# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/ha00919.fasta.nr -Q ../query/KIAA0077.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0077, 1798 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7827163 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0075+/-0.000182; mu= 16.6458+/- 0.010 mean_var=71.7093+/-13.971, 0's: 39 Z-trim: 40 B-trim: 0 in 0/65 Lambda= 0.151456 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 41, opt: 29, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|134034993|sp|Q14997.2|PSME4_HUMAN RecName: Full (1843) 12077 2649.5 0 gi|119903486|ref|XP_606554.3| PREDICTED: proteasom (1843) 11793 2587.5 0 gi|149044860|gb|EDL98046.1| rCG23342, isoform CRA_ (1843) 11652 2556.6 0 gi|109500155|ref|XP_001055468.1| PREDICTED: simila (2011) 11652 2556.7 0 gi|81862437|sp|Q5SSW2.1|PSME4_MOUSE RecName: Full= (1843) 11637 2553.4 0 gi|85566853|gb|AAI12170.1| Proteasome (prosome, ma (1729) 11624 2550.5 0 gi|73970154|ref|XP_531823.2| PREDICTED: similar to (1774) 11595 2544.2 0 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