# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/ha04841s1.fasta.huge -Q ../query/KIAA0213.ptfa ./tmplib.23147 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0213, 1626 aa vs ./tmplib.23147 library 1985879 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.0905+/-0.0106; mu= -18.0792+/- 0.719 mean_var=458.0591+/-108.782, 0's: 0 Z-trim: 43 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.059926 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 41, opt: 29, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0204 ( 1164 res) ha02801 (1164) 531 61.8 9.8e-10 KIAA1142 ( 467 res) hh05864 ( 467) 446 54.1 8.2e-08 KIAA1901 ( 1265 res) hh03635 (1265) 458 55.5 8.2e-08 KIAA1361 ( 1005 res) fj02367 (1005) 454 55.1 8.9e-08 KIAA1264 ( 753 res) hj01058 ( 753) 446 54.3 1.2e-07 KIAA0881 ( 1064 res) hk07534 (1064) 422 52.3 6.3e-07 KIAA1995 ( 1011 res) bh00088 (1011) 421 52.2 6.4e-07 KIAA0096 ( 766 res) ha01240s1 ( 766) 408 51.0 1.1e-06 KIAA1860 ( 689 res) fh18358 ( 689) 396 49.9 2.2e-06 KIAA0968 ( 527 res) hj06483 ( 527) 391 49.4 2.4e-06 KIAA0175 ( 656 res) ha02337 ( 656) 391 49.4 2.8e-06 KIAA0551 ( 1385 res) hh00867s1 (1385) 399 50.4 3e-06 KIAA0722 ( 1066 res) hk02030s1 (1066) 373 48.1 1.2e-05 KIAA1765 ( 608 res) fj12188(revised) ( 608) 363 47.0 1.4e-05 KIAA0623 ( 1100 res) hg04615 (1100) 365 47.4 2e-05 KIAA0619 ( 1428 res) hg04117 (1428) 359 47.0 3.4e-05 KIAA1101 ( 467 res) hk08029 ( 467) 341 45.0 4.4e-05 KIAA0687 ( 1175 res) hk02992 (1175) 352 46.3 4.5e-05 KIAA1278 ( 1311 res) hg03689(revised) (1311) 352 46.3 4.8e-05 KIAA0787 ( 557 res) hk05521s1 ( 557) 340 45.0 5.4e-05 KIAA0537 ( 698 res) hg03925 ( 698) 336 44.7 8e-05 KIAA0369 ( 794 res) hh00177 ( 794) 331 44.3 0.00012 KIAA0344 ( 2066 res) hg01568 (2066) 329 44.5 0.00027 KIAA0151 ( 723 res) ha03241 ( 723) 314 42.8 0.00031 KIAA0834 ( 453 res) hj05353 ( 453) 306 41.9 0.00035 KIAA0936 ( 640 res) hh04647 ( 640) 308 42.3 0.0004 KIAA1124 ( 1760 res) fg05708 (1760) 309 42.7 0.00079 KIAA1639 ( 2584 res) af14886 (2584) 307 42.7 0.0012 KIAA0999 ( 1371 res) fj10213 (1371) 285 40.6 0.0028 KIAA1811 ( 715 res) ha06731 ( 715) 273 39.3 0.0036 KIAA0561 ( 1308 res) hh01676 (1308) 268 39.1 0.0074 >>KIAA0204 ( 1164 res) ha02801 (1164 aa) initn: 372 init1: 148 opt: 531 Z-score: 266.7 bits: 61.8 E(): 9.8e-10 Smith-Waterman score: 531; 35.616% identity (64.726% similar) in 292 aa overlap (1344-1625:31-310) 1320 1330 1340 1350 1360 1370 KIAA02 AIQKSVRLFEEKRYREMRRKNIIGQVCDTPKSYDNVMHVGLRKVTFKWQRGNKIGEGQYG :.:..: . : : :. ...:.: .: KIAA02 SLSARNSVLGGKMSFFSFRKIFKLGSEKKKKQYEHVKR-DLNPEDF-WEIIGELGDGAFG 10 20 30 40 50 1380 1390 1400 1410 1420 1430 KIAA02 KVYTCISVDTGELMAMKEIRFQPNDHKTIKETAD---ELKIFEGIKHPNLVRYFGVELHR ::: . .:. : : : : : :. .: : :. :. . :::.:. . . .. 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KIAA11 AAPAVPGPPGPRSPQR-EPQRVSHEQFRAALQLVVDPGDPRSYLDNFI------------ 160 170 180 190 200 1370 1380 1390 1400 1410 1420 KIAA02 RGNKIGEGQYGKVYTCISV--DTGELMAMKEIRFQPNDHKTIKETADELKIFEGIKHPNL :::::. : : ::.. ..:.:.:.:.. .. .... . .:. :.. .: :. KIAA11 ---KIGEGSTGIV--CIATVRSSGKLVAVKKMDLRKQQRREL--LFNEVVIMRDYQHENV 210 220 230 240 250 1430 1440 1450 1460 1470 KIAA02 VRYFGVELHREEMYIFMEYCDEGTLEE-VSRLGLQEHVIRLYSKQITIAINVLHEHGIVH :.... : .:... ::. . :.: . :.. ..:. : . :..::: .:..: KIAA11 VEMYNSYLVGDELWVVMEFLEGGALTDIVTHTRMNEEQIAAVCLAVLQALSVLHAQGVIH 260 270 280 290 300 310 1480 1490 1500 1510 1520 1530 KIAA02 RDIKGANIFLTSSGLIKLGDFGCSVKLKNNAQTMPGEVNSTLGTAAYMAPEVITRAKGEG ::::. .:.:: .: .::.::: ... .. .: . .: .:: .::::.:.: KIAA11 RDIKSDSILLTHDGRVKLSDFGFCAQV---SKEVPRR-KSLVGTPYWMAPELISRLP--- 320 330 340 350 360 1540 1550 1560 1570 1580 1590 KIAA02 HGRAADIWSLGCVVIEMVTGKRPWHEYEHNFQIMYKVGMGHKPPIPERL---SPEGKDFL .: .:::::: .::::: :. :. . : .. : :. . :: . : :: : :: KIAA11 YGPEVDIWSLGIMVIEMVDGEPPYFN-EPPLKAM-KMIRDNLPPRLKNLHKVSPSLKGFL 370 380 390 400 410 420 1600 1610 1620 KIAA02 SHCLESDPKMRWTASQLLDHSFVKVCTDEE .. : :: .: ::..:: : :. KIAA11 DRLLVRDPAQRATAAELLKHPFLAKAGPPASIVPLMRQNRTR 430 440 450 460 >>KIAA1901 ( 1265 res) hh03635 (1265 aa) initn: 386 init1: 187 opt: 458 Z-score: 232.1 bits: 55.5 E(): 8.2e-08 Smith-Waterman score: 458; 30.037% identity (65.568% similar) in 273 aa overlap (1355-1619:5-265) 1330 1340 1350 1360 1370 1380 KIAA02 KRYREMRRKNIIGQVCDTPKSYDNVMHVGLRKVTFKWQRGNKIGEGQYGKVYTCISVDTG ... :. : .:::::..::. :.. : KIAA19 RCLRKRIMEKYVRLQKIGEGSFGKAILVKSTEDG 10 20 30 1390 1400 1410 1420 1430 1440 KIAA02 ELMAMKEIRFQPNDHKTIKETADELKIFEGIKHPNLVRYFGVELHREEMYIFMEYCDEGT . ...::: .. . : .:. :. .. ..::::.:.: . .:: :.::. : KIAA19 RQYVIKEINISRMSSKEREESRREVAVLANMKHPNIVQYRESFEENGSLYIVMDYCEGGD 40 50 60 70 80 90 1450 1460 1470 1480 1490 KIAA02 LEEVSRLGLQEHVIRLYSK------QITIAINVLHEHGIVHRDIKGANIFLTSSGLIKLG : .:.. :. :. .. :: .:.. .:.. :.:::::. :::::..: ..:: KIAA19 L--FKRINAQKGVLFQEDQILDWFVQICLALKHVHDRKILHRDIKSQNIFLTKDGTVQLG 100 110 120 130 140 150 1500 1510 1520 1530 1540 1550 KIAA02 DFGCSVKLKNNAQTMPGEVNSTLGTAAYMAPEVITRAKGEGHGRAADIWSLGCVVIEMVT ::: . :..... . . .:: :..::. ... .. .:::.::::. :. : KIAA19 DFGIARVLNSTVEL----ARTCIGTPYYLSPEI---CENKPYNNKSDIWALGCVLYELCT 160 170 180 190 200 1560 1570 1580 1590 1600 1610 KIAA02 GKRPWHEYEHNFQ--IMYKVGMGHKPPIPERLSPEGKDFLSHCLESDPKMRWTASQLLDH : : .: . . .. :. : ::. . : . ....:. .. .:. : .....:.. KIAA19 LK---HAFEAGSMKNLVLKIISGSFPPVSLHYSYDLRSLVSQLFKRNPRDRPSVNSILEK 210 220 230 240 250 260 1620 KIAA02 SFVKVCTDEE .:. KIAA19 GFIAKRIEKFLSPQLIAEEFCLKTFSKFGSQPIPAKRPASGQNSISVMPAQKITKPAAKY 270 280 290 300 310 320 >>KIAA1361 ( 1005 res) fj02367 (1005 aa) initn: 381 init1: 161 opt: 454 Z-score: 231.5 bits: 55.1 E(): 8.9e-08 Smith-Waterman score: 454; 33.205% identity (64.865% similar) in 259 aa overlap (1366-1619:37-285) 1340 1350 1360 1370 1380 1390 KIAA02 IGQVCDTPKSYDNVMHVGLRKVTFKWQRGNKIGEGQYGKVYTCISVDTGELMAMKEIRFQ .::.:..: :: .: :.:..:.:.. .. KIAA13 STNRAGSLKDPEIAELFFKEDPEKLFTDLREIGHGSFGAVYFARDVRTNEVVAIKKMSYS 10 20 30 40 50 60 1400 1410 1420 1430 1440 1450 KIAA02 PNDH-KTIKETADELKIFEGIKHPNLVRYFGVELHREEMYIFMEYC--DEGTLEEVSRLG .. . .. :.:... ::::: ..: : :... .. :::: . . : :: . KIAA13 GKQSTEKWQDIIKEVKFLQRIKHPNSIEYKGCYLREHTAWLVMEYCLGSASDLLEVHKKP 70 80 90 100 110 120 1460 1470 1480 1490 1500 1510 KIAA02 LQEHVIRLYSKQITIAINVLHEHGIVHRDIKGANIFLTSSGLIKLGDFGCSVKLKNNAQT ::: : .. .. :: : ..:::::..::.:: : .::.::: . . KIAA13 LQEVEIAAITHGALQGLAYLHSHTMIHRDIKAGNILLTEPGQVKLADFGSA--------S 130 140 150 160 170 1520 1530 1540 1550 1560 1570 KIAA02 MPGEVNSTLGTAAYMAPEVITRA-KGEGHGRAADIWSLGCVVIEMVTGKRPWHEYEHNFQ : . .:: .:: .:::::: .:. :.. :.:::: . ::.. : : .. . .. KIAA13 MASPANSFVGTPYWMAPEVILAMDEGQYDGKV-DVWSLGITCIELAERKPPLFNM-NAMS 180 190 200 210 220 230 1580 1590 1600 1610 1620 KIAA02 IMYKVGMGHKPPIP-ERLSPEGKDFLSHCLESDPKMRWTASQLLDHSFVKVCTDEE .:.......: . .. : ..:.. ::.. :. : :. .:: : :: KIAA13 ALYHIAQNESPTLQSNEWSDYFRNFVDSCLQKIPQDRPTSEELLKHIFVLRERPETVLID 240 250 260 270 280 290 KIAA13 LIQRTKDAVRELDNLQYRKMKKLLFQEAHNGPAVEAQEEEEEQDHGVGRTGTVNSVGSNQ 300 310 320 330 340 350 >>KIAA1264 ( 753 res) hj01058 (753 aa) initn: 307 init1: 140 opt: 446 Z-score: 229.4 bits: 54.3 E(): 1.2e-07 Smith-Waterman score: 446; 33.716% identity (66.667% similar) in 261 aa overlap (1366-1621:488-736) 1340 1350 1360 1370 1380 1390 KIAA02 IGQVCDTPKSYDNVMHVGLRKVTFKWQRGNKIGEGQYGKVYTCISVD--TGELMAMKEIR :::::. : : ::... ::. .:.:.. KIAA12 PSRVSHEQFRAALQLVVSPGDPREYLANFIKIGEGSTGIV--CIATEKHTGKQVAVKKMD 460 470 480 490 500 510 1400 1410 1420 1430 1440 1450 KIAA02 FQPNDHKTIKETADELKIFEGIKHPNLVRYFGVELHREEMYIFMEYCDEGTLEE-VSRLG .. .... . .:. :.. .: :.: ... : .:... ::. . :.: . :.. KIAA12 LRKQQRREL--LFNEVVIMRDYHHDNVVDMYSSYLVGDELWVVMEFLEGGALTDIVTHTR 520 530 540 550 560 570 1460 1470 1480 1490 1500 1510 KIAA02 LQEHVIRLYSKQITIAINVLHEHGIVHRDIKGANIFLTSSGLIKLGDFGCSVKLKNNAQT ..:. : .. :.. ::..:..:::::. .:.:::.: :::.::: ... .. KIAA12 MNEEQIATVCLSVLRALSYLHNQGVIHRDIKSDSILLTSDGRIKLSDFGFCAQV---SKE 580 590 600 610 620 630 1520 1530 1540 1550 1560 1570 KIAA02 MPGEVNSTLGTAAYMAPEVITRAKGEGHGRAADIWSLGCVVIEMVTGKRPWHEYEHNFQI .: . .: .:: .::::::.: .: .:::::: .::::. :. :. . : .: KIAA12 VP-KRKSLVGTPYWMAPEVISRLP---YGTEVDIWSLGIMVIEMIDGEPPYFN-EPPLQA 640 650 660 670 680 1580 1590 1600 1610 1620 KIAA02 MYKVGMGHKPPIPE--RLSPEGKDFLSHCLESDPKMRWTASQLLDHSFVKVCTDEE : .. . : . . ..: . ::. : .:..: ::..:: : :.:. KIAA12 MRRIRDSLPPRVKDLHKVSSVLRGFLDLMLVREPSQRATAQELLGHPFLKLAGPPSCIVP 690 700 710 720 730 740 KIAA12 LMRQYRHH 750 >>KIAA0881 ( 1064 res) hk07534 (1064 aa) initn: 291 init1: 159 opt: 422 Z-score: 216.2 bits: 52.3 E(): 6.3e-07 Smith-Waterman score: 449; 32.046% identity (65.637% similar) in 259 aa overlap (1366-1619:48-296) 1340 1350 1360 1370 1380 1390 KIAA02 IGQVCDTPKSYDNVMHVGLRKVTFKWQRGNKIGEGQYGKVYTCISVDTGELMAMKEIRFQ .::.:..: :: .: ..:..:.:.. .. KIAA08 AGGRAGSLKDPDVAELFFKDDPEKLFSDLREIGHGSFGAVYFARDVRNSEVVAIKKMSYS 20 30 40 50 60 70 1400 1410 1420 1430 1440 1450 KIAA02 -PNDHKTIKETADELKIFEGIKHPNLVRYFGVELHREEMYIFMEYC--DEGTLEEVSRLG .... .. :..... ..::: ..: : :... .. :::: . . : :: . KIAA08 GKQSNEKWQDIIKEVRFLQKLRHPNTIQYRGCYLREHTAWLVMEYCLGSASDLLEVHKKP 80 90 100 110 120 130 1460 1470 1480 1490 1500 1510 KIAA02 LQEHVIRLYSKQITIAINVLHEHGIVHRDIKGANIFLTSSGLIKLGDFGCSVKLKNNAQT ::: : .. .. :: :...:::.:..::.:. ::.:::::: .:. KIAA08 LQEVEIAAVTHGALQGLAYLHSHNMIHRDVKAGNILLSEPGLVKLGDFG-------SASI 140 150 160 170 180 190 1520 1530 1540 1550 1560 1570 KIAA02 MPGEVNSTLGTAAYMAPEVITRA-KGEGHGRAADIWSLGCVVIEMVTGKRPWHEYEHNFQ : . .:: .:: .:::::: .:. :.. :.:::: . ::.. : : .. . .. KIAA08 M-APANSFVGTPYWMAPEVILAMDEGQYDGKV-DVWSLGITCIELAERKPPLFNM-NAMS 200 210 220 230 240 1580 1590 1600 1610 1620 KIAA02 IMYKVGMGHKPPIPE-RLSPEGKDFLSHCLESDPKMRWTASQLLDHSFVKVCTDEE .:.......: . . : ..:.. ::.. :. : :. :: : :: KIAA08 ALYHIAQNESPVLQSGHWSEYFRNFVDSCLQKIPQDRPTSEVLLKHRFVLRERPPTVIMD 250 260 270 280 290 300 KIAA08 LIQRTKDAVRELDNLQYRKMKKILFQEAPNGPGAEAPEEEEEAEPYMHRAGTLTSLESSH 310 320 330 340 350 360 >>KIAA1995 ( 1011 res) bh00088 (1011 aa) initn: 325 init1: 163 opt: 421 Z-score: 216.1 bits: 52.2 E(): 6.4e-07 Smith-Waterman score: 421; 30.385% identity (65.385% similar) in 260 aa overlap (1367-1620:90-341) 1340 1350 1360 1370 1380 1390 KIAA02 GQVCDTPKSYDNVMHVGLRKVTFKWQRGNKIGEGQYGKVYTCISVDTGELMAMKEIRFQP .:.: .:.. .. :.. ::. . KIAA19 SSPGPSASQGPRAGGGAAEQEELHYIPIRVLGRGAFGEATLYRRTEDDSLVVWKEVDLTR 60 70 80 90 100 110 1400 1410 1420 1430 1440 1450 KIAA02 NDHKTIKETADELKIFEGIKHPNLVRYFGVELHREEMYIFMEYCDEGTL-EEVSRLG--- ..: ... .:. :. ..: :.. :.. . . : .:::. :.: ... : KIAA19 LSEKERRDALNEIVILALLQHDNIIAYYNHFMDNTTLLIELEYCNGGNLYDKILRQKDKL 120 130 140 150 160 170 1460 1470 1480 1490 1500 1510 KIAA02 LQEHVIRLYSKQITIAINVLHEHGIVHRDIKGANIFLTSSGLIKLGDFGCSVKLKNNAQT ..:... : ::. :.. .:. ::.::::: :::::...::::::.: . :: :. . KIAA19 FEEEMVVWYLFQIVSAVSCIHKAGILHRDIKTLNIFLTKANLIKLGDYGLAKKL-NSEYS 180 190 200 210 220 230 1520 1530 1540 1550 1560 1570 KIAA02 MPGEVNSTLGTAAYMAPEVITRAKGEGHGRAADIWSLGCVVIEMVTGKRPWHEYEHNFQI : ... .:: ::.::. .: .. .:::..:::..:..: :: . . . ... KIAA19 M---AETLVGTPYYMSPEL---CQGVKYNFKSDIWAVGCVIFELLTLKRTF-DATNPLNL 240 250 260 270 280 290 1580 1590 1600 1610 1620 KIAA02 MYKVGMGHKPPIPE--RLSPEGKDFLSHCLESDPKMRWTASQLLDHSFVKVCTDEE :. .: . . . : : ... ::..::..: ::..:::. ... 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KIAA00 TLTMI-MDCKYTVPSHVSKECKDLITRMLQRDPKRRASLEEIENHPWLQGVDPSPATKYN 230 240 250 260 270 280 KIAA00 IPLVSYKNLSEEEHNSIIQRMVLGDIADRDAIVEALETNRYNHITATYFLLAERILREKQ 290 300 310 320 330 340 >>KIAA1860 ( 689 res) fh18358 (689 aa) initn: 353 init1: 144 opt: 396 Z-score: 206.6 bits: 49.9 E(): 2.2e-06 Smith-Waterman score: 396; 29.183% identity (62.257% similar) in 257 aa overlap (1367-1621:66-313) 1340 1350 1360 1370 1380 1390 KIAA02 GQVCDTPKSYDNVMHVGLRKVTFKWQRGNKIGEGQYGKVYTCISVDTGELMAMKEIRFQP ::.:...:: . ::. .:.: : KIAA18 SRSLGARCRNSIASCPEEQPHVGNYRLLRTIGKGNFAKVKLARHILTGREVAIKIIDKTQ 40 50 60 70 80 90 1400 1410 1420 1430 1440 1450 KIAA02 NDHKTIKETADELKIFEGIKHPNLVRYFGVELHREEMYIFMEYCDEGTLEE--VSRLGLQ . ..... :..:..:..:::.:. : : .. .:. ::: . : . . ::. .. KIAA18 LNPSSLQKLFREVRIMKGLNHPNIVKLFEVIETEKTLYLVMEYASAGEVFDYLVSHGRMK 100 110 120 130 140 150 1460 1470 1480 1490 1500 1510 KIAA02 EHVIRLYSKQITIAINVLHEHGIVHRDIKGANIFLTSSGLIKLGDFGCSVKLKNNAQTMP :. : .::. :.. :...:::::.:. :..: . . ::..::: : : :. 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KIAA09 GAEQQRLSPGPPVPSLTCLPSARMATITCTRFTEEYQLFEELGKGAFSVVRRCVKVLAGQ 30 40 50 60 70 80 1390 1400 1410 1420 1430 1440 KIAA02 LMAMKEI---RFQPNDHKTIKETADELKIFEGIKHPNLVRYFGVELHREEMYIFMEYCDE .: : : ... ::. ... : .: . .::::.:: .. . :.... KIAA09 EYAAKIINTKKLSARDHQKLER---EARICRLLKHPNIVRLHDSISEEGHHYLIFDLVTG 90 100 110 120 130 140 1450 1460 1470 1480 1490 KIAA02 GTLEE--VSRLGLQEHVIRLYSKQITIAINVLHEHGIVHRDIKGANIFLTSS---GLIKL : : : :.: .: .:: :. :. :.::::.: :..:.:. . .:: KIAA09 GELFEDIVAREYYSEADASHCIQQILEAVLHCHQMGVVHRDLKPENLLLASKLKGAAVKL 150 160 170 180 190 200 1500 1510 1520 1530 1540 1550 KIAA02 GDFGCSVKLKNNAQTMPGEVNSTLGTAAYMAPEVITRAKGEGHGRAADIWSLGCVVIEMV .::: ....... :. : . :: .:..:::. . . .:. .:.:. : .. .. 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