Comparison between the cloned and the revised DNA sequences

Cloned DNA sequence, length = 5543 bp
Revised DNA sequence, length = 5536 bp

<< Positions of primers used in RT-PCR experiment(s) >>

 1 : f NN05395  1655 -  1675     GAG AAG CAG CAG GGA ACA AAG
     r NN05396  2055 -  2035     GAC GAG GTG TAG CAG GAG AGA
<< Positions of inserion/deletion/mutation(s) in the aligned sequence >>
 1 :  1792 -  1793        2-bp deletion  (in the revised sequence)
 2 :  1796 -  1797        2-bp mutation  (in the revised sequence)
 3 :  1799 -  1805        7-bp deletion  (in the revised sequence)
 4 :  1808 -  1809        2-bp mutation  (in the revised sequence)
 5 :  1812 -  1813        2-bp insertion (in the revised sequence)
Predicted coding region: colored in green ( 2 - 2221 in the revised sequence).


*- Clone Name -*      1          .         .         .         .         . 50
hh04831b              1 GGCCGCGGGGCCCCCAGGCCTGGAGGCCGAGGGGCGGGCGCCGGAGAGCG 50
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)     1 GGCCGCGGGGCCCCCAGGCCTGGAGGCCGAGGGGCGGGCGCCGGAGAGCG 50

                     51          .         .         .         .         . 100
hh04831b             51 CGGGCCCCGGGCCCGGGGGTGACGCCGCGGAGACCCCCGGCCTGCCCCCG 100
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)    51 CGGGCCCCGGGCCCGGGGGTGACGCCGCGGAGACCCCCGGCCTGCCCCCG 100

                    101          .         .         .         .         . 150
hh04831b            101 GCCCACAGCGGGACCCTCATGATGGCTTTCCGGGACGTCACGGTGCAGAT 150
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)   101 GCCCACAGCGGGACCCTCATGATGGCTTTCCGGGACGTCACGGTGCAGAT 150

                    151          .         .         .         .         . 200
hh04831b            151 CGCCAACCAGAACATATCCGTCTCCTCCTCCACGGCTCTGTCGGTGGCCA 200
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)   151 CGCCAACCAGAACATATCCGTCTCCTCCTCCACGGCTCTGTCGGTGGCCA 200

                    201          .         .         .         .         . 250
hh04831b            201 ACTGCCTGGGCGCTCAGACGGTCCAGGCCCCCGCAGAGCCCGCGGCGGGC 250
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)   201 ACTGCCTGGGCGCTCAGACGGTCCAGGCCCCCGCAGAGCCCGCGGCGGGC 250

                    251          .         .         .         .         . 300
hh04831b            251 AAGGCCGAGCAGGGCGAGACCTCTGGGCGGGAGGCCCCGGAAGCCCCCGC 300
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)   251 AAGGCCGAGCAGGGCGAGACCTCTGGGCGGGAGGCCCCGGAAGCCCCCGC 300

                    301          .         .         .         .         . 350
hh04831b            301 TGTGGGCCGGGAGGACGCGTCAGCCGAGGACTCATGCGCAGAGGCTGGGG 350
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)   301 TGTGGGCCGGGAGGACGCGTCAGCCGAGGACTCATGCGCAGAGGCTGGGG 350

                    351          .         .         .         .         . 400
hh04831b            351 CTAGTGGGGCGGCGGATGGGGCCACAGCCCCCAAAACAGAGGAGGAAGAG 400
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)   351 CTAGTGGGGCGGCGGATGGGGCCACAGCCCCCAAAACAGAGGAGGAAGAG 400

                    401          .         .         .         .         . 450
hh04831b            401 GAGGAGGAGGAGACGGCGGAGGTGGGGAGAGGGGCCGAGGCCGAGGCAGG 450
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)   401 GAGGAGGAGGAGACGGCGGAGGTGGGGAGAGGGGCCGAGGCCGAGGCAGG 450

                    451          .         .         .         .         . 500
hh04831b            451 CGACTTGGAGCAGCTGAGCAGCAGCAGCACGTCCACCAAGTCCGCCAAGT 500
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)   451 CGACTTGGAGCAGCTGAGCAGCAGCAGCACGTCCACCAAGTCCGCCAAGT 500

                    501          .         .         .         .         . 550
hh04831b            501 CAGGCTCGGAGGCGTCGGCCTCCGCCTCCAAGGACGCCCTGCAGGCCATG 550
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)   501 CAGGCTCGGAGGCGTCGGCCTCCGCCTCCAAGGACGCCCTGCAGGCCATG 550

                    551          .         .         .         .         . 600
hh04831b            551 ATCCTGAGCCTGCCGCGCTACCACTGCGAGAACCCAGCCAGCTGCAAGTC 600
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)   551 ATCCTGAGCCTGCCGCGCTACCACTGCGAGAACCCAGCCAGCTGCAAGTC 600

                    601          .         .         .         .         . 650
hh04831b            601 GCCCACGCTCTCCACCGACACCCTGCGCAAGCGGCTCTACCGCATCGGCC 650
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)   601 GCCCACGCTCTCCACCGACACCCTGCGCAAGCGGCTCTACCGCATCGGCC 650

                    651          .         .         .         .         . 700
hh04831b            651 TCAACCTCTTCAACATAAACCCCGACAAGGGCATCCAGTTCCTGATCTCA 700
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)   651 TCAACCTCTTCAACATAAACCCCGACAAGGGCATCCAGTTCCTGATCTCA 700

                    701          .         .         .         .         . 750
hh04831b            701 CGCGGCTTCATCCCGGACACCCCCATCGGTGTGGCCCATTTCCTCCTCCA 750
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)   701 CGCGGCTTCATCCCGGACACCCCCATCGGTGTGGCCCATTTCCTCCTCCA 750

                    751          .         .         .         .         . 800
hh04831b            751 GCGAAAGGGCCTCAGCCGCCAGATGATTGGAGAGTTCCTGGGCAACAGCA 800
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)   751 GCGAAAGGGCCTCAGCCGCCAGATGATTGGAGAGTTCCTGGGCAACAGCA 800

                    801          .         .         .         .         . 850
hh04831b            801 AGAAGCAGTTCAACCGCGACGTGCTGGACTGCGTGGTGGACGAGATGGAC 850
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)   801 AGAAGCAGTTCAACCGCGACGTGCTGGACTGCGTGGTGGACGAGATGGAC 850

                    851          .         .         .         .         . 900
hh04831b            851 TTCTCCAGCATGGAGCTGGACGAGGCCCTGCGCAAGTTCCAGGCACACAT 900
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)   851 TTCTCCAGCATGGAGCTGGACGAGGCCCTGCGCAAGTTCCAGGCACACAT 900

                    901          .         .         .         .         . 950
hh04831b            901 CCGTGTGCAGGGGGAGGCTCAGAAGGTGGAGCGGCTCATTGAGGCCTTCA 950
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)   901 CCGTGTGCAGGGGGAGGCTCAGAAGGTGGAGCGGCTCATTGAGGCCTTCA 950

                    951          .         .         .         .         . 1000
hh04831b            951 GCCAGCGCTACTGCATGTGCAACCCCGAAGTGGTTCAGCAGTTCCACAAC 1000
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)   951 GCCAGCGCTACTGCATGTGCAACCCCGAAGTGGTTCAGCAGTTCCACAAC 1000

                   1001          .         .         .         .         . 1050
hh04831b           1001 CCCGACACTATCTTCATCCTCGCCTTCGCCATCATCCTCCTCAACACCGA 1050
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)  1001 CCCGACACTATCTTCATCCTCGCCTTCGCCATCATCCTCCTCAACACCGA 1050

                   1051          .         .         .         .         . 1100
hh04831b           1051 CATGTACAGCCCCAACATCAAGCCTGACCGGAAGATGATGCTGGAGGACT 1100
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)  1051 CATGTACAGCCCCAACATCAAGCCTGACCGGAAGATGATGCTGGAGGACT 1100

                   1101          .         .         .         .         . 1150
hh04831b           1101 TCATCCGAAACCTTCGAGGTGTGGACGATGGCGCTGACATCCCCAGGGAG 1150
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)  1101 TCATCCGAAACCTTCGAGGTGTGGACGATGGCGCTGACATCCCCAGGGAG 1150

                   1151          .         .         .         .         . 1200
hh04831b           1151 CTGGTGGTAGGCATCTATGAGAGGATACAGCAGAAGGAGCTCAAGTCCAA 1200
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)  1151 CTGGTGGTAGGCATCTATGAGAGGATACAGCAGAAGGAGCTCAAGTCCAA 1200

                   1201          .         .         .         .         . 1250
hh04831b           1201 TGAGGACCACGTCACGTACGTCACCAAGGTGGAGAAGTCCATTGTGGGCA 1250
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)  1201 TGAGGACCACGTCACGTACGTCACCAAGGTGGAGAAGTCCATTGTGGGCA 1250

                   1251          .         .         .         .         . 1300
hh04831b           1251 TGAAGACAGTGCTGTCCGTGCCCCACCGCCGCCTGGTGTGCTGCAGCCGG 1300
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)  1251 TGAAGACAGTGCTGTCCGTGCCCCACCGCCGCCTGGTGTGCTGCAGCCGG 1300

                   1301          .         .         .         .         . 1350
hh04831b           1301 CTCTTCGAGGTGACGGATGTGAACAAGCTGCAGAAGCAGGCAGCGCATCA 1350
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)  1301 CTCTTCGAGGTGACGGATGTGAACAAGCTGCAGAAGCAGGCAGCGCATCA 1350

                   1351          .         .         .         .         . 1400
hh04831b           1351 GAGGGAGGTGTTCCTCTTCAATGACCTGCTGGTGATTCTCAAACTTTGCC 1400
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)  1351 GAGGGAGGTGTTCCTCTTCAATGACCTGCTGGTGATTCTCAAACTTTGCC 1400

                   1401          .         .         .         .         . 1450
hh04831b           1401 CGAAGAAGAAGAGCTCCTCCACGTACACCTTTTGCAAGTCAGTTGGCCTG 1450
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)  1401 CGAAGAAGAAGAGCTCCTCCACGTACACCTTTTGCAAGTCAGTTGGCCTG 1450

                   1451          .         .         .         .         . 1500
hh04831b           1451 CTGGGCATGCAGTTCCAGCTCTTTGAGAACGAGTATTACTCTCATGGCAT 1500
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)  1451 CTGGGCATGCAGTTCCAGCTCTTTGAGAACGAGTATTACTCTCATGGCAT 1500

                   1501          .         .         .         .         . 1550
hh04831b           1501 CACACTGGTGACCCCGCTCTCGGGCTCCGAGAAGAAGCAGGTGCTGCATT 1550
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)  1501 CACACTGGTGACCCCGCTCTCGGGCTCCGAGAAGAAGCAGGTGCTGCATT 1550

                   1551          .         .         .         .         . 1600
hh04831b           1551 TCTGTGCCCTGGGCTCGGACGAGATGCAGAAGTTCGTGGAGGACCTGAAG 1600
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)  1551 TCTGTGCCCTGGGCTCGGACGAGATGCAGAAGTTCGTGGAGGACCTGAAG 1600

                   1601          .         .         .         .         . 1650
hh04831b           1601 GAGTCCATTGCTGAGGTGACGGAGCTGGAGCAGATCCGAATAGAGTGGGA 1650
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)  1601 GAGTCCATTGCTGAGGTGACGGAGCTGGAGCAGATCCGAATAGAGTGGGA 1650

                   1651          .         .         .         .         . 1700
hh04831b           1651 GCTGGAGAAGCAGCAGGGAACAAAGACACTCTCCTTCAAGCCCTGCGGAG 1700
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)  1651 GCTGGAGAAGCAGCAGGGAACAAAGACACTCTCCTTCAAGCCCTGCGGAG 1700

                   1701          .         .         .         .         . 1750
hh04831b           1701 CCCAGGGGGACCCACAGTCAAAGCAAGGATCGCCGACAGCCAAAAGGGAA 1750
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)  1701 CCCAGGGGGACCCACAGTCAAAGCAAGGATCGCCGACAGCCAAAAGGGAA 1750

                   1751          .         .         .         .         . 1800
hh04831b           1751 GCCGCGCTCAGGGAGAGGCCGGCGGAGAGCACGGTGGAGGTAAGTGGAGC 1800
                        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |  
hh04831b(revised)  1751 GCCGCGCTCAGGGAGAGGCCGGCGGAGAGCACGGTGGAGGT--GTCAA-- 1796

                   1801          .         .         .         .         . 1850
hh04831b           1801 CCTGGTTGCCA--AGGCTTCAAACGTCCCAGCACAACTCCGGGCTGGGGG 1848
                             ||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)  1797 -----TTCACAACAGGCTTCAAACGTCCCAGCACAACTCCGGGCTGGGGG 1841

                   1851          .         .         .         .         . 1900
hh04831b           1849 CCGAGAGGGGAGCGCCGGTGCCGCCGCCAGACCTGCAGCCTAGCCCCCCG 1898
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)  1842 CCGAGAGGGGAGCGCCGGTGCCGCCGCCAGACCTGCAGCCTAGCCCCCCG 1891

                   1901          .         .         .         .         . 1950
hh04831b           1899 AGACAGCAGACCCCACCACTGCCGCCGCCGCCACCCACGCCCCCGGGCAC 1948
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)  1892 AGACAGCAGACCCCACCACTGCCGCCGCCGCCACCCACGCCCCCGGGCAC 1941

                   1951          .         .         .         .         . 2000
hh04831b           1949 CCTGGTGCAGTGCCAGCAAATTGTCAAGGTCATTGTCCTGGACAAGCCCT 1998
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)  1942 CCTGGTGCAGTGCCAGCAAATTGTCAAGGTCATTGTCCTGGACAAGCCCT 1991

                   2001          .         .         .         .         . 2050
hh04831b           1999 GCCTGGCCCGCATGGAGCCCCTGCTGAGCCAGGCTCTCTCCTGCTACACC 2048
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)  1992 GCCTGGCCCGCATGGAGCCCCTGCTGAGCCAGGCTCTCTCCTGCTACACC 2041

                   2051          .         .         .         .         . 2100
hh04831b           2049 TCGTCGTCCTCTGACTCCTGCGGCTCCACACCCCTGGGCGGCCCCGGCTC 2098
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)  2042 TCGTCGTCCTCTGACTCCTGCGGCTCCACACCCCTGGGCGGCCCCGGCTC 2091

                   2101          .         .         .         .         . 2150
hh04831b           2099 TCCGGTCAAGGTCACCCACCAGCCTCCGCTGCCCCCGCCCCCACCCCCCT 2148
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)  2092 TCCGGTCAAGGTCACCCACCAGCCTCCGCTGCCCCCGCCCCCACCCCCCT 2141

                   2151          .         .         .         .         . 2200
hh04831b           2149 ACAACCACCCTCACCAGTTCTGTCCCCCAGGCTCCCTGCTGCACGGGCAC 2198
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)  2142 ACAACCACCCTCACCAGTTCTGTCCCCCAGGCTCCCTGCTGCACGGGCAC 2191

                   2201          .         .         .         .         . 2250
hh04831b           2199 CGCTACTCCAGTGGCTCAAGGAGCCTGGTGTAGACTCTGCCCCACCACCC 2248
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)  2192 CGCTACTCCAGTGGCTCAAGGAGCCTGGTGTAGACTCTGCCCCACCACCC 2241

                   2251          .         .         .         .         . 2300
hh04831b           2249 TGCTGTCCTGGGAGGGCTGGCCACTGGGGGGCCTGGGCTGCCCCTCCACT 2298
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)  2242 TGCTGTCCTGGGAGGGCTGGCCACTGGGGGGCCTGGGCTGCCCCTCCACT 2291

                   2301          .         .         .         .         . 2350
hh04831b           2299 GCTCCCCATACCCTGGCACGATGCGTTCCTGGTCACTGATCACCATCATT 2348
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)  2292 GCTCCCCATACCCTGGCACGATGCGTTCCTGGTCACTGATCACCATCATT 2341

                   2351          .         .         .         .         . 2400
hh04831b           2349 TTGGGAAGAGAATCCCAATCCCTGGCACCTGGGTTTGCCTCATCCAACCA 2398
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)  2342 TTGGGAAGAGAATCCCAATCCCTGGCACCTGGGTTTGCCTCATCCAACCA 2391

                   2401          .         .         .         .         . 2450
hh04831b           2399 TCCTTCCCTTTCTCAGCTGCACCCCCTCTGCAGATCTGAAGACACACCTC 2448
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)  2392 TCCTTCCCTTTCTCAGCTGCACCCCCTCTGCAGATCTGAAGACACACCTC 2441

                   2451          .         .         .         .         . 2500
hh04831b           2449 ACTCTCCCAGGGCCCTACACAGCCAGACCCGGCGAGGCCTCCTCTTCCCC 2498
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)  2442 ACTCTCCCAGGGCCCTACACAGCCAGACCCGGCGAGGCCTCCTCTTCCCC 2491

                   2501          .         .         .         .         . 2550
hh04831b           2499 TGGCCACCACTTTCCCCCATTGGACCATGGACTGAAGAAAACGAGCTGAG 2548
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)  2492 TGGCCACCACTTTCCCCCATTGGACCATGGACTGAAGAAAACGAGCTGAG 2541

                   2551          .         .         .         .         . 2600
hh04831b           2549 GGTCTAACGAGCTTGCAGGCTTTGAGTCTGTTAGTGCCCGGGGCCTCGGG 2598
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)  2542 GGTCTAACGAGCTTGCAGGCTTTGAGTCTGTTAGTGCCCGGGGCCTCGGG 2591

                   2601          .         .         .         .         . 2650
hh04831b           2599 CCTTGGGCAGCAGCATGAGGCTGGGCCGGCCGGCAGTGGAGCACTAGACA 2648
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)  2592 CCTTGGGCAGCAGCATGAGGCTGGGCCGGCCGGCAGTGGAGCACTAGACA 2641

                   2651          .         .         .         .         . 2700
hh04831b           2649 GAGTGGCTGGCTCGCAGCCCAGAACTAGTGCCTCTGTAGCTGCACTGAGG 2698
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)  2642 GAGTGGCTGGCTCGCAGCCCAGAACTAGTGCCTCTGTAGCTGCACTGAGG 2691

                   2701          .         .         .         .         . 2750
hh04831b           2699 GGAGGAGGGTTGGTCCCACCCCTGGAGGGACAGGTGGGAGGAGTGAGGAG 2748
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)  2692 GGAGGAGGGTTGGTCCCACCCCTGGAGGGACAGGTGGGAGGAGTGAGGAG 2741

                   2751          .         .         .         .         . 2800
hh04831b           2749 GGGGCTTTTTCTGCCACCCCCGCCCCCAAGCCTGAAACTCTCAGGAGTCT 2798
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)  2742 GGGGCTTTTTCTGCCACCCCCGCCCCCAAGCCTGAAACTCTCAGGAGTCT 2791

                   2801          .         .         .         .         . 2850
hh04831b           2799 ACTTCTTGGTCCCCAGGGACATTGGCTGTCCTGACCATGTCCTTCCCCCT 2848
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)  2792 ACTTCTTGGTCCCCAGGGACATTGGCTGTCCTGACCATGTCCTTCCCCCT 2841

                   2851          .         .         .         .         . 2900
hh04831b           2849 CCTCCCAGGGCCTCTGCTTCCTCAGGAGCTGCCCAGACTCCAGAAAAGCC 2898
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)  2842 CCTCCCAGGGCCTCTGCTTCCTCAGGAGCTGCCCAGACTCCAGAAAAGCC 2891

                   2901          .         .         .         .         . 2950
hh04831b           2899 TGGAAAAAGGGAGGCGGGAAGGGGAGCACTTTCGGCTTTCTATAGGTCAG 2948
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)  2892 TGGAAAAAGGGAGGCGGGAAGGGGAGCACTTTCGGCTTTCTATAGGTCAG 2941

                   2951          .         .         .         .         . 3000
hh04831b           2949 TCCAGCAGGGCCATGGGATCGCGAGGTCATGTATCTGCAAAATGCACCTT 2998
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)  2942 TCCAGCAGGGCCATGGGATCGCGAGGTCATGTATCTGCAAAATGCACCTT 2991

                   3001          .         .         .         .         . 3050
hh04831b           2999 TTTAAAGAGTGTCTTAGTTCCCCAGCCCCAGCTAATACCCGGCCAATGCC 3048
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)  2992 TTTAAAGAGTGTCTTAGTTCCCCAGCCCCAGCTAATACCCGGCCAATGCC 3041

                   3051          .         .         .         .         . 3100
hh04831b           3049 GTGTACGCACAGGCATGTGCACGCAAACACGCATGAGAACCAGGCCATTC 3098
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)  3042 GTGTACGCACAGGCATGTGCACGCAAACACGCATGAGAACCAGGCCATTC 3091

                   3101          .         .         .         .         . 3150
hh04831b           3099 CTTCCGCTGTGGAAGCAGAACTGGAGACGGGGCAGGAATGTGCCCAGCAG 3148
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)  3092 CTTCCGCTGTGGAAGCAGAACTGGAGACGGGGCAGGAATGTGCCCAGCAG 3141

                   3151          .         .         .         .         . 3200
hh04831b           3149 AGATGGGGCTCAGCCCGAGGCAGGGCTCCCTCCTGCATGAGGCTCGGCCC 3198
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)  3142 AGATGGGGCTCAGCCCGAGGCAGGGCTCCCTCCTGCATGAGGCTCGGCCC 3191

                   3201          .         .         .         .         . 3250
hh04831b           3199 GAGGCAGGGCTCCCTCCTGCATGAGTCTGTGGCCTCCAGGAGGGACTTGG 3248
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)  3192 GAGGCAGGGCTCCCTCCTGCATGAGTCTGTGGCCTCCAGGAGGGACTTGG 3241

                   3251          .         .         .         .         . 3300
hh04831b           3249 GTGCAGATGTAAGCAAGAAAAACCGGGGCTCCAGAGGCATGTGCATTTCC 3298
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)  3242 GTGCAGATGTAAGCAAGAAAAACCGGGGCTCCAGAGGCATGTGCATTTCC 3291

                   3301          .         .         .         .         . 3350
hh04831b           3299 CCTGCGCCCCTCAGCCTTTAAATATTCCCTCCTCCTAGAAGGTTCTAGAC 3348
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)  3292 CCTGCGCCCCTCAGCCTTTAAATATTCCCTCCTCCTAGAAGGTTCTAGAC 3341

                   3351          .         .         .         .         . 3400
hh04831b           3349 CCCCCCCTTCCAGCAGGGGTGCCCAAGAGTCCCTGGACCCTCAAAATTGC 3398
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)  3342 CCCCCCCTTCCAGCAGGGGTGCCCAAGAGTCCCTGGACCCTCAAAATTGC 3391

                   3401          .         .         .         .         . 3450
hh04831b           3399 AAAGGAGACCCAAGCGGGGCTCGCTGACCTCCCAGGGCCCAGCAAGATGG 3448
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)  3392 AAAGGAGACCCAAGCGGGGCTCGCTGACCTCCCAGGGCCCAGCAAGATGG 3441

                   3451          .         .         .         .         . 3500
hh04831b           3449 GATAGCCAGCCTTAGGTGGCCCCACGAGCCCAAGCCTGGGGAAGGGCCCC 3498
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)  3442 GATAGCCAGCCTTAGGTGGCCCCACGAGCCCAAGCCTGGGGAAGGGCCCC 3491

                   3501          .         .         .         .         . 3550
hh04831b           3499 TCCCCAGCCAGACGAGAGGCAGCCACCCCAGAGACCACAGGAGCCGTACC 3548
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)  3492 TCCCCAGCCAGACGAGAGGCAGCCACCCCAGAGACCACAGGAGCCGTACC 3541

                   3551          .         .         .         .         . 3600
hh04831b           3549 ATGGCCTGCGCAGTCAGGCCCTATCAGGATGTGTCTGTCCCAAGCCTGGC 3598
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)  3542 ATGGCCTGCGCAGTCAGGCCCTATCAGGATGTGTCTGTCCCAAGCCTGGC 3591

                   3601          .         .         .         .         . 3650
hh04831b           3599 CAGGCTCCAGTCCTGTGCCAGTAGCTCACTGCTGTCCTATGTGCAGGTCC 3648
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)  3592 CAGGCTCCAGTCCTGTGCCAGTAGCTCACTGCTGTCCTATGTGCAGGTCC 3641

                   3651          .         .         .         .         . 3700
hh04831b           3649 CCCAACACTTGGAGCCTGTGGTTAAGGCCTCCTGGGAGAGGCAGTGAGCA 3698
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)  3642 CCCAACACTTGGAGCCTGTGGTTAAGGCCTCCTGGGAGAGGCAGTGAGCA 3691

                   3701          .         .         .         .         . 3750
hh04831b           3699 TGAGTCAAAGGTGACATGGACTTGAATCTCCCCACCCCGCCCCGCCTGCA 3748
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)  3692 TGAGTCAAAGGTGACATGGACTTGAATCTCCCCACCCCGCCCCGCCTGCA 3741

                   3751          .         .         .         .         . 3800
hh04831b           3749 GTAGCCGGGCCAGGTAGGAGGCAAGGATCATTCCCTGCTCCCAGAGGTTC 3798
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)  3742 GTAGCCGGGCCAGGTAGGAGGCAAGGATCATTCCCTGCTCCCAGAGGTTC 3791

                   3801          .         .         .         .         . 3850
hh04831b           3799 CAGATGACCTAGTTTCGTTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGGTCACCCAGACG 3848
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)  3792 CAGATGACCTAGTTTCGTTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGGTCACCCAGACG 3841

                   3851          .         .         .         .         . 3900
hh04831b           3849 TCACTGTGATATCACCTAGTGAATCTATTTCTGGCCCTGTCTTCGTCGGC 3898
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)  3842 TCACTGTGATATCACCTAGTGAATCTATTTCTGGCCCTGTCTTCGTCGGC 3891

                   3901          .         .         .         .         . 3950
hh04831b           3899 CCAGTTTCTGTAACTTGCAGCCAATTTGCCCTCTCCCCTGTGGCTGCCAG 3948
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)  3892 CCAGTTTCTGTAACTTGCAGCCAATTTGCCCTCTCCCCTGTGGCTGCCAG 3941

                   3951          .         .         .         .         . 4000
hh04831b           3949 CCCATCTGCCCCTCTGTGTCCTTGCTGCCCTGGCCCTCCTCTGTTTTCTG 3998
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)  3942 CCCATCTGCCCCTCTGTGTCCTTGCTGCCCTGGCCCTCCTCTGTTTTCTG 3991

                   4001          .         .         .         .         . 4050
hh04831b           3999 TAACAGATGCTCCAGTCATTGCCTTTCAGAGTGGAGCAGATGACAGATGG 4048
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)  3992 TAACAGATGCTCCAGTCATTGCCTTTCAGAGTGGAGCAGATGACAGATGG 4041

                   4051          .         .         .         .         . 4100
hh04831b           4049 GGTGCACGCATTCAGACACCTCTGATGCCCTTAGCCAGGGCAGGGATCGT 4098
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)  4042 GGTGCACGCATTCAGACACCTCTGATGCCCTTAGCCAGGGCAGGGATCGT 4091

                   4101          .         .         .         .         . 4150
hh04831b           4099 CCTTAAAGTGAAGGCCTGGACAGGAGGAGTCAGGGACTTGGGAGGAGGTG 4148
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)  4092 CCTTAAAGTGAAGGCCTGGACAGGAGGAGTCAGGGACTTGGGAGGAGGTG 4141

                   4151          .         .         .         .         . 4200
hh04831b           4149 GAGCTGTGGGGATGGGAGTGGAGGAATCAAAATGAGGGAAGCTGAAAATA 4198
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)  4142 GAGCTGTGGGGATGGGAGTGGAGGAATCAAAATGAGGGAAGCTGAAAATA 4191

                   4201          .         .         .         .         . 4250
hh04831b           4199 GAATGAAAACGATGACTAAGAGGCAGGGAGTGCGAGGTATGGGGGAATAG 4248
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)  4192 GAATGAAAACGATGACTAAGAGGCAGGGAGTGCGAGGTATGGGGGAATAG 4241

                   4251          .         .         .         .         . 4300
hh04831b           4249 GAACTATGAGCTAAATATACTTATGGGGTGGGGGCCGTGGGGGCCAGGGA 4298
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)  4242 GAACTATGAGCTAAATATACTTATGGGGTGGGGGCCGTGGGGGCCAGGGA 4291

                   4301          .         .         .         .         . 4350
hh04831b           4299 CACTCTCCCAGACAGCCCTGACCCGCCAGGCAGGACCCCGTCCCCTGCTC 4348
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)  4292 CACTCTCCCAGACAGCCCTGACCCGCCAGGCAGGACCCCGTCCCCTGCTC 4341

                   4351          .         .         .         .         . 4400
hh04831b           4349 ACACAGCTCTTCAAGCTTACCAAGGACAGGCAGGACCCCGTCCCCTGCTC 4398
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)  4342 ACACAGCTCTTCAAGCTTACCAAGGACAGGCAGGACCCCGTCCCCTGCTC 4391

                   4401          .         .         .         .         . 4450
hh04831b           4399 ACACAGCTCTTCAAGCTTACCAAGTGCCCTCAACAGGGGAGAGCAACCCC 4448
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)  4392 ACACAGCTCTTCAAGCTTACCAAGTGCCCTCAACAGGGGAGAGCAACCCC 4441

                   4451          .         .         .         .         . 4500
hh04831b           4449 AGGCCCTCCCTCCCACCTCAGCTGAAGCCCCAATCTTCCAAATCGGAACC 4498
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)  4442 AGGCCCTCCCTCCCACCTCAGCTGAAGCCCCAATCTTCCAAATCGGAACC 4491

                   4501          .         .         .         .         . 4550
hh04831b           4499 AGCAAGTCTTAGGGCTGGCACGCATCTGGGCCTCTAGCTGAGAACCCGGA 4548
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)  4492 AGCAAGTCTTAGGGCTGGCACGCATCTGGGCCTCTAGCTGAGAACCCGGA 4541

                   4551          .         .         .         .         . 4600
hh04831b           4549 CTCTCAGGCACCTCAGTGCCCCTGCCCCAGGGCAGAGGCCCACCCCGTGG 4598
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)  4542 CTCTCAGGCACCTCAGTGCCCCTGCCCCAGGGCAGAGGCCCACCCCGTGG 4591

                   4601          .         .         .         .         . 4650
hh04831b           4599 GTTGGTGCAGTGGCTGCCCTGGGCTCCACGGGCAGCACAGGGAGTCTGTC 4648
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)  4592 GTTGGTGCAGTGGCTGCCCTGGGCTCCACGGGCAGCACAGGGAGTCTGTC 4641

                   4651          .         .         .         .         . 4700
hh04831b           4649 CAGGAAGCAGCCCAGCCGGGGTCAGTATTCCGTGGAGCCAGTCCTGAGCT 4698
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)  4642 CAGGAAGCAGCCCAGCCGGGGTCAGTATTCCGTGGAGCCAGTCCTGAGCT 4691

                   4701          .         .         .         .         . 4750
hh04831b           4699 GGGAGGGGCATTTAACACCCCTGAGGGCCTGGGGCAGGACACAGCTGGCC 4748
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)  4692 GGGAGGGGCATTTAACACCCCTGAGGGCCTGGGGCAGGACACAGCTGGCC 4741

                   4751          .         .         .         .         . 4800
hh04831b           4749 CTCCTCATTGTCAGGGGAAGCAAGTGCCCAACATCTGTAACCTCCCTTCC 4798
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)  4742 CTCCTCATTGTCAGGGGAAGCAAGTGCCCAACATCTGTAACCTCCCTTCC 4791

                   4801          .         .         .         .         . 4850
hh04831b           4799 CTGCTCAGTCCCCAGGCCAAGGTTGGGACCCCTCTCCATCCCTGTCCCCA 4848
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)  4792 CTGCTCAGTCCCCAGGCCAAGGTTGGGACCCCTCTCCATCCCTGTCCCCA 4841

                   4851          .         .         .         .         . 4900
hh04831b           4849 GAGCCTAGACCTCAGGGACCTAGGAAAAGCCTCTTGCTCCCTCCCCACGG 4898
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)  4842 GAGCCTAGACCTCAGGGACCTAGGAAAAGCCTCTTGCTCCCTCCCCACGG 4891

                   4901          .         .         .         .         . 4950
hh04831b           4899 CAGCAGACAGGGCAGGGCCTCCAGCCCCCAGAGGGCCGGTGGGGGGTGCT 4948
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)  4892 CAGCAGACAGGGCAGGGCCTCCAGCCCCCAGAGGGCCGGTGGGGGGTGCT 4941

                   4951          .         .         .         .         . 5000
hh04831b           4949 CTCGGGCCTTCCTGCTCTCCTAAGGTTGCGGGGACAGTAGAGTGCTGAGC 4998
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)  4942 CTCGGGCCTTCCTGCTCTCCTAAGGTTGCGGGGACAGTAGAGTGCTGAGC 4991

                   5001          .         .         .         .         . 5050
hh04831b           4999 CCCAGACCCAGTCACCCCAAGATGGCCCCACTCTATCCACTCTCTAGACC 5048
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)  4992 CCCAGACCCAGTCACCCCAAGATGGCCCCACTCTATCCACTCTCTAGACC 5041

                   5051          .         .         .         .         . 5100
hh04831b           5049 TTTGGGAAATCTGGGTCCCTCTCCTGATTTGATCCATTCGGCCCCAACTC 5098
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)  5042 TTTGGGAAATCTGGGTCCCTCTCCTGATTTGATCCATTCGGCCCCAACTC 5091

                   5101          .         .         .         .         . 5150
hh04831b           5099 CAGAGTCGGGAATGGGAGATGAAACTAGTTTTCCACCCACTTTTGGACAA 5148
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)  5092 CAGAGTCGGGAATGGGAGATGAAACTAGTTTTCCACCCACTTTTGGACAA 5141

                   5151          .         .         .         .         . 5200
hh04831b           5149 GTCCCACCCCTAGATCTGAAGCAAGCTCTACCAGCAGCGTGTCCTGGAAG 5198
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)  5142 GTCCCACCCCTAGATCTGAAGCAAGCTCTACCAGCAGCGTGTCCTGGAAG 5191

                   5201          .         .         .         .         . 5250
hh04831b           5199 CCTGCCTGCCTGCCTGCCCGTCTGCACAGGTGTCTTGATCCAGCCCTGCG 5248
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)  5192 CCTGCCTGCCTGCCTGCCCGTCTGCACAGGTGTCTTGATCCAGCCCTGCG 5241

                   5251          .         .         .         .         . 5300
hh04831b           5249 TCTTCGAGCCCCTGTGCCACCGGTCCCCACGGCCCGCCAGGAGTCTCTTT 5298
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)  5242 TCTTCGAGCCCCTGTGCCACCGGTCCCCACGGCCCGCCAGGAGTCTCTTT 5291

                   5301          .         .         .         .         . 5350
hh04831b           5299 GTACCCACTAGGCTTCCCTGATGACCATCTGTCTGTCCGTCCCTGTTTTT 5348
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)  5292 GTACCCACTAGGCTTCCCTGATGACCATCTGTCTGTCCGTCCCTGTTTTT 5341

                   5351          .         .         .         .         . 5400
hh04831b           5349 GCTGTACATAACTCCTGCTGCACCCTCTCCCCGCACACCCGTCACCCATG 5398
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)  5342 GCTGTACATAACTCCTGCTGCACCCTCTCCCCGCACACCCGTCACCCATG 5391

                   5401          .         .         .         .         . 5450
hh04831b           5399 AGAGAGAAACCTCTCTAGGGAAAGGCAGGGTGGCTGCACCCAGCAACTAA 5448
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)  5392 AGAGAGAAACCTCTCTAGGGAAAGGCAGGGTGGCTGCACCCAGCAACTAA 5441

                   5451          .         .         .         .         . 5500
hh04831b           5449 TCCAAATGGCAAATATTTTGTAACAAAATAGCCCAGAGGTATTTTATCTG 5498
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)  5442 TCCAAATGGCAAATATTTTGTAACAAAATAGCCCAGAGGTATTTTATCTG 5491

                   5501          .         .         .         .      5545
hh04831b           5499 TTCAATTCATAGAGTTTTAGAGATTATATTGAAAGATGTCACTTG 5543
                        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh04831b(revised)  5492 TTCAATTCATAGAGTTTTAGAGATTATATTGAAAGATGTCACTTG 5536