# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/ha02928.fasta.huge -Q ../query/KIAA0189.ptfa ./tmplib.23147 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0189, 1132 aa vs ./tmplib.23147 library 1986373 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.7600+/-0.00699; mu= 13.8167+/- 0.472 mean_var=259.6751+/-61.797, 0's: 0 Z-trim: 19 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.079590 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1723 ( 1554 res) pf00881 (1554) 2585 311.1 8e-85 KIAA0131 ( 942 res) ha01235 ( 942) 284 46.6 2.1e-05 KIAA1722 ( 1499 res) pf00674s1 (1499) 285 47.0 2.5e-05 KIAA0013 ( 1086 res) ha00450s1 (1086) 265 44.5 0.0001 KIAA1314 ( 681 res) fh12718 ( 681) 251 42.6 0.00024 KIAA1204 ( 1445 res) fg03451 (1445) 243 42.1 0.00069 KIAA0411 ( 1061 res) hg02120 (1061) 238 41.4 0.00087 KIAA0672 ( 824 res) hk02382 ( 824) 227 39.9 0.0018 KIAA0456 ( 1095 res) hg00633 (1095) 228 40.2 0.002 KIAA1478 ( 570 res) fj05212 ( 570) 218 38.7 0.003 KIAA0621 ( 753 res) hg04539 ( 753) 217 38.7 0.0038 KIAA1391 ( 1194 res) hh12985 (1194) 220 39.4 0.0039 KIAA1424 ( 1944 res) ha06448 (1944) 219 39.6 0.0054 KIAA0712 ( 1770 res) hg04169 (1770) 218 39.4 0.0056 KIAA1501 ( 735 res) hh12863 ( 735) 212 38.1 0.0056 KIAA0782 ( 1281 res) hk05405s1 (1281) 214 38.7 0.0065 KIAA1304 ( 1051 res) fh04032 (1051) 211 38.3 0.0074 >>KIAA1723 ( 1554 res) pf00881 (1554 aa) initn: 2424 init1: 1061 opt: 2585 Z-score: 1614.8 bits: 311.1 E(): 8e-85 Smith-Waterman score: 2669; 42.641% identity (63.835% similar) in 1189 aa overlap (56-1131:476-1552) 30 40 50 60 70 80 KIAA01 VPDGAVPPGLASCPLALCQRPNPKGWTRPPEAEAKRACEWLQATGFPQYVQLFEEGSFPL : :::.::.::.:::::::.::.:. ::. 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KIAA17 ----SEIP-ERRDSGVGASLTRSNRHRLRWHSFQSSHRPSLNSVSLQINCQSVAQMNLLQ 1010 1020 1030 1040 1050 640 650 660 670 680 690 KIAA01 KGSLLRLTAFMEKYTVPHKQGWVWSMPKFMRRNKTPDYRGQHVFGVPPLIHVQRTGQPLP : :::.:::..:::: .:.:. :..::::.: :.:::. . ::::: ..::::::::: KIAA17 KYSLLKLTALLEKYTPSNKHGFSWAVPKFMKRIKVPDYKDRSVFGVPLTVNVQRTGQPLP 1060 1070 1080 1090 1100 1110 700 710 720 730 740 750 KIAA01 QSIQQAMRYLRSQCLDQVGIFRKSGVKSRIQNLRQMNETSPDNVCYEGQSAYDVADLLKQ :::::::::::..::::::.::::::::::: :::::: . : : :::::::::::.::: KIAA17 QSIQQAMRYLRNHCLDQVGLFRKSGVKSRIQALRQMNEGAIDCVNYEGQSAYDVADMLKQ 1120 1130 1140 1150 1160 1170 760 770 780 790 800 810 KIAA01 YFRDLPEPIFTSKLTTTFLQIYQLLPKDQWLAAAQAATLLLPDENREVLQTLLYFLSDIA ::::::::..:.::. ::::::: .:::: : : .:: .:::::::::::::::::::.. 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KIAA17 LAHMIAECKKLFQVPEEM--SRCRNSYTEQELKPLTLEALGHLGNDDSA--DYQHFLQDC 1300 1310 1320 1330 1340 1350 940 950 960 970 980 990 KIAA01 IQDLLRDAAERFKGWMSVPGPQHTELACRKAPDGHPLRLWKASTEVAAPPAVVLHRVLRE .. :.... :.::::.: ...::. .:. .: :::::.. :: : : .:.:.:.: KIAA17 VDGLFKEVKEKFKGWVSYSTSEQAELSYKKVSEGPPLRLWRSVIEVPAVPEEILKRLLKE 1360 1370 1380 1390 1400 1410 1000 1010 1020 1030 1040 1050 KIAA01 RALWDEDLLRAQVLEALMPGVELYHYVTDSMAPHPCRDFVVLRMWRSDLPRGGCLLVSQS . ::: ::: ..:.: : .:.:.:: .:::::: ::.:::: ::..::.:.: :. : KIAA17 QHLWDVDLLDSKVIEILDSQTEIYQYVQNSMAPHPARDYVVLRTWRTNLPKGACALLLTS 1420 1430 1440 1450 1460 1470 1060 1070 1080 1090 1100 1110 KIAA01 LDPEQPVPESGVRALMLTSQYLMEPCGLGRSRLTHICRADLRGRSPDWYNKVFGHLCAME .: .. .: :::. .: :.::.:::: :.:.::..::.::::. :.::.: :::::: : KIAA17 VDHDR-APVVGVRVNVLLSRYLIEPCGPGKSKLTYMCRVDLRGHMPEWYTKSFGHLCAAE 1480 1490 1500 1510 1520 1530 1120 1130 KIAA01 VAKIRDSFPTLQAAGPETKL :.:::::: . .. .:: KIAA17 VVKIRDSFSNQNTETKDTKSR 1540 1550 >>KIAA0131 ( 942 res) ha01235 (942 aa) initn: 215 init1: 138 opt: 284 Z-score: 188.9 bits: 46.6 E(): 2.1e-05 Smith-Waterman score: 284; 31.551% identity (62.032% similar) in 187 aa overlap (657-836:476-661) 630 640 650 660 670 680 KIAA01 FAGQINLLHKGSLLRLTAFMEKYTVPHKQGWV-WSMPKFMR-RNKTPDYR-GQHVFGVPP :. ... ::.. :. :. . .:..:: KIAA01 GRSILAKLQAKHEKLQEALQRGDKEEQEVSWTQYTQRKFQKSRQPRPSSQYNQRLFGGDM 450 460 470 480 490 500 690 700 710 720 730 740 KIAA01 LIHVQRTGQPLPQSIQQAMRYLRSQCLDQVGIFRKSGVKSRIQNLRQMNETSPDNVCYEG .: .:::.: ... .:.. . :.. :::: ::.. :....:. : . : . :: KIAA01 EKFIQSSGQPVPLVVESCIRFINLNGLQHEGIFRVSGAQLRVSEIRDAFERGEDPLV-EG 510 520 530 540 550 560 750 760 770 780 790 800 KIAA01 QSAYD---VADLLKQYFRDLPEPIFTSKLTTTFLQIYQLLPKDQWLAAAQAATLLLPDEN .:.: :: .:: :::.: :.: : .: .: . . .. :: KIAA01 CTAHDLDSVAGVLKLYFRSLEPPLFPPDLFGELLASSELEATAERVEHVSRLLWRLPAPV 570 580 590 600 610 620 810 820 830 840 850 KIAA01 REVLQTLLYFLSDIAS-AEENQMTAGNLAVCLAPSIFHLNVSKKDSPSPRIKSKRSLIGR ::. :. ::. .:. ..::.: :::::..:... KIAA01 LVVLRYLFTFLNHLAQYSDENMMDPYNLAVCFGPTLLPVPAGQDPVALQGRVNQLVQTLI 630 640 650 660 670 680 860 870 880 890 900 910 KIAA01 PGPRDLSDNMAATQGLSHMISDCKKLFQVPQDMVLQLCSSYSAAELSPPGPALAELRQAQ KIAA01 VQPDRVFPPLTSLPGPVYEKCMAPPSASCLGDAQLESLGADNEPELEAEMPAQEDDLEGV 690 700 710 720 730 740 >>KIAA1722 ( 1499 res) pf00674s1 (1499 aa) initn: 201 init1: 117 opt: 285 Z-score: 187.6 bits: 47.0 E(): 2.5e-05 Smith-Waterman score: 297; 23.826% identity (57.383% similar) in 298 aa overlap (566-845:1121-1414) 540 550 560 570 580 590 KIAA01 PTFASSLSVEEGHSISDTVASSSELDSSGNSMNEAEAAGSLAGLQASMPRERRDSGVGAS ..:.:.. :: : .. : . : .: KIAA17 MDAVVKPRNEEENIYSVPHDSTQGKIITIRNINKAQSNGSGNGSDSEMDTSSLERGRKVS 1100 1110 1120 1130 1140 1150 600 610 620 630 640 KIAA01 L-TRP------CRKL-RWHSFQNSHRPSLNSESLEINRQFAGQINLLHKGSLLRLTAFME . ..: : .: :. :...: . ..: : .. : . .::. . .: KIAA17 IVSKPVLYRTRCTRLGRFASYRTSFSVGSDDELGPIRKKEEDQASQGYKGDNAVIP--YE 1160 1170 1180 1190 1200 650 660 670 680 690 KIAA01 KYTVPHKQGWVWSMPKFMRRNKTPDYRGQ--------HVFGVPPLIHVQRTGQPLPQSIQ :.... . :. . .. : : : . . :::: : : .:.: :. KIAA17 TDEDPRRRNILRSLRRNTKKPK-PKPRPSITKATWESNYFGVP-LTTVVTPEKPIPIFIE 1210 1220 1230 1240 1250 1260 700 710 720 730 740 750 KIAA01 QAMRYLRSQCLDQVGIFRKSGVKSRIQNL-RQMNETSPDNVCYEGQSAYDVADLLKQYFR . ..:... :. ::.: :: ::....: ::... .. . .. :: .:..: KIAA17 RCIEYIEATGLSTEGIYRVSGNKSEMESLQRQFDQDHNLDLAEKDFTVNTVAGAMKSFFS 1270 1280 1290 1300 1310 1320 760 770 780 790 800 810 KIAA01 DLPEPIFTSKLTTTFLQIYQLLPKDQWLAAAQAATLLLPDENREVLQTLLYFLSDIASAE .::.:. .. ... ... ..: : : . . .: ::.::.. .. :. .. . KIAA17 ELPDPLVPYNMQIDLVEAHKINDREQKLHALKEVLKKFPKENHEVFKYVISHLNKVSHNN 1330 1340 1350 1360 1370 1380 820 830 840 850 860 870 KIAA01 E-NQMTAGNLAVCLAPSIFHLNVSKKDSPSPRIKSKRSLIGRPGPRDLSDNMAATQGLSH . : ::. ::..:. :.... . : :. KIAA17 KVNLMTSENLSICFWPTLMRPDFSTMDALTATRTYQTIIELFIQQCPFFFYNRPITEPPG 1390 1400 1410 1420 1430 1440 >>KIAA0013 ( 1086 res) ha00450s1 (1086 aa) initn: 157 init1: 157 opt: 265 Z-score: 176.6 bits: 44.5 E(): 0.0001 Smith-Waterman score: 265; 31.282% identity (62.051% similar) in 195 aa overlap (666-854:96-285) 640 650 660 670 680 690 KIAA01 KGSLLRLTAFMEKYTVPHKQGWVWSMPKFMRRNKTPDYR-GQHVFGVP----PLIHVQRT ::..: . : ..:::: : : . KIAA00 DQRLVRLALLQHLRAFYGIKVKGVRGQCDRRRHETAATEIGGKIFGVPFNALPHSAVPEY 70 80 90 100 110 120 700 710 720 730 740 750 KIAA01 GQPLPQSIQQAMRYLRSQCLDQVGIFRKSGVKSRIQNLRQMNETSPDNVCYEGQSAYDVA :. .:. . .: :... . :.::::: :.. :. :... . : . :.: KIAA00 GH-IPSFLVDACTSLEDH-IHTEGLFRKSGSVIRLKALK--NKVDHGEGCLSSAPPCDIA 130 140 150 160 170 180 760 770 780 790 800 810 KIAA01 DLLKQYFRDLPEPIFTSKLTTTFLQIYQLLPKDQWLAAAQAATLLLPDENREVLQTLLYF ::::.::.:::::. . : ..:. :: ... :. . :: :.. .::. .. : KIAA00 GLLKQFFRELPEPILPADLHEALLKAQQLGTEEKN-KATLLLSCLLADHTVHVLRYFFNF 190 200 210 220 230 240 820 830 840 850 860 KIAA01 LSDIA-SAEENQMTAGNLAVCLAPSIFHLNVSKKDSPSPRIKSKRSLIGRPGPRDLSDNM : ... . ::.: ..:::: .::.... . ... : :. : KIAA00 LRNVSLRSSENKMDSSNLAVIFAPNLLQTSEGHEKMSSNTEKKLRLQAAVVQTLIDYASD 250 260 270 280 290 300 870 880 890 900 910 920 KIAA01 AATQGLSHMISDCKKLFQVPQDMVLQLCSSYSAAELSPPGPALAELRQAQAAGVSLSLYM KIAA00 IGRVPDFILEKIPAMLGIDGLCATPSLEGFEEGEYETPGEYKRKRRQSVGDFVSGALNKF 310 320 330 340 350 360 >>KIAA1314 ( 681 res) fh12718 (681 aa) initn: 180 init1: 67 opt: 251 Z-score: 169.8 bits: 42.6 E(): 0.00024 Smith-Waterman score: 268; 25.688% identity (60.550% similar) in 218 aa overlap (638-844:306-511) 610 620 630 640 650 660 KIAA01 FQNSHRPSLNSESLEINRQFAGQINLLHKGSLLRLTAFMEKYTVPHKQGWVWSMPKFMRR ::..::::.. . . ..: KIAA13 LTKFNVQKTRFGLTEAGDLSAEDMKKIRHLSLIELTAFFDAFGIQ------------LKR 280 290 300 310 320 670 680 690 700 710 720 KIAA01 NKTPDYRGQH--VFGVP--PLIHVQRTGQP---LPQSIQQAMRYLRSQCLDQVGIFRKSG ::: .:. .:::: :. .: .: .: .:. .. .. . :.. :::: :: KIAA13 NKTEKVKGRDNGIFGVPLTVLLDGDRKKDPGVKVPLVLQKFFEKVEESGLESEGIFRLSG 330 340 350 360 370 380 730 740 750 760 770 KIAA01 VKSRIQNLRQMNET--SPDNVCYEGQSAYDVADLLKQYFRDLPEPIFTSKLTTTFLQIYQ ..... :. .. . :. .. . ..: .:: .::.:: .: . .:..... KIAA13 CTAKVKQYREELDAKFNADKFKWDKMCHREAAVMLKAFFRELPTSLFPVEYIPAFISLME 390 400 410 420 430 440 780 790 800 810 820 830 KIAA01 LLPKDQ-WLAAAQAATLLLPDENREVLQTLLYFLSDIASAE-ENQMTAGNLAVCLAPSIF :. . . : . .. ::: ::.. :.:. :.. . . : .:.:. :... .::..: KIAA13 RGPHVKVQFQALHLMVMALPDANRDAAQALMTFFNKVIANESKNRMSLWNISTVMAPNLF 450 460 470 480 490 500 840 850 860 870 880 890 KIAA01 HLNVSKKDSPSPRIKSKRSLIGRPGPRDLSDNMAATQGLSHMISDCKKLFQVPQDMVLQL ...: KIAA13 FSRSKHSDYEELLLANTAAHIIRLMLKYQKILWKVPSFLITQVRRMNEATMLLKKQLPSV 510 520 530 540 550 560 >>KIAA1204 ( 1445 res) fg03451 (1445 aa) initn: 279 init1: 136 opt: 243 Z-score: 161.7 bits: 42.1 E(): 0.00069 Smith-Waterman score: 243; 31.902% identity (61.350% similar) in 163 aa overlap (679-836:20-180) 650 660 670 680 690 700 KIAA01 YTVPHKQGWVWSMPKFMRRNKTPDYRGQHVFGVPPLIHVQRTGQPLPQSIQQAMRYLRSQ :: ... .:: .: ... ...... 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KIAA12 ARNLALVWAPNLLRSKEIEATGCNGDAAFLAVRVQQVVIEFILNHVDQIFNNGAPGSLEN 170 180 190 200 210 220 >>KIAA0411 ( 1061 res) hg02120 (1061 aa) initn: 193 init1: 91 opt: 238 Z-score: 159.9 bits: 41.4 E(): 0.00087 Smith-Waterman score: 238; 28.387% identity (60.000% similar) in 155 aa overlap (688-838:475-628) 660 670 680 690 700 710 KIAA01 VWSMPKFMRRNKTPDYRGQHVFGVPPLIHVQRTGQPLPQSIQQAMRYLRSQCLDQVGIFR : .:: .: ... .::. :.: :::: KIAA04 KHDLLKQTLGEGERAECGTTRGRRNARTRNQDSGQAIPLVVESCIRYINLYGLQQQGIFR 450 460 470 480 490 500 720 730 740 750 760 770 KIAA01 KSGVKSRIQNLRQMNETSPDNVCYEGQSAYD---VADLLKQYFRDLPEPIFTSKLTTTFL : . ....... : . : . . :. : :: .:: ::: : .:.: .. .. 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