# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -H -O./tmp/sj07676.fasta.huge -Q ../query/FLJ00243.ptfa ./tmplib.10216 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 FLJ00243, 503 aa vs ./tmplib.10216 library 2210491 residues in 2457 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.6303+/-0.00794; mu= -9.5474+/- 0.529 mean_var=499.4118+/-114.529, 0's: 0 Z-trim: 5 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.057391 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2457) FLJ00364 ( 601 res) sh04977 ( 601) 3408 296.4 4.5e-81 KIAA0616 ( 634 res) hg03623 ( 634) 413 48.4 2.1e-06 KIAA0181 ( 2079 res) ha02522s1 (2079) 208 32.1 0.55 KIAA2030 ( 1023 res) ef00583 (1023) 200 31.1 0.57 KIAA1930 ( 664 res) fj11193 ( 664) 193 30.2 0.65 KIAA0579 ( 910 res) bg00015 ( 910) 186 29.8 1.2 KIAA1587 ( 991 res) fj08327 ( 991) 172 28.7 2.8 KIAA0346 ( 1682 res) hg01508s1 (1682) 176 29.3 3 KIAA0618 ( 1052 res) hg03971 (1052) 167 28.3 3.8 KIAA0458 ( 1552 res) ef01252 (1552) 165 28.4 5.4 KIAA0613 ( 734 res) hg01088b ( 734) 157 27.3 5.5 KIAA2032 ( 952 res) eh00720 ( 952) 155 27.3 7.2 KIAA1204 ( 1445 res) fg03451 (1445) 159 27.9 7.4 KIAA0079 ( 1102 res) ha03543 (1102) 156 27.5 7.4 KIAA1205 ( 1217 res) fg03511a (1217) 156 27.5 7.9 KIAA0977 ( 1207 res) hj07018 (1207) 155 27.4 8.3 KIAA1887 ( 967 res) fk02232 ( 967) 152 27.0 8.6 KIAA0781 ( 950 res) hk09678 ( 950) 151 27.0 9 KIAA1048 ( 897 res) hh02560 ( 897) 150 26.8 9.2 KIAA0863 ( 1181 res) hk06535 (1181) 152 27.2 9.7 KIAA2025 ( 1109 res) fh08764 (1109) 151 27.0 9.9 KIAA0947 ( 2330 res) ef03552 (2330) 158 28.0 10 KIAA2018 ( 1685 res) ha04734 (1685) 152 27.4 12 FLJ00253 ( 349 res) sj09455 ( 349) 135 25.1 12 KIAA1085 ( 584 res) hj07690 ( 584) 140 25.8 13 KIAA1814 ( 1285 res) ph00952 (1285) 148 26.9 13 KIAA0048 ( 627 res) ha01311 ( 627) 140 25.8 13 KIAA0992 ( 772 res) hk07554 ( 772) 142 26.1 13 KIAA1760 ( 2219 res) af00030 (2219) 153 27.6 13 KIAA0250 ( 1122 res) ha02790 (1122) 145 26.6 14 KIAA0054 ( 1943 res) ha00503s1 (1943) 150 27.3 15 KIAA1483 ( 428 res) fj06303 ( 428) 133 25.0 16 KIAA1938 ( 1376 res) hg00912s1 (1376) 145 26.7 16 KIAA0910 ( 1315 res) hg02207s1 (1315) 144 26.6 16 KIAA1668 ( 791 res) fh11717 ( 791) 138 25.8 17 KIAA1203 ( 727 res) fg03361 ( 727) 136 25.6 18 KIAA1635 ( 1435 res) fh23184(revised) (1435) 143 26.5 18 KIAA1453 ( 1123 res) fh14729 (1123) 140 26.1 19 KIAA0298 ( 901 res) hf00341(revised) ( 901) 137 25.8 19 KIAA1802 ( 821 res) fj21631 ( 821) 136 25.6 19 KIAA1602 ( 1003 res) fj10252 (1003) 138 25.9 20 KIAA1608 ( 872 res) fj20142 ( 872) 135 25.6 21 KIAA0029 ( 974 res) ha00566 ( 974) 136 25.7 22 FLJ00224 ( 896 res) sj06244 ( 896) 135 25.6 22 KIAA1935 ( 441 res) fk03135(revised) ( 441) 127 24.5 22 KIAA1080 ( 517 res) hj07082 ( 517) 127 24.6 25 KIAA0886 ( 1233 res) hk07722 (1233) 136 25.9 25 KIAA1041 ( 642 res) fh02801 ( 642) 129 24.9 25 KIAA1683 ( 832 res) fh24307 ( 832) 131 25.2 26 KIAA0808 ( 530 res) hk04477s1 ( 530) 126 24.6 26 >>FLJ00364 ( 601 res) sh04977 (601 aa) initn: 3408 init1: 3408 opt: 3408 Z-score: 1548.8 bits: 296.4 E(): 4.5e-81 Smith-Waterman score: 3408; 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KIAA20 RSSQIHTSSSSQTHVSSSSQAQIAASSHALG---TSEAQDASSLTQVTKVHQHSAVQQNY 560 570 580 590 600 610 240 250 260 270 280 FLJ002 NNHPQTSVPNASALHPSLRLFSLSNPSLSTTNLSGPSRRRQPPVSPLTLS-PGP-EANQG . :... . : .: ..: . ::.:: .. : . .: . : :: :.: ...:: KIAA20 VSPLQATI-SKSQTNPVVKLSN--NPQLSCSS-SLIKTSDKPLMYRLPLSTPSPGNGSQG 620 630 640 650 660 670 290 300 310 320 330 340 FLJ002 FSRQLSSTSPLAPYPTSQMVSSDRSQLSFLPTEAQAQVSPPPPYPA-PQELTQPLLQQPR .: : : . .. .... ::.: .. ... : : :. :.: .: KIAA20 SHPLVSRTVPSTTTSSNYLAKAMVSQISTQGFKSPFSMAASPKLAASPKPATSP---KPL 680 690 700 710 720 350 360 370 380 390 400 FLJ002 APEAPAQQPQAA-SSLPQSDFQLLPAQGSSLTNFFPDVGFDQQSMRPGPAFPQQVPLVQQ :. .:. . :. :. . .:. : .: : . .. :. . :. :: : KIAA20 PSPKPSASPKPSLSAKPSVSTKLI-----SKSNPTP-----KPTVSPSSSSPNA--LVAQ 730 740 750 760 770 410 420 430 440 450 460 FLJ002 GSRELQDS-FHLRPSPYSNCGSLPN-TILPDSSTSLFKDLNSALAGLPEVSLNVDTPFPL ::. .: : .:: .. . :. ..::.: :: ::: .. :...: : KIAA20 GSHSSTNSPVHKQPSGMNISRQSPTLNLLPSSRTS----------GLPPTK-NLQAPSKL 780 790 800 810 820 470 480 490 500 FLJ002 EEELQIEPL---SLDGLNMLSDSSMGLLDPSVEETFRADRL . . . ::.:. : .: : KIAA20 TNSSSTGTVGKNSLSGIAMNVPASRGSNLNSSGANRTSLSGGTGSGTQGATKPLSTPHRP 830 840 850 860 870 880 >>KIAA1930 ( 664 res) fj11193 (664 aa) initn: 82 init1: 54 opt: 193 Z-score: 109.7 bits: 30.2 E(): 0.65 Smith-Waterman score: 193; 26.316% identity (54.135% similar) in 266 aa overlap (138-393:12-266) 110 120 130 140 150 160 FLJ002 PLPKQLWETKEIQSLSGRPRSCDVGGGNAFPHNGQ-NLGLSPFLGTLNTGGSLPDLTNLH ::. : .:...::.: : .. . KIAA19 CHYHYPQCSKPPHSHYYRLHPKPIISTLTTTGPTLNIIGPV 10 20 30 40 170 180 190 200 210 220 FLJ002 YSTPLPA-SLDTTDHHFGSMS-VGNSVNNIPAAMTHLGIRSSSGLQSSRSNPSIQATLNK .: :. .. . : .: . ...: .. :.. :: : : .. .:: .. : . KIAA19 QTTTSPTHTMPSPTHTTASPTHTSTSPTHTPTSPTHK--TSMSPPTTTSPTPSGMG-LVQ 50 60 70 80 90 230 240 250 260 270 280 FLJ002 TVLSSSLNNHPQTSVPNASALHPSLRLFSLSNPSLSTTNLSGPSRRRQPPVSPLTLSP-G :. : . :: :: :. . : : : :. :: ..::.::.. .: . : . KIAA19 TATSPT---HPTTS-PTHPTTSPILINVSPST-SLELATLSSPSKHSDPTLPGTDSLPCS 100 110 120 130 140 150 290 300 310 320 330 FLJ002 PEANQGFSRQLSSTSPLAPYPTSQMVSSDRSQLSFLPTEAQAQV-----SPPPPYPAPQE : ...... : . .: .:.: : :: . : : ... : .: :: ::::. KIAA19 PPVSNSYT-QADPMAPRTPHP-SPAHSSRKPLTSPAPDPSESTVQSLSPTPSPPTPAPQH 160 170 180 190 200 210 340 350 360 370 380 390 FLJ002 LTQPLLQQPRAPEAPAQQPQAASSLPQSDFQLLPAQGSSLTNFFPDV-GFDQQSMRPGPA : . ..: : .. :: .. :. : .. . ::.. :..:. : KIAA19 SDLCLAMAVQTPVPTAAGGSGDRSLEEALGALMAAL-DDYRGQFPELQGLEQEVTRLESL 220 230 240 250 260 270 400 410 420 430 440 450 FLJ002 FPQQVPLVQQGSRELQDSFHLRPSPYSNCGSLPNTILPDSSTSLFKDLNSALAGLPEVSL KIAA19 LMRQGLTRSRASSLSITVEHALESFSFLNEDEDEDNDVPGDRPPSSPEAGAEDSIDSPSA 280 290 300 310 320 330 >>KIAA0579 ( 910 res) bg00015 (910 aa) initn: 141 init1: 62 opt: 186 Z-score: 105.1 bits: 29.8 E(): 1.2 Smith-Waterman score: 186; 25.513% identity (49.560% similar) in 341 aa overlap (130-451:522-842) 100 110 120 130 140 150 FLJ002 ENLLNVPKPLPKQLWETKEIQSLSGRPRSCDVGGGNAFPHNG-QNL-GLSPFLGTLNTGG :: ..: ::. : : ::: . : . 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KIAA05 LQGGFCANSNTASPSSHPSTSFANM--ATLPSCPAPSSSPALSSVPESSFYSSSGGGGST 660 670 680 690 700 710 330 340 350 360 370 380 FLJ002 PPPPYPAPQELTQPLLQQPRAPEAPAQQPQAA---SSLPQSDFQLLPAQGSSLTNFFPDV : :.. . ::: :: :: : . .: : . : .:.: KIAA05 GNIPASNPNHHHHHHHQQPPAPPQPAPPPPGCIVCTSCGCSGSCGSSGLTVSYANYFQH- 720 730 740 750 760 770 390 400 410 420 430 440 FLJ002 GFDQQSMRPGPAFPQQVPLVQQGSRELQD-----SFHLRPSPYSNCGSLPNTILPDSSTS :. :. : .: . :. ..: :. .: . .:::. :. :. .: .:: KIAA05 PFSGPSVFTFPFLPFS-PMCSSGYVSAQQYGGGSTFPVVHAPYSSSGT-PDPVLSGQSTF 780 790 800 810 820 830 450 460 470 480 490 500 FLJ002 LFKDLNSALAGLPEVSLNVDTPFPLEEELQIEPLSLDGLNMLSDSSMGLLDPSVEETFRA ... .:: KIAA05 AVPPMQNFMAGTAGVYQTQGLVGSSNGSSHKKSGNLSCYNCGATGHRAQDCKQPSMDFNR 840 850 860 870 880 890 >>KIAA1587 ( 991 res) fj08327 (991 aa) initn: 108 init1: 53 opt: 172 Z-score: 98.4 bits: 28.7 E(): 2.8 Smith-Waterman score: 178; 24.745% identity (49.745% similar) in 392 aa overlap (114-487:59-414) 90 100 110 120 130 140 FLJ002 NNGHGEVASFPGPLKEENLLNVPKPLPKQLWETKEIQSLSGRPRSCDVGGGNAF--PHNG : . . : : :: :... : .. KIAA15 TPVGRTMSLVSQNSRRRRRRVAKATAHNSSWGEMQAPNAPGLP--ADVPGSDVPQGPSDS 30 40 50 60 70 80 150 160 170 180 190 FLJ002 QNL-GLSPFLGTLNTGGSLPDLTNLHYSTPLPASLDTTDHHFG--SMSVGNSVNNIPAAM : : :: : . . :: . :: .: ... .. : ..: : ... .:. KIAA15 QILQGLCASEGP--STSVLPT-SAEGPSTFVPPTISEASSASGQPTISEGPGTSVLPTPS 90 100 110 120 130 140 200 210 220 230 240 250 FLJ002 THLGIRS----SSGLQSSRSNPSIQATLNKTVLSSSLNNHPQTSVPNASALHPSLRLFSL :. . :.:: .: . . .. .. .:: ..:.:::: ... :: : KIAA15 EGLSTSGPPTISKGLCTSVTLAASEGRNTSRPPTSS--EEPSTSVPPTASEVPSTSLPPT 150 160 170 180 190 200 260 270 280 290 300 FLJ002 SNPSLST----TNLSGPSRRR--QPPVSPLT-LSPGPEANQGFSRQLSSTSPLAPYPTSQ . . :: : ::: : .: : . : : . : : :..: :. :: KIAA15 PGEGTSTSVPPTAYEGPSTSVVPTPDEGPSTSVLPTPGEGPGTSVPLAATEGLS---TSV 210 220 230 240 250 310 320 330 340 350 360 FLJ002 MVSSDRSQLSFLPTEAQAQVSPPPPYPAPQELTQPLLQQPRAP-EAPAQQPQAASSLPQS ... :.. . .: : .: : : : . : . : .: :.:. . :.: :: KIAA15 QATPDEGPSTSVPPTATEGLSTPVP---PTRDEGPSTSVPATPGEGPSTSVLPAASDGQS 260 270 280 290 300 310 370 380 390 400 410 420 FLJ002 DFQLLPAQGSSLTNFFPDVGFDQQSMRPGPAFPQQVPLVQQGSRELQDSFHLRPSPYSNC ..:.:..:.. .. : .. . : . : : . .:: : . :.: KIAA15 -ISLVPTRGKGSSTSVPPTATE------GLSTSVQ-PTAGEGS-----STSVPPTP---G 320 330 340 350 430 440 450 460 470 480 FLJ002 GSLPNTILPDSSTSLFKDLNSALAGLPEVSLNVDTPFPLEE-ELQIEPLSLDGLNMLSDS :.: ... : .. : .. . . : .:. :.: : .. : . :: ::. KIAA15 GGLSTSVPPTATEELSTSVPPTPGEGPSTSV---LPIPGEGLSTSVPPTASDG----SDT 360 370 380 390 400 410 490 500 FLJ002 SMGLLDPSVEETFRADRL :. KIAA15 SVPPTPGEGASTLVQPTAPDGPGSSVLPNPGEGPSTLFSSSASVDRNPSKCSLVLPSPRV 420 430 440 450 460 470 >>KIAA0346 ( 1682 res) hg01508s1 (1682 aa) initn: 189 init1: 65 opt: 176 Z-score: 97.7 bits: 29.3 E(): 3 Smith-Waterman score: 191; 32.227% identity (48.341% similar) in 211 aa overlap (266-449:510-706) 240 250 260 270 280 290 FLJ002 QTSVPNASALHPSLRLFSLSNPSLSTTNLSGPSRRRQPPVSPLTLSPGPEANQGFS--RQ :: : ::. :: :.. :: : KIAA03 PPPPAWLKGPACRAAREDGEILEELFFGTEGPPRPAPPPLPHREGFLGPPASR-FSVGTQ 480 490 500 510 520 530 300 310 320 330 340 350 FLJ002 LSSTSPLAPYPTSQMVSSDRSQLSFLPTEAQAQVS-PPPPYPAPQELTQPLLQQPRAPEA : : : : ::.. .:. .. : :. . :: ::::: : . .:: :: : . 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KIAA03 IRKEEEQQQHEAGVAPQPPLKEPFASLQSPFPTDTAPTTTAPAVAVTTTTTTTTTTTATQ 710 720 730 740 750 760 >>KIAA0618 ( 1052 res) hg03971 (1052 aa) initn: 134 init1: 58 opt: 167 Z-score: 95.9 bits: 28.3 E(): 3.8 Smith-Waterman score: 177; 24.317% identity (53.005% similar) in 366 aa overlap (57-405:475-806) 30 40 50 60 70 80 FLJ002 PWKDEKHPGFRLTSALNRTNSDSALHTSALSTKPQDPYGGGGQSAWPAPYMGFCDGENNG .:::: . .. ::: ..: : .: KIAA06 PPTTLLGLIPAPSMVPATDTKAPPTLQAETATKPQ-----ATSAPSPAPKQSFLFGTQNT 450 460 470 480 490 90 100 110 120 130 140 FLJ002 HGEVASFPGPLKEENLLNVPKPL----PKQLWETKEIQSLSGRPRSCDVGGGNAFPHNGQ . :. . .. ::. ::. :: . : . . .....: . . KIAA06 SPSSPAAPAASSAPPMF---KPIFTAPPKS---EKEGPTPPGPSVTATAPSSSSLPTTTS 500 510 520 530 540 550 150 160 170 180 190 FLJ002 NLG--LSPFLGTLNTGGSLPDLTNLHYSTPLPASLDTTDHHF--GSMSVGNSVNNIPAAM . . ..: ..... .:.: . . .: ::. :: . : :. ..: : .: KIAA06 TTAPTFQPVFSSMGPPASVPLPAPFFKQTTTPATAPTTTAPLFTGLASATSAVAPITSAS 560 570 580 590 600 610 200 210 220 230 240 250 FLJ002 --THLGIRSSSGLQ-SSRSNPSIQATLNKTVLSSS--LNNHPQTSVPNASALHPSL-RLF : . . . :. .: :. :...: . .. .:. : . ::.: :... :.. .: KIAA06 PSTDSASKPAFGFGINSVSSSSVSTTTSTATAASQPFLFGAPQAS---AASFTPAMGSIF 620 630 640 650 660 670 260 270 280 290 300 310 FLJ002 SLSNP-SLSTTNLSGPSRRRQPPVSPLTLSPGPEANQGFSRQLSSTSP-LAPYPTSQMVS ....: .: ::. . . : . : . .::. :....: . :: .. KIAA06 QFGKPPALPTTTTVTTFSQSLHTAVPTATSSSAADFSGFGSTLATSAPATSSQPT--LTF 680 690 700 710 720 320 330 340 350 360 FLJ002 SDRSQLSF-LPTEAQAQVSPPPPYPAPQELTQPLLQQPRAPEAPAQQPQAASSLPQSDFQ :. : .: .: ..:. :: : ::. ..: :: : .: : ::. : KIAA06 SNTSTPTFNIPFGSSAK-SPLPSYPG----ANP---QPAFGAAEGQPPGAAK--PA---- 730 740 750 760 770 370 380 390 400 410 420 FLJ002 LLPAQGSSLTNFFPDVGFDQQSMRPGPAFPQQVPLVQQGSRELQDSFHLRPSPYSNCGSL : :. :::.: : . . . : :: :... .: KIAA06 LAPSFGSSFT--FGNSA--APAAAPTPAPPSMIKVVPAYVPTPIHPIFGGATHSAFGLKA 780 790 800 810 820 830 430 440 450 460 470 480 FLJ002 PNTILPDSSTSLFKDLNSALAGLPEVSLNVDTPFPLEEELQIEPLSLDGLNMLSDSSMGL KIAA06 TASAFGAPASSQPAFGGSTAVFFGAATSSGFGATTQTASSGSSSSVFGSTTPSPFTFGGS 840 850 860 870 880 890 >>KIAA0458 ( 1552 res) ef01252 (1552 aa) initn: 195 init1: 88 opt: 165 Z-score: 93.2 bits: 28.4 E(): 5.4 Smith-Waterman score: 206; 23.884% identity (43.973% similar) in 448 aa overlap (4-439:712-1111) 10 20 30 FLJ002 RQFDGSAFGANYSSQPLDESWPRQQPPWKDEKH :.:: ..:: . : : . KIAA04 EGSSDPKDIDQDNRSTSPSIPSPQDNESDSDSSAQQQMLQAQPPALQAPTGVTPAPSSAP 690 700 710 720 730 740 40 50 60 70 80 90 FLJ002 PGFRLTSALNRTNSDSALHTSALSTKPQDPYGGGGQSAWPAPYMGFCDGENNGHGEVASF :: . . : : .:. .. : : : . .: :.:. : . : KIAA04 PGTPQLPTPGPTPSATAVPPQGSPTASQAPNQPQAPTA-PVPHT---------HIQQAPA 750 760 770 780 790 100 110 120 130 140 150 FLJ002 PGPLKEENLLNVPKPLPKQLWETKEIQSLSGRPRSCDVGGGNAFPHNGQNLGLSPFLGTL : . . :.: :. .: :.: . .. . : .::. : .: KIAA04 LHPQRPPSPHPPPHPSPHP-----PLQPLTGSAGQPSAPSHAQPPLHGQG---PPGPHSL 800 810 820 830 840 160 170 180 190 200 210 FLJ002 NTGGSLPDLTNLHYSTPLPASLDTTDHHFGSMSVGNSVNNIPAAMTHLGIR---SSSGLQ ..: : : : . : : .: . :. .:.: ::. : ... :.:.:: KIAA04 QAG---PLLQ--HPGPPQPFGLPPQASQ-GQAPLGTS---PAAAYPHTSLQLPASQSALQ 850 860 870 880 890 220 230 240 250 260 270 FLJ002 SSRSNPSIQATLNKTVLSSSLNNHPQTSVPNASALHPSLRLFSLSNPSLSTTNLSGPSRR :.. : : . .. : : .:. : . . ::.:: . : . : KIAA04 SQQP-PREQPLPPAPLAMPHIKPPPTTPIPQLPAPQAHKHPPHLSGPSPFSMNANLPPPP 900 910 920 930 940 950 280 290 300 310 320 330 FLJ002 RQPPVSPLTLSPGPEANQGFSRQLSSTSPLAPYPTSQMVSSDRSQLSFLPTEAQAQVSPP :.: :. : :. :: .: :: . :. .: : .:.: :: KIAA04 ALKPLSSLSTHHPPSAHP---------PPLQLMPQSQPLPSSPAQP---PGLTQSQNLPP 960 970 980 990 1000 340 350 360 370 380 FLJ002 PP--YPAPQELTQ-----PLLQQPRAPEAPAQQPQAASSLPQSDFQLLPAQGSSLTNFFP :: .: : : : :. :.: .: .: : . . :... : : . . : KIAA04 PPASHP-PTGLHQVAPQPPFAQHPFVPGGP--PPITPPTCPSTS---TPPAGPGTSAQPP 1010 1020 1030 1040 1050 390 400 410 420 430 440 FLJ002 DVGFDQQ--SMRPGPAFPQQVPLVQQGSRELQDSFHLRPSPYSNCGSLPNTILPDSSTSL : . :. : . : .: :: . :.:. . . : . :. . :. . 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