# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -H -O./tmp/sj04686.fasta.huge -Q ../query/FLJ00416.ptfa ./tmplib.10216 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 FLJ00416, 221 aa vs ./tmplib.10216 library 2210773 residues in 2457 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5444+/-0.00641; mu= 15.4018+/- 0.432 mean_var=231.5334+/-53.199, 0's: 0 Z-trim: 77 B-trim: 24 in 1/39 Lambda= 0.084288 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 36, opt: 24, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2457) KIAA1951 ( 679 res) fj05532 ( 679) 417 62.5 5.8e-11 KIAA0412 ( 720 res) hg03242 ( 720) 416 62.4 6.5e-11 KIAA1431 ( 891 res) fj00022 ( 891) 413 62.2 9.2e-11 KIAA1508 ( 573 res) hk06576 ( 573) 409 61.4 1e-10 KIAA0628 ( 540 res) hh01433 ( 540) 406 61.0 1.3e-10 KIAA2003 ( 460 res) ah02593 ( 460) 405 60.7 1.3e-10 KIAA1954 ( 468 res) fk02322 ( 468) 405 60.7 1.3e-10 KIAA1198 ( 553 res) fg01911 ( 553) 405 60.8 1.4e-10 KIAA1829 ( 557 res) hj00069 ( 557) 403 60.6 1.7e-10 KIAA1710 ( 515 res) fj18457 ( 515) 397 59.8 2.7e-10 FLJ00284 ( 366 res) sh02281 ( 366) 394 59.2 3e-10 KIAA0326 ( 927 res) hg00579 ( 927) 399 60.5 3.1e-10 KIAA1874 ( 579 res) hk07257s1 ( 579) 396 59.8 3.2e-10 KIAA1956 ( 680 res) fk08713 ( 680) 396 59.9 3.4e-10 KIAA1806 ( 481 res) fk00438 ( 481) 394 59.4 3.4e-10 KIAA1396 ( 551 res) hj08221 ( 551) 394 59.5 3.6e-10 KIAA0557 ( 493 res) hh01334 ( 493) 393 59.3 3.8e-10 KIAA0065 ( 848 res) ha00946 ( 848) 395 60.0 4.1e-10 KIAA1827 ( 469 res) fk01409 ( 469) 390 58.9 4.7e-10 FLJ00187 ( 563 res) sj02149 ( 563) 388 58.8 6.1e-10 KIAA1615 ( 484 res) fj13419 ( 484) 386 58.4 6.7e-10 FLJ00032 ( 705 res) as00032 ( 705) 388 59.0 6.8e-10 KIAA1611 ( 813 res) fj12627 ( 813) 388 59.1 7.3e-10 KIAA0798 ( 682 res) hk06584 ( 682) 387 58.8 7.3e-10 KIAA2007 ( 580 res) fj01689 ( 580) 386 58.6 7.3e-10 KIAA1871 ( 821 res) hj05256s1 ( 821) 387 59.0 7.9e-10 KIAA1962 ( 746 res) hm00158 ( 746) 386 58.8 8.2e-10 KIAA1947 ( 608 res) fh23660 ( 608) 384 58.4 8.9e-10 KIAA1979 ( 309 res) fj09511 ( 309) 377 57.0 1.2e-09 FLJ00309 ( 564 res) sh05969 ( 564) 378 57.6 1.4e-09 KIAA1473 ( 574 res) fj03262 ( 574) 377 57.5 1.6e-09 KIAA2033 ( 766 res) ej00602s1 ( 766) 378 57.8 1.6e-09 KIAA1852 ( 948 res) fj01514 ( 948) 377 57.9 2e-09 KIAA1969 ( 595 res) fk06944 ( 595) 374 57.1 2e-09 KIAA1559 ( 544 res) fh19195 ( 544) 370 56.6 2.7e-09 KIAA1982 ( 599 res) fk06527(revised) ( 599) 369 56.5 3.1e-09 KIAA0426 ( 613 res) hh01274 ( 613) 369 56.6 3.2e-09 KIAA1015 ( 841 res) hk03609(revised) ( 841) 369 56.8 3.7e-09 KIAA0961 ( 530 res) hj05830 ( 530) 366 56.1 3.8e-09 KIAA1141 ( 914 res) hk01833 ( 914) 368 56.7 4.1e-09 KIAA1339 ( 409 res) fj00071 ( 409) 360 55.1 5.6e-09 KIAA1349 ( 752 res) fj00940 ( 752) 361 55.7 6.8e-09 KIAA0972 ( 702 res) hj06859 ( 702) 360 55.6 7.2e-09 KIAA1948 ( 487 res) fh24556 ( 487) 357 54.9 7.8e-09 KIAA1588 ( 613 res) fj08823 ( 613) 356 55.0 9.4e-09 KIAA1388 ( 599 res) fj06552 ( 599) 346 53.7 2.2e-08 KIAA0924 ( 617 res) hh02883 ( 617) 345 53.6 2.4e-08 KIAA1190 ( 174 res) hg03443a ( 174) 335 51.4 3.1e-08 KIAA1020 ( 638 res) fg00473s1 ( 638) 329 51.7 9.4e-08 KIAA0441 ( 702 res) hh00601s1 ( 702) 322 50.9 1.8e-07 >>KIAA1951 ( 679 res) fj05532 (679 aa) initn: 594 init1: 328 opt: 417 Z-score: 290.2 bits: 62.5 E(): 5.8e-11 Smith-Waterman score: 417; 40.556% identity (61.667% similar) in 180 aa overlap (19-192:426-588) 10 20 30 40 FLJ004 WGADPLTCSSVSPLLQREPPHTTVFPATMDDVPAPTPAPAPPAAAAPR : .:. :: . .: : : ::::: . 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KIAA04 EKPFVCSECGKAFTHCSTFILHKRAHTGEKPFECKECGKAFSNRKDLIRHFSIHTGEKPY 520 530 540 550 560 570 80 90 100 110 120 130 FLJ004 ACPRCGKGFKHSFNLANHLRSHTGERPYRCSACPKGFRDSTGLLHHQVVHTGEKPYCCLV : .:::.: . .:. : : :.::.::.: : :.: ::.:..: ..::::::: : KIAA04 ECVECGKAFTRMSGLTRHKRIHSGEKPYECVECGKSFCWSTNLIRHAIIHTGEKPYKCSE 580 590 600 610 620 630 140 150 160 170 180 190 FLJ004 CELRFSSRSSLGRHLKRQHRGVLPSPLQPGPGLPALSAPCSVCCNVGPCSVCGGSGAGGG : :: ::: .: .:.: : : . : : :. :: KIAA04 CGKAFSRSSSLTQH-QRMHTGKNPISVTD-VGRPFTSGQTSVTLRELLLGKDFLNVTTEA 640 650 660 670 680 690 200 210 220 FLJ004 EGPEGAGAGLGSWGLAEAAAAA KIAA04 NILPEETSSSASDQPYQRETPQVSSL 700 710 720 >>KIAA1431 ( 891 res) fj00022 (891 aa) initn: 1853 init1: 379 opt: 413 Z-score: 286.5 bits: 62.2 E(): 9.2e-11 Smith-Waterman score: 413; 43.624% identity (66.443% similar) in 149 aa overlap (50-192:639-786) 20 30 40 50 60 70 FLJ004 PHTTVFPATMDDVPAPTPAPAPPAAAAPRVPFHCSECGKSFRYRSDLRRHFARHTALKPH ::.:.:::::: :.: : ::. ::. KIAA14 EKPFKCKECGKAFRQNIHLASHLRIHTGEKPFECAECGKSFSISSQLATHQRIHTGEKPY 610 620 630 640 650 660 80 90 100 110 120 130 FLJ004 ACPRCGKGFKHSFNLANHLRSHTGERPYRCSACPKGFRDSTGLLHHQVVHTGEKPYCCLV : :.:.: .. .::.: ..::::.::.:. : :.: ..: :..:: :::::::: :. KIAA14 ECKVCSKAFTQKAHLAQHQKTHTGEKPYECKECGKAFSQTTHLIQHQRVHTGEKPYKCME 670 680 690 700 710 720 140 150 160 170 180 190 FLJ004 CELRFSSRSSLGRHLKRQHRGVLPSP-LQPGPGLPALSA-PCSVCCNVG--P--CSVCGG : :.. :: .: .: : : : .. : .. . :. : ..: : ::::: KIAA14 CGKAFGDNSSCTQH-QRLHTGQRPYECIECGKAFKTKSSLICHRRSHTGEKPYECSVCGK 730 740 750 760 770 780 200 210 220 FLJ004 SGAGGGEGPEGAGAGLGSWGLAEAAAAA KIAA14 AFSHRQSLSVHQRIHSGKKPYECKECRKTFIQIGHLNQHKRVHTGERSYNYKKSRKVFRQ 790 800 810 820 830 840 >>KIAA1508 ( 573 res) hk06576 (573 aa) initn: 723 init1: 395 opt: 409 Z-score: 285.5 bits: 61.4 E(): 1e-10 Smith-Waterman score: 421; 50.000% identity (69.298% similar) in 114 aa overlap (50-163:296-408) 20 30 40 50 60 70 FLJ004 PHTTVFPATMDDVPAPTPAPAPPAAAAPRVPFHCSECGKSFRYRSDLRRHFARHTALKPH :..:::::::: . ..: :: . ::. .:. KIAA15 ERPYDCSECGKSFRQVSVLIQHQRVHTGERPYECSECGKSFSHSTNLYRHRSAHTSTRPY 270 280 290 300 310 320 80 90 100 110 120 130 FLJ004 ACPRCGKGFKHSFNLANHLRSHTGERPYRCSACPKGFRDSTGLLHHQVVHTGEKPYCCLV : .:::.:.:: :: : : ::: :::.:: : :.: . :.::: ::::.:: : KIAA15 ECSECGKSFSHSTNLFRHWRVHTGVRPYECSECGKAFSCNIYLIHHQRFHTGERPYVCSE 330 340 350 360 370 380 140 150 160 170 180 190 FLJ004 CELRFSSRSSLGRHLKRQHRGVLPSPLQPGPGLPALSAPCSVCCNVGPCSVCGGSGAGGG : :...: : .: .: : : : KIAA15 CGKSFGQKSVLIQH-QRVHTGERPYECSECGKVFSQSSGLFRHRRAHTKTKPYECSECEK 390 400 410 420 430 440 >>KIAA0628 ( 540 res) hh01433 (540 aa) initn: 1910 init1: 368 opt: 406 Z-score: 283.8 bits: 61.0 E(): 1.3e-10 Smith-Waterman score: 406; 48.649% identity (72.072% similar) in 111 aa overlap (50-160:266-375) 20 30 40 50 60 70 FLJ004 PHTTVFPATMDDVPAPTPAPAPPAAAAPRVPFHCSECGKSFRYRSDLRRHFARHTALKPH :..:.:::::: :.: ::. :: .: . KIAA06 ERPFECKECGKGFSQSSLLIRHQRIHTGERPYECNECGKSFIRSSSLIRHYQIHTEVKQY 240 250 260 270 280 290 80 90 100 110 120 130 FLJ004 ACPRCGKGFKHSFNLANHLRSHTGERPYRCSACPKGFRDSTGLLHHQVVHTGEKPYCCLV : .:::.:.: .: .: : ::::::..:. : :.: :. :..:: .::::.:: : KIAA06 ECKECGKAFRHRSDLIEHQRIHTGERPFECNECGKAFIRSSKLIQHQRIHTGERPYVCNE 300 310 320 330 340 350 140 150 160 170 180 190 FLJ004 CELRFSSRSSLGRHLKRQHRGVLPSPLQPGPGLPALSAPCSVCCNVGPCSVCGGSGAGGG : :::. :.. .: .: : : KIAA06 CGKRFSQTSNFTQH-QRIHTGEKLYECNECGKAFFLSSYLIRHQKIHTGERVYECKECGK 360 370 380 390 400 410 >>KIAA2003 ( 460 res) ah02593 (460 aa) initn: 1798 init1: 391 opt: 405 Z-score: 283.7 bits: 60.7 E(): 1.3e-10 Smith-Waterman score: 414; 50.877% identity (71.930% similar) in 114 aa overlap (50-163:211-323) 20 30 40 50 60 70 FLJ004 PHTTVFPATMDDVPAPTPAPAPPAAAAPRVPFHCSECGKSFRYRSDLRRHFARHTALKPH :..: ::::::: :.: .: :::..:: KIAA20 ERCYICSECGKSFSKSYSLNDHWRLHTGEKPYECRECGKSFRQSSSLIQHRRVHTAVRPH 190 200 210 220 230 240 80 90 100 110 120 130 FLJ004 ACPRCGKGFKHSFNLANHLRSHTGERPYRCSACPKGFRDSTGLLHHQVVHTGEKPYCCLV : .::: :... :: .: : :::::::.:: : :.: . ..::.:. :::::.:: : KIAA20 ECDECGKLFSNKSNLIKHRRVHTGERPYECSECGKSFSQRSALLQHRGVHTGERPYECSE 250 260 270 280 290 300 140 150 160 170 180 190 FLJ004 CELRFSSRSSLGRHLKRQHRGVLPSPLQPGPGLPALSAPCSVCCNVGPCSVCGGSGAGGG : :. .::: .: .. : : : KIAA20 CGKFFTYHSSLIKH-QKVHSGSRPYECSECGKSFSQNSSLIEHHRVHTGERPYKCSECGK 310 320 330 340 350 >>KIAA1954 ( 468 res) fk02322 (468 aa) initn: 1208 init1: 389 opt: 405 Z-score: 283.6 bits: 60.7 E(): 1.3e-10 Smith-Waterman score: 405; 49.123% identity (72.807% similar) in 114 aa overlap (50-163:113-225) 20 30 40 50 60 70 FLJ004 PHTTVFPATMDDVPAPTPAPAPPAAAAPRVPFHCSECGKSFRYRSDLRRHFARHTALKPH ::.:. :::.::. :.: .: ::. ::. KIAA19 KKHHECTDCGKTFLWKTQLTEHQRIHTGEKPFECNVCGKAFRHSSSLGQHENAHTGEKPY 90 100 110 120 130 140 80 90 100 110 120 130 FLJ004 ACPRCGKGFKHSFNLANHLRSHTGERPYRCSACPKGFRDSTGLLHHQVVHTGEKPYCCLV : :::.:..: .:..: : ::::.::::. : ..:: .:.: .:.:.:.::::. : KIAA19 QCSLCGKAFQRSSSLVQHQRIHTGEKPYRCNLCGRSFRHGTSLTQHEVTHSGEKPFQCKE 150 160 170 180 190 200 140 150 160 170 180 190 FLJ004 CELRFSSRSSLGRHLKRQHRGVLPSPLQPGPGLPALSAPCSVCCNVGPCSVCGGSGAGGG : :: ::: .: .: : : : KIAA19 CGKAFSRCSSLVQH-ERTHTGEKPFECSICGRAFGQSPSLYKHMRIHKRGKPYQSSNYSI 210 220 230 240 250 260 >>KIAA1198 ( 553 res) fg01911 (553 aa) initn: 950 init1: 356 opt: 405 Z-score: 283.0 bits: 60.8 E(): 1.4e-10 Smith-Waterman score: 405; 43.333% identity (63.333% similar) in 150 aa overlap (50-192:273-420) 20 30 40 50 60 70 FLJ004 PHTTVFPATMDDVPAPTPAPAPPAAAAPRVPFHCSECGKSFRYRSDLRRHFARHTALKPH :..:.::::.::: . :::: ::. ::. 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KIAA18 EKPYECNQCGKAFSRRIALTLHQRIHTGEKPFKCSECGKTFGYRSHLNQHQRIHTGEKPY 360 370 380 390 400 410 80 90 100 110 120 130 FLJ004 ACPRCGKGFKHSFNLANHLRSHTGERPYRCSACPKGFRDSTGLLHHQVVHTGEKPYCCLV : .::: :. . .: : : ::::::..:: : :.: :. :.::. :.::::: : KIAA18 ECIKCGKFFRTDSQLNRHHRIHTGERPFECSKCGKAFSDALVLIHHKRSHAGEKPYECNK 420 430 440 450 460 470 140 150 160 170 180 190 FLJ004 CELRFSSRSSLGRHLKRQHRGVLPSPLQPGPGLPALSAPCSVCCNVGPCSVCGGSGAGGG : :: : :..: .: : : : KIAA18 CGKAFSCGSYLNQH-QRIHTGEKPYECSECGKAFHQILSLRLHQRIHAGEKPYKCNECGN 480 490 500 510 520 530 >>KIAA1710 ( 515 res) fj18457 (515 aa) initn: 1703 init1: 379 opt: 397 Z-score: 278.0 bits: 59.8 E(): 2.7e-10 Smith-Waterman score: 413; 47.581% identity (70.161% similar) in 124 aa overlap (50-172:350-472) 20 30 40 50 60 70 FLJ004 PHTTVFPATMDDVPAPTPAPAPPAAAAPRVPFHCSECGKSFRYRSDLRRHFARHTALKPH :..:.::::.: ::: :: ::. ::. 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