# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -H -O./tmp/sj09535.fasta.huge -Q ../query/FLJ00420.ptfa ./tmplib.10216 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 FLJ00420, 613 aa vs ./tmplib.10216 library 2210381 residues in 2457 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 14.7144+/-0.0107; mu= -25.9090+/- 0.715 mean_var=849.8783+/-193.093, 0's: 0 Z-trim: 4 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.043994 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2457) KIAA0691 ( 762 res) hk03735 ( 762) 3693 249.5 8.9e-67 KIAA2032 ( 952 res) eh00720 ( 952) 266 32.1 0.31 KIAA0023 ( 2111 res) ha00512 (2111) 261 32.2 0.65 KIAA0910 ( 1315 res) hg02207s1 (1315) 253 31.4 0.68 KIAA1506 ( 3309 res) ff04330 (3309) 255 32.0 1.1 FLJ00201 ( 705 res) sj04110 ( 705) 225 29.4 1.5 KIAA1802 ( 821 res) fj21631 ( 821) 225 29.4 1.7 KIAA1064 ( 1315 res) hj05008s1 (1315) 226 29.7 2.2 KIAA1668 ( 791 res) fh11717 ( 791) 216 28.8 2.5 KIAA1522 ( 1044 res) fh14706(revised) (1044) 217 29.0 2.8 KIAA0309 ( 3053 res) hg00096s1 (3053) 232 30.5 2.9 KIAA1116 ( 1330 res) hk02574(revised) (1330) 217 29.2 3.3 KIAA1491 ( 757 res) fj08187 ( 757) 206 28.2 3.7 KIAA1690 ( 482 res) fh27434 ( 482) 199 27.5 3.8 KIAA0181 ( 2079 res) ha02522s1 (2079) 219 29.5 4.1 KIAA1085 ( 584 res) hj07690 ( 584) 196 27.4 4.9 FLJ00386 ( 811 res) sj04204 ( 811) 199 27.8 5.3 KIAA1813 ( 673 res) ph00819b ( 673) 196 27.5 5.4 FLJ00353 ( 1766 res) sh01144 (1766) 208 28.7 5.9 FLJ00141 ( 1326 res) sh04092 (1326) 203 28.3 6.1 KIAA0638 ( 1384 res) hj03347s1 (1384) 203 28.3 6.3 FLJ00198 ( 677 res) sj03504 ( 677) 192 27.2 6.4 KIAA0940 ( 699 res) hh04894 ( 699) 192 27.3 6.6 KIAA1986 ( 334 res) pg00636 ( 334) 180 26.1 6.9 KIAA1887 ( 967 res) fk02232 ( 967) 195 27.6 7.1 KIAA0269 ( 567 res) ha06751 ( 567) 186 26.8 7.5 KIAA1447 ( 1721 res) fh04686 (1721) 201 28.3 7.9 FLJ00086 ( 399 res) as00086 ( 399) 178 26.1 8.5 KIAA0304 ( 2415 res) af07172 (2415) 204 28.6 8.6 KIAA1271 ( 542 res) hk06527 ( 542) 182 26.5 8.7 KIAA0458 ( 1552 res) ef01252 (1552) 197 28.0 8.8 KIAA0613 ( 734 res) hg01088b ( 734) 185 26.8 9.2 KIAA1096 ( 1919 res) pf00402 (1919) 197 28.1 10 KIAA1760 ( 2219 res) af00030 (2219) 199 28.3 10 KIAA1886 ( 655 res) fk01837 ( 655) 181 26.5 10 FLJ00253 ( 349 res) sj09455 ( 349) 171 25.6 11 KIAA1172 ( 929 res) hj03919(revised) ( 929) 183 26.8 12 KIAA0035 ( 707 res) ha01976 ( 707) 178 26.4 12 KIAA1139 ( 1124 res) hk00330 (1124) 184 27.0 13 FLJ00269 ( 1383 res) sj06049 (1383) 187 27.3 13 KIAA1375 ( 546 res) fj04426 ( 546) 173 25.9 13 FLJ00139 ( 585 res) sh03241 ( 585) 173 26.0 14 KIAA0324 ( 2800 res) ee08846s1 (2800) 196 28.2 14 KIAA0737 ( 629 res) hk03869 ( 629) 174 26.1 14 KIAA1471 ( 1421 res) fj02383s1 (1421) 184 27.1 15 KIAA0250 ( 1122 res) ha02790 (1122) 180 26.7 15 KIAA0450 ( 1182 res) hj05822 (1182) 180 26.8 16 KIAA1681 ( 1236 res) fh23697 (1236) 179 26.7 17 KIAA1814 ( 1285 res) ph00952 (1285) 178 26.7 18 KIAA0973 ( 1583 res) hj06871 (1583) 181 27.0 18 >>KIAA0691 ( 762 res) hk03735 (762 aa) initn: 3671 init1: 3671 opt: 3693 Z-score: 1292.2 bits: 249.5 E(): 8.9e-67 Smith-Waterman score: 3693; 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KIAA00 SPGVMGTSVATSASKIIPQGADSTMLATKTVKHGAPSPSHPISAPQAAAAAALRRQMASQ 1060 1070 1080 1090 1100 1110 200 210 220 230 240 FLJ004 SPIPPSPANCTTENSEDDKKRGRSTDSEVSQSPAKNGSK---PVHSNQHPQSPAVPPTYP .: . .. : .: . . . .. .. : ::. :: .:: :. . : KIAA00 APAVNTLTESTLKNVPQVVNVQELKNNPATPSTAKTPHPVLTPVAANQAKQGSLINSLKP 1120 1130 1140 1150 1160 1170 250 260 270 280 290 300 FLJ004 SGPPPAASALSTTPGNNGVP----APAAPPSALGPKASPAPSHNSGTPAPYAQAVAPPAP ::: ::.. ::. .:. : .. ::: : ..: ::: .. . :.: KIAA00 SGPTPASGQLSSGDKASGTAKIETAVTSTPSASGQFSKPFSFSPSGTGFNFG--IITPTP 1180 1190 1200 1210 1220 310 320 330 340 350 360 FLJ004 SGPSTT-QPRPPSVQPSGGGGGGSGGGGSSSSSNSSAGGGAGKQNGATSYSSVVADSPAE :. :. : ::.. :. . :.::::. : . : .. .: :: :.. .:.: KIAA00 SSNFTAAQGATPSTKESSQPDAFSSGGGSKPSYE--AIPESSPPSGITSASNT---TPGE 1230 1240 1250 1260 1270 1280 370 380 390 400 410 FLJ004 VALSSSGGNNASSQALGPPSGPHNPPPSTSKE---PSAAAPTGAG---GVAPGSGNNSGG : ::: :. ::. :. . ::: : ::. : : :. :....: KIAA00 PAASSSRPVAPSGTALSTTSSKLETPPSKLGELLFPSSLAGETLGSFSGLRVGQADDSTK 1290 1300 1310 1320 1330 1340 420 430 440 450 460 470 FLJ004 PSLLVPLPVNPPSSPTPSFSDAKAAGALLNGPPQFS--TAPEIKAPEPLSSLKSMAERAA :. . .: :. ... .: ...:: .. : : . . .:. : .. KIAA00 PT--NKASSTSLTSTQPTKTSGVPSGFNFTAPPVLGKHTEPPVTSSATTTSVAPPAATST 1350 1360 1370 1380 1390 1400 480 490 500 510 FLJ004 ISSGIEDPVPTLHLTERDII------LS------------STSAPPASAQPPLQLSEVNI :... .:. .: :: ..:. : :: :: . . . KIAA00 SSTAVFGSLPVTSAGSSGVISFGGTSLSAGKTSFSFGSQQTNSTVPPSAPPPTT-AATPL 1410 1420 1430 1440 1450 1460 520 530 540 550 560 570 FLJ004 PLSLGVCPLGPV--PLTKEQLYQQA---MEEAAWHHMPH-PSDSERIRTSPGTPVRRPPT : :. . .: . : .: ..: :::. .:. :.::: KIAA00 PTSFPTLSFGSLLSSATTPSLPMSAGRSTEEATSSALPEKPGDSEVSASAASLLEEQQSA 1470 1480 1490 1500 1510 1520 580 590 600 610 FLJ004 TTRCHPHTRTLWNSTSACRPRHSSSSSTIWRALRHSIWQPRP KIAA00 QLPQAPPQTSDSVKKEPVLAQPAVSNSGTAASSTSLVALSAEATPATTGVPDARTEAVPP 1530 1540 1550 1560 1570 1580 >>KIAA0910 ( 1315 res) hg02207s1 (1315 aa) initn: 195 init1: 156 opt: 253 Z-score: 109.4 bits: 31.4 E(): 0.68 Smith-Waterman score: 253; 25.890% identity (52.427% similar) in 309 aa overlap (139-431:1005-1294) 110 120 130 140 150 160 FLJ004 TILRMLDNDSILVDAIRKIKDDVEYYVDSSQDPDFEENEFLYDDLDLEDIPQALVATSPP ..::. .: : ....:: : :: ... 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KIAA09 PRAGVISAPQSHARASAGRLTPESQSKTSETSKGSTFLPEPLKPQAAFPPQSSLPPPAQR 1210 1220 1230 1240 1250 1260 400 410 420 430 440 450 FLJ004 SKEPSAAAPTGAGGVAPGSGNNSGGPSLLVPLPVNPPSSPTPSFSDAKAAGALLNGPPQF .:: .:..: : :: . :.: .: : :: : KIAA09 LQEP--LVPVAAP--MPQSGPQ---PNLETP-PQPPPRSRSSHSLPSEASSQPQQEQPSG 1270 1280 1290 1300 1310 460 470 480 490 500 510 FLJ004 STAPEIKAPEPLSSLKSMAERAAISSGIEDPVPTLHLTERDIILSSTSAPPASAQPPLQL >>KIAA1506 ( 3309 res) ff04330 (3309 aa) initn: 197 init1: 96 opt: 255 Z-score: 105.5 bits: 32.0 E(): 1.1 Smith-Waterman score: 276; 23.024% identity (48.969% similar) in 582 aa overlap (74-591:1160-1686) 50 60 70 80 90 FLJ004 EKEEVGQWLTNTIDTLNMQVDQFESEVESLSVQTRKKKGDKDKQDRIEG------LKRHI :.. .... . : ..::.. ::.. KIAA15 ASSQERAPYVQKARDNRAALRINKVQMSNDSMKRQQQQDSIDPSSRIDSELFKDPLKQRE 1130 1140 1150 1160 1170 1180 100 110 120 130 140 150 FLJ004 EKHRYHVRMLETILRMLDNDSILVDAIRKIKDDVEYYVDSSQDPDFEENEFLYD---DLD .:. . .. . .:. .... ..: .:. ..:. ...:. .: ...: . : KIAA15 SEHEQEWKFRQQ-MRQKSKQQAKIEATQKL-EQVKNEQQQQQQQQFGSQHLLVQSGSDTP 1190 1200 1210 1220 1230 1240 160 170 180 190 200 FLJ004 LEDI-----PQALVATSPPSHSHMEDEIFNQSSSTPTSTTSSS--------PIPPSPANC : :: .. :..: .. . .: ::::::.:.. : ::.:. KIAA15 SSGIQSPLTPQPGNGNMSPAQSFHKELFTKQPPSTPTSTSSDDVFVKPQAPPPPPAPSRI 1250 1260 1270 1280 1290 1300 210 220 230 240 250 FLJ004 TTENSEDDKKRGRSTDSEVSQSPAKNGSKPVHSNQHPQSPAVPPTYPSG---PPPAASAL ..: .....:: :. . .: ::..: :: : . : :::.. .. KIAA15 PIQDSL--------SQAQTSQPPSPQVFSPGSSNSRPPSPMDPYAKMVGTPRPPPVGHSF 1310 1320 1330 1340 1350 260 270 280 290 300 FLJ004 S----TTPGNNGVP-APAAPPSALGPKAS--PAP-----SHNSGTPAPYAQAVAPPAP-- : ..: .: .: . .. : .. .. :.: : .. . :::. : : KIAA15 SRRNSAAPVENCTPLSSVSRPLQMNETTANRPSPVRDLCSSSTTNNDPYAKPPDTPRPVM 1360 1370 1380 1390 1400 1410 310 320 330 340 350 360 FLJ004 --SGP-STTQPRPPSVQPSGGGGGGSGGGGSSSSSNSSAGGGAGKQNGATSYSSVVADSP . : : : : :. . . : ..: .. .. : . .: ::. . .: KIAA15 TDQFPKSLGLSRSPVVSEQTAKGPIAAGTSDHFTKPSPRADVFQRQRIPDSYARPLL-TP 1420 1430 1440 1450 1460 1470 370 380 390 400 410 FLJ004 AEVALSSSGGNNASSQALGPPSGPHNPPPSTSKEPSAAAPTGAGGVAPGSGNNSGGP--- : . .:: :: . : .:::: :..: :.:. .: : : KIAA15 APL---DSGP--------GPFKTPMQPPPS-SQDPY-------GSVSQASRRLSVDPYER 1480 1490 1500 1510 420 430 440 450 460 FLJ004 SLLVPLPVN-------------PPSSPTPSFSDAKAAGALLNGPPQFSTAPEIKAP--EP :.: :.. :: .: :. ... : . . : . : . : .: KIAA15 PALTPRPIDNFSHNQSNDPYSQPPLTPHPAVNESFAHPSRAFSQPGTISRPTSQDPYSQP 1520 1530 1540 1550 1560 1570 470 480 490 500 510 520 FLJ004 LSSLKSMAERAAISSGIEDPVPTLHLTERDIILSSTSAPPASAQPPLQLSEVNIPLSLGV .. . ... . ::: : :. . : ::.. .: . :. : : KIAA15 PGTPRPVVDSYSQSSG----------TARSNT-DPYSQPPGTPRP----TTVD-PYSQQ- 1580 1590 1600 1610 1620 530 540 550 560 570 FLJ004 CPLGPVPLTKEQLYQQAMEEAAWHHMP--HPSDSERIRTSPG--TPVRRPPTTTRCHPHT : : : :. .:. . . : : :: . : :: .: .::.: : :. KIAA15 -PQTPRPSTQTDLFVTPVTNQR-HSDPYAHPPGTPR----PGISVPYSQPPATPR--PRI 1630 1640 1650 1660 1670 580 590 600 610 FLJ004 RTLWNSTSACRPRHSSSSSTIWRALRHSIWQPRP .. .: :: KIAA15 SEGFTRSSMTRPVLMPNQDPFLQAAQNRGPALPGPLVRPPDTCSQTPRPPGPGLSDTFSR 1680 1690 1700 1710 1720 1730 >>FLJ00201 ( 705 res) sj04110 (705 aa) initn: 268 init1: 134 opt: 225 Z-score: 103.0 bits: 29.4 E(): 1.5 Smith-Waterman score: 267; 26.852% identity (49.691% similar) in 324 aa overlap (193-485:69-379) 170 180 190 200 210 220 FLJ004 VATSPPSHSHMEDEIFNQSSSTPTSTTSSSPIPPSPANCTTENSEDDKKRGRSTDSEVSQ :.: : . : . : :. . . FLJ002 GYAPVKYIQPMQKGPVGPPFREGKGQYLEMPLPLLPMDLKGEPGPPGKPGPRGPPGPPG- 40 50 60 70 80 90 230 240 250 260 270 FLJ004 SPAKNG-SKP-VHSNQHPQSP--------AVPPTYPSG-PPPAASALSTTPGNNGVPAPA :.: : .:: .:.. : .: : :: :. ::. .: :: : . FLJ002 FPGKPGMGKPGLHGQPGPAGPPGFSRMGKAGPPGLPGKVGPPGQPGLRGEPGIRGDQGLR 100 110 120 130 140 150 280 290 300 310 320 330 FLJ004 APPSALGPKASPAPSHNSGTPAPYAQAV-APPAPSGPSTTQPRPPSVQPSGGGGGGSGGG .:: :: . :.:: . : ::.: .::. .: : .: :. : :..: FLJ002 GPP---GPPGLPGPSGITIPGKPGAQGVPGPPGFQGEPGPQGEPGP--PGDRGLKGDNGV 160 170 180 190 200 210 340 350 360 370 380 FLJ004 GSSSSSNSSAGGGAGKQNGATSYSSVVADSPAEVALSSSGGNNASSQALGPPS------- :. . .. . ::: : . ... .:. .: .. :... : : :. FLJ002 GQPGLPGAPGQGGAPGPPGLPGPAGL--GKPGLDGLPGAPGDKGESGPPGVPGPRGEPGA 220 230 240 250 260 270 390 400 410 420 430 FLJ004 -GPHNPP-------PSTSKEPSAAAPTGAGGVAPGSGNNSGGPSLLVPLPVNPPSSPTPS ::..:: :... :. .:.:: : ::. : :.:. : . :. : :. FLJ002 VGPKGPPGVDGVGVPGAAGLPGPQGPSGAKG-EPGT---RGPPGLIGPTGYGMPGLPGPK 280 290 300 310 320 440 450 460 470 480 490 FLJ004 FSDAKAAGA--LLN--GPPQFSTAPEIKAPEPLSSLKSMAERAAISSGIEDPVPTLHLTE .: ::. ::. : : . : ..:. :.. .. :.. . : : FLJ002 -GDRGPAGVPGLLGDRGEPGEDGEPGEQGPQGLGGPPGLPGSAGLPGRRGPPGPKGEAGP 330 340 350 360 370 380 500 510 520 530 540 550 FLJ004 RDIILSSTSAPPASAQPPLQLSEVNIPLSLGVCPLGPVPLTKEQLYQQAMEEAAWHHMPH FLJ002 GGPPGVPGIRGDQGPSGLAGKPGVPGERGLPGAHGPPGPTGPKGEPGFTGRPGGPGVAGA 390 400 410 420 430 440 >>KIAA1802 ( 821 res) fj21631 (821 aa) initn: 151 init1: 111 opt: 225 Z-score: 102.2 bits: 29.4 E(): 1.7 Smith-Waterman score: 286; 28.418% identity (50.402% similar) in 373 aa overlap (156-507:225-553) 130 140 150 160 170 180 FLJ004 KIKDDVEYYVDSSQDPDFEENEFLYDDLDLEDIPQALVATSPPSHSHMEDEIFNQSSSTP :.. .: .: ..::. . . :.:.: KIAA18 EPPKSVPVCESQKLAPVPSPEPQKPAPVSPESVKATLSNPKPQKQSHFPETLGPPSASSP 200 210 220 230 240 250 190 200 210 220 230 240 FLJ004 TSTT-SSSPIP--PSPANCTTENSEDDKKRGRSTDSEVSQSPAKNGSKPVHSNQHPQSPA : . ..:: : :::: : ...: .:.:. : . ... .: .: :: KIAA18 ESPVLAASPEPWGPSPA-----ASPESRKSARTTSPEPRKPSPSESPEP----WKP-FPA 260 270 280 290 300 250 260 270 280 290 FLJ004 VPPTYPSGPPPAASALSTTPGNNGVPAP--AAPPSALGP--KASPAPSHNSGTPAPYAQA : : : : ::.: : :: : : : . : .. :: :.:::: .:.:. KIAA18 VSPE-PRRPAPAVSPGSWKPGPPGSPRPWKSNPSASSGPWKPAKPAPSV---SPGPWK-- 310 320 330 340 350 300 310 320 330 340 350 FLJ004 VAPPAPS-GPSTTQPRPPSVQPSGGGGGGSGGGGSSSSSNSSAGGGAGKQNGATSYSSVV : :: .:. .: : ::. :.: ..::.. .. :. :. : KIAA18 ---PIPSVSPGPWKPTP-SVS-------------SASWKSSSVSPSSWKSPPASPES--W 360 370 380 390 360 370 380 390 400 410 FLJ004 ADSPAEVALSSSGGNNASSQALGPPSGPHNPPPSTSKEPSAAAPTGAGGVAPGSGNNSGG ..: :. .. . .:. :: .:. :. : .:.:. : . ::. KIAA18 KSGPPELRKTAPTLSPEHWKAV-PPVSPELRKPGPPLSPEIRSPAGS----PELRKPSGS 400 410 420 430 440 450 420 430 440 450 460 FLJ004 PSL--LVP--LPVNPPSSPTPSFSDAKAAGA--LLNGP----PQFSTAPEIKAPEPLSSL :.: : : ..: : : . .. .:. : .. :: . :: . : : : KIAA18 PDLWKLSPDQRKTSPASLDFPESQKSSRGGSPDLWKSSFFIEPQKPVFPETRKPGP--SG 460 470 480 490 500 510 470 480 490 500 510 520 FLJ004 KSMAERAAISSGIEDPVPTLHLTERDIIL---SSTSAPPASAQPPLQLSEVNIPLSLGVC : . .:: : : :: .. : : . .::::: . KIAA18 PSESPKAA--SDIWKPVLSIDTEPRKPALFPEPAKTAPPASPEARKRALFPEPRKHALFP 520 530 540 550 560 570 530 540 550 560 570 580 FLJ004 PLGPVPLTKEQLYQQAMEEAAWHHMPHPSDSERIRTSPGTPVRRPPTTTRCHPHTRTLWN KIAA18 ELPKSALFSESQKAVELGDELQIDAIDDQKCDILVQEELLASPKKLLEDTLFPSSKKLKK 580 590 600 610 620 630 >>KIAA1064 ( 1315 res) hj05008s1 (1315 aa) initn: 236 init1: 94 opt: 226 Z-score: 100.2 bits: 29.7 E(): 2.2 Smith-Waterman score: 240; 24.925% identity (50.150% similar) in 333 aa overlap (163-470:978-1302) 140 150 160 170 180 190 FLJ004 YYVDSSQDPDFEENEFLYDDLDLEDIPQALVATSPPSHSHMEDEIFNQSSSTPTSTTSSS :. : :: .. ..: . : ... KIAA10 AVNIPLDPLPGHPLRDPRSQLQQFSHIKKDVTLSKPSFARTV--LWNPEDLIPLPIPKQD 950 960 970 980 990 1000 200 210 220 230 240 250 FLJ004 PIPPSPANCTTENSEDDKKRGRSTDSEVSQSPAKNGSKPVHSNQHPQSPAVPPTYPSGPP .:: :: . . : . . :.. . .. . :.. :.: . : KIAA10 AVPPVPAALQSMPTLDPRLH-RAATAGPPNARQRPGASTDSSTQGANLPDFELLSRILKT 1010 1020 1030 1040 1050 1060 260 270 280 290 300 FLJ004 PAASALSTTPGNNGVPA-P---AAP--PSALGPKASPAPSHNSGTPAPYAQAVAPPA-PS :.. :..::.. :. : :: : : : : :. .. :.: :.: .: : :: KIAA10 VNATGSSAAPGSSDKPSDPRVRKAPTDPRLQKPTDSTASSR-AAKPGP-AEAPSPTASPS 1070 1080 1090 1100 1110 1120 310 320 330 340 350 360 FLJ004 G---PSTTQPRPPSVQPSGGGGGGSGGGGSSSSSNSSAGGGAGKQNGATSYSSVVADSPA : : .: : : : .:: : :.::: :: :. : . :. . . .::. : KIAA10 GDASPPATAPYDPRVLAAGGLGQGGGGGQSSVLSGISLYDPRTPNAGGKA-TEPAADTGA 1130 1140 1150 1160 1170 1180 370 380 390 400 FLJ004 EVALSSSGGNNASSQALGPP--------------SGPHNPPPSTSKEPSAAAPTGAGGVA . . ..:....:.: :: .: . : :.. : : ...: KIAA10 QPKGAEGNGKSSASKAKEPPFVRKSALEQPETGKAGADGGTP-TDRYNSYNRPRPKAAAA 1190 1200 1210 1220 1230 1240 410 420 430 440 450 460 FLJ004 PGSGNNSGGPSLLVPLPVNPPSSPTPS-FSDAKAAGALLNGPPQFSTAPEIKAPEPLSSL :.. . . : : : . . :.:. :. .: . .: : ...: .. . .:: KIAA10 PAATTATPPPEGAPPQP-GVHNLPVPTLFGTVKQTPKTGSGSPFAGNSPAREGEQDAASL 1250 1260 1270 1280 1290 470 480 490 500 510 520 FLJ004 KSMAERAAISSGIEDPVPTLHLTERDIILSSTSAPPASAQPPLQLSEVNIPLSLGVCPLG :.. KIAA10 KDVFKGFDPTASPFCQ 1300 1310 >>KIAA1668 ( 791 res) fh11717 (791 aa) initn: 133 init1: 82 opt: 216 Z-score: 99.3 bits: 28.8 E(): 2.5 Smith-Waterman score: 244; 22.222% identity (50.949% similar) in 369 aa overlap (159-512:206-554) 130 140 150 160 170 180 FLJ004 DDVEYYVDSSQDPDFEENEFLYDDLDLEDIPQALVATSPPSHSHMEDEIFNQSSSTPT-- :: . :.: .... :. . .. :: KIAA16 DAKDVPGGGPSSSAPAGAEADGPKASPEARPQ--IPTKPRVPGKLQ-ELASPPAGRPTPA 180 190 200 210 220 230 190 200 210 220 230 240 FLJ004 ---STTSSSPIPPSPANCTTENSEDDKKRGRSTDSEVSQSPAKNGSKPVHSNQHPQSPAV .. :..: ::.: .. ..:. ... :. : .. :: . . .:. KIAA16 PRKASESTTPAPPTPRPRSSLQQENLVEQAGSS----SLVNGRLHELPVPKPRGTPKPSE 240 250 260 270 280 250 260 270 280 290 300 FLJ004 PPTYPSGPPPAASALSTTPGNNGVPAPAAPPSALGPKASPAPS-HNSGTPAPYAQAVAPP : :: . ... : .. ::: : :. :: .. . . .:.:: . :: : KIAA16 GTPAPRKDPPWITLVQAEPKKK--PAPLPPSSSPGPPSQDSRQVENGGT-----EEVAQP 290 300 310 320 330 340 310 320 330 340 350 360 FLJ004 APSGPSTTQPRPPSVQPSGGGGGGSGGGGSSSSSNSSAGGGAGKQNGATSYSSVVADSPA .:.. ..: : . . .. : ..: . . . .. :. . ..:: KIAA16 SPTASLESKPYNPFEEEEEDKEEEAPAAPSLATSPALGHPESTPKSLHPWYGITPTSSPK 350 360 370 380 390 400 370 380 390 400 410 420 FLJ004 EVALSSSGGNNASSQALGPPSGPHNPPPSTSKEPSAAAPTGAGGVAPGSGNNSGGPSLLV . . .:: :: :. :::.. :. .. . .. :.....: :: KIAA16 TKKRPAPRAPSASPLALHASRLSHSEPPSATPSPALSVES----LSSESASQTAGAELLE 410 420 430 440 450 430 440 450 460 470 FLJ004 PLPVNPPSSPTPSFSDAKAAG--ALLNGPPQFSTAPEIKAPE----PLSSLKSMAERAAI : :. : :: :. . : . :. ..... :. :. : .: ..: :. KIAA16 P-PAVPKSSSEPAVHAPGTPGNPVSLSTNSSLASSGELVEPRVEQMPQAS-PGLAPRTRG 460 470 480 490 500 510 480 490 500 510 520 530 FLJ004 SSGIEDPVPTLHLTERDIILSSTSAP---PASAQPPLQLSEVNIPLSLGVCPLGPVPLTK ::: . : : ..: . .: :.:..: ::. 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