# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hg00276.fasta.huge -Q ../query/KIAA0317.ptfa ./tmplib.23147 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0317, 826 aa vs ./tmplib.23147 library 1986679 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.4649+/-0.00479; mu= 18.2927+/- 0.327 mean_var=82.9332+/-19.602, 0's: 0 Z-trim: 15 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.140835 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0312 ( 3192 res) ff01724 (3192) 716 156.6 3.9e-38 KIAA0439 ( 995 res) hj00462 ( 995) 593 131.0 6.2e-31 KIAA1320 ( 567 res) fh13757 ( 567) 588 129.7 8.8e-31 KIAA0093 ( 927 res) ha00935 ( 927) 586 129.5 1.6e-30 KIAA0010 ( 1086 res) ha00408 (1086) 532 118.6 3.5e-27 KIAA0322 ( 1614 res) hg00462s1 (1614) 503 113.0 2.7e-25 KIAA1625 ( 859 res) hh15184 ( 859) 500 112.0 2.8e-25 KIAA1301 ( 1581 res) fg06833 (1581) 500 112.3 4e-25 KIAA0896 ( 2820 res) hk08890s2 (2820) 385 89.3 6.3e-18 KIAA0045 ( 2005 res) ha00941 (2005) 291 70.0 2.9e-12 KIAA1131 ( 2168 res) pf08614 (2168) 277 67.2 2.2e-11 KIAA1593 ( 953 res) fj09260 ( 953) 254 62.1 3.3e-10 KIAA0614 ( 3006 res) hg01176s2 (3006) 182 48.1 1.7e-05 KIAA0032 ( 1054 res) ha01920 (1054) 145 40.0 0.0016 KIAA1333 ( 741 res) fh15412 ( 741) 137 38.2 0.004 >>KIAA0312 ( 3192 res) ff01724 (3192 aa) initn: 748 init1: 197 opt: 716 Z-score: 776.6 bits: 156.6 E(): 3.9e-38 Smith-Waterman score: 723; 34.596% identity (67.172% similar) in 396 aa overlap (442-825:2812-3191) 420 430 440 450 460 470 KIAA03 PPVELSCKERNILAATFIRSLHKNIGGSETFQDKVNFFQRELRQVHMKRPHSKVTLKVSR :. : ..:..::... . ....: : KIAA03 TVLNQILRQSTTHLADGPFAVLVDYIRVLDFDVKRKYFRQELERLDEGLRKEDMAVHVRR 2790 2800 2810 2820 2830 2840 480 490 500 510 520 530 KIAA03 HALLESSLKATRNFSISDWSKNFEVVFQDEEALDWGGPRREWFELICKALFDTTNQLFTR ..:.: . . : . .. . .::. ::. : :: :::. .: . .:. :: : KIAA03 DHVFEDSYRELHRKSPEEMKNRLYIVFEGEEGQDAGGLLREWYMIISREMFNPMYALF-R 2850 2860 2870 2880 2890 2900 540 550 560 570 580 KIAA03 FSDNNQALVHPNPNR---PAHLRLKMYEFAGRLVGKCLYESSLGGAYKQLVRARFTRSFL : .... ::. : :: ....:.::.:.: .:.. .:.. ::::: KIAA03 TSPGDRVTYTINPSSHCNPNHL--SYFKFVGRIVAKAVYDN-------RLLECYFTRSFY 2910 2920 2930 2940 2950 590 600 610 620 630 640 KIAA03 AQIIGLRMHYKYFETDDPEFYKSKVCFILNNDMSEM--ELVFAEEKYNKSGQLDKVVELM .:.: ..: .:..: .::.. : ..:.::.: . .:.:. : .. : . .: .: KIAA03 KHILGKSVRYTDMESEDYHFYQGLV-YLLENDVSTLGYDLTFSTE-VQEFG-VCEVRDLK 2960 2970 2980 2990 3000 650 660 670 680 690 700 KIAA03 TGGAQTPVTNANKIFYLNLLAQYRLASQVKEEVEHFLKGLNELVPENLLAIFDENELELL .::. ::. :: :..:. :.:... ..... ::.:. :..:. :..:: :.::::: KIAA03 PNGANILVTEENKKEYVHLVCQMRMTGAIRKQLAAFLEGFYEIIPKRLISIFTEQELELL 3010 3020 3030 3040 3050 3060 710 720 730 740 750 760 KIAA03 MCGTGDISVSDFKAHAVVVGGSWHFREKVMRWFWTVVSSLTQEELARLLQFTTGSSQLPP . : :...:.:... ... ..::: .. :. : . :..:::.::.:..: KIAA03 ISGLPTIDIDDLKSNTEY--HKYQSNSIQIQWFWRALRSFDQADRAKFLQFVTGTSKVPL 3070 3080 3090 3100 3110 3120 770 780 790 800 810 KIAA03 GGFAAL-----CPSFQIIAAPTHST--LPTAHTCFNQLCLPTYDSYEEVHRMLQLAISEG ::::: .::: .:: ::.:::::::: ::.:.:.:....:: :::.: KIAA03 QGFAALEGMNGIQKFQI-HRDDRSTDRLPSAHTCFNQLDLPAYESFEKLRHMLLLAIQEC 3130 3140 3150 3160 3170 3180 820 KIAA03 CEGFGML ::::. 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KIAA04 KGRTYYVNHNNRTTTWTRPIMQLAEDGASGSATNSNN---HLIEPQIRRPRSLSSPTVTL 420 430 440 450 460 470 340 350 360 370 380 KIAA03 D---EEDEDSPSECHTPEKVKKPK--KVYCYVSPK-QFSVKEFYLKIIP-WRLYTFRVCP . : .::: . . . ...:. . : ::: : .: . .: : :.. :. : KIAA04 SAPLEGAKDSPVRRAVKDTLSNPQSPQPSPYNSPKPQHKVTQSFLP--PGWEM---RIAP 480 490 500 510 520 390 400 410 420 KIAA03 -GTKF---------SYLGPD---PVH--KLLTLVVDD-GIQPP-----VELSCKERNILA : : .. : ::: . .: .: : :: ..:. . : KIAA04 NGRPFFIDHNTKTTTWEDPRLKFPVHMRSKTSLNPNDLGPLPPGWEERIHLDGRTFYIDH 530 540 550 560 570 580 430 440 450 460 470 KIAA03 ATFI------RSLHKNIGG-----SETFQDKVNFFQRELRQVHMKRPHSKVTLKVSRHAL . : : . : : :. :..: ..:...:.. :. . .:. :. . KIAA04 NSKITQWEDPRLQNPAITGPAVPYSREFKQKYDYFRKKLKK-PADIPN-RFEMKLHRNNI 590 600 610 620 630 640 480 490 500 510 520 530 KIAA03 LESSLKATRNFSISDWSKN-FEVVFQDEEALDWGGPRREWFELICKALFDTTNQLFTRFS .: : . . . : : . . :..:..::.:: :::: :. : .:. :: . KIAA04 FEESYRRIMSVKRPDVLKARLWIEFESEKGLDYGGVAREWFFLLSKEMFNPYYGLFEYSA 650 660 670 680 690 700 540 550 560 570 580 590 KIAA03 DNNQAL-VHPNPNRPAHLRLKMYEFAGRLVGKCLYESSLGGAYKQLVRARFTRSFLAQII .: .: ..:: . . .:... : ::..: .....: .. : : : ... KIAA04 TDNYTLQINPNSGLCNEDHLSYFTFIGRVAGLAVFHGKLLDGF-------FIRPFYKMML 710 720 730 740 750 760 600 610 620 630 640 650 KIAA03 GLRMHYKYFETDDPEFYKSKVCFILNNDMSEMELVFA--EEKYNKSGQLDKVVELMTGGA : .. . .:. : :.:.: . .::.:: .:..:.: ::..... :.: : .:. KIAA04 GKQITLNDMESVDSEYYNS-LKWILENDPTELDLMFCIDEENFGQTYQVD----LKPNGS 770 780 790 800 810 660 670 680 690 700 710 KIAA03 QTPVTNANKIFYLNLLAQYRLASQVKEEVEHFLKGLNELVPENLLAIFDENELELLMCGT . ::: :: :..:. :.:....:..... ::.:..::.: .:. ::::::::::::: KIAA04 EIMVTNENKREYIDLVIQWRFVNRVQKQMNAFLEGFTELLPIDLIKIFDENELELLMCGL 820 830 840 850 860 870 720 730 740 750 760 770 KIAA03 GDISVSDFKAHAVVVGGSWHFREKVMRWFWTVVSSLTQEELARLLQFTTGSSQLPPGGFA ::..:.:.. :.. .: . . :..::: .: . :. :::::.::.:..: .::: KIAA04 GDVDVNDWRQHSIYKNG-YCPNHPVIQWFWKAVLLMDAEKRIRLLQFVTGTSRVPMNGFA 880 890 900 910 920 930 780 790 800 810 820 KIAA03 ALCPS-----FQIIAAPTHSTLPTAHTCFNQLCLPTYDSYEEVHRMLQLAISEGCEGFGM : : : : . :: ::::::.: :: :...:.... : .:. :. .:: KIAA04 ELYGSNGPQLFTIEQWGSPEKLPRAHTCFNRLDLPPYETFEDLREKLLMAV-ENAQGFEG 940 950 960 970 980 990 KIAA03 L KIAA04 VD >>KIAA1320 ( 567 res) fh13757 (567 aa) initn: 580 init1: 207 opt: 588 Z-score: 644.5 bits: 129.7 E(): 8.8e-31 Smith-Waterman score: 684; 33.414% identity (64.649% similar) in 413 aa overlap (430-825:172-566) 400 410 420 430 440 450 KIAA03 KLLTLVVDDGIQPPVELSCKERNILAATFIRSLHKNIGGSETFQDKVNFFQRELRQVH-- : .: : .. :.:. ..: ..:.. . KIAA13 DEVLKCFVNRNPKIIFDHFHFLLECPELMSRFMH--IIKAQPFKDRCEWFYEHLHSGQPD 150 160 170 180 190 460 470 480 490 500 510 KIAA03 ---MKRP-HSKVTLKVSRHALLESSLKATRNFSISDWSKNFEVVFQDEEALDWGGPRREW ..:: . . : : : ....:: ... . . . .... : :. ::.. : ::: KIAA13 SDMVHRPVNENDILLVHRDSIFRSSCEVVSKANCAKLKQGIAVRFHGEEGMGQG-VVREW 200 210 220 230 240 250 520 530 540 550 560 570 KIAA03 FELICKALFDTTNQLFTRFSDNNQALVHPNPNR---PAHLRLKMYEFAGRLVGKCLYESS :... . . . :::. .:.. .:: : : :: ....:::...: : KIAA13 FDILSNEIVNPDYALFTQSADGTT--FQPNSNSYVNPDHL--NYFRFAGQILGLAL---- 260 270 280 290 300 310 580 590 600 610 620 KIAA03 LGGAYKQLVRARFTRSFLAQIIGLRMHYKYFETDDPEFYKSKVCFILNNDMSEM--ELVF ..::: ::::: .:.:. ..:. . :::. :. . .::.::.:.. ::.: KIAA13 ---NHRQLVNIYFTRSFYKHILGIPVNYQDVASIDPEYAKN-LQWILDNDISDLGLELTF 320 330 340 350 360 630 640 650 660 670 680 KIAA03 AEEKYNKSGQLDKVVELMTGGAQTPVTNANKIFYLNLLAQYRLASQVKEEVEHFLKGLNE . : . : ...: : ::.. ::. :: :..:... :.. .. ... ::.:.. KIAA13 SVET-DVFGAMEEV-PLKPGGGSILVTQNNKAEYVQLVTELRMTRAIQPQINAFLQGFHM 370 380 390 400 410 420 690 700 710 720 730 740 KIAA03 LVPENLLAIFDENELELLMCGTGDISVSDFKAHAVVVGGSWHFREKVMRWFWTVVSSLTQ ..: .:. .::: :::::. : .:.:::. .. ..: .. .. :..::: :: ..:: KIAA13 FIPPSLIQLFDEYELELLLSGMPEIDVSDWIKNTEYTSG-YEREDPVIQWFWEVVEDITQ 430 440 450 460 470 480 750 760 770 780 790 800 KIAA03 EELARLLQFTTGSSQLPPGGFAALC-----PSFQIIAAP-THSTLPTAHTCFNQLCLPTY :: . ::::.::::..: :::: . .: : :.: : . :::. ::.:.: :: : KIAA13 EERVLLLQFVTGSSRVPHGGFANIMGGSGLQNFTIAAVPYTPNLLPTSSTCINMLKLPEY 490 500 510 520 530 540 810 820 KIAA03 DSYEEVHRMLQLAISEGCEGFGML : : .. : .:. : :. : KIAA13 PSKEILKDRLLVALHCGSYGYTMA 550 560 >>KIAA0093 ( 927 res) ha00935 (927 aa) initn: 685 init1: 267 opt: 586 Z-score: 639.9 bits: 129.5 E(): 1.6e-30 Smith-Waterman score: 770; 31.216% identity (58.984% similar) in 551 aa overlap (305-823:393-923) 280 290 300 310 320 330 KIAA03 DIIVLSEDEKNIVERNVSTSGVSIYFEAYLYNATNCSSTPWHLPPMHMT-SSQRRPSTAV : : .: : : .. : ... :. KIAA00 EQPTLPVLLPTSSGLPPGWEEKQDERGRSYYVDHNSRTTTWTKPTVQATVETSQLTSSQS 370 380 390 400 410 420 340 350 360 370 380 KIAA03 DEEDEDSPSECHTPEKVKKPKKVYCYVSPKQFSVKE------FYL----KIIPWRLYTFR . ... : . ..: .:... :: . :.. :.. : :. .. KIAA00 SAGPQSQASTSDSGQQVTQPSEIEQGFLPKGWEVRHAPNGRPFFIDHNTKTTTWEDPRLK 430 440 450 460 470 480 390 400 410 420 430 KIAA03 VCPGT---KFSY-----LGPDPVHKLLTLVVDDG----IQPPVELSCKERNILAATFIRS . :. : : ::: : . :: :. .. . : : . : . KIAA00 I-PAHLRGKTSLDTSNDLGPLP-PGWEERTHTDGRIFYINHNIKRTQWEDPRLENVAITG 490 500 510 520 530 540 440 450 460 470 480 490 KIAA03 LHKNIGGSETFQDKVNFFQRELRQVHMKRPHSKVTLKVSRHALLESSLKATRNFSISDWS . :. .. : .::.:.:.. . :. : .:. : ..::.: . . . .:. KIAA00 --PAVPYSRDYKRKYEFFRRKLKK-QNDIPN-KFEMKLRRATVLEDSYRRIMGVKRADFL 550 560 570 580 590 500 510 520 530 540 KIAA03 KN-FEVVFQDEEALDWGGPRREWFELICKALFDTTNQLFTRFSDNNQAL-VHPNPNRPAH : . . :. :..::.:: :::: :: : .:. :: . .: .: ..:: . . KIAA00 KARLWIEFDGEKGLDYGGVAREWFFLISKEMFNPYYGLFEYSATDNYTLQINPNSGLCNE 600 610 620 630 640 650 550 560 570 580 590 600 KIAA03 LRLKMYEFAGRLVGKCLYESSLGGAYKQLVRARFTRSFLAQIIGLRMHYKYFETDDPEFY .:....: ::..: .:...: .. : : : ... . . .:. : :.: KIAA00 DHLSYFKFIGRVAGMAVYHGKLLDGF-------FIRPFYKMMLHKPITLHDMESVDSEYY 660 670 680 690 700 610 620 630 640 650 660 KIAA03 KSKVCFILNNDMSEMELVFA--EEKYNKSGQLDKVVELMTGGAQTPVTNANKIFYLNLLA .: . .::.:: .:..: : :: .... : :: .::.. ::: :: :. :. KIAA00 NS-LRWILENDPTELDLRFIIDEELFGQTHQH----ELKNGGSEIVVTNKNKKEYIYLVI 710 720 730 740 750 760 670 680 690 700 710 720 KIAA03 QYRLASQVKEEVEHFLKGLNELVPENLLAIFDENELELLMCGTGDISVSDFKAHAVVVGG :.:......... : .:. ::.:..:. ::::::::::::: ::..:.:.. :. .: KIAA00 QWRFVNRIQKQMAAFKEGFFELIPQDLIKIFDENELELLMCGLGDVDVNDWREHTKYKNG 770 780 790 800 810 820 730 740 750 760 770 780 KIAA03 SWHFREKVMRWFWTVVSSLTQEELARLLQFTTGSSQLPPGGFAALC----P-SFQIIAAP . ..:..::: .: . .:. :::::.::.:..: .::: : : :: . KIAA00 -YSANHQVIQWFWKAVLMMDSEKRIRLLQFVTGTSRVPMNGFAELYGSNGPQSFTVEQWG 830 840 850 860 870 880 790 800 810 820 KIAA03 THSTLPTAHTCFNQLCLPTYDSYEEVHRMLQLAISEGCEGFGML : :: ::::::.: :: :.:.::. ::.:: :. .:: KIAA00 TPEKLPRAHTCFNRLDLPPYESFEELWDKLQMAI-ENTQGFDGVD 890 900 910 920 >>KIAA0010 ( 1086 res) ha00408 (1086 aa) initn: 426 init1: 278 opt: 532 Z-score: 579.8 bits: 118.6 E(): 3.5e-27 Smith-Waterman score: 533; 30.490% identity (58.422% similar) in 469 aa overlap (377-823:654-1083) 350 360 370 380 390 400 KIAA03 PEKVKKPKKVYCYVSPKQFSVKEFYLKIIPWRLYTFRVCPGTKFSYLGPDPVHKLLTLVV :: :: ... .:: : .. KIAA00 FCPPNHWLSEQEDIKADKVTQLYVPASRHVWR---FR-----RMGRIGP------LQSTL 630 640 650 660 410 420 430 440 450 460 KIAA03 DDGIQ-PPVELSCKERNILAATFIRSLHKNIGGSETFQDKVNFFQREL----RQVHMKRP : :.. ::. .: .::.. . : . . :...:..::: . ..:. : KIAA00 DVGLESPPLSVS-EERQLAVLTELPFV-------VPFEERVKIFQRLIYADKQEVQGDGP 670 680 690 700 710 720 470 480 490 500 510 KIAA03 H-SKVTLKVSRHALLESSLKATRNFSISDWSKNFEVVFQ-----DEEALDWGGPRREWFE . ... . :. . :.. . : .: ..: . :: ..: :: ::... KIAA00 FLDGINVTIRRNYIYEDAYDKLSPENEPDLKKRIRVHLLNAHGLDEAGIDGGGIFREFLN 730 740 750 760 770 780 520 530 540 550 560 570 KIAA03 LICKALFDTTNQLFTRFSDNNQALVHPNPNRPAHLRL-----KMYEFAGRLVGKCLYESS . :. :. :: : :. .:..:..::: :.. . . : : .:..:: :::. KIAA00 ELLKSGFNP-NQGF--FKTTNEGLLYPNP--AAQMLVGDSFARHYYFLARMLGKALYEN- 790 800 810 820 830 580 590 600 610 620 KIAA03 LGGAYKQLVRARFTRSFLAQIIGLR--MHYKYFETDDPEFYKSKVCFI--LNNDMSEMEL .::. :. ::....: . ... . ::: ::. . :. ..:. :. : KIAA00 ------MLVELPFAGFFLSKLLGTSADVDIHHLASLDPEVYKN-LLFLKSYEDDVEELGL 840 850 860 870 880 630 640 650 660 670 680 KIAA03 VFAEEKYNKSGQLDKVVELMTGGAQTPVTNANKIFYLNLLAQYRLASQVKEEVEHFLKGL :. . : :. .:::: :: . :::.::.: :..:.:.::: :.... : .:: KIAA00 NFTVVN-NDLGEA-QVVELKFGGKDIPVTSANRIAYIHLVADYRLNRQIRQHCLAFRQGL 890 900 910 920 930 940 690 700 710 720 730 740 KIAA03 NELVPENLLAIFDENELELLMCGTG-DISVSDFKAHAVVVGGSWHFREKVMRWFWTVVSS ..: . : .::..:...:. :. ::. :.:. . :: . . :.. :: :: . KIAA00 ANVVSLEWLRMFDQQEIQVLISGAQVPISLEDLKSFTNYSGG-YSADHPVIKVFWRVVEG 950 960 970 980 990 1000 750 760 770 780 790 800 KIAA03 LTQEELARLLQFTTGSSQLPPGGFAALCPSFQIIAAPTH-STLPTAHTCFNQLCLPTYDS .:.:: .::.:.:. :. : :: : :.: : . . :::: ::.: : :: . . KIAA00 FTDEEKRKLLKFVTSCSRPPLLGFKELYPAFCIHNGGSDLERLPTASTCMNLLKLPEFYD 1010 1020 1030 1040 1050 1060 810 820 KIAA03 YEEVHRMLQLAISEGCEGFGML .. : :: : :: KIAA00 ETLLRSKLLYAI-ECAAGFELS 1070 1080 >>KIAA0322 ( 1614 res) hg00462s1 (1614 aa) initn: 539 init1: 193 opt: 503 Z-score: 546.0 bits: 113.0 E(): 2.7e-25 Smith-Waterman score: 643; 33.503% identity (63.706% similar) in 394 aa overlap (442-825:1235-1613) 420 430 440 450 460 470 KIAA03 PPVELSCKERNILAATFIRSLHKNIGGSETFQDKVNFFQRELRQVHMKRPHSKVTLKVSR :. :. : :.:. . . .:. : . : KIAA03 SPRCSPCSSPQNSPGLQRASARAPSPYRRDFEAKLRNFYRKLEAKGFGQGPGKIKLIIRR 1210 1220 1230 1240 1250 1260 480 490 500 510 520 530 KIAA03 HALLESSLKATRNFSISDWSKN-FEVVFQDEEALDWGGPRREWFELICKALFDTTNQLFT :::.... . .: .. ..: . :.: ::.::..:: ::.: :. . ::. :: KIAA03 DHLLEGTFNQVMAYSRKELQRNKLYVTFVGEEGLDYSGPSREFFFLLSQELFNPYYGLF- 1270 1280 1290 1300 1310 1320 540 550 560 570 580 KIAA03 RFSDNNQALVHPNPNRP-AHLRLKMYEFAGRLVGKCLYESSLGGAYKQLVRARFTRSFLA ..: :. :. .: .. .:. ..:.::..: : .. :. : ::: : KIAA03 EYSANDTYTVQISPMSAFVENHLEWFRFSGRILGLAL-------IHQYLLDAFFTRPFYK 1330 1340 1350 1360 1370 590 600 610 620 630 640 KIAA03 QIIGLRMHYKYFETDDPEFYKSKVCFILNNDMSE-MELVFA--EEKYNKSGQLDKVVELM .. : . .: : ::..: . .. .:.... ..:.:. :: . ::. . :: KIAA03 ALLRLPCDLSDLEYLDEEFHQS-LQWMKDNNITDILDLTFTVNEEVF---GQVTER-ELK 1380 1390 1400 1410 1420 1430 650 660 670 680 690 700 KIAA03 TGGAQTPVTNANKIFYLNLLAQYRLASQVKEEVEHFLKGLNELVPENLLAIFDENELELL .:::.: ::. :: :.. ....:. : ...: ...:. :.: :...:: ::::. KIAA03 SGGANTQVTEKNKKEYIERMVKWRVERGVVQQTEALVRGFYEVVDSRLVSVFDARELELV 1440 1450 1460 1470 1480 1490 710 720 730 740 750 760 KIAA03 MCGTGDISVSDFKAHAVVVGGSWHFREKVMRWFWTVVSSLTQEELARLLQFTTGSSQLPP . ::..:...:.. .. :: .: . :.::::..: ...:. :::::.::.:..: KIAA03 IAGTAEIDLNDWRNNTEYRGG-YHDGHLVIRWFWAAVERFNNEQRLRLLQFVTGTSSVPY 1500 1510 1520 1530 1540 1550 770 780 790 800 810 820 KIAA03 GGFAALCPS-----FQIIAAPTHSTLPTAHTCFNQLCLPTYDSYEEVHRMLQLAISEGCE ::::: : : : ..:: ::::::.: :: : :: ... : :. : KIAA03 EGFAALRGSNGLRRFCIEKWGKITSLPRAHTCFNRLDLPPYPSYSMLYEKLLTAVEE-TS 1560 1570 1580 1590 1600 KIAA03 GFGML ::. KIAA03 TFGLE 1610 >>KIAA1625 ( 859 res) hh15184 (859 aa) initn: 653 init1: 183 opt: 500 Z-score: 545.8 bits: 112.0 E(): 2.8e-25 Smith-Waterman score: 668; 33.417% identity (64.824% similar) in 398 aa overlap (445-825:483-858) 420 430 440 450 460 470 KIAA03 ELSCKERNILAATFIRSLHKNIGGSETFQDKVNFFQRELRQVHMKRPHSKVTLKVSRHAL :.. ...:: . . : .. .:::. . KIAA16 EPSQPLPLPSEGSLEDEELPAQRYERDLVQKLKVLRHELSLQQPQAGHCRI--EVSREEI 460 470 480 490 500 510 480 490 500 510 520 530 KIAA03 LESSLKATRNFSISDWSKNFEVVFQDEEALDWGGPRREWFELICKALFDTTNQLFTRFSD .: : . .. .: .: . : :. ::.::.:: :::. :.:. ... :: ..: KIAA16 FEESYRQIMKMRPKDLKKRLMVKFRGEEGLDYGGVAREWLYLLCHEMLNPYYGLF-QYST 520 530 540 550 560 540 550 560 570 580 590 KIAA03 NNQALVHPNPNR---PAHLRLKMYEFAGRLVGKCLYESSLGGAYKQLVRARFTRSFLAQI .: ... ::. : :: ....:.::..: ... : : . . :: : :. KIAA16 DNIYMLQINPDSSINPDHL--SYFHFVGRIMGLAVFH----GHY---INGGFTVPFYKQL 570 580 590 600 610 620 600 610 620 630 640 650 KIAA03 IGLRMHYKYFETDDPEFYKSKVCFILNNDMSE-MELVFAEEKYNKSGQLDKVVELMTGGA .: .. . .:. :::..:: : .::.::.. .. .: : .: :.. . :: .: KIAA16 LGKPIQLSDLESVDPELHKSLV-WILENDITPVLDHTFCVE-HNAFGRILQH-ELKPNGR 630 640 650 660 670 660 670 680 690 700 710 KIAA03 QTPVTNANKIFYLNLLAQYRLASQVKEEVEHFLKGLNELVPENLLAIFDENELELLMCGT ..:::. :: :. : ...:. .. . . ::.:::.:..:: ::..::::.. : KIAA16 NVPVTEENKKEYVRLYVNWRFMRGIEAQFLALQKGFNELIPQHLLKPFDQKELELIIGGL 680 690 700 710 720 730 720 730 740 750 760 KIAA03 GDISVSDFKAHAVV---VGGSWHFREKVMRWFWTVVSSLTQEELARLLQFTTGSSQLPPG :...:.:... . :. : ...:::: .: .. .:. ::::::.:::...: KIAA16 DKIDLNDWKSNTRLKHCVADS-----NIVRWFWQAVETFDEERRARLLQFVTGSTRVPLQ 740 750 760 770 780 790 770 780 790 800 810 KIAA03 GFAALCPS----------FQIIAAPTHSTLPTAHTCFNQLCLPTYDSYEEVHRMLQLAIS :: :: : ...: : : ..:: ::::::.. .: :.:::.... : :. KIAA16 GFKALQGSTGAAGPRLFTIHLIDANT-DNLPKAHTCFNRIDIPPYESYEKLYEKLLTAVE 800 810 820 830 840 850 820 KIAA03 EGCEGFGML : : ::.. KIAA16 ETC-GFAVE >>KIAA1301 ( 1581 res) fg06833 (1581 aa) initn: 527 init1: 201 opt: 500 Z-score: 542.8 bits: 112.3 E(): 4e-25 Smith-Waterman score: 640; 32.995% identity (62.690% similar) in 394 aa overlap (442-825:1202-1580) 420 430 440 450 460 470 KIAA03 PPVELSCKERNILAATFIRSLHKNIGGSETFQDKVNFFQRELRQVHMKRPHSKVTLKVSR :. :. : :.:. . . .:. : . : KIAA13 SPRGSPVSSPQNSPGTQRANARAPAPYKRDFEAKLRNFYRKLETKGYGQGPGKLKLIIRR 1180 1190 1200 1210 1220 1230 480 490 500 510 520 530 KIAA03 HALLESSLKATRNFSISDWSKN-FEVVFQDEEALDWGGPRREWFELICKALFDTTNQLFT :::.... ..: .: ..: . :.: ::.::..:: ::.: :. . ::. :: KIAA13 DHLLEDAFNQIMGYSRKDLQRNKLYVTFVGEEGLDYSGPSREFFFLVSRELFNPYYGLF- 1240 1250 1260 1270 1280 1290 540 550 560 570 580 KIAA03 RFSDNNQALVHPNPNRP-AHLRLKMYEFAGRLVGKCLYESSLGGAYKQLVRARFTRSFLA ..: :. :. .: . . . ..:.::..: : .. :. : ::: : KIAA13 EYSANDTYTVQISPMSAFVDNHHEWFRFSGRILGLAL-------IHQYLLDAFFTRPFYK 1300 1310 1320 1330 1340 590 600 610 620 630 640 KIAA03 QIIGLRMHYKYFETDDPEFYKSKVCFILNNDMSE-MELVFA--EEKYNKSGQLDKVVELM .. . . .: : ::..: . .. .::. . ..:.:. :: . ::. . :: KIAA13 ALLRILCDLSDLEYLDEEFHQS-LQWMKDNDIHDILDLTFTVNEEVF---GQITER-ELK 1350 1360 1370 1380 1390 650 660 670 680 690 700 KIAA03 TGGAQTPVTNANKIFYLNLLAQYRLASQVKEEVEHFLKGLNELVPENLLAIFDENELELL :::. :::. :: :.. ....:. : ...: ...:. :.: :...:: ::::. KIAA13 PGGANIPVTEKNKKEYIERMVKWRIERGVVQQTESLVRGFYEVVDARLVSVFDARELELV 1400 1410 1420 1430 1440 1450 710 720 730 740 750 760 KIAA03 MCGTGDISVSDFKAHAVVVGGSWHFREKVMRWFWTVVSSLTQEELARLLQFTTGSSQLPP . ::..:..::.. .. :: .: . :.::::..: ...:. :::::.::.:..: KIAA13 IAGTAEIDLSDWRNNTEYRGG-YHDNHIVIRWFWAAVERFNNEQRLRLLQFVTGTSSIPY 1460 1470 1480 1490 1500 1510 770 780 790 800 810 820 KIAA03 GGFAALCPS-----FQIIAAPTHSTLPTAHTCFNQLCLPTYDSYEEVHRMLQLAISEGCE :::.: : : . ..:: ::::::.: :: : :. ... : :. : KIAA13 EGFASLRGSNGPRRFCVEKWGKITALPRAHTCFNRLDLPPYPSFSMLYEKLLTAVEE-TS 1520 1530 1540 1550 1560 1570 KIAA03 GFGML ::. KIAA13 TFGLE 1580 >>KIAA0896 ( 2820 res) hk08890s2 (2820 aa) initn: 353 init1: 167 opt: 385 Z-score: 413.7 bits: 89.3 E(): 6.3e-18 Smith-Waterman score: 385; 28.254% identity (59.683% similar) in 315 aa overlap (523-823:2520-2819) 500 510 520 530 540 550 KIAA03 NFEVVFQDEEALDWGGPRREWFELICKALFDTTNQLFTRFSDNNQALVHPNPNRPAHLRL : . :: .. ..... : :.. .. :: KIAA08 DSSEKVQENRKRHGSSRSVVDMDLDDTDDGDDNAPLF--YQPGKRGFYTPRPGKNTEARL 2490 2500 2510 2520 2530 2540 560 570 580 590 600 610 KIAA03 KMYEFAGRLVGKCLYESSLGGAYKQLVRARFTRSFLAQIIGLRMHYKYFETDDPEFYKSK . .. ::..: :: .. .: ..: . ..: ..... : :: .:.: KIAA08 NCFRNIGRILGLCLLQN-------ELCPITLNRHVIKVLLGRKVNWHDFAFFDPVMYESL 2550 2560 2570 2580 2590 2600 620 630 640 650 660 KIAA03 VCFILNNDMSE-------MELVFAEE--KYNKSGQLDKVVELMTGGAQTPVTNANKIFYL .:: .. :. :.:.:: . : . .:: :::. .:.. ::: : :. KIAA08 RQLILASQSSDADAVFSAMDLAFAIDLCKEEGGGQ----VELIPNGVNIPVTPQNVYEYV 2610 2620 2630 2640 2650 670 680 690 700 710 720 KIAA03 NLLAQYRLASQVKEEVEHFLKGLNELVPENLLAIFDENELELLMCGTGDISVSDFKAHAV :..:. ... .. . ::: ...:.: : . ....::. : :...:. . . . KIAA08 RKYAEHRMLVVAEQPLHAMRKGLLDVLPKNSLEDLTAEDFRLLVNGCGEVNVQMLISFTS 2660 2670 2680 2690 2700 2710 730 740 750 760 770 KIAA03 VVGGSWHFREKVM---RWFWTVVSSLTQEELARLLQFTTGSSQLPPG--GFAALCPSFQI : . ::.. ::::..: .... : :. : :.: .:: . :: . ::. : KIAA08 FNDESGENAEKLLQFKRWFWSIVEKMSMTERQDLVYFWTSSPSLPASEEGFQPM-PSITI 2720 2730 2740 2750 2760 2770 780 790 800 810 820 KIAA03 IAAPTHSTLPTAHTCFNQLCLPTYDSYEEVHRMLQLAISEGCEGFGML : . ::::.::...: .: :.: . ... : :::. :: KIAA08 -RPPDDQHLPTANTCISRLYVPLYSSKQILKQKLLLAIKTKNFGFV 2780 2790 2800 2810 2820 >>KIAA0045 ( 2005 res) ha00941 (2005 aa) initn: 356 init1: 125 opt: 291 Z-score: 312.2 bits: 70.0 E(): 2.9e-12 Smith-Waterman score: 312; 26.238% identity (51.733% similar) in 404 aa overlap (454-825:1608-2004) 430 440 450 460 470 480 KIAA03 LAATFIRSLHKNIGGSETFQDKVNFFQRELRQVHMKRPHSKVTLKVSRHALLESSLKATR :. .:. .: . : .:.:: . . KIAA00 LLDTNPEINQSDSQDSRVAPRLDRKKRTVNREELLKQAESVMQDLGSSRAMLEIQYENEV 1580 1590 1600 1610 1620 1630 490 500 510 520 530 540 KIAA03 NFSISDWSKNFEVVFQDEEALDWGGPRREWFELICKALFDTTNQLFTRFSDNNQ---ALV . ... . . .: :. . : : : : : .: :.. .: : :: KIAA00 GTGLGPTLEFYALVSQELQRADLGLWRGEEVTLSN----PKGSQEGTKYIQNLQGLFALP 1640 1650 1660 1670 1680 1690 550 560 570 580 590 KIAA03 HPNPNRPAHL-RLKM-YEFAGRLVGKC-----LYESSLGGA-YKQLVRAR--FTRSFLAQ .:::. ..:: ..: :.:..: : . :: :: ..: . .: : . KIAA00 FGRTAKPAHIAKVKMKFRFLGKLMAKAIMDFRLVDLPLGLPFYKWMLRQETSLTSHDLFD 1700 1710 1720 1730 1740 1750 600 610 620 630 640 KIAA03 IIGLRMHYKYFETDDPEFYKSKVCFILNNDMSEMELVFAEEKYNKSG------QLDKV-- : . . : : . ..: . ...... : .: : . .: :: . KIAA00 IDPVVARSVYHLED---IVRQKKRLEQDKSQTKESLQYALETLTMNGCSVEDLGLDFTLP 1760 1770 1780 1790 1800 1810 650 660 670 680 690 KIAA03 ----VELMTGGAQTPVTNANKIFYLNLLAQYRLASQVKEEVEHFLKGLNELVPENLLAIF .:: :: . ::: : :: :. . : :... . : :.. . : . : : KIAA00 GFPNIELKKGGKDIPVTIHNLEEYLRLVIFWALNEGVSRQFDSFRDGFESVFPLSHLQYF 1820 1830 1840 1850 1860 1870 700 710 720 730 740 750 KIAA03 DENELELLMCGT-GDISVSDFKAHAVVVGGSWHFREKVMRWFWTVVSSLTQEELARLLQF .::. :.::. .: . . .. ....... ..::. .:. .::: KIAA00 YPEELDQLLCGSKADTWDAKTLMECCRPDHGYTHDSRAVKFLFEILSSFDNEQQRLFLQF 1880 1890 1900 1910 1920 1930 760 770 780 790 800 810 KIAA03 TTGSSQLPPGGFAALCPSFQIIAAPTHST------LPTAHTCFNQLCLPTYDSYEEVHRM .::: .:: ::: .: : . :. .:: ::.. :: : : :: :.: : ... KIAA00 VTGSPRLPVGGFRSLNPPLTIVRKTFESTENPDDFLPSVMTCVNYLKLPDYSSIEIMREK 1940 1950 1960 1970 1980 1990 820 KIAA03 LQLAISEGCEGFGML : .: :: ..: . KIAA00 LLIAAREGQQSFHLS 2000 826 residues in 1 query sequences 1986679 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:16:11 2008 done: Thu Dec 18 15:16:12 2008 Total Scan time: 0.600 Total Display time: 0.340 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]