Comparison between the cloned and the revised DNA sequences

Cloned DNA sequence, length = 4910 bp
Revised DNA sequence, length = 4481 bp

<< Positions of primers used in RT-PCR experiment(s) >>

 1 : f NN03814  2489 -  2509     CTT CAA GAT GGC AGT AAA GAA
     r NN03815  3396 -  3376     GCA TCA GTG GAA TAA AGG TAG
 2 : f NN05883  3600 -  3620     GAG CAG GTG GTG GAT TAC TTG
     r NN05884  4207 -  4187     GCA TTC TTG GGA CTT GTT TGG
<< Positions of inserion/deletion/mutation(s) in the aligned sequence >>
 1 :  2706 -  3008      303-bp deletion  (in the revised sequence)
 2 :  3786 -  3911      126-bp deletion  (in the revised sequence)
Predicted coding region: colored in green ( 189 - 3806 in the revised sequence).


*- Clone Name -*      1          .         .         .         .         . 50
hj00237               1 GGAATTTCCCGCGGAGCTGACAGCGCTTGCGCTCCCCCTACTCGTTCTAA 50
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hj00237(revised)      1 GGAATTTCCCGCGGAGCTGACAGCGCTTGCGCTCCCCCTACTCGTTCTAA 50

                     51          .         .         .         .         . 100
hj00237              51 TTCCACGCGCTCCAAAATATCCGCCATGGAGAAATCTTGGCCAGGATGTC 100
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hj00237(revised)     51 TTCCACGCGCTCCAAAATATCCGCCATGGAGAAATCTTGGCCAGGATGTC 100

                    101          .         .         .         .         . 150
hj00237             101 CATTCTAGGCCCATCGGTGCTGTCTTGCTGAAGGTTGGGTCAGGCATCTA 150
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hj00237(revised)    101 CATTCTAGGCCCATCGGTGCTGTCTTGCTGAAGGTTGGGTCAGGCATCTA 150

                    151          .         .         .         .         . 200
hj00237             151 AAGGGACTGTGGTAAGGGAGGGTGTGACACAGGTGTAAGCTGCCATCGTC 200
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hj00237(revised)    151 AAGGGACTGTGGTAAGGGAGGGTGTGACACAGGTGTAAGCTGCCATCGTC 200

                    201          .         .         .         .         . 250
hj00237             201 ATCATGAACTTTGAGGGTCTGGACCCTGGACTGGCAGAATATGCCCCAGC 250
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hj00237(revised)    201 ATCATGAACTTTGAGGGTCTGGACCCTGGACTGGCAGAATATGCCCCAGC 250

                    251          .         .         .         .         . 300
hj00237             251 CATGCATTCTGCCCTGGACCCTGTCTTGGATGCCCACCTGAACCCAAGTC 300
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hj00237(revised)    251 CATGCATTCTGCCCTGGACCCTGTCTTGGATGCCCACCTGAACCCAAGTC 300

                    301          .         .         .         .         . 350
hj00237             301 TGCTACAGAATGTGGAGCTGGACCCAGAGGGAGTGGCCTTGGAGGCTCTT 350
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hj00237(revised)    301 TGCTACAGAATGTGGAGCTGGACCCAGAGGGAGTGGCCTTGGAGGCTCTT 350

                    351          .         .         .         .         . 400
hj00237             351 CCCGTCCAGGAATCAGTGCACATAATGGAAGGTGTCTACTCTGAATTGCA 400
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hj00237(revised)    351 CCCGTCCAGGAATCAGTGCACATAATGGAAGGTGTCTACTCTGAATTGCA 400

                    401          .         .         .         .         . 450
hj00237             401 CAGCGTGGTGGCTGAAGTGGGTGTACCTGTTTCCGTCTCCCACTTTGACT 450
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hj00237(revised)    401 CAGCGTGGTGGCTGAAGTGGGTGTACCTGTTTCCGTCTCCCACTTTGACT 450

                    451          .         .         .         .         . 500
hj00237             451 TGCACGAGGAGATGCTGTGGGTGGGGAGCCACGGGGGCCATGCCACTTCA 500
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hj00237(revised)    451 TGCACGAGGAGATGCTGTGGGTGGGGAGCCACGGGGGCCATGCCACTTCA 500

                    501          .         .         .         .         . 550
hj00237             501 TTTTTTGGCCCAGCCTTGGAGCGCTACTCATCCTTTCAAGTCAATGGCAG 550
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hj00237(revised)    501 TTTTTTGGCCCAGCCTTGGAGCGCTACTCATCCTTTCAAGTCAATGGCAG 550

                    551          .         .         .         .         . 600
hj00237             551 TGATGATATTCGGCAGATCCAGAGCCTGGAGAATGGTATCCTTTTTCTCA 600
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hj00237(revised)    551 TGATGATATTCGGCAGATCCAGAGCCTGGAGAATGGTATCCTTTTTCTCA 600

                    601          .         .         .         .         . 650
hj00237             601 CCAAGAACAACCTCAAGTATATGGCCCGTGGGGGCCTCATTATATTTGAT 650
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hj00237(revised)    601 CCAAGAACAACCTCAAGTATATGGCCCGTGGGGGCCTCATTATATTTGAT 650

                    651          .         .         .         .         . 700
hj00237             651 TACCTGCTGGATGAGAATGAGGATATGCACAGTCTCCTACTGACTGACAG 700
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hj00237(revised)    651 TACCTGCTGGATGAGAATGAGGATATGCACAGTCTCCTACTGACTGACAG 700

                    701          .         .         .         .         . 750
hj00237             701 CAGCACTCTACTCGTTGGTGGGCTGCAGAATCACATACTAGAGATTGATC 750
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hj00237(revised)    701 CAGCACTCTACTCGTTGGTGGGCTGCAGAATCACATACTAGAGATTGATC 750

                    751          .         .         .         .         . 800
hj00237             751 TTAACACTGTCCAGGAGACTCAGAAGTATGCAGTAGAGACGCCTGGAGTC 800
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hj00237(revised)    751 TTAACACTGTCCAGGAGACTCAGAAGTATGCAGTAGAGACGCCTGGAGTC 800

                    801          .         .         .         .         . 850
hj00237             801 ACCATCATGAGACAGACAAATCGCTTCTTCTTCTGCGGCCACACGTCTGG 850
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hj00237(revised)    801 ACCATCATGAGACAGACAAATCGCTTCTTCTTCTGCGGCCACACGTCTGG 850

                    851          .         .         .         .         . 900
hj00237             851 CAAGGTTTCCCTGAGAGACCTCCGTACTTTTAAGGTGGAACATGAGTTTG 900
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hj00237(revised)    851 CAAGGTTTCCCTGAGAGACCTCCGTACTTTTAAGGTGGAACATGAGTTTG 900

                    901          .         .         .         .         . 950
hj00237             901 ATGCCTTCTCAGGAAGTCTGTCAGACTTTGATGTGCATGGCAACCTGCTA 950
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hj00237(revised)    901 ATGCCTTCTCAGGAAGTCTGTCAGACTTTGATGTGCATGGCAACCTGCTA 950

                    951          .         .         .         .         . 1000
hj00237             951 GCTGCCTGTGGCTTCTCCAGCCGCCTCACTGGCCTGGCCTGCGACCGTTT 1000
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hj00237(revised)    951 GCTGCCTGTGGCTTCTCCAGCCGCCTCACTGGCCTGGCCTGCGACCGTTT 1000

                   1001          .         .         .         .         . 1050
hj00237            1001 CCTCAAGGTGTATGATTTGCGCATGATGCGTGCCATCACACCACTTCAAG 1050
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hj00237(revised)   1001 CCTCAAGGTGTATGATTTGCGCATGATGCGTGCCATCACACCACTTCAAG 1050

                   1051          .         .         .         .         . 1100
hj00237            1051 TACATGTGGATCCTGCCTTCTTGCGCTTCATTCCTACATATACTTCTCGT 1100
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hj00237(revised)   1051 TACATGTGGATCCTGCCTTCTTGCGCTTCATTCCTACATATACTTCTCGT 1100

                   1101          .         .         .         .         . 1150
hj00237            1101 CTTGCTATCATCTCTCAGTCAGGGCAGTGCCAATTCTGTGAACCCACAGG 1150
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hj00237(revised)   1101 CTTGCTATCATCTCTCAGTCAGGGCAGTGCCAATTCTGTGAACCCACAGG 1150

                   1151          .         .         .         .         . 1200
hj00237            1151 CCTGGCCAACCCAGCCGATATCTTTCATGTGAATCCTGTGGGGCCTCTGC 1200
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hj00237(revised)   1151 CCTGGCCAACCCAGCCGATATCTTTCATGTGAATCCTGTGGGGCCTCTGC 1200

                   1201          .         .         .         .         . 1250
hj00237            1201 TAATGACATTTGATGTGTCAGCCAGCAAGCAGGCTCTGGCCTTTGGGGAT 1250
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hj00237(revised)   1201 TAATGACATTTGATGTGTCAGCCAGCAAGCAGGCTCTGGCCTTTGGGGAT 1250

                   1251          .         .         .         .         . 1300
hj00237            1251 TCTGAGGGCTGTGTGCACCTCTGGACTGATTCCCCGGAGCCTTCCTTCAA 1300
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hj00237(revised)   1251 TCTGAGGGCTGTGTGCACCTCTGGACTGATTCCCCGGAGCCTTCCTTCAA 1300

                   1301          .         .         .         .         . 1350
hj00237            1301 CCCCTACTCCCGTGAGACTGAGTTTGCTTTGCCGTGTCTCGTGGACTCAC 1350
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hj00237(revised)   1301 CCCCTACTCCCGTGAGACTGAGTTTGCTTTGCCGTGTCTCGTGGACTCAC 1350

                   1351          .         .         .         .         . 1400
hj00237            1351 TGCCTCCTCTGGACTGGAGCCAGGACCTGCTGCCTCTTTCCCTCATCCCT 1400
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hj00237(revised)   1351 TGCCTCCTCTGGACTGGAGCCAGGACCTGCTGCCTCTTTCCCTCATCCCT 1400

                   1401          .         .         .         .         . 1450
hj00237            1401 GTCCCACTCACCACTGACACACTTCTCTCTGATTGGCCTGCTGCCAACTC 1450
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hj00237(revised)   1401 GTCCCACTCACCACTGACACACTTCTCTCTGATTGGCCTGCTGCCAACTC 1450

                   1451          .         .         .         .         . 1500
hj00237            1451 TGCTCCAGCTCCCAGGCGAGCACCACCCGTGGATGCAGAGATTCTGCGCA 1500
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hj00237(revised)   1451 TGCTCCAGCTCCCAGGCGAGCACCACCCGTGGATGCAGAGATTCTGCGCA 1500

                   1501          .         .         .         .         . 1550
hj00237            1501 CCATGAAGAAGGTGGGCTTCATTGGCTATGCGCCCAATCCCCGCACCAGG 1550
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hj00237(revised)   1501 CCATGAAGAAGGTGGGCTTCATTGGCTATGCGCCCAATCCCCGCACCAGG 1550

                   1551          .         .         .         .         . 1600
hj00237            1551 CTGCGCAATCAGATACCCTACAGACTCAAGGAGTCAGACAGTGAATTTGA 1600
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hj00237(revised)   1551 CTGCGCAATCAGATACCCTACAGACTCAAGGAGTCAGACAGTGAATTTGA 1600

                   1601          .         .         .         .         . 1650
hj00237            1601 CAGCTTCAGCCAGGTCACTGAGTCACCAGTAGGACGAGAAGAGGAACCAC 1650
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hj00237(revised)   1601 CAGCTTCAGCCAGGTCACTGAGTCACCAGTAGGACGAGAAGAGGAACCAC 1650

                   1651          .         .         .         .         . 1700
hj00237            1651 ATCTCCACATGGTTTCTAAGAAATACCGCAAGGTGACCATCAAATATTCC 1700
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hj00237(revised)   1651 ATCTCCACATGGTTTCTAAGAAATACCGCAAGGTGACCATCAAATATTCC 1700

                   1701          .         .         .         .         . 1750
hj00237            1701 AAGCTAGGGCTGGAGGACTTTGACTTCAAACACTACAATAAGACCTTGTT 1750
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hj00237(revised)   1701 AAGCTAGGGCTGGAGGACTTTGACTTCAAACACTACAATAAGACCTTGTT 1750

                   1751          .         .         .         .         . 1800
hj00237            1751 TGCTGGATTAGAGCCCCACATTCCCAACGCCTACTGTAACTGCATGATCC 1800
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hj00237(revised)   1751 TGCTGGATTAGAGCCCCACATTCCCAACGCCTACTGTAACTGCATGATCC 1800

                   1801          .         .         .         .         . 1850
hj00237            1801 AGGTGCTCTATTTCCTGGAGCCTGTACGCTGTCTAATTCAAAACCACCTT 1850
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hj00237(revised)   1801 AGGTGCTCTATTTCCTGGAGCCTGTACGCTGTCTAATTCAAAACCACCTT 1850

                   1851          .         .         .         .         . 1900
hj00237            1851 TGCCAGAAGGAGTTCTGTCTGGCATGTGAGCTGGGCTTCCTGTTTCACAT 1900
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hj00237(revised)   1851 TGCCAGAAGGAGTTCTGTCTGGCATGTGAGCTGGGCTTCCTGTTTCACAT 1900

                   1901          .         .         .         .         . 1950
hj00237            1901 GTTGGACCTCTCTCGTGGTGACCCTTGCCAGGGCAATAATTTTCTTCGGG 1950
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hj00237(revised)   1901 GTTGGACCTCTCTCGTGGTGACCCTTGCCAGGGCAATAATTTTCTTCGGG 1950

                   1951          .         .         .         .         . 2000
hj00237            1951 CATTCCGTACTATTCCTGAGGCCTCAGCCCTCGGTCTAATCCTGGCTGAC 2000
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hj00237(revised)   1951 CATTCCGTACTATTCCTGAGGCCTCAGCCCTCGGTCTAATCCTGGCTGAC 2000

                   2001          .         .         .         .         . 2050
hj00237            2001 TCAGATGAGGCCTCAGGCAAGGGCAATCTGGCCAGGCTCATTCAGAGGTG 2050
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hj00237(revised)   2001 TCAGATGAGGCCTCAGGCAAGGGCAATCTGGCCAGGCTCATTCAGAGGTG 2050

                   2051          .         .         .         .         . 2100
hj00237            2051 GAATCGCTTCATTCTCACTCAACTGCATCAAGATATGCAGGAGCTGGAAA 2100
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hj00237(revised)   2051 GAATCGCTTCATTCTCACTCAACTGCATCAAGATATGCAGGAGCTGGAAA 2100

                   2101          .         .         .         .         . 2150
hj00237            2101 TACCACAGGCTTATCGAGGTGCTGGAGGCAGCTTTTGCTCATCGGGGGAC 2150
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hj00237(revised)   2101 TACCACAGGCTTATCGAGGTGCTGGAGGCAGCTTTTGCTCATCGGGGGAC 2150

                   2151          .         .         .         .         . 2200
hj00237            2151 TCTGTTATTGGGCAGCTCTTCAGCTGTGAGATGGAGAACTGCAGCCTCTG 2200
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hj00237(revised)   2151 TCTGTTATTGGGCAGCTCTTCAGCTGTGAGATGGAGAACTGCAGCCTCTG 2200

                   2201          .         .         .         .         . 2250
hj00237            2201 CCGCTGTGGCAGTGAGACCGTGCGAGCCTCATCCACTCTGCTTTTCACAC 2250
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hj00237(revised)   2201 CCGCTGTGGCAGTGAGACCGTGCGAGCCTCATCCACTCTGCTTTTCACAC 2250

                   2251          .         .         .         .         . 2300
hj00237            2251 TCTCCTACCCTGATGGTAGCAAAAGTGATAAAACTGGGAAGAACTATGAC 2300
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hj00237(revised)   2251 TCTCCTACCCTGATGGTAGCAAAAGTGATAAAACTGGGAAGAACTATGAC 2300

                   2301          .         .         .         .         . 2350
hj00237            2301 TTTGCTCAGGTGCTGAAGCGAAGCATCTGCCTGGACCAGAATACACAGGC 2350
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hj00237(revised)   2301 TTTGCTCAGGTGCTGAAGCGAAGCATCTGCCTGGACCAGAATACACAGGC 2350

                   2351          .         .         .         .         . 2400
hj00237            2351 CTGGTGTGACACCTGTGAAAAGTACCAGCCCACGATTCAGACCCGCAACA 2400
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hj00237(revised)   2351 CTGGTGTGACACCTGTGAAAAGTACCAGCCCACGATTCAGACCCGCAACA 2400

                   2401          .         .         .         .         . 2450
hj00237            2401 TCCGCCATCTGCCAGATATTCTTGTCATCAATTGTGAGGTGAACAGCTCA 2450
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hj00237(revised)   2401 TCCGCCATCTGCCAGATATTCTTGTCATCAATTGTGAGGTGAACAGCTCA 2450

                   2451          .         .         .         .         . 2500
hj00237            2451 AAAGAGGCTGATTTCTGGAGAATGCAGGCTGAGGTTGCCTTCAAGATGGC 2500
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hj00237(revised)   2451 AAAGAGGCTGATTTCTGGAGAATGCAGGCTGAGGTTGCCTTCAAGATGGC 2500

                   2501          .         .         .         .         . 2550
hj00237            2501 AGTAAAGAAACACGGTGGGGAAATCTCCAAGAACAAGGAATTTGCTTTGG 2550
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hj00237(revised)   2501 AGTAAAGAAACACGGTGGGGAAATCTCCAAGAACAAGGAATTTGCTTTGG 2550

                   2551          .         .         .         .         . 2600
hj00237            2551 CTGATTGGAAGGAACTAGGGAGTCCAGAGGGTGTGCTGGTGTGTCCCTCC 2600
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hj00237(revised)   2551 CTGATTGGAAGGAACTAGGGAGTCCAGAGGGTGTGCTGGTGTGTCCCTCC 2600

                   2601          .         .         .         .         . 2650
hj00237            2601 ATTGAGGAGTTGAAGAACGTCTGGCTTCCTTTCTCCATTCGCATGAAGAT 2650
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hj00237(revised)   2601 ATTGAGGAGTTGAAGAACGTCTGGCTTCCTTTCTCCATTCGCATGAAGAT 2650

                   2651          .         .         .         .         . 2700
hj00237            2651 GACCAAAAACAAAGGGCTGGATGTTTGCAATTGGACTGATGGGGATGAGA 2700
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hj00237(revised)   2651 GACCAAAAACAAAGGGCTGGATGTTTGCAATTGGACTGATGGGGATGAGA 2700

                   2701          .         .         .         .         . 2750
hj00237            2701 TGCAGGTTGTTGAAAAACCGGGAAGAGGAAAGGGAATAAGGGAGAGAAGG 2750
                        |||||                                             
hj00237(revised)   2701 TGCAG--------------------------------------------- 2705

                   2751          .         .         .         .         . 2800
hj00237            2751 TGGGGCAGAAGGTAAAGGAGGGCAGGGGAAGGTGAAACTTAGCAGAGGGA 2800
                                                                          
hj00237(revised)   2706 -------------------------------------------------- 2706

                   2801          .         .         .         .         . 2850
hj00237            2801 AAAGGAAGAGAATAAGGCCTAGTATTTACCTGTTAGGGGATTTTCCATAG 2850
                                                                          
hj00237(revised)   2706 -------------------------------------------------- 2706

                   2851          .         .         .         .         . 2900
hj00237            2851 TCACTCAGTTCAGTGTTGGGGTCCTAGATGGGCTAGGATGGAGATAACCC 2900
                                                                          
hj00237(revised)   2706 -------------------------------------------------- 2706

                   2901          .         .         .         .         . 2950
hj00237            2901 ACCCTGGTCCCCCATCCCCCATACCCCCAACTCCCTGTCCTCTGTCCCCA 2950
                                                                          
hj00237(revised)   2706 -------------------------------------------------- 2706

                   2951          .         .         .         .         . 3000
hj00237            2951 TTCCCCTCCCTTCCCCATCCTTAAACTTAGCTTAGCAGCCTGGGTACCCC 3000
                                                                          
hj00237(revised)   2706 -------------------------------------------------- 2706

                   3001          .         .         .         .         . 3050
hj00237            3001 CCTCACAGTGGGGCCCAGCCAGGGCAGAGGAGGAGCATGGTGTCTATGTG 3050
                                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hj00237(revised)   2706 --------TGGGGCCCAGCCAGGGCAGAGGAGGAGCATGGTGTCTATGTG 2747

                   3051          .         .         .         .         . 3100
hj00237            3051 TATGACCTGATGGCTACTGTGGTACACATCCTGGACTCACGCACAGGGGG 3100
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hj00237(revised)   2748 TATGACCTGATGGCTACTGTGGTACACATCCTGGACTCACGCACAGGGGG 2797

                   3101          .         .         .         .         . 3150
hj00237            3101 CAGCCTGGTGGCTCACATCAAAGTTGGAGAGACCTACCACCAGCGCAAGG 3150
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hj00237(revised)   2798 CAGCCTGGTGGCTCACATCAAAGTTGGAGAGACCTACCACCAGCGCAAGG 2847

                   3151          .         .         .         .         . 3200
hj00237            3151 AGGGCGTTACTCACCAGCAGTGGTATCTGTTCAATGACTTTCTTATTGAA 3200
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hj00237(revised)   2848 AGGGCGTTACTCACCAGCAGTGGTATCTGTTCAATGACTTTCTTATTGAA 2897

                   3201          .         .         .         .         . 3250
hj00237            3201 CCTATTGATAAGCATGAAGCTGTGCAGTTTGACATGAATTGGAAAGTACC 3250
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hj00237(revised)   2898 CCTATTGATAAGCATGAAGCTGTGCAGTTTGACATGAATTGGAAAGTACC 2947

                   3251          .         .         .         .         . 3300
hj00237            3251 TGCAATCCTTTATTATGTCAAACGGAATCTCAATTCCAGATACAACCTGA 3300
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hj00237(revised)   2948 TGCAATCCTTTATTATGTCAAACGGAATCTCAATTCCAGATACAACCTGA 2997

                   3301          .         .         .         .         . 3350
hj00237            3301 ACATCAAGAACCCTATTGAGGCAAGTGTCTTGCTGGCTGAAGCCTCGCTG 3350
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hj00237(revised)   2998 ACATCAAGAACCCTATTGAGGCAAGTGTCTTGCTGGCTGAAGCCTCGCTG 3047

                   3351          .         .         .         .         . 3400
hj00237            3351 GCACGGAAGCAGCGGAAAACACATACTACCTTTATTCCACTGATGCTGAA 3400
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hj00237(revised)   3048 GCACGGAAGCAGCGGAAAACACATACTACCTTTATTCCACTGATGCTGAA 3097

                   3401          .         .         .         .         . 3450
hj00237            3401 TGAGATGCCACAGATTGGGGACCTGGTGGGTCTGGATGCTGAGTTTGTCA 3450
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hj00237(revised)   3098 TGAGATGCCACAGATTGGGGACCTGGTGGGTCTGGATGCTGAGTTTGTCA 3147

                   3451          .         .         .         .         . 3500
hj00237            3451 CCCTTAATGAGGAGGAAGCAGAGTTACGCAGTGATGGTACCAAGTCTACC 3500
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hj00237(revised)   3148 CCCTTAATGAGGAGGAAGCAGAGTTACGCAGTGATGGTACCAAGTCTACC 3197

                   3501          .         .         .         .         . 3550
hj00237            3501 ATTAAACCAAGCCAGATGTCAGTAGCCAGGATTACCTGTGTTCGGGGCCA 3550
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hj00237(revised)   3198 ATTAAACCAAGCCAGATGTCAGTAGCCAGGATTACCTGTGTTCGGGGCCA 3247

                   3551          .         .         .         .         . 3600
hj00237            3551 GGGACCCAATGAGGGTATCCCCTTCATTGATGACTACATCTCTACCCAGG 3600
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hj00237(revised)   3248 GGGACCCAATGAGGGTATCCCCTTCATTGATGACTACATCTCTACCCAGG 3297

                   3601          .         .         .         .         . 3650
hj00237            3601 AGCAGGTGGTGGATTACTTGACTCAATACTCGGGTATAAAGCCTGGTGAC 3650
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hj00237(revised)   3298 AGCAGGTGGTGGATTACTTGACTCAATACTCGGGTATAAAGCCTGGTGAC 3347

                   3651          .         .         .         .         . 3700
hj00237            3651 CTCGATGCCAAAATTTCCTCCAAGCACCTAACAACTCTCAAGTCTACCTA 3700
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hj00237(revised)   3348 CTCGATGCCAAAATTTCCTCCAAGCACCTAACAACTCTCAAGTCTACCTA 3397

                   3701          .         .         .         .         . 3750
hj00237            3701 CTTAAAGCTTCGTTTTCTCATTGACATTGGAGTCAAGTTTGTGGGTCATG 3750
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hj00237(revised)   3398 CTTAAAGCTTCGTTTTCTCATTGACATTGGAGTCAAGTTTGTGGGTCATG 3447

                   3751          .         .         .         .         . 3800
hj00237            3751 GCCTGCAGAAGGACTTCCGGGTCATCAACCTGATGGTTTGGCAGGGCTCT 3800
                        |||||||||||||||||||||||||||||||||||               
hj00237(revised)   3448 GCCTGCAGAAGGACTTCCGGGTCATCAACCTGATG--------------- 3482

                   3801          .         .         .         .         . 3850
hj00237            3801 TTTAAGAGTCTTCTTGTGAGAGTGGGCCCCTCAGGGTATACATTGTGCCT 3850
                                                                          
hj00237(revised)   3483 -------------------------------------------------- 3483

                   3851          .         .         .         .         . 3900
hj00237            3851 TTAGAGAATGGGGAATTATAGGTCCCCTACCTTAAGTCTCCCCCTCTTTT 3900
                                                                          
hj00237(revised)   3483 -------------------------------------------------- 3483

                   3901          .         .         .         .         . 3950
hj00237            3901 ATCCTTGCCAGGTGCCCAAGGACCAAGTCCTTGACACTGTCTACCTGTTC 3950
                                   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hj00237(revised)   3483 -----------GTGCCCAAGGACCAAGTCCTTGACACTGTCTACCTGTTC 3521

                   3951          .         .         .         .         . 4000
hj00237            3951 CATATGCCCCGAAAACGAATGATTTCCCTGCGATTCCTTGCTTGGTACTT 4000
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hj00237(revised)   3522 CATATGCCCCGAAAACGAATGATTTCCCTGCGATTCCTTGCTTGGTACTT 3571

                   4001          .         .         .         .         . 4050
hj00237            4001 TCTGGACCTGAAGATTCAAGGGGAAACCCATGACAGTATTGAGGATGCCC 4050
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hj00237(revised)   3572 TCTGGACCTGAAGATTCAAGGGGAAACCCATGACAGTATTGAGGATGCCC 3621

                   4051          .         .         .         .         . 4100
hj00237            4051 GCACAGCCCTTCAGCTGTACCGAAAGTATCTGGAGCTAAGCAAAAATGGC 4100
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hj00237(revised)   3622 GCACAGCCCTTCAGCTGTACCGAAAGTATCTGGAGCTAAGCAAAAATGGC 3671

                   4101          .         .         .         .         . 4150
hj00237            4101 ACTGAGCCTGAGTCTTTCCACAAGGTGCTCAAGGGTCTTTATGAGAAGGG 4150
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hj00237(revised)   3672 ACTGAGCCTGAGTCTTTCCACAAGGTGCTCAAGGGTCTTTATGAGAAGGG 3721

                   4151          .         .         .         .         . 4200
hj00237            4151 CAGAAAGATGGACTGGAAGGTGCCTGAGCCTGAGGGCCAAACAAGTCCCA 4200
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hj00237(revised)   3722 CAGAAAGATGGACTGGAAGGTGCCTGAGCCTGAGGGCCAAACAAGTCCCA 3771

                   4201          .         .         .         .         . 4250
hj00237            4201 AGAATGCAGCTGTCTTCTCCTCAGTGCTGGCGCTCTGACTACCCTTCCCA 4250
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hj00237(revised)   3772 AGAATGCAGCTGTCTTCTCCTCAGTGCTGGCGCTCTGACTACCCTTCCCA 3821

                   4251          .         .         .         .         . 4300
hj00237            4251 AAGAACCACGGCCCTCTCCCTTTACTGTTCTATAGCCCCAGAACTGGGAG 4300
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hj00237(revised)   3822 AAGAACCACGGCCCTCTCCCTTTACTGTTCTATAGCCCCAGAACTGGGAG 3871

                   4301          .         .         .         .         . 4350
hj00237            4301 ATGGCTTCCTAAGTTGGCTATACCTTGTCCACTTCCAGTACTGGACGTGC 4350
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hj00237(revised)   3872 ATGGCTTCCTAAGTTGGCTATACCTTGTCCACTTCCAGTACTGGACGTGC 3921

                   4351          .         .         .         .         . 4400
hj00237            4351 TCAGGGTCTAGGGTCACAGATGGTGCTATTAATTGAACTGGAACACAGCA 4400
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hj00237(revised)   3922 TCAGGGTCTAGGGTCACAGATGGTGCTATTAATTGAACTGGAACACAGCA 3971

                   4401          .         .         .         .         . 4450
hj00237            4401 GAATTGTTGCAAAGGTTCTAGGAGCCAGATTCATTCCTTCTTCATTCTTT 4450
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hj00237(revised)   3972 GAATTGTTGCAAAGGTTCTAGGAGCCAGATTCATTCCTTCTTCATTCTTT 4021

                   4451          .         .         .         .         . 4500
hj00237            4451 GCAAAACAGTGGTACAGACATGGAGTCTAGAATTGACCCAGATGGAAAGT 4500
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hj00237(revised)   4022 GCAAAACAGTGGTACAGACATGGAGTCTAGAATTGACCCAGATGGAAAGT 4071

                   4501          .         .         .         .         . 4550
hj00237            4501 AATTGGTATTCTTAATATCCTGGGTGACTAATATCCAGGCAGAGAAGCTC 4550
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hj00237(revised)   4072 AATTGGTATTCTTAATATCCTGGGTGACTAATATCCAGGCAGAGAAGCTC 4121

                   4551          .         .         .         .         . 4600
hj00237            4551 CTGGAACCATAACTGTAAGTTCCTAGCTGGCTAGGGATTGAAGTCCTGGA 4600
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hj00237(revised)   4122 CTGGAACCATAACTGTAAGTTCCTAGCTGGCTAGGGATTGAAGTCCTGGA 4171

                   4601          .         .         .         .         . 4650
hj00237            4601 CAGTGACAGAGGATACCACAGTAGTTCAAGACTTAGCACAAGTCACCAAC 4650
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hj00237(revised)   4172 CAGTGACAGAGGATACCACAGTAGTTCAAGACTTAGCACAAGTCACCAAC 4221

                   4651          .         .         .         .         . 4700
hj00237            4651 TGCTTCAGGGATACCTGGAGGGGCCAGCAAGTAGAGTGTTGGTGGCCCAA 4700
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hj00237(revised)   4222 TGCTTCAGGGATACCTGGAGGGGCCAGCAAGTAGAGTGTTGGTGGCCCAA 4271

                   4701          .         .         .         .         . 4750
hj00237            4701 GCAAACCAGTGTTGCCAATACCATTGCCAAAAGGGCCTTTGGATCCTGGA 4750
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hj00237(revised)   4272 GCAAACCAGTGTTGCCAATACCATTGCCAAAAGGGCCTTTGGATCCTGGA 4321

                   4751          .         .         .         .         . 4800
hj00237            4751 CAAAGCTTGGCTGCCGGCTTCATTTATTCCTGCTGATGGCTGAGAAGCAT 4800
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hj00237(revised)   4322 CAAAGCTTGGCTGCCGGCTTCATTTATTCCTGCTGATGGCTGAGAAGCAT 4371

                   4801          .         .         .         .         . 4850
hj00237            4801 CTGTCTTCCATCCCACTTGCCTGTCCCAAGTTTTGTTCCATTTTTTAAAA 4850
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hj00237(revised)   4372 CTGTCTTCCATCCCACTTGCCTGTCCCAAGTTTTGTTCCATTTTTTAAAA 4421

                   4851          .         .         .         .         . 4900
hj00237            4851 ATTTGTTGTAAACTGCATGTTTTATAAAATAAAAATAAAATATCGTTTGT 4900
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hj00237(revised)   4422 ATTTGTTGTAAACTGCATGTTTTATAAAATAAAAATAAAATATCGTTTGT 4471

                   4901          . 4910
hj00237            4901 TATTTATCTC 4910
                        ||||||||||
hj00237(revised)   4472 TATTTATCTC 4481