Comparison between the cloned and the revised DNA sequences

Cloned DNA sequence, length = 4050 bp
Revised DNA sequence, length = 4050 bp

<< Positions of primers used in RT-PCR experiment(s) >>

 1 : f NN04513   515 -   535     CCT CCT AAT TAC ATC CAT GGG
     r NN04514   964 -   944     AGT CCA GAC CAG TAA AGA ATG
 2 : f NN06937  2883 -  2903     CCT TGA CCT GCC CCA CTC TGA
     r NN06938  3943 -  3923     TTT GAT GGC CCC CTG GTT CTT
<< Positions of inserion/deletion/mutation(s) in the aligned sequence >>
 1 :   767 -   767        1-bp deletion  (in the revised sequence)
 2 :  3656 -  3656        1-bp insertion (in the revised sequence)
Predicted coding region: colored in green ( 3 - 3989 in the revised sequence).


*- Clone Name -*      1          .         .         .         .         . 50
hk04449               1 CCCGGGATCCCCTAGAAGAAATGGCCCAGTTGAGCAGCTGTGACAGTCCT 50
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk04449(revised)      1 CCCGGGATCCCCTAGAAGAAATGGCCCAGTTGAGCAGCTGTGACAGTCCT 50

                     51          .         .         .         .         . 100
hk04449              51 GACACTCCAGAGACAGATGATTCTATTGAGGGCCATGGGGCATCTCTGCC 100
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk04449(revised)     51 GACACTCCAGAGACAGATGATTCTATTGAGGGCCATGGGGCATCTCTGCC 100

                    101          .         .         .         .         . 150
hk04449             101 ATCTAAAAAGACACCCTCTGAAGAGGACTTCGAGACCATTAAGCTCATCA 150
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk04449(revised)    101 ATCTAAAAAGACACCCTCTGAAGAGGACTTCGAGACCATTAAGCTCATCA 150

                    151          .         .         .         .         . 200
hk04449             151 GCAATGGCGCCTATGGGGCTGTATTTCTGGTGCGGCACAAGTCCACCCGG 200
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk04449(revised)    151 GCAATGGCGCCTATGGGGCTGTATTTCTGGTGCGGCACAAGTCCACCCGG 200

                    201          .         .         .         .         . 250
hk04449             201 CAGCGCTTTGCCATGAAGAAGATCAACAAGCAGAACCTGATCCTACGGAA 250
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk04449(revised)    201 CAGCGCTTTGCCATGAAGAAGATCAACAAGCAGAACCTGATCCTACGGAA 250

                    251          .         .         .         .         . 300
hk04449             251 CCAGATCCAGCAGGCCTTCGTGGAGCGTGACATACTGACTTTCGCTGAGA 300
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk04449(revised)    251 CCAGATCCAGCAGGCCTTCGTGGAGCGTGACATACTGACTTTCGCTGAGA 300

                    301          .         .         .         .         . 350
hk04449             301 ACCCCTTTGTGGTCAGCATGTTCTGCTCCTTTGATACCAAGCGCCACTTG 350
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk04449(revised)    301 ACCCCTTTGTGGTCAGCATGTTCTGCTCCTTTGATACCAAGCGCCACTTG 350

                    351          .         .         .         .         . 400
hk04449             351 TGCATGGTGATGGAGTACGTTGAAGGGGGAGACTGTGCCACTCTGCTGAA 400
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk04449(revised)    351 TGCATGGTGATGGAGTACGTTGAAGGGGGAGACTGTGCCACTCTGCTGAA 400

                    401          .         .         .         .         . 450
hk04449             401 GAATATTGGGGCCCTGCCTGTGGACATGGTGCGTCTATACTTTGCGGAAA 450
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk04449(revised)    401 GAATATTGGGGCCCTGCCTGTGGACATGGTGCGTCTATACTTTGCGGAAA 450

                    451          .         .         .         .         . 500
hk04449             451 CTGTGCTGGCCCTGGAGTACTTACACAACTATGGCATCGTGCACCGTGAC 500
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk04449(revised)    451 CTGTGCTGGCCCTGGAGTACTTACACAACTATGGCATCGTGCACCGTGAC 500

                    501          .         .         .         .         . 550
hk04449             501 CTCAAGCCTGACAACCTCCTAATTACATCCATGGGGCACATCAAGCTCAC 550
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk04449(revised)    501 CTCAAGCCTGACAACCTCCTAATTACATCCATGGGGCACATCAAGCTCAC 550

                    551          .         .         .         .         . 600
hk04449             551 GGACTTTGGACTGTCCAAAATGGGCCTCATGAGTCTGACAACGAACTTGT 600
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk04449(revised)    551 GGACTTTGGACTGTCCAAAATGGGCCTCATGAGTCTGACAACGAACTTGT 600

                    601          .         .         .         .         . 650
hk04449             601 ATGAGGGTCATATTGAAAAGGATGCCCGGGAATTCCTGGACAAGCAGGTA 650
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk04449(revised)    601 ATGAGGGTCATATTGAAAAGGATGCCCGGGAATTCCTGGACAAGCAGGTA 650

                    651          .         .         .         .         . 700
hk04449             651 TGCGGGACCCCAGAATACATTGCGCCTGAGGTGATCCTGCGCCAGGGCTA 700
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk04449(revised)    651 TGCGGGACCCCAGAATACATTGCGCCTGAGGTGATCCTGCGCCAGGGCTA 700

                    701          .         .         .         .         . 750
hk04449             701 TGGGAAGCCAGTGGACTGGTGGGCCATGGGCATTATCCTGTATGAGTTCC 750
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk04449(revised)    701 TGGGAAGCCAGTGGACTGGTGGGCCATGGGCATTATCCTGTATGAGTTCC 750

                    751          .         .         .         .         . 800
hk04449             751 TGGTGGGCTGCGTCCCTTTTTTTTGGAGATACTCCGGAGGAGCTCTTTGG 800
                        |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
hk04449(revised)    751 TGGTGGGCTGCGTCCC-TTTTTTTGGAGATACTCCGGAGGAGCTCTTTGG 799

                    801          .         .         .         .         . 850
hk04449             801 GCAGGTGATCAGTGATGAGATTGTGTGGCCTGAGGGTGATGAGGCACTGC 850
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk04449(revised)    800 GCAGGTGATCAGTGATGAGATTGTGTGGCCTGAGGGTGATGAGGCACTGC 849

                    851          .         .         .         .         . 900
hk04449             851 CCCCAGACGCCCAGGACCTCACCTCCAAACTGCTCCACCAGAACCCTCTG 900
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk04449(revised)    850 CCCCAGACGCCCAGGACCTCACCTCCAAACTGCTCCACCAGAACCCTCTG 899

                    901          .         .         .         .         . 950
hk04449             901 GAGAGACTTGGCACAGGCAGTGCCTATGAGGTGAAGCAGCACCCATTCTT 950
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk04449(revised)    900 GAGAGACTTGGCACAGGCAGTGCCTATGAGGTGAAGCAGCACCCATTCTT 949

                    951          .         .         .         .         . 1000
hk04449             951 TACTGGTCTGGACTGGACAGGACTTCTCCGCCAGAAGGCTGAATTTATTC 1000
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk04449(revised)    950 TACTGGTCTGGACTGGACAGGACTTCTCCGCCAGAAGGCTGAATTTATTC 999

                   1001          .         .         .         .         . 1050
hk04449            1001 CTCAGTTGGAGTCAGAGGATGATACTAGCTATTTTGACACCCGCTCAGAG 1050
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk04449(revised)   1000 CTCAGTTGGAGTCAGAGGATGATACTAGCTATTTTGACACCCGCTCAGAG 1049

                   1051          .         .         .         .         . 1100
hk04449            1051 CGATACCACCACATGGACTCGGAGGATGAGGAAGAAGTGAGTGAGGATGG 1100
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk04449(revised)   1050 CGATACCACCACATGGACTCGGAGGATGAGGAAGAAGTGAGTGAGGATGG 1099

                   1101          .         .         .         .         . 1150
hk04449            1101 CTGCCTTGAGATCCGCCAGTTCTCTTCCTGCTCTCCAAGGTTCAACAAGG 1150
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk04449(revised)   1100 CTGCCTTGAGATCCGCCAGTTCTCTTCCTGCTCTCCAAGGTTCAACAAGG 1149

                   1151          .         .         .         .         . 1200
hk04449            1151 TGTACAGCAGCATGGAGCGGCTCTCACTGCTCGAGGAGCGCCGGACACCA 1200
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk04449(revised)   1150 TGTACAGCAGCATGGAGCGGCTCTCACTGCTCGAGGAGCGCCGGACACCA 1199

                   1201          .         .         .         .         . 1250
hk04449            1201 CCCCCGACCAAGCGCAGCCTGAGTGAGGAGAAGGAGGACCATTCAGATGG 1250
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk04449(revised)   1200 CCCCCGACCAAGCGCAGCCTGAGTGAGGAGAAGGAGGACCATTCAGATGG 1249

                   1251          .         .         .         .         . 1300
hk04449            1251 CCTGGCAGGGCTCAAAGGCCGAGACCGGAGCTGGGTGATTGGCTCCCCTG 1300
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk04449(revised)   1250 CCTGGCAGGGCTCAAAGGCCGAGACCGGAGCTGGGTGATTGGCTCCCCTG 1299

                   1301          .         .         .         .         . 1350
hk04449            1301 AGATATTACGGAAGCGGCTGTCGGTGTCTGAGTCGTCCCACACAGAGAGT 1350
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk04449(revised)   1300 AGATATTACGGAAGCGGCTGTCGGTGTCTGAGTCGTCCCACACAGAGAGT 1349

                   1351          .         .         .         .         . 1400
hk04449            1351 GACTCAAGCCCTCCAATGACAGTGCGACGCCGCTGCTCAGGCCTCCTGGA 1400
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk04449(revised)   1350 GACTCAAGCCCTCCAATGACAGTGCGACGCCGCTGCTCAGGCCTCCTGGA 1399

                   1401          .         .         .         .         . 1450
hk04449            1401 TGCGCCTCGGTTCCCGGAGGGCCCTGAGGAGGCCAGCAGCACCCTCAGGA 1450
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk04449(revised)   1400 TGCGCCTCGGTTCCCGGAGGGCCCTGAGGAGGCCAGCAGCACCCTCAGGA 1449

                   1451          .         .         .         .         . 1500
hk04449            1451 GGCAACCACAGGAGGGTATATGGGTCCTGACACCCCCATCTGGAGAGGGG 1500
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk04449(revised)   1450 GGCAACCACAGGAGGGTATATGGGTCCTGACACCCCCATCTGGAGAGGGG 1499

                   1501          .         .         .         .         . 1550
hk04449            1501 GTATCTGGGCCTGTCACTGAACACTCAGGGGAGCAGCGGCCAAAGCTGGA 1550
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk04449(revised)   1500 GTATCTGGGCCTGTCACTGAACACTCAGGGGAGCAGCGGCCAAAGCTGGA 1549

                   1551          .         .         .         .         . 1600
hk04449            1551 TGAGGAAGCTGTTGGCCGGAGCAGTGGTTCCAGTCCAGCTATGGAGACCC 1600
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk04449(revised)   1550 TGAGGAAGCTGTTGGCCGGAGCAGTGGTTCCAGTCCAGCTATGGAGACCC 1599

                   1601          .         .         .         .         . 1650
hk04449            1601 GAGGCCGTGGGACCTCACAGCTGGCTGAGGGAGCCACAGCCAAGGCCATC 1650
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk04449(revised)   1600 GAGGCCGTGGGACCTCACAGCTGGCTGAGGGAGCCACAGCCAAGGCCATC 1649

                   1651          .         .         .         .         . 1700
hk04449            1651 AGTGACCTGGCTGTGCGTAGGGCCCGCCACCGGCTGCTCTCTGGGGACTC 1700
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk04449(revised)   1650 AGTGACCTGGCTGTGCGTAGGGCCCGCCACCGGCTGCTCTCTGGGGACTC 1699

                   1701          .         .         .         .         . 1750
hk04449            1701 AACAGAGAAGCGCACTGCTCGCCCTGTCAACAAAGTGATCAAGTCCGCCT 1750
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk04449(revised)   1700 AACAGAGAAGCGCACTGCTCGCCCTGTCAACAAAGTGATCAAGTCCGCCT 1749

                   1751          .         .         .         .         . 1800
hk04449            1751 CAGCCACAGCCCTCTCACTCCTCATTCCTTCGGAACACCACACCTGCTCC 1800
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk04449(revised)   1750 CAGCCACAGCCCTCTCACTCCTCATTCCTTCGGAACACCACACCTGCTCC 1799

                   1801          .         .         .         .         . 1850
hk04449            1801 CCGTTGGCCAGCCCCATGTCCCCACATTCTCAGTCGTCCAACCCATCATC 1850
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk04449(revised)   1800 CCGTTGGCCAGCCCCATGTCCCCACATTCTCAGTCGTCCAACCCATCATC 1849

                   1851          .         .         .         .         . 1900
hk04449            1851 CCGGGACTCTTCTCCAAGCAGGGACTTCTTGCCAGCCCTTGGCAGCATGA 1900
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk04449(revised)   1850 CCGGGACTCTTCTCCAAGCAGGGACTTCTTGCCAGCCCTTGGCAGCATGA 1899

                   1901          .         .         .         .         . 1950
hk04449            1901 GGCCTCCCATCATCATCCACCGAGCTGGCAAGAAGTATGGCTTCACCCTG 1950
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk04449(revised)   1900 GGCCTCCCATCATCATCCACCGAGCTGGCAAGAAGTATGGCTTCACCCTG 1949

                   1951          .         .         .         .         . 2000
hk04449            1951 CGGGCCATTCGCGTCTACATGGGTGACTCCGATGTCTACACCGTGCACCA 2000
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk04449(revised)   1950 CGGGCCATTCGCGTCTACATGGGTGACTCCGATGTCTACACCGTGCACCA 1999

                   2001          .         .         .         .         . 2050
hk04449            2001 TATGGTGTGGCACGTGGAGGATGGAGGTCCGGCCAGTGAGGCAGGGCTTC 2050
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk04449(revised)   2000 TATGGTGTGGCACGTGGAGGATGGAGGTCCGGCCAGTGAGGCAGGGCTTC 2049

                   2051          .         .         .         .         . 2100
hk04449            2051 GTCAAGGTGACCTCATCACCCATGTCAATGGGGAACCTGTGCATGGCCTG 2100
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk04449(revised)   2050 GTCAAGGTGACCTCATCACCCATGTCAATGGGGAACCTGTGCATGGCCTG 2099

                   2101          .         .         .         .         . 2150
hk04449            2101 GTGCACACGGAGGTGGTGGAGCTGATCCTGAAGAGTGGAAACAAGGTGGC 2150
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk04449(revised)   2100 GTGCACACGGAGGTGGTGGAGCTGATCCTGAAGAGTGGAAACAAGGTGGC 2149

                   2151          .         .         .         .         . 2200
hk04449            2151 CATTTCAACAACTCCCCTGGAGAACACATCCATTAAAGTGGGGCCAGCTC 2200
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk04449(revised)   2150 CATTTCAACAACTCCCCTGGAGAACACATCCATTAAAGTGGGGCCAGCTC 2199

                   2201          .         .         .         .         . 2250
hk04449            2201 GGAAGGGCAGCTACAAGGCCAAGATGGCCCGAAGGAGCAAGAGGAGCCGC 2250
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk04449(revised)   2200 GGAAGGGCAGCTACAAGGCCAAGATGGCCCGAAGGAGCAAGAGGAGCCGC 2249

                   2251          .         .         .         .         . 2300
hk04449            2251 GGCAAGGATGGGCAAGAAAGCAGAAAAAGGAGCTCCCTGTTCCGCAAGAT 2300
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk04449(revised)   2250 GGCAAGGATGGGCAAGAAAGCAGAAAAAGGAGCTCCCTGTTCCGCAAGAT 2299

                   2301          .         .         .         .         . 2350
hk04449            2301 CACCAAGCAAGCATCCCTGCTCCACACCAGCCGCAGCCTTTCTTCCCTTA 2350
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk04449(revised)   2300 CACCAAGCAAGCATCCCTGCTCCACACCAGCCGCAGCCTTTCTTCCCTTA 2349

                   2351          .         .         .         .         . 2400
hk04449            2351 ACCGCTCCTTGTCATCAGGGGAGAGTGGGCCAGGCTCTCCCACACACAGC 2400
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk04449(revised)   2350 ACCGCTCCTTGTCATCAGGGGAGAGTGGGCCAGGCTCTCCCACACACAGC 2399

                   2401          .         .         .         .         . 2450
hk04449            2401 CACAGCCTTTCCCCCCGATCTCCCACTCAAGGCTACCGGGTGACCCCCGA 2450
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk04449(revised)   2400 CACAGCCTTTCCCCCCGATCTCCCACTCAAGGCTACCGGGTGACCCCCGA 2449

                   2451          .         .         .         .         . 2500
hk04449            2451 TGCTGTGCATTCAGTGGGAGGGAATTCATCACAGAGCAGCTCCCCCAGCT 2500
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk04449(revised)   2450 TGCTGTGCATTCAGTGGGAGGGAATTCATCACAGAGCAGCTCCCCCAGCT 2499

                   2501          .         .         .         .         . 2550
hk04449            2501 CCAGCGTGCCCAGTTCCCCAGCCGGCTCTGGGCACACACGGCCCAGCTCC 2550
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk04449(revised)   2500 CCAGCGTGCCCAGTTCCCCAGCCGGCTCTGGGCACACACGGCCCAGCTCC 2549

                   2551          .         .         .         .         . 2600
hk04449            2551 CTCCACGGTCTGGCACCCAAGCTCCAACGCCAGTACCGCTCTCCACGGCG 2600
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk04449(revised)   2550 CTCCACGGTCTGGCACCCAAGCTCCAACGCCAGTACCGCTCTCCACGGCG 2599

                   2601          .         .         .         .         . 2650
hk04449            2601 CAAGTCAGCAGGCAGCATCCCACTGTCACCACTGGCCCACACCCCTTCTC 2650
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk04449(revised)   2600 CAAGTCAGCAGGCAGCATCCCACTGTCACCACTGGCCCACACCCCTTCTC 2649

                   2651          .         .         .         .         . 2700
hk04449            2651 CCCCACCCCCAACAGCTTCACCTCAGCGGTCCCCATCGCCCCTGTCTGGC 2700
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk04449(revised)   2650 CCCCACCCCCAACAGCTTCACCTCAGCGGTCCCCATCGCCCCTGTCTGGC 2699

                   2701          .         .         .         .         . 2750
hk04449            2701 CATGTAGCCCAGGCCTTTCCCACAAAGCTTCACTTGTCACCTCCCCTGGG 2750
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk04449(revised)   2700 CATGTAGCCCAGGCCTTTCCCACAAAGCTTCACTTGTCACCTCCCCTGGG 2749

                   2751          .         .         .         .         . 2800
hk04449            2751 CAGGCAACTCTCACGGCCCAAGAGTGCGGAGCCACCCCGTTCACCACTAC 2800
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk04449(revised)   2750 CAGGCAACTCTCACGGCCCAAGAGTGCGGAGCCACCCCGTTCACCACTAC 2799

                   2801          .         .         .         .         . 2850
hk04449            2801 TCAAGAGGGTGCAGTCGGCTGAGAAACTGGCAGCAGCACTTGCCGCCTCT 2850
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk04449(revised)   2800 TCAAGAGGGTGCAGTCGGCTGAGAAACTGGCAGCAGCACTTGCCGCCTCT 2849

                   2851          .         .         .         .         . 2900
hk04449            2851 GAGAAGAAGCTAGCCACTTCTCGCAAGCACAGCCTTGACCTGCCCCACTC 2900
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk04449(revised)   2850 GAGAAGAAGCTAGCCACTTCTCGCAAGCACAGCCTTGACCTGCCCCACTC 2899

                   2901          .         .         .         .         . 2950
hk04449            2901 TGAACTAAAGAAGGAACTGCCGCCCAGGGAAGTGAGCCCTCTGGAGGTAG 2950
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk04449(revised)   2900 TGAACTAAAGAAGGAACTGCCGCCCAGGGAAGTGAGCCCTCTGGAGGTAG 2949

                   2951          .         .         .         .         . 3000
hk04449            2951 TTGGAGCCAGGAGTGTGCTGTCTGGCAAGGGGGCCCTGCCAGGGAAGGGG 3000
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk04449(revised)   2950 TTGGAGCCAGGAGTGTGCTGTCTGGCAAGGGGGCCCTGCCAGGGAAGGGG 2999

                   3001          .         .         .         .         . 3050
hk04449            3001 GTGCTGCAGCCTGCTCCCTCACGGGCCCTAGGCACCCTCCGGCAGGACCG 3050
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk04449(revised)   3000 GTGCTGCAGCCTGCTCCCTCACGGGCCCTAGGCACCCTCCGGCAGGACCG 3049

                   3051          .         .         .         .         . 3100
hk04449            3051 AGCCGAACGACGGGAGTCGCTGCAGAAGCAAGAAGCCATTCGTGAGGTGG 3100
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk04449(revised)   3050 AGCCGAACGACGGGAGTCGCTGCAGAAGCAAGAAGCCATTCGTGAGGTGG 3099

                   3101          .         .         .         .         . 3150
hk04449            3101 ACTCCTCAGAGGACGACACCGAGGAAGGGCCTGAGAACAGCCAGGGTGCA 3150
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk04449(revised)   3100 ACTCCTCAGAGGACGACACCGAGGAAGGGCCTGAGAACAGCCAGGGTGCA 3149

                   3151          .         .         .         .         . 3200
hk04449            3151 CAGGAGCTGAGCTTGGCACCTCACCCAGAAGTGAGCCAGAGTGTGGCCCC 3200
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk04449(revised)   3150 CAGGAGCTGAGCTTGGCACCTCACCCAGAAGTGAGCCAGAGTGTGGCCCC 3199

                   3201          .         .         .         .         . 3250
hk04449            3201 TAAAGGAGCAGGAGAGAGTGGGGAAGAGGATCCTTTCCCGTCCAGAGGCC 3250
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk04449(revised)   3200 TAAAGGAGCAGGAGAGAGTGGGGAAGAGGATCCTTTCCCGTCCAGAGGCC 3249

                   3251          .         .         .         .         . 3300
hk04449            3251 CTAGGAGCCTGGGCCCAATGGTCCCAAGCCTATTGACAGGGATCACACTG 3300
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk04449(revised)   3250 CTAGGAGCCTGGGCCCAATGGTCCCAAGCCTATTGACAGGGATCACACTG 3299

                   3301          .         .         .         .         . 3350
hk04449            3301 GGGCCTCCCAGAATGGAAAGTCCCAGTGGTCCCCACAGGAGGCTCGGGAG 3350
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk04449(revised)   3300 GGGCCTCCCAGAATGGAAAGTCCCAGTGGTCCCCACAGGAGGCTCGGGAG 3349

                   3351          .         .         .         .         . 3400
hk04449            3351 CCCACAAGCCATTGAGGAGGCTGCCAGCTCCTCCTCAGCAGGCCCCAACC 3400
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk04449(revised)   3350 CCCACAAGCCATTGAGGAGGCTGCCAGCTCCTCCTCAGCAGGCCCCAACC 3399

                   3401          .         .         .         .         . 3450
hk04449            3401 TAGGTCAGTCTGGAGCCACAGACCCCATCCCTCCTGAAGGTTGCTGGAAG 3450
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk04449(revised)   3400 TAGGTCAGTCTGGAGCCACAGACCCCATCCCTCCTGAAGGTTGCTGGAAG 3449

                   3451          .         .         .         .         . 3500
hk04449            3451 GCCCAGCACCTCCACACCCAGGCACTAACAGCACTTTCTCCCAGCACTTC 3500
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk04449(revised)   3450 GCCCAGCACCTCCACACCCAGGCACTAACAGCACTTTCTCCCAGCACTTC 3499

                   3501          .         .         .         .         . 3550
hk04449            3501 GGGACTCACCCCCACCAGCAGTTGCTCTCCTCCCAGCTCCACCTCTGGGA 3550
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk04449(revised)   3500 GGGACTCACCCCCACCAGCAGTTGCTCTCCTCCCAGCTCCACCTCTGGGA 3549

                   3551          .         .         .         .         . 3600
hk04449            3551 AGCTGAGCATGTGGTCCTGGAAATCCCTTATTGAGGGCCCAGACAGGGCA 3600
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk04449(revised)   3550 AGCTGAGCATGTGGTCCTGGAAATCCCTTATTGAGGGCCCAGACAGGGCA 3599

                   3601          .         .         .         .         . 3650
hk04449            3601 TCCCCAAGCAGAAAGGCAACCATGGCAGGTGGGCTAGCCAACCTCCAGGA 3650
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk04449(revised)   3600 TCCCCAAGCAGAAAGGCAACCATGGCAGGTGGGCTAGCCAACCTCCAGGA 3649

                   3651          .         .         .         .         . 3700
hk04449            3651 TTTGG-AAACACAACTCCAGCCCAGCCTAAGAACCTGTCTCCCAGGGAGC 3699
                        ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk04449(revised)   3650 TTTGGAAAACACAACTCCAGCCCAGCCTAAGAACCTGTCTCCCAGGGAGC 3699

                   3701          .         .         .         .         . 3750
hk04449            3700 AGGGGAAGACACAGCCACCTAGTGCCCCCAGACTGGCCCATCCATCTTAT 3749
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk04449(revised)   3700 AGGGGAAGACACAGCCACCTAGTGCCCCCAGACTGGCCCATCCATCTTAT 3749

                   3751          .         .         .         .         . 3800
hk04449            3750 GAGGATCCCAGCCAGGGCTGGCTATGGGAGTCTGAGTGTGCACAAGCAGT 3799
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk04449(revised)   3750 GAGGATCCCAGCCAGGGCTGGCTATGGGAGTCTGAGTGTGCACAAGCAGT 3799

                   3801          .         .         .         .         . 3850
hk04449            3800 GAAAGAGGATCCAGCCCTGAGCATCACCCAAGTGCCTGATGCCTCAGGTG 3849
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk04449(revised)   3800 GAAAGAGGATCCAGCCCTGAGCATCACCCAAGTGCCTGATGCCTCAGGTG 3849

                   3851          .         .         .         .         . 3900
hk04449            3850 ACAGAAGGCAGGACGTTCCATGCCGAGGCTGCCCCCTCACCCAGAAGTCT 3899
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk04449(revised)   3850 ACAGAAGGCAGGACGTTCCATGCCGAGGCTGCCCCCTCACCCAGAAGTCT 3899

                   3901          .         .         .         .         . 3950
hk04449            3900 GAGCCCAGCCTCAGGAGGGGCCAAGAACCAGGGGGCCATCAAAAGCATCG 3949
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk04449(revised)   3900 GAGCCCAGCCTCAGGAGGGGCCAAGAACCAGGGGGCCATCAAAAGCATCG 3949

                   3951          .         .         .         .         . 4000
hk04449            3950 GGATTTGGCATTGGTTCCAGATGAGCTTTTAAAGCAAACATAGCAGTTGT 3999
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk04449(revised)   3950 GGATTTGGCATTGGTTCCAGATGAGCTTTTAAAGCAAACATAGCAGTTGT 3999

                   4001          .         .         .         .         . 4050
hk04449            4000 TTGCCATTTCTTGCACTCAGACCTGTGTAATATATGCTCCTGGAAACCAT 4049
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hk04449(revised)   4000 TTGCCATTTCTTGCACTCAGACCTGTGTAATATATGCTCCTGGAAACCAT 4049

                   4051   4051
hk04449            4050 C 4050
                        |
hk04449(revised)   4050 C 4050