# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hg00096s1.fasta.huge -Q ../query/KIAA0309.ptfa ./tmplib.23147 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0309, 3053 aa vs ./tmplib.23147 library 1984452 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 17.1381+/-0.0146; mu= -38.0213+/- 0.990 mean_var=850.3128+/-202.630, 0's: 0 Z-trim: 35 B-trim: 8 in 1/39 Lambda= 0.043983 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 46, opt: 34, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1498 ( 1731 res) hh01611 (1731) 1609 119.6 1.1e-26 KIAA1259 ( 1561 res) hh15706 (1561) 692 61.3 3.3e-09 KIAA0444 ( 978 res) hg00035 ( 978) 562 52.9 7.1e-07 KIAA1122 ( 1048 res) hj01698 (1048) 526 50.7 3.6e-06 KIAA1564 ( 2432 res) fh20840s1 (2432) 527 51.0 6.6e-06 KIAA1416 ( 1966 res) hh02957s1 (1966) 517 50.3 8.7e-06 KIAA1335 ( 2041 res) bf00973 (2041) 508 49.8 1.3e-05 KIAA0308 ( 2759 res) ee00163 (2759) 511 50.1 1.5e-05 KIAA0306 ( 1451 res) hg00063 (1451) 493 48.7 2e-05 KIAA1760 ( 2219 res) af00030 (2219) 480 48.0 4.8e-05 KIAA1887 ( 967 res) fk02232 ( 967) 437 45.0 0.00017 KIAA1471 ( 1421 res) fj02383s1 (1421) 429 44.6 0.00033 KIAA1683 ( 832 res) fh24307 ( 832) 373 40.9 0.0026 KIAA0618 ( 1052 res) hg03971 (1052) 365 40.5 0.0043 KIAA0613 ( 734 res) hg01088b ( 734) 358 39.9 0.0045 KIAA0656 ( 912 res) hk01789 ( 912) 355 39.8 0.0061 KIAA0754 ( 1174 res) hh06485 (1174) 356 39.9 0.007 KIAA1818 ( 1157 res) hg00622 (1157) 354 39.8 0.0076 >>KIAA1498 ( 1731 res) hh01611 (1731 aa) initn: 2382 init1: 863 opt: 1609 Z-score: 571.0 bits: 119.6 E(): 1.1e-26 Smith-Waterman score: 2126; 35.178% identity (58.216% similar) in 1211 aa overlap (10-1192:664-1622) 10 20 30 KIAA03 VSDGMTGSNPVSPASSSSPASSGAGGISPQHIAQDSSLD :.: .:: .:.:... : :: :..: .. 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KIAA14 --IATFSANPEA----KGGEVVKIAQLASITGPQSRVAQPETPVTLQFQGSKFTLSHSQL 1480 1490 1500 1510 1520 1110 1120 1130 1140 1150 KIAA03 RQLAVGQPRPLQ--------MP--PTMVNNTGVVKIVVRQAP--RDGLTPVPPL---APA :::..::: :: : : . :: .: :: . .: :: .:: KIAA14 RQLTAGQPLQLQGSVLQIVSAPGQPYLRAPGPVVMQTVSQAGAVHGALGSKPPAGGPSPA 1530 1540 1550 1560 1570 1580 1160 1170 1180 1190 1200 1210 KIAA03 PRPPSSGLPA--VLNPRPTLTPGRLPTPTLGTARAPMPTPTLVRPLLKLVHSPSPEVSAS : :. :.:. ..: . :: :. .:. :: KIAA14 PLTPQVGVPGRVAVNALAVGEPGTASKPA-----SPIGGPTQEEKTRLLKERLDQIYLVN 1590 1600 1610 1620 1630 1640 1220 1230 1240 1250 1260 1270 KIAA03 APGAAPLTISSPLHVPSSLPGPASSPMPIPNSSPLASPVSSTVSVPLSSSLPISVPTTLP KIAA14 ERRCSQAPVYGRDLLRICALPSHGRVQWRGSLDGRRGKEAGPAHSYTSSSESPSELMLTL 1650 1660 1670 1680 1690 1700 >>KIAA1259 ( 1561 res) hh15706 (1561 aa) initn: 1356 init1: 635 opt: 692 Z-score: 257.1 bits: 61.3 E(): 3.3e-09 Smith-Waterman score: 1061; 45.133% identity (75.811% similar) in 339 aa overlap (578-897:498-836) 550 560 570 580 590 600 KIAA03 GSGPPTPGPTTLGPKKEITDIAAAAESLQPKGYTLATTQVKT----PIPLLLRGQLREYQ ..:.::. .... : : .. :.:. :: KIAA12 QARTRSFDEDAKESRAAALRAANKSGTGFGESYSLANPSIRAGEDIPQPTIFNGKLKGYQ 470 480 490 500 510 520 610 620 630 640 650 660 KIAA03 HIGLDWLVTMYEKKLNGILADEMGLGKTIQTISLLAHLACEKGNWGPHLIIVPTSVMLNW :..::...::. .:::::::::::::.:.:.:::::: ... ::: ::: :.:.. :: KIAA12 LKGMNWLANLYEQGINGILADEMGLGKTVQSIALLAHLAERENIWGPFLIISPASTLNNW 530 540 550 560 570 580 670 680 690 700 710 KIAA03 EMELKRWCPSFKILTYYGAQKERKLKRQGW------TKPNAFHVCITSYKLVLQDHQAFR ..:. :. :.::.: :.: ..::. :. : :. ::: ::::.::.:: . :. KIAA12 HQEFTRFVPKFKVLPYWGNPHDRKVIRRFWSQKTLYTQDAPFHVVITSYQLVVQDVKYFQ 590 600 610 620 630 640 720 730 740 750 760 770 KIAA03 RKNWRYLILDEAQNIKNFKSQRWQSLLNFNSQRRLLLTGTPLQNSLMELWSLMHFLMPHV : .:.:..::::: .:. .: ::. ::.:. . ::::::::.::.. :::.:.::.:: . KIAA12 RVKWQYMVLDEAQALKSSSSVRWKILLQFQCRNRLLLTGTPIQNTMAELWALLHFIMPTL 650 660 670 680 690 700 780 790 800 810 820 830 KIAA03 FQSHREFKEWFSNPLTGMIEGSQEYNEGLVKRLHKVLRPFLLRRVKVDVEKQMPKKYEHV :.::.::.::::. . . :... .:. ..::: .:.::.:::.: :::... : : . KIAA12 FDSHEEFNEWFSKDIESHAENKSAIDENQLSRLHMILKPFMLRRIKKDVENELSDKIEIL 710 720 730 740 750 760 840 850 860 870 880 KIAA03 IRCRLSKRQRCLY---------DDFMAQTTTKETLATGHFMSVINILMQLRKVCNHPNLF . :.:..::. :: .:.. .. . : . :..:..::.:::::::.:: KIAA12 MYCQLTSRQKLLYQALKNKISIEDLLQSSMGSTQQAQNTTSSLMNLVMQFRKVCNHPELF 770 780 790 800 810 820 890 900 910 920 930 940 KIAA03 DPRPVTSPFITPGICFSTASLVLRATDVHPLQRIDMGRFDLIGLEGRVSRYEADTFLPRH . . . ::: KIAA12 ERQETWSPFHISLKPYHISKFIYRHGQIRVFNHSRDRWLRVLSPFAPDYIQRSLFHRKGI 830 840 850 860 870 880 >>KIAA0444 ( 978 res) hg00035 (978 aa) initn: 668 init1: 319 opt: 562 Z-score: 215.3 bits: 52.9 E(): 7.1e-07 Smith-Waterman score: 562; 33.645% identity (64.486% similar) in 321 aa overlap (1866-2178:48-361) 1840 1850 1860 1870 1880 1890 KIAA03 ELWPRARPLHRIVCNMRTQFPDLRLIQYDCGKLQTLAVLLRQLKAEGHRVLIFTQMTRML :::. : .:..:. ::::::::.:::.:: KIAA04 NHPYLFPVAAVEAPVLPNGSYDGSSLVKSSGKLMLLQKMLKKLRDEGHRVLIFSQMTKML 20 30 40 50 60 70 1900 1910 1920 1930 1940 1950 KIAA03 DVLEQFLTYHGHLYLRLDGSTRVEQRQALMERFNAD-KRIFCFILSTRSGGVGVNLTGAD :.::.:: :.:. : :.::. :: ..:::: . :::.::::.::.:.::. :: KIAA04 DLLEDFLEYEGYKYERIDGGITGGLRQEAIDRFNAPGAQQFCFLLSTRAGGLGINLATAD 80 90 100 110 120 130 1960 1970 1980 1990 2000 2010 KIAA03 TVVFYDSDWNPTMDAQAQDRCHRIGQTRDVHIYRLISERTVEENILKKANQKRMLGDMAI ::..::::::: : :: .: :::::.. : :::.... .::: : . :..: :: ... KIAA04 TVIIYDSDWNPHNDIQAFSRAHRIGQNKKVMIYRFVTRASVEERITQVAKRKMMLTHLVV 140 150 160 170 180 190 2020 2030 2040 2050 2060 2070 KIAA03 EGG-NFTTAYFKQQTIRELFDMPLEEPSSSSVPSAPEEEEETVASKQTHILEQALCRAED . : . .. . .: . ... . :: ...: . . .. :. .. : . KIAA04 RPGLGSKSGSMTKQELDDILKFGTEELFKDDVEGMMSQGQRPVTPIPDVQSSKGGNLAAS 200 210 220 230 240 250 2080 2090 2100 2110 2120 2130 KIAA03 EEDIRAATQAKAEQVAELAEFNENDGFPAGEGEEAGRPGAEDEEMSRAEQEIAALVEQLT . ...: .. .: . . : .. . .. ...: :.. .. .... KIAA04 AKKKHGSTPPGDNKDVEDSSVIHYDDAAISKLLDRNQDATDDTELQNMNEYLSSF----- 260 270 280 290 300 310 2140 2150 2160 2170 2180 KIAA03 PIERYAMKFLEASLEEVSREELKQAEEQVEAA------RKDLDQAKEEVFRLPQEEEEGP . .:... : ..::: :: .:: ::.:. :. .: .:.. : KIAA04 KVAQYVVRE-EDGVEEVEREIIKQ-EENVDPDYWEKLLRHHYEQQQEDLARNLGKGKRIR 320 330 340 350 360 370 2190 2200 2210 2220 2230 2240 KIAA03 GAGDESSCGTGGGTHRRSKKAKAPERPGTRVSERLRGARAETQGANHTPVISAHQTRSTT KIAA04 KQVNYNDASQEDQEWQDELSDNQSEYSIGSEDEDEDFEERPEGQSGRRQSRRQLKSDRDK 380 390 400 410 420 430 >>KIAA1122 ( 1048 res) hj01698 (1048 aa) initn: 1173 init1: 512 opt: 526 Z-score: 202.5 bits: 50.7 E(): 3.6e-06 Smith-Waterman score: 798; 29.542% identity (59.527% similar) in 677 aa overlap (264-887:148-809) 240 250 260 270 280 290 KIAA03 QPLTSSKAGSSPCLGSSSAASSPPPPASRLDDEDGDFQPQEDEEEDDEETIE-VEEQQEG .::... : ...:: .: . : .. KIAA11 SEDVVSPNCSNTVQEKTFNKDTVIIVSEPSEDEESQGLPTMARRNDDISELEDLSELEDL 120 130 140 150 160 170 300 310 320 330 340 KIAA03 NDAEAQRREIELLRREGELPLEELLRSLPPQLLEGPSSPSQTPSSHDSDTRDGPEE---G .::. : . ::. .... : .:..: . ..: . . . :. ::.. . KIAA11 KDAKLQTLK-ELFPQRSDNDLLKLIES--TSTMDGAIAAALLMFG---DAGGGPRKRKLS 180 190 200 210 220 230 350 360 370 380 390 400 KIAA03 AEEEPPQVLEIKPPPSAVTQRNKQPWHPDEDDEEFTANEEEAEDEEDTIAAEEQLEGEVD . :: . :.. : : : .:..: .:. .....:. . : : KIAA11 SSSEPYEEDEFNDDQSIKKTRLD---HGEESNE--SAESSSNWEKQESIVLKLQKEFPNF 240 250 260 270 280 410 420 430 440 450 460 KIAA03 HAMELSELAREGELSMEELLQQYAGAYAPGS-----GSSEDEDEDEVDANSSDCEPEGPV .:: :. .: : . : :.. ..: . ..:: . ::.. :.. :.. . KIAA11 DKQELREVLKEHEWMYTEALESLK-VFAEDQDMQYVSQSEVPNGKEVSSRSQN-YPKNAT 290 300 310 320 330 340 470 480 490 500 510 KIAA03 EAEEPPQEDSSSQSDSVEDRSEDEED-----EHSEEEETS--GSSASEE-SESEESEDAQ ... . . ..:. . :... . : :: . : ::: .:. : .:: . KIAA11 KTKLKQKFSMKAQNGFNKKRKKNVFNPKRVVEDSEYDSGSDVGSSLDEDYSSGEEVMEDG 350 360 370 380 390 400 520 530 540 550 KIAA03 SQSQADEEEEDDDFGVEYLLARDEEQS-------------EADAGSGPPTPG-------- ... . .: ..: :. . ... :: . : : KIAA11 YKGKILHFLQDASIGELTLIPQCSQKKAQKITELRPFNSWEALFTKMSKTNGLSEDLIWH 410 420 430 440 450 460 560 570 580 590 600 KIAA03 -PTTLGPKKEITDIAAAAESLQ---PKGYTLATTQ-----VKTPIPLLLRGQLREYQHIG : . . . . :... : :. : . .. : : .:. ::..: KIAA11 CKTLIQERDVVIRLMNKCEDISNKLTKQVTMLTGNGGGWNIEQPSILNQSLSLKPYQKVG 470 480 490 500 510 520 610 620 630 640 650 660 KIAA03 LDWLVTMYEKKLNGILADEMGLGKTIQTISLLAHLACEKGNWGPHLIIVPTSVMLNWEME :.::. .... ::::::::::::::::.:..::.: ..:: :::::.::.:.. :: : KIAA11 LNWLALVHKHGLNGILADEMGLGKTIQAIAFLAYLY-QEGNNGPHLIVVPASTIDNWLRE 530 540 550 560 570 580 670 680 690 700 710 720 KIAA03 LKRWCPSFKILTYYGAQKERKLKRQGW-TKPNAFHVCITSYKLVLQ---DHQAFRRKNWR .. :::..:.: :::.:.::: : . .. . ..: .:.:. ... :.. ::: . KIAA11 VNLWCPTLKVLCYYGSQEERKQIRFNIHSRYEDYNVIVTTYNCAISSSDDRSLFRRLKLN 590 600 610 620 630 640 730 740 750 760 770 780 KIAA03 YLILDEAQNIKNFKSQRWQSLLNFNSQRRLLLTGTPLQNSLMELWSLMHFLMPHVFQSHR : :.::.. .::. : :.: :...:.. ::::::::.::.:.:: ::..:.:::.:.: KIAA11 YAIFDEGHMLKNMGSIRYQHLMTINANNRLLLTGTPVQNNLLELMSLLNFVMPHMFSSST 650 660 670 680 690 700 790 800 810 820 830 840 KIAA03 -EFKEWFSNPLTGMIEGSQEYNEGLVKRLHKVLRPFLLRRVKVDVEKQMPKKYEHVIRCR :... ::. . : : :.. . . .....::.::::: .: ::.: : ... : KIAA11 SEIRRMFSSKTKSADEQSI-YEKERIAHAKQIIKPFILRRVKEEVLKQLPPKKDRIELCA 710 720 730 740 750 760 850 860 870 880 890 900 KIAA03 LSKRQRCLYDD-FMAQTTTKETLATGHFMSVINILMQLRKVCNHPNLFDPRPVTSPFITP .:..:. :: : . ..:.: . . :..:::::. ::: : KIAA11 MSEKQEQLYLGLFNRLKKSINNLVTEKNTEMCNVMMQLRKMANHPLLHRQYYTAEKLKEM 770 780 790 800 810 820 910 920 930 940 950 960 KIAA03 GICFSTASLVLRATDVHPLQRIDMGRFDLIGLEGRVSRYEADTFLPRHRLSRRVLLEVAT KIAA11 SQLMLKEPTHCEANPDLIFEDMEVMTDFELHVLCKQYRHINNFQLDMDLILDSGKFRVLG 830 840 850 860 870 880 >>KIAA1564 ( 2432 res) fh20840s1 (2432 aa) initn: 899 init1: 277 opt: 527 Z-score: 197.9 bits: 51.0 E(): 6.6e-06 Smith-Waterman score: 682; 27.486% identity (53.591% similar) in 724 aa overlap (234-889:254-953) 210 220 230 240 250 KIAA03 EKRKKALDLHLDFIVGQTEKYSDLLSQSLNQPLTSSKAGSSPCLG-----SSSAASSPPP :: ..:. :.: :. :.: ... KIAA15 VTLSSVQQAQIMGPGQSPGQRLSVPVKVVLQPQAGSSQGASSGLSVVKVLSASEVAALSS 230 240 250 260 270 280 260 270 280 290 300 310 KIAA03 PASRLDDEDGDFQPQEDEEEDDEETIEVEEQQEGNDAEAQRREIELLRREGELPL---EE ::: : .:... . .. .:...: :. : : ..: :. KIAA15 PASSAPHSGGKTGMEENRRLEHQK-----KQEKANRIVAEAIARARARGEQNIPRVLNED 290 300 310 320 330 320 330 340 350 360 370 KIAA03 LLRSLPPQLLEGPSSPSQTPSSHDSDTRDGPEE----GAEEEPPQVLEIKPPPSAVTQRN : :. :. :: .. . :. . .. :.. :: . . ... .: .. KIAA15 ELPSVRPEE-EGEKK-RRKKSAGERLKEEKPKKSKTSGASKTKGKS-KLNTITPVVGKKR 340 350 360 370 380 390 380 390 400 410 KIAA03 KQPWHPDEDDEEFTANEEEAEDEEDTIAAE------------EQLEGEVDHAMELSELAR :. :..: : . ::::..: . :.:. .. : :. KIAA15 KRNTSSDNSDVEVMPAQSPREDEESSIQKRRSNRQVKRKKYTEDLDIKITDDEEEEEVDV 400 410 420 430 440 450 420 430 440 450 460 470 KIAA03 EGELSMEELL----QQYAGAYAPGSGSSEDEDEDEVDANSSDCEPEGPVEAEEPPQEDSS : .. : .: :. : : : . :. .: :: : . .: :. . KIAA15 TGPIKPEPILPEPVQEPDGETLP-SMQFFVENPSEEDAAIVDKVLSMRIVKKELPS-GQY 460 470 480 490 500 510 480 490 500 510 520 KIAA03 SQSDSVEDRSEDEEDEHSEEEETS----GSSASEESESEESEDAQSQS--QADEEEEDDD .... . .. : : : . .. . ... :: . . ::: . : KIAA15 TEAEEFFVKYKNYSYLHCEWATISQLEKDKRIHQKLKRFKTKMAQMRHFFHEDEEPFNPD 520 530 540 550 560 570 530 540 550 560 570 KIAA03 FGVEYLLARDEEQSEADAGSGPPT----------PGPTTLGPKKEITDIAAAAE-----S . :: :: .: : .: :. : . :: .: . : : KIAA15 Y-VEVDRILDESHS-IDKDNGEPVIYYLVKWCSLPYEDSTWELKEDVDEGKIREFKRIQS 580 590 600 610 620 630 580 590 600 610 620 KIAA03 LQPKGYTLATTQVKTPIPLLL------RGQLREYQHIGLDWLVTMYEKKLNGILADEMGL .:. . :... : : :.:::::: :..::. . .. : :::::::: KIAA15 RHPELKRVNRPQASAWKKLELSHEYKNRNQLREYQLEGVNWLLFNWYNRQNCILADEMGL 640 650 660 670 680 690 630 640 650 660 670 680 KIAA03 GKTIQTISLLAHLACEKGNWGPHLIIVPTSVMLNWEMELKRWCPSFKILTYYGAQKERKL :::::.:..: .. . : :: :.:.: :.. ::: :.. : .. ..:.:. :.. KIAA15 GKTIQSIAFLQEVY-NVGIHGPFLVIAPLSTITNWEREFNTWTE-MNTIVYHGSLASRQM 700 710 720 730 740 690 700 710 720 730 KIAA03 KRQ---------GWTKPNA--FHVCITSYKLVLQDHQAFRRKNWRYLILDEAQNIKNFKS .: : :.: : . ::.....:.: .:. .:: .:.:::. .:: . KIAA15 IQQYEMYCKDSRGRLIPGAYKFDALITTFEMILSDCPELREIEWRCVIIDEAHRLKNRNC 750 760 770 780 790 800 740 750 760 770 780 790 KIAA03 QRWQSLLNFNSQRRLLLTGTPLQNSLMELWSLMHFLMPHVFQSHREFKEWFSNPLTGMIE . .:: ... ....:::::::::.. ::.::.::: : : :. :: . :.. : KIAA15 KLLDSLKHMDLEHKVLLTGTPLQNTVEELFSLLHFLEPSQFPSESEFLKDFGDLKT---- 810 820 830 840 850 860 800 810 820 830 840 850 KIAA03 GSQEYNEGLVKRLHKVLRPFLLRRVKVDVEKQMPKKYEHVIRCRLSKRQRCLYDDFMAQT : :..:. .:.:..:::.: ::::.. : : .:. .:.. :. : .. .. KIAA15 ------EEQVQKLQAILKPMMLRRLKEDVEKNLAPKQETIIEVELTNIQKKYYRAILEKN 870 880 890 900 910 860 870 880 890 900 910 KIAA03 TTKETLATGH--FMSVINILMQLRKVCNHPNLFDPRPVTSPFITPGICFSTASLVLRATD . . ..:: . ...: .:.::: :::: :.. KIAA15 FSFLSKGAGHTNMPNLLNTMMELRKCCNHPYLINGAEEKILTEFREACHIIPHDFHLQAM 920 930 940 950 960 970 920 930 940 950 960 970 KIAA03 VHPLQRIDMGRFDLIGLEGRVSRYEADTFLPRHRLSRRVLLEVATAPDPPPRPKPVKMKV KIAA15 VRSAGKLVLIDKLLPKLKAGGHKVLIFSQMVRCLDILEDYLIQRRYLYERIDGRVRGNLR 980 990 1000 1010 1020 1030 >>KIAA1416 ( 1966 res) hh02957s1 (1966 aa) initn: 1032 init1: 301 opt: 517 Z-score: 195.8 bits: 50.3 E(): 8.7e-06 Smith-Waterman score: 645; 30.891% identity (56.832% similar) in 505 aa overlap (445-889:7-497) 420 430 440 450 460 KIAA03 SELAREGELSMEELLQQYAGAYAPGSGSSEDEDEDEVDA-------NSSDCEPEGPVEAE ::. :..:: :.:. : . :.:: KIAA14 LEFKISDEEADDADAAGRDSPSNTSQSEQQESVDAE 10 20 30 470 480 490 500 510 KIAA03 EPPQEDSSSQSDSVEDRSEDEEDEHSEEEETSGSSAS---------EESESEES------ : : : : ::. ..:. :. . :: .. .. : :. :... KIAA14 GPVVEKIMS-SRSVKKQKESGEEVEIEEFYVKYKNFSYLHCQWASIEDLEKDKRIQQKIK 40 50 60 70 80 90 520 530 540 550 KIAA03 --EDAQSQSQADEEEEDDDFGVEYL-LAR--DEEQSEADAGSGPPT---------PGPTT . :.:.. : ::. :. .:. . : : .: : : : : : . KIAA14 RFKAKQGQNKFLSEIEDELFNPDYVEVDRIMDFARSTDDRGE-PVTHYLVKWCSLPYEDS 100 110 120 130 140 150 560 570 580 590 600 KIAA03 LGPKKEITDIAAAAESLQPKGYTLATTQVKTPIPLLLR-----------GQLREYQHIGL ... : : : . . : .:. : . ..::::: :. KIAA14 TWERRQDIDQAKIEEFEKLMSREPETERVERPPADDWKKSESSREYKNNNKLREYQLEGV 160 170 180 190 200 210 610 620 630 640 650 660 KIAA03 DWLVTMYEKKLNGILADEMGLGKTIQTISLLAHLACEKGNWGPHLIIVPTSVMLNWEMEL .::. . . : :::::::::::::.:..: .. :: :: :.:.: :.. ::: :. KIAA14 NWLLFNWYNMRNCILADEMGLGKTIQSITFLYEIYL-KGIHGPFLVIAPLSTIPNWEREF 220 230 240 250 260 270 670 680 690 700 710 KIAA03 KRWCPSFKILTYYGAQKERK---LKRQGWTKPNA--------FHVCITSYKLVLQDHQAF . : .....:.:.: :. : .. . :.. ::. ::.....: : . KIAA14 RTWTE-LNVVVYHGSQASRRTIQLYEMYFKDPQGRVIKGSYKFHAIITTFEMILTDCPEL 280 290 300 310 320 330 720 730 740 750 760 770 KIAA03 RRKNWRYLILDEAQNIKNFKSQRWQSLLNFNSQRRLLLTGTPLQNSLMELWSLMHFLMPH : :: ...:::. .:: . . ..: .. ....:::::::::.. ::.::.::: : KIAA14 RNIPWRCVVIDEAHRLKNRNCKLLEGLKMMDLEHKVLLTGTPLQNTVEELFSLLHFLEPS 340 350 360 370 380 390 780 790 800 810 820 830 KIAA03 VFQSHREFKEWFSNPLTGMIEGSQEYNEGLVKRLHKVLRPFLLRRVKVDVEKQMPKKYEH : :. : . :.. : : :..:. .:.:..:::.: ::::.. : : KIAA14 RFPSETTFMQEFGDLKT----------EEQVQKLQAILKPMMLRRLKEDVEKNLAPKEET 400 410 420 430 440 840 850 860 870 880 890 KIAA03 VIRCRLSKRQRCLYDDFMAQTTTKETLATGH--FMSVINILMQLRKVCNHPNLFDPRPVT .:. .:.. :. : .. .. : . . :. ...: .:.::: :::: :.. KIAA14 IIEVELTNIQKKYYRAILEKNFTFLSKGGGQANVPNLLNTMMELRKCCNHPYLINGAEEK 450 460 470 480 490 500 900 910 920 930 940 950 KIAA03 SPFITPGICFSTASLVLRATDVHPLQRIDMGRFDLIGLEGRVSRYEADTFLPRHRLSRRV KIAA14 ILEEFKETHNAESPDFQLQAMIQAAGKLVLIDKLLPKLKAGGHRVLIFSQMVRCLDILED 510 520 530 540 550 560 >>KIAA1335 ( 2041 res) bf00973 (2041 aa) initn: 597 init1: 300 opt: 508 Z-score: 192.5 bits: 49.8 E(): 1.3e-05 Smith-Waterman score: 508; 32.743% identity (60.767% similar) in 339 aa overlap (1856-2181:97-428) 1830 1840 1850 1860 1870 1880 KIAA03 QAAFQEQLASELWPRARPLHRIVCNMRTQFPDLRL---IQYDCGKLQTLAVLLRQLKAEG ::..: :: ::: . :: .: : : KIAA13 LRKCCNHPYLINGAEEKILEDFRKTHSPDAPDFQLQAMIQA-AGKLVLIDKLLPKLIAGG 70 80 90 100 110 120 1890 1900 1910 1920 1930 1940 KIAA03 HRVLIFTQMTRMLDVLEQFLTYHGHLYLRLDGSTRVEQRQALMERF-NADKRIFCFILST :.::::.::.: ::.::..: . . : :.:: .: . ::: ..:: . :. : :.: : KIAA13 HKVLIFSQMVRCLDILEDYLIQRRYTYERIDGRVRGNLRQAAIDRFCKPDSDRFVFLLCT 130 140 150 160 170 180 1950 1960 1970 1980 1990 2000 KIAA03 RSGGVGVNLTGADTVVFYDSDWNPTMDAQAQDRCHRIGQTRDVHIYRLISERTVEENILK :.::.:.:::.::: ...:::::: : ::: :::::::.. :..::::.. . :.... KIAA13 RAGGLGINLTAADTCIIFDSDWNPQNDLQAQARCHRIGQSKAVKVYRLITRNSYEREMFD 190 200 210 220 230 240 2010 2020 2030 2040 2050 KIAA03 KAN-----QKRMLGDMAIEGGNFTTAYFKQQTIRELFDMPLEEPSSSSVPSAPEEEEETV ::. .: .: :. .:: : .: . :. :. :.. . ... . .: . KIAA13 KASLKLGLDKAVLQDINRKGG---TNGVQQLSKMEVEDL-LRKGAYGALMDEEDEGSKFC 250 260 270 280 290 300 2060 2070 2080 2090 2100 2110 KIAA03 ASKQTHILEQALCRAEDEEDIRAATQAKAEQVAELAEFNENDGFPAGEGEEAGRPGAEDE .::.. . . ...: ::: :: . . . : . .. .. . : KIAA13 EEDIDQILQRRTHTITIQSEGKGSTFAKASFVASGNRTDISLDDP-NFWQKWAKIAELDT 310 320 330 340 350 360 2120 2130 2140 2150 2160 2170 KIAA03 EMSRAEQEIAALVEQLTPIERYAMKFLEASLEEVSREELKQAEEQVEAARKDLDQAKE-- : . .. .. .. .. .: : : : : : ....:. .:. :.:.. KIAA13 EAKNEKESLVIDRPRVRKQTKHYNSFEEDELMEFS-ELDSDSDERPTRSRRLNDKARRYL 370 380 390 400 410 2180 2190 2200 2210 2220 2230 KIAA03 --EVFRLPQEEEEGPGAGDESSCGTGGGTHRRSKKAKAPERPGTRVSERLRGARAETQGA : ::. . KIAA13 RAECFRVEKNLLIFGWGRWKDILTHGRFKWHLNEKDMEMICRALLVYCVKHYKGDEKIKS 420 430 440 450 460 470 >>KIAA0308 ( 2759 res) ee00163 (2759 aa) initn: 964 init1: 292 opt: 511 Z-score: 191.7 bits: 50.1 E(): 1.5e-05 Smith-Waterman score: 633; 25.926% identity (52.778% similar) in 756 aa overlap (195-887:294-1026) 170 180 190 200 210 220 KIAA03 RREEQAKLRRIASTMAKDVRQFWSNVEKVVQFKQQSRLEEKRKKALDLHLD--FIVGQTE .: ... ... .. :: :: : . KIAA03 EENLLHQVESQTEPFTGLDPEDLLQEGLLPHFDESTFGQDNSSHILDHDLDRQFTSHLVT 270 280 290 300 310 320 230 240 250 260 270 KIAA03 KYSDLLS---QSLNQPLTSSKAGSSPCLGSSSAASSPPPPASRLDDEDGDFQPQEDE--- . ::. . :: . :: .. . . . ::.:. .: .: . .. KIAA03 RPSDMAQTQLQSQARSWHSSFSNHQHLHDRNHLCLQRQPPSSKKSDGSGTYTKLQNTQVR 330 340 350 360 370 380 280 290 300 310 320 330 KIAA03 ---EEDDEETIEVEEQQEGND---AEAQRREIELLRREGELPLEELLRSLPPQLLEGPSS :. ... .: : .:: . .:: . : : : ..: ...: .:: KIAA03 VMSEKKQRKKVESESKQEKANRIISEAIAKAKE--RGERNIPRVMSPENFPTASVEGKEE 390 400 410 420 430 440 340 350 360 370 380 KIAA03 PS---QTPSSHDSDTRDGPEEGAEEEPPQVLEIKPPPSAVTQRNKQPWHPDEDDEEFTAN . . . .:.:.. . .: .. .. .: .:: . . .:: :. KIAA03 KKGRRMKSKPKDKDSKKTKTCSKLKEKTKIGKL-----IITLGKKQKRKNESSDEISDAE 450 460 470 480 490 390 400 410 420 430 440 KIAA03 EEEAEDEEDTIAAEEQLEGEVDHAMELSELAREGELSMEELL--QQYAGAYAPGSGSSED . . .: . ... . .. . .. ::. : ::. .. :: : . KIAA03 QMPQHTLKDQDSQKRRSNRQIKRKKYAEDI--EGKQSEEEVKGSMKIKKNSAPLPGEQPL 500 510 520 530 540 550 450 460 470 480 490 KIAA03 ----EDEDEVDANSSD-CEPEGPVEAEEPP--QEDSSSQSDSVEDRSEDEEDEHSEEEET :. .: :: : :. : : . :. . .. : . . .::. 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KIAA03 YLVKWCSLPYEDSTWELKEDVDLAKIEEFEQLQASRPDTRCLDRPPSNIWKKIDQSRDYK 680 690 700 710 720 730 600 610 620 630 640 650 KIAA03 --GQLREYQHIGLDWLVTMYEKKLNGILADEMGLGKTIQTISLLAHLACEKGNWGPHLII .:::::: ::.::. . .. : :::::::::::::.:..: .. : :: ::: KIAA03 NGNQLREYQLEGLNWLLFNWYNRRNCILADEMGLGKTIQSITFLYEILLT-GIRGPFLII 740 750 760 770 780 790 660 670 680 690 700 KIAA03 VPTSVMLNWEMELKRWCPSFKILTYYGAQKERKLKRQ---------GWTKPNA--FHVCI .: :.. ::: :.. : ......:.:. :.. .: : .: :.. : KIAA03 APLSTIANWEREFRTWT-DINVVVYHGSLISRQMIQQYEMYFRDSQGRIIRGAYRFQAII 800 810 820 830 840 850 710 720 730 740 750 760 KIAA03 TSYKLVLQDHQAFRRKNWRYLILDEAQNIKNFKSQRWQSLLNFNSQRRLLLTGTPLQNSL :.....: . .:: .:.:::. .:: . . ..: .: ....:::::::::.. KIAA03 TTFEMILGGCGELNAIEWRCVIIDEAHRLKNKNCKLLEGLKLMNLEHKVLLTGTPLQNTV 860 870 880 890 900 910 770 780 790 800 810 820 KIAA03 MELWSLMHFLMPHVFQSHREFKEWFSNPLTGMIEGSQEYNEGLVKRLHKVLRPFLLRRVK ::.::.::: : : :. : . :.. : : :..:. .:.:..:::.: KIAA03 EELFSLLHFLEPLRFPSESTFMQEFGDLKT----------EEQVQKLQAILKPMMLRRLK 920 930 940 950 960 830 840 850 860 870 880 KIAA03 VDVEKQMPKKYEHVIRCRLSKRQRCLYDDFMAQTTTKETLATGHFM--SVINILMQLRKV ::::.. : : .:. .:.. :. : .. .. . . ..:. ...: .:.::: KIAA03 EDVEKKLAPKEETIIEVELTNIQKKYYRAILEKNFSFLSKGAGQTNVPNLVNTMMELRKC 970 980 990 1000 1010 1020 890 900 910 920 930 940 KIAA03 CNHPNLFDPRPVTSPFITPGICFSTASLVLRATDVHPLQRIDMGRFDLIGLEGRVSRYEA :::: : KIAA03 CNHPYLIKGAEEKILGEFRDTYNPAASDFHLQAMIQSAGKLVLIDKLLPKMKAGGHKVLI 1030 1040 1050 1060 1070 1080 >>KIAA0306 ( 1451 res) hg00063 (1451 aa) initn: 222 init1: 115 opt: 493 Z-score: 189.3 bits: 48.7 E(): 2e-05 Smith-Waterman score: 586; 28.993% identity (50.000% similar) in 814 aa overlap (1004-1767:413-1149) 980 990 1000 1010 1020 1030 KIAA03 KVNRMLQPVPKQEGRTVVVVNNPRAPLGPVPVRPPPGPELSAQPTPGPVPQVLPASLMVS :.:::: : .. ::. . . :: . .. 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KIAA03 PA-TATPAPTSPFPSATAGSMTYSLVAPKAQRPS--PKAPQKVKAAIASI--PVG---SF 990 1000 1010 1020 1030 1650 1660 1670 1680 1690 1700 KIAA03 VVSASG-AAPLPVTMVSRLPVSKDE-PDT-LTLRSGPPSPPSTATSFGGPRPRRQPPPPP ..::: .: : . :: . :.. : . ::.:: .. : : .:: :: KIAA03 EAGASGRPGPAPRQPLEPGPVREPTAPESELEGQPTPPAPPPLPETWT-PTARSSPPLPP 1040 1050 1060 1070 1080 1090 1710 1720 1730 1740 1750 1760 KIAA03 RSPFYLDSLEEKRKRQRSERLERIFQLSEAHGALAPVYGTEVLDFCTLPQPVASPIGPRS . ::. . . : . : : . .: : : : : .: . 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KIAA17 GESSAEPP-PSDMGTVGGQASHPQTLGARALGSPR----KRPEQQDVSSPAKTVGRFSVV 1700 1710 1720 1730 1740 2570 2580 2590 2600 2610 KIAA03 PGQPP----GPKVLRKLPGRLVTVVE-----EKELVRRRRQQRGAASTLVPGVSETSASP : .:. :: : . : . .:. :: : .::.. ::.: .: KIAA17 STQDEWTLASPHSLRYSAPPDVYLDEAPSSPDVKLAVRRAQ---TASSIEVGVGEPVSSD 1750 1760 1770 1780 1790 1800 2620 2630 2640 2650 2660 KIAA03 GSPSVRSMSGPESSPPIGGPCEAAPSSSLPTPPQQPFIA--RRHIELGVTGGGSPENGDG .. ::.. ::. :.:. . : .: . : : .: KIAA17 SGD-----EGPRARPPVQKQASLPVSGSVAGDFVKKATAFLQRPSRAGSLGPETPSRVGM 1810 1820 1830 1840 1850 2670 2680 2690 2700 2710 2720 KIAA03 ALLAITPPAVKRRRGRPPKKNRSP---ADAGRGVDEAPSSTLKGKTN-GADPVPGPETLI . .:. . . . . . : : :: . .. . :: .. .. :.: KIAA17 KVPTISVTSFHSQSSYISSDNDSELEDADIKKELQSLREKHLKEISELQSQQKQEIEALY 1860 1870 1880 1890 1900 1910 2730 2740 2750 2760 2770 2780 KIAA03 --VADPVLEPQLIPGPQPLGPQPVHRPNPLLSPVEKRRRGRPPKARDLPIPGTISSAGDG .. : : :.. : .: :. : . : . : .:.: . . ::.: KIAA17 RRLGKP-LPPNV--GFFHTAP-PTGRRRKTSKSKLKAGKLLNPLVRQLKV--VASSTGHL 1920 1930 1940 1950 1960 1970 2790 2800 2810 2820 2830 2840 KIAA03 NSESRTQPPPHPSPLTPLPPLLVCPTATVANTVTTVTISTSPPKRKRGRPPKNPPSPRPS . :: : :. :.:. :. .. .: .. ..: : : : KIAA17 ADSSRGPPAKDPAQ------------ASVGLTADSTGLS------GKAVQTQQPCSVRAS 1980 1990 2000 2010 2850 2860 2870 2880 2890 KIAA03 QLPVLDRDSTSVLESCGLGRRRQPQGQGESEGSSSDE-----DGSRPLTRLARLRLEAEG :. : : : : : : : ::: . ..: ..:.: .:. . . 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