# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/bg00151.fasta.huge -Q ../query/KIAA0320.ptfa ./tmplib.23147 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0320, 1933 aa vs ./tmplib.23147 library 1985572 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.5015+/-0.00573; mu= 9.0442+/- 0.390 mean_var=121.4399+/-29.362, 0's: 0 Z-trim: 5 B-trim: 47 in 1/39 Lambda= 0.116384 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 42, opt: 30, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1027 ( 2550 res) fh00156s1 (2550) 9134 1546.6 0 KIAA0655 ( 1083 res) hk01768 (1083) 360 73.1 4.1e-13 >>KIAA1027 ( 2550 res) fh00156s1 (2550 aa) initn: 5448 init1: 3990 opt: 9134 Z-score: 8284.1 bits: 1546.6 E(): 0 Smith-Waterman score: 9134; 74.289% identity (92.706% similar) in 1933 aa overlap (2-1931:617-2549) 10 20 30 KIAA03 DLLRAARTLAGAVSDLLKAVQPTSGEPRQTV ::.::. ::::::.::...::.:.::::.. 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