Comparison between the cloned and the revised DNA sequences

Cloned DNA sequence, length = 5694 bp
Revised DNA sequence, length = 5140 bp

<< Positions of primers used in RT-PCR experiment(s) >>

 1 : f NN05510   667 -   687     AAG AGG AGT GTG GGA AAG TGG
     r NN05511  1796 -  1776     CAG CTA GTC TAC AAC GGT ATG
<< Positions of inserion/deletion/mutation(s) in the aligned sequence >>
 1 :   768 -  1321      554-bp deletion  (in the revised sequence)
Predicted coding region: colored in green ( 567 - 2489 in the revised sequence).


*- Clone Name -*      1          .         .         .         .         . 50
hh01904               1 CAAAAGAGAAACATAAAAAGGATGGGGTAACAGTTATAGACAGCTTAGGC 50
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh01904(revised)      1 CAAAAGAGAAACATAAAAAGGATGGGGTAACAGTTATAGACAGCTTAGGC 50

                     51          .         .         .         .         . 100
hh01904              51 TAGTCTTGGATTATAGTAATCTGCAGATACATGGTGTGTGAATGACATCT 100
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh01904(revised)     51 TAGTCTTGGATTATAGTAATCTGCAGATACATGGTGTGTGAATGACATCT 100

                    101          .         .         .         .         . 150
hh01904             101 GAAGGTGTTATCTTACACTGTAAATCATTTTTATGACTACACATATACTA 150
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh01904(revised)    101 GAAGGTGTTATCTTACACTGTAAATCATTTTTATGACTACACATATACTA 150

                    151          .         .         .         .         . 200
hh01904             151 TTTCATGAAGATGAAAATGCATTTCTAGTGAATTTCTAAACTTGTTTGTA 200
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh01904(revised)    151 TTTCATGAAGATGAAAATGCATTTCTAGTGAATTTCTAAACTTGTTTGTA 200

                    201          .         .         .         .         . 250
hh01904             201 AACAGTAACTTCTTTTAAATTAGCTAACTCTAAATGATCTGTTCTAATTA 250
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh01904(revised)    201 AACAGTAACTTCTTTTAAATTAGCTAACTCTAAATGATCTGTTCTAATTA 250

                    251          .         .         .         .         . 300
hh01904             251 ATTTTCAACTTGCATAACGTGAAAAAGAAGTAATTTTCAACTTGTAACTT 300
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh01904(revised)    251 ATTTTCAACTTGCATAACGTGAAAAAGAAGTAATTTTCAACTTGTAACTT 300

                    301          .         .         .         .         . 350
hh01904             301 TACTGAAAAATTTCAAATATGCTTTTCCATAATATTTACCAGGGTTACTA 350
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh01904(revised)    301 TACTGAAAAATTTCAAATATGCTTTTCCATAATATTTACCAGGGTTACTA 350

                    351          .         .         .         .         . 400
hh01904             351 GTAACAGAAACTTACCAGTTAATGGAATATTTCTTTCCTCACTACCTCTC 400
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh01904(revised)    351 GTAACAGAAACTTACCAGTTAATGGAATATTTCTTTCCTCACTACCTCTC 400

                    401          .         .         .         .         . 450
hh01904             401 AAATATATATGTCCCTTGGAAGAGATCGAAGTGAGAAATTAAAAACATGA 450
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh01904(revised)    401 AAATATATATGTCCCTTGGAAGAGATCGAAGTGAGAAATTAAAAACATGA 450

                    451          .         .         .         .         . 500
hh01904             451 GAACTAGAAAGGAAACAAGAGCATAGGAGTTTTTATGAGGATAATAAACC 500
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh01904(revised)    451 GAACTAGAAAGGAAACAAGAGCATAGGAGTTTTTATGAGGATAATAAACC 500

                    501          .         .         .         .         . 550
hh01904             501 CACATGGGAAGAGCCAGATCACAGAATAAACTTTTTTATTTTTTAACAAA 550
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh01904(revised)    501 CACATGGGAAGAGCCAGATCACAGAATAAACTTTTTTATTTTTTAACAAA 550

                    551          .         .         .         .         . 600
hh01904             551 ACACATTTTAATGTAATCCATGTTTAACTGCAGACTTGCCTTAAAACAAG 600
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh01904(revised)    551 ACACATTTTAATGTAATCCATGTTTAACTGCAGACTTGCCTTAAAACAAG 600

                    601          .         .         .         .         . 650
hh01904             601 AAAATGAGGAGAAAAGAAATGCCGATATGTTGTATAATAAAGATAGTGAA 650
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh01904(revised)    601 AAAATGAGGAGAAAAGAAATGCCGATATGTTGTATAATAAAGATAGTGAA 650

                    651          .         .         .         .         . 700
hh01904             651 CAGTTAAGAATAAAAGAAGAGGAGTGTGGGAAAGTGGTTGAAACAAAGCA 700
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh01904(revised)    651 CAGTTAAGAATAAAAGAAGAGGAGTGTGGGAAAGTGGTTGAAACAAAGCA 700

                    701          .         .         .         .         . 750
hh01904             701 ACAACTTAAATGGAATCTGAGAAGACTTGTTAAGGAATTGAGGACAGTAA 750
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh01904(revised)    701 ACAACTTAAATGGAATCTGAGAAGACTTGTTAAGGAATTGAGGACAGTAA 750

                    751          .         .         .         .         . 800
hh01904             751 GAAATAACTTGGATCTGGTAAATTAATCTTTGGTGTAAACTTCATTTTTC 800
                        |||||||||||||||||                                 
hh01904(revised)    751 GAAATAACTTGGATCTG--------------------------------- 767

                    801          .         .         .         .         . 850
hh01904             801 TAACTTTATGTTTCATCGGTATTACTTATAATTTTTTGCCTTCATGTATA 850
                                                                          
hh01904(revised)    768 -------------------------------------------------- 768

                    851          .         .         .         .         . 900
hh01904             851 TCATTTAGGTTTAAAATAAACCAAAACTGTTATTTCCTCTTAAGAATGAA 900
                                                                          
hh01904(revised)    768 -------------------------------------------------- 768

                    901          .         .         .         .         . 950
hh01904             901 CTATGACATTTATAGATAAAATTATTTACTGTAAACCTTGTCATCTAATA 950
                                                                          
hh01904(revised)    768 -------------------------------------------------- 768

                    951          .         .         .         .         . 1000
hh01904             951 GATGCTCAGTCTGTGTTTTTAGAGTGGAGGATAAGTTGAGTTTAATCACT 1000
                                                                          
hh01904(revised)    768 -------------------------------------------------- 768

                   1001          .         .         .         .         . 1050
hh01904            1001 AATATAGCTGTTCATTTACACATTTTTTATGTTAAAATACAGGCTAAATA 1050
                                                                          
hh01904(revised)    768 -------------------------------------------------- 768

                   1051          .         .         .         .         . 1100
hh01904            1051 GCTTTGAAACTATAAGGACACTAGTTAAATGTTTTGAAAGAAATTTTATT 1100
                                                                          
hh01904(revised)    768 -------------------------------------------------- 768

                   1101          .         .         .         .         . 1150
hh01904            1101 TCACAATGCTGTATCTTCTCGTAGTTAAGAACTGTTTTTCCTCTTTGACA 1150
                                                                          
hh01904(revised)    768 -------------------------------------------------- 768

                   1151          .         .         .         .         . 1200
hh01904            1151 GATTTAGCTGTCATGTATGCAATTAAGATTTGAGTGATTCTTGAGGGATA 1200
                                                                          
hh01904(revised)    768 -------------------------------------------------- 768

                   1201          .         .         .         .         . 1250
hh01904            1201 AAAGTTCTTGTGTTTTAACAGGCTACTTCTTTTTAACCGTTTTATAAGAG 1250
                                                                          
hh01904(revised)    768 -------------------------------------------------- 768

                   1251          .         .         .         .         . 1300
hh01904            1251 AGGCTCTGCTCTTAACCTTTTAGATTTTCTTTTTCAGTGCTATTAGACCA 1300
                                                                          
hh01904(revised)    768 -------------------------------------------------- 768

                   1301          .         .         .         .         . 1350
hh01904            1301 AAACCTCCATGTTATCTCTAGGTTGTGCAGGAGAGAAACGATGCCCAGAA 1350
                                             |||||||||||||||||||||||||||||
hh01904(revised)    768 ---------------------GTTGTGCAGGAGAGAAACGATGCCCAGAA 796

                   1351          .         .         .         .         . 1400
hh01904            1351 GCAACTTTCTGAAGAACAGGATGCCAGAATATTACAAGATCAGATTCTGA 1400
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh01904(revised)    797 GCAACTTTCTGAAGAACAGGATGCCAGAATATTACAAGATCAGATTCTGA 846

                   1401          .         .         .         .         . 1450
hh01904            1401 CGAGTAAACAAAAGGAACTAGAAATGGCTCGAAAGAAAATGAATTCTGAG 1450
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh01904(revised)    847 CGAGTAAACAAAAGGAACTAGAAATGGCTCGAAAGAAAATGAATTCTGAG 896

                   1451          .         .         .         .         . 1500
hh01904            1451 ATTTCTCATAGGCATCAGAAAGAAAAGGATCTCTTTCATGAAGATTGCAT 1500
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh01904(revised)    897 ATTTCTCATAGGCATCAGAAAGAAAAGGATCTCTTTCATGAAGATTGCAT 946

                   1501          .         .         .         .         . 1550
hh01904            1501 GTTGCAGGAAGAAATTGCCTTGCTGAGACTGGAAATAGATACAATAAAAA 1550
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh01904(revised)    947 GTTGCAGGAAGAAATTGCCTTGCTGAGACTGGAAATAGATACAATAAAAA 996

                   1551          .         .         .         .         . 1600
hh01904            1551 ATCAGAACAAGCAAAAGGAAAAGAAATATTTTGAGGACATTGAGGCTGTG 1600
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh01904(revised)    997 ATCAGAACAAGCAAAAGGAAAAGAAATATTTTGAGGACATTGAGGCTGTG 1046

                   1601          .         .         .         .         . 1650
hh01904            1601 AAAGAAAAGAATGATAACCTTCAAAAAATTATAAAACTAAATGAGGAAAC 1650
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh01904(revised)   1047 AAAGAAAAGAATGATAACCTTCAAAAAATTATAAAACTAAATGAGGAAAC 1096

                   1651          .         .         .         .         . 1700
hh01904            1651 ATTAACAGAAACAATACTCCAGTACAGTGGACAGCTGAACAATCTGACAG 1700
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh01904(revised)   1097 ATTAACAGAAACAATACTCCAGTACAGTGGACAGCTGAACAATCTGACAG 1146

                   1701          .         .         .         .         . 1750
hh01904            1701 CTGAGAACAAAATACTCAATTCTGAACTGGAGAATGGGAAACAGAACCAA 1750
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh01904(revised)   1147 CTGAGAACAAAATACTCAATTCTGAACTGGAGAATGGGAAACAGAACCAA 1196

                   1751          .         .         .         .         . 1800
hh01904            1751 GAAAGACTAGAAATAGAAATGGAATCATACCGTTGTAGACTAGCTGCTGC 1800
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh01904(revised)   1197 GAAAGACTAGAAATAGAAATGGAATCATACCGTTGTAGACTAGCTGCTGC 1246

                   1801          .         .         .         .         . 1850
hh01904            1801 TGTACGTGACTGTGATCAAAGTCAGACAGCAAGAGACCTAAAACTTGATT 1850
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh01904(revised)   1247 TGTACGTGACTGTGATCAAAGTCAGACAGCAAGAGACCTAAAACTTGATT 1296

                   1851          .         .         .         .         . 1900
hh01904            1851 TCCAGAGAACAAGACAAGAGTGGGTTCGTTTACATGACAAAATGAAGGTT 1900
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh01904(revised)   1297 TCCAGAGAACAAGACAAGAGTGGGTTCGTTTACATGACAAAATGAAGGTT 1346

                   1901          .         .         .         .         . 1950
hh01904            1901 GATATGTCTGGCCTACAAGCTAAGAATGAGATTCTTTCTGAAAAACTTTC 1950
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh01904(revised)   1347 GATATGTCTGGCCTACAAGCTAAGAATGAGATTCTTTCTGAAAAACTTTC 1396

                   1951          .         .         .         .         . 2000
hh01904            1951 TAATGCTGAAAGTAAAATTAACAGCCTACAAATTCAGCTCCATAACACAA 2000
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh01904(revised)   1397 TAATGCTGAAAGTAAAATTAACAGCCTACAAATTCAGCTCCATAACACAA 1446

                   2001          .         .         .         .         . 2050
hh01904            2001 GAGATGCTCTTGGAAGAGAGAGTTTGATTTTGGAACGTGTGCAAAGAGAC 2050
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh01904(revised)   1447 GAGATGCTCTTGGAAGAGAGAGTTTGATTTTGGAACGTGTGCAAAGAGAC 1496

                   2051          .         .         .         .         . 2100
hh01904            2051 CTCAGCCAAACACAGTGTCAGAAGAAAGAAACTGAACAAATGTACCAAAT 2100
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh01904(revised)   1497 CTCAGCCAAACACAGTGTCAGAAGAAAGAAACTGAACAAATGTACCAAAT 1546

                   2101          .         .         .         .         . 2150
hh01904            2101 TGAACAAAGCAAACTGAAGAAATACATTGCCAAGCAGGAATCTGTAGAGG 2150
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh01904(revised)   1547 TGAACAAAGCAAACTGAAGAAATACATTGCCAAGCAGGAATCTGTAGAGG 1596

                   2151          .         .         .         .         . 2200
hh01904            2151 AGAGATTATCTCAACTACAAAGTGAAAATATGTTGCTTCGACAGCAACTG 2200
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh01904(revised)   1597 AGAGATTATCTCAACTACAAAGTGAAAATATGTTGCTTCGACAGCAACTG 1646

                   2201          .         .         .         .         . 2250
hh01904            2201 GATGATGCTCACAAGAAAGCTAACAGTCAAGAAAAGACAAGCAGTACTAT 2250
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh01904(revised)   1647 GATGATGCTCACAAGAAAGCTAACAGTCAAGAAAAGACAAGCAGTACTAT 1696

                   2251          .         .         .         .         . 2300
hh01904            2251 CCAAGACCAGTTTCATTCTGCTGCCAAAAATCTTCAAGCTGAGAGTGAAA 2300
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh01904(revised)   1697 CCAAGACCAGTTTCATTCTGCTGCCAAAAATCTTCAAGCTGAGAGTGAAA 1746

                   2301          .         .         .         .         . 2350
hh01904            2301 AGCAGATTCTTTCACTACAAGAGAAGAACAAGGAGCTGATGGATGAATAT 2350
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh01904(revised)   1747 AGCAGATTCTTTCACTACAAGAGAAGAACAAGGAGCTGATGGATGAATAT 1796

                   2351          .         .         .         .         . 2400
hh01904            2351 AATCATTTAAAAGAAAGAATGGATCAATGTGAGAAAGAGAAAGCAGGAAG 2400
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh01904(revised)   1797 AATCATTTAAAAGAAAGAATGGATCAATGTGAGAAAGAGAAAGCAGGAAG 1846

                   2401          .         .         .         .         . 2450
hh01904            2401 AAAAATTGACCTTACAGAAGCACAGGAAACTGTACCTTCACGATGTCTAC 2450
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh01904(revised)   1847 AAAAATTGACCTTACAGAAGCACAGGAAACTGTACCTTCACGATGTCTAC 1896

                   2451          .         .         .         .         . 2500
hh01904            2451 ATCTGGATGCAGAGAATGAAGTTCTTCAACTTCAACAGACATTATTCTCT 2500
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh01904(revised)   1897 ATCTGGATGCAGAGAATGAAGTTCTTCAACTTCAACAGACATTATTCTCT 1946

                   2501          .         .         .         .         . 2550
hh01904            2501 ATGAAAGCAATACAAAAGCAATGTGAAACACTACAGAAGAATAAGAAGCA 2550
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh01904(revised)   1947 ATGAAAGCAATACAAAAGCAATGTGAAACACTACAGAAGAATAAGAAGCA 1996

                   2551          .         .         .         .         . 2600
hh01904            2551 GCTGAAACAAGAAGTAGTAAACCTCAAAAGTTATATGGAAAGAAATATGT 2600
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh01904(revised)   1997 GCTGAAACAAGAAGTAGTAAACCTCAAAAGTTATATGGAAAGAAATATGT 2046

                   2601          .         .         .         .         . 2650
hh01904            2601 TAGAACGTGGTAAAGCTGAATGGCATAAACTGTTGATTGAAGAAAGAGCA 2650
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh01904(revised)   2047 TAGAACGTGGTAAAGCTGAATGGCATAAACTGTTGATTGAAGAAAGAGCA 2096

                   2651          .         .         .         .         . 2700
hh01904            2651 AGGAAGGAGATAGAAGAAAAATTAAACGAAGCCATTCTCACCTTGCAGAA 2700
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh01904(revised)   2097 AGGAAGGAGATAGAAGAAAAATTAAACGAAGCCATTCTCACCTTGCAGAA 2146

                   2701          .         .         .         .         . 2750
hh01904            2701 ACAAGCAGCAGTATCTCATGAACAGTTAGTACAGTTAAGGGAGGATAATA 2750
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh01904(revised)   2147 ACAAGCAGCAGTATCTCATGAACAGTTAGTACAGTTAAGGGAGGATAATA 2196

                   2751          .         .         .         .         . 2800
hh01904            2751 CTACTTCAATAAAAACTCAGATGGAACTCACAATCAAAGATCTGGAATCT 2800
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh01904(revised)   2197 CTACTTCAATAAAAACTCAGATGGAACTCACAATCAAAGATCTGGAATCT 2246

                   2801          .         .         .         .         . 2850
hh01904            2801 GAAATCTCCAGAATAAAAACTTCGCAAGCCGACTTTAATAAAACCGAATT 2850
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh01904(revised)   2247 GAAATCTCCAGAATAAAAACTTCGCAAGCCGACTTTAATAAAACCGAATT 2296

                   2851          .         .         .         .         . 2900
hh01904            2851 GGAAAGATATAAGGAACTCTACCTAGAAGAAGTGAAAGTTAGAGAATCCT 2900
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh01904(revised)   2297 GGAAAGATATAAGGAACTCTACCTAGAAGAAGTGAAAGTTAGAGAATCCT 2346

                   2901          .         .         .         .         . 2950
hh01904            2901 TGTCAAATGAACTCAGTAGAACTAATGAGATGATAGCAGAGGTCAGTACG 2950
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh01904(revised)   2347 TGTCAAATGAACTCAGTAGAACTAATGAGATGATAGCAGAGGTCAGTACG 2396

                   2951          .         .         .         .         . 3000
hh01904            2951 CAACTTACTGTGGAGAAAGAGCAGACCAGATCCAGATCTCTATTCTGCTT 3000
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh01904(revised)   2397 CAACTTACTGTGGAGAAAGAGCAGACCAGATCCAGATCTCTATTCTGCTT 2446

                   3001          .         .         .         .         . 3050
hh01904            3001 ATGCTACAAGGCCAGTCCTAGAGTCACCTTGCGTTGGAAATCTTAATGAT 3050
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh01904(revised)   2447 ATGCTACAAGGCCAGTCCTAGAGTCACCTTGCGTTGGAAATCTTAATGAT 2496

                   3051          .         .         .         .         . 3100
hh01904            3051 AGTGAAGGTCTCAACAGAAAACATATTCCAAGAAAAAAGAGGTCTGCTCT 3100
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh01904(revised)   2497 AGTGAAGGTCTCAACAGAAAACATATTCCAAGAAAAAAGAGGTCTGCTCT 2546

                   3101          .         .         .         .         . 3150
hh01904            3101 TAAGGACATGGAGAGCTACTTGTTGAAGGTTAGCTATCTTTTTTCCTTCG 3150
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh01904(revised)   2547 TAAGGACATGGAGAGCTACTTGTTGAAGGTTAGCTATCTTTTTTCCTTCG 2596

                   3151          .         .         .         .         . 3200
hh01904            3151 GCGTTCAGATTTCTGATAGAATTCTTGTATGTTATTTGGTAAAATAGTTA 3200
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh01904(revised)   2597 GCGTTCAGATTTCTGATAGAATTCTTGTATGTTATTTGGTAAAATAGTTA 2646

                   3201          .         .         .         .         . 3250
hh01904            3201 CTTAATTGTCTTGTGTATGGTAAGTAAAAGTAATAATTACCTGTGTTAAT 3250
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh01904(revised)   2647 CTTAATTGTCTTGTGTATGGTAAGTAAAAGTAATAATTACCTGTGTTAAT 2696

                   3251          .         .         .         .         . 3300
hh01904            3251 AAAGAGAGGAGACAGAAATTTTACCGTTATTTTTAAGTCTCTGGAGCTCT 3300
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh01904(revised)   2697 AAAGAGAGGAGACAGAAATTTTACCGTTATTTTTAAGTCTCTGGAGCTCT 2746

                   3301          .         .         .         .         . 3350
hh01904            3301 CATTGATAAGAGATTACTCCTTTGTTAACTTTATTTAATAAATGTAACCA 3350
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh01904(revised)   2747 CATTGATAAGAGATTACTCCTTTGTTAACTTTATTTAATAAATGTAACCA 2796

                   3351          .         .         .         .         . 3400
hh01904            3351 AACTGACACATTTTAAATTTTTTTAAAAACTGCATTTAAGTTAGATTTTA 3400
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh01904(revised)   2797 AACTGACACATTTTAAATTTTTTTAAAAACTGCATTTAAGTTAGATTTTA 2846

                   3401          .         .         .         .         . 3450
hh01904            3401 ACCAAAGGTTTACTTTGATGTGCTTTGTCTTACTAATTGATTTTAGTTTG 3450
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh01904(revised)   2847 ACCAAAGGTTTACTTTGATGTGCTTTGTCTTACTAATTGATTTTAGTTTG 2896

                   3451          .         .         .         .         . 3500
hh01904            3451 TCTGGGGTTCACTTTTAATGGGTTTAGTGTGCCTGGGGTCACTTTTAAAG 3500
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh01904(revised)   2897 TCTGGGGTTCACTTTTAATGGGTTTAGTGTGCCTGGGGTCACTTTTAAAG 2946

                   3501          .         .         .         .         . 3550
hh01904            3501 TTTTTCTGCGTCATCTCAGGTTTTCTACCTGTCATCATATGTGAATGATT 3550
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh01904(revised)   2947 TTTTTCTGCGTCATCTCAGGTTTTCTACCTGTCATCATATGTGAATGATT 2996

                   3551          .         .         .         .         . 3600
hh01904            3551 GGTGTCCAAACACTAACCACCCATGGATGTTTATTATTTAAAAGGACCCA 3600
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh01904(revised)   2997 GGTGTCCAAACACTAACCACCCATGGATGTTTATTATTTAAAAGGACCCA 3046

                   3601          .         .         .         .         . 3650
hh01904            3601 AGGTGAATACTTTTATATGTTATATAAACCTGCAACACTTGATTAATCTG 3650
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh01904(revised)   3047 AGGTGAATACTTTTATATGTTATATAAACCTGCAACACTTGATTAATCTG 3096

                   3651          .         .         .         .         . 3700
hh01904            3651 TTCTTTAAGTTAAAAGTTTTGTGATTTTCTTATATGAGTACATCTGTAAT 3700
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh01904(revised)   3097 TTCTTTAAGTTAAAAGTTTTGTGATTTTCTTATATGAGTACATCTGTAAT 3146

                   3701          .         .         .         .         . 3750
hh01904            3701 TGCTATTGCACTTAATAGTGTTTTAATCCCAATTTTAGTAAAATGTGTCT 3750
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh01904(revised)   3147 TGCTATTGCACTTAATAGTGTTTTAATCCCAATTTTAGTAAAATGTGTCT 3196

                   3751          .         .         .         .         . 3800
hh01904            3751 ATTGCTATGCAATAGCACAGTGGTTTTGAAATAGTTAAATCAAATAAATA 3800
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh01904(revised)   3197 ATTGCTATGCAATAGCACAGTGGTTTTGAAATAGTTAAATCAAATAAATA 3246

                   3801          .         .         .         .         . 3850
hh01904            3801 TTTGAATTTTTAAAGTAAAGCTCACATAAGTTTTGTCTCTCTACCTGGCC 3850
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh01904(revised)   3247 TTTGAATTTTTAAAGTAAAGCTCACATAAGTTTTGTCTCTCTACCTGGCC 3296

                   3851          .         .         .         .         . 3900
hh01904            3851 ATAACTTTAGTAATTGATGACTAAGATGGCAATGGTATCTAGAGTCCTTC 3900
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh01904(revised)   3297 ATAACTTTAGTAATTGATGACTAAGATGGCAATGGTATCTAGAGTCCTTC 3346

                   3901          .         .         .         .         . 3950
hh01904            3901 AATAGCAAATGTGACCAAACAGAATCAGTTCTATTCTTAATACCCCAAAT 3950
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh01904(revised)   3347 AATAGCAAATGTGACCAAACAGAATCAGTTCTATTCTTAATACCCCAAAT 3396

                   3951          .         .         .         .         . 4000
hh01904            3951 TCCATGTAAAGCTGCACATGGACATCTCCCCTGGACATGTAACAGGAACC 4000
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh01904(revised)   3397 TCCATGTAAAGCTGCACATGGACATCTCCCCTGGACATGTAACAGGAACC 3446

                   4001          .         .         .         .         . 4050
hh01904            4001 TTTTAGTTCAACCGTGTGGTTTCACTCAGAGTAAGAGTCTATTTCTGGGG 4050
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh01904(revised)   3447 TTTTAGTTCAACCGTGTGGTTTCACTCAGAGTAAGAGTCTATTTCTGGGG 3496

                   4051          .         .         .         .         . 4100
hh01904            4051 ATTTCAAAATGGATCCAAAAATGACGAGCTGTATCAACTATAGAGTTGGT 4100
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh01904(revised)   3497 ATTTCAAAATGGATCCAAAAATGACGAGCTGTATCAACTATAGAGTTGGT 3546

                   4101          .         .         .         .         . 4150
hh01904            4101 AAGGAAAAAAAAAACAAAACGTAGTTCAACTATGCTTGACCCAGATTAAG 4150
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh01904(revised)   3547 AAGGAAAAAAAAAACAAAACGTAGTTCAACTATGCTTGACCCAGATTAAG 3596

                   4151          .         .         .         .         . 4200
hh01904            4151 GTATTTGTCTAACATTTGTCCATTTTTCAACTGAGGGAAAATTACAAAAA 4200
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh01904(revised)   3597 GTATTTGTCTAACATTTGTCCATTTTTCAACTGAGGGAAAATTACAAAAA 3646

                   4201          .         .         .         .         . 4250
hh01904            4201 CTGGGCACAGTGGCACACACCTGTAGTCCCAGCTGCTCCTGAGGCTGAGG 4250
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh01904(revised)   3647 CTGGGCACAGTGGCACACACCTGTAGTCCCAGCTGCTCCTGAGGCTGAGG 3696

                   4251          .         .         .         .         . 4300
hh01904            4251 CAGGAAGATCACTTGAACCCAGGAGTTCAAATCTGCAGTGCGCAATGATT 4300
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh01904(revised)   3697 CAGGAAGATCACTTGAACCCAGGAGTTCAAATCTGCAGTGCGCAATGATT 3746

                   4301          .         .         .         .         . 4350
hh01904            4301 ATTCCTGTGAGTAGCTACGGCACTGCAGCATTCCAATCTGGGCAACATAG 4350
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh01904(revised)   3747 ATTCCTGTGAGTAGCTACGGCACTGCAGCATTCCAATCTGGGCAACATAG 3796

                   4351          .         .         .         .         . 4400
hh01904            4351 CAAGATTCTGTCTCTTAAAAAAATTACAAAATCCATAAAACATTTGTTTG 4400
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh01904(revised)   3797 CAAGATTCTGTCTCTTAAAAAAATTACAAAATCCATAAAACATTTGTTTG 3846

                   4401          .         .         .         .         . 4450
hh01904            4401 AACAACAATAGATAAATAGTTTTCTTTGTGTATATTGTTGTTTTTAAAAT 4450
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh01904(revised)   3847 AACAACAATAGATAAATAGTTTTCTTTGTGTATATTGTTGTTTTTAAAAT 3896

                   4451          .         .         .         .         . 4500
hh01904            4451 TTTCAATCGATGCACATTGGCTTATAGTTTTGATGTTTTTATGATCTCCT 4500
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh01904(revised)   3897 TTTCAATCGATGCACATTGGCTTATAGTTTTGATGTTTTTATGATCTCCT 3946

                   4501          .         .         .         .         . 4550
hh01904            4501 TAGCGCACAGAAAAGTAGCGCAGGCCCACATGGAATGAACCTCAACCTTG 4550
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh01904(revised)   3947 TAGCGCACAGAAAAGTAGCGCAGGCCCACATGGAATGAACCTCAACCTTG 3996

                   4551          .         .         .         .         . 4600
hh01904            4551 TTGTGTTTACCTGGCTATTTCGTGTCCTAACAAATCATAGAAGAGCAAAT 4600
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh01904(revised)   3997 TTGTGTTTACCTGGCTATTTCGTGTCCTAACAAATCATAGAAGAGCAAAT 4046

                   4601          .         .         .         .         . 4650
hh01904            4601 CTAAGGTTTCTTAGATAGCATTGTGGCCAAATAGCTTAAAAGGGAATGCA 4650
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh01904(revised)   4047 CTAAGGTTTCTTAGATAGCATTGTGGCCAAATAGCTTAAAAGGGAATGCA 4096

                   4651          .         .         .         .         . 4700
hh01904            4651 TTAAATGATTGTTTTAATACATAGATTACAAGAGCCCAGCTAGCTGATAT 4700
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh01904(revised)   4097 TTAAATGATTGTTTTAATACATAGATTACAAGAGCCCAGCTAGCTGATAT 4146

                   4701          .         .         .         .         . 4750
hh01904            4701 TTTTAATCATATTGTTCGCTTAGGTTTTATTTTTCTGAAAAAAATGAGAT 4750
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh01904(revised)   4147 TTTTAATCATATTGTTCGCTTAGGTTTTATTTTTCTGAAAAAAATGAGAT 4196

                   4751          .         .         .         .         . 4800
hh01904            4751 GATCAGCGTCCAAATGCCTCAGTCATGAAATTGTACCACTGGGTACTAAT 4800
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh01904(revised)   4197 GATCAGCGTCCAAATGCCTCAGTCATGAAATTGTACCACTGGGTACTAAT 4246

                   4801          .         .         .         .         . 4850
hh01904            4801 GGGAAATGAATGTTAAATACGTCTGTAAATGGTTAAGCAAGATGCAAATA 4850
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh01904(revised)   4247 GGGAAATGAATGTTAAATACGTCTGTAAATGGTTAAGCAAGATGCAAATA 4296

                   4851          .         .         .         .         . 4900
hh01904            4851 TAATGTTCTCATTAGTACTATGAACCCCCAAAATTTGAGACAAGTCTCAA 4900
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh01904(revised)   4297 TAATGTTCTCATTAGTACTATGAACCCCCAAAATTTGAGACAAGTCTCAA 4346

                   4901          .         .         .         .         . 4950
hh01904            4901 TTAATTTAGAAAGTTTATTTTGCCGAGGTTGAGGACACACATCCATGACA 4950
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh01904(revised)   4347 TTAATTTAGAAAGTTTATTTTGCCGAGGTTGAGGACACACATCCATGACA 4396

                   4951          .         .         .         .         . 5000
hh01904            4951 CAGCCTCAGGAAGTCCTGATGACATGTGTCCAAGGTGGTTGGGGCACAGC 5000
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh01904(revised)   4397 CAGCCTCAGGAAGTCCTGATGACATGTGTCCAAGGTGGTTGGGGCACAGC 4446

                   5001          .         .         .         .         . 5050
hh01904            5001 TTGGTTTTATACATTTTAGGGGGAGACATGAGACATCAATCAATATATTT 5050
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh01904(revised)   4447 TTGGTTTTATACATTTTAGGGGGAGACATGAGACATCAATCAATATATTT 4496

                   5051          .         .         .         .         . 5100
hh01904            5051 AAGAAGTACATTGGTTCACTCTGGAAAGGCGGGACAATTTGAAGCAAAGG 5100
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh01904(revised)   4497 AAGAAGTACATTGGTTCACTCTGGAAAGGCGGGACAATTTGAAGCAAAGG 4546

                   5101          .         .         .         .         . 5150
hh01904            5101 GAGGAAGACTGGTAGCGGGGAGGGGGCTTCCAGGTCACAGATAGGTGAGA 5150
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh01904(revised)   4547 GAGGAAGACTGGTAGCGGGGAGGGGGCTTCCAGGTCACAGATAGGTGAGA 4596

                   5151          .         .         .         .         . 5200
hh01904            5151 GACAAACAGTTGCACTCTTTTGAGTTTCTGATTAGCTTTTCCAAAGGAGA 5200
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh01904(revised)   4597 GACAAACAGTTGCACTCTTTTGAGTTTCTGATTAGCTTTTCCAAAGGAGA 4646

                   5201          .         .         .         .         . 5250
hh01904            5201 CAGTCAGATCTGCATTTATCTTAGTGAGCAGAGAGGTAACTTTGAATAGA 5250
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh01904(revised)   4647 CAGTCAGATCTGCATTTATCTTAGTGAGCAGAGAGGTAACTTTGAATAGA 4696

                   5251          .         .         .         .         . 5300
hh01904            5251 ATGGGAGGCAGGTTTGCCCTAAGCAGTTTCCAGCCTGAGTTTTCCTTTTA 5300
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh01904(revised)   4697 ATGGGAGGCAGGTTTGCCCTAAGCAGTTTCCAGCCTGAGTTTTCCTTTTA 4746

                   5301          .         .         .         .         . 5350
hh01904            5301 GCTTAGTGATTTTGGAGGCCCAAGATATTTTCCTTTCACAGTACTTACCA 5350
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh01904(revised)   4747 GCTTAGTGATTTTGGAGGCCCAAGATATTTTCCTTTCACAGTACTTACCA 4796

                   5351          .         .         .         .         . 5400
hh01904            5351 GAAAAACAAGGTAATGTATCATTTTACAAGATAGTGCTGAGAGAGTATAA 5400
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh01904(revised)   4797 GAAAAACAAGGTAATGTATCATTTTACAAGATAGTGCTGAGAGAGTATAA 4846

                   5401          .         .         .         .         . 5450
hh01904            5401 AAAGCAGATGTAGGCCGGGCACTGTAGCTCACACCTGTAATCCCAGCACT 5450
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh01904(revised)   4847 AAAGCAGATGTAGGCCGGGCACTGTAGCTCACACCTGTAATCCCAGCACT 4896

                   5451          .         .         .         .         . 5500
hh01904            5451 TTGGGAGGCCGAGGCGAGTGGGTCACTTGAGGTCAGGAATTCAAGACCAG 5500
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh01904(revised)   4897 TTGGGAGGCCGAGGCGAGTGGGTCACTTGAGGTCAGGAATTCAAGACCAG 4946

                   5501          .         .         .         .         . 5550
hh01904            5501 CCTGGACAACATGGTGAAACCCTGTCTCTGCTAAAAATACAAAAATTAGC 5550
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh01904(revised)   4947 CCTGGACAACATGGTGAAACCCTGTCTCTGCTAAAAATACAAAAATTAGC 4996

                   5551          .         .         .         .         . 5600
hh01904            5551 CTGGCATGGTGGCGGGCGCCTATAATCCTAGCTACTTGGGAGGCTGAGGC 5600
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh01904(revised)   4997 CTGGCATGGTGGCGGGCGCCTATAATCCTAGCTACTTGGGAGGCTGAGGC 5046

                   5601          .         .         .         .         . 5650
hh01904            5601 AGGAGAATCGCTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTG 5650
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh01904(revised)   5047 AGGAGAATCGCTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTG 5096

                   5651          .         .         .         .     5694
hh01904            5651 TGCCACTGCACTGCAGCCCAGGTGACAGAGCAAGACTCCATCTC 5694
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh01904(revised)   5097 TGCCACTGCACTGCAGCCCAGGTGACAGAGCAAGACTCCATCTC 5140