Comparison between the cloned and the revised DNA sequences

Cloned DNA sequence, length = 5815 bp
Revised DNA sequence, length = 5817 bp

<< Positions of primers used in RT-PCR experiment(s) >>

 1 : f NN05329  2613 -  2633     TCT GGG TCG TTC TGT CCT TCA
     r NN05330  2995 -  2975     CTC GAT CAT GCC TGC TGT GTC
<< Positions of inserion/deletion/mutation(s) in the aligned sequence >>
 1 :  2823 -  2824        2-bp insertion (in the revised sequence)
Predicted coding region: colored in green ( 2 - 5653 in the revised sequence).


*- Clone Name -*      1          .         .         .         .         . 50
hh05359               1 GAGCGGCGCCCTGCTCTGGCCGTTGCTCCCGCTCCTGCTCCTGCTGCTGT 50
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)      1 GAGCGGCGCCCTGCTCTGGCCGTTGCTCCCGCTCCTGCTCCTGCTGCTGT 50

                     51          .         .         .         .         . 100
hh05359              51 CGGCGCGGGACGGCGTGCGCGCCGCGCAGCCTCAGGCCCCGGGTTACTTG 100
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)     51 CGGCGCGGGACGGCGTGCGCGCCGCGCAGCCTCAGGCCCCGGGTTACTTG 100

                    101          .         .         .         .         . 150
hh05359             101 ATTGCAGCTCCCTCTGTTTTTCGCGCGGGCGTGGAGGAAGTCATCAGCGT 150
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)    101 ATTGCAGCTCCCTCTGTTTTTCGCGCGGGCGTGGAGGAAGTCATCAGCGT 150

                    151          .         .         .         .         . 200
hh05359             151 GACCATCTTTAACTCTCCAAGGGAAGTCACGGTCCAGGCTCAGCTGGTGG 200
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)    151 GACCATCTTTAACTCTCCAAGGGAAGTCACGGTCCAGGCTCAGCTGGTGG 200

                    201          .         .         .         .         . 250
hh05359             201 CCCAGGGTGAGCCGGTGGTGCAGAGCCAGGGAGCCATCCTGGATAAAGGG 250
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)    201 CCCAGGGTGAGCCGGTGGTGCAGAGCCAGGGAGCCATCCTGGATAAAGGG 250

                    251          .         .         .         .         . 300
hh05359             251 ACAATCAAACTCAAGGTGCCCACGGGCCTCCGGGGCCAAGCGCTTCTGAA 300
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)    251 ACAATCAAACTCAAGGTGCCCACGGGCCTCCGGGGCCAAGCGCTTCTGAA 300

                    301          .         .         .         .         . 350
hh05359             301 AGTGTGGGGCCGCGGCTGGCAGGCGGAGGAGGGGCCCCTCTTTCACAACC 350
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)    301 AGTGTGGGGCCGCGGCTGGCAGGCGGAGGAGGGGCCCCTCTTTCACAACC 350

                    351          .         .         .         .         . 400
hh05359             351 AGACCTCGGTGACCGTGGACGGCCGGGGCGCTTCTGTATTCATCCAGACG 400
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)    351 AGACCTCGGTGACCGTGGACGGCCGGGGCGCTTCTGTATTCATCCAGACG 400

                    401          .         .         .         .         . 450
hh05359             401 GACAAGCCTGTGTACAGACCCCAGCACCGAGTGCTCATAAGCATCTTCAC 450
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)    401 GACAAGCCTGTGTACAGACCCCAGCACCGAGTGCTCATAAGCATCTTCAC 450

                    451          .         .         .         .         . 500
hh05359             451 CGTCTCTCCAAATCTGAGGCCTGTCAACGAGAAGCTGGAAGCCTACATCC 500
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)    451 CGTCTCTCCAAATCTGAGGCCTGTCAACGAGAAGCTGGAAGCCTACATCC 500

                    501          .         .         .         .         . 550
hh05359             501 TGGACCCCCGAGGCTCTCGGATGATAGAGTGGAGACACTTAAAGCCGTTC 550
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)    501 TGGACCCCCGAGGCTCTCGGATGATAGAGTGGAGACACTTAAAGCCGTTC 550

                    551          .         .         .         .         . 600
hh05359             551 TGCTGCGGCATCACCAACATGAGCTTCCCCTTGTCCGACCAGCCTGTGTT 600
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)    551 TGCTGCGGCATCACCAACATGAGCTTCCCCTTGTCCGACCAGCCTGTGTT 600

                    601          .         .         .         .         . 650
hh05359             601 GGGAGAATGGTTCATTTTTGTTGAAATGCAAGGCCACGCGTACAACAAGT 650
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)    601 GGGAGAATGGTTCATTTTTGTTGAAATGCAAGGCCACGCGTACAACAAGT 650

                    651          .         .         .         .         . 700
hh05359             651 CTTTTGAAGTTCAGAAGTATGTGTTGCCCAAGTTTGAGCTTCTGATTGAC 700
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)    651 CTTTTGAAGTTCAGAAGTATGTGTTGCCCAAGTTTGAGCTTCTGATTGAC 700

                    701          .         .         .         .         . 750
hh05359             701 CCGCCCCGGTATATCCAAGACCTGGACGCCTGTGAGACAGGCACTGTGCG 750
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)    701 CCGCCCCGGTATATCCAAGACCTGGACGCCTGTGAGACAGGCACTGTGCG 750

                    751          .         .         .         .         . 800
hh05359             751 GGCCAGGTATACCTTTGGGAAACCTGTGGCTGGTGCCTTAACGATCAACA 800
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)    751 GGCCAGGTATACCTTTGGGAAACCTGTGGCTGGTGCCTTAACGATCAACA 800

                    801          .         .         .         .         . 850
hh05359             801 TGACTGTTAATGGTGTAGGGTACTACAGCCACGAGGTGGGACGCCCTGTC 850
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)    801 TGACTGTTAATGGTGTAGGGTACTACAGCCACGAGGTGGGACGCCCTGTC 850

                    851          .         .         .         .         . 900
hh05359             851 CTCAGAACAACCAAGATCCTCGGCTCCCAGGACTTCGACATCTGCGTGAG 900
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)    851 CTCAGAACAACCAAGATCCTCGGCTCCCAGGACTTCGACATCTGCGTGAG 900

                    901          .         .         .         .         . 950
hh05359             901 GGACATGATCCCAGCGGACGTCCCTGAGCACTTCCGGGGCAGGGTCAGCA 950
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)    901 GGACATGATCCCAGCGGACGTCCCTGAGCACTTCCGGGGCAGGGTCAGCA 950

                    951          .         .         .         .         . 1000
hh05359             951 TCTGGGCCATGGTGACCAGTGTGGACGGGAGCCAGCAGGTCGCGTTCGAT 1000
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)    951 TCTGGGCCATGGTGACCAGTGTGGACGGGAGCCAGCAGGTCGCGTTCGAT 1000

                   1001          .         .         .         .         . 1050
hh05359            1001 GACTCCACCCCCGTGCAGAGGCAGCTGGTGGACATCCGGTACTCCAAGGA 1050
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)   1001 GACTCCACCCCCGTGCAGAGGCAGCTGGTGGACATCCGGTACTCCAAGGA 1050

                   1051          .         .         .         .         . 1100
hh05359            1051 CACGAGGAAGCAGTTCAAGCCGGGCCTGGCCTACGTGGGGAAGGTGGAGC 1100
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)   1051 CACGAGGAAGCAGTTCAAGCCGGGCCTGGCCTACGTGGGGAAGGTGGAGC 1100

                   1101          .         .         .         .         . 1150
hh05359            1101 TATCCTACCCCGATGGCAGCCCAGCTGAGGGGGTGACGGTCCAGATTAAG 1150
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)   1101 TATCCTACCCCGATGGCAGCCCAGCTGAGGGGGTGACGGTCCAGATTAAG 1150

                   1151          .         .         .         .         . 1200
hh05359            1151 GCAGAGCTGACACCAAAGGATAACATCTACACCAGTGAAGTTGTGTCCCA 1200
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)   1151 GCAGAGCTGACACCAAAGGATAACATCTACACCAGTGAAGTTGTGTCCCA 1200

                   1201          .         .         .         .         . 1250
hh05359            1201 GCGTGGACTAGTGGGGTTTGAAATCCCCTCCATCCCCACGTCAGCCCAGC 1250
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)   1201 GCGTGGACTAGTGGGGTTTGAAATCCCCTCCATCCCCACGTCAGCCCAGC 1250

                   1251          .         .         .         .         . 1300
hh05359            1251 ACGTGTGGCTGGAGACCAAGGTGATGGCACTGAACGGGAAGCCCGTGGGG 1300
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)   1251 ACGTGTGGCTGGAGACCAAGGTGATGGCACTGAACGGGAAGCCCGTGGGG 1300

                   1301          .         .         .         .         . 1350
hh05359            1301 GCTCAGTACCTGCCCAGCTACCTCTCCCTCGGCAGCTGGTACTCCCCCAG 1350
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)   1301 GCTCAGTACCTGCCCAGCTACCTCTCCCTCGGCAGCTGGTACTCCCCCAG 1350

                   1351          .         .         .         .         . 1400
hh05359            1351 CCAGTGCTACCTGCAGCTGCAGCCACCCTCCCACCCACTGCAGGTTGGGG 1400
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)   1351 CCAGTGCTACCTGCAGCTGCAGCCACCCTCCCACCCACTGCAGGTTGGGG 1400

                   1401          .         .         .         .         . 1450
hh05359            1401 AAGAAGCCTATTTTTCTGTGAAGTCCACATGTCCCTGCAACTTTACCCTG 1450
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)   1401 AAGAAGCCTATTTTTCTGTGAAGTCCACATGTCCCTGCAACTTTACCCTG 1450

                   1451          .         .         .         .         . 1500
hh05359            1451 TACTACGAGGTGGCTGCACGGGGCAATATTGTGCTATCGGGCCAGCAGCC 1500
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)   1451 TACTACGAGGTGGCTGCACGGGGCAATATTGTGCTATCGGGCCAGCAGCC 1500

                   1501          .         .         .         .         . 1550
hh05359            1501 TGCCCACACCACCCAGCAGCGAAGCAAGCGGGCGGCCCCTGCCCTGGAGA 1550
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)   1501 TGCCCACACCACCCAGCAGCGAAGCAAGCGGGCGGCCCCTGCCCTGGAGA 1550

                   1551          .         .         .         .         . 1600
hh05359            1551 AACCGATTCGTTTAACACACCTTTCTGAGACAGAGCCCCCACCAGCCCCA 1600
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)   1551 AACCGATTCGTTTAACACACCTTTCTGAGACAGAGCCCCCACCAGCCCCA 1600

                   1601          .         .         .         .         . 1650
hh05359            1601 GAAGCTGAGGTCGACGTGTGTGTGACCTCTCTTCATCTGGCCGTGACCCC 1650
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)   1601 GAAGCTGAGGTCGACGTGTGTGTGACCTCTCTTCATCTGGCCGTGACCCC 1650

                   1651          .         .         .         .         . 1700
hh05359            1651 CAGCATGGTCCCCCTTGGTCGCCTGCTGGTCTTCTACGTCAGGGAGAATG 1700
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)   1651 CAGCATGGTCCCCCTTGGTCGCCTGCTGGTCTTCTACGTCAGGGAGAATG 1700

                   1701          .         .         .         .         . 1750
hh05359            1701 GAGAAGGGGTCGCCGACAGCCTTCAGTTTGCAGTCGAGACCTTCTTCGAA 1750
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)   1701 GAGAAGGGGTCGCCGACAGCCTTCAGTTTGCAGTCGAGACCTTCTTCGAA 1750

                   1751          .         .         .         .         . 1800
hh05359            1751 AACCAGGTTTCAGTGACGTATTCAGCAAATGAGACCCAACCTGGGGAGGT 1800
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)   1751 AACCAGGTTTCAGTGACGTATTCAGCAAATGAGACCCAACCTGGGGAGGT 1800

                   1801          .         .         .         .         . 1850
hh05359            1801 TGTCGACCTGCGGATCAGGGCTGCAAGGGGCAGCTGTGTGTGCGTCGCCG 1850
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)   1801 TGTCGACCTGCGGATCAGGGCTGCAAGGGGCAGCTGTGTGTGCGTCGCCG 1850

                   1851          .         .         .         .         . 1900
hh05359            1851 CAGTTGATAAGAGTGTCTACCTGCTCAGGTCTGGGTTCCGGCTGACTCCT 1900
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)   1851 CAGTTGATAAGAGTGTCTACCTGCTCAGGTCTGGGTTCCGGCTGACTCCT 1900

                   1901          .         .         .         .         . 1950
hh05359            1901 GCCCAGGTTTTCCAGGAACTGGAAGATTATGATGTTTCTGATTCCTTTGG 1950
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)   1901 GCCCAGGTTTTCCAGGAACTGGAAGATTATGATGTTTCTGATTCCTTTGG 1950

                   1951          .         .         .         .         . 2000
hh05359            1951 CGTGTCCAGGGAGGATGGTCCTTTTTGGTGGGCTGGGCTGACGGCACAAC 2000
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)   1951 CGTGTCCAGGGAGGATGGTCCTTTTTGGTGGGCTGGGCTGACGGCACAAC 2000

                   2001          .         .         .         .         . 2050
hh05359            2001 GACGCCGGCGCTCCTCTGTCTTCCCGTGGCCTTGGGGCATCACCAAGGAC 2050
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)   2001 GACGCCGGCGCTCCTCTGTCTTCCCGTGGCCTTGGGGCATCACCAAGGAC 2050

                   2051          .         .         .         .         . 2100
hh05359            2051 TCTGGGTTTGCCTTCACCGAAACGGGACTGGTGGTGATGACCGACCGAGT 2100
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)   2051 TCTGGGTTTGCCTTCACCGAAACGGGACTGGTGGTGATGACCGACCGAGT 2100

                   2101          .         .         .         .         . 2150
hh05359            2101 GAGCCTGAACCACCGGCAGGACGGTGGCCTCTACACCGATGAGGCTGTCC 2150
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)   2101 GAGCCTGAACCACCGGCAGGACGGTGGCCTCTACACCGATGAGGCTGTCC 2150

                   2151          .         .         .         .         . 2200
hh05359            2151 CCGCTTTCCAGCCCCACACAGGGAGCCTGGTGGCAGTGGCTCCTTCCAGG 2200
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)   2151 CCGCTTTCCAGCCCCACACAGGGAGCCTGGTGGCAGTGGCTCCTTCCAGG 2200

                   2201          .         .         .         .         . 2250
hh05359            2201 CACCCCCCCAGAACAGAGAAGAGAAAAAGGACTTTCTTCCCCGAAACATG 2250
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)   2201 CACCCCCCCAGAACAGAGAAGAGAAAAAGGACTTTCTTCCCCGAAACATG 2250

                   2251          .         .         .         .         . 2300
hh05359            2251 GATTTGGCATTGTCTCAACATCAGTGACCCATCTGGTGAGGGGACACTCA 2300
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)   2251 GATTTGGCATTGTCTCAACATCAGTGACCCATCTGGTGAGGGGACACTCA 2300

                   2301          .         .         .         .         . 2350
hh05359            2301 GTGTGAAGGTCCCGGACTCCATCACCAGCTGGGTGGGTGAGGCCGTGGCC 2350
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)   2301 GTGTGAAGGTCCCGGACTCCATCACCAGCTGGGTGGGTGAGGCCGTGGCC 2350

                   2351          .         .         .         .         . 2400
hh05359            2351 CTGTCCACCTCTCAGGGCTTAGGCATCGCCGAGCCCTCCCTGCTGAAGAC 2400
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)   2351 CTGTCCACCTCTCAGGGCTTAGGCATCGCCGAGCCCTCCCTGCTGAAGAC 2400

                   2401          .         .         .         .         . 2450
hh05359            2401 CTTCAAGCCCTTCTTCGTGGACTTCATGCTCCCCGCTCTCATCATCCGTG 2450
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)   2401 CTTCAAGCCCTTCTTCGTGGACTTCATGCTCCCCGCTCTCATCATCCGTG 2450

                   2451          .         .         .         .         . 2500
hh05359            2451 GGGAGCAGGTCAAGATCCCGCTCAGTGTCTACAACTACATGGGCACCTGC 2500
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)   2451 GGGAGCAGGTCAAGATCCCGCTCAGTGTCTACAACTACATGGGCACCTGC 2500

                   2501          .         .         .         .         . 2550
hh05359            2501 GCTGAGGTGTACATGAAGCTCTCGGTTCCCAAGGGCATCCAGTTTGTTGG 2550
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)   2501 GCTGAGGTGTACATGAAGCTCTCGGTTCCCAAGGGCATCCAGTTTGTTGG 2550

                   2551          .         .         .         .         . 2600
hh05359            2551 GCATCCTGGCAAACGCCATGTGACCAAGAAGATGTGTGTGGCCCCCGGGG 2600
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)   2551 GCATCCTGGCAAACGCCATGTGACCAAGAAGATGTGTGTGGCCCCCGGGG 2600

                   2601          .         .         .         .         . 2650
hh05359            2601 AGGCTGAGCCCATCTGGGTCGTTCTGTCCTTCAGCGACCTGGGACTCAAC 2650
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)   2601 AGGCTGAGCCCATCTGGGTCGTTCTGTCCTTCAGCGACCTGGGACTCAAC 2650

                   2651          .         .         .         .         . 2700
hh05359            2651 AACATCACGGCCAAAGCCCTTGCTTACGGAGACACAAATTGCTGCCGGGA 2700
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)   2651 AACATCACGGCCAAAGCCCTTGCTTACGGAGACACAAATTGCTGCCGGGA 2700

                   2701          .         .         .         .         . 2750
hh05359            2701 TGGGAGGTCCAGCAAACACCCTGAGGAGAATCACGCCGACAGGAGGGTCC 2750
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)   2701 TGGGAGGTCCAGCAAACACCCTGAGGAGAATCACGCCGACAGGAGGGTCC 2750

                   2751          .         .         .         .         . 2800
hh05359            2751 CCATCGGGGTGGATCACGTCAGGCGCAGTGTGATGGTTGAGGCGGAAGGA 2800
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)   2751 CCATCGGGGTGGATCACGTCAGGCGCAGTGTGATGGTTGAGGCGGAAGGA 2800

                   2801          .         .         .         .         . 2850
hh05359            2801 GTCCCCCGGGCGTACACCTACA--GCATTCTTCTGTCCCAGTGAGAGAGT 2848
                        ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)   2801 GTCCCCCGGGCGTACACCTACAGCGCATTCTTCTGTCCCAGTGAGAGAGT 2850

                   2851          .         .         .         .         . 2900
hh05359            2849 CCACATCTCCACCCCCAACAAGTATGAGTTCCAGTATGTGCAGCGGCCAC 2898
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)   2851 CCACATCTCCACCCCCAACAAGTATGAGTTCCAGTATGTGCAGCGGCCAC 2900

                   2901          .         .         .         .         . 2950
hh05359            2899 TGCGCCTCACCCGCTTTGATGTGGCTGTGCGAGCTCACAATGATGCCCGT 2948
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)   2901 TGCGCCTCACCCGCTTTGATGTGGCTGTGCGAGCTCACAATGATGCCCGT 2950

                   2951          .         .         .         .         . 3000
hh05359            2949 GTGGCCTTGTCTTCTGGGCCCCAGGACACAGCAGGCATGATCGAGATCGT 2998
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)   2951 GTGGCCTTGTCTTCTGGGCCCCAGGACACAGCAGGCATGATCGAGATCGT 3000

                   3001          .         .         .         .         . 3050
hh05359            2999 CCTGGGGGGGCATCAGAACACCAGGTCATGGATCTCCACCAGCAAGATGG 3048
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)   3001 CCTGGGGGGGCATCAGAACACCAGGTCATGGATCTCCACCAGCAAGATGG 3050

                   3051          .         .         .         .         . 3100
hh05359            3049 GAGAGCCCGTGGCCAGTGCACACACGGCCAAGATCCTCTCCTGGGATGAA 3098
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)   3051 GAGAGCCCGTGGCCAGTGCACACACGGCCAAGATCCTCTCCTGGGATGAA 3100

                   3101          .         .         .         .         . 3150
hh05359            3099 TTCAGAACATTCTGGATCAGCTGGCGTGGTGGCCTTATCCAGGTTGGCCA 3148
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)   3101 TTCAGAACATTCTGGATCAGCTGGCGTGGTGGCCTTATCCAGGTTGGCCA 3150

                   3151          .         .         .         .         . 3200
hh05359            3149 TGGTCCAGAGCCATCCAATGAGTCTGTCATTGTGGCCTGGACCCTCCCGA 3198
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)   3151 TGGTCCAGAGCCATCCAATGAGTCTGTCATTGTGGCCTGGACCCTCCCGA 3200

                   3201          .         .         .         .         . 3250
hh05359            3199 GGCCACCAGAGGTCCAGTTCATTGGCTTTTCCACCGGCTGGGGCTCCATG 3248
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)   3201 GGCCACCAGAGGTCCAGTTCATTGGCTTTTCCACCGGCTGGGGCTCCATG 3250

                   3251          .         .         .         .         . 3300
hh05359            3249 GGTGAATTCCGAATCTGGAGGAAGATGGAGGTGGACGAGAGCTACAGCGA 3298
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)   3251 GGTGAATTCCGAATCTGGAGGAAGATGGAGGTGGACGAGAGCTACAGCGA 3300

                   3301          .         .         .         .         . 3350
hh05359            3299 GGCCTTCACCCTGGGGGTCCCACACGGCGCCATCCCTGGGTCTGAGCGAG 3348
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)   3301 GGCCTTCACCCTGGGGGTCCCACACGGCGCCATCCCTGGGTCTGAGCGAG 3350

                   3351          .         .         .         .         . 3400
hh05359            3349 CCACCGCCTCCATCATCGGGGACGTCATGGGGCCAACCCTGAACCACCTC 3398
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)   3351 CCACCGCCTCCATCATCGGGGACGTCATGGGGCCAACCCTGAACCACCTC 3400

                   3401          .         .         .         .         . 3450
hh05359            3399 AACAACCTCCTGCGGCTGCCGTTTGGCTGTGGAGAGCAGAACATGATCCA 3448
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)   3401 AACAACCTCCTGCGGCTGCCGTTTGGCTGTGGAGAGCAGAACATGATCCA 3450

                   3451          .         .         .         .         . 3500
hh05359            3449 CTTTGCACCCAACGTCTTTGTCTTGAAGTATCTTCAGAAAACCCAGCAGC 3498
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)   3451 CTTTGCACCCAACGTCTTTGTCTTGAAGTATCTTCAGAAAACCCAGCAGC 3500

                   3501          .         .         .         .         . 3550
hh05359            3499 TCAGCCCTGAGGTGGAGAGAGAGACCACCGACTACCTAGTACAAGGCTAC 3548
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)   3501 TCAGCCCTGAGGTGGAGAGAGAGACCACCGACTACCTAGTACAAGGCTAC 3550

                   3551          .         .         .         .         . 3600
hh05359            3549 CAGCGCCAGCTGACCTACAAGCGCCAGGATGGCTCCTACAGCGCGTTTGG 3598
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)   3551 CAGCGCCAGCTGACCTACAAGCGCCAGGATGGCTCCTACAGCGCGTTTGG 3600

                   3601          .         .         .         .         . 3650
hh05359            3599 GGAGCGGGACGCATCGGGGAGCATGTGGCTCACAGCCTTTGTCCTGAAGT 3648
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)   3601 GGAGCGGGACGCATCGGGGAGCATGTGGCTCACAGCCTTTGTCCTGAAGT 3650

                   3651          .         .         .         .         . 3700
hh05359            3649 CCTTCGCACAGGCTCGCAGCTTTATCTTCGTGGACCCCCGGGAGCTGGCT 3698
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)   3651 CCTTCGCACAGGCTCGCAGCTTTATCTTCGTGGACCCCCGGGAGCTGGCT 3700

                   3701          .         .         .         .         . 3750
hh05359            3699 GCCGCCAAGAGCTGGATCATCCAGCAGCAGCAGGCCGATGGCTCCTTCCT 3748
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)   3701 GCCGCCAAGAGCTGGATCATCCAGCAGCAGCAGGCCGATGGCTCCTTCCT 3750

                   3751          .         .         .         .         . 3800
hh05359            3749 GGCCGTGGGCAGGGTCCTGAACAAGGACATCCAGGGTGGGATCCACGGCA 3798
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)   3751 GGCCGTGGGCAGGGTCCTGAACAAGGACATCCAGGGTGGGATCCACGGCA 3800

                   3801          .         .         .         .         . 3850
hh05359            3799 TTGTCCCGCTGACAGCCTACGTGGTGGTTGCTCTCCTGGAAACAGGCACA 3848
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)   3801 TTGTCCCGCTGACAGCCTACGTGGTGGTTGCTCTCCTGGAAACAGGCACA 3850

                   3851          .         .         .         .         . 3900
hh05359            3849 GCCTCAGAGGAGGAGAGAGGCTCCACTGACAAAGCGAGGCACTTCCTGGA 3898
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)   3851 GCCTCAGAGGAGGAGAGAGGCTCCACTGACAAAGCGAGGCACTTCCTGGA 3900

                   3901          .         .         .         .         . 3950
hh05359            3899 GTCTGCTGCGCCCCTGGCCATGGACCCTTATAGCTGTGCCCTGACTACCT 3948
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)   3901 GTCTGCTGCGCCCCTGGCCATGGACCCTTATAGCTGTGCCCTGACTACCT 3950

                   3951          .         .         .         .         . 4000
hh05359            3949 ACGCGCTGACCCTGCTCCGCAGCCCGGCAGCCCCTGAGGCACTGCGCAAG 3998
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)   3951 ACGCGCTGACCCTGCTCCGCAGCCCGGCAGCCCCTGAGGCACTGCGCAAG 4000

                   4001          .         .         .         .         . 4050
hh05359            3999 CTCCGTAGCCTGGCCATCATGCGAGATGGGGTCACCCACTGGAGCCTGTC 4048
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)   4001 CTCCGTAGCCTGGCCATCATGCGAGATGGGGTCACCCACTGGAGCCTGTC 4050

                   4051          .         .         .         .         . 4100
hh05359            4049 AAATTCCTGGGACGTGGACAAGGGCACATTCTTGAGCTTCAGTGACAGGG 4098
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)   4051 AAATTCCTGGGACGTGGACAAGGGCACATTCTTGAGCTTCAGTGACAGGG 4100

                   4101          .         .         .         .         . 4150
hh05359            4099 TCTCTCAGTCAGTGGTCTCGGCCGAGGTGGAAATGACAGCCTACGCCCTT 4148
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)   4101 TCTCTCAGTCAGTGGTCTCGGCCGAGGTGGAAATGACAGCCTACGCCCTT 4150

                   4151          .         .         .         .         . 4200
hh05359            4149 CTGACCTACACTCTGCTGGGTGACGTGGCTGCCGCCCTGCCTGTGGTGAA 4198
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)   4151 CTGACCTACACTCTGCTGGGTGACGTGGCTGCCGCCCTGCCTGTGGTGAA 4200

                   4201          .         .         .         .         . 4250
hh05359            4199 GTGGCTGTCCCAGCAGCGAAATGCACTTGGGGGCTTCTCCTCCACTCAGG 4248
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)   4201 GTGGCTGTCCCAGCAGCGAAATGCACTTGGGGGCTTCTCCTCCACTCAGG 4250

                   4251          .         .         .         .         . 4300
hh05359            4249 ACACCTGCGTGGCTCTGCAGGCCTTGGCTGAATATGCCATCTTGTCCTAT 4298
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)   4251 ACACCTGCGTGGCTCTGCAGGCCTTGGCTGAATATGCCATCTTGTCCTAT 4300

                   4301          .         .         .         .         . 4350
hh05359            4299 GCTGGAGGCATCAACCTCACTGTCTCCCTGGCCTCCACCAACCTGGACTA 4348
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)   4301 GCTGGAGGCATCAACCTCACTGTCTCCCTGGCCTCCACCAACCTGGACTA 4350

                   4351          .         .         .         .         . 4400
hh05359            4349 CCAGGAAACCTTCGAGCTGCACAGGACCAACCAGAAGGTTCTGCAGACAG 4398
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)   4351 CCAGGAAACCTTCGAGCTGCACAGGACCAACCAGAAGGTTCTGCAGACAG 4400

                   4401          .         .         .         .         . 4450
hh05359            4399 CAGCGATCCCCAGCCTCCCCACGGGGCTGTTTGTGAGTGCCAAGGGGGAC 4448
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)   4401 CAGCGATCCCCAGCCTCCCCACGGGGCTGTTTGTGAGTGCCAAGGGGGAC 4450

                   4451          .         .         .         .         . 4500
hh05359            4449 GGCTGCTGCCTGATGCAGATTGATGTCACCTACAATGTGCCTGACCCGGT 4498
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)   4451 GGCTGCTGCCTGATGCAGATTGATGTCACCTACAATGTGCCTGACCCGGT 4500

                   4501          .         .         .         .         . 4550
hh05359            4499 GGCCAAGCCAGCTTTCCAGCTGCTCGTAAGCCTCCAGGAGCCTGAGGCCC 4548
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)   4501 GGCCAAGCCAGCTTTCCAGCTGCTCGTAAGCCTCCAGGAGCCTGAGGCCC 4550

                   4551          .         .         .         .         . 4600
hh05359            4549 AGGGACGCCCGCCCCCCATGCCTGCCTCCGCAGCTGAGGGTTCCCGAGGA 4598
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)   4551 AGGGACGCCCGCCCCCCATGCCTGCCTCCGCAGCTGAGGGTTCCCGAGGA 4600

                   4601          .         .         .         .         . 4650
hh05359            4599 GACTGGCCCCCAGCTGACGATGATGACCCAGCGGCCGATCAGCATCACCA 4648
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)   4601 GACTGGCCCCCAGCTGACGATGATGACCCAGCGGCCGATCAGCATCACCA 4650

                   4651          .         .         .         .         . 4700
hh05359            4649 GGAATACAAGGTGATGCTGGAGGTGTGCACCAGGTGGCTGCATGCAGGGT 4698
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)   4651 GGAATACAAGGTGATGCTGGAGGTGTGCACCAGGTGGCTGCATGCAGGGT 4700

                   4701          .         .         .         .         . 4750
hh05359            4699 CTTCCAATATGGCTGTCCTGGAGGTGCCCCTGCTGTCAGGCTTCCGGGCA 4748
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)   4701 CTTCCAATATGGCTGTCCTGGAGGTGCCCCTGCTGTCAGGCTTCCGGGCA 4750

                   4751          .         .         .         .         . 4800
hh05359            4749 GACATCGAGAGCCTGGAGCAGCTGCTCCTTGACAAGCACATGGGGATGAA 4798
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)   4751 GACATCGAGAGCCTGGAGCAGCTGCTCCTTGACAAGCACATGGGGATGAA 4800

                   4801          .         .         .         .         . 4850
hh05359            4799 GAGGTATGAAGTGGCTGGACGCCGAGTGCTCTTCTACTTTGATGAGATCC 4848
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)   4801 GAGGTATGAAGTGGCTGGACGCCGAGTGCTCTTCTACTTTGATGAGATCC 4850

                   4851          .         .         .         .         . 4900
hh05359            4849 CCAGCCGGTGCCTGACGTGCGTGCGGTTCCGTGCTCTCCGGGAGTGCGTG 4898
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)   4851 CCAGCCGGTGCCTGACGTGCGTGCGGTTCCGTGCTCTCCGGGAGTGCGTG 4900

                   4901          .         .         .         .         . 4950
hh05359            4899 GTGGGCAGGACGTCGGCGCTGCCAGTCTCCGTGTACGACTACTACGAACC 4948
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)   4901 GTGGGCAGGACGTCGGCGCTGCCAGTCTCCGTGTACGACTACTACGAACC 4950

                   4951          .         .         .         .         . 5000
hh05359            4949 CGCCTTCGAGGCCACTCGCTTCTACAACGTCAGCACGCACAGCCCACTCG 4998
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)   4951 CGCCTTCGAGGCCACTCGCTTCTACAACGTCAGCACGCACAGCCCACTCG 5000

                   5001          .         .         .         .         . 5050
hh05359            4999 CCCGGGAACTGTGCGCCGGACCCGCGTGCAACGAAGTGGAGCGCGCCCCT 5048
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)   5001 CCCGGGAACTGTGCGCCGGACCCGCGTGCAACGAAGTGGAGCGCGCCCCT 5050

                   5051          .         .         .         .         . 5100
hh05359            5049 GCCCGGGGCCCGGGCTGGTTCCCCGGCGAGTCGGGCCCTGCCGTGGCCCC 5098
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)   5051 GCCCGGGGCCCGGGCTGGTTCCCCGGCGAGTCGGGCCCTGCCGTGGCCCC 5100

                   5101          .         .         .         .         . 5150
hh05359            5099 TGAGGAGGGGGCGGCGATCGCGCGATGCGGCTGCGACCACGACTGCGGCG 5148
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)   5101 TGAGGAGGGGGCGGCGATCGCGCGATGCGGCTGCGACCACGACTGCGGCG 5150

                   5151          .         .         .         .         . 5200
hh05359            5149 CCCAGGGGAACCCGGTGTGCGGCTCCGACGGGGTGGTCTACGCCAGCGCC 5198
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)   5151 CCCAGGGGAACCCGGTGTGCGGCTCCGACGGGGTGGTCTACGCCAGCGCC 5200

                   5201          .         .         .         .         . 5250
hh05359            5199 TGCCGCCTGCGGGAGGCCGCCTGCCGCCAGGCCGCGCCCCTGGAGCCCGC 5248
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)   5201 TGCCGCCTGCGGGAGGCCGCCTGCCGCCAGGCCGCGCCCCTGGAGCCCGC 5250

                   5251          .         .         .         .         . 5300
hh05359            5249 GCCTCCCAGCTGCTGCGCCCTCGAGCAGCGGCTGCCGGCCTCGTCGTCCT 5298
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)   5251 GCCTCCCAGCTGCTGCGCCCTCGAGCAGCGGCTGCCGGCCTCGTCGTCCT 5300

                   5301          .         .         .         .         . 5350
hh05359            5299 CCACCTACGGGGATGACCTGGCTTCTGTGGCCCCGGGGCCTTTACAGCAG 5348
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)   5301 CCACCTACGGGGATGACCTGGCTTCTGTGGCCCCGGGGCCTTTACAGCAG 5350

                   5351          .         .         .         .         . 5400
hh05359            5349 GACGTGAAGCTGAATGGAGCCGGCCTTGAGGTGGAGGACTCAGACCCTGA 5398
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)   5351 GACGTGAAGCTGAATGGAGCCGGCCTTGAGGTGGAGGACTCAGACCCTGA 5400

                   5401          .         .         .         .         . 5450
hh05359            5399 GCCTGAAGGGGAGGCGGAGGACAGGGTCACAGCCGGGCCTCGGCCTCCTG 5448
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)   5401 GCCTGAAGGGGAGGCGGAGGACAGGGTCACAGCCGGGCCTCGGCCTCCTG 5450

                   5451          .         .         .         .         . 5500
hh05359            5449 TGAGCAGCGGGAACCTGGAAAGCAGCACCCAGAGCGCCAGCCCGTTCCAC 5498
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)   5451 TGAGCAGCGGGAACCTGGAAAGCAGCACCCAGAGCGCCAGCCCGTTCCAC 5500

                   5501          .         .         .         .         . 5550
hh05359            5499 AGATGGGGCCAGACTCCGGCCCCTCAGAGACATAGTGGCCGGGTGGTGGG 5548
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)   5501 AGATGGGGCCAGACTCCGGCCCCTCAGAGACATAGTGGCCGGGTGGTGGG 5550

                   5551          .         .         .         .         . 5600
hh05359            5549 GGCCCACAGGCCAGGGCTTCTGAGCCCTGTCTTCGTCTACAGCCCAGCCT 5598
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)   5551 GGCCCACAGGCCAGGGCTTCTGAGCCCTGTCTTCGTCTACAGCCCAGCCT 5600

                   5601          .         .         .         .         . 5650
hh05359            5599 TTCAGAGTGGTGGGGAGGAGGGTTTATGGATGTCAAACACCTGCACCTTG 5648
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)   5601 TTCAGAGTGGTGGGGAGGAGGGTTTATGGATGTCAAACACCTGCACCTTG 5650

                   5651          .         .         .         .         . 5700
hh05359            5649 AGATAATCCTACAACCACATGCAGTTGTGGGACCGCAGTTTGGTCCTGGG 5698
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)   5651 AGATAATCCTACAACCACATGCAGTTGTGGGACCGCAGTTTGGTCCTGGG 5700

                   5701          .         .         .         .         . 5750
hh05359            5699 GACCATTCATACCCACACACCCAGCTTGTGCCTGTGGTTAACATCTCAGA 5748
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)   5701 GACCATTCATACCCACACACCCAGCTTGTGCCTGTGGTTAACATCTCAGA 5750

                   5751          .         .         .         .         . 5800
hh05359            5749 AAACTCTGGTAAATGATCACTCCAGGATATTGACACGAATACACGTTACT 5798
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh05359(revised)   5751 AAACTCTGGTAAATGATCACTCCAGGATATTGACACGAATACACGTTACT 5800

                   5801          .        5817
hh05359            5799 GATCTTACTCACATGTT 5815
                        |||||||||||||||||
hh05359(revised)   5801 GATCTTACTCACATGTT 5817