Comparison between the cloned and the revised DNA sequences

Cloned DNA sequence, length = 5313 bp
Revised DNA sequence, length = 3498 bp

<< Positions of primers used in RT-PCR experiment(s) >>

 1 : f NN06838   148 -   168     CTT CGG CCA GTA TCC TCT TCA
     r NN06839  2778 -  2758     GAT CGC AGT ACA TCT GTT CAA
 2 : f NN06840  2627 -  2647     ACA GCC AGC TCC ACG AAC AGT
     r NN08094  3074 -  3054     CAC AGA TAG GGC TTC CAC TTC
<< Positions of inserion/deletion/mutation(s) in the aligned sequence >>
 1 :   272 -  2108     1837-bp deletion  (in the revised sequence)
 2 :  2790 -  2811       22-bp insertion (in the revised sequence)
Predicted coding region: colored in green ( 77 - 2347 in the revised sequence).


*- Clone Name -*      1          .         .         .         .         . 50
fh04655               1 GTGCATTTCTAACCAGCTATCAGGAAGTTGCTGAATTTAAAATGTTGTCT 50
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
fh04655(revised)      1 GTGCATTTCTAACCAGCTATCAGGAAGTTGCTGAATTTAAAATGTTGTCT 50

                     51          .         .         .         .         . 100
fh04655              51 CTGTGGAGCCAGAAGATAGGCTTTAGATAGTCATAGTGATGTCTTTTTTA 100
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
fh04655(revised)     51 CTGTGGAGCCAGAAGATAGGCTTTAGATAGTCATAGTGATGTCTTTTTTA 100

                    101          .         .         .         .         . 150
fh04655             101 AAAAGTCTCTCTCTTTGCCTAGGAAAACCCTTTTGTAACAATGAGACCTT 150
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
fh04655(revised)    101 AAAAGTCTCTCTCTTTGCCTAGGAAAACCCTTTTGTAACAATGAGACCTT 150

                    151          .         .         .         .         . 200
fh04655             151 CGGCCAGTATCCTCTTCAGGTAAACGGTTATCGCAACTTAGACGAGTGTT 200
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
fh04655(revised)    151 CGGCCAGTATCCTCTTCAGGTAAACGGTTATCGCAACTTAGACGAGTGTT 200

                    201          .         .         .         .         . 250
fh04655             201 TGGAAGGGGCCATGGTGGAGGGTGATGTTGAGCTTCTTCCCTCCGATCAC 250
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
fh04655(revised)    201 TGGAAGGGGCCATGGTGGAGGGTGATGTTGAGCTTCTTCCCTCCGATCAC 250

                    251          .         .         .         .         . 300
fh04655             251 TCGGTGAAGTATGGACAAGAGGTACGTTGGAGATCTTTATTTGCTGTGCC 300
                        |||||||||||||||||||||                             
fh04655(revised)    251 TCGGTGAAGTATGGACAAGAG----------------------------- 271

                    301          .         .         .         .         . 350
fh04655             301 AGTGACAAAGCCAGTTAAGTAGGAGTGAGCTTTTGGGCAGACTAGTTTCC 350
                                                                          
fh04655(revised)    272 -------------------------------------------------- 272

                    351          .         .         .         .         . 400
fh04655             351 CATCACATATTAAGTAACTTTACACTTAGCAGAACTTGAATTTGTCTTAA 400
                                                                          
fh04655(revised)    272 -------------------------------------------------- 272

                    401          .         .         .         .         . 450
fh04655             401 GTCTCTCATCAGTTGATGTGAGTCAGTGAGTATCAGTACTTTGATAAATA 450
                                                                          
fh04655(revised)    272 -------------------------------------------------- 272

                    451          .         .         .         .         . 500
fh04655             451 ATTTTTACTAAAACTATGAATTTGAGTTACTCGTGTAAAGGTTGTATGCT 500
                                                                          
fh04655(revised)    272 -------------------------------------------------- 272

                    501          .         .         .         .         . 550
fh04655             501 GCTTCTGATGTTTTAAGTATGATCAAGTTTCTCTCTTTCTGTTGAAGCCT 550
                                                                          
fh04655(revised)    272 -------------------------------------------------- 272

                    551          .         .         .         .         . 600
fh04655             551 ACCTGTACCTGAGTAGGGAGAACCCACTGCCTCCATATTTTCGGAGGGTA 600
                                                                          
fh04655(revised)    272 -------------------------------------------------- 272

                    601          .         .         .         .         . 650
fh04655             601 AAAGTACAGTGATTAACTCCTATGGTATGCCATTTAGAATATTTTCCCTA 650
                                                                          
fh04655(revised)    272 -------------------------------------------------- 272

                    651          .         .         .         .         . 700
fh04655             651 TTATAGTATTTACTGTTCTCAATTGTAAATTCTGCCTTTGCTTTTAACAT 700
                                                                          
fh04655(revised)    272 -------------------------------------------------- 272

                    701          .         .         .         .         . 750
fh04655             701 TTTTAAAATTTAATTTTCATTTGTTTATTTATGTATCTATTTTTTTTTCT 750
                                                                          
fh04655(revised)    272 -------------------------------------------------- 272

                    751          .         .         .         .         . 800
fh04655             751 GGGTTGGAAAGACGGGGGAAGTTAAAGGGAGAGCATGGGTAGTTAACATC 800
                                                                          
fh04655(revised)    272 -------------------------------------------------- 272

                    801          .         .         .         .         . 850
fh04655             801 TCAGTATTCCAGTTAGGTTAAGAATTAGTGAATAGCATTTGTAACATAAT 850
                                                                          
fh04655(revised)    272 -------------------------------------------------- 272

                    851          .         .         .         .         . 900
fh04655             851 TCTTTACACAGTTGGGATTGTTCTCCATTGATCATACATTTTGAGACAAA 900
                                                                          
fh04655(revised)    272 -------------------------------------------------- 272

                    901          .         .         .         .         . 950
fh04655             901 ACTGTGGCTTATATATGATTCCAACTCAGTAATTACTATAGGAGAAAGTG 950
                                                                          
fh04655(revised)    272 -------------------------------------------------- 272

                    951          .         .         .         .         . 1000
fh04655             951 GAGCTTTCCTGAATTAAAATAGGGAGCCTAACATGAGCCATATGAAAATA 1000
                                                                          
fh04655(revised)    272 -------------------------------------------------- 272

                   1001          .         .         .         .         . 1050
fh04655            1001 CATTCACTGTAGAGCAGTGTTGGAACTCAGAGAGCTGCTGCCTCCCTGGA 1050
                                                                          
fh04655(revised)    272 -------------------------------------------------- 272

                   1051          .         .         .         .         . 1100
fh04655            1051 TTTTCAAGGAAAAACTGATTCCTAATGGAGGAATTACGTCATCTGTACCA 1100
                                                                          
fh04655(revised)    272 -------------------------------------------------- 272

                   1101          .         .         .         .         . 1150
fh04655            1101 TCTGTGCAAACCTGGTGCATCCTCTTACAAAAGAGGGAGTCTTCACCAGC 1150
                                                                          
fh04655(revised)    272 -------------------------------------------------- 272

                   1151          .         .         .         .         . 1200
fh04655            1151 TATACTTAGGCCTGTGGAGACCTGTATTCCAGGATGGGAATTCTATAAAA 1200
                                                                          
fh04655(revised)    272 -------------------------------------------------- 272

                   1201          .         .         .         .         . 1250
fh04655            1201 ATTAAACAAAACAACAAAATTGTCATGCTCATTTAGATTTCACCCTGAGG 1250
                                                                          
fh04655(revised)    272 -------------------------------------------------- 272

                   1251          .         .         .         .         . 1300
fh04655            1251 TGGTCTCACAGGCTGTGTGAATTCACCTCATTATGCTGACAGGGTATCTG 1300
                                                                          
fh04655(revised)    272 -------------------------------------------------- 272

                   1301          .         .         .         .         . 1350
fh04655            1301 AAGGGAATGTTGCTTGCACTTGTGGTAAAGGAAATATTTTAAAGCTGTTG 1350
                                                                          
fh04655(revised)    272 -------------------------------------------------- 272

                   1351          .         .         .         .         . 1400
fh04655            1351 ACAGGAACCTCAGACATACAGGTGAATTGAATAGAAAAGCCAAATCTGAT 1400
                                                                          
fh04655(revised)    272 -------------------------------------------------- 272

                   1401          .         .         .         .         . 1450
fh04655            1401 TTAGCTTTTCCTCACCTGTGATCCCTGACTGTTGAGTCTTTTTTATGTCA 1450
                                                                          
fh04655(revised)    272 -------------------------------------------------- 272

                   1451          .         .         .         .         . 1500
fh04655            1451 GTGCCTTCCTTCTTTGAAACTCAAGTAACATCGTAGGTTGATTTGACTGG 1500
                                                                          
fh04655(revised)    272 -------------------------------------------------- 272

                   1501          .         .         .         .         . 1550
fh04655            1501 CTTCTTTATGAGACCTCTGTAAGTTTTTGAAATTCAGAGATTTTTCTTAG 1550
                                                                          
fh04655(revised)    272 -------------------------------------------------- 272

                   1551          .         .         .         .         . 1600
fh04655            1551 AAATTGAGAAATTGTAAAACCATGAGGCTATTTCAAATTTCCTTTGTATA 1600
                                                                          
fh04655(revised)    272 -------------------------------------------------- 272

                   1601          .         .         .         .         . 1650
fh04655            1601 TATAAAGGAGATTCAAATTATGGTTAATAGACTAAAACAGCATGTAATAT 1650
                                                                          
fh04655(revised)    272 -------------------------------------------------- 272

                   1651          .         .         .         .         . 1700
fh04655            1651 ATGTACACATATGAGTCTTTTTAGCTGGCACATGGAGTTGTCTCTTTAGC 1700
                                                                          
fh04655(revised)    272 -------------------------------------------------- 272

                   1701          .         .         .         .         . 1750
fh04655            1701 TACATGCTGCTTCGATCATAATTTCATATTCTGTAGTTAGGCTAGCTGTT 1750
                                                                          
fh04655(revised)    272 -------------------------------------------------- 272

                   1751          .         .         .         .         . 1800
fh04655            1751 AAGTTTTTAAACCTCTTCTGAATACTGATGATGTAACGAATGAGTTATGT 1800
                                                                          
fh04655(revised)    272 -------------------------------------------------- 272

                   1801          .         .         .         .         . 1850
fh04655            1801 AGATGCTTAGTGCGGTTCACATATTCAAGGGTGGTTTATTCTGAGGATGA 1850
                                                                          
fh04655(revised)    272 -------------------------------------------------- 272

                   1851          .         .         .         .         . 1900
fh04655            1851 TGGTTGAGTAAAATTCTGTTGACTGGCTAGTAAATTTGGAGTCTTGAGGA 1900
                                                                          
fh04655(revised)    272 -------------------------------------------------- 272

                   1901          .         .         .         .         . 1950
fh04655            1901 ATGTTGAACCATATTCTGTAAGAGAATGAGATTCTAAGTGTTGATTCCCT 1950
                                                                          
fh04655(revised)    272 -------------------------------------------------- 272

                   1951          .         .         .         .         . 2000
fh04655            1951 TTAGTGTTTGGGATAAAAAAAAGTTCTAGTATGAGTTTGCCTTGAGTATA 2000
                                                                          
fh04655(revised)    272 -------------------------------------------------- 272

                   2001          .         .         .         .         . 2050
fh04655            2001 AGTTCTATACCAAAGGAAGAAACTTTAATGAGAGATATTTTAAATCTGGT 2050
                                                                          
fh04655(revised)    272 -------------------------------------------------- 272

                   2051          .         .         .         .         . 2100
fh04655            2051 TATTGTAATTTCCTAAAATTAATTTTTCTTTCTCTCACATTTCTACTCTT 2100
                                                                          
fh04655(revised)    272 -------------------------------------------------- 272

                   2101          .         .         .         .         . 2150
fh04655            2101 GACACTAGCGTTGGTTTACAAAGCTACCTCCAGTGTTGACCTTTGAACTC 2150
                                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
fh04655(revised)    272 --------CGTTGGTTTACAAAGCTACCTCCAGTGTTGACCTTTGAACTC 313

                   2151          .         .         .         .         . 2200
fh04655            2151 TCAAGATTTGAGTTTAATCAGTCCCTTGGGCAGCCAGAGAAAATTCACAA 2200
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
fh04655(revised)    314 TCAAGATTTGAGTTTAATCAGTCCCTTGGGCAGCCAGAGAAAATTCACAA 363

                   2201          .         .         .         .         . 2250
fh04655            2201 TAAGCTGGAATTTCCTCAGATTATTTATATGGACAGGTACATGTACAGGA 2250
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
fh04655(revised)    364 TAAGCTGGAATTTCCTCAGATTATTTATATGGACAGGTACATGTACAGGA 413

                   2251          .         .         .         .         . 2300
fh04655            2251 GCAAGGAGCTTATTCGAAATAAGAGAGAGTGTATTCGAAAGTTGAAGGAG 2300
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
fh04655(revised)    414 GCAAGGAGCTTATTCGAAATAAGAGAGAGTGTATTCGAAAGTTGAAGGAG 463

                   2301          .         .         .         .         . 2350
fh04655            2301 GAAATAAAAATTCTGCAGCAAAAATTGGAAAGGTATGTGAAATATGGCTC 2350
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
fh04655(revised)    464 GAAATAAAAATTCTGCAGCAAAAATTGGAAAGGTATGTGAAATATGGCTC 513

                   2351          .         .         .         .         . 2400
fh04655            2351 AGGCCCAGCTCGGTTCCCGCTCCCGGACATGCTGAAATATGTTATTGAAT 2400
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
fh04655(revised)    514 AGGCCCAGCTCGGTTCCCGCTCCCGGACATGCTGAAATATGTTATTGAAT 563

                   2401          .         .         .         .         . 2450
fh04655            2401 TTGCTAGTACAAAACCTGCCTCAGAAAGCTGTCCACCTGAAAGTGACACA 2450
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
fh04655(revised)    564 TTGCTAGTACAAAACCTGCCTCAGAAAGCTGTCCACCTGAAAGTGACACA 613

                   2451          .         .         .         .         . 2500
fh04655            2451 CATATGACATTACCACTTTCTTCAGTGCACTGCTCGGTTTCTGACCAGAC 2500
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
fh04655(revised)    614 CATATGACATTACCACTTTCTTCAGTGCACTGCTCGGTTTCTGACCAGAC 663

                   2501          .         .         .         .         . 2550
fh04655            2501 ATCCAAGGAAAGTACAAGTACAGAAAGCTCTTCTCAGGATGTTGAAAGTA 2550
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
fh04655(revised)    664 ATCCAAGGAAAGTACAAGTACAGAAAGCTCTTCTCAGGATGTTGAAAGTA 713

                   2551          .         .         .         .         . 2600
fh04655            2551 CCTTTTCTTCTCCTGAAGATTCTTTACCCAAGTCTAAACCACTGACATCT 2600
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
fh04655(revised)    714 CCTTTTCTTCTCCTGAAGATTCTTTACCCAAGTCTAAACCACTGACATCT 763

                   2601          .         .         .         .         . 2650
fh04655            2601 TCTCGGTCTTCCATGGAAATGCCTTCACAGCCAGCTCCACGAACAGTCAC 2650
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
fh04655(revised)    764 TCTCGGTCTTCCATGGAAATGCCTTCACAGCCAGCTCCACGAACAGTCAC 813

                   2651          .         .         .         .         . 2700
fh04655            2651 AGATGAGGAGATAAATTTTGTTAAGACCTGTCTTCAGAGATGGAGGAGTG 2700
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
fh04655(revised)    814 AGATGAGGAGATAAATTTTGTTAAGACCTGTCTTCAGAGATGGAGGAGTG 863

                   2701          .         .         .         .         . 2750
fh04655            2701 AGATTGAACAAGATATACAAGATTTAAAGACTTGTATTGCAAGTACTACT 2750
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
fh04655(revised)    864 AGATTGAACAAGATATACAAGATTTAAAGACTTGTATTGCAAGTACTACT 913

                   2751          .         .         .         .         . 2800
fh04655            2751 CAGACTATTGAACAGATGTACTGCGATCCTCTCCTTCGT----------- 2789
                        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           
fh04655(revised)    914 CAGACTATTGAACAGATGTACTGCGATCCTCTCCTTCGTCAGGTGCCTTA 963

                   2801          .         .         .         .         . 2850
fh04655            2790 -----------CAGTTCTTGTTCATGAAGGACAAGCAAATGCTGGACACT 2828
                                   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
fh04655(revised)    964 TCGCTTGCATGCAGTTCTTGTTCATGAAGGACAAGCAAATGCTGGACACT 1013

                   2851          .         .         .         .         . 2900
fh04655            2829 ATTGGGCCTATATCTATAATCAACCCCGACAGAGCTGGCTCAAGTACAAT 2878
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
fh04655(revised)   1014 ATTGGGCCTATATCTATAATCAACCCCGACAGAGCTGGCTCAAGTACAAT 1063

                   2901          .         .         .         .         . 2950
fh04655            2879 GACATCTCTGTTACTGAATCTTCCTGGGAAGAAGTTGAAAGAGATTCCTA 2928
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
fh04655(revised)   1064 GACATCTCTGTTACTGAATCTTCCTGGGAAGAAGTTGAAAGAGATTCCTA 1113

                   2951          .         .         .         .         . 3000
fh04655            2929 TGGAGGCCTGAGAAATGTTAGTGCTTACTGTCTGATGTACATTAATGACA 2978
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
fh04655(revised)   1114 TGGAGGCCTGAGAAATGTTAGTGCTTACTGTCTGATGTACATTAATGACA 1163

                   3001          .         .         .         .         . 3050
fh04655            2979 AACTACCCTACTTCAATGCAGAGGCAGCCCCAACTGAATCAGATCAAATG 3028
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
fh04655(revised)   1164 AACTACCCTACTTCAATGCAGAGGCAGCCCCAACTGAATCAGATCAAATG 1213

                   3051          .         .         .         .         . 3100
fh04655            3029 TCAGAAGTGGAAGCCCTATCTGTGGAACTCAAGCATTACATTCAGGAGGA 3078
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
fh04655(revised)   1214 TCAGAAGTGGAAGCCCTATCTGTGGAACTCAAGCATTACATTCAGGAGGA 1263

                   3101          .         .         .         .         . 3150
fh04655            3079 TAACTGGCGGTTTGAGCAGGAAGTAGAGGAGTGGGAAGAAGAGCAGTCTT 3128
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
fh04655(revised)   1264 TAACTGGCGGTTTGAGCAGGAAGTAGAGGAGTGGGAAGAAGAGCAGTCTT 1313

                   3151          .         .         .         .         . 3200
fh04655            3129 GCAAAATCCCTCAAATGGAGTCCTCCACCAACTCCTCATCACAGGACTAC 3178
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
fh04655(revised)   1314 GCAAAATCCCTCAAATGGAGTCCTCCACCAACTCCTCATCACAGGACTAC 1363

                   3201          .         .         .         .         . 3250
fh04655            3179 TCTACATCACAAGAGCCTTCAGTAGCCTCTTCTCATGGGGTTCGCTGCTT 3228
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
fh04655(revised)   1364 TCTACATCACAAGAGCCTTCAGTAGCCTCTTCTCATGGGGTTCGCTGCTT 1413

                   3251          .         .         .         .         . 3300
fh04655            3229 GTCATCTGAGCATGCTGTGATTGTAAAGGAGCAAACTGCCCAGGCTATTG 3278
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
fh04655(revised)   1414 GTCATCTGAGCATGCTGTGATTGTAAAGGAGCAAACTGCCCAGGCTATTG 1463

                   3301          .         .         .         .         . 3350
fh04655            3279 CAAACACAGCCCGTGCCTATGAGAAGAGCGGTGTAGAAGCGGCACTGAGT 3328
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
fh04655(revised)   1464 CAAACACAGCCCGTGCCTATGAGAAGAGCGGTGTAGAAGCGGCACTGAGT 1513

                   3351          .         .         .         .         . 3400
fh04655            3329 GAGGCATTCCATGAAGAATACTCCAGGCTCTATCAGCTTGCCAAAGAGAC 3378
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
fh04655(revised)   1514 GAGGCATTCCATGAAGAATACTCCAGGCTCTATCAGCTTGCCAAAGAGAC 1563

                   3401          .         .         .         .         . 3450
fh04655            3379 CCCCACCTCTCACAGTGATCCTCGACTTCAGCATGTCCTTGTCTACTTTT 3428
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
fh04655(revised)   1564 CCCCACCTCTCACAGTGATCCTCGACTTCAGCATGTCCTTGTCTACTTTT 1613

                   3451          .         .         .         .         . 3500
fh04655            3429 TCCAAAATGAAGCACCCAAAAGGGTAGTAGAACGAACCCTTCTGGAACAG 3478
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
fh04655(revised)   1614 TCCAAAATGAAGCACCCAAAAGGGTAGTAGAACGAACCCTTCTGGAACAG 1663

                   3501          .         .         .         .         . 3550
fh04655            3479 TTTGCAGATAAAAATCTTAGCTATGATGAAAGATCAATCAGCATTATGAA 3528
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
fh04655(revised)   1664 TTTGCAGATAAAAATCTTAGCTATGATGAAAGATCAATCAGCATTATGAA 1713

                   3551          .         .         .         .         . 3600
fh04655            3529 GGTGGCTCAAGCGAAACTGAAGGAAATTGGTCCAGATGACATGAATATGG 3578
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
fh04655(revised)   1714 GGTGGCTCAAGCGAAACTGAAGGAAATTGGTCCAGATGACATGAATATGG 1763

                   3601          .         .         .         .         . 3650
fh04655            3579 AAGAGTACAAGAAGTGGCATGAAGATTATAGTTTGTTCCGAAAAGTGTCT 3628
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
fh04655(revised)   1764 AAGAGTACAAGAAGTGGCATGAAGATTATAGTTTGTTCCGAAAAGTGTCT 1813

                   3651          .         .         .         .         . 3700
fh04655            3629 GTGTATCTCCTAACAGGCCTAGAACTCTATCAAAAAGGAAAGTACCAAGA 3678
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
fh04655(revised)   1814 GTGTATCTCCTAACAGGCCTAGAACTCTATCAAAAAGGAAAGTACCAAGA 1863

                   3701          .         .         .         .         . 3750
fh04655            3679 GGCACTTTCCTACCTGGTATATGCCTACCAGAGCAATGCTGCCCTGCTGA 3728
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
fh04655(revised)   1864 GGCACTTTCCTACCTGGTATATGCCTACCAGAGCAATGCTGCCCTGCTGA 1913

                   3751          .         .         .         .         . 3800
fh04655            3729 TGAAGGGGCCCCGCCGGGGGGTCAAAGAATCCGTGATTGCTTTATACCGA 3778
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
fh04655(revised)   1914 TGAAGGGGCCCCGCCGGGGGGTCAAAGAATCCGTGATTGCTTTATACCGA 1963

                   3801          .         .         .         .         . 3850
fh04655            3779 AGAAAATGCCTTCTGGAGCTGAATGCCAAAGCAGCTTCTCTTTTTGAAAC 3828
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
fh04655(revised)   1964 AGAAAATGCCTTCTGGAGCTGAATGCCAAAGCAGCTTCTCTTTTTGAAAC 2013

                   3851          .         .         .         .         . 3900
fh04655            3829 AAATGATGATCACTCCGTAACTGAGGGCATTAATGTGATGAATGAACTGA 3878
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
fh04655(revised)   2014 AAATGATGATCACTCCGTAACTGAGGGCATTAATGTGATGAATGAACTGA 2063

                   3901          .         .         .         .         . 3950
fh04655            3879 TCATCCCCTGCATTCACCTTATCATTAATAATGACATTTCCAAGGATGAT 3928
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
fh04655(revised)   2064 TCATCCCCTGCATTCACCTTATCATTAATAATGACATTTCCAAGGATGAT 2113

                   3951          .         .         .         .         . 4000
fh04655            3929 CTGGATGCCATTGAGGTCATGAGAAACCATTGGTGCTCTTACCTTGGGCA 3978
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
fh04655(revised)   2114 CTGGATGCCATTGAGGTCATGAGAAACCATTGGTGCTCTTACCTTGGGCA 2163

                   4001          .         .         .         .         . 4050
fh04655            3979 AGATATTGCAGAAAATCTGCAGCTGTGCCTAGGGGAGTTTCTACCCAGAC 4028
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
fh04655(revised)   2164 AGATATTGCAGAAAATCTGCAGCTGTGCCTAGGGGAGTTTCTACCCAGAC 2213

                   4051          .         .         .         .         . 4100
fh04655            4029 TTCTAGATCCTTCTGCAGAAATCATCGTCTTGAAAGAGCCTCCAACTATT 4078
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
fh04655(revised)   2214 TTCTAGATCCTTCTGCAGAAATCATCGTCTTGAAAGAGCCTCCAACTATT 2263

                   4101          .         .         .         .         . 4150
fh04655            4079 CGACCCAATTCTCCCTATGACCTATGTAGCCGATTTGCAGCTGTCATGGA 4128
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
fh04655(revised)   2264 CGACCCAATTCTCCCTATGACCTATGTAGCCGATTTGCAGCTGTCATGGA 2313

                   4151          .         .         .         .         . 4200
fh04655            4129 GTCAATTCAGGGAGTTTCAACTGTGACAGTGAAATAAGCTCCCACATGTT 4178
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
fh04655(revised)   2314 GTCAATTCAGGGAGTTTCAACTGTGACAGTGAAATAAGCTCCCACATGTT 2363

                   4201          .         .         .         .         . 4250
fh04655            4179 CAAGGCCCATTCTGGTTCCTGGCTGCCTGCCTCTTGCACAGAAGTTCGTT 4228
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
fh04655(revised)   2364 CAAGGCCCATTCTGGTTCCTGGCTGCCTGCCTCTTGCACAGAAGTTCGTT 2413

                   4251          .         .         .         .         . 4300
fh04655            4229 GTCATAGTGCTCACCTTGGGAAAAGGATTAGGTGGGCACATAAGATTCCG 4278
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
fh04655(revised)   2414 GTCATAGTGCTCACCTTGGGAAAAGGATTAGGTGGGCACATAAGATTCCG 2463

                   4301          .         .         .         .         . 4350
fh04655            4279 ATCAGACCCCAACCATGCTGCATGTGTAAAGAAGGATTGAAAATAAAATT 4328
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
fh04655(revised)   2464 ATCAGACCCCAACCATGCTGCATGTGTAAAGAAGGATTGAAAATAAAATT 2513

                   4351          .         .         .         .         . 4400
fh04655            4329 GCACTTTTTAGGTACAAAATCATAAAAGCTGTTTCACTAGAAAAGGCAGA 4378
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
fh04655(revised)   2514 GCACTTTTTAGGTACAAAATCATAAAAGCTGTTTCACTAGAAAAGGCAGA 2563

                   4401          .         .         .         .         . 4450
fh04655            4379 AAGCAGTGTATTAAGGTGTTGAATTACGCCAGAAGACCTGAAATGCCTTG 4428
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
fh04655(revised)   2564 AAGCAGTGTATTAAGGTGTTGAATTACGCCAGAAGACCTGAAATGCCTTG 2613

                   4451          .         .         .         .         . 4500
fh04655            4429 TACCTACAACAATGCTTAGGCTTTTCTAAGCCTCTTGCCACTTTTAAAAT 4478
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
fh04655(revised)   2614 TACCTACAACAATGCTTAGGCTTTTCTAAGCCTCTTGCCACTTTTAAAAT 2663

                   4501          .         .         .         .         . 4550
fh04655            4479 TATCCTTCAGGCATAAATATTTTTGACAGCAGAATAGAAGAATGATTCAT 4528
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
fh04655(revised)   2664 TATCCTTCAGGCATAAATATTTTTGACAGCAGAATAGAAGAATGATTCAT 2713

                   4551          .         .         .         .         . 4600
fh04655            4529 GAGAACCTGAACCAGATGAACAGCTACTAGTTATTTTATCAAATACAGAT 4578
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
fh04655(revised)   2714 GAGAACCTGAACCAGATGAACAGCTACTAGTTATTTTATCAAATACAGAT 2763

                   4601          .         .         .         .         . 4650
fh04655            4579 GACATTTAAAAATTCTTAACTACAAGAGATTAGAAATATAAACCTTGCCT 4628
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
fh04655(revised)   2764 GACATTTAAAAATTCTTAACTACAAGAGATTAGAAATATAAACCTTGCCT 2813

                   4651          .         .         .         .         . 4700
fh04655            4629 GGCTCTTGCCAGGAGATAACAAAATGGGTTGCTGATGAACTGCACCCTTT 4678
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
fh04655(revised)   2814 GGCTCTTGCCAGGAGATAACAAAATGGGTTGCTGATGAACTGCACCCTTT 2863

                   4701          .         .         .         .         . 4750
fh04655            4679 TACATGTGGGTAGAATATAAGCTCACATGGCAGTGAGATGTTGAAAAGTC 4728
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
fh04655(revised)   2864 TACATGTGGGTAGAATATAAGCTCACATGGCAGTGAGATGTTGAAAAGTC 2913

                   4751          .         .         .         .         . 4800
fh04655            4729 AAAAGAGACCTGTCTCTCTCCTTTCTTTTCTATCTTTAAACCAGAAAACC 4778
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
fh04655(revised)   2914 AAAAGAGACCTGTCTCTCTCCTTTCTTTTCTATCTTTAAACCAGAAAACC 2963

                   4801          .         .         .         .         . 4850
fh04655            4779 TCATACTCAGTCCTCAGTGAAAGAAAGTAAAGTATTAAGGACTTTAGACA 4828
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
fh04655(revised)   2964 TCATACTCAGTCCTCAGTGAAAGAAAGTAAAGTATTAAGGACTTTAGACA 3013

                   4851          .         .         .         .         . 4900
fh04655            4829 GAAGAGCATTGTGTAACTTGACTGAAGATCATCCATTAATAGTTATTAGG 4878
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
fh04655(revised)   3014 GAAGAGCATTGTGTAACTTGACTGAAGATCATCCATTAATAGTTATTAGG 3063

                   4901          .         .         .         .         . 4950
fh04655            4879 CATTTAGGTAAAATTTTCTAATACCTAAAAATTGTCAAAAACAGTCAATA 4928
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
fh04655(revised)   3064 CATTTAGGTAAAATTTTCTAATACCTAAAAATTGTCAAAAACAGTCAATA 3113

                   4951          .         .         .         .         . 5000
fh04655            4929 GGGCTACTGCTGGCCCAAAGACCATTTAGGTCCACCTCCTCTTTTTTGCT 4978
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
fh04655(revised)   3114 GGGCTACTGCTGGCCCAAAGACCATTTAGGTCCACCTCCTCTTTTTTGCT 3163

                   5001          .         .         .         .         . 5050
fh04655            4979 CTTTTTTTTTTTCTGTGACAGTTTCACTGTGTCGCCCAGGCTGGCGTTCA 5028
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
fh04655(revised)   3164 CTTTTTTTTTTTCTGTGACAGTTTCACTGTGTCGCCCAGGCTGGCGTTCA 3213

                   5051          .         .         .         .         . 5100
fh04655            5029 GTGGTGCAATCTCAGCTCACTGCAAACTCTGTCTCCTGGGCTCAAGTGAT 5078
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
fh04655(revised)   3214 GTGGTGCAATCTCAGCTCACTGCAAACTCTGTCTCCTGGGCTCAAGTGAT 3263

                   5101          .         .         .         .         . 5150
fh04655            5079 TCTCGTGCCTCAGCCTCCCGAATAGCTGGAATTACGGGCATGCACCACCA 5128
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
fh04655(revised)   3264 TCTCGTGCCTCAGCCTCCCGAATAGCTGGAATTACGGGCATGCACCACCA 3313

                   5151          .         .         .         .         . 5200
fh04655            5129 CACCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAATAGAGATGGGGTTTCACCATATTG 5178
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
fh04655(revised)   3314 CACCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAATAGAGATGGGGTTTCACCATATTG 3363

                   5201          .         .         .         .         . 5250
fh04655            5179 GCCAGGCTGATCTCTAACTCCTGGCCTCAAGTGATCTATCTGCCTCCCTC 5228
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
fh04655(revised)   3364 GCCAGGCTGATCTCTAACTCCTGGCCTCAAGTGATCTATCTGCCTCCCTC 3413

                   5251          .         .         .         .         . 5300
fh04655            5229 AGCCTCCCAAAGTCTGGGATTGCAGACAAGTCATCGTACCCGGCCTTCTT 5278
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
fh04655(revised)   3414 AGCCTCCCAAAGTCTGGGATTGCAGACAAGTCATCGTACCCGGCCTTCTT 3463

                   5301          .         .         .      5335
fh04655            5279 TTTTGCCCTTAAAAGTAAGGGATGTGGGTTTGTAC 5313
                        |||||||||||||||||||||||||||||||||||
fh04655(revised)   3464 TTTTGCCCTTAAAAGTAAGGGATGTGGGTTTGTAC 3498