . : .:..:: KIAA08 WPYVVSITCLKHKSGGHAVQLLRAVSLGQVVITKNRNGLYYRCRVIGAASQTCYEVNFDD 920 930 940 950 960 970 >>KIAA0780 ( 1100 res) hk05362 (1100 aa) initn: 266 init1: 120 opt: 374 Z-score: 283.8 bits: 63.5 E(): 1.3e-10 Smith-Waterman score: 381; 28.792% identity (52.699% similar) in 389 aa overlap (84-422:529-901) 60 70 80 90 100 110 FLJ001 FPRRSLQRRVVEGQRPSGGHRGARWKRRGENTPSASDNSDTTDSHATSTSASRCSKLPSS ..:: :...: :: ::. . : : KIAA07 DHIKLSGNSCLSTSVTEDIKTEDDKAYAYRSVPSISSEAD--DSIPLSTGYEKPEKSDPS 500 510 520 530 540 550 120 130 140 150 160 FLJ001 TKSGWPRQNEKKPSEVFRTDLITAMKIPDSYQ----LSPDDYYILADPWRQEWEKGVQVP : ::.. :. : . . ..: . : . : : . . . :. . .:: KIAA07 ELS-WPKSPESCSSVAESNGVLTEGEESDVESHGNGLEPGEIPAVPSGERNSF----KVP 560 570 580 590 600 610 170 180 190 200 210 220 FLJ001 AGAEAIPEPVVRILPPLEGPPAQASPSSTMLGEG-SQPDWPG--GSRYDLDEIDAYWLEL . ::. . :: :::. :: . . .. :. . : . . ...: ... : KIAA07 SIAEGENKTSKSWRHPLSRPPAR-SPMTLVKQQAPSDEELPEVLSIEEEVEETESWAKPL 620 630 640 650 660 670 230 240 250 260 FLJ001 I----------------NSELKEMERPELDELTLERVLEELETLCHQNMAR------AIE : :. . .: .:. :: .. .. ..: :: . KIAA07 IHLWQTKSPNFAAEQEYNATVARM-KPHCAICTLLMPYHKPDSSNEENDARWETKLDEVV 680 690 700 710 720 270 280 290 300 310 FLJ001 TQEG--------LGIEYDEDVVCDVCRSPEG----EDGNEMVF-CDKCNVCVHQACYGI- :.:: . . :.:. .. :: . :::. ... : :: : :: .:::: KIAA07 TSEGKTKPLIPEMCFIYSEE---NIEYSPPNAFLEEDGTSLLISCAKCCVRVHASCYGIP 730 740 750 760 770 780 320 330 340 350 360 FLJ001 -LKVPTGSWLCRTCALGVQP-KCLLCPKRGGALKPTRSGTKWVHVSCALWIPEVSI-GCP .. : ::: : .. .: :: :::::: :... ::.:: ::. .::: . . : KIAA07 SHEICDG-WLCARCKRNAWTAECCLCNLRGGALKQTKNN-KWAHVMCAVAVPEVRFTNVP 790 800 810 820 830 840 370 380 390 400 410 420 FLJ001 EKMEPITKISHIPASRWALSCSLC----KECTGTCIQCSMPSCVTAFHVTCAFDHGLEMR :. . ...:: .: :.: .: :. .:.:::::. : ..:::::: :. : KIAA07 ERTQ--IDVGRIPLQRLKLKCIFCRHRVKRVSGACIQCSYGRCPASFHVTCAHAAGVLME 850 860 870 880 890 900 430 440 450 460 470 480 FLJ001 TILADNDEVKFKSFCQEHSDGGPRNEPTSEPTEPSQAGEDLEKVTLRKQRLQQLEEDFYE KIAA07 PDDWPYVVNITCFRHKVNPNVKSKACEKVISVGQTVITKHRNTRYYSCRVMAVTSQTFYE 910 920 930 940 950 960 >>KIAA0677 ( 1073 res) hk02635 (1073 aa) initn: 276 init1: 120 opt: 372 Z-score: 282.4 bits: 63.2 E(): 1.6e-10 Smith-Waterman score: 372; 35.211% identity (56.808% similar) in 213 aa overlap (288-484:738-939) 260 270 280 290 300 310 FLJ001 NMARAIETQEGLGIEYDEDVVCDVCRSPEGEDGNE-MVFCDKCNVCVHQACYGILKVPTG :::. .: : ::.: :: .:::. . .. 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KIAA07 ETDAG-RWVHIVCALYVPGVAFGDIDKLRPVT-LTEMNYSKYGAKECSFCEDPRFARTGV 410 420 430 440 450 460 400 410 420 430 440 450 FLJ001 CIQCSMPSCVTAFHVTCAFDHGLEMRTILADNDEVKFKSFCQEHSDGGPRNEPTSEPTEP ::.:. : . :::::: .:: .. .. : ..:..:.: KIAA07 CISCDAGMCRAYFHVTCAQKEGLLSEAAAEEDIADPFFAYCKQHADRLDRKWKRKNYLAL 470 480 490 500 510 520 460 470 480 490 500 510 FLJ001 SQAGEDLEKVTLRKQRLQQLEEDFYELVEPAEVAERLDLAEALVDFIYQYWKLKRKANAN KIAA07 QSYCKMSLQEREKQLSPEAQARINARLQQYRAKAELARSTRPQAWVPREKLPRPLTSSAS 530 540 550 560 570 580 >>KIAA0304 ( 2415 res) af07172 (2415 aa) initn: 143 init1: 77 opt: 197 Z-score: 149.6 bits: 39.8 E(): 0.0039 Smith-Waterman score: 197; 28.395% identity (50.617% similar) in 162 aa overlap (330-480:1280-1426) 300 310 320 330 340 350 FLJ001 NVCVHQACYGILKVPTGSWLCRTCALGVQPKCLLCPKRGGALKPTRSG-------TKWVH .: :: : : : ..: ..:.: KIAA03 TPESGQPPGDPSAAFQGKDPAAFSHLEDPRQCALCLKYGDA-DSKEAGRLLYIGQNEWTH 1250 1260 1270 1280 1290 1300 360 370 380 390 400 410 FLJ001 VSCALWIPEVSIGCPEKMEPITKISHIPASRW-ALSCSLCKECTGTCIQCSMPSCVTAFH :.::.: :: :. . : : ..: . : :: . :. . : . ::.. :: KIAA03 VNCAIWSAEVF----EENDGSLKNVHAAVARGRQMRCELCLK-PGATVGCCLSSCLSNFH 1310 1320 1330 1340 1350 1360 420 430 440 450 460 FLJ001 VTCAFDHGLEMRTILADNDEVKFKSFCQEHSD---GGPRNEPTSEPTEPSQAGEDLEKVT :: :. :. .: :::.:.: : .: . . .. :.: .. KIAA03 FMCARAS----YCIFQDDKKV----FCQKHTDLLDGKEIVNPDGFDVL-RRVYVDFEGIN 1370 1380 1390 1400 1410 470 480 490 500 510 520 FLJ001 LRKQRLQQLEEDFYELVEPAEVAERLDLAEALVDFIYQYWKLKRKANANQPLLTPKTDEV .... : :: : KIAA03 FKRKFLTGLEPDAINVLIGSIRIDSLGTLSDLSDCEGRLFPIGYQCSRLYWSTVDARRRC 1420 1430 1440 1450 1460 1470 >>KIAA0582 ( 760 res) fh15957 (760 aa) initn: 55 init1: 55 opt: 130 Z-score: 105.3 bits: 29.9 E(): 1.2 Smith-Waterman score: 130; 26.238% identity (46.535% similar) in 202 aa overlap (24-212:361-546) 10 20 30 40 50 FLJ001 RHRLRSCGPTVPGGGRGAWDAAGPAASLAATP-DGCAPPALPRRPQELPASGA : : .: : .: :.: . :...: . . KIAA05 VLQDSGVDLDSFSVSPASTLKSPTNVSPNCPPAEATALPFSGPREPSLKQWPSRVPQKQG 340 350 360 370 380 390 60 70 80 90 100 110 FLJ001 SFPRRSLQRRVVEGQRPSGGHRGARWKRRGENTPSASDNSDTTDSHATSTSASRCSKLPS .. : .. . . : : : :::.:: .:.: : .: : .: . 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