# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/ha04657.fasta.huge -Q ../query/KIAA0224.ptfa ./tmplib.23147 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0224, 1256 aa vs ./tmplib.23147 library 1986249 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.1091+/-0.00784; mu= 7.6225+/- 0.531 mean_var=210.7718+/-51.416, 0's: 0 Z-trim: 18 B-trim: 80 in 1/39 Lambda= 0.088342 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0577 ( 1043 res) hj00291 (1043) 2331 311.0 6.5e-85 KIAA1488 ( 852 res) fj07893 ( 852) 615 92.2 3.9e-19 KIAA0134 ( 587 res) ha04001 ( 587) 544 82.9 1.7e-16 KIAA0890 ( 1210 res) hk08057 (1210) 496 77.2 1.8e-14 KIAA1517 ( 998 res) fh11426(revised) ( 998) 452 71.5 7.8e-13 KIAA0139 ( 1388 res) ha04032 (1388) 255 46.5 3.5e-05 KIAA1019 ( 2309 res) fg00188s1 (2309) 245 45.5 0.00012 KIAA0853 ( 967 res) hk06136 ( 967) 211 40.7 0.0014 >>KIAA0577 ( 1043 res) hj00291 (1043 aa) initn: 2308 init1: 871 opt: 2331 Z-score: 1616.3 bits: 311.0 E(): 6.5e-85 Smith-Waterman score: 2353; 41.031% identity (70.000% similar) in 970 aa overlap (255-1182:74-1022) 230 240 250 260 270 280 KIAA02 EPESPRHRPKDAATPSRSTWEEEDSGYGSSRRSQWESPSPTPSYRDSERSHRLSTRDRDR :.. :.:. : .:: : . ...: KIAA05 EFVQRLRDTDTLDLSGPARDFALRLWNKVPRKAVVEKPA-----RAAEREAR-ALLEKNR 50 60 70 80 90 290 300 310 320 330 KIAA02 SVR----GKYSDDTPLPTPSYKYNEWADDRRHLGSTPRLSRGRGRREEGEEGISFDTEE- : : .. :.. . . . .. :.:: . . . . :.:.. . . .. KIAA05 SYRLLEDSEESSEETVSRAGSSLQKKRKKRKHLRKKREEEEEEEASEKGKKKTGGSKQQT 100 110 120 130 140 150 340 350 360 370 380 390 KIAA02 ERQQWEDDQRQADRDWYMMDEGYDEFHNPLAYSSEDYVR----RREQHLHKQKQKRI--S :. . ::. ....:. . : : : . . ..: .: : ... ... :::. . KIAA05 EKPESEDEWERTERERLQDLEERDAFAERVRQRDKDRTRNVLERSDKKAYEEAQKRLKMA 160 170 180 190 200 210 400 410 420 430 440 450 KIAA02 AQRRQINEDNERWETNRMLTSGVVHRLEVDEDFEEDNAAKVHLMVHNLVPPFLDGRIVFT . :. . : .. : . .. : ::.: . : . :: : . .. KIAA05 EEDRKAMVPELRKKSRREYLAK--REREKLEDLEAELADE----------EFLFGDVELS 220 230 240 250 260 460 470 480 490 KIAA02 KQPEPVIPVKDATSDLAIIARK-GSQ-----TVRKHREQKERKKA--------------- .. . . : . ::: : : : : : : .. : . KIAA05 RHERQELKYKRRVRDLAREYRAAGEQEKLEATNRYHMPKETRGQPARAVDLVEEESGAPG 270 280 290 300 310 320 500 510 520 530 540 KIAA02 -QHKHWE-----LAGTKLGDIMGVKKEEEPDKAVTEDGKVDY-RTEQKFADHMKRKSEAS ....:: :. :.: ....: . . .. :. ... :. : .:. .: KIAA05 EEQRRWEEARLGAASLKFGARDAASQEPKYQLVLEEEETIEFVRATQLQGDEEPSAPPTS 330 340 350 360 370 380 550 560 570 580 590 600 KIAA02 SEFAKKKSILEQRQYLPIFAVQQELLTIIRDNSIVIVVGETGSGKTTQLTQYLHEDGYTD .. .:.:: :. ::.: ..:::. : .....:. ::::::::::. ::: :.:::. 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KIAA05 ACEMLQDRCRRLGSKIRELLVLPIYANLPSDMQARIFQPTPPGARKVVVATNIAETSLTI 630 640 650 660 670 680 850 860 870 880 890 900 KIAA02 DGIMFVIDSGYCKLKVFNPRIGMDALQIYPISQANANQRSGRAGRTGPGQCFRLYTQSAY .::..:.: :.:: : .::: ::..: . : :.:.::::.:::::.. :.:::::: :: KIAA05 EGIIYVLDPGFCKQKSYNPRTGMESLTVTPCSKASANQRAGRAGRVAAGKCFRLYTAWAY 690 700 710 720 730 740 910 920 930 940 950 960 KIAA02 KNELLTTTVPEIQRTNLANVVLLLKSLGVQDLLQFHFMDPPPEDNMLNSMYQLWILGALD ..:: :::::::::.:.::::::::::..::..: :.:::: ...: .. ::. ::::. KIAA05 QHELEETTVPEIQRTSLGNVVLLLKSLGIHDLMHFDFLDPPPYETLLLALEQLYALGALN 750 760 770 780 790 800 970 980 990 1000 1010 1020 KIAA02 NTGGLTSTGRLMVEFPLDPALSKMLIVSCDMGCSSEILLIVSMLSVP-AIFYRPKGREEE . : ::..:: :.:.:.:: ::::...: ..:: ::: ...:::: .:::::: . . KIAA05 HLGELTTSGRKMAELPVDPMLSKMILASEKYSCSEEILTVAAMLSVNNSIFYRPKDKVVH 810 820 830 840 850 860 1030 1040 1050 1060 1070 1080 KIAA02 SDQIREKFAVPESDHLTYLNVYLQWKNNNYSTIWCNDHFIHAKAMRKVREVRAQLKDIMV .:. : .: .: .:::. :::: :: ...::. :: ..:.. ..::..:.:: ::. .. KIAA05 ADNARVNFFLPGGDHLVLLNVYTQWAESGYSSQWCYENFVQFRSMRRARDVREQLEGLLE 870 880 890 900 910 920 1090 1100 1110 1120 1130 1140 KIAA02 QQRMSLASCGTDWDIVRKCICAAYFHQAAKLKGIGEYVNIRTGMPCHLHPTSSLFGMGYT . ...:.:: :. ::: : :.::...:.: : : ... . .::.:::: . KIAA05 RVEVGLSSCQGDYIRVRKAITAGYFYHTARLTRSG-YRTVKQQQTVFIHPNSSLFEQ--Q 930 940 950 960 970 980 1150 1160 1170 1180 1190 1200 KIAA02 PDYIVYHELVMTTKEYMQCVTAVDGEWLAELGPMFYSVKQAGKSRQENRRRAKEEASAME : ...:::::.::::.:. : ... :: :..: .:..:. KIAA05 PRWLLYHELVLTTKEFMRQVLEIESSWLLEVAPHYYKAKELEDPHAKKMPKKIGKTREEL 990 1000 1010 1020 1030 1040 1210 1220 1230 1240 1250 KIAA02 EEMALAEEQLRARRQEQEKRSPLGSVRSTKIYTPGRKEQGEPMAPRRTPARFGL KIAA05 G >>KIAA1488 ( 852 res) fj07893 (852 aa) initn: 911 init1: 286 opt: 615 Z-score: 435.3 bits: 92.2 E(): 3.9e-19 Smith-Waterman score: 1031; 29.973% identity (60.345% similar) in 754 aa overlap (512-1165:16-749) 490 500 510 520 530 540 KIAA02 KHREQKERKKAQHKHWELAGTKLGDIMGVKKEEEPDKAVTEDGKVDYRTEQKFADHMKRK .:.::: : .: ::. . ...: KIAA14 IRNRSYIDRDSEYLLQENEPD------GTLD----QKLLEDLQKK 10 20 30 550 560 570 580 590 600 KIAA02 SEASSEFAKKKSILEQRQYLPIFAVQQELLTIIRDNSIVIVVGETGSGKTTQLTQYLHED .. . .. . . . :. :: ...:.::...: ....... :::: :::::.::.. : KIAA14 KN-DLRYIEMQHF---REKLPSYGMQKELVNLIDNHQVTVISGETGCGKTTQVTQFIL-D 40 50 60 70 80 90 610 620 630 640 650 KIAA02 GYTDYGM-----IGCTQPRRVAAMSVAKRVSEEMGGNLG--EEVGYAIRFED-CTSENTL .: . : : ::::::..:.:::.::. : . . : . .:: ::... .. KIAA14 NYIERGKGSACRIVCTQPRRISAISVAERVAAERAESCGSGNSTGYQIRLQSRLPRKQGS 100 110 120 130 140 150 660 670 680 690 700 710 KIAA02 IKYMTDGILLRESLREADLDHYSAIIMDEAHERSLNTDVLFGLLREVVARRSDLKLIVTS : : : ::.:. . :. : :..:: :::.:..:::. ...... :::::.:. : KIAA14 ILYCTTGIILQWLQSDPYLSSVSHIVLDEIHERNLQSDVLMTVVKDLLNFRSDLKVILMS 160 170 180 190 200 210 720 730 740 750 KIAA02 ATMDAEKFAAFFGNVPIFHIPGRTFPV------DIL--FSKTPQE--------------- ::..::::. .::: :..:::: :::: :.. . .:.. KIAA14 ATLNAEKFSEYFGNCPMIHIPGFTFPVVEYLLEDVIEKIRYVPEQKEHRSQFKRGFMQGH 220 230 240 250 260 270 760 KIAA02 ------------------DYV-------------------EAAVKQSLQVHL------SG ::: . : .: : : KIAA14 VNRQEKEEKEAIYKERWPDYVRELRRRYSASTVDVIEMMEDDKVDLNLIVALIRYIVLEE 280 290 300 310 320 330 770 780 790 800 810 820 KIAA02 APGDILIFMPGQEDIEVTSDQIVEHLEELENAPALAVLPIYSQLPSDLQAKIFQKAPDGV : ::.:.:: ..: . : .. .. . .. . ..:..: .:. :...:...: :: KIAA14 EDGAILVFLPGWDNISTLHDLLMSQV--MFKSDKFLIIPLHSLMPTVNQTQVFKRTPPGV 340 350 360 370 380 830 840 850 860 870 880 KIAA02 RKCIVATNIAETSLTVDGIMFVIDSGYCKLKVFNPRIGMDALQIYPISQANANQRSGRAG :: ..::::::::.:.: ...:::.: : :. . ...... .:.:::.::.:::: KIAA14 RKIVIATNIAETSITIDDVVYVIDGGKIKETHFDTQNNISTMSAEWVSKANAKQRKGRAG 390 400 410 420 430 440 890 900 910 920 930 940 KIAA02 RTGPGQCFRLYTQSAYKNELLTT-TVPEIQRTNLANVVLLLKSLGVQDLLQF--HFMDPP :. ::.:..:: .. . :: .::: :: : .. : .: : . . : ..:::: KIAA14 RVQPGHCYHLY--NGLRASLLDDYQLPEILRTPLEELCLQIKILRLGGIAYFLSRLMDPP 450 460 470 480 490 500 950 960 970 980 990 1000 KIAA02 PEDNMLNSMYQLWILGALDNTGGLTSTGRLMVEFPLDPALSKMLIVSCDMGCSSEILLIV .. .: :. .: :.:::. :: : ....:..: ..::.. . . : . .: :. KIAA14 SNEAVLLSIRHLMELNALDKQEELTPLGVHLARLPVEPHIGKMILFGALFCCLDPVLTIA 510 520 530 540 550 560 1010 1020 1030 1040 1050 KIAA02 SMLSVPAIFYRPKGREEESDQIREKFAVP-ESDHLTYLNVYLQWKNNN-----YSTIWCN . :: : : :.:. .: :...: .::::: .:.. :.. : .: KIAA14 ASLSFKDPFVIPLGKEKIADARRKELAKDTRSDHLTVVNAFEGWEEARRRGFRYEKDYCW 570 580 590 600 610 620 1060 1070 1080 1090 1100 KIAA02 DHFIHAKAMRKVREVRAQLKDIM-----VQQRMSL---ASCGTDWD-IVRKCICAAYFHQ ..:. ..... ......:. . . :..: .. ..: . :.. :::. . . KIAA14 EYFLSSNTLQMLHNMKGQFAEHLLGAGFVSSRNPKDPESNINSDNEKIIKAVICAGLYPK 630 640 650 660 670 680 1110 1120 1130 1140 1150 1160 KIAA02 AAKLK-GIGE---YVNIRT---GMPCHLHPTS-SLFGMGYTPDYIVYHELVMTTKEYMQC .::.. ..:. .:.. : :. .:: : .. . ....:: . :.. :. KIAA14 VAKIRLNLGKKRKMVKVYTKTDGL-VAVHPKSVNVEQTDFHYNWLIYHLKMRTSSIYLYD 690 700 710 720 730 740 1170 1180 1190 1200 1210 1220 KIAA02 VTAVDGEWLAELGPMFYSVKQAGKSRQENRRRAKEEASAMEEEMALAEEQLRARRQEQEK : : KIAA14 CTEVSPYCLLFFGGDISIQKDNDQETIAVDEWIVFQSPARIAHLVKELRKELDILLQEKI 750 760 770 780 790 800 >>KIAA0134 ( 587 res) ha04001 (587 aa) initn: 793 init1: 427 opt: 544 Z-score: 388.2 bits: 82.9 E(): 1.7e-16 Smith-Waterman score: 939; 36.538% identity (61.325% similar) in 468 aa overlap (548-1015:160-546) 520 530 540 550 560 570 KIAA02 KAVTEDGKVDYRTEQKFADHMKRKSEASSEFAKKKSILEQRQYLPIFAVQQELLTIIRDN :.. .. ..: ::: ...: .... KIAA01 QGLGRHLPAERVAEFRRALLHYLDFGQKQAFGRLAKLQRERAALPIAQYGNRILQTLKEH 130 140 150 160 170 180 580 590 600 610 620 630 KIAA02 SIVIVVGETGSGKTTQLTQYLHEDGYTDYGMIGCTQPRRVAAMSVAKRVSEEMGGNLGEE ..:.:.:.:: ::.::. ::: :.. ..::::::.: .:.::::. : .. : . KIAA01 QVVVVAGDTGCGKSTQVPQYLLAAGFSH---VACTQPRRIACISLAKRVGFESLSQYGSQ 190 200 210 220 230 240 640 650 660 670 680 690 KIAA02 VGYAIRFEDCTSENTLIKYMTDGILLRESLREADLDHYSAIIMDEAHERSLNTDVLFGLL ::: ::::. : : : ..: :.:::. :: .: .: ..:.::.::: :..: :.:.: KIAA01 VGYQIRFESTRSAATKIVFLTVGLLLRQIQREPSLPQYEVLIVDEVHERHLHNDFLLGVL 250 260 270 280 290 300 700 710 720 730 740 750 KIAA02 REVVARRSDLKLIVTSATMDAEKFAAFFGNVPIFHIPGRTFPVDILFSKTPQEDYVEAAV .... : :::.:. :::.. :...:.:.:. ..::: ::. . KIAA01 QRLLPTRPDLKVILMSATINISLFSSYFSNAPVVQVPGRLFPITV--------------- 310 320 330 340 350 760 770 780 790 800 810 KIAA02 KQSLQVHLSGAPGDILIFMPGQEDIEVTSDQIVEHLEELENAPALAVLPIYSQLPSDLQA KIAA01 ------------------------------------------------------------ 820 830 840 850 860 870 KIAA02 KIFQKAPDGVRKCIVATNIAETSLTVDGIMFVIDSGYCKLKVFNPRIGMDALQIYPISQA :. :: ::::::..:::::::.:.::: ::.::: : ..:. .. :: . :::: KIAA01 --FDVAPPGVRKCILSTNIAETSVTIDGIRFVVDSGKVKEMSYDPQAKLQRLQEFWISQA 360 370 380 390 400 880 890 900 910 920 930 KIAA02 NANQRSGRAGRTGPGQCFRLYTQSAYKNELLTTTVPEIQRTNLANVVLLLKSLGVQDLLQ .:.::.::::::::: :::::..: : . . ::::.:. : ..:: .::..: : KIAA01 SAEQRKGRAGRTGPGVCFRLYAESDY-DAFAPYPVPEIRRVALDSLVLQMKSMSVGDPRT 410 420 430 440 450 460 940 950 960 970 980 990 KIAA02 FHFMDPPPEDNMLNSMYQLWILGALDNTGGLTSTGRLMVEFPLDPALSKMLIVSCDMGCS : :..::: .. ... : ::::.. .:: : :....:.: ...::::.. .. KIAA01 FPFIEPPPPASLETAILYLRDQGALDSSEALTPIGSLLAQLPVDVVIGKMLILGSMFSLV 470 480 490 500 510 520 1000 1010 1020 1030 1040 1050 KIAA02 SEILLIVSMLSVPAIFYRPKGREEESDQIREKFAVPESDHLTYLNVYLQWKNNNYSTIWC .: :.. ::: . : : KIAA01 EPVLTIAAALSVQSPFTRSAQSSPECCTPPASSLAAPRCCTHRSWRPATATEAETTRTR 530 540 550 560 570 580 >>KIAA0890 ( 1210 res) hk08057 (1210 aa) initn: 908 init1: 250 opt: 496 Z-score: 351.6 bits: 77.2 E(): 1.8e-14 Smith-Waterman score: 881; 30.240% identity (60.320% similar) in 625 aa overlap (540-1122:428-1043) 510 520 530 540 550 560 KIAA02 VKKEEEPDKAVTEDGKVDYRTEQKFADHMKRKSEASSEFAKKKS-ILEQRQYLPIFAVQQ : :.. :. .... . .. ::. .. KIAA08 DILPLGKDSGPLSDPITGKPYVPLLEAEEVRLSQSLLELWRRRGPVWQEAPQLPVDPHRD 400 410 420 430 440 450 570 580 590 600 610 620 KIAA02 ELLTIIRDNSIVIVVGETGSGKTTQLTQYLHEDGYTDYGMIGC----TQPRRVAAMSVAK .:. :... .:.. :.:: ::::.. : : : :. : :::::..:.:::. KIAA08 TILNAIEQHPVVVISGDTGCGKTTRIPQLLLERYVTEGRGARCNVIITQPRRISAVSVAQ 460 470 480 490 500 510 630 640 650 660 670 680 KIAA02 RVSEEMGGNLGEEVGYAIRFEDCT-SENTLIKYMTDGILLRESLREADLDHYSAIIMDEA :::.:.: .: ..::. .:.:. :.. . . : :::::. . .:. : .:.::. KIAA08 RVSHELGPSLRRNVGFQVRLESKPPSRGGALLFCTVGILLRKLQSNPSLEGVSHVIVDEV 520 530 540 550 560 570 690 700 710 720 730 740 KIAA02 HERSLNTDVLFGLLREVVARRSDLKLIVTSATMDAEKFAAFFGNVPIFHIPGRTFPV--- :::..::: :. ::. . :.:.. ::: : :.:. .::. :....:: .:: KIAA08 HERDVNTDFLLILLKGLQRLNPALRLVLMSATGDNERFSRYFGGCPVIKVPGFMYPVKEH 580 590 600 610 620 630 750 760 770 780 KIAA02 ---DILFSKTPQEDYV----------EAAVK----QSLQVHLS--GAPGDILIFMPGQED ::: .: ...:. : :. .: .:.. : :: :: :.:: .. KIAA08 YLEDIL-AKLGKHQYLHRHRHHESEDECALDLDLVTDLVLHIDARGEPGGILCFLPGWQE 640 650 660 670 680 690 790 800 810 820 830 840 KIAA02 IEVTSDQIVEHLEELENAPALAVLPIYSQLPSDLQAKIFQKAPDGVRKCIVATNIAETSL :. ..... : : :. .::..:..: : :::. : :::: ..::::::::. KIAA08 IKGVQQRLQEALGMHESK--YLILPVHSNIPMMDQKAIFQQPPVGVRKIVLATNIAETSI 700 710 720 730 740 750 850 860 870 880 890 900 KIAA02 TVDGIMFVIDSGYCKLKVFNPRIGMDALQIYPISQANANQRSGRAGRTGPGQCFRLYTQS :.. :. :.::: : . .. . .. :. .:.::. :: ::::: : ..:. .: KIAA08 TINDIVHVVDSGLHKEERYDLKTKVSCLETVWVSRANVIQRRGRAGRCQSGFAYHLFPRS 760 770 780 790 800 810 910 920 930 940 950 KIAA02 AYKNELLTTTVPEIQRTNLANVVLLLK-SLGVQDLLQF--HFMDPPPEDNMLNSMYQLWI . ... :::: :: : :.:: : . . ..: . .: : . ... : KIAA08 RLE-KMVPFQVPEILRTPLENLVLQAKIHMPEKTAVEFLSKAVDSPNIKAVDEAVILLQE 820 830 840 850 860 870 960 970 980 990 1000 1010 KIAA02 LGALDNTGGLTSTGRLMVEFPLDPALSKMLIVSCDMGCSSEILLIVSMLSVPAIFYRPKG .:.::. ::. :. .... :: :.: .... . : .:..:: :. . .. KIAA08 IGVLDQREYLTTLGQRLAHISTDPRLAKAIVLAAIFRCLHPLLVVVSCLTRDPFSSSLQN 880 890 900 910 920 930 1020 1030 1040 1050 1060 1070 KIAA02 REEESDQIREKFAVPE-SDHLTYLNVY------LQWKNNNYSTIWCNDHFIHAKAMRKVR : : :... .. ::::... . :.:.. . . ......: ..: .. KIAA08 RAE-VDKVKALLSHDSGSDHLAFVRAVAGWEEVLRWQDRSSRENYLEENLLYAPSLRFIH 940 950 960 970 980 990 1080 1090 1100 1110 1120 KIAA02 EVRAQLKDIMVQQRMSLASCGTDWD-IVRKCICAAYFHQAAKLKGI---GEYVNIRTGMP . :... . . . : : . . : : .. .::. : : :. KIAA08 GLIKQFSENIYEAFL----VGKPSDCTLASAQCNEYSEEEELVKGVLMAGLYPNLIQVRQ 1000 1010 1020 1030 1040 1130 1140 1150 1160 1170 1180 KIAA02 CHLHPTSSLFGMGYTPDYIVYHELVMTTKEYMQCVTAVDGEWLAELGPMFYSVKQAGKSR KIAA08 GKVTRQGKFKPNSVTYRTKSGNILLHKSTINREATRLRSRWLTYFMAVKSNGSVFVRDSS 1050 1060 1070 1080 1090 1100 >>KIAA1517 ( 998 res) fh11426(revised) (998 aa) initn: 1020 init1: 356 opt: 452 Z-score: 322.3 bits: 71.5 E(): 7.8e-13 Smith-Waterman score: 1063; 30.888% identity (56.371% similar) in 777 aa overlap (550-1177:64-834) 520 530 540 550 560 570 KIAA02 VTEDGKVDYRTEQKFADHMKRKSEASSEFAKKKSILEQRQYLPIFAVQQELLTIIRDNSI .. . :.: :::.. .: .. . .. : KIAA15 PAGMTVPPPPAAAPPLPRALAKPAVFIPVNRSPEMQEERLKLPILSEEQVIMEAVAEHPI 40 50 60 70 80 90 580 590 600 610 620 630 KIAA02 VIVVGETGSGKTTQLTQYLHEDGYT-DYGMIGCTQPRRVAAMSVAKRVSEEMGGNLGEEV ::: ::::::::::. :.:.: :.. . ..:: :.::::::.....::..:: ::...: KIAA15 VIVCGETGSGKTTQVPQFLYEAGFSSEDSIIGVTEPRRVAAVAMSQRVAKEM--NLSQRV 100 110 120 130 140 150 640 650 660 670 680 690 KIAA02 -GYAIRFEDCTSENTLIKYMTDGILLRESLREADLDHYSAIIMDEAHERSLNTDVLFGLL .: ::.: ..:.: ::.::::.::.: .. : .:...:.:::::::. ::.:.::: KIAA15 VSYQIRYEGNVTEETRIKFMTDGVLLKEIQKDFLLLRYKVVIIDEAHERSVYTDILIGLL 160 170 180 190 200 210 700 710 720 730 740 KIAA02 REVV---ARRS-DLKLIVTSATMDAEKFAA----FFGNVPIFHIPGRTFPVDILFSK-TP ..: :.:. :::.. :::. .: :. : :.... .: ::: . :.: :: KIAA15 SRIVTLRAKRNLPLKLLIMSATLRVEDFTQNPRLFAKPPPVIKVESRQFPVTVHFNKRTP 220 230 240 250 260 270 750 760 770 780 KIAA02 QEDYVEAAVKQSLQVHLSGAPGDILIFMPGQEDI-------------------EVTSDQI ::: .. ..: : ::.:. :: .. : .:: KIAA15 LEDYSGECFRKVCKIHRMLPAGGILVFLTGQAEVHALCRRLRKAFPPSRARPQEKDDDQK 280 290 300 310 320 330 790 800 KIAA02 --VEHLEELENA-----------------------PA----------------------- ::........ :: KIAA15 DSVEEMRKFKKSRARAKKARAEVLPQINLDHYSVLPAGEGDEDREAEVDEEEGALDSDLD 340 350 360 370 380 390 810 820 830 840 KIAA02 -------------------LAVLPIYSQLPSDLQAKIFQKAPDGVRKCIVATNIAETSLT : :::.:: : . ::..:. :.:.: :.::::.:::::: KIAA15 LDLGDGGQDGGEQPDASLPLHVLPLYSLLAPEKQAQVFKPPPEGTRLCVVATNVAETSLT 400 410 420 430 440 450 850 860 870 880 890 900 KIAA02 VDGIMFVIDSGYCKLKVFNPRIGMDALQIYPISQANANQRSGRAGRTGPGQCFRLYTQSA . :: .:.: : : . .. :...... .:::.:.::.:::::: ::.:.:::. :: KIAA15 IPGIKYVVDCGKVKKRYYDRVTGVSSFRVTWVSQASADQRAGRAGRTEPGHCYRLYS-SA 460 470 480 490 500 510 910 920 930 940 950 960 KIAA02 YKNELLTTTVPEIQRTNLANVVLLLKSLGVQDLLQFHFMDPPPEDNMLNSMYQLWILGAL ... ::: : . ...: .:.:.:. ...: : :: . .: . : :::: KIAA15 VFGDFEQFPPPEITRRPVEDLILQMKALNVEKVINFPFPTPPSVEALLAAEELLIALGAL 520 530 540 550 560 570 970 980 990 1000 KIAA02 -------------DN--TGGLTSTGRLMVEFPLDPALSKMLIVSCDMGCSSEILLIVSML .: . .:. :: :. ::. : .::: .: . :: . ::. . KIAA15 QPPQKAERVKQLQENRLSCPITALGRTMATFPVAPRYAKMLALSRQHGCLPYAITIVASM 580 590 600 610 620 630 1010 1020 1030 1040 KIAA02 SVPAIFY---RPKGREEESDQIREKFA---------------VPESDHLTYLNVYLQWKN .: .: :: . .:: ... : : . .: .. :.. . KIAA15 TVRELFEELDRPAASDEELTRLKSKRARVAQMKRTWAGQGASLKLGDLMVLLGAVGACEY 640 650 660 670 680 690 1050 1060 1070 1080 1090 KIAA02 NNYSTIWCNDHFIHAKAMRKVREVRAQLK----------DIMVQQRMSLASCGTDWDIVR . . .:. . .. ::: ..:..:.:: ...:. .:. .. .: KIAA15 ASCTPQFCEANGLRYKAMMEIRRLRGQLTTSVNAVCPEAELFVDPKMQ-PPTESQVTYLR 700 710 720 730 740 1100 1110 1120 1130 1140 1150 KIAA02 KCICAAYFHQAAKLKGIGEYVN------IRTGM---PCHLHPTSSLFGMGYTPDYIVYHE . . :. . :. :... .: . : .::.: :: :...::.: KIAA15 QIVTAGLGDHLARRVQSEEMLEDKWRNAYKTPLLDDPVFIHPSSVLFKE--LPEFVVYQE 750 760 770 780 790 800 1160 1170 1180 1190 1200 1210 KIAA02 LVMTTKEYMQCVTAVDGEWLAELGPMFYSVKQAGKSRQENRRRAKEEASAMEEEMALAEE .: ::: ::. :..:. .:. : : . KIAA15 IVETTKMYMKGVSSVEVQWIPALLPSYCQFDKPLEEPAPTYCPERGRVLCHRASVFYRVG 810 820 830 840 850 860 >>KIAA0139 ( 1388 res) ha04032 (1388 aa) initn: 287 init1: 92 opt: 255 Z-score: 185.0 bits: 46.5 E(): 3.5e-05 Smith-Waterman score: 264; 30.293% identity (51.140% similar) in 307 aa overlap (88-355:1103-1383) 60 70 80 90 100 110 KIAA02 SKSAASEQHVFKAPAPRPSLLGLDLLASLKRREREEKDDGEDKKKSKVSSYKDWEESKDD : :. :: . ... .. :... :: KIAA01 RGPRRGLDDDRGPRRGMDDDRGPRRGMDDDRGPRRGMDDDRGPRRGLDDDRGPWRNADDD 1080 1090 1100 1110 1120 1130 120 130 140 150 160 KIAA02 Q---KDAEEEGGDQAGQNIRKDRHYRSA------RVETPSHPGG----VSEEFWERSRQR . . ::.. : .:. :: : : : :.:: :. : :.. KIAA01 RIPRRGAEDDRGPW--RNMDDDRLSRRADDDRFPRRGDDSRPGPWRPLVKPGGW---REK 1140 1150 1160 1170 1180 170 180 190 200 210 220 KIAA02 ERERREH-GVYASSK--EEKDWKKEKSRDRDYDRKRDRDERDRSRHSSRSERDGGSERSS :. :.: : :. ::..: .:: :::: ..::.: :.. ::. ::. 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KIAA10 IRRKRSRSSERGRSPKRLTDLDKAQLLEIAK-ANAAAMCAKAGVPLPPN-LKPAPPPTIE 2040 2050 2060 2070 2080 2090 380 390 400 410 420 430 KIAA02 RREQHLHKQKQKRISAQRRQINEDNERWETNRMLTSGVVHRLEVDEDFEEDNAAKVH-LM . : .: .: ....: .. .. . .:.. .:... ::. : . KIAA10 E------KVAKKSGGATIEELTEKCKQIAQSKEDDDVIVNKPHVSDEEEEEPPFYHHPFK 2100 2110 2120 2130 2140 2150 440 450 460 470 480 490 KIAA02 VHNLVPPFLDGRIVFTKQPEPVIPVKDATSDLAIIARKGSQTVRKHREQKERKKAQHKHW . . : :.. :. .: : : : ...: . . .::: :: :.. . . .: KIAA10 LSEPKPIFFNLNIAAAK-PTP--PKSQVTLTKEFPVSSGSQ----HR--KKEADSVYGEW 2160 2170 2180 2190 2200 500 510 520 530 540 550 KIAA02 ---ELAGTKLGDIMGVKKEEEPDKA-VTEDGKVDYRTEQKFADHMKRKSEASSEFAKKKS : : . : .: . . :... : ..:.: . .: :.:. KIAA10 VPVEKNGEENKDDDNVFSSNLPSEGRVKRQGRVRRQMKQPAASHLTVTRCNSLCGTKPQS 2210 2220 2230 2240 2250 2260 560 570 580 590 600 610 KIAA02 ILEQRQYLPIFAVQQELLTIIRDNSIVIVVGETGSGKTTQLTQYLHEDGYTDYGMIGCTQ KIAA10 EKHRIAENSVITSLPNIGPSLHLWEGSPRYNYLASRFASRLYSSRFWW 2270 2280 2290 2300 >>KIAA0853 ( 967 res) hk06136 (967 aa) initn: 551 init1: 142 opt: 211 Z-score: 156.4 bits: 40.7 E(): 0.0014 Smith-Waterman score: 288; 24.038% identity (50.481% similar) in 416 aa overlap (159-555:9-400) 130 140 150 160 170 180 KIAA02 AGQNIRKDRHYRSARVETPSHPGGVSEEFWERSRQRERERREHGVYASSKEEKDWKKEKS ::.:.::::: ::. .:.. KIAA08 KARRELERERARERERER-----------EKERDRERD 10 20 190 200 210 220 230 240 KIAA02 RDRDYDRKRDRD-ERDRS--RHSSRSERDGGSERSSRRN---EPESPRHRPKDAATPSRS ::::.::.:.:. :::: :. : ::. :: .:. : : : : .: . 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KIAA08 ESSRRYEEQELKEKVSSVDKQREQTEILESSRMRAQDIIGHHQSEDRETSDRAHDENKKK 200 210 220 230 240 250 420 430 440 450 460 470 KIAA02 GVVHRLEVDEDFEEDNAAKVHLMVHNLVPPFLDGRIVFTKQPEPVIPV----KDATSDLA . ... . . :.: : . :. ::.. :. . . : . .: KIAA08 AKIQKKPIKKKKEDD----VGIERGNIETTSEDGQVFSPKKGQKKKSIEKKRKKSKGDSD 260 270 280 290 300 310 480 490 500 510 520 KIAA02 IIARKGSQTVRKHREQKERK-KAQHKHWELAGTKLGDIMGVKKEEEPDKAVTEDGKVDYR : ....: .:.: . .... :. . : : . .:.:. . : : : KIAA08 ISDEEAAQQSKKKRGPRTPPITTKEELVEMCNGKNGILEDSQKKEDTAFSDWSDEDVPDR 320 330 340 350 360 370 530 540 550 560 570 580 KIAA02 TEQKFADHMKRKSEASSEFAKKKSILEQRQYLPIFAVQQELLTIIRDNSIVIVVGETGSG :: :.: . .: . .:.: KIAA08 TEVTEAEHTATATTPGSTPSPLSSLLPPPPPVATATATTVPATLAATTAAAATSFSTSAI 380 390 400 410 420 430 1256 residues in 1 query sequences 1986249 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:12:19 2008 done: Thu Dec 18 15:12:20 2008 Total Scan time: 0.740 Total Display time: 0.370 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]