# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hg00063.fasta.huge -Q ../query/KIAA0306.ptfa ./tmplib.23147 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. 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KIAA05 VSAEGVTV-----EEPASERLKPETQ---ETRPREKPPLPATKAVPTPRQSTVPKLPAVH 1090 1100 1110 1120 1130 1090 1100 1110 1120 1130 KIAA03 TPTARSSPPLPPPAEERTSAKGPETMASKFPSS----SSDWRVPGQGLEN---RGEPPTP :. :: : :: .: : ... : : .:: . .:. . : : : KIAA05 PARLRKLSFLPTP---RT--QGSEDVVQAFISEIGIEASDLSSLLEQFEKSEAKKECP-P 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1140 1150 1160 1170 1180 1190 KIAA03 PSPAPAPAVAPGGSSESSSGRAAGDTPERKEAAGTGKKVKVRPPP--LKKTFDSVDNRVL :.:: . ::. .:. . . . : . : :... . :: : : . .:. .: KIAA05 PAPADSLAVGNSGGVDIPQEKRPLDRLQAPELANVAGLTPPATPPHQLWKPLAAVS--LL 1200 1210 1220 1230 1240 1250 1200 1210 1220 1230 1240 1250 KIAA03 SEVDFEERFAELPEFRPEEVLPSPTLQSLATSPRAILGSYRKKRKNSTDLDSAPEDPTSP ... . :. ..:: : . .. . ... : : . .: : : .. : : KIAA05 AKAKSPKSTAQEGTLKPEGVTEAKHPAAVRLQ-EGVHGPSRVHV-GSGDHDYCVRSRTPP 1260 1270 1280 1290 1300 1260 1270 1280 1290 1300 1310 KIAA03 KRKMRRRSSCSSEPNTPKSAKCEGDIFTFDRTGTEAEDVLGELEYDKVPYSSLRRTLDQR :. KIAA05 KKMPALVIPEVGSRWNVKRHQDITIKPVLSLGPAAPPPPCIAASREPLDHRTSSEQADPS 1310 1320 1330 1340 1350 1360 1451 residues in 1 query sequences 1986054 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:15:34 2008 done: Thu Dec 18 15:15:35 2008 Total Scan time: 0.850 Total Display time: 0.250 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]