Comparison between the cloned and the revised DNA sequences

Cloned DNA sequence, length = 4420 bp
Revised DNA sequence, length = 4311 bp

<< Positions of primers used in RT-PCR experiment(s) >>

 1 : f NN09329   371 -   391     CAG GCT ATG GAT CGA AGT TGT
     r NN09330   720 -   700     CTC TCA ACC ATT TCT GTG TCC
 2 : f NN09331  3076 -  3096     GGA GCC TGC AAT AAC CAA ACT
     r NN09332  3350 -  3330     GGC TCC ACA TAG GTA ATC TGA
<< Positions of inserion/deletion/mutation(s) in the aligned sequence >>
 1 :   498 -   498        1-bp insertion (in the revised sequence)
 2 :  3120 -  3229      110-bp deletion  (in the revised sequence)
Predicted coding region: colored in green ( 2 - 3907 in the revised sequence).


*- Clone Name -*      1          .         .         .         .         . 50
pj02581               1 CAAAAACTTGGAAGGAAATCATGACCAGCATGGCAGAAACAGCCTTCTTG 50
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
pj02581(revised)      1 CAAAAACTTGGAAGGAAATCATGACCAGCATGGCAGAAACAGCCTTCTTG 50

                     51          .         .         .         .         . 100
pj02581              51 CATCATATATTCATTATGTTTTCCGCCTACCAAATACTTACCCTAATTCA 100
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
pj02581(revised)     51 CATCATATATTCATTATGTTTTCCGCCTACCAAATACTTACCCTAATTCA 100

                    101          .         .         .         .         . 150
pj02581             101 TCATCACCAGGTCCTGGGGGTTTGGGAGGATCAGTGCATTATGCCACAAT 150
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
pj02581(revised)    101 TCATCACCAGGTCCTGGGGGTTTGGGAGGATCAGTGCATTATGCCACAAT 150

                    151          .         .         .         .         . 200
pj02581             151 GGCTAGATCTGCGGTGAGACCTGCAAGCCTTAATTTAAATCGTTCTCGAA 200
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
pj02581(revised)    151 GGCTAGATCTGCGGTGAGACCTGCAAGCCTTAATTTAAATCGTTCTCGAA 200

                    201          .         .         .         .         . 250
pj02581             201 GCCTTAGTAATAGCAATCCAGATATATCTGGGACTCCCACGTCACCAGAT 250
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
pj02581(revised)    201 GCCTTAGTAATAGCAATCCAGATATATCTGGGACTCCCACGTCACCAGAT 250

                    251          .         .         .         .         . 300
pj02581             251 GATGAAGTTCGATCAATCATCGGGAGTAAGGGTTTAGATCGCTCCAATTC 300
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
pj02581(revised)    251 GATGAAGTTCGATCAATCATCGGGAGTAAGGGTTTAGATCGCTCCAATTC 300

                    301          .         .         .         .         . 350
pj02581             301 CTGGGTTAACACTGGTGGTCCAAAAGCTGCCCCATGGGGATCCAACCCCA 350
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
pj02581(revised)    301 CTGGGTTAACACTGGTGGTCCAAAAGCTGCCCCATGGGGATCCAACCCCA 350

                    351          .         .         .         .         . 400
pj02581             351 GTCCAAGTGCAGAATCAACACAGGCTATGGATCGAAGTTGTAATCGTATG 400
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
pj02581(revised)    351 GTCCAAGTGCAGAATCAACACAGGCTATGGATCGAAGTTGTAATCGTATG 400

                    401          .         .         .         .         . 450
pj02581             401 TCTTCGCACACAGAGACGTCAAGTTTCTTACAAACATTAACGGGACGCTT 450
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
pj02581(revised)    401 TCTTCGCACACAGAGACGTCAAGTTTCTTACAAACATTAACGGGACGCTT 450

                    451          .         .         .         .         . 500
pj02581             451 ACCAACTAAAAAGCTTTTTCACGAGGAGCTGGCTTTGCAGTGGGTTG-TT 499
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
pj02581(revised)    451 ACCAACTAAAAAGCTTTTTCACGAGGAGCTGGCTTTGCAGTGGGTTGTTT 500

                    501          .         .         .         .         . 550
pj02581             500 GCAGTGGCAGCGTTCGGGAATCAGCTTTGCAACAAGCCTGGTTCTTTTTT 549
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
pj02581(revised)    501 GCAGTGGCAGCGTTCGGGAATCAGCTTTGCAACAAGCCTGGTTCTTTTTT 550

                    551          .         .         .         .         . 600
pj02581             550 GAATTAATGGTAAAGAGCATGGTGCACCATTTATACTTTAATGATAAACT 599
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
pj02581(revised)    551 GAATTAATGGTAAAGAGCATGGTGCACCATTTATACTTTAATGATAAACT 600

                    601          .         .         .         .         . 650
pj02581             600 TGAGGCTCCAAGGAAAAGTCGTTTTCCAGAACGTTTCATGGATGACATTG 649
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
pj02581(revised)    601 TGAGGCTCCAAGGAAAAGTCGTTTTCCAGAACGTTTCATGGATGACATTG 650

                    651          .         .         .         .         . 700
pj02581             650 CAGCTCTTGTCAGCACGATTGCTAGTGATATAGTTTCACGATTTCAGAAG 699
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
pj02581(revised)    651 CAGCTCTTGTCAGCACGATTGCTAGTGATATAGTTTCACGATTTCAGAAG 700

                    701          .         .         .         .         . 750
pj02581             700 GACACAGAAATGGTTGAGAGACTCAATACAAGCCTTGCATTCTTTCTCAA 749
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
pj02581(revised)    701 GACACAGAAATGGTTGAGAGACTCAATACAAGCCTTGCATTCTTTCTCAA 750

                    751          .         .         .         .         . 800
pj02581             750 TGATCTGTTGTCTGTTATGGACAGAGGATTTGTTTTTAGCCTTATAAAGT 799
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
pj02581(revised)    751 TGATCTGTTGTCTGTTATGGACAGAGGATTTGTTTTTAGCCTTATAAAGT 800

                    801          .         .         .         .         . 850
pj02581             800 CCTGCTATAAACAGGTGTCTTCAAAGCTTTACTCATTACCGAATCCCAGT 849
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
pj02581(revised)    801 CCTGCTATAAACAGGTGTCTTCAAAGCTTTACTCATTACCGAATCCCAGT 850

                    851          .         .         .         .         . 900
pj02581             850 GTTCTGGTGTCCTTGAGGCTGGATTTTCTACGAATCATCTGCAGTCATGA 899
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
pj02581(revised)    851 GTTCTGGTGTCCTTGAGGCTGGATTTTCTACGAATCATCTGCAGTCATGA 900

                    901          .         .         .         .         . 950
pj02581             900 GCACTATGTTACATTAAACTTACCCTGCAGCTTACTTACTCCACCTGCAT 949
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
pj02581(revised)    901 GCACTATGTTACATTAAACTTACCCTGCAGCTTACTTACTCCACCTGCAT 950

                    951          .         .         .         .         . 1000
pj02581             950 CTCCATCACCTTCTGTTTCTTCTGCAACATCTCAGAGTTCTGGATTTTCT 999
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
pj02581(revised)    951 CTCCATCACCTTCTGTTTCTTCTGCAACATCTCAGAGTTCTGGATTTTCT 1000

                   1001          .         .         .         .         . 1050
pj02581            1000 ACGAATGTACAAGACCAAAAGATTGCAAATATGTTTGAATTATCCGTGCC 1049
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
pj02581(revised)   1001 ACGAATGTACAAGACCAAAAGATTGCAAATATGTTTGAATTATCCGTGCC 1050

                   1051          .         .         .         .         . 1100
pj02581            1050 TTTCCGCCAACAGCATTATTTGGCAGGACTTGTGTTAACAGAGCTGGCTG 1099
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
pj02581(revised)   1051 TTTCCGCCAACAGCATTATTTGGCAGGACTTGTGTTAACAGAGCTGGCTG 1100

                   1101          .         .         .         .         . 1150
pj02581            1100 TCATTTTAGACCCTGATGCTGAAGGACTGTTTGGATTGCATAAGAAAGTC 1149
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
pj02581(revised)   1101 TCATTTTAGACCCTGATGCTGAAGGACTGTTTGGATTGCATAAGAAAGTC 1150

                   1151          .         .         .         .         . 1200
pj02581            1150 ATCAATATGGTACACAATTTACTCTCCAGTCACGACTCAGACCCGCGGTA 1199
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
pj02581(revised)   1151 ATCAATATGGTACACAATTTACTCTCCAGTCACGACTCAGACCCGCGGTA 1200

                   1201          .         .         .         .         . 1250
pj02581            1200 CTCTGACCCTCAGATAAAGGCTCGAGTGGCCATGTTGTATCTACCTCTGA 1249
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
pj02581(revised)   1201 CTCTGACCCTCAGATAAAGGCTCGAGTGGCCATGTTGTATCTACCTCTGA 1250

                   1251          .         .         .         .         . 1300
pj02581            1250 TTGGTATTATCATGGAAACTGTACCTCAGCTGTATGATTTTACAGAAACT 1299
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
pj02581(revised)   1251 TTGGTATTATCATGGAAACTGTACCTCAGCTGTATGATTTTACAGAAACT 1300

                   1301          .         .         .         .         . 1350
pj02581            1300 CACAATCAACGAGGAAGACCAATTTGTATAGCCACTGATGATTATGAAAG 1349
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
pj02581(revised)   1301 CACAATCAACGAGGAAGACCAATTTGTATAGCCACTGATGATTATGAAAG 1350

                   1351          .         .         .         .         . 1400
pj02581            1350 TGAGAGCGGAAGTATGATAAGCCAGACCGTTGCCATGGCAATCGCAGGGA 1399
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
pj02581(revised)   1351 TGAGAGCGGAAGTATGATAAGCCAGACCGTTGCCATGGCAATCGCAGGGA 1400

                   1401          .         .         .         .         . 1450
pj02581            1400 CATCGGTCCCTCAACTAACAAGGCCTGGCAGTTTCCTCCTCACGTCAACG 1449
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
pj02581(revised)   1401 CATCGGTCCCTCAACTAACAAGGCCTGGCAGTTTCCTCCTCACGTCAACG 1450

                   1451          .         .         .         .         . 1500
pj02581            1450 AGTGGCAGGCAACACACTACCTTTTCAGCAGAATCAAGTCGAAGCCTTTT 1499
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
pj02581(revised)   1451 AGTGGCAGGCAACACACTACCTTTTCAGCAGAATCAAGTCGAAGCCTTTT 1500

                   1501          .         .         .         .         . 1550
pj02581            1500 GATCTGTCTACTTTGGGTTCTCAAAAATGCAGATGAAACAGTTCTACAGA 1549
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
pj02581(revised)   1501 GATCTGTCTACTTTGGGTTCTCAAAAATGCAGATGAAACAGTTCTACAGA 1550

                   1551          .         .         .         .         . 1600
pj02581            1550 AGTGGTTTACAGATCTCTCAGTCTTGCAGCTAAACCGGCTATTAGATCTG 1599
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
pj02581(revised)   1551 AGTGGTTTACAGATCTCTCAGTCTTGCAGCTAAACCGGCTATTAGATCTG 1600

                   1601          .         .         .         .         . 1650
pj02581            1600 CTTTATCTCTGTGTGTCTTGCTTTGAGTATAAAGGGAAAAAAGTGTTTGA 1649
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
pj02581(revised)   1601 CTTTATCTCTGTGTGTCTTGCTTTGAGTATAAAGGGAAAAAAGTGTTTGA 1650

                   1651          .         .         .         .         . 1700
pj02581            1650 ACGAATGAATAGCTTGACCTTTAAGAAATCAAAAGACATGAGAGCAAAGC 1699
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
pj02581(revised)   1651 ACGAATGAATAGCTTGACCTTTAAGAAATCAAAAGACATGAGAGCAAAGC 1700

                   1701          .         .         .         .         . 1750
pj02581            1700 TTGAAGAAGCTATTCTTGGGAGCATAGGTGCCAGGCAAGAAATGGTACGG 1749
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
pj02581(revised)   1701 TTGAAGAAGCTATTCTTGGGAGCATAGGTGCCAGGCAAGAAATGGTACGG 1750

                   1751          .         .         .         .         . 1800
pj02581            1750 CGAAGCCGAGGACAGCTCGAGAGAAGCCCATCTGGAAGTGCCTTTGGAAG 1799
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
pj02581(revised)   1751 CGAAGCCGAGGACAGCTCGAGAGAAGCCCATCTGGAAGTGCCTTTGGAAG 1800

                   1801          .         .         .         .         . 1850
pj02581            1800 TCAAGAAAATTTGAGGTGGAGGAAAGATATGACTCACTGGCGTCAAAACA 1849
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
pj02581(revised)   1801 TCAAGAAAATTTGAGGTGGAGGAAAGATATGACTCACTGGCGTCAAAACA 1850

                   1851          .         .         .         .         . 1900
pj02581            1850 CAGAGAAGCTTGACAAATCAAGAGCAGAGATTGAACACGAAGCACTGATT 1899
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
pj02581(revised)   1851 CAGAGAAGCTTGACAAATCAAGAGCAGAGATTGAACACGAAGCACTGATT 1900

                   1901          .         .         .         .         . 1950
pj02581            1900 GATGGAAACCTGGCTACAGAAGCAAACCTAATCATTTTAGATACATTAGA 1949
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
pj02581(revised)   1901 GATGGAAACCTGGCTACAGAAGCAAACCTAATCATTTTAGATACATTAGA 1950

                   1951          .         .         .         .         . 2000
pj02581            1950 GATTGTTGTTCAGACCGTTTCTGTAACGGAATCCAAAGAGAGCATTCTTG 1999
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
pj02581(revised)   1951 GATTGTTGTTCAGACCGTTTCTGTAACGGAATCCAAAGAGAGCATTCTTG 2000

                   2001          .         .         .         .         . 2050
pj02581            2000 GTGGAGTGCTAAAAGTGCTACTACACAGCATGGCCTGTAACCAAAGTGCA 2049
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
pj02581(revised)   2001 GTGGAGTGCTAAAAGTGCTACTACACAGCATGGCCTGTAACCAAAGTGCA 2050

                   2051          .         .         .         .         . 2100
pj02581            2050 GTTTATCTACAACACTGTTTTGCTACACAGAGAGCCTTGGTTTCAAAGTT 2099
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
pj02581(revised)   2051 GTTTATCTACAACACTGTTTTGCTACACAGAGAGCCTTGGTTTCAAAGTT 2100

                   2101          .         .         .         .         . 2150
pj02581            2100 TCCTGAACTCTTATTTGAAGAAGAGACAGAGCAGTGTGCTGATTTATGCC 2149
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
pj02581(revised)   2101 TCCTGAACTCTTATTTGAAGAAGAGACAGAGCAGTGTGCTGATTTATGCC 2150

                   2151          .         .         .         .         . 2200
pj02581            2150 TCAGGCTTCTCCGACACTGTAGCAGTAGCATCGGTACAATACGGTCACAC 2199
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
pj02581(revised)   2151 TCAGGCTTCTCCGACACTGTAGCAGTAGCATCGGTACAATACGGTCACAC 2200

                   2201          .         .         .         .         . 2250
pj02581            2200 GCCAGTGCCTCCCTTTACCTACTAATGAGGCAAAACTTTGAGATTGGGAA 2249
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
pj02581(revised)   2201 GCCAGTGCCTCCCTTTACCTACTAATGAGGCAAAACTTTGAGATTGGGAA 2250

                   2251          .         .         .         .         . 2300
pj02581            2250 TAACTTTGCCAGGGTTAAAATGCAGGTAACAATGTCACTATCCTCCTTGG 2299
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
pj02581(revised)   2251 TAACTTTGCCAGGGTTAAAATGCAGGTAACAATGTCACTATCCTCCTTGG 2300

                   2301          .         .         .         .         . 2350
pj02581            2300 TGGGCACATCTCAGAATTTTAATGAAGAATTCTTAAGACGTTCTCTAAAG 2349
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
pj02581(revised)   2301 TGGGCACATCTCAGAATTTTAATGAAGAATTCTTAAGACGTTCTCTAAAG 2350

                   2351          .         .         .         .         . 2400
pj02581            2350 ACTATATTGACATATGCTGAAGAAGATCTGGAATTGAGGGAAACAACATT 2399
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
pj02581(revised)   2351 ACTATATTGACATATGCTGAAGAAGATCTGGAATTGAGGGAAACAACATT 2400

                   2401          .         .         .         .         . 2450
pj02581            2400 TCCTGATCAGGTCCAGGATCTGGTTTTCAATCTCCATATGATTCTTTCTG 2449
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
pj02581(revised)   2401 TCCTGATCAGGTCCAGGATCTGGTTTTCAATCTCCATATGATTCTTTCTG 2450

                   2451          .         .         .         .         . 2500
pj02581            2450 ATACTGTGAAAATGAAGGAACACCAGGAGGATCCTGAAATGTTGATTGAT 2499
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
pj02581(revised)   2451 ATACTGTGAAAATGAAGGAACACCAGGAGGATCCTGAAATGTTGATTGAT 2500

                   2501          .         .         .         .         . 2550
pj02581            2500 CTAATGTACAGAATTGCCAAGGGTTACCAGACCTCTCCAGATCTGCGATT 2549
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
pj02581(revised)   2501 CTAATGTACAGAATTGCCAAGGGTTACCAGACCTCTCCAGATCTGCGATT 2550

                   2551          .         .         .         .         . 2600
pj02581            2550 GACCTGGTTGCAGAACATGGCAGGCAAGCACTCAGAACGAAGCAATCATG 2599
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
pj02581(revised)   2551 GACCTGGTTGCAGAACATGGCAGGCAAGCACTCAGAACGAAGCAATCATG 2600

                   2601          .         .         .         .         . 2650
pj02581            2600 CTGAAGCTGCACAGTGTCTAGTCCACTCAGCAGCACTTGTTGCTGAATAT 2649
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
pj02581(revised)   2601 CTGAAGCTGCACAGTGTCTAGTCCACTCAGCAGCACTTGTTGCTGAATAT 2650

                   2651          .         .         .         .         . 2700
pj02581            2650 TTGAGCATGCTGGAGGACCGGAAATATCTTCCTGTGGGATGTGTAACATT 2699
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
pj02581(revised)   2651 TTGAGCATGCTGGAGGACCGGAAATATCTTCCTGTGGGATGTGTAACATT 2700

                   2701          .         .         .         .         . 2750
pj02581            2700 TCAGAATATTTCATCTAATGTTTTAGAAGAATCTGCGGTCTCAGATGATG 2749
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
pj02581(revised)   2701 TCAGAATATTTCATCTAATGTTTTAGAAGAATCTGCGGTCTCAGATGATG 2750

                   2751          .         .         .         .         . 2800
pj02581            2750 TGGTATCTCCAGATGAAGAAGGTATCTGCTCTGGAAAATACTTTACTGAG 2799
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
pj02581(revised)   2751 TGGTATCTCCAGATGAAGAAGGTATCTGCTCTGGAAAATACTTTACTGAG 2800

                   2801          .         .         .         .         . 2850
pj02581            2800 TCAGGACTTGTGGGATTACTGGAACAAGCAGCTGCTTCCTTCTCTATGGC 2849
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
pj02581(revised)   2801 TCAGGACTTGTGGGATTACTGGAACAAGCAGCTGCTTCCTTCTCTATGGC 2850

                   2851          .         .         .         .         . 2900
pj02581            2850 TGGCATGTATGAAGCAGTTAATGAAGTTTACAAAGTACTTATTCCTATTC 2899
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
pj02581(revised)   2851 TGGCATGTATGAAGCAGTTAATGAAGTTTACAAAGTACTTATTCCTATTC 2900

                   2901          .         .         .         .         . 2950
pj02581            2900 ATGAAGCTAATCGGGATGCAAAGAAACTATCCACAATTCATGGTAAACTT 2949
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
pj02581(revised)   2901 ATGAAGCTAATCGGGATGCAAAGAAACTATCCACAATTCATGGTAAACTT 2950

                   2951          .         .         .         .         . 3000
pj02581            2950 CAAGAAGCATTCAGCAAAATTGTTCATCAGAGTACTGGCTGGGAGCGGAT 2999
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
pj02581(revised)   2951 CAAGAAGCATTCAGCAAAATTGTTCATCAGAGTACTGGCTGGGAGCGGAT 3000

                   3001          .         .         .         .         . 3050
pj02581            3000 GTTTGGCACCTATTTTCGTGTTGGTTTTTATGGAACCAAGTTCGGGGATT 3049
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
pj02581(revised)   3001 GTTTGGCACCTATTTTCGTGTTGGTTTTTATGGAACCAAGTTCGGGGATT 3050

                   3051          .         .         .         .         . 3100
pj02581            3050 TGGATGAACAAGAATTTGTTTACAAGGAGCCTGCAATAACCAAACTTGCA 3099
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
pj02581(revised)   3051 TGGATGAACAAGAATTTGTTTACAAGGAGCCTGCAATAACCAAACTTGCA 3100

                   3101          .         .         .         .         . 3150
pj02581            3100 GAGATATCTCACAGATTGGAGTGGATGGACCGGAAGCATTGGGTTCACCT 3149
                        |||||||||||||||||||                               
pj02581(revised)   3101 GAGATATCTCACAGATTGG------------------------------- 3119

                   3151          .         .         .         .         . 3200
pj02581            3150 GGGAGATTGTTTGAAATGCAGAACCTCAGACCCCACCCCAGCCCCTGTGA 3199
                                                                          
pj02581(revised)   3120 -------------------------------------------------- 3120

                   3201          .         .         .         .         . 3250
pj02581            3200 ATCAAAGTCTGCATTTTAACAAGATCCCCAGGGATTTTACGGAGAAAGAT 3249
                                                     |||||||||||||||||||||
pj02581(revised)   3120 -----------------------------AGGGATTTTACGGAGAAAGAT 3140

                   3251          .         .         .         .         . 3300
pj02581            3250 TTGGAGAGGATGTGGTTGAAGTAATCAAAGACTCTAATCCTGTAGACAAG 3299
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
pj02581(revised)   3141 TTGGAGAGGATGTGGTTGAAGTAATCAAAGACTCTAATCCTGTAGACAAG 3190

                   3301          .         .         .         .         . 3350
pj02581            3300 TGTAAATTAGATCCTAACAAGGCATATATTCAGATTACCTATGTGGAGCC 3349
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
pj02581(revised)   3191 TGTAAATTAGATCCTAACAAGGCATATATTCAGATTACCTATGTGGAGCC 3240

                   3351          .         .         .         .         . 3400
pj02581            3350 ATACTTTGACACATATGAGATGAAGGACAGAATCACCTATTTCGACAAAA 3399
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
pj02581(revised)   3241 ATACTTTGACACATATGAGATGAAGGACAGAATCACCTATTTCGACAAAA 3290

                   3401          .         .         .         .         . 3450
pj02581            3400 ATTACAATCTTCGTCGATTCATGTACTGTACACCCTTTACTTTAGATGGC 3449
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
pj02581(revised)   3291 ATTACAATCTTCGTCGATTCATGTACTGTACACCCTTTACTTTAGATGGC 3340

                   3451          .         .         .         .         . 3500
pj02581            3450 CGTGCCCATGGGGAACTTCATGAACAATTCAAAAGGAAGACCATTCTGAC 3499
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
pj02581(revised)   3341 CGTGCCCATGGGGAACTTCATGAACAATTCAAAAGGAAGACCATTCTGAC 3390

                   3501          .         .         .         .         . 3550
pj02581            3500 TACGTCTCATGCCTTTCCTTATATTAAAACAAGGGTCAATGTCACTCATA 3549
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
pj02581(revised)   3391 TACGTCTCATGCCTTTCCTTATATTAAAACAAGGGTCAATGTCACTCATA 3440

                   3551          .         .         .         .         . 3600
pj02581            3550 AAGAAGAGATCATCTTAACACCAATTGAAGTTGCTATTGAGGACATGCAG 3599
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
pj02581(revised)   3441 AAGAAGAGATCATCTTAACACCAATTGAAGTTGCTATTGAGGACATGCAG 3490

                   3601          .         .         .         .         . 3650
pj02581            3600 AAAAAGACACAGGAGTTGGCATTTGCAACACATCAGGATCCCGCAGACCC 3649
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
pj02581(revised)   3491 AAAAAGACACAGGAGTTGGCATTTGCAACACATCAGGATCCCGCAGACCC 3540

                   3651          .         .         .         .         . 3700
pj02581            3650 CAAAATGCTTCAGATGGTACTCCAGGGATCTGTAGGCACCACAGTGAATC 3699
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
pj02581(revised)   3541 CAAAATGCTTCAGATGGTACTCCAGGGATCTGTAGGCACCACAGTGAATC 3590

                   3701          .         .         .         .         . 3750
pj02581            3700 AGGGGCCTTTGGAAGTTGCCCAGGTTTTTCTGTCTGAAATACCTAGTGAC 3749
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
pj02581(revised)   3591 AGGGGCCTTTGGAAGTTGCCCAGGTTTTTCTGTCTGAAATACCTAGTGAC 3640

                   3751          .         .         .         .         . 3800
pj02581            3750 CCAAAGCTCTTCAGACATCATAATAAACTGCGACTCTGCTTTAAAGATTT 3799
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
pj02581(revised)   3641 CCAAAGCTCTTCAGACATCATAATAAACTGCGACTCTGCTTTAAAGATTT 3690

                   3801          .         .         .         .         . 3850
pj02581            3800 TACTAAAAGGTGTGAAGATGCCTTAAGAAAAAATAAGAGCTTAATTGGGC 3849
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
pj02581(revised)   3691 TACTAAAAGGTGTGAAGATGCCTTAAGAAAAAATAAGAGCTTAATTGGGC 3740

                   3851          .         .         .         .         . 3900
pj02581            3850 CGGATCAAAAGGAGTATCAAAGGGAACTGGAGAGAAACTATCATCGCCTT 3899
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
pj02581(revised)   3741 CGGATCAAAAGGAGTATCAAAGGGAACTGGAGAGAAACTATCATCGCCTT 3790

                   3901          .         .         .         .         . 3950
pj02581            3900 AAAGAGGCCCTACAGCCACTGATCAACAGAAAGATCCCTCAGTTATACAA 3949
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
pj02581(revised)   3791 AAAGAGGCCCTACAGCCACTGATCAACAGAAAGATCCCTCAGTTATACAA 3840

                   3951          .         .         .         .         . 4000
pj02581            3950 GGCAGTATTGCCTGTCACCTGCCACAGAGATTCCTTCAGTCGAATGAGCC 3999
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
pj02581(revised)   3841 GGCAGTATTGCCTGTCACCTGCCACAGAGATTCCTTCAGTCGAATGAGCC 3890

                   4001          .         .         .         .         . 4050
pj02581            4000 TTCGCAAAATGGATCTCTAAACTGAATGCACTTGTTTTATTCATCTGCAA 4049
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
pj02581(revised)   3891 TTCGCAAAATGGATCTCTAAACTGAATGCACTTGTTTTATTCATCTGCAA 3940

                   4051          .         .         .         .         . 4100
pj02581            4050 AGAGCCATGTATTCAACATCGAGTGTGAAAAGATCTATTGGAAAACAACA 4099
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
pj02581(revised)   3941 AGAGCCATGTATTCAACATCGAGTGTGAAAAGATCTATTGGAAAACAACA 3990

                   4101          .         .         .         .         . 4150
pj02581            4100 TGGAATGGAATTCTGGAAATTATTATTCATTGAAGAATGCAGTGGCCAAG 4149
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
pj02581(revised)   3991 TGGAATGGAATTCTGGAAATTATTATTCATTGAAGAATGCAGTGGCCAAG 4040

                   4151          .         .         .         .         . 4200
pj02581            4150 AAAATATCAAATGTAGATTGTTAACGCTTGAGAATCATGGCTATGGTTTC 4199
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
pj02581(revised)   4041 AAAATATCAAATGTAGATTGTTAACGCTTGAGAATCATGGCTATGGTTTC 4090

                   4201          .         .         .         .         . 4250
pj02581            4200 TAATGTTCTGGTAACAAGCTGTTATCTTTTAAGACATTTTAATGACTCAA 4249
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
pj02581(revised)   4091 TAATGTTCTGGTAACAAGCTGTTATCTTTTAAGACATTTTAATGACTCAA 4140

                   4251          .         .         .         .         . 4300
pj02581            4250 AGGTACACTATACATTTACCATTATTTATACCATAGCTAAGGTTAAAAAT 4299
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
pj02581(revised)   4141 AGGTACACTATACATTTACCATTATTTATACCATAGCTAAGGTTAAAAAT 4190

                   4301          .         .         .         .         . 4350
pj02581            4300 TTATTCACTTTAAGTTCGTATTTTTTAATTTATATTACCATTTATAGATT 4349
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
pj02581(revised)   4191 TTATTCACTTTAAGTTCGTATTTTTTAATTTATATTACCATTTATAGATT 4240

                   4351          .         .         .         .         . 4400
pj02581            4350 CATTTTGGAACCATTTTAAATGTAGTAATGCTTATTTTAAAGGTACTATT 4399
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
pj02581(revised)   4241 CATTTTGGAACCATTTTAAATGTAGTAATGCTTATTTTAAAGGTACTATT 4290

                   4401          .         .  4421
pj02581            4400 AAATATGTGAATGTTTACACT 4420
                        |||||||||||||||||||||
pj02581(revised)   4291 AAATATGTGAATGTTTACACT 4311