Comparison between the cloned and the revised DNA sequences

Cloned DNA sequence, length = 6169 bp
Revised DNA sequence, length = 5579 bp

<< Positions of primers used in RT-PCR experiment(s) >>

 1 : f NN05064  1422 -  1442     TAC CGT TCA TCG CCG TCA CCA
     r NN05065  1921 -  1901     CTC AAC CTT TTC CGC TGC CCG
 2 : f NN06355  1815 -  1835     TCT ACT TCT CCC TCA CTA CCG
     r NN06356  2810 -  2790     GCC TCA AGG TCA TGG TCA AGA
<< Positions of inserion/deletion/mutation(s) in the aligned sequence >>
 1 :  1730 -  1730        1-bp mutation  (in the revised sequence)
 2 :  2007 -  2218      212-bp deletion  (in the revised sequence)
 3 :  2357 -  2734      378-bp deletion  (in the revised sequence)
Predicted coding region: colored in green ( 2 - 2449 in the revised sequence).


*- Clone Name -*      1          .         .         .         .         . 50
hg03944               1 GGACCCCGGTGTCTGGCTTCCCCCGAGCCGGGACCCCGCGATGGCCAAGC 50
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)      1 GGACCCCGGTGTCTGGCTTCCCCCGAGCCGGGACCCCGCGATGGCCAAGC 50

                     51          .         .         .         .         . 100
hg03944              51 GCAGCTCGCTGTACATCCGCATCGTGGAGGGGAAGAACCTTCCCGCCAAG 100
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)     51 GCAGCTCGCTGTACATCCGCATCGTGGAGGGGAAGAACCTTCCCGCCAAG 100

                    101          .         .         .         .         . 150
hg03944             101 GACATCACTGGCAGCAGCGACCCCTACTGCATCGTGAAGGTGGACAATGA 150
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)    101 GACATCACTGGCAGCAGCGACCCCTACTGCATCGTGAAGGTGGACAATGA 150

                    151          .         .         .         .         . 200
hg03944             151 GCCCATCATCAGGACAGCCACAGTGTGGAAGACCCTGTGCCCCTTCTGGG 200
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)    151 GCCCATCATCAGGACAGCCACAGTGTGGAAGACCCTGTGCCCCTTCTGGG 200

                    201          .         .         .         .         . 250
hg03944             201 GTGAGGAGTACCAAGTGCACCTGCCGCCCACCTTCCACGCTGTGGCTTTC 250
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)    201 GTGAGGAGTACCAAGTGCACCTGCCGCCCACCTTCCACGCTGTGGCTTTC 250

                    251          .         .         .         .         . 300
hg03944             251 TATGTCATGGATGAGGATGCCCTCAGCCGGGACGACGTTATCGGAAAGGT 300
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)    251 TATGTCATGGATGAGGATGCCCTCAGCCGGGACGACGTTATCGGAAAGGT 300

                    301          .         .         .         .         . 350
hg03944             301 CTGCCTTACAAGGGACACCATAGCCTCTCACCCTAAGGGTTTCAGCGGGT 350
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)    301 CTGCCTTACAAGGGACACCATAGCCTCTCACCCTAAGGGTTTCAGCGGGT 350

                    351          .         .         .         .         . 400
hg03944             351 GGGCCCACCTGACGGAGGTCGACCCCGACGAGGAGGTGCAGGGCGAGATC 400
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)    351 GGGCCCACCTGACGGAGGTCGACCCCGACGAGGAGGTGCAGGGCGAGATC 400

                    401          .         .         .         .         . 450
hg03944             401 CACCTGCGGCTGGAAGTGTGGCCAGGGGCCCGGGCCTGCCGGCTACGCTG 450
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)    401 CACCTGCGGCTGGAAGTGTGGCCAGGGGCCCGGGCCTGCCGGCTACGCTG 450

                    451          .         .         .         .         . 500
hg03944             451 CTCTGTGCTGGAGGCCAGGGATCTGGCCCCAAAGGACCGCAATGGCACAT 500
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)    451 CTCTGTGCTGGAGGCCAGGGATCTGGCCCCAAAGGACCGCAATGGCACAT 500

                    501          .         .         .         .         . 550
hg03944             501 CTGACCCCTTCGTCCGAGTGCGCTACAAGGGCCGGACACGGGAGACCTCG 550
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)    501 CTGACCCCTTCGTCCGAGTGCGCTACAAGGGCCGGACACGGGAGACCTCG 550

                    551          .         .         .         .         . 600
hg03944             551 ATCGTGAAGAAGTCATGCTACCCACGCTGGAATGAGACGTTTGAATTTGA 600
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)    551 ATCGTGAAGAAGTCATGCTACCCACGCTGGAATGAGACGTTTGAATTTGA 600

                    601          .         .         .         .         . 650
hg03944             601 GCTGCAGGAGGGGGCCATGGAGGCACTGTGCGTGGAGGCCTGGGACTGGG 650
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)    601 GCTGCAGGAGGGGGCCATGGAGGCACTGTGCGTGGAGGCCTGGGACTGGG 650

                    651          .         .         .         .         . 700
hg03944             651 ACCTTGTCAGCCGAAACGACTTCCTGGGCAAAGTGGTGATTGATGTCCAG 700
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)    651 ACCTTGTCAGCCGAAACGACTTCCTGGGCAAAGTGGTGATTGATGTCCAG 700

                    701          .         .         .         .         . 750
hg03944             701 AGACTGCGGGTGGTGCAGCAGGAGGAGGGCTGGTTCCGGCTGCAGCCCGA 750
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)    701 AGACTGCGGGTGGTGCAGCAGGAGGAGGGCTGGTTCCGGCTGCAGCCCGA 750

                    751          .         .         .         .         . 800
hg03944             751 CCAGTCCAAGAGCCGGCGGCATGACGAGGGCAACCTGGGCTCCTTGCAGC 800
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)    751 CCAGTCCAAGAGCCGGCGGCATGACGAGGGCAACCTGGGCTCCTTGCAGC 800

                    801          .         .         .         .         . 850
hg03944             801 TGGAGGTGCGGCTGCGGGACGAGACGGTGCTGCCCTCCAGCTACTACCAG 850
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)    801 TGGAGGTGCGGCTGCGGGACGAGACGGTGCTGCCCTCCAGCTACTACCAG 850

                    851          .         .         .         .         . 900
hg03944             851 CCACTGGTGCACCTGCTGTGCCACGAGGTCAAGCTGGGCATGCAGGGCCC 900
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)    851 CCACTGGTGCACCTGCTGTGCCACGAGGTCAAGCTGGGCATGCAGGGCCC 900

                    901          .         .         .         .         . 950
hg03944             901 AGGGCAGCTGATCCCACTCATCGAGGAGACAACCAGCACCGAGTGTCGCC 950
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)    901 AGGGCAGCTGATCCCACTCATCGAGGAGACAACCAGCACCGAGTGTCGCC 950

                    951          .         .         .         .         . 1000
hg03944             951 AGGACGTGGCCACGAACCTGCTCAAGCTCTTCCTGGGGCAGGGGCTGGCC 1000
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)    951 AGGACGTGGCCACGAACCTGCTCAAGCTCTTCCTGGGGCAGGGGCTGGCC 1000

                   1001          .         .         .         .         . 1050
hg03944            1001 AAGGACTTCCTGGACCTGCTCTTCCAGCTGGAGCTGAGTCGCACCAGTGA 1050
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)   1001 AAGGACTTCCTGGACCTGCTCTTCCAGCTGGAGCTGAGTCGCACCAGTGA 1050

                   1051          .         .         .         .         . 1100
hg03944            1051 GACCAACACCCTGTTCCGGAGCAACTCTCTGGCCTCAAAGTCCATGGAGT 1100
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)   1051 GACCAACACCCTGTTCCGGAGCAACTCTCTGGCCTCAAAGTCCATGGAGT 1100

                   1101          .         .         .         .         . 1150
hg03944            1101 CTTTTCTGAAGGTGGCCGGGATGCAGTACCTGCACGGCGTCCTGGGCCCC 1150
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)   1101 CTTTTCTGAAGGTGGCCGGGATGCAGTACCTGCACGGCGTCCTGGGCCCC 1150

                   1151          .         .         .         .         . 1200
hg03944            1151 ATCATCAACAAGGTGTTTGAGGAGAAGAAGTACGTGGAGCTGGACCCCAG 1200
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)   1151 ATCATCAACAAGGTGTTTGAGGAGAAGAAGTACGTGGAGCTGGACCCCAG 1200

                   1201          .         .         .         .         . 1250
hg03944            1201 CAAAGTGGAAGTTAAGGATGTAGGGTGCTCCGGGCTGCACCGCCCGCAGA 1250
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)   1201 CAAAGTGGAAGTTAAGGATGTAGGGTGCTCCGGGCTGCACCGCCCGCAGA 1250

                   1251          .         .         .         .         . 1300
hg03944            1251 CCGAGGCCGAGGTGCTGGAGCAGAGCGCGCAGACGCTGCGCGCCCACCTG 1300
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)   1251 CCGAGGCCGAGGTGCTGGAGCAGAGCGCGCAGACGCTGCGCGCCCACCTG 1300

                   1301          .         .         .         .         . 1350
hg03944            1301 GGGGCCCTGCTGAGCGCGCTCAGCCGCTCGGTTCGCGCGTGCCCCGCCGT 1350
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)   1301 GGGGCCCTGCTGAGCGCGCTCAGCCGCTCGGTTCGCGCGTGCCCCGCCGT 1350

                   1351          .         .         .         .         . 1400
hg03944            1351 GGTGCGCGCCACCTTCCGCCAGCTCTTCCGGCGCGTGCGCGAGCGCTTCC 1400
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)   1351 GGTGCGCGCCACCTTCCGCCAGCTCTTCCGGCGCGTGCGCGAGCGCTTCC 1400

                   1401          .         .         .         .         . 1450
hg03944            1401 CCGGCGCCCAGCACGAGAATGTACCGTTCATCGCCGTCACCAGCTTCCTG 1450
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)   1401 CCGGCGCCCAGCACGAGAATGTACCGTTCATCGCCGTCACCAGCTTCCTG 1450

                   1451          .         .         .         .         . 1500
hg03944            1451 TGCCTGCGCTTCTTCTCTCCCGCCATCATGTCGCCCAAGCTCTTCCACCT 1500
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)   1451 TGCCTGCGCTTCTTCTCTCCCGCCATCATGTCGCCCAAGCTCTTCCACCT 1500

                   1501          .         .         .         .         . 1550
hg03944            1501 GCGGGAGCGCCACGCGGACGCCCGCACCAGCCGCACCCTGCTCCTGTTGG 1550
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)   1501 GCGGGAGCGCCACGCGGACGCCCGCACCAGCCGCACCCTGCTCCTGTTGG 1550

                   1551          .         .         .         .         . 1600
hg03944            1551 CCAAGGCAGTCCAGAACGTGGGCAACATGGACACGCCGGCTTCCAGGGCC 1600
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)   1551 CCAAGGCAGTCCAGAACGTGGGCAACATGGACACGCCGGCTTCCAGGGCC 1600

                   1601          .         .         .         .         . 1650
hg03944            1601 AAGGAGGCTTGGATGGAGCCGCTGCAGCCCACCGTGCGCCAGGGCGTGGC 1650
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)   1601 AAGGAGGCTTGGATGGAGCCGCTGCAGCCCACCGTGCGCCAGGGCGTGGC 1650

                   1651          .         .         .         .         . 1700
hg03944            1651 GCAGCTGAAGGACTTCATCACCAAGCTCGTGGACATCGAGGAGAAGGACG 1700
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)   1651 GCAGCTGAAGGACTTCATCACCAAGCTCGTGGACATCGAGGAGAAGGACG 1700

                   1701          .         .         .         .         . 1750
hg03944            1701 AGCTGGACCTGCAGCGGACGCTGAGTTTGTAGGCGCCACCTGTGAAGGAG 1750
                        ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
hg03944(revised)   1701 AGCTGGACCTGCAGCGGACGCTGAGTTTGCAGGCGCCACCTGTGAAGGAG 1750

                   1751          .         .         .         .         . 1800
hg03944            1751 GGGCCACTCTTCATCCACAGGACCAAGGGCAAGGGCCCCCTCATGTCCTC 1800
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)   1751 GGGCCACTCTTCATCCACAGGACCAAGGGCAAGGGCCCCCTCATGTCCTC 1800

                   1801          .         .         .         .         . 1850
hg03944            1801 CTCCTTCAAGAAGCTCTACTTCTCCCTCACTACCGAGGCCCTCAGCTTCG 1850
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)   1801 CTCCTTCAAGAAGCTCTACTTCTCCCTCACTACCGAGGCCCTCAGCTTCG 1850

                   1851          .         .         .         .         . 1900
hg03944            1851 CGAAGATGCCCAGCTCCAAGAAAAGCGCCCTCATCAAGTTAGCCAACATC 1900
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)   1851 CGAAGATGCCCAGCTCCAAGAAAAGCGCCCTCATCAAGTTAGCCAACATC 1900

                   1901          .         .         .         .         . 1950
hg03944            1901 CGGGCAGCGGAAAAGGTTGAGGAAAAGAGCTTTGGCGGCTCGCACGTCAT 1950
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)   1901 CGGGCAGCGGAAAAGGTTGAGGAAAAGAGCTTTGGCGGCTCGCACGTCAT 1950

                   1951          .         .         .         .         . 2000
hg03944            1951 GCAGGTCATCTACACGGACGACGCCGGCAGGCCCCAGACTGCCTACCTGC 2000
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)   1951 GCAGGTCATCTACACGGACGACGCCGGCAGGCCCCAGACTGCCTACCTGC 2000

                   2001          .         .         .         .         . 2050
hg03944            2001 AGTGCAAGGAGTTCCCTTTTGTGTCAGGGTCCAGAGCCACTGGGAAAAGT 2050
                        ||||||                                            
hg03944(revised)   2001 AGTGCA-------------------------------------------- 2006

                   2051          .         .         .         .         . 2100
hg03944            2051 AGTGATATCAGGGCCACCAAATATATTTGGCGGGTTCTGGAATACCTACG 2100
                                                                          
hg03944(revised)   2007 -------------------------------------------------- 2007

                   2101          .         .         .         .         . 2150
hg03944            2101 AGCGTGGCCAAGGGGCCAGCGGCGGCTGAAATCCAGCCCACACCAGCCTC 2150
                                                                          
hg03944(revised)   2007 -------------------------------------------------- 2007

                   2151          .         .         .         .         . 2200
hg03944            2151 CTGGGCTCCTACCATCCCGGTGCCTTCCGTGGGGACAAGTGGAGCTGCTG 2200
                                                                          
hg03944(revised)   2007 -------------------------------------------------- 2007

                   2201          .         .         .         .         . 2250
hg03944            2201 CCACCAAAAAGACGAGACAGTGTGTGAATGAGCTTAACCAGTGGCTGTCT 2250
                                          ||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)   2007 ------------------AGTGTGTGAATGAGCTTAACCAGTGGCTGTCT 2038

                   2251          .         .         .         .         . 2300
hg03944            2251 GCGCTGCGGAAGGTGAGCATCAACAACACCGGACTGCTGGGCTCCTACCA 2300
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)   2039 GCGCTGCGGAAGGTGAGCATCAACAACACCGGACTGCTGGGCTCCTACCA 2088

                   2301          .         .         .         .         . 2350
hg03944            2301 CCCTGGCGTCTTCCGTGGGGACAAGTGGAGCTGCTGCCACCAAAAAGAGA 2350
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)   2089 CCCTGGCGTCTTCCGTGGGGACAAGTGGAGCTGCTGCCACCAAAAAGAGA 2138

                   2351          .         .         .         .         . 2400
hg03944            2351 AGACAGACACAGACTTTCGCTCTGTCCCCCAGACTGGAGTGCAATGGCGC 2400
                        ||||||                                            
hg03944(revised)   2139 AGACAG-------------------------------------------- 2144

                   2401          .         .         .         .         . 2450
hg03944            2401 GATCTCGGCTCGCTGCAATCTCCGCCTCCCAGGGTCAAGCAGTTCTCCTG 2450
                                                                          
hg03944(revised)   2145 -------------------------------------------------- 2145

                   2451          .         .         .         .         . 2500
hg03944            2451 CCTCAACCTCCCCAGTAGCTGGGATGACCGGCACTCGCCACCAAGCCTGG 2500
                                                                          
hg03944(revised)   2145 -------------------------------------------------- 2145

                   2501          .         .         .         .         . 2550
hg03944            2501 CTAATTTTTTTGTATTTTGACTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTAGTCAA 2550
                                                                          
hg03944(revised)   2145 -------------------------------------------------- 2145

                   2551          .         .         .         .         . 2600
hg03944            2551 GCTGCTCTTGTTTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTTGATACTGA 2600
                                                                          
hg03944(revised)   2145 -------------------------------------------------- 2145

                   2601          .         .         .         .         . 2650
hg03944            2601 GTCTCGCTCTATCATCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCAATCTCGGCTCAC 2650
                                                                          
hg03944(revised)   2145 -------------------------------------------------- 2145

                   2651          .         .         .         .         . 2700
hg03944            2651 TGCAATCTCCGTTTCCCAGGCTCGGGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCA 2700
                                                                          
hg03944(revised)   2145 -------------------------------------------------- 2145

                   2701          .         .         .         .         . 2750
hg03944            2701 AGTACTACAGGCGCAAGCCACTGCACCCAGCTAAGTCAGGGCTGCGATAA 2750
                                                          ||||||||||||||||
hg03944(revised)   2145 ----------------------------------GTCAGGGCTGCGATAA 2160

                   2751          .         .         .         .         . 2800
hg03944            2751 GACCCGGTCACGGGTGACCCTGCAGGAGTGGAATGACCCTCTTGACCATG 2800
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)   2161 GACCCGGTCACGGGTGACCCTGCAGGAGTGGAATGACCCTCTTGACCATG 2210

                   2801          .         .         .         .         . 2850
hg03944            2801 ACCTTGAGGCCCAGCTCATCTACCGGCACCTGCTGGGCGTGGAGGCCATG 2850
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)   2211 ACCTTGAGGCCCAGCTCATCTACCGGCACCTGCTGGGCGTGGAGGCCATG 2260

                   2851          .         .         .         .         . 2900
hg03944            2851 CTGTGGGAGAGGCACCGGGAGCTGAGCGGGGGCACAGAGGCAGGCACGGT 2900
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)   2261 CTGTGGGAGAGGCACCGGGAGCTGAGCGGGGGCACAGAGGCAGGCACGGT 2310

                   2901          .         .         .         .         . 2950
hg03944            2901 GCCCACGAGCCCTGGCAAAGTCCCCGAGGACTCATTGGCCCGGCTGCTCC 2950
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)   2311 GCCCACGAGCCCTGGCAAAGTCCCCGAGGACTCATTGGCCCGGCTGCTCC 2360

                   2951          .         .         .         .         . 3000
hg03944            2951 GGGTGCTGCAGGACCTCCGCGAGGCCCATAGCTCCAGCCCGGCCGGCTCC 3000
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)   2361 GGGTGCTGCAGGACCTCCGCGAGGCCCATAGCTCCAGCCCGGCCGGCTCC 2410

                   3001          .         .         .         .         . 3050
hg03944            3001 CCACCCTCAGAGCCCAACTGCCTCCTGGAGCTGCAGACGTGAGGCCCGCC 3050
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)   2411 CCACCCTCAGAGCCCAACTGCCTCCTGGAGCTGCAGACGTGAGGCCCGCC 2460

                   3051          .         .         .         .         . 3100
hg03944            3051 CTACGCTCCCCTTGCTGAGTCCCCTGCCAAGCGCTCGGAGCCCCCCCAGG 3100
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)   2461 CTACGCTCCCCTTGCTGAGTCCCCTGCCAAGCGCTCGGAGCCCCCCCAGG 2510

                   3101          .         .         .         .         . 3150
hg03944            3101 ACACTCTGCACCCCCTCACCCCGGTCCTCCTCATTAGGGTGCAGGGCCTA 3150
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)   2511 ACACTCTGCACCCCCTCACCCCGGTCCTCCTCATTAGGGTGCAGGGCCTA 2560

                   3151          .         .         .         .         . 3200
hg03944            3151 GGTCTCTTCCAGGTGGGGGAGGGGGGAGAGTCAGGAATAAGGGGATCCCC 3200
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)   2561 GGTCTCTTCCAGGTGGGGGAGGGGGGAGAGTCAGGAATAAGGGGATCCCC 2610

                   3201          .         .         .         .         . 3250
hg03944            3201 AGAAGTGCAGAGCTGAGCAGGCTTGGGCCTGTCATGGCTGGCCGGAAGTG 3250
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)   2611 AGAAGTGCAGAGCTGAGCAGGCTTGGGCCTGTCATGGCTGGCCGGAAGTG 2660

                   3251          .         .         .         .         . 3300
hg03944            3251 TCCCCAGCTCCCTACAGACGCTGTAGCCATCACTGCCTCTCCAGGGACCC 3300
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)   2661 TCCCCAGCTCCCTACAGACGCTGTAGCCATCACTGCCTCTCCAGGGACCC 2710

                   3301          .         .         .         .         . 3350
hg03944            3301 TCCTCTCCTGCCCAGGACAGACCCAGCCAGAACCACTGCTAGGATGGGCC 3350
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)   2711 TCCTCTCCTGCCCAGGACAGACCCAGCCAGAACCACTGCTAGGATGGGCC 2760

                   3351          .         .         .         .         . 3400
hg03944            3351 GCACCCAGGGGTCTGGCCTCCAGGGACCTAGAGAATGGGAGGGAGAACGG 3400
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)   2761 GCACCCAGGGGTCTGGCCTCCAGGGACCTAGAGAATGGGAGGGAGAACGG 2810

                   3401          .         .         .         .         . 3450
hg03944            3401 GGCCCCAGGAGACCCGGCCGCCACCCCACCCGCTACCCTTGGGTGCCACA 3450
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)   2811 GGCCCCAGGAGACCCGGCCGCCACCCCACCCGCTACCCTTGGGTGCCACA 2860

                   3451          .         .         .         .         . 3500
hg03944            3451 GGGCTGTGCTGTTGCCAACAGTAAACCTGCTCTTACTGTCCAGGCTCTGG 3500
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)   2861 GGGCTGTGCTGTTGCCAACAGTAAACCTGCTCTTACTGTCCAGGCTCTGG 2910

                   3501          .         .         .         .         . 3550
hg03944            3501 GGTCTTGTGATGAGGGTCTGGGGAGAAAGTGGGCCCGGGGGGACCCCGGA 3550
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)   2911 GGTCTTGTGATGAGGGTCTGGGGAGAAAGTGGGCCCGGGGGGACCCCGGA 2960

                   3551          .         .         .         .         . 3600
hg03944            3551 GGCTGTCGGTGGATGTGCCGATGATGGGGCTGACAGTATGGGCTCTGGGC 3600
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)   2961 GGCTGTCGGTGGATGTGCCGATGATGGGGCTGACAGTATGGGCTCTGGGC 3010

                   3601          .         .         .         .         . 3650
hg03944            3601 ATCCCTGTTCCCCCCCCTTTCTTCCCCCCACTCTTCTGGGGTCGGGGGTT 3650
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)   3011 ATCCCTGTTCCCCCCCCTTTCTTCCCCCCACTCTTCTGGGGTCGGGGGTT 3060

                   3651          .         .         .         .         . 3700
hg03944            3651 CCTTTCCCTTCCCAGTTGCTGTCCCTGGGTCCCCTCTTTCATGTCCCACA 3700
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)   3061 CCTTTCCCTTCCCAGTTGCTGTCCCTGGGTCCCCTCTTTCATGTCCCACA 3110

                   3701          .         .         .         .         . 3750
hg03944            3701 GGCCACAGAGCCCAGTGTGTCCAACCAGCTGTTCTCTCCTCAAAGCAGCC 3750
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)   3111 GGCCACAGAGCCCAGTGTGTCCAACCAGCTGTTCTCTCCTCAAAGCAGCC 3160

                   3751          .         .         .         .         . 3800
hg03944            3751 CCCAAGCAAGTCCCTTCTCTAGGGTGTCCCTGAGGACAGCACAGAGGCGG 3800
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)   3161 CCCAAGCAAGTCCCTTCTCTAGGGTGTCCCTGAGGACAGCACAGAGGCGG 3210

                   3801          .         .         .         .         . 3850
hg03944            3801 GACTCAGAGACCCCATTCCTCTTCACGCAGCCCTTACCCCAAGCCCTCTA 3850
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)   3211 GACTCAGAGACCCCATTCCTCTTCACGCAGCCCTTACCCCAAGCCCTCTA 3260

                   3851          .         .         .         .         . 3900
hg03944            3851 GCTGTGTGGCTGGCAGTGTTGGCCACGTAGGGGCTCCCATCCCCCCACCA 3900
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)   3261 GCTGTGTGGCTGGCAGTGTTGGCCACGTAGGGGCTCCCATCCCCCCACCA 3310

                   3901          .         .         .         .         . 3950
hg03944            3901 TTGTGTCACATGGGCTGCCAGGCTCAGCTCCCAGCTGCGTCCACAGTGAC 3950
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)   3311 TTGTGTCACATGGGCTGCCAGGCTCAGCTCCCAGCTGCGTCCACAGTGAC 3360

                   3951          .         .         .         .         . 4000
hg03944            3951 CTGGATCAGGGTGGGGACAAGGACTGGACCCTCCTTCTCCAGAAGGCCTT 4000
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)   3361 CTGGATCAGGGTGGGGACAAGGACTGGACCCTCCTTCTCCAGAAGGCCTT 3410

                   4001          .         .         .         .         . 4050
hg03944            4001 CAGCTCTTGCCTTGCCATGCAGTCACCTCCTTCCCCCTCTGACCCCAGAT 4050
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)   3411 CAGCTCTTGCCTTGCCATGCAGTCACCTCCTTCCCCCTCTGACCCCAGAT 3460

                   4051          .         .         .         .         . 4100
hg03944            4051 CCCAAAGGTGCACCGTTGCCCCAGCCCCTTTCTGGCCCCATGGGGTTTCT 4100
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)   3461 CCCAAAGGTGCACCGTTGCCCCAGCCCCTTTCTGGCCCCATGGGGTTTCT 3510

                   4101          .         .         .         .         . 4150
hg03944            4101 CTGATGCCTTCATCATAGAGGCCCGGGGCTGGTCCGATGGTTGGCAAAAC 4150
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)   3511 CTGATGCCTTCATCATAGAGGCCCGGGGCTGGTCCGATGGTTGGCAAAAC 3560

                   4151          .         .         .         .         . 4200
hg03944            4151 TTGACTCCGGCCCAGTCCCCACTCTTGGGGACTTAGAACCCCTGCTGTCC 4200
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)   3561 TTGACTCCGGCCCAGTCCCCACTCTTGGGGACTTAGAACCCCTGCTGTCC 3610

                   4201          .         .         .         .         . 4250
hg03944            4201 TGGGATCTGGCCTGCCTTTCTTTGGTCAGTCCCTGTGGTCCCCCACCAGC 4250
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)   3611 TGGGATCTGGCCTGCCTTTCTTTGGTCAGTCCCTGTGGTCCCCCACCAGC 3660

                   4251          .         .         .         .         . 4300
hg03944            4251 TCCCCCTCCCATAGGGCTGCCCACCAAGCCCTGCCCCCAGCCCAAGAGGA 4300
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)   3661 TCCCCCTCCCATAGGGCTGCCCACCAAGCCCTGCCCCCAGCCCAAGAGGA 3710

                   4301          .         .         .         .         . 4350
hg03944            4301 GCCCCCACTGCCTGCGGGGCAGTGATGTCTGGCCACCGGCTCACACCAAT 4350
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)   3711 GCCCCCACTGCCTGCGGGGCAGTGATGTCTGGCCACCGGCTCACACCAAT 3760

                   4351          .         .         .         .         . 4400
hg03944            4351 GACTTGGTCCTGGGGTGGCAGAAGCAGCAGGTGACAGGAGCAGGGCCCCT 4400
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)   3761 GACTTGGTCCTGGGGTGGCAGAAGCAGCAGGTGACAGGAGCAGGGCCCCT 3810

                   4401          .         .         .         .         . 4450
hg03944            4401 GTCCCTCTCTTCTGGCCCTGTGGTACCCAGGCCACACGTTGTGCCCGCTC 4450
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)   3811 GTCCCTCTCTTCTGGCCCTGTGGTACCCAGGCCACACGTTGTGCCCGCTC 3860

                   4451          .         .         .         .         . 4500
hg03944            4451 TTGGGGCTGACCGGCTGTAGGGACCACCAGCCGCTGCTACTGTGGGCCGC 4500
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)   3861 TTGGGGCTGACCGGCTGTAGGGACCACCAGCCGCTGCTACTGTGGGCCGC 3910

                   4501          .         .         .         .         . 4550
hg03944            4501 CCCGGGGCAGGGTGGGCAGGGCTTTTGTGGGTTATGAGGACACAGAAGTC 4550
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)   3911 CCCGGGGCAGGGTGGGCAGGGCTTTTGTGGGTTATGAGGACACAGAAGTC 3960

                   4551          .         .         .         .         . 4600
hg03944            4551 CCTGAGGCCCCCAGACCTGGCTCAGCCAACCTCCTTCCTCCCCCGGTTGC 4600
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)   3961 CCTGAGGCCCCCAGACCTGGCTCAGCCAACCTCCTTCCTCCCCCGGTTGC 4010

                   4601          .         .         .         .         . 4650
hg03944            4601 CCCCCACTCTAAAGCCTCCTCCCTCCCAGCGTCCACTGGCTCCAGGCTCC 4650
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)   4011 CCCCCACTCTAAAGCCTCCTCCCTCCCAGCGTCCACTGGCTCCAGGCTCC 4060

                   4651          .         .         .         .         . 4700
hg03944            4651 TCACAACAGCAGCTCATAGACACGGGGCGTCTCCAGGTGGTCCCAGCCCT 4700
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)   4061 TCACAACAGCAGCTCATAGACACGGGGCGTCTCCAGGTGGTCCCAGCCCT 4110

                   4701          .         .         .         .         . 4750
hg03944            4701 CCAGATGTTTCTAGCTCTCCAGGTGGGCGCTGTTTTCACGTCTGCCTGCA 4750
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)   4111 CCAGATGTTTCTAGCTCTCCAGGTGGGCGCTGTTTTCACGTCTGCCTGCA 4160

                   4751          .         .         .         .         . 4800
hg03944            4751 TCCATTCATTCCTTCATTCCTCACCTTTATCCTGTTATCTCTATTTTTTT 4800
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)   4161 TCCATTCATTCCTTCATTCCTCACCTTTATCCTGTTATCTCTATTTTTTT 4210

                   4801          .         .         .         .         . 4850
hg03944            4801 AAGCTACCAGGAAGGAAAGGGAAGAAGAGATCACGAAACTGGGACCCCCA 4850
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)   4211 AAGCTACCAGGAAGGAAAGGGAAGAAGAGATCACGAAACTGGGACCCCCA 4260

                   4851          .         .         .         .         . 4900
hg03944            4851 GAAGGGAGGAGTGGGCTTTGAACTTAGACATCTACCTCAGAGCTCAAATA 4900
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)   4261 GAAGGGAGGAGTGGGCTTTGAACTTAGACATCTACCTCAGAGCTCAAATA 4310

                   4901          .         .         .         .         . 4950
hg03944            4901 GGTTGTTTAAAATCACATTCAATTTTCAGATGAAGGGGAACTTTATAGTT 4950
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)   4311 GGTTGTTTAAAATCACATTCAATTTTCAGATGAAGGGGAACTTTATAGTT 4360

                   4951          .         .         .         .         . 5000
hg03944            4951 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGGGCGGAGTCTCACTGTGTTGCCCA 5000
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)   4361 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGGGCGGAGTCTCACTGTGTTGCCCA 4410

                   5001          .         .         .         .         . 5050
hg03944            5001 GGCTGGAGTGCAAATGGCTTGATCTTGGTTCACTGCAACCTCTGCCTCCC 5050
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)   4411 GGCTGGAGTGCAAATGGCTTGATCTTGGTTCACTGCAACCTCTGCCTCCC 4460

                   5051          .         .         .         .         . 5100
hg03944            5051 AGGTTCAAGCAATTCTCTTGCCTCGGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTGGAG 5100
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)   4461 AGGTTCAAGCAATTCTCTTGCCTCGGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTGGAG 4510

                   5101          .         .         .         .         . 5150
hg03944            5101 GCGTGTGCCACCATGCCCAGCTAATTCTTGTATTTTTAGTAGAGACGGAG 5150
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)   4511 GCGTGTGCCACCATGCCCAGCTAATTCTTGTATTTTTAGTAGAGACGGAG 4560

                   5151          .         .         .         .         . 5200
hg03944            5151 TTTCTCCATGTTGGCCAGACTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCT 5200
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)   4561 TTTCTCCATGTTGGCCAGACTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCT 4610

                   5201          .         .         .         .         . 5250
hg03944            5201 GACCGCCTTGGCCTCCGAAAGTGCTGAGATTACAGTTGCGAGCCACTGTG 5250
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)   4611 GACCGCCTTGGCCTCCGAAAGTGCTGAGATTACAGTTGCGAGCCACTGTG 4660

                   5251          .         .         .         .         . 5300
hg03944            5251 CGTGGCCAGAACTTTATAATAAGAGACTTGAAGCTGGGTGTGACGGTGCA 5300
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)   4661 CGTGGCCAGAACTTTATAATAAGAGACTTGAAGCTGGGTGTGACGGTGCA 4710

                   5301          .         .         .         .         . 5350
hg03944            5301 CGCCTCTGGTCCCAGCTGCTCGGGAGGCCGGGACAGAAGGATCACCTTGA 5350
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)   4711 CGCCTCTGGTCCCAGCTGCTCGGGAGGCCGGGACAGAAGGATCACCTTGA 4760

                   5351          .         .         .         .         . 5400
hg03944            5351 GGCCAGGAGTTTAAGGCCAGCCTGGGCAACATAGCAAAACCTAGTCCCTA 5400
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)   4761 GGCCAGGAGTTTAAGGCCAGCCTGGGCAACATAGCAAAACCTAGTCCCTA 4810

                   5401          .         .         .         .         . 5450
hg03944            5401 AAATTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGAAAATAAAGGAGACTTGAAATT 5450
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)   4811 AAATTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGAAAATAAAGGAGACTTGAAATT 4860

                   5451          .         .         .         .         . 5500
hg03944            5451 TTTGAACTAAATAGTGGTGATGGCTACACATTGTGAATGTAATTAACACC 5500
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)   4861 TTTGAACTAAATAGTGGTGATGGCTACACATTGTGAATGTAATTAACACC 4910

                   5501          .         .         .         .         . 5550
hg03944            5501 ACTGAGTTAAACACTTAAAATGGTTAAAATGGCAAATTGTATGTTATACC 5550
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)   4911 ACTGAGTTAAACACTTAAAATGGTTAAAATGGCAAATTGTATGTTATACC 4960

                   5551          .         .         .         .         . 5600
hg03944            5551 TATTTTACTACAATAAAAAGTATAAAAAAGAGAAGATATTTAGGTGACTT 5600
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)   4961 TATTTTACTACAATAAAAAGTATAAAAAAGAGAAGATATTTAGGTGACTT 5010

                   5601          .         .         .         .         . 5650
hg03944            5601 ACAGCAACCAATTGCAACAAAACAAAATGTTAAGAAATGATCTTTTTATG 5650
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)   5011 ACAGCAACCAATTGCAACAAAACAAAATGTTAAGAAATGATCTTTTTATG 5060

                   5651          .         .         .         .         . 5700
hg03944            5651 AGGCAATTGGAAATTTGAACACTGATCAACTATAGGATGATTGGAATTAT 5700
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)   5061 AGGCAATTGGAAATTTGAACACTGATCAACTATAGGATGATTGGAATTAT 5110

                   5701          .         .         .         .         . 5750
hg03944            5701 TAATTTTTAAAGGTGTGATAAGATGCTGCACTTGGCTGGGCACAGTGGCA 5750
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)   5111 TAATTTTTAAAGGTGTGATAAGATGCTGCACTTGGCTGGGCACAGTGGCA 5160

                   5751          .         .         .         .         . 5800
hg03944            5751 CATGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGCAGGCTGAGGTGGGAGAATCGCTTG 5800
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)   5161 CATGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGCAGGCTGAGGTGGGAGAATCGCTTG 5210

                   5801          .         .         .         .         . 5850
hg03944            5801 AGCTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGGCAACGTGGCGAAATCCCCGTCTT 5850
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)   5211 AGCTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGGCAACGTGGCGAAATCCCCGTCTT 5260

                   5851          .         .         .         .         . 5900
hg03944            5851 TACAAAAACAAACAAACAAACAAAAAAGATATTGCAGTTGTGTTGTAAGC 5900
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)   5261 TACAAAAACAAACAAACAAACAAAAAAGATATTGCAGTTGTGTTGTAAGC 5310

                   5901          .         .         .         .         . 5950
hg03944            5901 GTCCTTATCTTTCAGAGCTACATAGTGGAATGTTTATGGAATATTTAGGA 5950
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)   5311 GTCCTTATCTTTCAGAGCTACATAGTGGAATGTTTATGGAATATTTAGGA 5360

                   5951          .         .         .         .         . 6000
hg03944            5951 TAAATGATATAGGCATTTGGGATTTGCTGCAAAATGACCCAGAGGCAGGG 6000
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)   5361 TAAATGATATAGGCATTTGGGATTTGCTGCAAAATGACCCAGAGGCAGGG 5410

                   6001          .         .         .         .         . 6050
hg03944            6001 GTCAGGGGGAGAGGTAGAGATGAGACAAGAGGTAGAGGGGAGAGGTAGAG 6050
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)   5411 GTCAGGGGGAGAGGTAGAGATGAGACAAGAGGTAGAGGGGAGAGGTAGAG 5460

                   6051          .         .         .         .         . 6100
hg03944            6051 GTAGCCACGAGCTGATAATTACAGACAAGAGATGCGGAGTATGTGGGGGC 6100
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)   5461 GTAGCCACGAGCTGATAATTACAGACAAGAGATGCGGAGTATGTGGGGGC 5510

                   6101          .         .         .         .         . 6150
hg03944            6101 TCATTATCCTGCATAGTCTATCTTTGTATATCTTTGAACTTTTCAAGAAT 6150
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg03944(revised)   5511 TCATTATCCTGCATAGTCTATCTTTGTATATCTTTGAACTTTTCAAGAAT 5560

                   6151          .          6169
hg03944            6151 AAAAAAGCTTAAAAAGTAT 6169
                        |||||||||||||||||||
hg03944(revised)   5561 AAAAAAGCTTAAAAAGTAT 5579