# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/ha02776.fasta.nr -Q ../query/KIAA0215.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0215, 857 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7824044 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1997+/-0.000189; mu= 13.6104+/- 0.011 mean_var=82.9561+/-16.152, 0's: 42 Z-trim: 53 B-trim: 905 in 1/67 Lambda= 0.140815 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|109130629|ref|XP_001100171.1| PREDICTED: PHD fi ( 938) 5872 1203.4 0 gi|34098663|sp|Q92613.1|JADE3_HUMAN RecName: Full= ( 823) 5667 1161.7 0 gi|158255876|dbj|BAF83909.1| unnamed protein produ ( 823) 5659 1160.1 0 gi|149744467|ref|XP_001491347.1| PREDICTED: PHD fi ( 824) 5173 1061.3 0 gi|57111725|ref|XP_538010.1| PREDICTED: similar to ( 823) 5116 1049.7 0 gi|109511472|ref|XP_001056752.1| PREDICTED: simila ( 824) 4777 980.9 0 gi|81891667|sp|Q6IE82.1|JADE3_MOUSE RecName: Full= ( 823) 4698 964.8 0 gi|123121965|emb|CAM21272.1| PHD finger protein 16 ( 824) 4698 964.8 0 gi|119923239|ref|XP_583146.3| PREDICTED: similar t ( 785) 4632 951.4 0 gi|126337132|ref|XP_001365577.1| PREDICTED: simila ( 820) 4207 865.1 0 gi|116248179|sp|Q0P4S5.1|JADE3_XENTR RecName: Full ( 817) 3761 774.5 0 gi|82188675|sp|Q7ZVP1.1|JADE3_DANRE RecName: Full= ( 795) 2894 598.3 4.1e-168 gi|114158604|ref|NP_001041504.1| Jade3 protein [Ta ( 790) 2790 577.2 9.4e-162 gi|109510415|ref|XP_234528.4| PREDICTED: similar t ( 542) 2651 548.8 2.3e-153 gi|118097582|ref|XP_414632.2| PREDICTED: similar t ( 797) 2129 442.9 2.5e-121 gi|73970748|ref|XP_862088.1| PREDICTED: similar to ( 791) 2106 438.2 6.4e-120 gi|73970744|ref|XP_862030.1| PREDICTED: similar to ( 788) 2091 435.2 5.3e-119 gi|73970746|ref|XP_862056.1| PREDICTED: similar to ( 792) 2088 434.6 8e-119 gi|73970754|ref|XP_862165.1| PREDICTED: similar to ( 788) 2076 432.1 4.3e-118 gi|67678113|gb|AAH97813.1| LOC733278 protein [Xeno ( 544) 2072 431.2 5.8e-118 gi|210111929|gb|EEA59717.1| hypothetical protein B ( 578) 2012 419.0 2.8e-114 gi|90079213|dbj|BAE89286.1| unnamed protein produc ( 279) 1874 390.7 4.6e-106 gi|212516969|gb|EEB18923.1| PHD finger protein, pu (2563) 1883 393.4 6.5e-106 gi|126290186|ref|XP_001370894.1| PREDICTED: simila ( 916) 1858 387.9 1e-104 gi|194208456|ref|XP_001501746.2| PREDICTED: PHD fi ( 851) 1844 385.0 7.1e-104 gi|116242597|sp|Q9NQC1.2|JADE2_HUMAN RecName: Full ( 790) 1816 379.3 3.5e-102 gi|158261965|dbj|BAF83160.1| unnamed protein produ ( 790) 1813 378.7 5.3e-102 gi|33871210|gb|AAH21962.2| PHF15 protein [Homo sap ( 791) 1813 378.7 5.3e-102 gi|40389473|tpe|CAE30490.1| TPA: Jade protein [Cio ( 585) 1811 378.2 5.6e-102 gi|148701695|gb|EDL33642.1| PHD finger protein 15, ( 770) 1810 378.1 7.9e-102 gi|168267232|dbj|BAG09672.1| PHD finger protein 15 ( 790) 1810 378.1 8e-102 gi|40389491|tpe|CAE30498.1| TPA: Jade2 protein [Mu ( 806) 1810 378.1 8.2e-102 gi|158258707|dbj|BAF85324.1| unnamed protein produ ( 791) 1804 376.9 1.9e-101 gi|114601894|ref|XP_517936.2| PREDICTED: PHD finge ( 825) 1800 376.1 3.4e-101 gi|119582656|gb|EAW62252.1| PHD finger protein 15, ( 850) 1800 376.1 3.5e-101 gi|194377302|dbj|BAG57599.1| unnamed protein produ ( 793) 1799 375.9 3.8e-101 gi|119582660|gb|EAW62256.1| PHD finger protein 15, ( 834) 1799 375.9 3.9e-101 gi|109078746|ref|XP_001102649.1| PREDICTED: simila ( 834) 1797 375.5 5.2e-101 gi|18676594|dbj|BAB84949.1| FLJ00195 protein [Homo ( 639) 1794 374.8 6.6e-101 gi|14042423|dbj|BAB55239.1| unnamed protein produc ( 509) 1790 373.9 9.8e-101 gi|194386878|dbj|BAG59805.1| unnamed protein produ ( 715) 1790 374.0 1.3e-100 gi|73983918|ref|XP_856307.1| PREDICTED: similar to ( 509) 1788 373.5 1.3e-100 gi|74748786|sp|Q6IE81.1|JADE1_HUMAN RecName: Full= ( 842) 1790 374.1 1.4e-100 gi|109075628|ref|XP_001083402.1| PREDICTED: simila ( 843) 1790 374.1 1.4e-100 gi|73970752|ref|XP_850716.1| PREDICTED: similar to ( 782) 1789 373.8 1.5e-100 gi|194219920|ref|XP_001504443.2| PREDICTED: PHD fi ( 784) 1788 373.6 1.8e-100 gi|73983916|ref|XP_848505.1| PREDICTED: similar to ( 843) 1788 373.7 1.9e-100 gi|123255297|emb|CAM26924.1| PHD finger protein 15 ( 576) 1781 372.1 3.8e-100 gi|75057838|sp|Q5E9T7.1|JADE1_BOVIN RecName: Full= ( 509) 1780 371.8 4e-100 gi|148701696|gb|EDL33643.1| PHD finger protein 15, ( 793) 1781 372.2 4.8e-100 >>gi|109130629|ref|XP_001100171.1| PREDICTED: PHD finger (938 aa) initn: 5872 init1: 5872 opt: 5872 Z-score: 6443.1 bits: 1203.4 E(): 0 Smith-Waterman score: 5872; 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