# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/ha02776.fasta.huge -Q ../query/KIAA0215.ptfa ./tmplib.23147 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0215, 857 aa vs ./tmplib.23147 library 1986648 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0018+/-0.00606; mu= 12.8045+/- 0.412 mean_var=147.0165+/-35.233, 0's: 0 Z-trim: 11 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.105777 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0239 ( 849 res) ha06313 ( 849) 1820 289.9 7.9e-79 KIAA1807 ( 702 res) fk00712 ( 702) 1305 211.2 3.2e-55 KIAA1286 ( 1214 res) hh11961(revised) (1214) 647 111.1 7.6e-25 KIAA0876 ( 1119 res) hh03683 (1119) 387 71.4 6.4e-13 KIAA0780 ( 1100 res) hk05362 (1100) 385 71.1 7.8e-13 KIAA0677 ( 1073 res) hk02635 (1073) 360 67.2 1.1e-11 KIAA0304 ( 2415 res) af07172 (2415) 189 41.6 0.0013 >>KIAA0239 ( 849 res) ha06313 (849 aa) initn: 2148 init1: 1273 opt: 1820 Z-score: 1507.1 bits: 289.9 E(): 7.9e-79 Smith-Waterman score: 2088; 42.790% identity (65.839% similar) in 846 aa overlap (1-820:22-831) 10 20 30 KIAA02 GGGYHSDRTHPAH----C--RAAAWSRAGAASQLREGCS ::: .. . :: : . .: :: . : KIAA02 LLLARSLSLLLAACSRKPARRGGGCTAQGREIAHVGQSCFKEYSAGRLRGAHATTTFGRM 10 20 30 40 50 60 40 50 60 70 80 KIAA02 RMKRHRPVSSSDSSDESPSTSFTSGSMYRIKSKIPN---------EHKKPAEVFRKDLIS . ::.. :::.:: . : . :: : : ::.:. ..:::.:::: :::. KIAA02 EEKRRKYSISSDNSDTTDSHA-TSTSASRC-SKLPSSTKSGWPRQNEKKPSEVFRTDLIT 70 80 90 100 110 90 100 110 120 130 140 KIAA02 AMKLPDSHHINPDSYYLFADTWKEEWEKGVQVPASPDTVPQPSLRIIAEKVKDVLFIRPR :::.:::....::.::..:: :..::::::::::. ...:.: .::. : : KIAA02 AMKIPDSYQLSPDDYYILADPWRQEWEKGVQVPAGAEAIPEPVVRILPP-----LEGPPA 120 130 140 150 160 170 150 160 170 180 190 200 KIAA02 KYIHCSSPDTTEPGYINIMELAASVCRYDLDDMDIFWLQELNEDLAEMGCGPVDENLMEK . .::..: : . . .. :::::..: .::. .: .: :: .:: .:. KIAA02 Q----ASPSSTMLGEGSQPDWPGG-SRYDLDEIDAYWLELINSELKEMERPELDELTLER 180 190 200 210 220 210 220 230 240 250 260 KIAA02 TVEVLERHCHENMNHAIETEEGLGIEYDEDVICDVCRSPDSEEGNDMVFCDKCNVCVHQA ..: :: ::.:: .::::.:::::::::::.:::::::..:.::.:::::::::::::: KIAA02 VLEELETLCHQNMARAIETQEGLGIEYDEDVVCDVCRSPEGEDGNEMVFCDKCNVCVHQA 230 240 250 260 270 280 270 280 290 300 310 320 KIAA02 CYGILKVPEGSWLCRSCVLGIYPQCVLCPKKGGALKTTKTGTKWAHVSCALWIPEVSIAC :::::::: ::::::.:.::. :.:.::::.::::: :..::::.:::::::::::::.: KIAA02 CYGILKVPTGSWLCRTCALGVQPKCLLCPKRGGALKPTRSGTKWVHVSCALWIPEVSIGC 290 300 310 320 330 340 330 340 350 360 370 380 KIAA02 PERMEPITKISHIPPSRWALVCNLCKLKTGACIQCSIKSCITAFHVTCAFEHGLEMKTIL ::.::::::::::: ::::: :.::: ::.:::::. ::. ::::::::.:::::.::: KIAA02 PEKMEPITKISHIPASRWALSCSLCKECTGTCIQCSMPSCVIAFHVTCAFDHGLEMRTIL 350 360 370 380 390 400 390 400 410 420 430 440 KIAA02 DEGDEVKFKSYCLKHSQNRQKLGEAEYPHHRAKEQSQAKS--EKTSLRAQKLRELEEEFY ..:::::::.: .::.. : . : . : ::: ::..:: :.:..:::.:: KIAA02 ADNDEVKFKSFCQEHSDG----GPRNEPTSEPTEPSQAGEDLEKVTLRKQRLQQLEEDFY 410 420 430 440 450 460 450 460 470 480 490 500 KIAA02 SLVRVEDVAAELGMPTLAVDFIYNYWKLKRKSNFNKPLFPPKEDEENGLVQPKEESIHTR ::. .:: .: . :::::.:::::::.: :.::. :: :: ..:.: ... .. : KIAA02 ELVEPAEVAERLDLAEALVDFIYQYWKLKRKANANQPLLTPKTDEVDNLAQQEQDVLYRR 470 480 490 500 510 520 510 520 530 540 550 560 KIAA02 MRMFMHLRQDLERVRNLCYMISRREKLKLSHNKIQEQIFGLQVQLLNQEIDAGLPLTNAL ...: :::::::::::::::..:::. : . :.::::: ::..:..:.. :: . . KIAA02 LKLFTHLRQDLERVRNLCYMVTRRERTKHAICKLQEQIFHLQMKLIEQDLCRGLSTSFPI 530 540 550 560 570 580 570 580 590 600 610 620 KIAA02 ENSLFYPPPRITLKLKMPKSTPEDHRNSSTETDQQPHSPDSSSSVHSIRNMQVPQESLEM ....: .... : :. : .. : : . .. : . .: .:.: KIAA02 DGTFFNSWLAQSVQI-----TAENMAMSEWPLNNG-HREDPAPGLLSEELLQ-DEETLL- 590 600 610 620 630 630 640 650 660 670 KIAA02 RTKSYPRYPLESKNNRLLASLSHSRSEAKESSPA---WRTPSSECYHGQSLGKPLVLQAA :. : : .. . ...: ::.. : :.:. .. : : : KIAA02 ---SFMRDPSLRPGDPARKARGRTRLPAKKKPPPPPPQDGPGSRTTPDKA-PKKTWGQDA 640 650 660 670 680 690 680 690 700 710 720 730 KIAA02 LHGQSSIGNGKSQPNSKFAKSNGLEGS-WSGN--VTQKDSSSEMFCDQEPVFSPHLVSQG :... : .: . :. : .: .:. . : . . : . ..... KIAA02 GSGKGGQGPPTRKPPRR--TSSHLPSSPAAGDCPILATPESPPPLAPETPDEAASVAADS 700 710 720 730 740 750 740 750 760 770 780 790 KIAA02 SFRKSTVEHFSRSF-KETTNRWVKNTEDLQCYVKPTKNMSPKEQFWGRQVLRRSAGRAPY . . . . . : : :. : ..: .:.: : .: . KIAA02 DVQVPGPAASPKPLGRLRPPRESKVTRRLPG-ARPDAGMGPPSA-----VAERPKVSLHF 760 770 780 790 800 800 810 820 830 840 850 KIAA02 Q-ENDGYCPDLELSDSEAES-DGNKEKVRVRKDSSDRENPPHDSRRDCHGKSKTHPLSHS . :.::: : :.:::..:. ::. .. KIAA02 DTETDGYFSDGEMSDSDVEAEDGGVQRGPREAGAEEVVRMGVLAS 810 820 830 840 >>KIAA1807 ( 702 res) fk00712 (702 aa) initn: 1935 init1: 1301 opt: 1305 Z-score: 1083.3 bits: 211.2 E(): 3.2e-55 Smith-Waterman score: 1831; 45.101% identity (69.020% similar) in 694 aa overlap (172-818:1-680) 150 160 170 180 190 200 KIAA02 RPRKYIHCSSPDTTEPGYINIMELAASVCRYDLDDMDIFWLQELNEDLAEMGCGPVDENL :::.::: ::. ::.. ::: .:: KIAA18 YDLNDMDAAWLELTNEEFKEMGMPELDEYT 10 20 30 210 220 230 240 250 260 KIAA02 MEKTVEVLERHCHENMNHAIETEEGLGIEYDEDVICDVCRSPDSEEGNDMVFCDKCNVCV ::...: .:..:..::::::::::::::::::::.::::.:::.:.::.::::::::.:: KIAA18 MERVLEEFEQRCYDNMNHAIETEEGLGIEYDEDVVCDVCQSPDGEDGNEMVFCDKCNICV 40 50 60 70 80 90 270 280 290 300 310 320 KIAA02 HQACYGILKVPEGSWLCRSCVLGIYPQCVLCPKKGGALKTTKTGTKWAHVSCALWIPEVS ::::::::::::::::::.:.::. :.:.::::::::.: :..::::.:::::::::::: KIAA18 HQACYGILKVPEGSWLCRTCALGVQPKCLLCPKKGGAMKPTRSGTKWVHVSCALWIPEVS 100 110 120 130 140 150 330 340 350 360 370 380 KIAA02 IACPERMEPITKISHIPPSRWALVCNLCKLKTGACIQCSIKSCITAFHVTCAFEHGLEMK :. ::.::::::.:::: :::::::.::. : :: ::::.:.: :::::::::..::::: KIAA18 IGSPEKMEPITKVSHIPSSRWALVCSLCNEKFGASIQCSVKNCRTAFHVTCAFDRGLEMK 160 170 180 190 200 210 390 400 410 420 KIAA02 TILDEGDEVKFKSYCLKHSQNRQ---KLGEAEYPHHRAKE--------------QSQAKS ::: :.::::::::: :::..:. .::.. .. : : :.. .. KIAA18 TILAENDEVKFKSYCPKHSSHRKPEESLGKGAAQENGAPECSPRNPLEPFASLEQNREEA 220 230 240 250 260 270 430 440 450 460 470 480 KIAA02 EKTSLRAQKLRELEEEFYSLVRVEDVAAELGMPTLAVDFIYNYWKLKRKSNFNKPLFPPK ...:.: :::..::.:::..: . ::: : .: .:::.:.::::::: ::::::. :: KIAA18 HRVSVRKQKLQQLEDEFYTFVNLLDVARALRLPEEVVDFLYQYWKLKRKVNFNKPLITPK 280 290 300 310 320 330 490 500 510 520 530 540 KIAA02 EDEENGLVQPKEESIHTRMRMFMHLRQDLERVRNLCYMISRREKLKLSHNKIQEQIFGLQ .:::..:.. ... . :...: :::::::::::: ::..::::.: : :.:::::.: KIAA18 KDEEDNLAKREQDVLFRRLQLFTHLRQDLERVRNLTYMVTRREKIKRSVCKVQEQIFNLY 340 350 360 370 380 390 550 560 570 580 590 600 KIAA02 VQLLNQEIDAGLPLT---NALENSLFYPPPRITLKLKMPKSTPEDHRNSSTETDQQPHSP ..::.:: .:.: . ..::: :.. : . :: :: . :. .: KIAA18 TKLLEQERVSGVPSSCSSSSLENMLLFNSPSVGP--DAPKI--EDLKWHSAFFRKQM--- 400 410 420 430 440 610 620 630 640 650 KIAA02 DSSSSVHSIR--NMQVP-QESLEMRTKSYPRYP-LESKNNRLLA-----SLSHSRSEAKE ..: :::.. . . : :.: . :. . : : .. . ... .: .. .::. KIAA18 -GTSLVHSLKKPHKRDPLQNSPGSEGKTLLKQPDLCGRREGMVVPESFLGLEKTFAEARL 450 460 470 480 490 500 660 670 680 690 KIAA02 SSPAWRTPSSECYHGQSLGKPL---VLQAALHGQSSIGNGK-------SQ---PNSKFAK : .. ::. . . .... :. .: . : :: :.. : KIAA18 ISAQQKNGVVMPDHGKRRDNRFHCDLIKGDLKDKSFKQSHKPLRSTDVSQRHLDNTRAAT 510 520 530 540 550 560 700 710 720 730 740 750 KIAA02 SNGLEGSWSGNVTQKDSSSEMFCDQEPV---FSPHLVSQGSFRKSTVEHFS--RSFKETT : :. : : :.:. . :. . .. :. . : :.... : :. KIAA18 SPGVGQSAPG--TRKEIVPK--CNGSLIKVNYNQTAVKVPTTPASPVKNWGGFRIPKKGE 570 580 590 600 610 760 770 780 790 800 810 KIAA02 NRWVKNTEDLQCYVKPTKNMSPKEQFWGRQVLRRSAGRAPYQENDGYCPDLELSDSEAES . ...: :. . . . ... : .. .::::: ::.:.::::.:. KIAA18 RQQQGEAHDGACHQHSDYPYLGLGRVPAKE--RAKSKLKSDNENDGYVPDVEMSDSESEA 620 630 640 650 660 670 820 830 840 850 KIAA02 DGNKEKVRVRKDSSDRENPPHDSRRDCHGKSKTHPLSHSSMQR . .: KIAA18 SEKKCIHTSSTISRRTDIIRRSILAS 680 690 700 >>KIAA1286 ( 1214 res) hh11961(revised) (1214 aa) initn: 740 init1: 227 opt: 647 Z-score: 537.9 bits: 111.1 E(): 7.6e-25 Smith-Waterman score: 740; 31.731% identity (55.192% similar) in 520 aa overlap (123-571:123-626) 100 110 120 130 140 150 KIAA02 HINPDSYYLFADTWKEEWEKGVQVPASPDTVPQPSLRIIAEKVKDVLFIRPRKYI-HCSS .::::.:.. .. : : . . KIAA12 PQFPGKSKKPSSKGKKKESCSKHASGTSFHLPQPSFRMVDSGIQPEAPPLPAAYYRYIEK 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 KIAA02 PDTTEPGYINIMELAASVCRYDLDDMDIFWLQELNEDLAEMGCGPVDENLMEKTVEVLER : : .: : : .::.:. :. ::. .:: : . :. . .: :. ::. KIAA12 P----P-----EDLDAEV-EYDMDEEDLAWLDMVNEKRRVDGHSLVSADTFELLVDRLEK 160 170 180 190 200 220 230 240 250 260 270 KIAA02 HCHENMNHAIETEEGLGIEYDEDVICDVCRSPDSEEGNDMVFCDKCNVCVHQACYGILKV . . . ... ....: :::..: :: . . ...: ..::: ::. ::: :::. . KIAA12 ESYLE-SRSSGAQQSL---IDEDAFCCVCLDDECHNSNVILFCDICNLAVHQECYGVPYI 210 220 230 240 250 280 290 300 310 320 KIAA02 PEGSWLCRSCVLGI-YP-QCVLCPKKGGALKTTKTGTKWAHVSCALWIPEVSIACPERME :::.:::: :. . : .:.:::.::::.: :. : .:::: ::.::::: .: .: KIAA12 PEGQWLCRCCLQSPSRPVDCILCPNKGGAFKQTSDG-HWAHVVCAIWIPEVCFANTVFLE 260 270 280 290 300 310 330 340 350 360 370 380 KIAA02 PITKISHIPPSRWALVCNLCKLK-TGACIQCSIKSCITAFHVTCAFEHGLEMK------T :: :..:::.:: :.: .:: : :: ::: .: :::::::: . :: :: : KIAA12 PIEGIDNIPPARWKLTCYICKQKGLGAAIQCHKVNCYTAFHVTCAQRAGLFMKIEPMRET 320 330 340 350 360 370 390 400 410 KIAA02 ILDEGD--EVKFKSYCLKHSQ-----NRQKL-------------------GEAEYPHHRA :. : :. .:: :: :.: :: : .. KIAA12 SLN-GTIFTVRKTAYCEAHSPPGAATARRKGDSPRSISETGDEEGLKEGDGEEEEEEEVE 380 390 400 410 420 430 420 430 440 450 460 KIAA02 KEQSQA------------KSEKTSLRAQKLRELEEEFYSLVRVEDVAAELGMPTLAVDFI .:...: :. : ::. . .: :: . . . : .:. .. : KIAA12 EEEQEAQGGVSGSLKGVPKKSKMSLKQKIKKEPEEAGQDTPSTLPMLAVPQIPSYRLNKI 440 450 460 470 480 490 470 480 490 500 KIAA02 ----------------YNYWKLKRKSNFNKPL-------FPPKEDEENGLVQPKEESIHT .::: :::.. . :: . ... :. . : ... KIAA12 CSGLSFQRKNQFMQRLHNYWLLKRQARNGVPLIRRLHSHLQSQRNAEQREQDEKTSAVKE 500 510 520 530 540 550 510 520 530 540 550 560 KIAA02 RMRMFMHLRQDLERVRNLCYMISRREKLKLSHNKIQEQIFGLQVQLLNQEIDAGLPLTNA .......::.::::.: : .: .::::: . :.:. . :... .: . . : : . KIAA12 ELKYWQKLRHDLERARLLIELIRKREKLKREQVKVQQAAMELELMPFNVLLRTTLDLLQE 560 570 580 590 600 610 570 580 590 600 610 620 KIAA02 LENSLFYPPPRITLKLKMPKSTPEDHRNSSTETDQQPHSPDSSSSVHSIRNMQVPQESLE . . .. : KIAA12 KDPAHIFAEPVNLSEVPDYLEFISKPMDFSTMRRKLESHLYRTLEEFEEDFNLIVTNCMK 620 630 640 650 660 670 >>KIAA0876 ( 1119 res) hh03683 (1119 aa) initn: 325 init1: 127 opt: 387 Z-score: 323.9 bits: 71.4 E(): 6.4e-13 Smith-Waterman score: 387; 40.120% identity (57.485% similar) in 167 aa overlap (244-399:769-929) 220 230 240 250 260 KIAA02 HENMNHAIETEEGLGIEYDEDVICDVCRSPDSEEGND----MVFCDKCNVCVHQACYGIL .: :.: .. : :: . :: .:::: KIAA08 LPSKSRQKTRPLIPEMCFTSGGENTEPLPANSYIGDDGTSPLIACGKCCLQVHASCYGIR 740 750 760 770 780 790 270 280 290 300 310 320 KIAA02 K--VPEGSWLCRSCVLGIYP-QCVLCPKKGGALKTTKTGTKWAHVSCALWIPEVSIACPE : :: : : :. . .: :: .::::. : : .: :: ::. .::. . KIAA08 PELVNEG-WTCSRCAAHAWTAECCLCNLRGGALQMT-TDRRWIHVICAIAVPEARFLNVI 800 810 820 830 840 850 330 340 350 360 370 380 KIAA02 RMEPITKISHIPPSRWALVCNLCKLK----TGACIQCSIKSCITAFHVTCAFEHGLEMKT . .:. :: :: .:: : : :. . .::::::: . : :.:::::: :. :. KIAA08 ERHPVD-ISAIPEQRWKLKCVYCRKRMKKVSGACIQCSYEHCSTSFHVTCAHAAGVLMEP 860 870 880 890 900 910 390 400 410 420 430 440 KIAA02 ILDEGDEVKFKSYCLKHSQNRQKLGEAEYPHHRAKEQSQAKSEKTSLRAQKLRELEEEFY :. : . :::: KIAA08 --DDWPYV-VSITCLKHKSGGHAVQLLRAVSLGQVVITKNRNGLYYRCRVIGAASQTCYE 920 930 940 950 960 970 >>KIAA0780 ( 1100 res) hk05362 (1100 aa) initn: 270 init1: 119 opt: 385 Z-score: 322.3 bits: 71.1 E(): 7.8e-13 Smith-Waterman score: 385; 40.361% identity (63.253% similar) in 166 aa overlap (246-402:762-920) 220 230 240 250 260 270 KIAA02 NMNHAIETEEGLGIEYDEDVICDVCRSPDSEEGNDMVF-CDKCNVCVHQACYGI--LKVP :.:..... : :: : :: .:::: .. KIAA07 EGKTKPLIPEMCFIYSEENIEYSPPNAFLEEDGTSLLISCAKCCVRVHASCYGIPSHEIC 740 750 760 770 780 790 280 290 300 310 320 330 KIAA02 EGSWLCRSCVLGIYP-QCVLCPKKGGALKTTKTGTKWAHVSCALWIPEVSIA-CPERMEP .: ::: : . . .: :: .::::: ::.. ::::: ::. .::: .. ::: . KIAA07 DG-WLCARCKRNAWTAECCLCNLRGGALKQTKNN-KWAHVMCAVAVPEVRFTNVPERTQ- 800 810 820 830 840 340 350 360 370 380 KIAA02 ITKISHIPPSRWALVCNLCKLK----TGACIQCSIKSCITAFHVTCAFEHGLEMKTILDE ...:: .: : : .:. . .::::::: : ..:::::: :. :. :. 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