# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -H -O./tmp/sj04432.fasta.huge -Q ../query/FLJ00204.ptfa ./tmplib.10216 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 FLJ00204, 573 aa vs ./tmplib.10216 library 2210421 residues in 2457 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.9692+/-0.00764; mu= -0.8051+/- 0.512 mean_var=406.0622+/-90.763, 0's: 0 Z-trim: 4 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.063647 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2457) KIAA1494 ( 638 res) fj08673 ( 638) 467 56.9 6.5e-09 KIAA1296 ( 815 res) fg03576 ( 815) 265 38.6 0.0028 KIAA0777 ( 1171 res) hk05279 (1171) 206 33.4 0.15 FLJ00139 ( 585 res) sh03241 ( 585) 176 30.2 0.68 KIAA1491 ( 757 res) fj08187 ( 757) 163 29.1 1.8 KIAA0200 ( 1042 res) ha02508 (1042) 157 28.8 3.2 KIAA1668 ( 791 res) fh11717 ( 791) 148 27.8 4.8 KIAA1959 ( 650 res) hh03965 ( 650) 145 27.4 5.2 KIAA1802 ( 821 res) fj21631 ( 821) 147 27.7 5.2 KIAA0181 ( 2079 res) ha02522s1 (2079) 155 29.0 5.3 KIAA0616 ( 634 res) hg03623 ( 634) 144 27.3 5.5 FLJ00261 ( 1651 res) sh06537 (1651) 151 28.5 6 KIAA0006 ( 773 res) ha01154 ( 773) 144 27.4 6.1 KIAA0574 ( 405 res) hj00204 ( 405) 138 26.5 6.2 FLJ00404 ( 261 res) sj07851 ( 261) 134 25.8 6.2 KIAA1741 ( 1777 res) fh23254 (1777) 151 28.6 6.3 FLJ00094 ( 376 res) as00094 ( 376) 137 26.3 6.3 KIAA0769 ( 746 res) hk05035 ( 746) 142 27.2 6.8 KIAA0035 ( 707 res) ha01976 ( 707) 140 27.0 7.5 KIAA0468 ( 410 res) hg01596 ( 410) 135 26.2 7.5 KIAA0142 ( 802 res) ha01169 ( 802) 141 27.2 7.5 KIAA1085 ( 584 res) hj07690 ( 584) 138 26.7 7.6 KIAA1187 ( 813 res) fk03027 ( 813) 140 27.1 8.1 KIAA0910 ( 1315 res) hg02207s1 (1315) 144 27.7 8.3 KIAA1139 ( 1124 res) hk00330 (1124) 142 27.5 8.6 KIAA0306 ( 1451 res) hg00063 (1451) 144 27.8 8.7 KIAA1306 ( 1154 res) fh05845 (1154) 140 27.3 9.9 KIAA0755 ( 1093 res) hk04532 (1093) 138 27.1 11 FLJ00070 ( 1382 res) as00070 (1382) 139 27.3 12 KIAA0079 ( 1102 res) ha03543 (1102) 136 26.9 12 KIAA1379 ( 457 res) fj05092s1 ( 457) 128 25.6 13 KIAA1844 ( 367 res) fj12009 ( 367) 126 25.3 13 KIAA0612 ( 1810 res) hg00654s1 (1810) 140 27.6 13 KIAA1019 ( 2309 res) fg00188s1 (2309) 141 27.8 14 KIAA0697 ( 2486 res) hk04486s1 (2486) 141 27.9 14 KIAA1096 ( 1919 res) pf00402 (1919) 138 27.4 15 KIAA1522 ( 1044 res) fh14706(revised) (1044) 131 26.4 17 KIAA0754 ( 1174 res) hh06485 (1174) 132 26.6 17 KIAA1685 ( 1505 res) pf04287 (1505) 134 26.9 17 FLJ00160 ( 1696 res) sh06621 (1696) 135 27.1 17 KIAA1115 ( 895 res) hk05464 ( 895) 129 26.1 17 KIAA1666 ( 1003 res) fg02554 (1003) 130 26.3 17 KIAA1690 ( 482 res) fh27434 ( 482) 123 25.2 18 KIAA0170 ( 2090 res) ha02399 (2090) 136 27.3 18 KIAA1681 ( 1236 res) fh23697 (1236) 131 26.5 18 KIAA1855 ( 1270 res) fg04654 (1270) 131 26.5 19 KIAA1471 ( 1421 res) fj02383s1 (1421) 132 26.7 19 KIAA1506 ( 3309 res) ff04330 (3309) 138 27.8 21 KIAA0904 ( 1535 res) ha00554 (1535) 130 26.5 22 KIAA0458 ( 1552 res) ef01252 (1552) 130 26.6 22 >>KIAA1494 ( 638 res) fj08673 (638 aa) initn: 1126 init1: 374 opt: 467 Z-score: 253.4 bits: 56.9 E(): 6.5e-09 Smith-Waterman score: 1369; 42.319% identity (64.006% similar) in 664 aa overlap (4-572:3-637) 10 20 30 40 50 60 FLJ002 PLLYVELNDSAKQLIEMDKPCPAAASSCNASLPSDSGAVASVAPSPTLSSSGAVSAFQRR :::.:..:::::: ::: :. . .:. :...: .:.:: .. KIAA14 ISYVEFNSAAKQLIEWDKP-PVP--GVDAGECSSAAAQSSTAP--------------KH 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 FLJ002 VDGKKNTKKRHSFTALSVTHRSSQAASHRHSMEISAPVLISSSDPRAAARIGDLAHLSCA : :::::::::::.:.....::::...::::::: :::::::.: :::::..:. :::. KIAA14 SDTKKNTKKRHSFTSLTMANKSSQASQNRHSMEISPPVLISSSNPTAAARISELSGLSCS 50 60 70 80 90 100 130 140 FLJ002 APTQDVSSSAG-----------------STPTAVPRAASVSGEQ---------------G ::.: :..: . :. :: :... . . KIAA14 APSQVHISTTGLIVTPPPSSPVTTGPSFTFPSDVPYQAALGTLNPPLPPPPLLAATVLAS 110 120 130 140 150 160 150 160 170 180 FLJ002 TPP--------------------------KVQLPLNVYLALYAYKPQKSDELELHKGEMY ::: . : .::.:.: : :.: :::::.::::. 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KIAA14 HTAAISIS-RASAPLACAAAAPLTSPSITSASLEAEPSGRIVTVLPGLPTSPDSASSACG 400 410 420 430 440 450 400 410 420 430 440 450 FLJ002 TGCKLDEKKSEKKEKKSGLLKLLAGASTKKKSRSPPSVSPTHDPQVAVDAL-LQGAVGPE .. :. ::::: ::::::.:::::.: : : .::: . ... : :::::::: KIAA14 NSSATKPDKDSKKEKK-GLLKLLSGASTKRKPRVSPPASPTLEVELGSAELPLQGAVGPE 460 470 480 490 500 510 460 470 480 490 500 FLJ002 VSSLSIHGRAGSCPIESE------MQGA-MGMEPLHRKAGSLD--LNFTSPSRQAPLSMA . . ::::::::.... . :: .... .::::.::: . .. : ::: :.. KIAA14 LPPGGGHGRAGSCPVDGDGPVTTAVAGAALAQDAFHRKASSLDSAVPIAPPPRQACSSLG 520 530 540 550 560 570 510 520 530 540 550 560 FLJ002 AIRPEPKLLPRERYRVVVSYPPQSEAEIELKEGDIVFVHKKREDGWYKGTLQRNGRTGLF . : . . ::.:::::::::::::.::::::::::::::::::.::::::::.:::: KIAA14 PVLNESRPVVCERHRVVVSYPPQSEAELELKEGDIVFVHKKREDGWFKGTLQRNGKTGLF 580 590 600 610 620 630 570 FLJ002 PGSFVESF ::::::. 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KIAA12 QDLFSYQALYSYIPQNDDELELRDGDIVDVMEKCDDGWFVGTSRRTKQFGTFPGNYVKPL 760 770 780 790 800 810 220 230 240 250 260 270 FLJ002 SRVPAGGAGPPRNNVVGGSPLAKGITTTMHPGSGSLSSLATATRPALPITTPQAHAQHPT KIAA12 YL >>KIAA0777 ( 1171 res) hk05279 (1171 aa) initn: 319 init1: 206 opt: 206 Z-score: 121.2 bits: 33.4 E(): 0.15 Smith-Waterman score: 206; 55.769% identity (78.846% similar) in 52 aa overlap (160-211:1117-1168) 130 140 150 160 170 180 FLJ002 AGSTPTAVPRAASVSGEQGTPPKVQLPLNVYLALYAYKPQKSDELELHKGEMYRVLEKCQ . ::: : :.. :::::..... :.:::. KIAA07 YSSDRIHSLSSNKPQRPVFTHENIQGGGEPFQALYNYTPRNEDELELRESDVIDVMEKCD 1090 1100 1110 1120 1130 1140 190 200 210 220 230 240 FLJ002 DGWFKGASLRTGVSGVFPGNYVTPVSRVPAGGAGPPRNNVVGGSPLAKGITTTMHPGSGS :::: :.: :: :.:::::: KIAA07 DGWFVGTSRRTKFFGTFPGNYVKRL 1150 1160 1170 >>FLJ00139 ( 585 res) sh03241 (585 aa) initn: 143 init1: 64 opt: 176 Z-score: 109.4 bits: 30.2 E(): 0.68 Smith-Waterman score: 193; 23.297% identity (50.549% similar) in 455 aa overlap (101-524:138-555) 80 90 100 110 120 130 FLJ002 HSFTALSVTHRSSQAASHRHSMEISAPVLISSSDPRAAARIGDLAHLSCAAPTQDVSSSA : .: . . :.: ::.. : FLJ001 ILTYVSQYYNYFHGRSPIGGMAGVKRASEDSEEEPSGKKAPVQAAKLPSPAPARKPPLSP 110 120 130 140 150 160 140 150 160 170 180 FLJ002 GSTPTAVPRAASVSGEQGTPPKVQLPLNVYLALYAY----KPQKSDELELHKGEMY-RVL ..: .: : : : :::.. : :. . : . . .: :..: : FLJ001 AQTNPVVQRRNE--GAGGPPPKTDQALAGSLVSSTCGVCGKHVHLVQRHLADGRLYHRSC 170 180 190 200 210 220 190 200 210 220 230 240 FLJ002 EKCQDGWFKGASLRTGVSGVF--PGNYVTPVSRVPAGGAGPPRNNVVGGSPLAKGITTTM .:.. . .:..:. . ::..: .:..::.... :. ..: : FLJ001 FRCKQC---SCTLHSGAYKATGEPGTFVC-TSHLPAAASASPK--LTGLVP--------R 230 240 250 260 270 250 260 270 280 290 300 FLJ002 HPGSGSLSSLATATRPALPITTPQAHAQHPTA-SPPTGSCLRHSAQPTASQARSTISTAA .::. ...: .. . : . .:. .:.: : .:. ... :.: . .: .:.. FLJ001 QPGAMGVDSRTSCS----PQKAQEANKARPSAWEPAAGNSPARASVPAAPNPAATSATSV 280 290 300 310 320 310 320 330 340 350 FLJ002 H---SAAQAQDR--PTAT---VSPLRTQNSPSRLPATSLRPHSVVSPQHSHQPPVQMCPR : : ...: :: : : : :..:: . .: : .... .: :: :: FLJ001 HVRSPARPSESRLAPTPTEGKVRPRVTNSSP--MGWSSAAPCTAAAASHPAVPPSAPDPR 330 340 350 360 370 380 360 370 380 390 400 410 FLJ002 PAIPLTSAASAITPPNVSAANLNGEAGGGPIGVLSTSSPTNTGCKLDEKKSEKKEKKSGL :: : ..: .. :... .. :::. : . :. .. .. . FLJ001 PATPQGGGAPRVAAPQTTLSSS------------STSAATVDPPAWTPSASRTQQARNKF 390 400 410 420 430 420 430 440 450 460 FLJ002 LKLLA-GASTKKKSRSP-PSVSPTHDP---------QVAVDALLQ-GAVGPEVSSLSIHG .. : .:. ..:.: ::. ..: . :..:: . :: .: : . . FLJ001 FQTSAVPPGTSLSGRGPTPSLVLSKDSSKEQARNFLKQALSALEEAGAPAPGRPSPATAA 440 450 460 470 480 490 470 480 490 500 510 FLJ002 RAGSCPIESEMQGAMGMEPLHRKAGSLDLNFTSPSRQ---APLSMAAIRPEPKLLPRERY .: : :.. .::. .. . :.. :::. :::: .. : : : FLJ001 VPSSQPKTEAPQASPLAKPLQSSSPRV-LGL--PSRMEPPAPLSTSSTSQASALPPAGRR 500 510 520 530 540 550 520 530 540 550 560 570 FLJ002 RVVVSYPPQSEAEIELKEGDIVFVHKKREDGWYKGTLQRNGRTGLFPGSFVESF .. : FLJ001 NLAESSGVGRVGAGSRPKPEAPMAKGKSTTLTQGE 560 570 580 >>KIAA1491 ( 757 res) fj08187 (757 aa) initn: 169 init1: 94 opt: 163 Z-score: 101.8 bits: 29.1 E(): 1.8 Smith-Waterman score: 176; 22.581% identity (48.387% similar) in 434 aa overlap (24-435:313-699) 10 20 30 40 50 FLJ002 PLLYVELNDSAKQLIEMDKPCPAAASSCNASLPSDSGAVASVAPSPTLSSSGA ...::.: ::: : ..... :: . :.. KIAA14 GHGGGRSQQTLDTPKTTGPPSALPSVSSLPSTTSCTALLPSTSQHTGDLTSSPLSQLSSS 290 300 310 320 330 340 60 70 80 90 100 110 FLJ002 VSAFQRRVDGKKNTKKRHSFTALSVTHRSSQAASHRHSMEISAPVLISSSDPRAAARIGD .:. : .... .. : : :: ::. .: : .. : :.:. . . . KIAA14 LSSHQSSLSAHAALSSSTSHTHASVESASSHQSSATFSTAATS-VSSSASSGVSLSSSMN 350 360 370 380 390 400 120 130 140 150 160 FLJ002 LAHLSC--AAPTQDVSSSAGSTPTAVPRAASVSGEQGTPPKVQLPLNVYLA-----LYAY :. : ..:.. :::. ..: .. : . ::.:: .. : ::. : :: KIAA14 TANSLCLGGTPASASSSSSRAAPLVTSGKAPPNLPQGVPPLLH---NQYLVGPGGLLPAY 410 420 430 440 450 170 180 190 200 210 220 FLJ002 KPQKSDELELHKGEMYRVLEKCQDGWFKGASLRTGVSGVFPGNYVTPVSRVPAGGAGPPR :::.. .... : .: .:.. :. : KIAA14 PIYGYDELQMLQSRL-------------------------PVDYYGIPFAAPTALAS--R 460 470 480 490 230 240 250 260 270 280 FLJ002 NNVVGGSPLAKGITTTMHPGSGSLSSLATATRPALPITTP-QAH--AQHPTASP--PTGS .. ....: .: : :. .: : :: :: : . :.: ::.: ..: : : KIAA14 DGSLANNPYPGDVTKF---GRGDSASPAPATTPAQPQQSQSQTHHTAQQPFVNPALPPGY 500 510 520 530 540 290 300 310 320 330 FLJ002 CLR----HSAQPTASQARSTISTAAHSAAQAQDRPTATVSPLRTQNSPSRLPATSLRPHS ....:.: : :. . :: : . . .: .: :.. :. KIAA14 SYTGLPYYTGMPSAFQYGPTMFVPPASAKQ---HGVNLSTP-----TPPFQQASGYGQHG 550 560 570 580 590 600 340 350 360 370 380 390 FLJ002 VVSPQHSHQPPVQMCPRPAIPLTSAASAITPPNVSAANLNGEAGGGPIGVLSTSSPTNTG . ... .: . :.. :: ::. .: . : .. .:. : :: KIAA14 YST---GYDDLTQGTAAGDYSKGGYAGSSQAPNKSAG--SGPGKGVSVSSSTTGLPDMTG 610 620 630 640 650 400 410 420 430 440 450 FLJ002 CKLDEKKS-EKKEKKSGL-----LKLLAGASTKKKSRSPPSVSPTHDPQVAVDALLQGAV .. .. .:. ..: : . :.. : . :. .: KIAA14 SVYNKTQTFDKQGFHAGTPPPFSLPSVLGSTGPLASGAAPGYAPPPFLHILPAHQQPHSQ 660 670 680 690 700 710 460 470 480 490 500 510 FLJ002 GPEVSSLSIHGRAGSCPIESEMQGAMGMEPLHRKAGSLDLNFTSPSRQAPLSMAAIRPEP KIAA14 LLHHHLPQDAQSGSGQRSQPSSLQPKSQASKPAYGNSPYWTN 720 730 740 750 >>KIAA0200 ( 1042 res) ha02508 (1042 aa) initn: 107 init1: 54 opt: 157 Z-score: 97.4 bits: 28.8 E(): 3.2 Smith-Waterman score: 187; 23.111% identity (50.444% similar) in 450 aa overlap (20-454:611-1030) 10 20 30 40 FLJ002 PLLYVELNDSAKQLIEMDKPCPAAASSCNASLPSDSGAVASVAPSPTLS : : :.: ... :. : : .: :: :: KIAA02 NSLFLMKPKPGNMPFRSLVPPGQEQNPSSVPVQAQATSVGTQPPAVSVA-SSHNSSPYLS 590 600 610 620 630 50 60 70 80 90 100 FLJ002 SSGAVSAFQRR---VDGKKNTKKRHSFTALSVTHRSSQAASHR--HSMEISAPVLISSSD :. ....... .: .:. ..... : ..: .: : . . .. 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