# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/ha03233.fasta.huge -Q ../query/KIAA0158.ptfa ./tmplib.23147 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0158, 367 aa vs ./tmplib.23147 library 1987138 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9233+/-0.00539; mu= 13.0436+/- 0.367 mean_var=101.1867+/-23.925, 0's: 0 Z-trim: 3 B-trim: 154 in 1/39 Lambda= 0.127501 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0991 ( 630 res) hk06065 ( 630) 981 190.9 1.6e-49 KIAA0202 ( 508 res) ha02944 ( 508) 859 168.3 8.2e-43 KIAA0128 ( 424 res) ha03961 ( 424) 841 164.9 7.3e-42 >>KIAA0991 ( 630 res) hk06065 (630 aa) initn: 630 init1: 457 opt: 981 Z-score: 980.7 bits: 190.9 E(): 1.6e-49 Smith-Waterman score: 981; 46.519% identity (78.481% similar) in 316 aa overlap (9-319:306-618) 10 20 30 KIAA01 DEASQKMSKQQPTQFINPETP---GYVGFANLPNQVHR :: :.. : ..: ::::. .. .:..: KIAA09 AEATPRSQEATEAAPSCVGDMADTPRDAGLKQAPASR-NEKAPVDFGYVGIDSILEQMRR 280 290 300 310 320 330 40 50 60 70 80 90 KIAA01 KSVKKGFEFTLMVVGESGLGKSTLINSLFLTDLYPERVIPGAAEKIERTVQIEASTVEIE :..:.::::..::::.::::::::::.:: . . . : : . :.: .:..:.. : .:: KIAA09 KAMKQGFEFNIMVVGQSGLGKSTLINTLFKSKISRKSVQPTSEERIPKTIEIKSITHDIE 340 350 360 370 380 390 100 110 120 130 140 150 KIAA01 ERGVKLRLTVVDTPGYGDAINCRDCFKTIISYIDEQFERYLHDESGLNRRH-IIDNRVHC :.::...:::.::::.:: :: ..:.. :...:..:.:.::..: ..::.. : :.:::: KIAA09 EKGVRMKLTVIDTPGFGDHINNENCWQPIMKFINDQYEKYLQEEVNINRKKRIPDTRVHC 400 410 420 430 440 450 160 170 180 190 200 210 KIAA01 CFYFISPFGHGLKPLDVAFMKAIHNKVNIVPVIAKADTLTLKERERLKKRILDEIEEHNI :.::: ::.:.:::. ::: . . :::::::::::::::.:: ..:.:: .. ..: KIAA09 CLYFIPATGHSLRPLDIEFMKRLSKVVNIVPVIAKADTLTLEERVHFKQRITADLLSNGI 460 470 480 490 500 510 220 230 240 250 260 270 KIAA01 KIYHLPDAESDEDEDFKEQTRLLKASIPFSVVGSNQLIEAKGKKVRGRLYPWGVVEVENP .: :. : ::: . . .. .. :::.::::.. ...::.. :: ::..:::: KIAA09 DVY--PQKEFDEDSEDRLVNEKFREMIPFAVVGSDHEYQVNGKRILGRKTKWGTIEVENT 520 530 540 550 560 570 280 290 300 310 320 330 KIAA01 EHNDFLKLRTMLI-THMQDLQEVTQDLHYENFRSERLKRGGRKVENEDMNKDQILLEKEA : .: :: .:: ::::.....:...:.: .: .::..:. . : KIAA09 THCEFAYLRDLLIRTHMQNIKDITSSIHFEAYRVKRLNEGSSAMANGVEEKEPEAPEM 580 590 600 610 620 630 340 350 360 KIAA01 ELRRMQEMIARMQAQMQMQMQGGDGDGGALGHHV >>KIAA0202 ( 508 res) ha02944 (508 aa) initn: 784 init1: 259 opt: 859 Z-score: 860.5 bits: 168.3 E(): 8.2e-43 Smith-Waterman score: 859; 41.246% identity (73.591% similar) in 337 aa overlap (22-354:102-425) 10 20 30 40 50 KIAA01 DEASQKMSKQQPTQFINPETPGYVGFANLPNQVHRKSVKKGFEFTLMVVGE :.::: .::.:. ::: .:: :... ::: KIAA02 HPPGAELAMAATDLERFSNAEPEPRSLSLGGHVGFDSLPDQLVSKSVTQGFSFNILCVGE 80 90 100 110 120 130 60 70 80 90 100 110 KIAA01 SGLGKSTLINSLFLTDLYPERVIPGAAEKIERTVQIEASTVEIEERGVKLRLTVVDTPGY .:.:::::.:.:: : . :. : . : :... .: ...: .:.:.::.::. :. 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