# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hf00389s1.fasta.nr -Q ../query/KIAA0300.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0300, 2847 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7815783 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.5513+/-0.000198; mu= 11.5686+/- 0.011 mean_var=122.8692+/-22.947, 0's: 36 Z-trim: 80 B-trim: 0 in 0/68 Lambda= 0.115705 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 45, opt: 33, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|145559516|sp|O15018.4|PDZD2_HUMAN RecName: Full (2839) 18766 3145.7 0 gi|119631182|gb|EAX10777.1| hCG2039413, isoform CR (2665) 17576 2947.0 0 gi|114600804|ref|XP_526957.2| PREDICTED: PDZ domai (2443) 15739 2640.4 0 gi|12751452|gb|AAK07661.1|AF338650_1 PDZ domain-co (2641) 13265 2227.4 0 gi|194388340|dbj|BAG65554.1| unnamed protein produ (1070) 6914 1166.9 0 gi|124486716|ref|NP_001074533.1| PDZ domain contai (2796) 6720 1134.9 0 gi|148671318|gb|EDL03265.1| mCG7214 [Mus musculus] (2573) 3851 656.0 2e-184 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1.6e-44 gi|12854548|dbj|BAB30066.1| unnamed protein produc ( 170) 1031 184.3 1.3e-43 gi|74202097|dbj|BAE23036.1| unnamed protein produc ( 171) 954 171.4 9.5e-40 gi|194378268|dbj|BAG57884.1| unnamed protein produ ( 132) 870 157.3 1.3e-35 gi|189539066|ref|XP_691830.3| PREDICTED: similar t (1054) 874 158.7 4e-35 gi|86212163|gb|ABC87741.1| interleukin-16 [Tetraod (1266) 861 156.6 2e-34 gi|73951277|ref|XP_860817.1| PREDICTED: similar to (1283) 852 155.1 5.9e-34 gi|114658513|ref|XP_001157183.1| PREDICTED: interl (1244) 850 154.8 7.2e-34 gi|119619507|gb|EAW99101.1| interleukin 16 (lympho (1244) 847 154.3 1e-33 gi|119619504|gb|EAW99098.1| interleukin 16 (lympho (1291) 847 154.3 1e-33 gi|126273708|ref|XP_001367451.1| PREDICTED: hypoth (1471) 847 154.3 1.2e-33 gi|74194106|dbj|BAE36953.1| unnamed protein produc ( 170) 818 148.7 6.5e-33 gi|73951273|ref|XP_545880.2| PREDICTED: similar to (1329) 819 149.6 2.7e-32 gi|73951275|ref|XP_860788.1| PREDICTED: similar to (1335) 819 149.6 2.7e-32 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