# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/ha02538.fasta.nr -Q ../query/KIAA0230.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0230, 1496 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7801677 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0473+/-0.000189; mu= 16.3628+/- 0.011 mean_var=81.0433+/-15.495, 0's: 32 Z-trim: 167 B-trim: 15 in 1/65 Lambda= 0.142467 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|172045828|sp|Q92626.2|PXDN_HUMAN RecName: Full= (1479) 10083 2083.4 0 gi|187956549|gb|AAI50790.1| Peroxidasin homolog (D (1475) 9256 1913.4 0 gi|123788303|sp|Q3UQ28.1|PXDN_MOUSE RecName: Full= (1475) 9242 1910.5 0 gi|126303939|ref|XP_001381381.1| PREDICTED: hypoth (1627) 9015 1863.9 0 gi|149728202|ref|XP_001503092.1| PREDICTED: peroxi (1431) 8916 1843.5 0 gi|194680924|ref|XP_593953.4| PREDICTED: similar t (1417) 8615 1781.7 0 gi|172044151|sp|A4IGL7.1|PXDN_XENTR RecName: Full= (1457) 7766 1607.2 0 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(1528) 3210 670.8 2.2e-189 gi|156545056|ref|XP_001600862.1| PREDICTED: simila (1240) 3083 644.6 1.3e-181 gi|66499817|ref|XP_396476.2| PREDICTED: similar to (1293) 3082 644.4 1.6e-181 gi|190624367|gb|EDV39891.1| GF10247 [Drosophila an (1531) 3000 627.6 2.1e-176 gi|194108133|gb|EDW30176.1| GL22623 [Drosophila pe (1534) 2945 616.3 5.4e-173 gi|198149538|gb|EAL31341.2| GA11325 [Drosophila ps (1529) 2931 613.4 3.9e-172 gi|190653079|gb|EDV50322.1| GG14508 [Drosophila er (1526) 2901 607.3 2.8e-170 gi|194180302|gb|EDW93913.1| GE21698 [Drosophila ya (1528) 2893 605.6 8.8e-170 gi|74871953|sp|Q9VZZ4.1|PXDN_DROME RecName: Full=P (1527) 2892 605.4 1e-169 gi|15291383|gb|AAK92960.1| GH18946p [Drosophila me (1311) 2884 603.7 2.9e-169 gi|194163930|gb|EDW78831.1| GK12503 [Drosophila wi (1540) 2884 603.8 3.2e-169 gi|108884376|gb|EAT48601.1| peroxidasin [Aedes aeg ( 886) 2858 598.2 8.8e-168 gi|194195388|gb|EDX08964.1| GD13382 [Drosophila si (1528) 2846 595.9 7.2e-167 gi|630884|pir||S46224 peroxidasin - fruit fly (Dro (1535) 2845 595.7 8.3e-167 gi|193897817|gb|EDV96683.1| GH15071 [Drosophila gr (1534) 2842 595.1 1.3e-166 gi|167880828|gb|EDS44211.1| thyroid peroxidase [Cu ( 888) 2806 587.5 1.4e-164 >>gi|172045828|sp|Q92626.2|PXDN_HUMAN RecName: Full=Pero (1479 aa) initn: 10083 init1: 10083 opt: 10083 Z-score: 11191.2 bits: 2083.4 E(): 0 Smith-Waterman score: 10083; 100.000% identity (100.000% similar) in 1479 aa overlap (18-1496:1-1479) 10 20 30 40 50 60 KIAA02 SRPWWLRASERPSAPSAMAKRSRGPGRRCLLALVLFCAWGTLAVVAQKPGAGCPSRCLCF ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|172 MAKRSRGPGRRCLLALVLFCAWGTLAVVAQKPGAGCPSRCLCF 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 KIAA02 RTTVRCMHLLLEAVPAVAPQTSILDLRFNRIREIQPGAFRRLRNLNTLLLNNNQIKRIPS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|172 RTTVRCMHLLLEAVPAVAPQTSILDLRFNRIREIQPGAFRRLRNLNTLLLNNNQIKRIPS 50 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 180 KIAA02 GAFEDLENLKYLYLYKNEIQSIDRQAFKGLASLEQLYLHFNQIETLDPDSFQHLPKLERL 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:::.....:.::.:::::.:::::.:::: :.::.::::.:::.::: :::::: gi|172 GEYTCFATNSVETIHSTAYIIVQAVPQFTVVPQDRNVFEGHTVDFHCEAQGNPKPVIAWT 400 410 420 430 440 450 490 500 510 520 530 540 KIAA02 KGGSQLSVDRRHLVLSSGTLRISGVALHDQGQYECQAVNIIGSQKVVAHLTVQPRVTPVF :::.:::::::: ::::::::: ::::::::::::::::.::....:.: :: :::::: gi|172 KGGNQLSVDRRHQVLSSGTLRILRVALHDQGQYECQAVNIVGSKSTAAQLIVQTRVTPVF 460 470 480 490 500 510 550 560 570 580 590 600 KIAA02 ASIPSDTTVEVGANVQLPCSSQGEPEPAITWNKDGVQVTESGKFHISPEGFLTINDVGPA :..:.: :::::..::.::::::.: : :::::::.::::::::::::.:.:.: :.: : gi|172 ATVPNDMTVEVGTDVQIPCSSQGDPLPIITWNKDGIQVTESGKFHISPHGYLAIRDAGLA 520 530 540 550 560 570 610 620 630 640 650 660 KIAA02 DAGRYECVARNTIGSASVSMVLSVNVPDVSRNGDPFVATSIVEAIATVDRAINSTRTHLF : ::::::::: :: .:::::::: ::.:::.:::::::::.:::::::::::::::::: gi|172 DQGRYECVARNPIGYSSVSMVLSVLVPEVSRTGDPFVATSIIEAIATVDRAINSTRTHLF 580 590 600 610 620 630 670 680 690 700 710 720 KIAA02 DSRPRSPNDLLALFRYPRDPYTVEQARAGEIFERTLQLIQEHVQHGLMVDLNGTSYHYND 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:.:::::::::: :: .: .. gi|134 RFWYENPGVFTAAQLTQIKQTSLARVLCDNGDNITKVQHDLFRVAEFPHGYVSCKNIAKM 1240 1250 1260 1270 1280 1290 1330 1340 1350 1360 1370 1380 KIAA02 DLRVWQDCCEDCRTRGQFNAFSYHFRGRRSLEFSYQEDKPTKKTRPRKIPSVGRQGEHLS ::::::::::::::::::..:: ::::.:: : ::.::. : :: .. gi|134 DLRVWQDCCEDCRTRGQFSTFSNHFRGKRSTEHSYKEDN--------KEPS--SLLNQSV 1300 1310 1320 1330 1340 1390 1400 1410 1420 1430 1440 KIAA02 NSTSAFSTRSDASGTNDFREFVLEMQKTITDLRTQIKKLESRLSTTECVDAGGESHANNT :.: .. .:::.::::.:::::: :: ::::::::::.:.:.: ::::... gi|134 NTTCNTEQPKNLPHVNDFKEFVLDMQKTITGLRKQIKKLESRLSNTDCTDETGESHSTKE 1350 1360 1370 1380 1390 1400 1450 1460 1470 1480 1490 KIAA02 KWKKDACTICECKDGQVTCFVEACPPATCAVPVNIPGACCPVCLQKRAEEKP ::.::::: ::: .:..::::..:::..:. : : :.::::: . . . gi|134 KWNKDACTKCECYNGHITCFVKSCPPVNCSRPQRIEGVCCPVCTDDKIQST 1410 1420 1430 1440 1450 1460 >>gi|133778327|gb|AAI12914.1| Pxdn protein [Mus musculus (1106 aa) initn: 6942 init1: 6355 opt: 6944 Z-score: 7706.0 bits: 1438.1 E(): 0 Smith-Waterman score: 6944; 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