# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hg00928.fasta.huge -Q ../query/KIAA0331.ptfa ./tmplib.23147 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0331, 814 aa vs ./tmplib.23147 library 1986691 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 3.6649+/-0.00455; mu= 22.6977+/- 0.310 mean_var=75.3945+/-18.034, 0's: 0 Z-trim: 11 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.147708 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1739 ( 963 res) pj00464 ( 963) 946 211.8 2.8e-55 KIAA1479 ( 1022 res) fh17949 (1022) 859 193.3 1.1e-49 KIAA1745 ( 893 res) pj01678 ( 893) 821 185.1 2.8e-47 KIAA1619 ( 869 res) fj14720 ( 869) 777 175.7 1.8e-44 KIAA1368 ( 1049 res) fj03125 (1049) 719 163.5 1.1e-40 KIAA1869 ( 935 res) hh01800 ( 935) 691 157.4 6.2e-39 KIAA1445 ( 1202 res) fg03469b (1202) 498 116.5 1.7e-26 KIAA0620 ( 1985 res) hg04174 (1985) 145 41.6 0.001 KIAA0093 ( 927 res) ha00935 ( 927) 136 39.2 0.0025 KIAA0315 ( 1841 res) hg00246 (1841) 132 38.8 0.0065 >>KIAA1739 ( 963 res) pj00464 (963 aa) initn: 936 init1: 240 opt: 946 Z-score: 1084.3 bits: 211.8 E(): 2.8e-55 Smith-Waterman score: 1139; 33.766% identity (61.851% similar) in 616 aa overlap (90-698:176-762) 60 70 80 90 100 110 KIAA03 TGGHTADTTHPRLRLSHKELLNLNRTSIFHSPFGFLDLHTMLLDEYQERLFVGGRDLVYS : :. :. :. : : :.::.:. ... 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KIAA17 TFG-GRDLPAEQPGSFLYDARLQ-ALVVMAAQPRHAGAYHCFSEEQGARLAAEGYLVAVV 720 730 740 750 760 770 720 730 740 750 760 770 KIAA03 EEEKVEDMFNKDDEEDRHHRMPCPAQSSISQGAKPWYKEFLQLIGYSNFQRVEEYCEKVW KIAA17 AGPSVTLEARAPLENLGLVWLAVVALGAVCLVLLLLVLSLRRRLREELEKGAKATERTLV 780 790 800 810 820 830 >>KIAA1479 ( 1022 res) fh17949 (1022 aa) initn: 834 init1: 266 opt: 859 Z-score: 983.9 bits: 193.3 E(): 1.1e-49 Smith-Waterman score: 1067; 34.182% identity (62.727% similar) in 550 aa overlap (95-613:68-594) 70 80 90 100 110 120 KIAA03 ADTTHPRLRLSHKELLNLNRTSIFHSPFGFLDLHTMLLDEYQERLFVGGRDLVYSLSLER ::.. :: . .. :...::: ::...:.. KIAA14 DEPLNTVDYHYSRQYPVFRGRPSGNESQHRLDFQLML--KIRDTLYIAGRDQVYTVNLNE 40 50 60 70 80 90 130 140 150 160 170 180 KIAA03 ISDGY----KEIHWPSTALKMEECIMKGKDAGECANYVRVLHHYNRTHLLTCGTGAFDPV . :.. : : :.: :::: :: :...:. : ...:::.::.:. KIAA14 MPKTEVIPNKKLTWRSRQQDRENCAMKGKHKDECHNFIKVFVPRNDEMVFVCGTNAFNPM 100 110 120 130 140 150 190 200 210 220 230 KIAA03 CAFIRVGYHLEDPLFHLESPRSE-RGRGRCPFDPSSSFISTLIGSELFAGLYSDYWSRDA : . : : :: : : .::::: .. .. . ..:... .:. . :: KIAA14 CRYYR--------LSTLEYDGEEISGLARCPFDARQTNVALFADGKLYSATVADFLASDA 160 170 180 190 200 240 250 260 270 280 290 KIAA03 AIFRSMGRLAHIRTEHDDERLLKEPKFVGSYMIPDNEDRDDNKVYFFFTEKALEAENNAH .:.:::: . .:: . : . .:::.:. . : ::::: : :.: .: .. KIAA14 VIYRSMGDGSALRTIKYDSKWIKEPHFLHAIEY-------GNYVYFFFREIAVEHNNLGK 210 220 230 240 250 260 300 310 320 330 340 350 KIAA03 AIYTRVGRLCVNDVGG-QRILVNKWSTFLKARLVCSVPGMNGIDTYFDELEDVFLLPTRD :.:.::.:.: ::.:: ::.: ..:..:::::: ::::: . . ::: :... . . KIAA14 AVYSRVARICKNDMGGSQRVLEKHWTSFLKARLNCSVPGDSFF--YFDVLQSITDI-IQI 270 280 290 300 310 360 370 380 390 400 410 KIAA03 HKNPVIFGLFNTTSNIFRGHAICVYHMSSIRAAFNGPYAHKEGPEYHWS-VYEGKVPYPR . :.. :.:.: : . : :.:.. :..:. .:.: . ... :. :. : : ::: :: KIAA14 NGIPTVVGVFTTQLNSIPGSAVCAFSMDDIEKVFKGRFKEQKTPDSVWTAVPEDKVPKPR 320 330 340 350 360 370 420 430 440 450 460 470 KIAA03 PGSCASKVNGGRYGTTKDYPDDAIRFARSHPLMYQAIKPAHKKPILVKTDGKYNLKQIAV :: ::.. . : :. :.::... : .::::: .:. : .: ..:: .: : :.: KIAA14 PGCCAKHGLAEAYKTSIDFPDETLSFIKSHPLMDSAVPPIADEPWFTKTRVRYRLTAISV 380 390 400 410 420 430 480 490 500 510 520 KIAA03 DRVEAEDGQYDVLFIGTDNGIVLKVITIYNQEMESMEEVILEELQIF---------KDPV :. . .: :.:.:.. :.::::.. .. . . :.:::.. . .. KIAA14 DHSAGPYQNYTVIFVGSEAGMVLKVLA-KTSPFSLNDSVLLEEIEAYNHAKCSAENEEDK 440 450 460 470 480 490 530 540 550 560 570 580 KIAA03 PIISMEISSKRQQLYIGSASAVAQVRFHHCDMYGSACADCCLA-RDPYCAW--DGISCSR .::..... .. ::.. .: . .. . .:. ::: : :.: :::::.: .: ::.: KIAA14 KVISLQLDKDHHALYVAFSSCIIRIPLSRCERYGS-CKKSCIASRDPYCGWLSQG-SCGR 500 510 520 530 540 550 590 600 610 620 630 KIAA03 YYPTGTHAKRRF----------RRQDVRHGNAAQ--QCFGQQFVGDALDKTEEHLAYGIE : . : .::.. ::.:. .: : KIAA14 VTPGMLLLTEDFFAFHNHSAEGYEQDTEFGNTAHLGDCHGVRWEVQSGESNQMVHMNVLI 560 570 580 590 600 610 640 650 660 670 680 690 KIAA03 NNSTLLECTPRSLQAKVIWFVQKGRETRKEEVKTDDRVVKMDLGLLFLRLHKSDAGTYFC KIAA14 TCVFAAFVLGAFIAGVAVYCYRDMFVRKNRKIHKDAESAQSCTDSSGSFAKLNGLFDSPV 620 630 640 650 660 670 >>KIAA1745 ( 893 res) pj01678 (893 aa) initn: 744 init1: 216 opt: 821 Z-score: 940.7 bits: 185.1 E(): 2.8e-47 Smith-Waterman score: 1107; 30.649% identity (59.610% similar) in 770 aa overlap (8-753:44-775) 10 20 30 KIAA03 QRVRFLTKPLARCPWREVLSKTQTLLKVRSEGLDGEH .: : .: .: . .:: : . KIAA17 PPRSGGGGPRGDSGADRGAELPPVSPAEPPEPEPRDTVAPALRMLRTAMGLRSW-LAAPW 20 30 40 50 60 70 40 50 60 70 80 90 KIAA03 GSMASAGHIITLLLWGYLLELWTGGHTADTTHPRLRLSHKELLNLNRTSIFHSPFGFLDL :.. .. ::: :: : . . ::. : : . .: . . . KIAA17 GALPPRPPLLLLLL---LLLLLQPPPPTWALSPRISLP---LGSEERPFLRFEAEHISNY 80 90 100 110 120 100 110 120 130 140 150 KIAA03 HTMLLDEYQERLFVGGRDLVYSLS--LERISDG-YKEIHWPSTALKMEECIMKGKDAG-E ..::.. . :.::.:. ...:: : . : :.:. : . : : ..: .:::: . KIAA17 TALLLSRDGRTLYVGAREALFALSSNLSFLPGGEYQELLWGADAEKKQQCSFKGKDPQRD 130 140 150 160 170 180 160 170 180 190 200 KIAA03 CANYVRVLHHYNRTHLLTCGTGAFDPVCAFIRVGYHLEDPLFHLESPRS-----ERGRGR : ::...: . .::.::::.::.:.:..: ..:. : : .. : :.:: KIAA17 CQNYIKILLPLSGSHLFTCGTAAFSPMCTYI----NMEN--FTLARDEKGNVLLEDGKGR 190 200 210 220 230 240 210 220 230 240 250 260 KIAA03 CPFDPSSSFISTLIGSELFAGLYSDYWSRDAAIFRSMGRLAHIRTEHDDERLLKEPKFVG :::::. . . .. .::..: :.. . : :: ::.. : .:: .. :..: ::. KIAA17 CPFDPNFKSTALVVDGELYTGTVSSFQGNDPAISRSQS-LRPTKTE-SSLNWLQDPAFVA 250 260 270 280 290 270 280 290 300 310 320 KIAA03 SYMIPDNEDR---DDNKVYFFFTEKALEAENNAHAIYTRVGRLCVNDVGGQRILVNKWST : .::.. ::.:.::::.: . : : ..: .:..:.: .: ::.:.: ..:.. KIAA17 SAYIPESLGSLQGDDDKIYFFFSETGQEFEFFENTIVSRIARICKGDEGGERVLQQRWTS 300 310 320 330 340 350 330 340 350 360 370 380 KIAA03 FLKARLVCSVPGMNGIDTYFDELEDVFLL-PT-RDHKNPVIFGLFNTT--SNIFRGHAIC ::::.:.:: : .:. :. :.::: : :. .: .. ...:.:.. . .: :.: KIAA17 FLKAQLLCSRPD-DGFP--FNVLQDVFTLSPSPQDWRDTLFYGVFTSQWHRGTTEGSAVC 360 370 380 390 400 410 390 400 410 420 430 440 KIAA03 VYHMSSIRAAFNGPYAHKEGPEYHWSVYEGKVPYPRPGSCASKVNGGR-YGTTKDYPDDA :. :.... .:.: : . . .: . :: ::::.: .. : ... . :: . KIAA17 VFTMKDVQRVFSGLYKEVNRETQQWYTVTHPVPTPRPGACITNSARERKINSSLQLPDRV 420 430 440 450 460 470 450 460 470 480 490 500 KIAA03 IRFARSHPLMYQAIKPAHKKPILVKTDGKYNLKQIAVDRVEAEDGQYDVLFIGTDNGIVL . : ..: :: .. .. .:.. ...: ...:: :: . :::::.:: .: . KIAA17 LNFLKDHFLMDGQVR---SRMLLLQPQARY--QRVAVHRVPGLHHTYDVLFLGTGDGRLH 480 490 500 510 520 530 510 520 530 540 550 560 KIAA03 KVITIYNQEMESMEEVILEELQIFKDPVPIISMEISSKRQQLYIGSASAVAQVRFHHCDM :.... . :.::::::.. :. .. ....: :: .: :.:.:: . .:.. KIAA17 KAVSVGPRVH------IIEELQIFSSGQPVQNLLLDTHRGLLYAASHSGVVQVPMANCSL 540 550 560 570 580 570 580 590 600 610 620 KIAA03 YGSACADCCLARDPYCAWDGISCSRYYPTGTHAKRRFRRQDVRHGNAAQQCFGQQFVGDA : : :.:: :::::::::.: ::.. . : ::.. ..: . : ... :. . KIAA17 YRS-CGDCLLARDPYCAWSGSSCKHVSLYQPQLATRPWIQDIEGASAKDLCSASSVVSPS 590 600 610 620 630 640 630 640 650 660 670 KIAA03 LDKTEEHLAYGIE---NNSTLLECTPRSLQAKVIWFVQKGRETRKEEVKTDDRVVKMDLG . : :. .. :. . : : : : .:. ..: :... . : KIAA17 FVPTGEKPCEQVQFQPNTVNTLACPLLSNLATRLWL-RNG-----APVNASASCHVLPTG 650 660 670 680 690 680 690 700 710 720 730 KIAA03 LLFLRLHKSDAGTYFCQTVEHSFVHTVRKITLEVVEEEKVEDMFNKDDEED---RHHRMP :.: . .. : . : ..:..: . : . ::::. : :. .. :. KIAA17 DLLL-VGTQQLGEFQCWSLEEGFQQLVASYCPEVVED-GVADQTDEGGSVPVIISTSRVS 700 710 720 730 740 750 740 750 760 770 780 790 KIAA03 CPAQSSISQGA-KPWYKEFLQLIGYSNFQRVEEYCEKVWCTDRKRKKLKMSPSKWKYANP :: .. : :: . ..:::: KIAA17 APAGGKASWGADRSYWKEFLVMCTLFVLAVLLPVLFLLYRHRNSMKVFLKQGECASVHPK 760 770 780 790 800 810 >>KIAA1619 ( 869 res) fj14720 (869 aa) initn: 561 init1: 181 opt: 777 Z-score: 890.1 bits: 175.7 E(): 1.8e-44 Smith-Waterman score: 1059; 31.638% identity (59.605% similar) in 708 aa overlap (39-711:11-681) 10 20 30 40 50 60 KIAA03 PLARCPWREVLSKTQTLLKVRSEGLDGEHGSMASAGHIITLLL----WGYLLELWTGGHT ..: : ...: : :: : : . : KIAA16 ASHSPPPQPVTLAPFGGLVSLGLPRKMWGRLWPLLLSILT 10 20 30 40 70 80 90 100 110 KIAA03 ADTTH-PRLRLSHKELLNLNRTSIFHSPFG----F----LDLHTMLLDEYQERLFVGGRD : .. : :: .:: : .: . .. : . :.::.: . ::.::.: KIAA16 ATAVPGPSLRRPSRELDATPRMTIPYEELSGTRHFKGQAQNYSTLLLEEASARLLVGARG 50 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 KIAA03 LVYSLSLERISDG-YKEIHWPSTALKMEECIMKGKDAG-ECANYVRVLHHYNRTHLLTCG ..::: . :.:: .::::: .. . .: .:::. :: :.:: :.. : ::: .:: KIAA16 ALFSLSANDIGDGAHKEIHWEASPEMQSKCHQKGKNNQTECFNHVRFLQRLNSTHLYACG 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 KIAA03 TGAFDPVCAFIRVGYHLEDPLFHLESPRS-ERGRGRCPFDPSSSFISTLIGSELFAGLYS : ::.:.:: : . : : : : :.:. .::.::. .: . .: . :... KIAA16 THAFQPLCAAI------DAEAFTL--PTSFEEGKEKCPYDPARGFTGLIIDGGLYTATRY 170 180 190 200 210 240 250 260 270 280 KIAA03 DYWSRDAAIFRSMGRLAH-IRTEHDDERLLKEPKFVGSYMIPDNEDR---DDNKVYFFFT .. : : :: : : .:::. . :.. .:: : .. ... ::.:::.::: KIAA16 EFRSIPD-IRRS--RHPHSLRTEETPMHWLNDAEFVFSVLVRESKASAVGDDDKVYYFFT 220 230 240 250 260 290 300 310 320 330 340 KIAA03 EKALEAEN-------NAHAIYTRVGRLCVNDVGGQRILVNKWSTFLKARLVCSVPGMNGI :.: : . ..: . .::.:.: .:.::..:: .::..::::::.: .: KIAA16 ERATEEGSGSFTQSRSSHRV-ARVARVCKGDLGGKKILQKKWTSFLKARLICHIP----- 270 280 290 300 310 320 350 360 370 380 390 KIAA03 DTYFDELEDVFLLPTRDHKNPVIFGLFNTTSN--IFRGHAICVYHMSSIRAAFNGPYAHK .. :. : : .. . ... :. ... ... ::: : .. :.:.: ::: . KIAA16 --LYETLRGVCSLDAETSSRTHFYAAFTLSTQWKTLEASAICRYDLAEIQAVFAGPYMEY 330 340 350 360 370 380 400 410 420 430 440 450 KIAA03 EGPEYHWSVYEGKVPYPRPGSCAS-KVNGGRYGTTKDYPDDAIRFARSHPLMYQAIKPAH . .:. ::: :: :::::: . .. . :....: :. .. :.. :::: . . :.. KIAA16 QDGSRRWGRYEGGVPEPRPGSCITDSLRSQGYNSSQDLPSLVLDFVKLHPLMARPVVPTR 390 400 410 420 430 440 460 470 480 490 500 510 KIAA03 KKPILVKTDGKYNLKQIAVDRVEAEDGQ-YDVLFIGTDNGIVLKVITIYNQEMESMEEVI .:.:.: . .:. ... : . : ::.::.:: .: . :.. . .. :. : KIAA16 GRPLLLKRNIRYT--HLTGTPVTTPAGPTYDLLFLGTADGWIHKAV-VLGSGMH-----I 450 460 470 480 490 520 530 540 550 560 570 KIAA03 LEELQIFKDPVPIISMEISSKRQQLYIGSASAVAQVRFHHCDMYGSACADCCLARDPYCA .:: :.:.. . .. :: ...::.:. :.: :. . :. : : : :: :::::::. KIAA16 IEETQVFRESQSVENLVISLLQHSLYVGAPSGVIQLPLSSCSRYRS-CYDCILARDPYCG 500 510 520 530 540 550 580 590 600 610 620 630 KIAA03 WD-GI-SCSRYYPTGTHAK--RRFRRQDVRHGNAAQQCFGQQFVGDALDKTEEHLAYGIE :: : .:. ..... : ::...:: . : ... .: . . : KIAA16 WDPGTHACAAATTIANRSQGSRTALIQDIERGN--RGCESSRDTGPPPPLKTRSVLRG-- 560 570 580 590 600 640 650 660 670 680 690 KIAA03 NNSTLLECTPRSLQAKVIWFVQKGRETRKEEVKTDDRVVKMDLGLLFLRLHKSDAGTYFC ...:: : : :...:... : .. : .: ::: . .:.: : KIAA16 -DDVLLPCDQPSNLARALWLLN-GSMGLSD--GQGGYRVGVD-GLLVTDAQPEHSGNYGC 610 620 630 640 650 660 700 710 720 730 740 750 KIAA03 QTVEHSFVHTVRKITLEVVEEEKVEDMFNKDDEEDRHHRMPCPAQSSISQGAKPWYKEFL . :... . . .: : KIAA16 YAEENGLRTLLASYSLTVRPATPAPAPKAPATPGAQLAPDVRLLYVLAIAALGGLCLILA 670 680 690 700 710 720 >>KIAA1368 ( 1049 res) fj03125 (1049 aa) initn: 714 init1: 282 opt: 719 Z-score: 822.6 bits: 163.5 E(): 1.1e-40 Smith-Waterman score: 1019; 31.795% identity (63.932% similar) in 585 aa overlap (49-606:8-563) 20 30 40 50 60 70 KIAA03 LSKTQTLLKVRSEGLDGEHGSMASAGHIITLLLWGYLLELWTGGHTADTTHPRLRLSHKE :::. ::.. .: :. .: . .:: . KIAA13 TTMRSEALLLYFTLLHFAGAGFPEDS-EP-ISISHGN 10 20 30 80 90 100 110 120 KIAA03 LLNLNRTSIFHSP------FGFLDLHTMLLDEYQERLFVGGRDLVYSLSLE--RISDGY- . . . :.: ::.. ... .. :....:: .:..... . . : KIAA13 YTKQYPVFVGHKPGRNTTQRHRLDIQMIMI--MNGTLYIAARDHIYTVDIDTSHTEEIYC 40 50 60 70 80 90 130 140 150 160 170 180 KIAA03 -KEIHWPSTALKMEECIMKGKDAGECANYVRVLHHYNRTHLLTCGTGAFDPVCAFIRVGY :.. : : .. : :::: :: :...:: . : :..:::.::.: : .: KIAA13 SKKLTWKSRQADVDTCRMKGKHKDECHNFIKVLLKKNDDALFVCGTNAFNPSCR----NY 100 110 120 130 140 190 200 210 220 230 240 KIAA03 HLEDPLFHLESPRSERGRGRCPFDPSSSFISTLIGSELFAGLYSDYWSRDAAIFRSMGRL .. : : . . : : .:::.: . . .. . ..:... .:. . ::.:.::.:. KIAA13 KM-DTLEPFGDEFS--GMARCPYDAKHANVALFADGKLYSATVTDFLAIDAVIYRSLGES 150 160 170 180 190 200 250 260 270 280 290 300 KIAA03 AHIRTEHDDERLLKEPKFVGSYMIPDNEDRDDNKVYFFFTEKALEAENNAHAIYTRVGRL .:: . : . :::: :: . : : .:::: : :.: .. ..... ::... KIAA13 PTLRTVKHDSKWLKEPYFVQAV------DYGDY-IYFFFREIAVEYNTMGKVVFPRVAQV 210 220 230 240 250 310 320 330 340 350 360 KIAA03 CVNDVGG-QRILVNKWSTFLKARLVCSVPGMNGIDTYFDELE---DVFLLPTRDHKNPVI : ::.:: ::.: ..:..:::::: ::::: . . ::. :. ::. . :: :. KIAA13 CKNDMGGSQRVLEKQWTSFLKARLNCSVPGDSHF--YFNILQAVTDVIRINGRD----VV 260 270 280 290 300 310 370 380 390 400 410 420 KIAA03 FGLFNTTSNIFRGHAICVYHMSSIRAAFNGPYAHKEGPEYHWS-VYEGKVPYPRPGSCAS .. :.: : . : :.:.: : .: ..:.: . ....:. :. : . .:: :::: ::. KIAA13 LATFSTPYNSIPGSAVCAYDMLDIASVFTGRFKEQKSPDSTWTPVPDERVPKPRPGCCAG 320 330 340 350 360 370 430 440 450 460 470 480 KIAA03 KVNGGRYGTTKDYPDDAIRFARSHPLMYQAIKPAHKKPILVKTDGKYNLKQIAVDRVEAE . . ::.:....:::.. : ..:::: .:. ..: ...: .: : .:::: . . KIAA13 SSSLERYATSNEFPDDTLNFIKTHPLMDEAVPSIFNRPWFLRTMVRYRLTKIAVDTAAGP 380 390 400 410 420 430 490 500 510 520 530 KIAA03 DGQYDVLFIGTDNGIVLKVITIYNQEMESMEEVILEELQIFK------DPVP---IISME .. :.:.:...::.:: .. .. . ..:::..... : : :..:. KIAA13 YQNHTVVFLGSEKGIILKFLARIGNSGFLNDSLFLEEMSVYNSEKCSYDGVEDKRIMGMQ 440 450 460 470 480 490 540 550 560 570 580 590 KIAA03 ISSKRQQLYIGSASAVAQVRFHHCDMYGSACADCCLA-RDPYCAW--DGISCSRYYPTGT .. ..::.. .. : .: . .:. .:. : :.: :::::.: .: .::. : KIAA13 LDRASSSLYVAFSTCVIKVPLGRCERHGK-CKKTCIASRDPYCGWIKEGGACSHLSP--- 500 510 520 530 540 600 610 620 630 640 650 KIAA03 HAKRRFRRQDVRHGNAAQQCFGQQFVGDALDKTEEHLAYGIENNSTLLECTPRSLQAKVI ... :. ::...:: KIAA13 NSRLTFE-QDIERGNTDGLGDCHNSFVALNDISTPLPDNEMSYNTVYGHSSSLLPSTTTS 550 560 570 580 590 600 >>KIAA1869 ( 935 res) hh01800 (935 aa) initn: 622 init1: 178 opt: 691 Z-score: 790.8 bits: 157.4 E(): 6.2e-39 Smith-Waterman score: 941; 30.807% identity (61.614% similar) in 607 aa overlap (40-615:6-583) 10 20 30 40 50 60 KIAA03 LARCPWREVLSKTQTLLKVRSEGLDGEHGSMASAGHIITLLLWGYLLELWTGGHT-ADTT : : :.. ::: :: : . :: : KIAA18 AAPHRMPRAPHFMPLLL---LLLLLSLPHTQAAFP 10 20 30 70 80 90 100 110 120 KIAA03 HPRLRLSHKELLNLNRTSIFH--------SPFGFLDLHTMLLDEYQERLFVGGRDLVYSL . : : ..: . . : :. . .: ::.. .: .. :.:..:: :.:. KIAA18 QDPLPLLISDLQGTSPLSWFRGLEDDAVAAELG-LDFQRFL--TLNRTLLVAARDHVFSF 40 50 60 70 80 130 140 150 160 170 KIAA03 SLERISDGY-----KEIHWPSTALKMEECIMKGKDAGECANYVRVLHHYNRTHLLTCGTG .:. .: : . : : .:.: ..:: . :: ::.::: .. ::.:::. KIAA18 DLQAEEEGEGLVPNKYLTWRSQ--DVENCAVRGKLTDECYNYIRVLVPWDSQTLLACGTN 90 100 110 120 130 140 180 190 200 210 220 230 KIAA03 AFDPVCAFIRVGYHLEDPLFHLESPRSE-RGRGRCPFDPSSSFISTLIGSELFAGLYSDY .:.::: .: . . :.. : :..::::: ..: .. . . :... .:. KIAA18 SFSPVCR----SYGITS----LQQEGEELSGQARCPFDATQSNVAIFAEGSLYSATAADF 150 160 170 180 190 240 250 260 270 280 290 KIAA03 WSRDAAIFRSMGRLAHIRTEHDDERLLKEPKFVGSYMIPDNEDRDDNKVYFFFTEKALEA . ::...::.: .:. . : . :.::.:: . :. ::::: : ..: KIAA18 QASDAVVYRSLGPQPPLRSAKYDSKWLREPHFVQALEHGDH-------VYFFFREVSVED 200 210 220 230 240 250 300 310 320 330 340 350 KIAA03 ENNAHAIYTRVGRLCVNDVGGQ-RILVNKWSTFLKARLVCSVPGMNGIDTYFDELEDVFL ... ..::.:.: :.::. : : .:..::: :: ::::: . . ::: :. .. KIAA18 ARLGRVQFSRVARVCKRDMGGSPRALDRHWTSFLKLRLNCSVPGDSTF--YFDVLQ-ALT 260 270 280 290 300 360 370 380 390 400 410 KIAA03 LPTRDHKNPVIFGLFNTTSNIFRGHAICVYHMSSIRAAFNGPYAHKEGPEYHWS-VYEGK :. : ..::.:.: .: . : :.:..... :. .:.: . .... . :. : : . KIAA18 GPVNLHGRSALFGVFTTQTNSIPGSAVCAFYLDEIERGFEGKFKEQRSLDGAWTPVSEDR 310 320 330 340 350 360 420 430 440 450 460 470 KIAA03 VPYPRPGSCASKVNGGRYGTTKDYPDDAIRFARSHPLMYQAIKPAHKKPILVKTDGKYNL :: :::::::. ... .....: :::.. : ..:::. :. :. ..:.:. :. . : KIAA18 VPSPRPGSCAGVGGAALFSSSRDLPDDVLTFIKAHPLLDPAVPPVTHQPLLTLTS-RALL 370 380 390 400 410 420 480 490 500 510 520 KIAA03 KQIAVDRVEAEDGQYDVLFIGTDNGIVLKVITIYNQEMESMEEVILEELQIF-------- :.::: . . .. :.:.:...: ::::.: .. . : ..:::.. . KIAA18 TQVAVDGMAGPHSNITVMFLGSNDGTVLKVLTPGGRSG-GPEPILLEEIDAYSPARCSGK 430 440 450 460 470 480 530 540 550 560 570 580 KIAA03 ---KDPVPIISMEISSKRQQLYIGSASAVAQVRFHHCDMYGSACADCCLA-RDPYCAWDG . ::..:.... ..:... .. .. . . .: .: :: ::: .::::.: . KIAA18 RTAQTARRIIGLELDTEGHRLFVAFSGCIVYLPLSRCARHG-ACQRSCLASQDPYCGWHS 490 500 510 520 530 540 590 600 610 620 630 KIAA03 I-SCSRYYPTG-THAKRRFRRQDVRHGNAAQQCFGQQFVGDALDKTEEHLAYGIENNSTL .: .: : . . .....::. . :.: KIAA18 SRGCVDIRGSGGTDVDQAGNQESMEHGDCQDGATGSQSGPGDSAYGVRRDLPPASASRSV 550 560 570 580 590 600 640 650 660 670 680 690 KIAA03 LECTPRSLQAKVIWFVQKGRETRKEEVKTDDRVVKMDLGLLFLRLHKSDAGTYFCQTVEH KIAA18 PIPLLLASVAAAFALGASVSGLLVSCACRRAHRRRGKDIETPGLPRPLSLRSLARLHGGG 610 620 630 640 650 660 >>KIAA1445 ( 1202 res) fg03469b (1202 aa) initn: 597 init1: 182 opt: 498 Z-score: 567.5 bits: 116.5 E(): 1.7e-26 Smith-Waterman score: 922; 32.776% identity (60.702% similar) in 598 aa overlap (12-584:78-634) 10 20 30 KIAA03 QRVRFLTKPLARCPWRE---VLSKTQTLLKVRSEGLDGEHG :: : .:: .. :: : .: KIAA14 CVSWMPCGFSPSPVAHHLVPGPPDTPAQQLRCGWTVGGWLLSLVRGLLPCLPPGARTAEG 50 60 70 80 90 100 40 50 60 70 80 KIAA03 S-MASAGHI-ITLLLWGYLLELWTGGHTAD-TTHPRLRLSHKELLNLNR----------- :. :: . ..::: . : . . . : ...: :...: :.. KIAA14 PIMVLAGPLAVSLLLPSLTLLVSHLSSSQDVSSEPS---SEQQLCALSKHPTVAFEDLQP 110 120 130 140 150 160 90 100 110 120 130 140 KIAA03 -TSIFHSPFGFLDLHTMLLDEYQERLFVGGRDLVYSLSLERISDGYKEIHWPSTALKMEE .: : : : :. . :: ..:.::.:. .. ::: .: . .: :. . KIAA14 WVSNFTYP-GARDFSQLALDPSGNQLIVGARNYLFRLSLANVSL-LQATEWASSEDTRRS 170 180 190 200 210 220 150 160 170 180 190 200 KIAA03 CIMKGKDAGECANYVRVLHHYNRTHLLTCGTGAFDPVCAFIRVGYHLEDPLFHLESPRSE : ::: :: :::::: .: ... :::.::.:.:. .:: .: .. .. KIAA14 CQSKGKTEEECQNYVRVLIVAGR-KVFMCGTNAFSPMCTSRQVG-NLS------RTTEKI 230 240 250 260 270 210 220 230 240 250 260 KIAA03 RGRGRCPFDP---SSSFISTLIGSELFAGLYSDYWSRDAAIFRSMGRLAHIRTEHDDERL : .:::.:: :.. ::. .::.:. :. .:: ::.::.: .:: . . . KIAA14 NGVARCPYDPRHNSTAVISS--QGELYAATVIDFSGRDPAIYRSLGSGPPLRTAQYNSKW 280 290 300 310 320 330 270 280 290 300 310 320 KIAA03 LKEPKFVGSYMIPDNEDRDDNKVYFFFTEKALEAENNAHAIYTRVGRLCVNDVGGQRILV :.::.::..: : .:::. :.:.: .. ....:.::.:.: :::::. .: KIAA14 LNEPNFVAAYDI-------GLFAYFFLRENAVE-HDCGRTVYSRVARVCKNDVGGRFLLE 340 350 360 370 380 330 340 350 360 370 380 KIAA03 NKWSTFLKARLVCSVPGMNGIDTYFDELEDVFLLPTRDHKNPVIFGLFNTTSNIFRGHAI . :.::.:::: :: :: . :..::...: :: .: .:.:.:.:. : . . :. KIAA14 DTWTTFMKARLNCSRPGE--VPFYYNELQSAFHLPEQD----LIYGVFTTNVNSIAASAV 390 400 410 420 430 390 400 410 420 430 440 KIAA03 CVYHMSSIRAAFNGPYAHKEGPEYHWSVYEGKVPYPRPGSCASKVNGGRYGTTKDYPDDA :....:.: :::::. ..:.:. : . .: . :. .: . :. .:: KIAA14 CAFNLSAISQAFNGPFRYQENPRAAWLPIANPIPNFQCGTLPE--TGPNENLTERSLQDA 440 450 460 470 480 490 450 460 470 480 490 500 KIAA03 IRFARSHPLMYQAIKPAHKKPILVKTDGKYNLKQIAVDRVEAEDGQYDVLFIGTDNGIVL :. :: .:..:. .: ... . ... ...:: :.:.: : ::.:::..: .: KIAA14 QRLF----LMSEAVQPVTPEPCVTQDSVRFS--HLVVDLVQAKDTLYHVLYIGTESGTIL 500 510 520 530 540 550 510 520 530 540 550 KIAA03 KVITIYNQEMESMEEVILEELQIFKDPV--PIISMEISSKRQQLYIGSASAVAQVRFHHC :... .. :.. ::::... :. :..: . . :..: ..: .: ...: KIAA14 KALSTASR---SLHGCYLEELHVLPPGRREPLRSLRILHSARALFVGLRDGVLRVPLERC 560 570 580 590 600 560 570 580 590 600 610 KIAA03 DMYGSACADCCLARDPYCAWDGIS--CSRYYPTGTHAKRRFRRQDVRHGNAAQQCFGQQF : : : : ::::::.::: . :: KIAA14 AAYRSQGA-CLGARDPYCGWDGKQQRCSTLEDSSNMSLWTQNITACPVRNVTRDGGFGPW 610 620 630 640 650 660 >>KIAA0620 ( 1985 res) hg04174 (1985 aa) initn: 91 init1: 62 opt: 145 Z-score: 158.8 bits: 41.6 E(): 0.001 Smith-Waterman score: 210; 22.840% identity (55.864% similar) in 324 aa overlap (266-578:339-628) 240 250 260 270 280 290 KIAA03 SRDAAIFRSMGRLAHIRTEHDDERLLKEPKFVGSYMIP-DNEDRDDNKVYFFFTEKALEA ::.... : : .. .:. .. .: . KIAA06 LAKLFTFDLNPSDDNILKIKQGAKEQHKLGFVSAFLHPSDPPPGAQSYAYLALNSEARAG 310 320 330 340 350 360 300 310 320 330 340 350 KIAA03 ENNAHAIYTRVGRLCV-NDVGGQRILVNKWSTFLKARLVCSVPGMNGIDTYFDELEDVFL .....: . ..:.:. . .::. ... .... : :. : : ...: .:: KIAA06 DKESQA-RSLLARICLPHGAGGDAKKLTE--SYIQLGLQCA--GGAGRGDLYSRLVSVF- 370 380 390 400 410 420 360 370 380 390 400 KIAA03 LPTRDHKNPVIFGLFNTT--SNIFRGH--AICVYHMSSIRAAFNGPYAH---KEGPEYHW :.:.. .:..:. : :. :.:.......:::. . . . .:. KIAA06 -PARER----LFAVFERPQGSPAARAAPAALCAFRFADVRAAIRAARTACFVEPAPDV-V 430 440 450 460 470 410 420 430 440 450 460 KIAA03 SVYEGKVPYPRPGSCASKVNGGRYGTTKDYPD--DAIRFARSHPLMYQAIKPAHKKPILV .: .. : : .: :.: . :. : .::: . ..: . :.. KIAA06 AVLDSVVQGTGP-ACERKLN------IQLQPEQLDCGAAHLQHPL--SILQPLKATPVF- 480 490 500 510 520 470 480 490 500 510 520 KIAA03 KTDGKYNLKQIAVDRVEAEDGQYDVLFIGTDNGIVLKVITIYNQEMESMEEVILEELQIF .. : : ..:: : ..: ..:.:: :: .::. :. :. . . .. . KIAA06 RAPG---LTSVAVASV----NNYTAVFLGTVNGRLLKIN--LNESMQVVSRRVVTV--AY 530 540 550 560 570 530 540 550 560 570 580 KIAA03 KDPVPIISMEISSKRQQLYIGSASAVAQVRFHHCDMYGSACADCCLARDPYCAWDGISCS .:: . . . ::. .. .:.:. :... :.:.:: : : ::.: KIAA06 GEPVHHVMQFDPADSVYLYLMTSHQMARVKVAACNVH-STCGDCVGAADAYCGWCALETR 580 590 600 610 620 630 590 600 610 620 630 640 KIAA03 RYYPTGTHAKRRFRRQDVRHGNAAQQCFGQQFVGDALDKTEEHLAYGIENNSTLLECTPR KIAA06 CTLQQDCTNSSQQHFWTSASEGPSRCPAMTVLPSEIDVRQEYPGMILQISGSLPSLSGME 640 650 660 670 680 690 >>KIAA0093 ( 927 res) ha00935 (927 aa) initn: 118 init1: 93 opt: 136 Z-score: 151.7 bits: 39.2 E(): 0.0025 Smith-Waterman score: 137; 26.609% identity (49.356% similar) in 233 aa overlap (191-416:477-686) 170 180 190 200 210 220 KIAA03 LHHYNRTHLLTCGTGAFDPVCAFIRVGYHLEDPLFHLESPRSERGRGRCPFDPSSSFIST ::: .:. : . ::. .: :... 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